The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
GPEGFQYRALYPFRRERPEDLELLPGDVLVVSRAALQALGVAEGGERCPQSVGWMPGLNERTRQRGDFPGTYVEFLGPVALA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structure of the SH3 domain of the phosphoinositide 3-kinase p85 beta subunit
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta
|
| total genus |
21
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4F16 A; 1T0J A; 1CKA A; 1AEY A; 1E6G A; 4OMQ A; 1BK2 A; 2KYM A; 4HVW A; 2FRY A; 2DJQ A; 3IQL A; 1YCS B; 2HEQ A; 2P4R A; 3UA6 A; 3VS1 A; 1WXB A; 2DM1 A; 4FSS A; 4J9C A; 2YT6 A; 1GCP A; 2C0O A; 2DRM A; 3M0P A; 4D8D A; 2J6K A; 1PHT A; 4RTX A; 1WLP B; 2RNA A; 2F2X A; 2O2O A; 2BZ8 A; 4JJD A; 4JJB A; 2KNB B; 1U5S A; 2MIO A; 3NGP A; 2DF6 A; 3VS6 A; 1WIE A; 2PTK A; 3NMZ C; 1YP5 A; 2BTT A; 4LNP A; 4J9G A; 1KIK A; 2LQW A; 1K0S A; 4ORZ A; 2ESW A; 4OML A; 2C0I A; 3M0S A; 4OMM A; 2GGR A; 4CC4 B; 2LJ3 A; 2M0Y A; 4OMN A; 2X3X D; 1S1N A; 1E7O A; 3I5R A; 4X1V A; 4RTY A; 3ULR B; 2DL4 A; 3VS3 A; 1VYU A; 4HXJ A; 1NEG A; 3NHN A; 1WFW A; 3SHW A; 3SEM A; 2F2V A; 2RF0 A; 1WX6 A; 1UG1 A; 2O9S A; 3M0U A; 1M27 C; 2JXB A; 1KSW A; 2K9G A; 2HSP A; 4WCI A; 1VA7 A; 3THK A; 5I22 A; 1ARK A; 4J9E A; 4RTW A; 1T3L A; 1PRM C; 2ENM A; 5EC7 A; 2DYB A; 2J6O A; 1NYG A; 2OAW A; 1TUC A; 4K11 A; 4HVU A; 1AVZ C; 3GBQ A; 2RPN A; 1BBZ A; 2RQR A; 1J3T A; 4OMO A; 1JQQ A; 2PNI A; 1ABO A; 2L2P A; 4AFZ C; 2O88 A; 1K0X A; 2A36 A; 2L3S A; 1JO8 A; 2OI3 A; 5HCK A; 2EYW A; 4Y92 A; 2DL3 A; 5IHN A; 1KFZ A; 4J9I A; 3PE0 A; 3I9Q A; 1UJY A; 2L3P A; 1ZSG A; 3VRY A; 3CQT A; 1T0H A; 2CUB A; 1TUD A; 4RTZ A; 2CSQ A; 3ZL7 C; 1GBQ A; 2JS2 A; 2LZ6 B; 2YUQ A; 1Y57 A; 3VRZ A; 1KJW A; 1AZE A; 3I35 A; 4J9D A; 2AK5 A; 2EYX A; 1BB9 A; 2A28 A; 1HD3 A; 5GJW B; 1SEM A; 4AFQ C; 3REA B; 1TG0 A; 1AWX A; 1HSQ A; 3A98 A; 1B3Q A; 1H8K A; 2JM9 A; 1GCQ C; 4HVV A; 2NWM A; 2VKN A; 4RTU A; 2FPF A; 1E6H A; 3M0T A; 3TSW A; 3VS5 A; 2W10 A; 2HCK A; 1V1C A; 1U06 A; 2LCS A; 1H3H A; 2RQT A; 2ED0 A; 1RUW A; 2F2W A; 1WXT A; 2GNC A; 1SHG A; 2KXD A; 2CH4 W; 2JT4 A; 4GLM A; 3EG1 A; 3EG0 A; 4JJC A; 1VYV A; 2ROL A; 2EW3 A; 1AWO A; 2ABL A; 2L3Q A; 2W0Z A; 1NEB A; 2DLP A; 1ZBJ A; 1NLO C; 2AZS A; 3TSZ A; 3EG2 A; 2KRO A; 1QLY A; 1I07 A; 4GBQ A; 2DBK A; 2YUO A; 1YWO A; 2LX7 A; 2J06 A; 1UFF A; 1QWF A; 1X2K A; 2DNU A; 2CT3 A; 2G6F X; 4IIO A; 2JW4 A; 1WDX A; 2PZ1 A; 4DEX A; 2K2M A; 2KXC A; 3QWY A; 1UGV A; 1PRL C; 4E6R A; 1X2Q A; 3EGU A; 4RTV A; 3KFV A; 2EGE A; 3UAT A; 2GTJ A; 1K4U S; 2D8H A; 1UJ0 A; 1UUE A; 4A63 B; 2L0A A; 2VVK A; 1HJD A; 1A0N B; 1FYN A; 2KT8 A; 1ZUY A; 2V1Q A; 1WA7 A; 2LP5 A; 1JU5 C; 2HBW A; 1G83 A; 2SRC A; 1M30 A; 3M0R A; 2X3W D; 1IO6 A; 1M3C A; 2JMC A; 1UEC A; 3H0I A; 4F17 A; 1X6B A; 2MOX A; 2EKH A; 1X43 A; 2EGA A; 2KE9 A; 1OV3 A; 3EHR A; 1QCF A; 1GRI A; 4R0K A; 2RQV A; 2V1R A; 1X27 A; 1SRL A; 1NYF A; 1SHF A; 2KYB A; 3LH5 A; 2GQI A; 2IIM A; 2AKL A; 3UF4 A; 2FPD A; 3H0F A; 3VS4 A; 4LUD A; 2BZX A; 2FO0 A; 1GBR A; 2AKK A; 1UDL A; 4RUG A; 2RN8 A; 2H8H A; 1VYT A; 2LNH B; 2DIL A; 1QKX A; 1NM7 A; 1CKB A; 1I0C A; 2K7A A; 2D1X A; 2O9V A; 4LN2 A; 1JXM A; 1W70 A; 2EGC A; 4Z89 A; 1AWJ A; 4JZ4 A; 2CT4 A; 2EVR A; 2E5K A; 1AZG B; 1LCK A; 2SEM A; 2BZY A; 1K76 A; 5L23 A; 2D8J A; 2LQN A; 2FPE A; 2EBP A; 4J9H A; 2YUN A; 1XOV A; 2C0T A; 4LE9 A; 1U3O A; 1MV0 B; 2DMO A; 2O31 A; 1UTI A; 1ZLM A; 1ZUU A; 2A08 A; 3H0H A; 2KT1 A; 1ABQ A; 1SPK A; 2KRM A; 1X6G A; 2YSQ A; 4OMP A; 2JS0 A; 4Z8A A; 1Y0M A; 5ECA A; 1PKS A; 1X69 A; 1UHF A; 1RI9 A; 1PNJ A; 1PKT A; 1WXU A; 1GFD A; 2I0N A; 4IIM A; 3QWX X; 2MCN A; 1UE9 A; 4AFS C; 1GFC A; 4CC7 A; 1M8M A; 2GBQ A; 1EFN A; 5IHK A; 3M0Q A; 2EYZ A; 4J9B A; 5FW9 A; 1M3B A; 1MV3 A; 4AG1 C; 5I11 A; 1MUZ A; 4QT7 A; 4D8K A; 2LJ0 A; 3REB B; 2OJ2 A; 1CSK A; 2DBM A; 2KGT A; 3PVL A; 2CH4 A; 1PWT A; 2QDL A; 2J7I A; 2XMF A; 4EIK A; 2ECZ A; 3FJ5 A; 4F14 A; 3U23 A; 4DEY A; 4KRT A; 1BU1 A; 2GTO A; 2K79 A; 4M4Z A; 4HCK A; 2J05 A; 4Z88 A; 3VS0 A; 1OPK A; 2RMO A; 2K3B A; 1JEG A; 2FEI A; 5FWC A; 2CUD A; 1OOT A; 3UA7 A; 3EHQ A; 2JMA A; 1QKW A; 2KBT A; 4J9F A; 1W6X A; 3PVQ A; 2EYY A; 2VWF A; 1JXO A; 2KRS A; 3JV3 A; 1YNZ A; 2DL8 A; 2EPD A; 2DE0 X; 3VS7 A; 5FWB A; 1YN8 A; 1Z9Z A; 1B07 A; 2DL5 A; 3RBB B; 2NUZ A; 2FRW A; 1OEB A; 2JTE A; 5IHI A; 3RNJ A; 2DL7 A; 1K9A A; 5IH2 A; 3C0C A; 2M51 A; 4CC3 A; 2J6F A; 1Z9Q A; 1SSH A; 2D0N A; 4AG2 C; 1ZUK A; 1AWW A; 3EG3 A; 5IXF A; 3NPF A; 1W1F A; 2LJ1 A; 2HDA A; 3VS2 A; 5GJV B; 2CRE A; 2ROT A; 1ZX6 A; 4CC2 A; 1WYX A; 1K1Z A; 3R6N A; 2DVJ A; 1G2B A; 4ZNX A; 2LMJ A; 5IXB A; 1GL5 A; 1RLP C; 3I5S A; 2DRK A; 2B86 A; 1QWE A; 4JZ3 A; 4AFU C; 1GCQ A; 1UHC A; 2RQW A; 2KR3 A; 1AD5 A; 1YWP A; 2K6D A; 3O5Z A; 2ED1 A; 3TVT A; 1SRM A; 2DA9 A; 2CSI A; 2DX1 A; 2YUP A; 1N5Z A; 2KEA A; 4JPB W; 2YDL A; 2JM8 A; 1WI7 A; 1RLQ C; 3H41 A; 1FMK A; 4LUE A; 1H92 A; 2CDT A; 4RTT A; 1AOJ A; 2KRN A; 1NG2 A; 2FG0 A; 1OPL A; 2RQU A; 1NLP C; 4ESR A; 1I1J A; 2AZV A; 2EQI A; 1T3S A; 1M3A A; 2A37 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CC7 A; 5KYU B; 1JJ2 S; 1MMA A; 3NTH A; 1AEY A; 2XDD A; 1VQ5 A; 4JRK A; 2KYM A; 1G3W A; 2HEQ A; 3I55 A; 1Q7Y C; 4XU1 A; 4FSS A; 4E2F B; 2ZPH B; 1PD0 A; 3N5B B; 2J6K A; 4PJJ A; 1KQ1 A; 1OU9 A; 2DZC A; 1M2V B; 2I2L A; 2YRD A; 2O2O A; 2BZ8 A; 2KNB B; 2DK3 A; 1QVF A; 1QMC A; 2DF6 A; 4VUB A; 3L2W A; 3NMZ C; 4QQD A; 2HBP A; 2BTT A; 5GAM e; 1LJO A; 4XTU A; 2KVQ G; 4IUV A; 5EG2 A; 3VYH B; 4ORZ A; 2K3Y A; 3JCM e; 4FT2 A; 4M75 C; 5KYX B; 3CD6 T; 4F04 B; 3CMA Q; 2V8K A; 4FYX B; 4C5E A; 1M90 R; 2DL4 A; 1VYU A; 1WHJ A; 2A0F B; 2O9S A; 3M0U A; 2JXB A; 5CKH A; 3TCJ A; 2E4H A; 3CCM A; 4FSX A; 1T3L A; 1K8A C; 4M77 B; 3VU3 C; 3E1S A; 1Q95 G; 1GXI E; 4HCB A; 1KQS P; 3MHX A; 4JDS A; 1XNI A; 1VQ6 Q; 1MND A; 2YLB A; 1NYG A; 4II1 A; 4EMK A; 1VQN A; 4K11 A; 4AT1 B; 3CCJ A; 1K9M U; 3V7S A; 2RQR A; 2LQ8 A; 3D7S B; 4OMO A; 2Z0W A; 2E3I A; 5HKC A; 3OBY A; 2L2P A; 4Q5W A; 3JRZ A; 3G6E T; 2A36 A; 1K0X A; 2L3S A; 2OI3 A; 2EYW A; 3OYN A; 2DL3 A; 4BAC A; 1B34 B; 1UJY A; 2MAM A; 2L3P A; 2COW A; 3L2U A; 4LDW A; 1YHQ Q; 4M7D G; 3VRY A; 3CQT A; 2VYT A; 1T0H A; 2CUB A; 3OS5 A; 1K73 C; 2JN0 A; 2JS2 A; 3CBP A; 4DBQ A; 1Q81 U; 5GAM g; 2D6F A; 2YUQ A; 2HZY A; 4QVD A; 3E19 A; 3OYY A; 2GFA A; 3I35 A; 2EYX A; 2A28 A; 2E3H A; 4J5Y A; 3ZFJ A; 3BDU A; 3OYK A; 1SEM A; 1TG0 A; 3A98 A; 2PVO B; 1N8R R; 1B3Q A; 1H8K A; 3CCE T; 5GAN 5; 1VQL Q; 1GCQ C; 4C8Q E; 3OW2 P; 3C95 A; 2VKN A; 2F5T X; 2LNV A; 4RTU A; 2FPF A; 3CCU A; 1E6H A; 2W10 A; 3JB9 I; 3JB9 J; 3L42 A; 5KCH A; 1H3H A; 2RQT A; 5IN1 A; 2RK1 A; 1Y07 A; 5M9O A; 2KY9 A; 3M58 A; 1KC8 U; 1M1G A; 5D6W A; 4E7I A; 4JJC A; 3CCJ T; 3E9G A; 4C92 D; 2ABL A; 1KQ2 A; 2QTV A; 3FC3 A; 2YHT A; 3QDF A; 3EFR A; 1UB4 A; 1KD1 C; 3EG2 A; 3QXE B; 1QLY A; 1IXD A; 4GBQ A; 5GAM h; 3CCQ A; 1YWO A; 1MMD A; 3JCM h; 2CZ7 B; 4A4K A; 1UFF A; 3DB4 A; 2DTI A; 2ZPI B; 2DNU A; 1VQP Q; 1XTD A; 4DOW A; 3MPU B; 4LD6 A; 1M8V A; 4IIO A; 4QKU A; 5J39 A; 2JW4 A; 4M75 E; 1YIJ A; 4IUU A; 2PZ1 A; 2CS7 A; 4DEX A; 2K2M A; 1UGV A; 4C92 C; 2K5F A; 2COY A; 1UJ0 A; 2FB7 A; 2E1H A; 4M7D A; 4MZM A; 2L0A A; 1M2O A; 2XG8 D; 4C5I A; 3CBO A; 3EAE A; 4OGC A; 2OTL A; 2X4J A; 1ZUY A; 2XK0 A; 3E9F A; 1YJ9 T; 5GAN 8; 3RR6 A; 2RHZ A; 1G83 A; 2XHC A; 1Q82 C; 1X75 C; 1IO6 A; 1M3C A; 2RI3 A; 5GMK j; 4HCZ A; 3H0I A; 1UEC A; 4PJO F; 2DIQ A; 8ATC B; 1X43 A; 2M0O A; 3EHR A; 2P0Q A; 2RQV A; 2QA4 Q; 2O4X A; 1BCM A; 1SRL A; 1NYF A; 1WQW A; 2KYB A; 4J6W A; 2GQI A; 2KDS A; 4M7A F; 3UF4 A; 2FPD A; 2CP3 A; 2NUP A; 4LUD A; 2AKK A; 1UDL A; 1H64 1; 2H8H A; 1K9M R; 2LNH B; 2MF2 A; 3UDC A; 2LDM A; 1TWB A; 3GP8 A; 1QKX A; 4PKC C; 2D1X A; 4LDX A; 1D3B A; 4O5V A; 2DD5 A; 4LD9 K; 1TOV A; 1OU8 A; 4Z89 A; 3M56 A; 5KYW B; 4BE2 A; 3JCM P; 3OYH A; 2EVR A; 3I56 Q; 1RAA B; 1K76 A; 5D6X A; 5KYY B; 2OTL T; 1Q81 R; 4HCC A; 2YUN A; 1XOV A; 4LE9 A; 2DO3 A; 2A08 A; 3LW5 E; 4A4E A; 1D1A A; 1XJW B; 2L89 A; 1UGP B; 3M5A A; 1Y0M A; 4WF2 A; 3EGX B; 3GLX A; 1PKS A; 1X69 A; 1UHF A; 3DLM A; 1RI9 A; 3MCA B; 4XTV A; 1PKT A; 1RAH B; 1VIE A; 1WJS A; 2BIV A; 2MWO A; 2ZPE B; 3ME9 A; 4E7H A; 3OMC A; 1S72 Q; 1GFC A; 1KC8 R; 4E7L A; 4PJO B; 3QYH B; 1YJN Q; 5IHK A; 3CMA A; 3CME T; 2GF7 A; 2EYZ A; 3DB3 A; 5FW9 A; 1MV3 A; 1ZA1 B; 1G3S A; 1QCO A; 2KGT A; 2QQ9 A; 3PVL A; 4M7A B; 4C92 E; 4PJL A; 1HK9 A; 5GAN 4; 5IT9 E; 3CPW P; 1RAG B; 1XQH A; 1ZSZ A; 4XTW A; 5GAO l; 3CCS T; 1YIT A; 4KRT A; 2LT4 A; 4JRQ A; 1R8O B; 2JTM A; 4Z88 A; 3VS0 A; 1OPK A; 2K3B A; 2CUD A; 3JB9 G; 3EHQ A; 1QKW A; 4J9F A; 1UGR B; 3PVQ A; 5GAO r; 2FZK B; 2IVW A; 4XTY A; 1WNL A; 1YN8 A; 4N0A C; 4OB0 B; 3TRE A; 2NUZ A; 4NS5 A; 5IHI A; 3J80 E; 1K9A A; 1RAC B; 2AHJ B; 1YHQ A; 2D9T A; 1OUL A; 5IXF A; 1VQK A; 2CRE A; 2K4Y A; 1ZX6 A; 3FDR A; 2WSE E; 3L2R A; 1K1Z A; 4KGZ B; 2BUD A; 3R6N A; 1VIF A; 2QG9 B; 1M90 C; 5CCA A; 3CCE Q; 4JZ3 A; 3CCV Q; 2DXT A; 1VQL A; 1YWP A; 2K6D A; 3TVT A; 2ED1 A; 2DER A; 1QP3 A; 1YIT T; 3QHS A; 2DX1 A; 3SWN A; 1N5Z A; 3PFS A; 4KBM B; 4JPB W; 2YDL A; 1PSF A; 2EQU A; 1PSE A; 4B6M A; 4JRP A; 1YBY A; 1KQS S; 2ZPG B; 1ZBX A; 3OS1 A; 4NL2 A; 3X26 B; 2O01 E; 3PTA A; 2KRN A; 2CGH A; 3V8K A; 4ESR A; 1I1J A; 1JBM A; 2EQI A; 1T3S A; 1TS9 A; 3OQ5 A; 4C92 B; 2JOY A; 2CKK A; 4IUT A; 4HVW A; 5FU6 B; 2FRY A; 4M77 G; 2DJQ A; 3IQL A; 4M78 E; 1YCS B; 2P4R A; 3JCM Q; 2DM1 A; 1VQK T; 4OGE A; 4V2S A; 3M0P A; 4D8D A; 2NUT B; 1WQ7 A; 3RKY A; 1PHT A; 1FX7 A; 5KYU A; 1WLP B; 4JJD A; 1IGQ A; 4JJB A; 4X34 A; 3NGP A; 4BE0 A; 2FL7 A; 4JUV A; 4ZGJ B; 2PTK A; 1JRI A; 2X35 A; 3SD4 A; 3HHT B; 4E47 A; 1SF9 A; 1N8R C; 1VQ9 Q; 3JCM d; 2P0K A; 4J9G A; 1KIK A; 1M2V A; 3OW2 S; 4GLK A; 1Q86 R; 4OML A; 3RES A; 4QVC A; 2BE7 D; 3M0S A; 3DLL A; 2GGR A; 2RI2 A; 2LJ3 A; 2M0Y A; 4Z02 A; 5GMK e; 4N4H A; 4OMN A; 2X3X D; 4ELY C; 3I5R A; 1E7O A; 3MP8 A; 3CCL Q; 2HKN A; 3NHN A; 3HFN A; 2RF0 A; 1WX6 A; 1UG1 A; 3CC2 Q; 1BYM A; 5GAN f; 2HSP A; 1VA7 A; 5KYX A; 2AIR B; 2CP0 A; 2EJG A; 1PRM C; 1TSF A; 2BKD N; 4IUR A; 2K2V A; 4ANJ A; 2J6O A; 3JAM E; 3PIP A; 5IAY A; 3VJP A; 3VYG A; 3TU4 K; 3PGG A; 4FL6 A; 3CCR Q; 1TUC A; 2QQR A; 3MEV A; 5L8R E; 2PNI A; 4C5G A; 1F1B B; 4M77 A; 2LCL A; 1I4K 1; 3I56 A; 3QSU A; 5IHN A; 3P8H A; 3L2Z A; 3I9Q A; 3S6W A; 4C8Q D; 2JVV A; 1ZSG A; 3BFM A; 2OAU A; 4JJN K; 5LJ5 f; 3X24 B; 5LJ3 f; 3CEY A; 3ZL7 C; 2VV5 A; 3G4S Q; 2ZAE A; 4EMK C; 3VRZ A; 4OF1 A; 1AZE A; 1B34 A; 2FYK A; 2EJF A; 3SDZ A; 1HD3 A; 4AFQ C; 1WZO A; 1HSQ A; 1O75 A; 2JM9 A; 4HVV A; 4C8Q C; 3TSW A; 4KH0 B; 3EFO B; 1ACM B; 2OTJ Q; 2RHU A; 5LJ3 e; 1YJW Q; 1K9M C; 4M75 D; 4C0D B; 4KGV B; 1SHG A; 2EQJ A; 2KXD A; 4XU0 A; 4ZGD B; 3EG0 A; 3V7C A; 2RB6 A; 1AWO A; 2W0Z A; 4FYY B; 2PVG B; 3CC4 T; 3CCS Q; 1NLO C; 4PL6 A; 1QVG A; 2ZGW A; 4B9W A; 1I07 A; 2LX7 A; 5J3B A; 3GF5 A; 3LYI A; 1ZQ1 A; 4YTL A; 3H6Z A; 5GMK h; 1Q81 C; 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