3O2AA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA02
2W7YA 3VXCA 5JK4A 2DS9A 4ZEKA 5I2KA 2Z8DA 5I59A 4ZEFA 2AYSA 4P0IA 4NF8A 4IY6A 4ELQA 2I3WA 3ILTB 3QSLA 4I8CA 4RA1A 1D3KA 1XOCA 3EHSA 3BBRA 2DP8A 3TTLA 1JW5A 2X7PA 1USYH 1PB8A 2O84X 1PDAA 4H8JA 4PFYA 3SETA 1SYHA 1BKAA 4RJZA 1II5A 3H4ZA 1BTJA 4OESA 1R6ZA 1AOVA 1RKMA 4ESXA 4ZE9A 5BUUA 1USYE 1SVXB 3JZJA 2ONKE 1SD3A 2PYYA 4G8NA 1FCKA 1IZ1A 2P2AA 2QSXA 4TOZA 4F19A 3BFTA 4YICA 4KQPA 5J1DA 1SW2A 1QULA 1N76A 1I6QA 3UN6A 3VE1B 4FAJA 2I58A 3VDFA 1DMBA 5ISUA 4C1TA 1RYXA 1Y9UA 3IO6A 2Q2CA 1B1XA 1NKXA 2DE3A 3CSGA 4K3FA 4JSDA 3QUFA 4YMAA 2GHAA 2NOOA 2PBWA 2F97A 4NWDA 4OTEA 4HCWA 4RK9A 1B5HA 3KSJA 1L5TA 1DPEA 3K2DA 4PE5B 4RY1A 3KZGA 2G93A 2Y7PA 3CRBA 3W9VA 2F8DA 3N6TA 1T0KA 1Q1KA 1WODA 4GL0A 1US5A 4F3PA 2OJTA 1VFEA 5AA2B 2OK2A 1AMFA 2B3FA 3PMXA 1AIVA 4QSCA 3MJNA 2ZNTA 1MY2A 2ZXTA 2XXQA 4KPTA 1MDP1 1XC1A 5AA2A 1FW0A 3CG3A 4GQOA 5F7VA 1PC3A 1SYIA 1MPCA 1Y1MA 3TZAA 4ECFA 1NNTA 3A3CA 1UQWA 3E13X 1OQGA 4GIZA 3TTRA 3VVDA 3TKDA 1PBPA 1YPNA 1R9QA 1ZU0A 3E9XA 2RC8A 2Z8EA 3PUZE 1N7WA 2THIA 4G77A 3H6VA 5CMBA 5FHNA 5K2XA 5KCJB 1O63A 4YKJA 5HBCA 2RKMA 4H8IA 4UA8A 3OENA 5JTYB 1B0LA 2RCAA 4ND9A 2F35A 1B4HA 2OCUA 3IK6B 4H6DA 1GV8A 3V5AA 3L6HA 3TMGA 4U22A 3VLUA 3B7DA 1MQIA 2V25A 4IB2A 3TCGA 1HSJA 3GBBA 1B6HA 2ESNA 2X7QA 4F3BA 3FV2A 3Q29A 1MXYA 2OZZA 3S9MC 3M3FA 1MQDA 2CMOA 2F6GA 2H99A 3E3KA 4H5GA 4GD5A 4NF4A 4YAHX 3UORA 1N04A 1Y4TA 3VLWA 2WKYA 4O3BA 4ZE8A 5H8FA 1B51A 1QW0A 3EQ1A 3PPRA 2XXRA 1ANFA 1LFGA 5DEXB 3OXNA 1QUJA 4XKNA 4YU0A 4G68C 2M8CA 5M2VA 4DLDA 1M5CA 5ITPA 4E0XA 3LSXA 3SDFA 4LONB 1EH3A 5CMCA 2GHBA 5FTIA 3H06B 1FTKA 3PMWA 1MXWA 2VD3A 4KD5A 4F3SA 2DOJA 1FTMA 3B6QA 1A8FA 3MUQA 4NWCA 5F1QA 3VVEA 1IXGA 1LBCA 3FJGA 4GVOA 3LSFB 1QVSA 2R6GE 4OMBA 1B2HA 1LB8A 3T66A 4WEDA 3R6UA 3GBAA 4XKRA 2I0BA 4EQ7A 3O9PA 3K01A 2FYIA 1B7ZA 2F7AA 3OO6A 4XKPA 4DDDA 4ELPA 1BP5A 1Y4CA 4U21A 3IOUA 3N6UA 2D3IA 2QS3A 3TYHA 2VOZA 1D9YA 3OO7A 2HXWA 3VLVA 3IB1A 4PFUA 5CMKA 3W15C 3C4MA 4LUBA 2V84A 4O3AA 5DYHA 1LSTA 3RQTA 1EU8A 3BKIB 4TLMB 1MH4A 3RY3A 4PETA 3S4UA 4ZS9A 1MY1A 3LC8A 1B3LA 1D9VA 1YTVA 4C1UA 3KSXA 3MZBA 4ONYA 4G2ZA 2V3UA 3RTWB 4OFLA 5I59B 2YJPA 4G68B 4HCYA 4ESWA 3DP8A 3N94A 1P1OA 4F29A 4LZ7A 2NWJA 4QHQA 3FVOA 4F39A 1P99A 1XS5A 2VGQA 4QFKA 4RPNA 4ZECA 4EXKA 1SBPA 4KYSA 3Q25A 3T9UA 3GLBA 1IIWA 2OWSA 1SW4A 3PPNA 3AXFA 1H43A 2PMSA 2XXYA 3TCFA 2ZNSA 2Z23A 3FUZA 5I56A 4KCDA 3FIRA 5AA4B 1M5BA 2VHAA 4RXLA 4EXLA 1EZPA 3OEKA 2DSFA 3I5OA 2XXWA 2UVHA 3MBPA 3PUYE 4F1YA 4NEDA 4PP0A 4NF5B 1I6BA 4JDFA 3KFMA 4F2OA 4OETA 3FV1A 5H8FB 2P1SA 4ZZAA 4F1VA 1LLSA 1MQHA 3F11A 1MPBA 3SEVA 2OLBA 1O7TA 2ZYKA 4P0GA 4EF1A 1IITA 5I57A 2O7IA 1MPDA 4U23A 4DIGA 1J1NA 3Q28A 3PD8A 4YKIA 3VXBA 1S50A 1VSOA 3G3KA 2O1MA 4OZ9A 1SI1A 3THIA 1D4NA 2H98A 1JEUA 2RF1A 1TXFA 3MVZA 3OELA 2UYFA 4LP2B 5ICQA 1R9LA 4BDNA 2DWJA 1MXXA 3TQWA 4Q0CA 4F18A 4KCCA 3DLNA 4XIGQ 1KWHA 4OYVA 2RCBA 5IKBA 2IA4A 5TPAB 1WDNA 3EHTA 3T9XB 4ELRA 3D4GA 4OWDA 4Z7EA 1POY1 4ZEDA 3OD7A 1B3HA 4LQ5A 3CFXA 4GWOA 1N0TA 3JYRA 4FEDA 4Q30B 3KEIA 5I2NB 5TPAA 1B32A 4OFJA 2XX8A 1H76A 4U4SA 1JVXA 1FTJA 2UVIA 3FZVA 4IGTA 4QSEA 3O66A 3QAXA 5L9OA 2QJEA 2F36A 1B05A 1IXHA 3HO7A 3N5LA 4Q5TA 3V83A 2XX7A 3FXUA 3IO4A 3PUXE 1FQAA 3OSQA 5H8SA 2Q89A 5I84A 3QK6A 3SKPA 2B3BA 3MPKA 3Q27A 3A3UA 5B7DA 3TTKA 4GRKA 5CMMA 3K6VA 1PB9A 3CFLA 2F7BA 1ZIUA 2V3TA 3DP4A 3H7MA 5AA3A 1TWYA 2GFEA 2I6EA 3QIMA 2ONRA 3LSWA 1I69A 4NF5A 2GRVA 4G4PA 3EN3A 4RYAA 4GF8A 4H0WA 2QS4A 2A5SA 2KLFA 4JB7A 4R72A 4WEPA 2XXTA 4LZ8A 4ZEBA 3HHGA 2I3VA 5KDTA 4F31B 3IOWA 5DT6A 4BDQA 4I62A 3RNNA 2ONSA 3U92A 4RK2A 4BLAA 4XTCQ 1A40A 5L9SA 2ZYOA 3H03A 1SQYA 1BLFA 2QRYA 3DM0A 1AL3A 2AIXA 2DE2A 1MM7A 1GR2A 4FECA 4Z0IA 3OO9A 3SEXA 5JEIA 1DSNA 3CI8A 3KN8A 5KCJA 1JNFA 3HN0A 5EYFA 3L6GA 4R6HA 1GGGA 3K1MA 2X26A 3ODBA 5ITOA 3RUMA 4BDMA 1MY4A 4LQ2A 2UVJA 4PFWA 4GXAA 1JVYA 2QPQA 3Q26A 2XHDA 4G68A 1DPPA 4OENA 5DVJA 4E0WA 4X9TA 4R75A 1A55A 3LUYA 1UTBB 2E1SA 1Y3NA 2B65A 3SERA 3N26A 3SEYA 5I2NA 1FQEA 1NFTA 2FA7A 3HSTA 3O6HA 5CRYA 3T9VA 3WAEA 4DXUA 3H6UA 2DXYA 2XX9A 1LAFE 2Y7IA 1EZ9A 3LR1A 3TTMA 1B9JA 3CG1A 1R1NA 1UTBA 2F5XA 2HCAA 3TPAA 4I1DA 3B6TA 2HFBA 4THIA 4YKKA 4ELOA 3RN8A 2F78A 4M1VA 1HSLA 4MF3A 1B40A 3I3VA 3QYTA 4LVQA 3VVFA 4BDOA 2AL5A 1QUKA 4MBPA 1MQGA 4KR5A 4YKPA 3QXMA 4BDRA 5H8NA 4JWOA 4AB6A 1F9BA 3FVNA 3P7IA 4HW8A 1N3XA 3TEPA 4MLQA 3D4CA 3T96B 1A99A 1MS7A 1PBQA 2HAVA 2Y84A 3PUWE 1MRPA 4LATA 4NF6A 4POWA 4X1DA 4BDLA 5KZTA 1ZTYA 1NNFA 4MFIA 3T9HB 3MAMA 3MVWA 2P0SA 2E0SA 3MP6A 4ISUA 4R6KA 5I58B 1Y3QA 3CSBA 5KDTB 4H67A 1QJMA 4AQ4A 1NH8A 3SESA 2Z22A 5I56B 1OLAA 3IOTA 5A5XB 2PVUA 1URSA 1QKBA 1MXVA 2ANJA 4KYDA 1ZBMA 1S7YA 2ABHA 1IXCA 2HZKA 4ZEIA 1MXZA 2D21A 1Z7ME 1LB9A 2I0CA 3K4UA 4KI0E 3SEUA 3LSLA 2XD2A 1TFDA 4JWYA 4R2FA 1POTA 3G7WA 3QUJA 4IGRA 1A7LA 4IO6A 1B5JA 1LBBA 1B58A 2DXRA 2A5TB 1FQDA 2XD3A 1NNKA 4TQUQ 3U8QA 2Q8JA 4EF2A 1JETA 1FQCA 1JW4A 3IOVA 1Z7NE 3MC2A 2AL4A 4QFNA 2H5YA 3KOSA 2H25A 4OEVA 4OQOA 3W9WA 5CBRA 4RNSA 1ZKBA 3UIFA 3FATA 4LA9A 5H8QA 1MG1A 4G8MA 3CR9A 5L8DA 4GOTA 1B3GA 1ZMGA 2ZMBA 3K02A 4PFTA 3TCHA 2HQ0A 3PMVA 5TU0A 4R73A 1LFHA 1NH7A 3O97A 3FJ7A 1XVXA 1H3DA 2R9JA 4HTGA 4X48A 2G29A 2ZNUA 4AB5A 3RTFB 1B3FA 2O6AA 3FVGA 4QSDA 1UIUA 3C34A 1CB6A 2DVCA 1JQFA 3FXRA 3UA8A 3E4RA 1URGA 3UGWA 2HZLA 4MH5A 3EF7A 5ELVA 3O6IA 3RT8A 1HSEA 4POXA 2H4IA 2UVGA 1CE2A 3OSRA 5H8QB 4KHZE 5EHSA 3MQ9A 5L9MA 3HV1A 2Y7RA 4R74A 5FHOA 1FQFA 4P11A 3T93B 3H3GA 1LCTA 2HEUA 1DOTA 3KOTA 2IEEA 4G8HA 1URDA 2YLNA 1TT1A 5CBSA 1P1QA 4H5FA 3EPEA 3C33A 5I57B 1PEBA 3O6GA 3OOAA 2I49A 3OEMA 3MP8A 2XXPA 4FIMA 2QL3A 3TQLA 3M3KA 4YB5A 1B1HA 1US4A 3K6XA 4WKMA 5A5XA 3I6VA 1MDQA 2O1LA 5DVIA 3UP9A 5JTYA 2XXIA 3PPOA 1LGBC 3R26A 4GXSB 5H8NB 5AE4A 2DYXA 4IO3A 4YB7A 1YCJA 2YPNA 4JWXA 3MPLA 4PQJA 4YMBA 2XXUA 3PGFA 4XKQA 4R9FA 3TELA 3G3IA 2DQVA 3GZGA 1SW5A 3G3GA 5BWJA 4F1UA 5AA1A 2V93A 4OXVA 5I2KB 5HM4B 3FGSA 3IJOB 2QS1A 2V3QA 1GVCA 2NUVA 1N7XA 3G3HA 3MZ9A 4KYEA 3K00A 2BJJX 1EZOA 3SEWA 1LAXA 2PT1A 2RC9A 3G3JA 2Q2AA 4ZZEA 3ZS6A 4GL8A 1O64A 3TTNA 4EDPA 3C35A 3KJTA 2A5TA 5FTHA 3MW0A 3V8XB 3M8UA 1OQHA 2REGA 3RPWA 3GXAA 1NL5A 1PB7A 4N13A 3KBRA 4DXBA 3S9NC 2REJA 1TFAA 4GLIA 1YAEA 2RINA 4O3CA 1A54A 5IAIA 1Y20A 4L17A 5DEXA 1MXUA 4ZDMA 1XHYA 3RLFE 4X1BA 4OVJA 1AH5A 1UTHB 4TLLB 5H8HA 5LOMA 1ZLQA 3IR1A 2XXXA 3O28A 1NMUA 2Y7KA 3O2AA 4FJPA 4FORA 4IO2A 4OFOA 3K6UA 4QFPA 5DVFA 4EQ9A 2FNCA 4R2BA 4DCYA 3TDJA 1N84A 4QFLA 1QKAA 1UTHA 4KFQA 1Q35A 2UYEA 4C0RA 1S9TA 2DWIA 3JV9A 3S9EA 4N07A 2LAOA 1LAHE 4GFRA 4NE4A 3MZ1A 2DE4A 2DWHA 4R6YA 2DWAA 4NF6B 3FD3A 1Y1ZA 2I48A 4NTLA 1VFDA 2XXHA 3DELB 2Y7WA 4NF4B 2PX1A 2O69A 3RGYA 1SW1A 2R71A 3U93A 1MM6A 1OLCA 3S2VA 1IQ7A 5I58A 3IJXB 3RT6B 1QUIA 1XT8A 1B0HA 1B7UA 3VV5A 1ELJA 1P1WA 2HAUA 4QFOA 1DTGA 1DTZA 3C31A 2F7CA 3LBSA 5CC2A 5CM6A 4JSOA 5ICTA 3ZSFA 2ALUA 2PT2A 4U4XA 3KG2A 4YB6A 3MP1A 1OMPA 2UXAA 2QMXA 3C9HA 1B7HA 3TUSA 2O68A 3VFJA 3ZKLA 4Q8RA 3UK4A 4JXIA 2RC7A 2QS2A 1NNPA 3C32A 3DP6A 3MWBA 4FEBA 4H65A 2XXVA 1XVYA 1BIYA 1MH3A 1P1UA 4MLVA 4DCXA 5TP9B 1ATGA 1FTOA 2F6PA 3K0VA 1VR5A 3A09A 3IAZA 3ONMA 1GTKA 4OERA 4U2RA 4F2QA 3V89B 4EQBA 3IX1A 1H45A 2QMWA 2VP1A 3H6WA 3OMBA 2O7UA 3OO8A 2ZYNA 4QF9A 5AA2D 3G3FA 3FVKA 4DZ1A 3T22A 3U1OA 3IB2A 4OEUA 3KN7A 1JW1A 1IXIA 3FASA 3KGCA 4IO4A 1FTLA 2F34A 2GH9A 1FQBA 3C36A 3O29A 3PPPA 4QRZA 4WXJA 3WAFA 3IL1B 3KJ7A 3PPQA 1VE4A 4H1XA 4IO7A 5EHMA 4FATA 5HPQA 3TODA 3S9LC 4IY5A 4YZZA 2VD2A 2I4BA 3K6WA 3PUVE 1B5IA 1OVBA 3U94A 5AA4A 3ECRA 3PU5A 1MQJA 5DTBA 2Q9TA 3U72A 1WVJA 3H6TA 1B3EA 1SDXA 3HHFA 3ILUB 4N6PA 4FE8A 3K1PA 4F3GA 4DXCA 3HCQA 1LAGE 1P1NA 3PD9A 4R9GA 3PV0E 5CI5A 3IORA 4IO5A 2NXOA 3EHUA 4UACA 1LFIA 4F22A 1Y3PA 1B46A 3K1NA 4I9DA 1OIBA 5B70A 3MVXA 4HS7A 3TAJA 1UIVA 3KN3A 5FHMA 1RYOA 5H8HB 3FJMA 1IEJA 1M5EA 4EUOA 4NF8B 4NMYA 1LCFA 1M5FA 4M4GA 2CZLA 3TFLA 1MY3A 1MY0A 1ZJLA 3ZKKA 1IUDA 2O51A 1I6AA 1A8EA 2Q88A 3CVGA 3CFZA 2Z8FA 5TP9A 2NVUB 3BFUA 2D5WA 1OVTA 5K2YA 2ZYMA 2OBGA 3IB0A 3R7XA 3MVYA 1N3WA 2DVZA 2OWTA 1JEVA 1B52A 3M3LA 4XXUA 1SI0A 4U1OA 3CIJA 3USDA 4OHNA 1B4ZA 1H44A 4JBZA 3FXQA 3HPIA 2I4CA 4U1ZA 4DE8A 4LZ5A 3B6WA 1M5DA 2H9BA 4RPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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