3O2AA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA02
3TTNA 3MW0A 1A55A 3K1NA 1EZ9A 1ZBMA 2F6GA 3A3UA 3R6UA 3TTMA 3AXFA 1GTKA 3MUQA 3W9WA 2D3IA 4BDMA 3RT6B 4DIGA 1AIVA 1BLFA 1F9BA 2B3BA 1Y4TA 1YCJA 2HFBA 2RC7A 1ZMGA 4XKRA 1B52A 5KDTB 4OFLA 4E0WA 3KOTA 3C9HA 2A5TB 1JEUA 4ZS9A 1SW1A 4KCCA 4TOZA 4ELOA 5I56A 1AOVA 2QSXA 5HPQA 4ZEFA 1WVJA 3DM0A 4O3CA 3SDFA 1QJMA 5EHMA 4YMBA 5IKBA 1ZTYA 4HS7A 3V89B 5I59A 1T0KA 3ILTB 3S9LC 1JVXA 4OVJA 1B1XA 4Q8RA 1A40A 3M3FA 4LP2B 4UACA 1H43A 3PPRA 2O1MA 3K6XA 4GQOA 4YKKA 4NE4A 1VFEA 5ICQA 2ZYOA 4H0WA 5CMBA 3OO9A 4F1VA 3UN6A 3CFXA 4NWCA 4KYEA 5CBSA 4GLIA 1XOCA 5DEXA 4KCDA 4LQ2A 4IO2A 2XD3A 1KWHA 3CVGA 4R72A 5CRYA 1BKAA 3E3KA 1D3KA 1UQWA 3K0VA 3PD8A 1M5BA 3ONMA 3PMXA 4KD5A 1YAEA 1Z7ME 3K6WA 4U4XA 2CMOA 1QKAA 3O28A 4R9GA 3WAEA 1M5CA 2THIA 4U23A 5ITPA 3T96B 2RKMA 2HEUA 2Q2AA 5I2KB 4E0XA 1URSA 3DP8A 3VLUA 2G93A 2UVGA 3DELB 5CMKA 1OVBA 2I6EA 4G68C 1NKXA 3OMBA 3SETA 3U8QA 2UXAA 4NF8B 3UGWA 4ELPA 2DVZA 2QS1A 1S50A 3C4MA 3FGSA 2A5TA 1LLSA 4DZ1A 3TTRA 5B70A 1A8FA 2VHAA 3O2AA 1NNKA 3LSFB 2E1SA 4OFOA 5L9SA 3LUYA 2D5WA 1ELJA 2RCBA 3G3HA 4FE8A 4H6DA 4LZ5A 4OZ9A 3EQ1A 2I58A 4XKQA 5F7VA 4ZEBA 3KG2A 3GBAA 4WEPA 4ZEIA 5AA2A 4XKPA 1TXFA 1OLAA 2I0CA 2XXVA 1B3FA 1MXXA 4QSCA 1B3EA 1H3DA 3IOVA 2X7PA 4WEDA 1B5JA 4M1VA 3TELA 1XS5A 3UK4A 3MPKA 3GBBA 3WAFA 1PDAA 1VE4A 3G7WA 2WKYA 1LGBC 1B05A 5K2YA 2Q88A 1B3GA 1HSEA 3FVGA 1B51A 3FVNA 3MBPA 4ESWA 5H8HA 2XXWA 1MY2A 3L6GA 1FTJA 3IK6B 3HHFA 5I84A 2DXYA 3VFJA 2VD2A 1RYXA 3TPAA 1LCFA 3W15C 4DCXA 1Y3QA 2I49A 1OQHA 2P2AA 2RC8A 5AA2B 1EZOA 3G3KA 4GWOA 3K6UA 4YB7A 1QUJA 4C1TA 4G4PA 4JWXA 3EHUA 1FTOA 4ECFA 2OLBA 3N26A 4LVQA 2GHAA 4P11A 1OVTA 2DYXA 4X1DA 2OBGA 3MAMA 4YAHX 4IGTA 2Z8DA 3KBRA 2UYEA 1OQGA 2Y7PA 1MM6A 3MZ1A 4RXLA 1JW5A 5I2NA 5KDTA 2VP1A 4MH5A 4R6YA 4BDLA 4F1YA 1JW1A 1LCTA 1ZU0A 2ONRA 3TCGA 1B32A 1QKBA 4X48A 1UTHB 3KSJA 3OD7A 4HCWA 4KYDA 4OWDA 4RY1A 1B2HA 1NH7A 1MQDA 1N3WA 1PC3A 2LAOA 1MY4A 4QRZA 3FATA 3C34A 3ZKKA 4QFNA 3TTLA 1FW0A 2ZYKA 3U72A 5AA1A 1B7ZA 3BFUA 4X9TA 1MQGA 3KGCA 1H76A 1ZLQA 1M5DA 1BP5A 1NMUA 1PEBA 2XX9A 3IB0A 1N0TA 3MVWA 1NNFA 3S4UA 5JTYB 3MQ9A 1B5HA 3KJ7A 3OXNA 2REJA 4H65A 4X1BA 1II5A 2ABHA 2W7YA 4EQ7A 3MPLA 3KZGA 4Q5TA 5I59B 2OJTA 2XXQA 3BBRA 1B3LA 3PV0E 1ANFA 3S9EA 1A54A 1Z7NE 3IOWA 5FHOA 4F22A 5TU0A 3V5AA 2XXHA 5TP9B 1B46A 3GLBA 4THIA 3VVFA 1N3XA 4H5FA 1EU8A 4NF6B 5I58B 2GH9A 2E0SA 3FD3A 1SYHA 4NF4B 3C33A 5M2VA 2ZNUA 1P1WA 1B3HA 3ZS6A 3V83A 4P0GA 3T22A 1RYOA 4OEUA 4IO4A 3FIRA 1URGA 1UTBB 1XVYA 2O6AA 4H5GA 1Y9UA 1D9VA 4F3BA 1Y3PA 4EF2A 3E13X 3HPIA 4YICA 2HXWA 3OO7A 2DSFA 2F6PA 2Z8FA 3D4CA 3HN0A 4ZEDA 3S9MC 5ELVA 3CFLA 3MP1A 4MF3A 3U92A 1IXCA 4GOTA 2NWJA 3RGYA 3PUVE 2QJEA 1NNTA 5JK4A 2DWJA 4C1UA 2ALUA 2V93A 3LSXA 1OIBA 2G29A 3IJOB 1B9JA 2VOZA 1ZKBA 1MXVA 3QXMA 3T9HB 3RN8A 3U94A 2QMWA 4JSOA 4WKMA 3TUSA 3MVXA 4BDOA 2V3TA 3T66A 1TFAA 3FV1A 4OXVA 2V3QA 3PGFA 3U1OA 4BLAA 1URDA 1LSTA 2H9BA 4NWDA 4U1OA 1MS7A 3CG3A 1B58A 3IX1A 2HAVA 1Y20A 3MZ9A 3C36A 5DVIA 3IORA 1NL5A 5L8DA 3SEWA 5BUUA 1FTMA 3IOUA 2DXRA 4POXA 4F2QA 4YB5A 1D4NA 1WDNA 4F18A 4DXUA 2Q9TA 5TPAA 2Y84A 2ZNSA 4FEDA 3Q26A 1DOTA 1FTLA 1SBPA 3O97A 4G8MA 2AIXA 1MXZA 4FECA 4EDPA 1CB6A 1FQEA 3FJGA 4MBPA 4NEDA 4GXSB 1B4HA 1DMBA 2DE2A 3ECRA 3GZGA 3IJXB 3PPQA 4OERA 2PT1A 4WXJA 4YU0A 3TCHA 2NVUB 1LAFE 1FQAA 3FUZA 1P1NA 1R1NA 2Z23A 4OFJA 3LBSA 4PE5B 4HW8A 5F1QA 1LFIA 2OCUA 2R71A 5CMCA 4IY6A 1Y4CA 3K00A 1YPNA 4PFWA 1MPDA 4R6HA 1P1QA 2P1SA 2DE4A 2IEEA 3L6HA 3CIJA 1IIWA 4L17A 5I56B 3V8XB 4ZE9A 3VLWA 3TMGA 3O6GA 2QS2A 3T9XB 1LFHA 3QSLA 1FTKA 1M5EA 2CZLA 1LFGA 2UVJA 3S2VA 1B6HA 4RNSA 3C32A 3E4RA 4Q0CA 2FA7A 4DE8A 3TQWA 3EHSA 4R73A 3TZAA 4ZEKA 1AL3A 3K2DA 2OWTA 3M3LA 3Q28A 2PVUA 2RCAA 4IO6A 4IB2A 1L5TA 1QW0A 3RTWB 1NNPA 2B65A 3GXAA 1HSLA 4GL0A 4R2FA 3N94A 1QUKA 1B1HA 1IXGA 1A8EA 2ONKE 2UVIA 3EN3A 3K6VA 1R6ZA 5FTHA 3SESA 2R6GE 3HHGA 1MQIA 2F5XA 4DXCA 2QRYA 1N76A 1FQBA 1Y1ZA 4G68B 3VVEA 2PX1A 1M5FA 2Z8EA 4GXAA 5CC2A 4ZECA 1IQ7A 4JSDA 3UP9A 5KZTA 3OO8A 1N84A 2I4CA 1YTVA 3RQTA 4YB6A 5AA3A 1PBQA 3PPPA 2YLNA 1MY3A 2F7AA 2I3WA 5FHNA 5TP9A 1S9TA 2OWSA 2ZXTA 4LONB 3H06B 4GRKA 3RLFE 4YKIA 2NUVA 2AL5A 3RTFB 4RA1A 1PBPA 5I57B 1DTZA 3THIA 3O6IA 3Q25A 5FTIA 2XX7A 2F35A 1MPCA 3FASA 3I5OA 3EF7A 4RPNA 4XKNA 2ANJA 1ZJLA 1AH5A 2PT2A 4I62A 4OETA 3H4ZA 4U4SA 4IO5A 4QFKA 3S9NC 4PFYA 3SEXA 4Z7EA 3IO6A 1VFDA 4YKPA 3UA8A 3FVOA 1PB7A 3FJMA 1IXHA 2QMXA 3OSRA 1UTHA 3KN8A 1S7YA 4JDFA 1SYIA 3P7IA 1JW4A 2DS9A 4K3FA 3OSQA 2P0SA 1QULA 1MH3A 3DLNA 3FXRA 1JNFA 1SW4A 4ONYA 2ZYNA 3VE1B 4YMAA 1I6QA 5L9OA 1TT1A 1B0HA 5DYHA 1O64A 3SEUA 3DP6A 3H6WA 5I57A 1JEVA 1SI1A 3OEKA 1MXYA 4PQJA 5LOMA 1QUIA 4MLQA 1JQFA 2ESNA 3PUZE 3QK6A 1N04A 4IGRA 3B6TA 2XHDA 3M8UA 4H8JA 2R9JA 5CBRA 3MP8A 4PETA 3G3IA 1DTGA 3KN7A 5ITOA 2H25A 2FYIA 3KN3A 4U2RA 4KR5A 2Q8JA 4TLLB 4DXBA 2H5YA 5AA4A 2QL3A 4G68A 1UIVA 1TWYA 1GVCA 4R74A 3MWBA 1BIYA 4PP0A 1P1UA 4EQBA 5A5XA 4I1DA 1XHYA 2X7QA 4O3AA 3PMVA 4R2BA 4GVOA 1MG1A 2KLFA 4XXUA 4I8CA 4DCYA 1LAXA 1USYE 2QS3A 1D9YA 4NMYA 3PUYE 3TDJA 1SI0A 3CR9A 4OMBA 2GHBA 2PBWA 4ZE8A 4G8NA 4EXLA 4EXKA 3OENA 3H6VA 1AMFA 2X26A 1SQYA 3MP6A 4H8IA 4TLMB 5J1DA 5JEIA 1PB8A 1XC1A 5AA4B 1B0LA 5CM6A 3SERA 4GD5A 1FQFA 4NF6A 3RT8A 4NF4A 1A99A 3PD9A 5K2XA 2I4BA 2ZYMA 1JETA 3IL1B 3QUJA 2I3VA 1TFDA 4AB6A 4KFQA 1IITA 4NF8A 4QHQA 3IAZA 2IA4A 3MC2A 3N6TA 4QSDA 3MVZA 1IXIA 2V84A 1MY0A 4HCYA 1VR5A 4ZZEA 4JB7A 3A09A 3LC8A 1GV8A 2UYFA 2NXOA 3E9XA 1MXWA 4JWYA 1Y1MA 1IZ1A 2H98A 2Y7KA 3TYHA 1LB9A 3BKIB 3UORA 5FHMA 3OELA 4F3SA 4R6KA 2PYYA 1P99A 4RK9A 3RPWA 1B4ZA 1MDP1 1N7WA 4GL8A 4FORA 4UA8A 3F11A 1US4A 3KSXA 1H45A 4OHNA 4RJZA 2H99A 1IEJA 1I6BA 1B40A 3ILUB 3JYRA 2XD2A 4R9FA 2YJPA 4N6PA 4OYVA 1SW5A 4KYSA 3VLVA 2V3UA 1I69A 3USDA 4NF5A 3IB2A 3OEMA 4U22A 3T9UA 3VVDA 3ZKLA 2FNCA 2Y7IA 2B3FA 3QUFA 4QF9A 3R7XA 3TAJA 4FATA 4G77A 3K4UA 2F78A 1OMPA 2H4IA 3CFZA 4U21A 3OOAA 2XXIA 4F39A 2Q89A 5I2NB 5CI5A 5EHSA 3CG1A 3VXBA 1NFTA 1SW2A 2XXXA 3PMWA 2XX8A 1XVXA 4Q30B 2O51A 4DDDA 4N13A 2O1LA 4P0IA 4JBZA 2YPNA 3OO6A 5H8QB 5DT6A 3EHTA 3FZVA 4C0RA 3HCQA 3KJTA 1GR2A 4LA9A 1B5IA 2O68A 4F29A 2O69A 3N5LA 4ND9A 4QFOA 3O9PA 4KI0E 3KOSA 5CMMA 1MY1A 4HTGA 4ESXA 1LAGE 4ZDMA 1XT8A 2RC9A 4F2OA 2F36A 1DPEA 3DP4A 5BWJA 3CRBA 3O66A 4LZ8A 5TPAB 1MM7A 4OTEA 5DEXB 1RKMA 4JXIA 4OENA 3TTKA 3QIMA 1FCKA 1FQCA 1P1OA 2F34A 2F97A 3B7DA 1UTBA 3IO4A 4JWOA 5EYFA 3C31A 3U93A 1R9QA 1Q35A 2UVHA 3CSBA 3H7MA 3K01A 5H8QA 4QSEA 3B6QA 5DVFA 1A7LA 1LAHE 2Z22A 4XTCQ 5AE4A 2HZKA 1Y3NA 2ONSA 1H44A 2XXUA 4RYAA 2DWHA 2OZZA 3G3FA 3LSLA 1US5A 2XXPA 4FEBA 3PPNA 4PFTA 2GFEA 1DPPA 3BFTA 2I0BA 3PPOA 4IO3A 4ZZAA 3Q27A 3B6WA 3MVYA 4G2ZA 5H8FB 4ISUA 3R26A 3TODA 5JTYA 1MH4A 2Y7WA 3K02A 3VV5A 3VXCA 4F3PA 1SDXA 5I2KA 3LR1A 3FVKA 2BJJX 2M8CA 4IY5A 3K1MA 3SKPA 2XXRA 4DLDA 2DP8A 2HZLA 2HQ0A 5IAIA 3Q29A 3CSGA 3N6UA 1OLCA 1O63A 1EH3A 1CE2A 1POTA 3A3CA 3EPEA 3G3GA 3SEYA 5DTBA 4BDQA 3W9VA 3H6TA 4O3BA 3TEPA 1BTJA 2QPQA 2A5SA 2D21A 1MQJA 3MZBA 2OK2A 5KCJB 1DSNA 1WODA 2ZMBA 1ATGA 2XXYA 3I3VA 1O7TA 3KFMA 4IO7A 4ELRA 5A5XB 4YKJA 5H8FA 1MPBA 4QFLA 3ZSFA 1MDQA 3H3GA 4F1UA 2DVCA 3FXUA 2NOOA 4Z0IA 5HBCA 3IB1A 4G8HA 2QS4A 3HV1A 3RNNA 4KHZE 2RINA 2VD3A 2DWAA 2HAUA 5HM4B 3HSTA 4POWA 3PUXE 4LATA 4R75A 4FAJA 3K1PA 4LUBA 1SD3A 4H67A 1B7UA 3H6UA 2HCAA 2V25A 4KPTA 2PMSA 5B7DA 1MRPA 4EUOA 4FJPA 5H8NB 1QVSA 3G3JA 2I48A 3MJNA 3VDFA 3IOTA 3TFLA 4H1XA 4NF5B 1PB9A 4N07A 5KCJA 3CI8A 2VGQA 4OEVA 3RY3A 4OQOA 1R9LA 2AL4A 1NH8A 2XXTA 1I6AA 3JV9A 3T9VA 4LZ7A 4RK2A 2F7BA 2O7IA 3M3KA 3PU5A 2DQVA 1UIUA 3FXQA 4MLVA 3T93B 4NTLA 3O6HA 3RUMA 5AA2D 2GRVA 2ZNTA 4GIZA 3HO7A 4PFUA 2Y7RA 4ELQA 4BDNA 2RF1A 3O29A 4GFRA 4I9DA 1Q1KA 4KQPA 5H8NA 3IR1A 3TQLA 1GGGA 1EZPA 5I58A 2F7CA 2O7UA 1B7HA 3LSWA 3UIFA 1HSJA 2DWIA 5L9MA 4EQ9A 4BDRA 4YZZA 4MFIA 5ISUA 3D4GA 2REGA 3KEIA 1VSOA 4OESA 1LB8A 4EF1A 4GF8A 3QYTA 1FQDA 3ODBA 1POY1 1USYH 4TQUQ 4U1ZA 4AQ4A 1LBCA 3H03A 2DOJA 2Q2CA 3TKDA 2DE3A 4AB5A 4F3GA 5ICTA 1MQHA 4M4GA 4F19A 2F8DA 1IUDA 5DVJA 1N7XA 3JZJA 2AYSA 3C35A 5H8HB 1J1NA 4RPOA 2O84X 1JVYA 1LBBA 3FJ7A 3PUWE 4FIMA 4XIGQ 1ZIUA 4QFPA 3I6VA 3SEVA 3FV2A 1MXUA 1SVXB 4F31B 5H8SA 3QAXA 4LQ5A 3TCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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