3O6GA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 90
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6gA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6gA02
1POY1 3EF7A 2ZYMA 3THIA 3TMGA 3I6VA 3U94A 4O3CA 1JW5A 1B5IA 4I1DA 2XD3A 1US5A 3LC8A 4MBPA 2I3VA 1A99A 3RY3A 3F11A 1JEUA 4RPNA 5ITPA 3T9VA 5AA4B 2Y7KA 2A5TB 3EQ1A 2VP1A 4G2ZA 4P0IA 3K6UA 1AMFA 4OMBA 3RQTA 1QKAA 2ONKE 2UVHA 2HAUA 3IB0A 1MH4A 1R1NA 3H7MA 1S9TA 1XOCA 5K2XA 4RK2A 1FQCA 3A3UA 4OWDA 3OEKA 1HSEA 4ISUA 4NF5A 1JW4A 1MXZA 2X7PA 2PYYA 1UQWA 1Y3PA 2O69A 3G3JA 5KCJB 3IO4A 4QSCA 2DS9A 5DT6A 4LZ7A 1BP5A 1B4HA 2O51A 4OESA 2Q89A 3A09A 3ILUB 3FASA 3ECRA 2F7AA 2Z8DA 3C9HA 3VDFA 2NUVA 1OLCA 3I3VA 1B40A 1SVXB 4PE5B 5BWJA 3ODBA 3T22A 1Y3NA 2BJJX 3N26A 4IO5A 4ECFA 1BTJA 1P1OA 5EHSA 4LONB 2G93A 1OVTA 4BDLA 1GGGA 5FHMA 2Z22A 2F8DA 3USDA 1WVJA 3CFXA 3K02A 3MAMA 4F3GA 4ZE9A 4G8MA 1MQDA 1M5DA 1US4A 4IGTA 2P0SA 3LSLA 3JZJA 5L9MA 1UTHB 1IEJA 3TCHA 4QFNA 4IY6A 5I57B 4KYEA 3FVKA 5EYFA 3ZSFA 4QSDA 3QUJA 5H8QB 2DXRA 3PMVA 4QFPA 4F29A 3CFZA 3E4RA 1S7YA 3GBBA 5I58A 1OLAA 4WEDA 4JSDA 3FJMA 4U23A 3MVYA 1I6QA 3JV9A 3QXMA 4XKRA 4XIGQ 2I6EA 1GVCA 2ONRA 5I84A 4I9DA 5DEXB 1SDXA 1B46A 3DM0A 4THIA 3OSRA 1N7XA 1NNPA 2X7QA 1H44A 1A8EA 4ND9A 1JNFA 2XXQA 2A5SA 3DP8A 5CMKA 3G7WA 3S9MC 4WKMA 1XHYA 4NE4A 4G68B 1LBCA 2VOZA 2VD2A 3MVZA 3VV5A 4DZ1A 1Y4CA 1J1NA 3CRBA 4ZECA 3ZKLA 5I59A 2V84A 1Q35A 2WKYA 4PFYA 5A5XA 1IXGA 1MXWA 3IB2A 3DELB 5CI5A 4R75A 3C4MA 4R74A 1MXUA 2O7IA 3O2AA 2DWJA 5ITOA 4PP0A 4BDQA 3FVGA 1I69A 4F1VA 4KHZE 4NF4A 5H8FA 3HO7A 3KOTA 4GXAA 5AE4A 3M3KA 4KPTA 1VFEA 3PPOA 1LB9A 3V5AA 3QK6A 4GVOA 4ONYA 5LOMA 2Z8EA 1EH3A 1MQGA 1PBPA 5H8HA 2DE3A 2QRYA 4G8HA 4H65A 1LBBA 2ESNA 4IB2A 1II5A 5JTYB 3S9EA 5KZTA 1RYOA 1B1XA 5FHNA 1VR5A 4EQBA 1ZIUA 5IKBA 3PUZE 2V3UA 3Q28A 3K6WA 3UP9A 4H8JA 4ELRA 2UVIA 4OHNA 1AOVA 4R9FA 3KEIA 4POWA 4ZEIA 1M5EA 4Q30B 4NMYA 3BFUA 4YAHX 3EHTA 2XX9A 4QFLA 4NF6A 3O6GA 3CVGA 3UIFA 3FJGA 1OQGA 4G77A 3FATA 3I5OA 4AB5A 4OETA 4PQJA 2Q2CA 2V3TA 1USYE 1S50A 1NH8A 2HEUA 3C35A 3SEWA 5TPAB 2NWJA 3EHSA 3AXFA 5CBSA 3UK4A 1DTGA 1HSLA 1DMBA 1CE2A 4FECA 3BKIB 1N04A 1MM7A 3PMWA 2QS2A 3B6WA 4Z0IA 3R7XA 2M8CA 2NXOA 3N5LA 3G3IA 1B58A 3U8QA 2HZKA 4FATA 3C33A 2HCAA 3TTRA 5AA1A 4NF8A 1M5FA 2DXYA 3PGFA 1OQHA 4EUOA 1ZJLA 4E0WA 4H67A 2KLFA 4GF8A 4FIMA 2NOOA 1DSNA 3KSJA 1MXYA 4YB5A 1IXIA 1AL3A 1LFGA 1SW5A 3O28A 2OCUA 4FE8A 3PPPA 2UYEA 4XKQA 5I2KB 5FTIA 1USYH 3H6VA 3L6GA 1DTZA 4HS7A 1PEBA 5DVJA 3TCFA 3IX1A 1N0TA 4KR5A 1D9YA 1LAXA 4BLAA 5J1DA 3FXRA 2P1SA 1TFAA 1FQEA 3IAZA 5AA2B 2CMOA 2Q8JA 1SI0A 2R6GE 3TODA 3RN8A 2ALUA 4RY1A 1NFTA 3CSGA 3SERA 3FD3A 2HFBA 4P11A 2H5YA 4EXKA 4R72A 2Q9TA 4TLLB 3FVNA 1N7WA 1SYHA 4ELPA 5HBCA 2QL3A 5L9OA 4ZEBA 2XD2A 4Z7EA 3RTFB 3H6UA 1UTBA 2AL4A 3CI8A 4UA8A 4OEVA 1EU8A 3QIMA 1Y1ZA 4F3PA 1PB9A 3K6VA 3WAEA 1FTJA 2Q88A 3C34A 3V89B 3FXUA 2FNCA 4HW8A 3ZKKA 4LATA 1IUDA 2E0SA 4MH5A 1LB8A 4H6DA 1B1HA 1B3LA 3C32A 2RKMA 1B6HA 4QRZA 3WAFA 4RJZA 1XVXA 3O6HA 4XTCQ 4X1DA 5L8DA 4O3AA 3T96B 4ZS9A 1EZOA 4JWXA 3VVFA 2Y7WA 3MVWA 3M8UA 5ELVA 3EHUA 2DYXA 4I62A 4ZZAA 4POXA 3HHGA 1ZLQA 3TUSA 4KQPA 2O68A 2F6GA 2HQ0A 2P2AA 3E3KA 3SEVA 4IY5A 3TAJA 3TPAA 3DLNA 3VXBA 3S9LC 4F3BA 1O63A 4IO6A 2GH9A 4F2QA 4KYDA 1IZ1A 3TTMA 2OWTA 3TCGA 1ANFA 4NTLA 2ONSA 1YTVA 4U2RA 5KCJA 4U1ZA 1EZ9A 3CSBA 2UXAA 3V8XB 2YJPA 2Y84A 2R71A 3OMBA 3RTWB 3OO8A 5DVFA 4R6HA 3Q27A 5IAIA 1MXVA 1NNFA 2Z8FA 2F7CA 2F35A 1IIWA 4DDDA 2ZYOA 1B3FA 4KYSA 5L9SA 5EHMA 5I58B 2Q2AA 5I2NA 2FYIA 1H3DA 3S4UA 1B0LA 3HV1A 1FTLA 1RKMA 3SDFA 1URSA 2FA7A 5F1QA 4N13A 1IITA 1MDP1 3B6TA 1B3HA 2O1LA 2V25A 1XT8A 3CR9A 3PD9A 3GXAA 4OYVA 3VVDA 2QS3A 5DTBA 4DCXA 4GL0A 1UTHA 4RYAA 2XX7A 4DXUA 4F3SA 1IXCA 3SEUA 1GV8A 4IO3A 5H8QA 4F22A 4GLIA 4YMAA 4TQUQ 1A55A 2HXWA 3OOAA 4JBZA 5H8SA 4QHQA 5TP9B 3K6XA 3EN3A 4OXVA 4OEUA 3L6HA 5DEXA 2YPNA 5JK4A 1JEVA 1HSJA 1QULA 3MZBA 3LR1A 2B3BA 3KJTA 4GQOA 1MPBA 5I59B 4JDFA 2RCAA 3IOWA 2DE2A 2V93A 5KDTB 4YKJA 1P1WA 4HCYA 4DXBA 3PU5A 4QFKA 1LCTA 3FV1A 3KOSA 4L17A 3RT8A 3IOTA 1EZPA 3OD7A 2Z23A 4F19A 4PFUA 1SYIA 3G3HA 1QUIA 1N84A 2QMXA 3IL1B 1LCFA 4NF4B 1LSTA 3FUZA 4G68A 1R6ZA 2O6AA 1Y4TA 2ABHA 1I6AA 2F5XA 3MZ9A 2CZLA 1LAFE 1I6BA 2H4IA 1Y20A 4NWDA 1OVBA 3OEMA 4LQ5A 3M3FA 1B7HA 4DE8A 3VLVA 3SETA 3T66A 5H8HB 4X1BA 4C0RA 1RYXA 1B52A 3HSTA 3O97A 1QJMA 3RNNA 5BUUA 4OTEA 1VSOA 2XXTA 2XXXA 3KGCA 4LZ8A 2THIA 3KFMA 1SBPA 1GTKA 4EF1A 3LSFB 4F1YA 1BIYA 5ICTA 3MPLA 1YPNA 1FTOA 2OK2A 4IO4A 1B7ZA 3PV0E 1PB7A 2AYSA 1SW1A 4BDMA 3KSXA 2DVCA 1H45A 3KZGA 3KN8A 1FQAA 2ANJA 2VD3A 4LUBA 4RPOA 4OZ9A 3O66A 3R6UA 4U1OA 4R2FA 1YCJA 2RC9A 3IOVA 1O7TA 4P0GA 2OJTA 2REJA 5ISUA 4LQ2A 1MH3A 4WEPA 2XXHA 1BKAA 1QW0A 3LSWA 2I0BA 3LUYA 2D3IA 1MY3A 4BDOA 4OVJA 4YKKA 2RCBA 4KCCA 3BFTA 3OSQA 3IK6B 3MP6A 1M5CA 1P1UA 1OMPA 1ZMGA 2DWIA 1JQFA 5I56B 3MP8A 4GWOA 1ATGA 2UVJA 1NNKA 4O3BA 1T0KA 3CG3A 3HPIA 1LFIA 4H5FA 3FV2A 4U4SA 4F31B 4PFTA 2NVUB 3N6UA 4BDNA 4YB7A 4R73A 1PB8A 4NF8B 3O6IA 3TYHA 2F78A 4QFOA 2XHDA 5HPQA 1XS5A 4M4GA 4TLMB 2Y7PA 3PUWE 2GRVA 4QSEA 3ILTB 2GHAA 2OWSA 5CMBA 2ZNTA 4FORA 5H8NA 3SEXA 3IB1A 2ZNUA 1QKBA 2IEEA 4H8IA 3PPRA 1N3WA 3MC2A 2XXWA 2F97A 4RNSA 4GRKA 3E9XA 4U21A 1PDAA 4HTGA 5FHOA 3TQLA 1SW2A 1WODA 2HZLA 1NNTA 4ZE8A 2QS1A 4NWCA 4OERA 3KN3A 2PT1A 1JETA 3EPEA 4FEBA 3W15C 1LAGE 2ZNSA 1MRPA 2OLBA 1SI1A 2QJEA 1FQBA 4E0XA 1B0HA 1MY1A 3K00A 5JEIA 1LFHA 4K3FA 1JW1A 3G3GA 3OO7A 1Y3QA 4AQ4A 1D4NA 1Y1MA 4EDPA 3IOUA 1UTBB 2ZYNA 1MG1A 5CBRA 1CB6A 1MS7A 3T9XB 3H06B 3S2VA 1NKXA 3UORA 2F6PA 3K1NA 4EXLA 3MQ9A 4YKIA 2I4CA 1URGA 4KCDA 2I58A 3TTKA 3IO6A 3QAXA 1MM6A 3K01A 2ZYKA 1QVSA 4IO7A 2QPQA 3P7IA 3TELA 4DLDA 4KD5A 5CC2A 3B7DA 4XKPA 2LAOA 3PUVE 3W9VA 4F39A 5TU0A 1SD3A 1LGBC 1AIVA 1SQYA 3DP4A 4XXUA 3W9WA 2ZXTA 3Q29A 2GFEA 4NF5B 2DSFA 3VFJA 2ZMBA 2QS4A 3IORA 2W7YA 1Z7NE 2H99A 1ZBMA 5AA4A 2X26A 2A5TA 4U22A 1TT1A 3OO6A 3MZ1A 3TEPA 3VVEA 3TQWA 2OBGA 1B51A 2RC8A 1NMUA 4Q8RA 1UIVA 3E13X 3CFLA 4IO2A 3H03A 4KI0E 3FXQA 4G68C 5AA3A 3N94A 4OFOA 1JVYA 5B7DA 2XXVA 3KBRA 4YZZA 1Z7ME 3PPNA 4KFQA 2DOJA 4OFLA 1VFDA 4QF9A 2I48A 3H3GA 2H9BA 1N3XA 3HCQA 1OIBA 1M5BA 4PETA 1NH7A 2YLNA 4YICA 1Q1KA 2O84X 1A40A 1BLFA 4R6YA 2AIXA 4ESXA 5AA2D 4G8NA 2UVGA 5I2NB 2PX1A 4FAJA 5CMMA 1B32A 3OELA 1ZU0A 1MPCA 2QMWA 4ZEDA 3KN7A 4H1XA 4JWOA 4LP2B 4H5GA 3O9PA 4BDRA 4MLVA 2I0CA 2IA4A 1PBQA 4YMBA 4X48A 3VE1B 1FCKA 2G29A 2DWHA 5CRYA 4MFIA 3K4UA 2D21A 3SEYA 1FQFA 3T9UA 5HM4B 2PT2A 4UACA 1H43A 2DP8A 1FQDA 1TXFA 3CIJA 5DYHA 5I57A 4LVQA 2Y7RA 4M1VA 1YAEA 3FIRA 2R9JA 1FTMA 2H98A 2XXRA 1MXXA 2DWAA 4EQ9A 3ONMA 5CMCA 3TTNA 1NL5A 4HCWA 2F36A 4GIZA 2PVUA 4ESWA 1N76A 4U4XA 1QUJA 1D9VA 1O64A 3GZGA 3QYTA 4R6KA 5FTHA 4JSOA 2OZZA 3OXNA 1LAHE 3IR1A 1IQ7A 4FJPA 2XXIA 5A5XB 1R9QA 4H0WA 1DPEA 4I8CA 2D5WA 3KG2A 3TFLA 3KJ7A 3BBRA 5TP9A 2VHAA 1SW4A 3PUYE 3T93B 5M2VA 1B5JA 2O1MA 4RA1A 4IGRA 2RF1A 4R9GA 2XXPA 3FZVA 4RXLA 5H8FB 3QSLA 4ZEKA 4ZZEA 5CM6A 4ELOA 3MW0A 1QUKA 4LA9A 3V83A 4LZ5A 4F2OA 3D4GA 3UA8A 5KDTA 1B9JA 1A8FA 1GR2A 2HAVA 3MUQA 3R26A 1B3GA 4R2BA 4YKPA 1TWYA 3UGWA 1MPDA 1AH5A 3K1MA 5K2YA 1B05A 3SESA 3MBPA 2PMSA 2XXYA 4JXIA 4TOZA 1KWHA 4GD5A 3T9HB 3TZAA 4X9TA 5B70A 3K0VA 4Q0CA 3PPQA 2RINA 1VE4A 2E1SA 3IJXB 2F34A 4G4PA 1FW0A 1P99A 4DCYA 4GOTA 4EF2A 4ZEFA 2XXUA 1TFDA 3MVXA 1B7UA 1MDQA 1B3EA 3U92A 5ICQA 3RUMA 1ELJA 1H76A 4MF3A 4XKNA 3A3CA 3FVOA 4WXJA 3VXCA 1XC1A 1MY2A 4NEDA 2UYFA 1FTKA 3LBSA 4NF6B 3TTLA 3TDJA 3LSXA 3MJNA 5JTYA 3H6WA 1UIUA 3QUFA 4ZDMA 3S9NC 3PMXA 2B65A 3MWBA 3MP1A 1URDA 3C31A 4JB7A 3PD8A 1IXHA 5DVIA 3U1OA 1P1NA 3GBAA 1MQHA 1MY0A 3RT6B 3Q26A 4F18A 3VLWA 2I49A 4OENA 1ZKBA 3RLFE 2GHBA 1P1QA 3HN0A 2DE4A 4RK9A 4YB6A 1JVXA 3ZS6A 3C36A 3SKPA 1B4ZA 3IJOB 1B5HA 3G3KA 3FJ7A 2AL5A 2RC7A 3OENA 3M3LA 3TKDA 1Y9UA 5I56A 2Y7IA 3D4CA 3H6TA 3FGSA 2XX8A 5H8NB 1PC3A 2QSXA 3RGYA 3OO9A 5TPAA 4GL8A 1DPPA 3G3FA 1D3KA 3N6TA 3PUXE 2DVZA 1LLSA 3HHFA 3B6QA 4C1UA 4GFRA 1A54A 3RPWA 3MPKA 1L5TA 4ELQA 1DOTA 1ZTYA 3O29A 1POTA 4C1TA 4F1UA 3Q25A 1R9LA 2H25A 3DP6A 4OFJA 1MQJA 2O7UA 4FEDA 4YU0A 4MLQA 3K1PA 2B3FA 4PFWA 2DQVA 2F7BA 2I4BA 4JWYA 1MQIA 3CG1A 4AB6A 4N07A 5F7VA 4Q5TA 3GLBA 3U72A 2REGA 4GXSB 3VLUA 3K2DA 2VGQA 5I2KA 4OQOA 1XVYA 2PBWA 3JYRA 3UN6A 3H4ZA 1F9BA 1WDNA 1B2HA 1MY4A 4EQ7A 2I3WA 4DXCA 4N6PA 5AA2A 1A7LA 3U93A 2V3QA 4DIGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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