3NYAA

Crystal structure of the human beta2 adrenergic receptor in complex with the neutral antagonist alprenolol
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
WVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIWTLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Conserved Binding Mode of Human beta(2) Adrenergic Receptor Inverse Agonists and Antagonist Revealed by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor, Lysozyme
total genus 166
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3nyaA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3nyaA01
1DYEA 4IAPA 2QARC 1M0LA 3GUJA 3L64A 4WW3A 1QUOA 4GBRB 1T6HA 3C7WA 2Z6BA 1BM1A 3DNAA 4W58A 2RB2X 4I7QA 1CV4A 3C8SA 1L74A 1L85A 1X0K1 1L84A 2NTHA 3C80A 3C8QA 3NY9A 1P8HA 3HU9A 2Y00A 148LE 3GUNA 1C69A 3SBBC 1DYGA 2NTGA 4I7JA 3SB5A 145LA 2YCYA 1GU8A 3HT9A 1C6BA 2HUKA 4DJHA 159LA 3RZEA 2QPEB 1VJMA 4FA7B 1OV5A 1QM8A 3QAKA 3QBKA 5G36A 1C62A 1OV7A 3CDRA 1PXRA 242LA 3GUKA 4EPIA 3HANA 3DKEX 3HDFA 1QT3A 252LA 2F47A 2Z73A 3UG9A 1XJTA 152LA 137LA 5A45A 2RBNA 1G0MA 1L27A 175LA 3DDLA 2B6TA 2L78A 1L65A 4J4QA 108LA 4BWBA 122LA 1OWYA 4GPOA 5AZDA 1C60A 3DN8A 1L46A 123LA 1LI3A 1QT4A 3FADA 1L02A 4DKLA 157LA 4EXMA 3EH3B 158LA 1OVKA 1PQDA 4PK0A 6LZMA 5LZMA 3DN0A 200LA 1XJUA 3HASA 255LA 1L29A 4I7NA 1L44A 1P8IA 2RH1A 1C6EA 3D4SA 4EKQA 1QTDA 1KGBA 4YXCA 1L52A 4MQSA 3DN1A 1L72A 4QI1A 1CTWA 3BVDB 1QTCA 1PQKA 1QTZA 4L6RA 1EPYA 1L12A 5B2NA 118LA 247LA 3QBLA 189LA 2OE9X 1G0JA 2BRDA 139LA 221LA 1DYDA 1QKOA 2R4RA 237LA 4E97A 3HAPA 3HT7A 1L07A 3UONA 4EPFA 3G3XA 1LN6A 1L75A 5ITEA 128LA 1KNIA 2Y03A 1L43A 1AP9A 1L82A 198LA 3VHZA 1L03A 3HUKA 5TGZA 177LA 1L71A 257LA 3DN2A 1BRDA 2LZMA 4XTOA 1QUGA 192LA 1L39A 201LA 218LA 3CDOA 3F9LA 2OU0X 1OYUA 1L93A 4EJ4A 2R4SA 4WAVA 213LA 2VT4A 4I7OA 3EH4B 2Y02A 3EH5B 3RFMA 1CV0A 1O0AA 1L20A 2I35A 3S3CB 5B6XA 5BR2A 3HAOA 1CV5A 1L36A 2I20A 1CU6A 3SB7A 1KS3A 1JTNA 3CDQA 3ODUA 5H2LA 2B7XA 3X3BA 4I7TA 1L76A 4ARLA 156LA 1L49A 1L88A 4W51A 4W55A 129LA 2LCBA 248LA 174LA 3SB6A 3CDVA 2RBRA 1G0KA 150LA 110LA 1L25A 249LA 1IXFA 3CAPA 1C63A 1L19A 232LA 1C66A 1P5CA 219LA 1L89A 3HUQA 1L58A 3QJQB 4GYCA 1M0KA 5A8EA 7LZMA 1XIOA 3VVKA 168LA 4JR8A 114LA 1M0MA 5A44A 1EHKB 5G54A 4PXKA 2Y01A 1L28A 1F88A 4W57A 4UG2A 1QTBA 1LW9A 4IB4A 3AYNA 3HH3A 2B74A 143LA 1L05A 1L80A 2RB0X 1L0MA 1R84A 1CV6A 2NTUA 5B6ZA 4AQNA 3GUIA 1G07A 3NYAA 3NY8A 220LA 1L87A 2OU9A 1G0LA 2OTZX 4X31A 138LA 1QTVA 1X0SA 1S51A 2AT9A 2WJLA 1L59A 1L79A 1CUQA 4XXJA 3GUMA 4LDEA 1L81A 1FBBA 1UAZA 3ZPRA 4ARMA 1JGJA 3T45A 4G7QB 1CX6A 115LA 2F2QA 2ZZLA 104LA 216LA 2Y04A 4GP8B 4EA3A 2OTYX 1L57A 144LA 2RB1X 1B6IA 3PWHA 1QUHA 165LA 1C6IA 1KW5A 4W52A 3HTFA 2X72A 1LYIA 1L38A 1L32A 3G3WA 3QJRB 1ZWNA 5G2AA 3PDSA 5G28A 3X3CA 3OE0A 1L63A 1QT7A 4MD1A 1D3NA 240LA 205LA 1L99A 4L35A 1L67A 1G0GA 1CU3A 246LA 172LA 1C6CA 2RBSA 2CUUA 4QIDA 224LA 1D3FA 3WQJA 5JJNA 1L86A 3C83A 1L54A 1L47A 1DYAA 1KY1A 4W54A 1F4ZA 2HULA 1Q5JA 1SWYA 2F32A 2Z55A 4LDLA 1L15A 2KSBA 212LA 4XT1A 1C8SA 3UTWA 238LA 2ANVA 2B70A 3C7ZA 1VGOA 142LA 1C6MA 1GUEA 5B34A 4I7SA 1L0JA 4FAAB 4BV0A 4XT3A 3PXOA 3HTBA 4MQTA 4W59A 4I7LA 2L6XA 4JKVA 4ARJA 3DN3A 4AMJA 3A7KA 1LWGA 1KMEA 1L83A 3ABWA 5H2MA 1JQUA 253LA 4OV0A 4KNFA 4PXFA 3UTVA 3HUAA 1L77A 1C6TA 2B6WA 3DQBA 1OWZA 1L97A 1L23A 4HWLA 1G06A 131LA 1L13A 2ANXA 3UTYA 4BVNA 2IGCA 1CVKA 4MD2A 4EKPA 1PXSA 5B6WA 1C64A 1LGUA 3KJ6A 4HYXA 3RUNA 1C61A 1DZEA 2PEDA 1Q5IA 226LA 1P56A 1L22A 5AWZA 1P37A 1IW9A 5C1MA 199LA 1L14A 3REYA 4EKSA 4W56A 2RBQA 1LYGA 3PQRA 181LA 4XTLA 3HH4A 206LA 2O4WA 1C67A 3S8FB 239LA 4ARMB 3UZAA 1L18A 215LA 176LA 256LA 4YX7C 4GP4B 1QT5A 2Q9EA 3COCA 197LA 4QRYA 1L09A 2RBOA 4K5YA 3HDEA 1QT6A 1NHBA 4LDOA 1C6HA 1T8FA 250LA 2I21A 1P36A 3DN4A 4KLYA 1D3JA 1L56A 3DMVA 3VW7A 1L30A 1L61A 2ZFEA 1SX7A 1QS9A 1QKPA 1G0PA 1L33A 1LGXA 3PBLA 1P64A 3GULA 4ARQA 2JAGA 5FJGA 1CX7A 5B6YA 3HTGA 2Q9DA 3MBVA 1L73A 1S53A 1QSQA 229LA 3DMZA 4ARPA 3SB9A 5B0WA 4IAQA 1P2RA 146LA 1P7SA 5AX1A 259LA 4G70B 1G1VA 3HH6A 4EIYA 1KG8A 1LPYA 1D9WA 235LA 5H2KA 5DYSA 1LYEA 2YDVA 4HYJA 2F93A 2LC9A 4X1HA 1LGWA 1L69A 1P2LA 4I7RA 3HARA 1LI2A 1L51A 1PQOA 234LA 3OE9A 1KG9A 3DMXA 3QBIA 225LA 3FA0A 3ZEVA 1C68A 178LA 120LA 1L06A 1LYHA 2HPYA 1L35A 127LA 3HTDA 2KS9A 1L94A 1L40A 214LA 4DAJA 222LA 3C8RA 180LA 2O7AA 5H2IA 5B35A 2RAYX 111LA 109LA 3DN6A 3P0GA 5LWEA 2B6ZA 169LA 244LA 241LA 2B6XA 210LA 1QS5A 1S52A 1OVHA 1L17A 1L26A 4I7MA 2YCZA 3OAXA 4A4MA 5KKHA 196LA 1CUPA 173LA 4W53A 1QUDA 1LLHA 3GUPA 1QT8A 182LA 184LA 1D2WA 4PJZA 2RAZX 1T97A 1L96A 2YCWA 1L34A 5H2NA 1R2NA 103LA 3C82A 5JJEA 186LA 2F95A 1L53A 4N6HA 1T8GA 4EKRA 3S8GB 3S3BB 1BRXA 162LA 3AYMA 2M3GA 195LA 1L01A 1SX2A 2QPDB 1E0PA 2WJKA 261LA 1D2YA 1JTMA 243LA 3F8VA 1C6AA 4IARA 1K28A 260LA 4N4WA 1L04A 1L50A 1L42A 2B6YA 231LA 3QJSB 1T8AA 4ARQB 4TL3A 1L31A 1L98A 3CDTA 3V2YA 228LA 5BR5A 1S8JA 155LA 1XEPA 1PQMA 4I7PA 3S3DB 5ETZA 2A4TA 1L16A 1C6DA 1LYDA 233LA 1L60A 1IW6A 1H2SA 3HT8A 3QJUB 1MGYA 4Y9HA 3HT6A 3C7YA 112LA 1CU5A 2HUMA 1SSYA 254LA 4I7KA 4MBSA 185LA 1C6LA 2G87A 4GRVA 245LA 1E12A 1XJIA 1AT9A 170LA 183LA 1CV1A 113LA 2B75A 3LZMA 187LA 5AHYA 1SWZA 140LA 119LA 1L90A 3GUOA 4AMIA 4G7SB 3AM6A 1C6GA 160LA 1P6YA 1WTHA 2EI4A 141LA 2OE7X 209LA 1PQJA 1G1WA 1JV7A 2O79A 262LA 1C8RA 1CU0A 3HWLA 4XTNA 3SBAA 191LA 2B73A 161LA 166LA 126LA 217LA 2YCXA 3C81A 1UCQA 2ZIYA 3NS0A 3QDCA 5ITCA 1PY6A 4G72B 3QAPA 5DHGA 3OE8A 1ZURA 5EN0A 3V2WA 1L45A 4JQ6A 3NSBA 211LA 1L95A 2KSAA 5AHZA 1L0KA 2RBPA 1CWQA 3ZPQA 5F8UA 1P46A 149LA 1L70A 5JJJA 1P3NA 1TN0A 2YDOA 3VI0A 4GBRA 1L62A 5G2DA 1L41A 147LA 1QSBA 1FBKA 3G3VA 1DYFA 1C65A 1XMEB 3QBGA 4N4YB 1F50A 1L66A 4FBZA 188LA 5G2CA 102LA 3C9MA 1L37A 1L24A 2OE4X 130LA 1KY0A 1S8LA 1C6NA 5B6VA 1QTHA 107LA 151LA 223LA 2OEAX 1L55A 1H68A 1L9HA 4BEYA 163LA 1L68A 3HAQA 4ZPUA 4FPDA 1L92A 1X0I1 3SN6R 1TN5A 2I1XA 1U19A 5H2PA 1SSWA 125LA 1LYJA 5H2HA 1CV3A 1PQIA 1C6PA 1JV6A 2OU8A 3QJVB 3C9LA 1I6SA 1S54A 3SB8A 5G53A 236LA 1QHJA 3CODA 2QB0B 251LA 164LA 3FI5A 1L00A 3K2RA 4NC3A 3L2XA 171LA 3EMLA 167LA 1JFPA 1KW7A 3JR6A 4G71B 4BEZA 227LA 1C6QA 230LA 2B72A 2LNLA 3VG9A 4YXAC 190LA 4LZMA 1DYBA 4GP5B 1DYCA 4G7RB 1LI6A 1C6FA 1P8UA 258LA 1GZMA 1L21A 5AX0A 4UHRA 3QJTB 3VGAA 1L11A 3OE6A 1OVJA 1L10A 1L64A 5J7AA 3UTXA 4OO9A 2J4YA 4BUOA 1C3WA 5DHHA 3HH5A 1C6JA 1ZYTA 2KSYA 4X32A 1C6KA 1LYFA 2NTWA 1G0QA 5H2OA 3UZCA 5H2JA 1TLAA 1CU2A 1LWKA 1L48A 3HU8A 1L08A 1HZXA 5I14A 2JAFA 1D3MA 1L91A 1BRRA 4S0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JWRA 1LZCA 1M0LA 3GUJA 3L64A 4GBRB 1GWDA 2Z39A 1BM1A 2RB2X 3C8SA 3SP3A 1L85A 1CKFA 3NY9A 2H9JA 1C69A 4LYTA 1DYGA 1BWIA 2DQDY 4DJHA 1VJMA 1HEQA 3A92A 3AZ6A 1VDQA 1WQRA 4EPIA 4ZEEA 3HDFA 5B07A 252LA 4MR1A 2Z73A 1LSFA 3UG9A 152LA 137LA 5A45A 3E3DA 2RBNA 175LA 3DDLA 2L78A 108LA 1CKGA 3T6UA 3DN8A 3EH3B 3FADA 5M1YA 4AGAA 158LA 1PQDA 1ALCA 1PZYA 3DN0A 1GFGA 1XJUA 1L29A 1L44A 4EKQA 1QTDA 5FDJA 1L52A 1MELL 4YXCA 4MQSA 2Z2FA 3LYZA 1UCOA 1PQKA 4L6RA 4NSJA 3QBLA 189LA 4KXIA 2OE9X 139LA 3WU9A 4WO6A 3HT7A 3UONA 1L75A 5KY1A 2Y03A 1L43A 1AP9A 1EQ4A 4NSIA 2MEBA 1GEZA 3DN2A 1LHKA 2BQOA 2Z38A 6LYZA 218LA 201LA 4H92A 1L93A 2ZIKA 2Y02A 2I35A 1L20A 5B6XA 4WG1A 2I20A 3A3QA 2RSCA 3CDQA 3ODUA 1GXV2 4YOPA 193LA 1F0WA 2LCBA 2X0AA 248LA 3TXKA 150LA 4G9SA 2EIZC 1L19A 1C66A 3HUQA 1M0KA 5A8EA 5KJ9A 1QTKA 3WW6A 4EOFA 168LA 1FN5A 1GAYA 1LSYA 5G54A 4ZFPA 2Y01A 1F88A 3A90A 1QTBA 3AYNA 1L80A 1CV6A 1UA6Y 1YKYX 4A7DA 1H87A 4FJRA 3NYAA 2OU9A 2OTZX 5K7OA 4X31A 1X0SA 1S51A 2AT9A 1XGRC 1GEVA 1L79A 1B7SA 3LZ2A 1UAZA 1FBBA 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 4UHR A;  3QJT B;  3VGA A;  1L11 A;  3OE6 A;  1OVJ A;  1L10 A;  1L64 A;  5J7A A;  3UTX A;  4OO9 A;  2J4Y A;  4BUO A;  1C3W A;  5DHH A;  3HH5 A;  1C6J A;  1ZYT A;  2KSY A;  4X32 A;  1C6K A;  1LYF A;  2NTW A;  1G0Q A;  5H2O A;  3UZC A;  5H2J A;  1TLA A;  1CU2 A;  1LWK A;  1L48 A;  3HU8 A;  1L08 A;  1HZX A;  5I14 A;  2JAF A;  1D3M A;  1L91 A;  1BRR A;  4S0W A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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