The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
|
sequence length |
82
|
structure length |
82
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Chain Sequence |
GPEGFQYRALYPFRRERPEDLELLPGDVLVVSRAALQALGVAEGGERCPQSVGWMPGLNERTRQRGDFPGTYVEFLGPVALA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structure of the SH3 domain of the phosphoinositide 3-kinase p85 beta subunit
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
21
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LCK A; 1SHG A; 2I0N A; 4DEY A; 4GLM A; 2L3P A; 2LJ1 A; 4CC4 B; 2KR3 A; 1UGV A; 3REB B; 3I5S A; 3ULR B; 2CSI A; 3NPF A; 1ABO A; 1RI9 A; 2LZ6 B; 2A37 A; 2RMO A; 2KGT A; 4LE9 A; 4HXJ A; 4CC3 A; 1X6B A; 2J6O A; 1GCQ A; 4RTU A; 1GL5 A; 2KBT A; 2DBK A; 1I0C A; 3M0U A; 2AZS A; 1K0X A; 2F2V A; 2KYM A; 2QDL A; 1AZG B; 3THK A; 2K3B A; 5FWB A; 2EGE A; 1SRM A; 1CKA A; 1B3Q A; 1VYU A; 2DRM A; 2KYB A; 4JJB A; 2KNB B; 2ED1 A; 3TSZ A; 2RN8 A; 2NUZ A; 3VS5 A; 2LQN A; 2LQW A; 1GBR A; 1N5Z A; 3EG1 A; 2C0T A; 1W6X A; 2M0Y A; 1AWJ A; 1SEM A; 1MV0 B; 2J6K A; 4CC7 A; 2OI3 A; 1M27 C; 2DA9 A; 3IQL A; 1RUW A; 1KFZ A; 1GBQ A; 1NEG A; 2D8H A; 3EG0 A; 1QWE A; 2L2P A; 1K76 A; 2YDL A; 2KRS A; 2K2M A; 1GFC A; 2KE9 A; 3UF4 A; 2J6F A; 1ARK A; 1WFW A; 1IO6 A; 1UTI A; 1I1J A; 2BZX A; 2KRM A; 4AFQ C; 1KSW A; 2EBP A; 4AFZ C; 3VS4 A; 1VA7 A; 1WX6 A; 1QKW A; 2RF0 A; 1SSH A; 1XOV A; 1PNJ A; 1WIE A; 4R0K A; 1B07 A; 1NG2 A; 2EYX A; 2PTK A; 3VS3 A; 5GJW B; 1I07 A; 1ZUK A; 2YUP A; 3QWY A; 4HVV A; 3H41 A; 1NYG A; 2RQV A; 3TVT A; 5IXB A; 3EHR A; 1WLP B; 2YT6 A; 3M0S A; 1JEG A; 1WXB A; 2ESW A; 2DX1 A; 1K1Z A; 2J7I A; 1WA7 A; 2A08 A; 1BB9 A; 4QT7 A; 1RLQ C; 2EYY A; 2GTO A; 1OOT A; 2BTT A; 1YWO A; 1UHF A; 1OPK A; 2FRW A; 1AWW A; 2PNI A; 3CQT A; 2DM1 A; 5GJV B; 4KRT A; 5HCK A; 1BK2 A; 2F2W A; 3RNJ A; 1MUZ A; 1Z9Z A; 1M3A A; 1UEC A; 1AOJ A; 2ENM A; 2X3W D; 4J9E A; 4LUD A; 1M30 A; 2B86 A; 3UAT A; 1YN8 A; 1M8M A; 4IIO A; 2J06 A; 3GBQ A; 3NHN A; 4ZNX A; 2D0N A; 2VVK A; 2OAW A; 2MCN A; 1Y57 A; 1PRL C; 1YWP A; 1AVZ C; 1UUE A; 2CH4 A; 1BBZ A; 1UJY A; 2XMF A; 2KXD A; 1UHC A; 1G2B A; 2LJ0 A; 2RNA A; 4RUG A; 3VS2 A; 4J9C A; 2DF6 A; 1KIK A; 4ESR A; 1Y0M A; 1EFN A; 2DE0 X; 2RQW A; 2HDA A; 2GQI A; 2VWF A; 3M0P A; 4F14 A; 2C0O A; 4D8K A; 1OPL A; 2D8J A; 1HJD A; 3H0I A; 2FG0 A; 1VYT A; 1JO8 A; 1W1F A; 4HVU A; 2H8H A; 3C0C A; 1QWF A; 1UG1 A; 1X2K A; 1QKX A; 2MIO A; 2JT4 A; 2DL3 A; 1RLP C; 1UDL A; 3VRY A; 2K6D A; 4RTT A; 2V1Q A; 4F16 A; 3PE0 A; 2JMC A; 1VYV A; 2EW3 A; 4JJC A; 4OML A; 1AZE A; 4J9B A; 1SPK A; 2L3Q A; 1GCP A; 1M3B A; 3M0R A; 4J9D A; 1J3T A; 3TSW A; 1E6H A; 2GTJ A; 4AFS C; 4JZ4 A; 2HCK A; 2JTE A; 5FWC A; 2AKK A; 2HEQ A; 1YNZ A; 1WXU A; 2K9G A; 2DLP A; 1FMK A; 2CRE A; 1T3S A; 2DMO A; 2EGA A; 2KT8 A; 4JJD A; 1ZBJ A; 4RTV A; 1YP5 A; 1NEB A; 1CSK A; 2JS2 A; 1V1C A; 2YSQ A; 2DL4 A; 2ROT A; 1X2Q A; 3RBB B; 5IHK A; 4IIM A; 1WYX A; 1WDX A; 2LJ3 A; 1QLY A; 4OMM A; 3QWX X; 4J9H A; 4OMP A; 4J9I A; 2CSQ A; 1Z9Q A; 3UA6 A; 4EIK A; 2DIL A; 4OMQ A; 2BZY A; 3VS0 A; 2AKL A; 1JXM A; 2A28 A; 2L3S A; 2ABL A; 3VS6 A; 1YCS B; 2JXB A; 2LNH B; 2JS0 A; 2OJ2 A; 1T0J A; 1OEB A; 1JU5 C; 2CH4 W; 2KRN A; 3I9Q A; 2DL8 A; 3PVQ A; 2PZ1 A; 1HSQ A; 1T0H A; 2O9V A; 1S1N A; 1U3O A; 4Z8A A; 2AZV A; 2K7A A; 2EGC A; 2CT4 A; 1KJW A; 3NMZ C; 4J9G A; 2W0Z A; 2P4R A; 2DJQ A; 1GRI A; 4OMN A; 5I11 A; 1ZX6 A; 4OMO A; 5ECA A; 2EYZ A; 4AG1 C; 2LCS A; 2K79 A; 4JPB W; 3KFV A; 5I22 A; 3EG2 A; 1UFF A; 1E7O A; 1SRL A; 2GGR A; 1TG0 A; 2IIM A; 3I35 A; 2DL7 A; 1H92 A; 1E6G A; 4ORZ A; 1NM7 A; 5IH2 A; 1UJ0 A; 1OV3 A; 1H3H A; 3ZL7 C; 2JMA A; 3SHW A; 4Z89 A; 3UA7 A; 1U5S A; 2A36 A; 5IXF A; 2AK5 A; 2LX7 A; 5L23 A; 4K11 A; 2FEI A; 5IHN A; 3EG3 A; 2EQI A; 1U06 A; 2G6F X; 4A63 B; 3A98 A; 4DEX A; 1PRM C; 3H0H A; 2L0A A; 2CUD A; 2CUB A; 2RQT A; 1NLP C; 3I5R A; 1X69 A; 3O5Z A; 2EVR A; 4GBQ A; 5EC7 A; 2MOX A; 2FPD A; 2NWM A; 3M0T A; 5IHI A; 1ABQ A; 4LUE A; 3VS7 A; 3EHQ A; 1QCF A; 1X27 A; 2EPD A; 2FO0 A; 2LMJ A; 2W10 A; 1WXT A; 2YUO A; 2D1X A; 2EKH A; 1ZSG A; 1JQQ A; 2FRY A; 1AEY A; 1W70 A; 2RQU A; 3H0F A; 1NLO C; 2LP5 A; 1M3C A; 1HD3 A; 2KRO A; 2CT3 A; 4Y92 A; 1UE9 A; 4RTW A; 4FSS A; 2J05 A; 1ZUY A; 1A0N B; 2E5K A; 2SRC A; 2O88 A; 2YUQ A; 3M0Q A; 1H8K A; 1PKS A; 2O9S A; 3VRZ A; 1AD5 A; 4JZ3 A; 2JM8 A; 2JM9 A; 4AG2 C; 2KXC A; 2ED0 A; 3U23 A; 2YUN A; 1X6G A; 1JXO A; 2HBW A; 1WI7 A; 2DYB A; 1ZUU A; 4CC2 A; 4RTX A; 4E6R A; 1BU1 A; 4F17 A; 1MV3 A; 4Z88 A; 2F2X A; 2EYW A; 4X1V A; 2KEA A; 2GBQ A; 1AWO A; 4D8D A; 2M51 A; 1CKB A; 2GNC A; 1K0S A; 2HSP A; 4M4Z A; 1GFD A; 1TUD A; 2DL5 A; 4WCI A; 2FPE A; 4LNP A; 4HCK A; 4AFU C; 1G83 A; 2RPN A; 4HVW A; 2RQR A; 2SEM A; 3EGU A; 3NGP A; 2DVJ A; 4LN2 A; 1NYF A; 3VS1 A; 2DRK A; 4J9F A; 2FPF A; 2DNU A; 3JV3 A; 1PKT A; 1X43 A; 3REA B; 2C0I A; 2BZ8 A; 3R6N A; 2ROL A; 4RTY A; 2X3X D; 2JW4 A; 2V1R A; 1TUC A; 5FW9 A; 1SHF A; 2O31 A; 2VKN A; 3SEM A; 1PWT A; 1FYN A; 1K9A A; 3FJ5 A; 2KT1 A; 1T3L A; 2DBM A; 3PVL A; 1ZLM A; 1GCQ C; 2CDT A; 4RTZ A; 1PHT A; 1K4U S; 3LH5 A; 2O2O A; 2ECZ A; 1AWX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3J7A F; 1SHG A; 2I0N A; 3CCL T; 4CC4 B; 1KHC A; 1UGV A; 1IB8 A; 3I5S A; 3ULR B; 2CSI A; 3MEA A; 2VV5 A; 1ABO A; 4DBF A; 2L89 A; 1VOM A; 2RMO A; 1KQS P; 2KGT A; 1KQ2 A; 2J6O A; 1C6V X; 2KBT A; 1I0C A; 1QCN A; 2MWP A; 2AZS A; 1VQK A; 3DKM A; 1SSF A; 2QDL A; 5CO7 A; 1YHQ A; 2NLU A; 2K3B A; 5KYY B; 4NL2 A; 2HBP A; 5GAN e; 2F69 A; 3RES A; 4KUL A; 3V8K A; 4JJB A; 1QP2 A; 3HSB A; 1YI2 A; 5I21 A; 3SB2 A; 5DLO A; 2LQN A; 4MDW A; 3RR6 A; 1W6X A; 2QQA A; 2ZCF B; 1MV0 B; 2K57 A; 2J6K A; 4CC7 A; 2OI3 A; 2DTH A; 3CD6 Q; 2JOY A; 1GBQ A; 5HY6 A; 1VQ4 Q; 4M78 C; 4C5I A; 1R0C B; 5LJ5 e; 2YDL A; 2ZPB B; 4B6M A; 1VQM Q; 5GAN 5; 3HPW A; 3CCR T; 1GFC A; 2KE9 A; 3UF4 A; 3CCV T; 3L2Q A; 1ZQ1 A; 1RAB B; 4KUD K; 2X4J A; 2HQE A; 2ATC B; 3CCM A; 4IUV A; 3OSS C; 1VA7 A; 1YIJ Q; 3G71 Q; 1VQ6 A; 4BUG A; 2MK5 A; 1IRX A; 1SSH A; 3JB9 F; 2CP3 A; 4M78 E; 1XOV A; 4R0K A; 1B07 A; 3CCQ Q; 1RAD B; 1RAA B; 3OMC A; 3P8D A; 3I55 T; 1G3Y A; 5CKE A; 1BIB A; 5GJW B; 2MYS A; 2OTJ Q; 5GAN 7; 1B7T A; 3QWY A; 4O5V A; 8AT1 B; 3G6E Q; 5IXB A; 2M02 A; 3RKW A; 4M7D C; 5KCO A; 3JCM Q; 2E64 A; 3QYH B; 5GAN 3; 4QT7 A; 1D09 B; 1EIF A; 1YWO A; 4Z02 A; 2JNG A; 2NUP A; 2PUO B; 3BFM A; 3CCJ T; 3VV0 A; 2DM1 A; 4KRT A; 5GAO q; 3CC2 T; 3JCM d; 4WTO B; 2ENM A; 2R5M A; 4M7D E; 1M1G A; 3MCA B; 3GBQ A; 2EQM A; 5L8R E; 3WXM B; 1YWP A; 1AVZ C; 4LDW A; 2RM4 A; 2DZ9 A; 1BBZ A; 1KD1 U; 3OYI A; 3JCM h; 1UHC A; 2Y90 A; 1VQM T; 3L2Z A; 4M7D D; 2LJ0 A; 3EGD B; 1AHJ B; 3JCM X; 3QII A; 4J9C A; 3EGX B; 4J8O A; 1Y0M A; 1K9M U; 1IZ6 A; 4M77 A; 5GAM f; 5GAN 2; 2P4T A; 4F14 A; 2C0O A; 5D6W A; 4J83 A; 4C0D C; 2P0K A; 4A4K A; 3H0I A; 3HL8 A; 1W1F A; 1WZO A; 1YI2 Q; 4PLI A; 2H3E B; 2MIO A; 2KAF A; 5LL6 S; 1I4K 1; 2K6D A; 1VQP A; 1WGS A; 2DFU A; 3PE0 A; 2MI6 A; 5GAO r; 2EJF A; 4FCY A; 4C5H A; 2CP0 A; 2IVW A; 1BI3 A; 1M3B A; 4C92 B; 1VUB A; 4MZM A; 3AT1 B; 1E6H A; 3PT9 A; 4AFS C; 1YIT A; 2ZGW A; 4PL6 A; 3T9N A; 1RAC B; 3M58 A; 4E7H A; 1YNZ A; 4C5E A; 3CCM Q; 2DLP A; 3QDR B; 3QZ5 B; 2CRE A; 2QYZ A; 4J5Y A; 2JZ2 A; 3M55 A; 4NOY A; 4P5N A; 5IHK A; 2VXE A; 1TU0 B; 2LJ3 A; 5LJ3 e; 5CAI A; 4LXC A; 3QWX X; 5GAN 6; 2CSQ A; 4E7S A; 1VQ7 A; 2Z0W A; 1OU8 A; 3OYD A; 1G3T A; 3EH2 A; 3JRZ A; 2L3S A; 2E4H A; 3VS6 A; 1K73 C; 4OF1 A; 1QVG S; 2OJ2 A; 3OW2 S; 3GLX A; 4FSX A; 2RHX A; 3LH0 A; 2H3J A; 2DL8 A; 2PZ1 A; 4F7U F; 2MF2 A; 4C8Q G; 4Z8A A; 1WQ7 A; 4KH1 B; 3A5Z B; 1VQK T; 4F7U B; 3NTK A; 1OI1 A; 3FLG A; 3OYH A; 2W0Z A; 1YHQ T; 2DJQ A; 5I11 A; 4PJL A; 2JVV A; 1OX9 A; 3KFV A; 3RDV A; 4IUR A; 4BY6 B; 1E7O A; 3TU4 K; 3JCM e; 2GGR A; 2E6N A; 1H92 A; 1E6G A; 3BY7 A; 2B8A A; 2DZC A; 3OS1 A; 5GAN 4; 2DIG A; 3CCE Q; 4FYX B; 1OV3 A; 4R56 A; 4M7A G; 4RCC A; 1WHG A; 2DXB A; 2EFI A; 3SHW A; 4PFO A; 5IXF A; 2OTL A; 4OP0 A; 4BE1 A; 4K11 A; 3RKY A; 3EG3 A; 2EQI A; 1U06 A; 4DEX A; 4X34 A; 1PRM C; 3H0H A; 2CUB A; 3MPU B; 1R77 A; 2MMP A; 3CCM T; 5D7U A; 1V76 A; 3MKD A; 1RL2 A; 4GBQ A; 3JSC A; 3OQ5 A; 5EC7 A; 2MOX A; 2K3X A; 1GXI E; 2DIQ A; 2AIR B; 1VQ6 T; 1Q86 C; 1TH7 A; 1UB4 A; 2HD0 A; 5GMK j; 4JRQ A; 2FO0 A; 2XI9 A; 2QI2 A; 2JN0 A; 4JLG A; 2LMJ A; 3CPW S; 1RAF B; 1Q7Y C; 4BI4 A; 1TXQ A; 2D1X A; 2HL5 C; 1VQP Q; 1JQQ A; 2FRY A; 2P0P A; 2QA4 A; 1W70 A; 3H0F A; 1BI2 A; 2VAS A; 1NLO C; 2VB6 A; 3VYG A; 2LP5 A; 1KK7 A; 7AT1 B; 2FZK B; 1JJ2 A; 4E7L A; 2KRO A; 1UGQ B; 2CS7 A; 5GAM d; 2PVG B; 1UE9 A; 3HKS A; 1R8O B; 2XDP A; 2DVE A; 1YIT Q; 4KT0 E; 2SRC A; 2Y4X A; 2O88 A; 2YUQ A; 3M0Q A; 4N4H A; 2O9S A; 3EG9 B; 1PSE A; 1TWB A; 4DBR A; 1QCO A; 1ZSZ B; 3V7C A; 3CC4 T; 3M54 A; 3U23 A; 3QXE B; 4XAX B; 1JXO A; 5KYX A; 4N0A A; 1ZUU A; 4RTX A; 2GCX A; 2FB7 A; 4Z88 A; 3LLR A; 1LVK A; 2D9T A; 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2L2P A; 3E9F A; 4WF2 A; 5LJ5 h; 3CBO A; 4C8Q A; 2QA4 Q; 2DK3 A; 1KHI A; 1ARK A; 1YIJ A; 3G71 A; 3RKX A; 4BY6 C; 1IO6 A; 2BZX A; 2CP5 A; 3MP6 A; 3OYL A; 1D0Z A; 2EAY A; 4AFQ C; 4AMC A; 5FLX E; 3JCM W; 1QVF P; 1KG1 A; 2LX9 A; 5GAM e; 3PTA A; 2EQK A; 1M1K R; 2YRD A; 3NFC A; 2QAZ A; 4AT1 B; 1M90 R; 1IRE B; 1YJW A; 2KK4 A; 2EYX A; 3CPF A; 1Y07 A; 4CRI A; 1TTH B; 4M7A A; 3VS3 A; 4EPC A; 1I07 A; 2COY A; 4C0D B; 1VQ5 Q; 3H41 A; 4Y91 A; 1B34 B; 2M9U A; 3EHR A; 1WLP B; 2JJ9 A; 3M0S A; 3VYH B; 1G3W A; 2J7I A; 2YXY A; 4FW1 A; 4XTU A; 1ZHI A; 2AHJ B; 2GTO A; 2RB6 A; 3D7S B; 2ZAE A; 1AWW A; 4ZGD B; 2PNI A; 3CQT A; 4E47 A; 4OB3 B; 5GJV B; 2F2W A; 3RNJ A; 1XQH A; 2LNV A; 5J26 A; 4ZN3 A; 1AOJ A; 2PUK B; 3JB9 I; 2HSE B; 3M4Y A; 3NHN A; 4ZNX A; 1YJN Q; 1EZZ B; 3SD4 A; 4F7U G; 4UC4 A; 3EFR A; 4FT4 A; 1EX4 A; 4LD9 K; 1UJY A; 1VIF A; 4QQG A; 4BDY A; 1ZSZ C; 3CEY A; 3OB9 A; 4HA8 A; 4EMG A; 5IT9 E; 3QG1 A; 3P8B B; 4RUG A; 1KIK A; 4ESR A; 2JTM A; 1EFN A; 5EG2 A; 2DXU A; 3OYK A; 4A4G A; 1G5V A; 2G3R A; 4D8K A; 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