3O6IA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA02
4BDLA 2ESNA 3ODBA 4KYEA 1B1XA 1B52A 1OLCA 3O97A 3GXAA 4IGRA 2HCAA 3KOTA 3K1MA 3O6IA 5F1QA 4NF8B 2B3BA 5H8QB 3BKIB 2Q8JA 1IZ1A 5KZTA 3P7IA 4G2ZA 3FXRA 4R9GA 1PB7A 3USDA 5AA1A 3VVDA 1NNTA 4Q5TA 2XXRA 2Y7PA 2DSFA 5ICQA 2A5TA 2RC7A 3TDJA 1FTOA 3EQ1A 1B3GA 4ZE9A 1XC1A 3MWBA 3U94A 3JYRA 2RC9A 5CMMA 2I49A 3V89B 5DYHA 1LGBC 1MM6A 4YB7A 4FE8A 3LC8A 3O9PA 2ONRA 5H8HB 2PT1A 3IR1A 3O66A 4FJPA 2XXYA 4MF3A 4QF9A 4ND9A 5BWJA 4XKPA 4XKRA 4JBZA 4OEUA 2NWJA 3G3JA 4WEDA 1URSA 2OWSA 1IXGA 3H3GA 4ECFA 1JW1A 3EPEA 4YB6A 3TTRA 3G3IA 2Q88A 3A09A 2A5TB 4DCYA 1DMBA 5EHMA 4GQOA 2ONKE 1VFDA 3V8XB 2I4BA 2GH9A 3MZ9A 3T93B 3E13X 3ECRA 2AL4A 1N3WA 1ZMGA 5CBSA 1MQHA 5I2KA 1JW4A 2HEUA 3H06B 4IO7A 2ZNSA 3FD3A 3M3FA 3LSXA 1XVYA 1GVCA 4DLDA 4EF2A 1B1HA 1IXCA 1B3EA 3KN3A 5JTYA 2NUVA 3PMXA 4LQ5A 3I6VA 1SW5A 3G3HA 4POXA 3K02A 1SYIA 1Y4CA 3MW0A 2DE2A 2XXXA 3D4GA 5CC2A 4N07A 1Q35A 2VOZA 3SDFA 4IO3A 2P2AA 3U8QA 2H98A 2B3FA 2F97A 3SEUA 1OLAA 4RK2A 4XKNA 2NXOA 1ZLQA 2H99A 4JDFA 1LFGA 3TCFA 1A7LA 1QUIA 4P11A 1MXUA 3PV0E 4AQ4A 4UA8A 5JTYB 2ZYNA 1NFTA 3LR1A 1ELJA 1OQGA 3CRBA 2Y7WA 2QS2A 2GHBA 4JWYA 4XXUA 2F34A 3T96B 2F7AA 4PFWA 5H8FB 2I0BA 3KJTA 1M5CA 5BUUA 3PPPA 1OVBA 3ZKKA 5L9MA 4LA9A 4IO5A 4Q0CA 4GL0A 1MY4A 3CR9A 4OERA 4Q8RA 2OBGA 3ONMA 4ZEKA 4EQ9A 1LAGE 2H4IA 1B32A 2QL3A 3CI8A 4YAHX 2KLFA 4F3PA 3IB2A 3C9HA 4Z7EA 4H8IA 5K2XA 2VD3A 4FAJA 4OFOA 5CMBA 3UK4A 4F1UA 1II5A 3H6TA 3MJNA 2Z8EA 4F3SA 1N0TA 2DQVA 5M2VA 1WDNA 3IORA 5CBRA 5DTBA 4OQOA 3PGFA 4R6YA 2HAVA 4TLLB 4ZE8A 3IB0A 4R72A 4NE4A 2YPNA 3ZSFA 1NMUA 3G3GA 4R6KA 4KPTA 2D21A 4KFQA 3TMGA 3FV2A 3FVKA 2XXVA 4WXJA 2O51A 1Y1ZA 4EUOA 5IKBA 3S2VA 3MUQA 4DXUA 1MM7A 2M8CA 4H0WA 2VP1A 3VDFA 2RKMA 2YJPA 3C35A 3JV9A 3W15C 4HW8A 1S7YA 1DSNA 3IOUA 3VE1B 1LAFE 1CB6A 2RCAA 5LOMA 3SEVA 4F18A 1JETA 2DYXA 3ILUB 1XS5A 3CSGA 4OEVA 1MQIA 1P1UA 2R9JA 3HV1A 2AIXA 2E0SA 3FXUA 3OENA 3OD7A 4MH5A 4Q30B 5TPAA 4QSCA 3BFTA 3E4RA 4GIZA 1QKBA 5EYFA 4GD5A 4IO6A 3H6UA 1Y4TA 3K6UA 3VLWA 5I2NA 4NWCA 1I6AA 3FUZA 3C4MA 1B3FA 5KCJA 2FA7A 5H8NA 2Y84A 3OO8A 2V3QA 3C34A 2XXUA 4YKIA 1WVJA 4G77A 1AOVA 3A3UA 3IB1A 3UIFA 3PMWA 4U4XA 4LP2B 4PFUA 5HM4B 2G29A 1SQYA 1MQGA 3TTLA 4NF6A 1POY1 5TPAB 3H03A 1A99A 1S9TA 3U72A 2WKYA 5AA3A 5I2NB 3PUWE 3HHGA 1BKAA 1MXWA 2O69A 1R9QA 1VFEA 5KCJB 4QFNA 1MXXA 1USYE 1ZBMA 2Y7IA 3CG3A 1IQ7A 4YU0A 3MVXA 4G68C 2DWAA 1O7TA 3UA8A 3KGCA 1P1NA 2F78A 4H6DA 4U23A 1LB8A 1IIWA 4NF6B 5EHSA 4C0RA 1LFHA 3FGSA 1OMPA 1B4ZA 1SW1A 1IUDA 4IO2A 3N26A 4DDDA 4HCYA 1ZKBA 4U2RA 3CSBA 5I84A 4TOZA 3K0VA 4RXLA 1Q1KA 1N7WA 2HZLA 1Y3QA 2OLBA 2PX1A 4JSDA 2E1SA 3G7WA 4M1VA 5TU0A 3SERA 3N6TA 1USYH 3QIMA 3QXMA 4KQPA 4OESA 1MDQA 3FXQA 2RCBA 4BDMA 1QUKA 3QYTA 2XX9A 4ZEDA 3SESA 1TFDA 1AL3A 5FTHA 4KR5A 1MH3A 1R9LA 1JEUA 4YB5A 1GV8A 4ELPA 1GR2A 4C1UA 3TKDA 1JVXA 5I58A 3N6UA 3O6GA 2I0CA 1YAEA 4PFTA 2QS1A 5A5XA 4GLIA 5DT6A 1N76A 3DP6A 3TQLA 1H43A 5I57A 3PD8A 1IITA 1NNKA 3QK6A 4IY5A 2H5YA 4U21A 4OENA 3C33A 3KJ7A 4IB2A 3S9MC 2I58A 4QSEA 2REJA 3MZBA 3T9UA 3IK6B 3GBBA 3TEPA 3CIJA 2UYFA 2GHAA 3DELB 3K01A 2O1LA 2ZXTA 1SBPA 1LFIA 2PBWA 5CM6A 4F1YA 2UVJA 4LQ2A 2DS9A 1KWHA 5IAIA 3KG2A 1B2HA 3FASA 4MFIA 4XTCQ 3TPAA 5I57B 5F7VA 3Q29A 4QSDA 5TP9A 4KYDA 2R6GE 4NWDA 3HCQA 1IXIA 5AA4A 3H6WA 4G68A 1B46A 1N04A 1AH5A 4FECA 2ABHA 1DTZA 3TTMA 1TWYA 3WAEA 2QPQA 3VVEA 3GZGA 1PB8A 3K6VA 4P0GA 2V3UA 1BIYA 3H6VA 3Q26A 2QMWA 1JQFA 4AB6A 3T22A 3UORA 1DPPA 4JSOA 2VD2A 3U92A 1QVSA 3QUJA 4JB7A 2ZMBA 2O84X 1DTGA 4EQBA 4EDPA 4DCXA 3V83A 2F8DA 1MPBA 3LSWA 3HPIA 1B51A 5B70A 2V3TA 4G4PA 3H4ZA 5TP9B 3M3KA 5AA4B 1M5FA 3QAXA 4O3AA 4TLMB 3PUVE 1AMFA 3KBRA 3UP9A 3B6QA 1PB9A 4LZ7A 5I2KB 4LZ5A 1MS7A 4QFKA 1A55A 1Z7NE 3EHSA 5ITPA 1B40A 3OO9A 3OELA 4LATA 3CFZA 3PD9A 3IOVA 1PC3A 1I6BA 1R6ZA 1LBBA 1PBQA 4AB5A 2I4CA 4R6HA 1MPDA 4BDNA 5KDTA 2HFBA 1SI0A 2DWHA 4ZZAA 3I3VA 2F36A 3FJMA 1L5TA 3C36A 1SI1A 3CG1A 3VXCA 4DE8A 4X1DA 1H3DA 2H25A 2CMOA 2QS3A 3BBRA 1WODA 5CI5A 2AL5A 2PT2A 3OEMA 1DPEA 1B6HA 4RYAA 5FHMA 3C32A 4POWA 2XXTA 3R7XA 4RPOA 1SDXA 4F22A 1RKMA 2HXWA 2O7IA 1LLSA 3BFUA 3E3KA 2XX8A 3L6GA 4PP0A 4G8NA 4E0WA 2F6GA 4GVOA 3HO7A 5B7DA 3QUFA 1B7UA 3K6WA 2LAOA 4BDRA 3MBPA 4OMBA 1YCJA 4XKQA 1B9JA 4KD5A 2F7CA 3VFJA 3SKPA 3MVZA 3HN0A 3RY3A 2QS4A 4E0XA 3I5OA 4NTLA 1D9VA 4YZZA 3M3LA 3O6HA 3RN8A 2XXQA 1R1NA 2F7BA 1QKAA 4WEPA 4I1DA 3ZKLA 1NL5A 4MLVA 4LZ8A 3IO6A 4FIMA 4PFYA 4F19A 4OYVA 2REGA 3D4CA 4F2QA 1YTVA 3TYHA 2ZNUA 2UVIA 2F5XA 3PPRA 4BDOA 4RJZA 4N6PA 1NNPA 4H8JA 1MY3A 4I9DA 4FEBA 1B5JA 3B6TA 3TZAA 2A5SA 3FVOA 4ESWA 4IO4A 4ISUA 1US5A 3W9VA 3U93A 5DEXA 2F35A 2NVUB 4XIGQ 5CMCA 3OSRA 1JW5A 3UGWA 4H5GA 1B0LA 3SEWA 3TELA 2OCUA 3FATA 4H67A 1NNFA 5HPQA 1LAXA 3T9HB 3LSFB 3Q25A 3VVFA 2DXYA 3Q28A 5L8DA 5FHOA 4OXVA 1LAHE 3PPQA 1FTLA 3IL1B 1H45A 5H8NB 3OSQA 4PQJA 4OHNA 2P1SA 3K4UA 2RC8A 4R73A 1MQDA 3RPWA 2O1MA 2VGQA 4ESXA 3MP1A 4HCWA 1UIUA 4DIGA 5L9OA 3MC2A 1BLFA 2VHAA 1B3HA 2QSXA 1ATGA 4BLAA 2NOOA 3RUMA 2ZNTA 3PUXE 1QW0A 3EHTA 3MVWA 2O6AA 1QUJA 4IGTA 1ZIUA 2XXHA 4QHQA 3FZVA 3N94A 4G8HA 4EXLA 1MDP1 3T66A 1IEJA 1BTJA 5ELVA 1B58A 1FW0A 4NF8A 1D3KA 2Z8DA 3TUSA 4HS7A 4U4SA 4ZEIA 4GRKA 2I3WA 5H8QA 4RA1A 2FNCA 2XXWA 1B5HA 2UYEA 3OOAA 1P1QA 3IOTA 1ZJLA 3TTNA 1UTBA 2DE4A 4HTGA 3K00A 2I6EA 1Y1MA 3MQ9A 4PE5B 4U1ZA 2Q2CA 4NF4A 3M8UA 1UQWA 3KEIA 2D5WA 4FEDA 2UVHA 1UTHA 3IOWA 4F3GA 1HSJA 3TQWA 1FQEA 1FQCA 2OJTA 1GTKA 1FCKA 2I3VA 1LCFA 4GXAA 1MH4A 2I48A 3B6WA 2V25A 2QMXA 5H8HA 2Z23A 3RT8A 4RPNA 5ISUA 3TTKA 3GBAA 4H65A 1A8FA 1VSOA 2Y7RA 3PU5A 2DVZA 4X48A 5FHNA 2CZLA 3DP4A 1SYHA 4GWOA 3PMVA 1UTBB 1M5EA 1EH3A 3E9XA 1XHYA 4YKPA 1RYOA 4GL8A 3HHFA 3KFMA 4NF4B 3MZ1A 4ELOA 1UTHB 2DWIA 1Y3PA 4ZZEA 1POTA 3A3CA 5DVFA 4MLQA 4U22A 4OFJA 3TCHA 4X1BA 5ITOA 3VLUA 5I58B 2XX7A 1CE2A 4KCDA 1FQAA 3EHUA 5A5XB 4RNSA 1TT1A 3PPOA 4EF1A 3T9XB 1ZTYA 1JEVA 1MPCA 2XD3A 5L9SA 2D3IA 1RYXA 2Q9TA 3IX1A 1FQFA 1EU8A 3CVGA 3ILTB 3R26A 4YKJA 1FQDA 1MXVA 4OFLA 4LUBA 1OVTA 4QFOA 1BP5A 1B05A 3G3FA 4M4GA 4L17A 5J1DA 5CMKA 3MPLA 1PDAA 3T9VA 3WAFA 1O63A 3FVNA 1DOTA 3RQTA 1FQBA 3TODA 3FIRA 2O68A 2Z22A 3O2AA 3OO6A 3RT6B 1LCTA 2Q2AA 2DWJA 3C31A 5H8SA 4JWOA 3MPKA 3SEYA 4LONB 2Z8FA 3FJ7A 4F39A 1N84A 3K6XA 4YMAA 1A40A 1VE4A 1AIVA 5AE4A 2G93A 3MP6A 4G68B 1MRPA 3IO4A 4C1TA 1MY0A 2THIA 1B7HA 3EN3A 4EXKA 4R2BA 3RNNA 1LBCA 1JVYA 4ZDMA 3U1OA 5I59A 5H8FA 2GRVA 1MQJA 2OZZA 2DP8A 1M5BA 1MXYA 5AA2A 4ZEBA 4YMBA 2DXRA 1Z7ME 1A8EA 4O3CA 3B7DA 4I62A 4H5FA 1J1NA 4QRZA 1HSEA 1XOCA 1N7XA 1SVXB 4KHZE 4MBPA 1XVXA 4ZECA 1XT8A 1NKXA 2RINA 3RLFE 1Y20A 1US4A 3THIA 1LB9A 3DM0A 3KN7A 3K1NA 4NF5A 2YLNA 1PEBA 1QJMA 5DVIA 4PETA 2ANJA 4ELQA 1B4HA 1EZOA 2X26A 2OWTA 1P1OA 4GFRA 4ZEFA 2P0SA 3IJXB 5CRYA 2HZKA 3O28A 1B7ZA 1T0KA 4O3BA 1SD3A 3CFXA 5I59B 1MXZA 5AA2B 3TCGA 5DVJA 3FJGA 3R6UA 3MAMA 3VXBA 2PMSA 3LBSA 1M5DA 3DLNA 3S9NC 4IY6A 3S4UA 4NF5B 3KN8A 3FV1A 5KDTB 4H1XA 4R9FA 1TFAA 2R71A 3TAJA 4EQ7A 4GOTA 2H9BA 3S9EA 4K3FA 4X9TA 3DP8A 4OETA 4KYSA 1IXHA 3IJOB 1O64A 3LUYA 2QJEA 4FATA 1N3XA 2BJJX 4OZ9A 3G3KA 1EZPA 1MY1A 4DXCA 2F6PA 2V84A 4JWXA 3PUYE 3EF7A 4DZ1A 3KZGA 3OO7A 4OTEA 1B0HA 1ZU0A 4YICA 4YKKA 1D9YA 2IEEA 3L6HA 2X7QA 1P99A 2X7PA 3GLBA 2DE3A 2ONSA 1SW4A 1H76A 1HSLA 1EZ9A 2QRYA 2HAUA 3O29A 2XHDA 5JEIA 3UN6A 4RK9A 1LSTA 2RF1A 1MG1A 1I6QA 5AA2D 1FTJA 3FVGA 1NH7A 2HQ0A 4F1VA 4GXSB 3TFLA 3MP8A 2W7YA 3OXNA 3K2DA 1GGGA 3JZJA 1S50A 2IA4A 3RTWB 3SETA 4RY1A 1I69A 4FORA 1FTKA 3H7MA 1FTMA 3VLVA 4R2FA 2FYIA 4DXBA 3F11A 2B65A 5K2YA 1D4NA 2ZYKA 3RGYA 2DOJA 4Z0IA 2UVGA 4N13A 2O7UA 2PVUA 4ONYA 3W9WA 2Q89A 3HSTA 3KSJA 2UXAA 4OVJA 3ZS6A 1URDA 3V5AA 1ANFA 3RTFB 3S9LC 5FTIA 1QULA 2OK2A 4OWDA 4R74A 4ZS9A 1B5IA 4P0IA 4F3BA 3OEKA 4JXIA 4KI0E 4WKMA 3SEXA 2XXPA 3VV5A 3PUZE 5DEXB 3N5LA 3MVYA 4LVQA 5I56A 4TQUQ 4GF8A 4KCCA 5ICTA 1F9BA 4UACA 3KOSA 1OQHA 1MY2A 3CFLA 4THIA 2V93A 4NMYA 4F29A 4NEDA 4F31B 1URGA 4I8CA 1VR5A 1A54A 4QFPA 1Y3NA 2ZYMA 1NH8A 2ALUA 2PYYA 2XD2A 1Y9UA 3QSLA 1OIBA 3Q27A 5JK4A 1UIVA 5HBCA 1P1WA 4G8MA 4F2OA 1YPNA 2DVCA 3KSXA 2XXIA 1TXFA 1PBPA 4QFLA 1JNFA 2GFEA 4ELRA 4BDQA 3OMBA 3IAZA 3K1PA 3LSLA 5I56B 3AXFA 2ZYOA 2Y7KA 2AYSA 4R75A 1H44A 1SW2A 1B3LA 3PPNA 4U1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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