3O2AA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o2aA02
1YCJA 2DE4A 3K6VA 3H6WA 4NTLA 3S9LC 5CBRA 1DMBA 1NH7A 5A5XB 1L5TA 3C31A 2NVUB 1TT1A 3GLBA 4TLMB 4NF4B 1B7ZA 1IIWA 2XD2A 4FECA 2E1SA 3USDA 1H44A 3VLUA 5B7DA 4GD5A 2XX7A 5KDTA 3FV2A 4YICA 2RINA 4ZEKA 2YJPA 2AL4A 2DP8A 4OQOA 5FHNA 4GLIA 1OQGA 3A3UA 1URDA 2F7AA 1B40A 1N7XA 1R9LA 3RTFB 2OWSA 4EXLA 1PB7A 3OO9A 3PPNA 4EQBA 1XC1A 4DLDA 1M5EA 3MVXA 2XX9A 1SW5A 3KSJA 4FORA 1A99A 1N0TA 1DTZA 4JSDA 2GRVA 1SYIA 3P7IA 1MXVA 3ILUB 3ZSFA 2QRYA 3OO6A 4R6YA 1A7LA 1B7UA 1EU8A 2XXYA 2REGA 4DZ1A 3HV1A 3KJ7A 4PP0A 3HHFA 2OBGA 4NF6B 1SYHA 4H0WA 2AIXA 4M4GA 4U2RA 3QSLA 5HBCA 2GFEA 1NMUA 3QUFA 4G68B 3A09A 1IXHA 3C34A 4XTCQ 4KD5A 4WEDA 5AA4A 2RKMA 5I2KA 2ZMBA 4KR5A 4ELQA 1Y9UA 5M2VA 3H06B 1SQYA 3T9VA 4HTGA 1MS7A 4DCXA 1A8EA 4P11A 4QFPA 3S9EA 5I58A 1QULA 4QSEA 4Q8RA 4ZDMA 5TPAA 3IOWA 1UTHB 3CFZA 5AA2D 1JETA 2ZNTA 1LCFA 2VHAA 4OYVA 4HS7A 3TFLA 4P0GA 4XKPA 1DOTA 1IEJA 4MFIA 3VDFA 4MH5A 1MQGA 4FEDA 4NE4A 5DEXB 4BLAA 3ONMA 4FJPA 2UXAA 2CZLA 2O84X 1LGBC 4GOTA 4JB7A 3K1PA 5DVFA 4G8MA 3U8QA 3MBPA 3HCQA 4QF9A 1LSTA 3MP6A 3WAFA 1M5DA 2UVJA 2P0SA 1MY1A 1D9YA 4G8HA 5HPQA 2UYFA 1MQHA 5L9SA 4ZE8A 1US5A 1B5JA 1B3FA 4EDPA 3C36A 2OZZA 1CE2A 5I56A 4YMAA 1B4HA 1HSEA 4C1UA 1YAEA 2HZLA 4YKJA 4DXCA 4RNSA 5I57A 2ZYMA 2ZXTA 5TP9B 3PV0E 4FIMA 2QSXA 3MVZA 2RCBA 3ZKLA 1JEVA 4MF3A 5AA2A 4ZECA 2Q89A 1OVTA 1P1UA 2DWAA 2UVIA 2PMSA 5H8NA 3SDFA 5I2NA 2NXOA 4YKIA 5K2XA 5AA1A 2XXXA 4ZZAA 4H65A 4OEUA 4UA8A 2V84A 4OERA 4MBPA 3K2DA 1M5BA 1NH8A 3E9XA 2XHDA 1A8FA 1Y4TA 3MVWA 1O7TA 5AA3A 5F7VA 4ND9A 2VP1A 1SBPA 3IX1A 1XVXA 1EZOA 2V25A 4K3FA 1PBPA 1NNFA 1MXZA 1JNFA 3EHUA 2F8DA 3TYHA 3IL1B 3VLVA 4TQUQ 1NNPA 2Q88A 4R74A 1B0HA 2RCAA 1CB6A 2F6PA 3IB0A 1MRPA 2UVGA 1H3DA 4X1DA 1UTBB 4ISUA 1WVJA 2GHAA 3FXRA 2OJTA 3U72A 3MW0A 3SEXA 3QAXA 4OXVA 5KDTB 1F9BA 4F39A 1SW2A 3GXAA 2LAOA 3MC2A 4NWDA 4LP2B 2QMWA 3MPLA 4NEDA 3IOTA 4GL0A 4O3AA 3FUZA 3K6WA 3MP1A 3R7XA 4POXA 4GVOA 3H6UA 2A5TA 3B6TA 2ONRA 4NF8A 3EHTA 1TXFA 1XT8A 1YPNA 5H8QA 5EHMA 1MY4A 4IO4A 1I69A 3KSXA 1B3HA 3W9VA 3S4UA 2QS3A 4N07A 3I5OA 3OXNA 2IEEA 1ELJA 4QFNA 5CM6A 1YTVA 3IAZA 4QFOA 1QKAA 4WEPA 3B6WA 3LSLA 1LFGA 4G68C 1MXYA 3SEYA 3UIFA 3TELA 2XD3A 4G4PA 3Q29A 3VLWA 2F7BA 1LBBA 3H6TA 4F22A 3KFMA 5AE4A 1S50A 4ELPA 1OVBA 4M1VA 2FYIA 3U94A 4JBZA 2P2AA 4KCCA 4LONB 3TMGA 4PQJA 1EZPA 2R6GE 4ZZEA 4NMYA 3UK4A 4O3BA 4IO5A 4EF2A 3FD3A 4OEVA 4DE8A 5TPAB 3C32A 2V3UA 4ZE9A 2Q2CA 1Z7ME 2ESNA 4THIA 2HQ0A 1NNKA 1MM7A 5CRYA 3DM0A 4PETA 1LCTA 1N84A 1ANFA 1OQHA 1D9VA 4JXIA 4X48A 5KZTA 4R9GA 4XKQA 3OEMA 4OESA 1BP5A 1IQ7A 4IY5A 4F3SA 3IB1A 2ONSA 4ELRA 4F2OA 3FIRA 3G3IA 1P1NA 3TTNA 2HFBA 4HCYA 2DXRA 3TTLA 1B3GA 1SVXB 2UVHA 3OSQA 4KYDA 1B4ZA 1US4A 2REJA 2F36A 2Q2AA 3THIA 2X7QA 3QUJA 2PT1A 5I56B 3CG1A 3KN8A 1OLAA 4ZEDA 4O3CA 3I3VA 3FJMA 3CRBA 3E3KA 1FTJA 3T9UA 4H8IA 2Y84A 3O97A 3RTWB 4KYEA 4GQOA 3V5AA 1R9QA 3TQWA 3G3GA 2XXPA 4XIGQ 4H5FA 1R1NA 4XXUA 4RPOA 3KOSA 4H8JA 2VOZA 2I4CA 4C0RA 1DSNA 3RLFE 1B51A 2HAVA 3K4UA 3UGWA 3FATA 1LFIA 3SETA 5H8NB 3H4ZA 2B3BA 1A55A 3PPOA 5I2NB 4GWOA 1VFEA 3IOUA 4YKKA 3E13X 4UACA 3VVFA 3O6GA 2H99A 4JDFA 2WKYA 4OFLA 3TZAA 1IXGA 3FJ7A 1FQEA 3DP4A 4OZ9A 3FXUA 3PPQA 4Q30B 4LZ7A 4OMBA 1RYOA 3U93A 4YAHX 4U22A 3PUZE 4F31B 2Y7IA 2DWHA 1BLFA 5F1QA 1TFAA 3MWBA 4AB5A 4HCWA 3TODA 1I6BA 2Y7KA 4F19A 1SW1A 5JTYA 4I1DA 2YLNA 1LAFE 4GL8A 1ZU0A 3G3JA 1B5HA 2XXIA 2XXUA 2ZYNA 1VSOA 5K2YA 3T96B 1PB9A 3PGFA 3B6QA 4KQPA 4IY6A 5L9OA 3KG2A 1POY1 4XKNA 1Z7NE 3FVGA 1IXCA 3RT8A 1LBCA 2F78A 1S7YA 5DVJA 2I48A 5IKBA 3CFLA 5JEIA 1D4NA 5I59B 4BDNA 2O7IA 2DSFA 4QFLA 1SI0A 1JVYA 4PFUA 3JYRA 2THIA 2UYEA 1FW0A 4U4SA 1OIBA 3MP8A 4NF8B 3U1OA 4GXSB 4EUOA 2RC7A 4DXBA 3PU5A 1HSLA 1PEBA 1NKXA 3R6UA 1GVCA 3MZBA 2DWJA 1P1QA 3N6UA 1N3XA 3M3FA 4QSCA 4IB2A 2O68A 5B70A 2ZNSA 3H03A 1P1OA 4FEBA 3C9HA 1IZ1A 2O7UA 4YU0A 2D21A 2HXWA 2I0CA 3O29A 4XKRA 2I58A 5FHOA 5BUUA 4LQ2A 1Y4CA 2Z22A 4GXAA 3OEKA 2V3TA 3S2VA 5DVIA 2RF1A 2R71A 3FASA 3QXMA 3TTMA 3SKPA 3IB2A 1N7WA 2H9BA 3GBBA 2Q9TA 1J1NA 3KBRA 1LFHA 5DT6A 2OK2A 3VV5A 1MY2A 3ZKKA 1N3WA 5CMMA 1BTJA 4MLVA 4QFKA 3TCGA 4JWXA 2F5XA 3T22A 3IORA 1MG1A 4IGTA 4Z0IA 1M5FA 3EF7A 1B05A 1O63A 1Y3QA 3TDJA 1PB8A 1MDP1 4YB6A 4AB6A 3HHGA 2O6AA 3M3LA 5DTBA 5H8FB 2F34A 3CFXA 3CSBA 4LA9A 3FXQA 2ANJA 3PUVE 4U1ZA 1B5IA 3K01A 3LSWA 3IJXB 4PFWA 1XVYA 1MXXA 5CBSA 3UP9A 1GGGA 3LC8A 3LSXA 4RK9A 4DDDA 2D3IA 3RGYA 3PD9A 4OFOA 2W7YA 2OLBA 3QK6A 3N94A 3EN3A 4EXKA 1ZJLA 2QL3A 2X7PA 4OENA 3LSFB 4ELOA 2CMOA 3RT6B 3K6XA 1JW5A 3T9XB 1AIVA 5HM4B 1UTHA 3RQTA 1RYXA 4QHQA 4N6PA 3LUYA 3C33A 4X1BA 4PFYA 2DOJA 4Q5TA 5IAIA 5ITPA 1Y20A 4YB5A 4RPNA 1MDQA 1JVXA 2DE2A 1AMFA 2GH9A 4LUBA 5ICQA 2G93A 1LAGE 1Q1KA 3CSGA 5ICTA 2RC8A 3AXFA 4KI0E 3DLNA 3HO7A 4G77A 1TWYA 2HEUA 1O64A 3C4MA 3OMBA 4KCDA 3U92A 4LATA 3K00A 1ATGA 4U4XA 2H25A 2V3QA 3FVNA 3N6TA 3FJGA 1AOVA 3S9MC 4R9FA 3OO8A 3TQLA 3SEWA 1XHYA 1BIYA 1B1XA 2QJEA 5AA4B 5I2KB 3V8XB 1USYH 4U21A 1Y1MA 4H1XA 2Y7WA 4EQ7A 3O6HA 5TP9A 1N76A 3H6VA 1H43A 3K1MA 3SERA 3BBRA 3SESA 4H67A 5I58B 1TFDA 1QUJA 3MUQA 1B58A 1EH3A 1MPCA 3JV9A 1FQBA 3G3HA 5CMCA 4JSOA 3TCHA 1QUKA 1NFTA 3CI8A 1NNTA 2I4BA 3F11A 4HW8A 3QIMA 4IO3A 4F1YA 3PUWE 2XXVA 1B0LA 2ZYKA 3TEPA 5H8HA 3SEUA 1MXWA 2YPNA 4R2BA 3RN8A 2F35A 2IA4A 4H5GA 1D3KA 3CVGA 3SEVA 3IO6A 1PBQA 4ZEFA 1LAHE 3MJNA 1H76A 2XXHA 3EHSA 3TTKA 3PMXA 2B3FA 2BJJX 1MM6A 4F18A 1XS5A 2I3VA 1II5A 1VR5A 4GIZA 4DCYA 2VD3A 4ONYA 4TOZA 3BKIB 3A3CA 2I0BA 1ZIUA 3G3KA 2NOOA 1FTLA 3L6HA 4Z7EA 4F1UA 2ZNUA 3Q28A 3O28A 5I57B 2DS9A 1IXIA 3T93B 5L8DA 1UTBA 3PUXE 1LLSA 1PDAA 4AQ4A 4NF5A 1QUIA 3TTRA 3JZJA 5AA2B 2F7CA 3IOVA 2PVUA 3KEIA 2Y7PA 1LAXA 3MVYA 4OTEA 4C1TA 3BFUA 4MLQA 1FTMA 5I84A 1B32A 1FCKA 1GR2A 1LB8A 1B46A 3KN7A 4OVJA 5TU0A 1DPPA 1B3EA 1B3LA 4QSDA 3VE1B 1NL5A 4F1VA 1MPBA 5J1DA 3W15C 4ECFA 2O69A 4OETA 4YKPA 2DYXA 4L17A 1EZ9A 1Y3PA 2DE3A 3MAMA 3T9HB 5KCJA 3HPIA 1FTKA 3OENA 3TUSA 1KWHA 1T0KA 2D5WA 3KN3A 1P1WA 2I49A 3O6IA 5BWJA 2O51A 3O2AA 1B2HA 1IITA 2ZYOA 3RPWA 4E0WA 4F3GA 4EF1A 4OHNA 1MXUA 1B52A 3K0VA 2AL5A 2OWTA 3BFTA 3VVDA 1IUDA 1MPDA 1H45A 2QS2A 5FTIA 2HZKA 2AYSA 1UIVA 1P99A 2F97A 4GRKA 1URGA 5EYFA 3FVKA 4BDLA 4DXUA 1MQDA 3Q27A 5DYHA 3G7WA 3PMVA 4RY1A 4WXJA 2Y7RA 4N13A 2GHBA 1FQFA 3MPKA 1MQIA 3DP8A 2DVZA 3H7MA 1N04A 4FAJA 5CMBA 2OCUA 1S9TA 1AL3A 3DP6A 3ODBA 2O1LA 4IGRA 3VXBA 1ZTYA 2A5TB 3E4RA 1SI1A 5H8QB 3OELA 1FTOA 4DIGA 2G29A 3TKDA 4P0IA 4ZEIA 3FV1A 4FATA 1R6ZA 4LZ5A 4BDOA 1OMPA 2HAUA 1SD3A 3CR9A 5LOMA 4KFQA 3H3GA 1I6QA 4RXLA 4YMBA 4KHZE 1JW4A 4GFRA 1MY3A 1DPEA 4R73A 2ABHA 2M8CA 4RA1A 5FTHA 4U23A 5A5XA 1FQDA 3QYTA 3ILTB 4NF4A 4G8NA 4LZ8A 3L6GA 4R6HA 1ZMGA 5EHSA 4IO2A 3OOAA 1JEUA 2VGQA 4ZS9A 4ESWA 2XXQA 4H6DA 3VVEA 2NWJA 1VE4A 3RY3A 4Q0CA 2A5SA 3MQ9A 4EQ9A 1ZKBA 4YZZA 1SW4A 2XXTA 3VFJA 3DELB 5CMKA 3G3FA 3IJOB 1GV8A 1WDNA 3K02A 2DQVA 3PUYE 3O9PA 4R75A 1URSA 1RKMA 4F29A 2ONKE 5H8HB 2XX8A 3IK6B 4PFTA 3CG3A 3EPEA 4R2FA 3KZGA 3ECRA 2KLFA 2DVCA 2XXWA 2PYYA 1B9JA 1VFDA 2ALUA 2Q8JA 1FQAA 1AH5A 2Z8DA 3O66A 3GZGA 4NF6A 4U1OA 1ZBMA 1A54A 4QRZA 3CIJA 1WODA 1Y1ZA 4G68A 3VXCA 4WKMA 4R6KA 2E0SA 1B1HA 3B7DA 2B65A 1ZLQA 4I8CA 2QPQA 2DWIA 3WAEA 1MH3A 1SDXA 4RYAA 4LQ5A 5FHMA 2F6GA 1BKAA 2V93A 3I6VA 5JK4A 1M5CA 2QS1A 3LR1A 4JWOA 3PMWA 4JWYA 2PX1A 3KOTA 3KGCA 4POWA 5H8SA 1DTGA 4NF5B 3T66A 2H98A 1Y3NA 3FGSA 1FQCA 1GTKA 1UIUA 3FZVA 3W9WA 5I59A 2FA7A 5DEXA 1QKBA 5ISUA 4BDMA 4F3BA 1I6AA 3UA8A 1QVSA 1PC3A 3EQ1A 4FE8A 3V83A 1Q35A 3IO4A 3HN0A 3R26A 2VD2A 1JQFA 1MH4A 4OWDA 2O1MA 5KCJB 1MY0A 3MZ1A 4I62A 1B7HA 2I6EA 4TLLB 2H5YA 2FNCA 1HSJA 1USYE 3IR1A 1POTA 4OFJA 3OO7A 3KJTA 4F2QA 3HSTA 5ITOA 3V89B 3Q26A 2QS4A 4BDRA 4IO6A 3D4CA 4GF8A 4PE5B 4F3PA 4ESXA 5JTYB 3ZS6A 3Q25A 4NWCA 3TPAA 3K6UA 2R9JA 4YB7A 4G2ZA 3PD8A 2QMXA 3C35A 2DXYA 1LB9A 4IO7A 5ELVA 3M8UA 2NUVA 4BDQA 2H4IA 1MQJA 3N26A 3S9NC 1XOCA 3RNNA 3RUMA 1B6HA 4RK2A 4LVQA 3FVOA 1A40A 2PBWA 2X26A 3N5LA 4R72A 3OD7A 2Z8EA 1QJMA 3OSRA 1OLCA 4E0XA 4KPTA 2PT2A 3TAJA 3LBSA 1QW0A 2XXRA 3K1NA 5CI5A 3UN6A 3D4GA 2P1SA 3TCFA 2HCAA 3UORA 3M3KA 2I3WA 2Z23A 3PPRA 4I9DA 4ZEBA 1JW1A 3MZ9A 1UQWA 2Z8FA 5L9MA 2RC9A 5CC2A 4X9TA 5H8FA 4KYSA 4RJZA 3PPPA 3GBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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