3O6IA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA02
1AH5A 3D4GA 2XXRA 4R6HA 4RK9A 4FEDA 4F2OA 3OD7A 1JVXA 3UP9A 3VXBA 4LZ5A 3LUYA 2QL3A 4LP2B 4KPTA 3A3UA 2D21A 5H8SA 4GF8A 3K6VA 4ISUA 2H4IA 1RYXA 3U72A 2NXOA 3SKPA 1NH8A 1QJMA 3TAJA 3H6UA 2OZZA 4ELQA 1LGBC 1SDXA 3KOTA 5CMKA 1S50A 3FJGA 1MY1A 1ANFA 3LR1A 2PX1A 4BDOA 2Z8EA 2UVIA 2QSXA 2HCAA 1OVTA 2PMSA 3PV0E 3V5AA 2ALUA 2DWAA 4G2ZA 2Y7WA 4GD5A 2DP8A 2I4BA 4DXCA 4FEBA 3KFMA 2DQVA 4F19A 3R6UA 1MPBA 3TEPA 4N6PA 1FTLA 1GV8A 5KCJB 3C9HA 3O6HA 2Z22A 2GH9A 4M4GA 4F3PA 2GHBA 3ZKLA 2O7IA 2F7BA 2GFEA 3MVWA 2ZXTA 4QFOA 4F1VA 3SEXA 2XXUA 3N94A 2ZNUA 5DTBA 5AA4B 3OEMA 4F3BA 3PD9A 1CB6A 4XKQA 3SEUA 4FATA 2DXYA 3VVFA 3T66A 2ZYKA 3G3HA 4FE8A 4JSDA 3GBAA 3G7WA 2Z8FA 2OWSA 3RGYA 4MF3A 4IGRA 4YB6A 4GL0A 2AYSA 4LONB 1JNFA 4NWCA 4H0WA 1XVXA 1FQEA 3O28A 3K01A 3E9XA 3TTKA 3TQLA 3HHFA 2ABHA 1SQYA 3N26A 4EDPA 5EYFA 1NFTA 3PPPA 4YZZA 3TQWA 3MP8A 1B40A 2I49A 3K0VA 4TLMB 4KR5A 4IO4A 4NEDA 2V3TA 3FJMA 2QRYA 5TP9A 1SYIA 4GXSB 4FECA 1DOTA 4AB5A 1MDP1 3C35A 1VFDA 4RJZA 3IOTA 3I6VA 2ZMBA 4DXUA 1I69A 4ZS9A 1OIBA 3MAMA 3K1MA 1MXUA 4JBZA 2WKYA 3FV2A 4KYEA 5CMMA 3IOVA 2ONKE 4YAHX 3IB0A 2Y7KA 3CSGA 1F9BA 4UACA 3TELA 1MS7A 1B52A 5TP9B 4C1TA 3V8XB 2P0SA 3OO9A 5IAIA 2DS9A 5JTYB 4GVOA 3EHSA 3IORA 4ESWA 4YB5A 1MQJA 2ZNSA 3VV5A 3W9WA 4NF4B 1LFIA 2RF1A 2P2AA 1A40A 4RNSA 4EUOA 1B9JA 1IXCA 3HSTA 4YKKA 3EPEA 4EQ7A 3B6WA 4I1DA 1A55A 1DPEA 1UTHA 3O6GA 1MY4A 1ZBMA 1YTVA 3ILUB 4NF5A 1O7TA 2O6AA 3DP4A 4KYDA 2VGQA 3KGCA 3E3KA 3IO6A 4PE5B 4GLIA 3C36A 1EZ9A 4KFQA 1MPDA 1N04A 1N3WA 2XD3A 1B2HA 4ZEDA 3CFXA 1TFAA 5CMCA 1GR2A 1H76A 4I8CA 3GLBA 3OENA 1P1QA 3T9XB 1LAGE 4GIZA 1ATGA 1SBPA 5TPAA 3O66A 3FASA 2RC7A 4OZ9A 3O29A 1H45A 2DWJA 4F3GA 3BKIB 1FQAA 3ECRA 3OO8A 5ITPA 3K4UA 3MC2A 1MQDA 2QS4A 3IR1A 3DP6A 3MZBA 3U92A 4KCCA 1BLFA 4BLAA 1BKAA 3HPIA 1I6QA 3MPKA 3RTFB 4NF6B 2UYEA 3IB1A 4HW8A 5H8NB 1LB8A 3S4UA 3R26A 2CMOA 5TPAB 1Q35A 3QSLA 3DP8A 4ND9A 1PB9A 1Z7NE 3OSRA 2LAOA 4KCDA 4LA9A 5CM6A 4X1BA 3C32A 1A99A 2IEEA 2VD3A 4POWA 1H44A 1BP5A 5H8QA 5I84A 5J1DA 2ONRA 1OLAA 5A5XA 2VP1A 4R75A 1LCFA 1FCKA 2PT1A 2RCBA 3TDJA 3TCHA 1JW1A 1PBPA 1D4NA 4EF2A 1D3KA 3KSJA 4Z0IA 1B1XA 2R71A 2OCUA 3THIA 3PPQA 4I62A 2Y84A 3HO7A 2F7CA 1NMUA 1Y3QA 5I2KA 1O63A 4H6DA 4IO6A 1HSJA 3IOWA 1FQFA 4BDLA 1B58A 4QRZA 3CFZA 1RKMA 1P1NA 4OFOA 1SW4A 2HZKA 5KDTB 3FIRA 3KJTA 3SESA 2KLFA 4KD5A 1UIVA 4DIGA 3H06B 4JWXA 4O3BA 3OXNA 2GRVA 5A5XB 4ELRA 1ZKBA 4GFRA 5AA2D 2XXXA 3B7DA 1Y20A 3S2VA 5AA2B 3Q26A 2I0CA 3TKDA 1XC1A 4O3CA 3CSBA 1N76A 5FTHA 1MY0A 1USYE 4QFKA 3N6UA 1WODA 1DTGA 5JK4A 3VLWA 2X7PA 3L6GA 1JEUA 4OVJA 1Y9UA 5EHMA 2Q8JA 2D5WA 2Y7RA 3RY3A 3PPRA 3W9VA 5DVFA 5DVIA 4DCYA 1A7LA 3K1NA 1QW0A 3O6IA 1R1NA 4POXA 1LBCA 2RINA 4IO2A 3HN0A 2X26A 4H8IA 2V25A 3HCQA 4R6YA 2GHAA 4YU0A 1EZPA 1QKBA 5L8DA 3SEVA 3BFUA 1UQWA 4NMYA 2W7YA 2I3VA 4F18A 1P99A 5KCJA 3PUYE 1N3XA 4O3AA 5CBSA 3KG2A 5L9MA 5I58B 2F78A 5I2NA 5CC2A 3PU5A 4ZEIA 4I9DA 1N84A 1MM7A 3L6HA 4OFJA 3FV1A 3M3KA 3QIMA 4F29A 5AA3A 4RY1A 4BDQA 4JWYA 1XHYA 3ODBA 4BDNA 5AA4A 4F1UA 3WAFA 3UORA 2H98A 1MRPA 3C33A 1I6AA 3V89B 4R72A 4GXAA 3HHGA 4XKPA 5I2NB 2H5YA 5H8FA 1MXXA 3I3VA 4QSDA 4G4PA 3E13X 1B3GA 3WAEA 4X48A 5LOMA 3MUQA 3M3LA 1HSEA 1P1UA 1B3LA 1MQIA 4DXBA 2P1SA 3CR9A 1EH3A 2D3IA 1FTJA 3LSXA 2A5TB 1QUJA 4K3FA 3S9MC 3SEWA 2DWHA 3PD8A 3G3GA 3QYTA 1IEJA 1NNFA 3IB2A 5H8FB 4U21A 3EF7A 4EF1A 3KJ7A 3U93A 1JW5A 2DE3A 1J1NA 3T9UA 3FATA 5DYHA 3OO7A 3PMWA 2NWJA 2Y7IA 1B6HA 4Q30B 1N7XA 1R6ZA 2B3FA 4OETA 3UA8A 3G3FA 1SVXB 3GXAA 3TTLA 3W15C 4QF9A 4R73A 1B7UA 4ZECA 5CI5A 2DXRA 2OBGA 1PB7A 5JTYA 2UYFA 1R9LA 5ITOA 5BWJA 2IA4A 4NF8A 4XIGQ 3FXQA 4G8HA 4IO5A 4G77A 2QS1A 4F22A 2FYIA 2UVHA 4Z7EA 3DLNA 1T0KA 4NF4A 1DTZA 1ZTYA 4U23A 3FUZA 4JB7A 4WKMA 1BIYA 3HV1A 4HCWA 1DSNA 5DT6A 5DVJA 4NE4A 3K02A 1PEBA 2ONSA 4LATA 4OESA 4PETA 1LBBA 3OO6A 2O7UA 1LFHA 3OOAA 5HPQA 4IO3A 2XXWA 4ZZAA 1GTKA 4NF8B 3KN8A 4KHZE 4H5FA 5HM4B 2RC9A 4EXKA 1LAHE 1MDQA 1O64A 3O97A 2DSFA 2THIA 1H43A 5H8HB 2BJJX 1URGA 2F34A 2R9JA 2CZLA 2XXPA 5BUUA 4P0GA 3FVKA 3MVYA 5B70A 4U2RA 3M3FA 1VSOA 3K00A 5AA1A 1HSLA 5CBRA 3TUSA 1FTOA 3G3JA 3CI8A 2ZYMA 2VD2A 4ZEBA 3TTNA 4YMBA 1QULA 1A8EA 3RT8A 3TODA 1B5JA 1ZMGA 2NVUB 3TTRA 2O69A 3E4RA 1IQ7A 5ICTA 4BDRA 4EQ9A 1B1HA 3EQ1A 3TMGA 2QMWA 4QSEA 3KBRA 4XKNA 2REJA 3RNNA 3BFTA 3Q25A 2XXHA 2VHAA 4WEPA 2PYYA 4OERA 4NF6A 4E0XA 1A54A 5H8NA 1B4HA 3K6UA 4G68C 2DYXA 1M5EA 1VFEA 4NWDA 5M2VA 4XXUA 2FA7A 4U22A 4OWDA 1FQBA 2F6PA 3TCGA 2RKMA 3C4MA 1FQCA 2I48A 4FORA 3Q27A 2AL5A 3RT6B 1D9YA 1M5CA 4MBPA 2YJPA 2HXWA 2HFBA 1B5IA 3LBSA 1EZOA 3QK6A 4THIA 3C34A 4MLVA 4YB7A 1R9QA 3VLVA 1M5DA 5I56B 4LVQA 3USDA 3OSQA 3G3KA 2E0SA 3H4ZA 4IB2A 4IO7A 4OMBA 4TOZA 4FIMA 2HEUA 4EXLA 3SERA 5EHSA 5KDTA 1B7HA 4HTGA 2G29A 3F11A 5FHMA 4U1OA 1OQGA 1KWHA 2HAUA 2F8DA 3T93B 3H6VA 2QPQA 3B6TA 3PPOA 4PQJA 1Q1KA 1B51A 3ZKKA 4KI0E 3VDFA 2I4CA 1B3FA 4RPOA 2DWIA 5AA2A 3IJOB 3RPWA 1SW2A 4MLQA 1US5A 4IGTA 1JW4A 1LCTA 3SETA 4C1UA 4LZ8A 1IIWA 2VOZA 1ZIUA 4QSCA 4R9FA 2I58A 3MPLA 1P1OA 2XHDA 3FVGA 4H1XA 4QHQA 5DEXA 4JXIA 3CIJA 5I57A 3UIFA 4F1YA 1LAXA 1XS5A 3ZSFA 3UN6A 2QS3A 1RYOA 1LFGA 1LSTA 2DVCA 2H9BA 5KZTA 4RPNA 4OENA 4R9GA 1MXVA 2B3BA 3A3CA 4GRKA 4F31B 1NNTA 4UA8A 3VXCA 3H03A 1LB9A 5FHNA 3TCFA 1QUIA 4DDDA 3V83A 3DELB 3MQ9A 1FTKA 2Z8DA 3FD3A 1IUDA 4YKIA 1XT8A 1TFDA 2O84X 1MQGA 5DEXB 4EQBA 3ONMA 1S9TA 4N13A 5I58A 4RA1A 1QUKA 2XD2A 1OMPA 5I57B 1Y1MA 4GL8A 4JWOA 5I59B 2F5XA 1AIVA 3FVNA 2F97A 3CFLA 4PFUA 1PC3A 2OWTA 1IITA 5K2YA 5CRYA 2XXQA 3T96B 4QFPA 3MVZA 3QXMA 4AB6A 1L5TA 4ECFA 2XXTA 2F6GA 4DLDA 5AE4A 4MFIA 3ILTB 1YAEA 4RXLA 3RTWB 2HQ0A 3TZAA 4BDMA 3RN8A 2F35A 3KOSA 1Y4TA 4OEVA 4Q8RA 1QKAA 4ZEFA 1Y4CA 1Y3PA 4Q5TA 4KYSA 3MP1A 1NKXA 4OXVA 4F39A 5L9OA 1EU8A 3FJ7A 4DZ1A 2OJTA 3FZVA 4C0RA 3SDFA 2A5TA 4ZE9A 1IZ1A 5ICQA 1B3EA 4X1DA 2UVJA 3K1PA 2HZLA 1II5A 3IL1B 3PMXA 3U1OA 1JVYA 2DE4A 3DM0A 4JSOA 3TTMA 1SYHA 2QMXA 3FXRA 3P7IA 1OVBA 4AQ4A 4G8NA 4DCXA 1OLCA 2QJEA 3MZ1A 3O2AA 3T9HB 2AIXA 3Q28A 3PUZE 4QFNA 2Q88A 2DE2A 3PUVE 2Q89A 4OTEA 1I6BA 3QAXA 3G3IA 4OEUA 4H65A 4GQOA 3IX1A 4G68A 2XXVA 1ZU0A 2A5SA 5FHOA 1MY2A 4F2QA 1DMBA 4ONYA 4R2FA 3VFJA 3IOUA 1M5BA 2I0BA 3VVDA 4OHNA 3LSLA 3CG1A 2XX9A 4ZE8A 1B3HA 1PBQA 2Q9TA 1IXIA 1N0TA 1B7ZA 1VE4A 2OK2A 1XVYA 3KN7A 4LQ2A 1ZJLA 3K6XA 4M1VA 1AL3A 2I6EA 4PFTA 2PVUA 3ZS6A 1JETA 4G68B 1M5FA 4LQ5A 2G93A 3UK4A 3IAZA 3MW0A 1MXWA 1SI0A 3TPAA 3H7MA 2RCAA 2F7AA 1N7WA 1H3DA 3QUFA 4LUBA 3TYHA 3AXFA 1MPCA 1D9VA 2YPNA 5H8HA 4U1ZA 3FGSA 4GOTA 2UXAA 2DOJA 5FTIA 1POY1 3O9PA 3T22A 3KEIA 4HS7A 5F7VA 3C31A 4XKRA 1URSA 3PGFA 3GBBA 1WVJA 3TFLA 3VVEA 1NH7A 3MJNA 5F1QA 4ZDMA 4U4SA 1FW0A 4YKPA 1P1WA 3OMBA 3UGWA 2B65A 4X9TA 3S9LC 2H25A 1TWYA 3JYRA 2ANJA 5CMBA 3OEKA 1FQDA 3PUXE 1IXHA 1MXZA 3PPNA 2ZNTA 1ELJA 1CE2A 3A09A 1UTBA 1MM6A 2X7QA 4DE8A 3S9EA 5TU0A 2Q2AA 1JQFA 4L17A 2YLNA 1SW1A 3RUMA 4G8MA 1LAFE 2UVGA 3S9NC 1YCJA 4H8JA 3EHUA 3N5LA 3D4CA 1FTMA 2V3QA 1MXYA 3MVXA 4OQOA 2RC8A 1S7YA 1B0LA 4ESXA 2XXIA 1B0HA 4RYAA 1NNKA 4TQUQ 2R6GE 1ZLQA 1IXGA 3Q29A 4XTCQ 4LZ7A 2PT2A 1GGGA 1B4ZA 4WEDA 5IKBA 4R74A 1UTBB 1PDAA 1NL5A 1QVSA 2V93A 3MWBA 5ISUA 4H67A 1JEVA 2AL4A 3R7XA 2XX8A 2V3UA 5I56A 5JEIA 2M8CA 2ZYOA 2O1MA 2I3WA 5B7DA 1BTJA 3B6QA 2DVZA 1UTHB 4H5GA 1B05A 1TXFA 1SW5A 4MH5A 4YMAA 4NF5B 3PUWE 3FXUA 1SD3A 4FJPA 4RK2A 1USYH 3FVOA 1VR5A 2F36A 4U4XA 1SI1A 2Q2CA 4P0IA 1MH3A 2PBWA 3OELA 5HBCA 4IY5A 2HAVA 2O68A 3IO4A 5K2XA 1AMFA 5ELVA 2V84A 3H6WA 4PP0A 4HCYA 1Y3NA 3IJXB 3RLFE 2Y7PA 2ESNA 2NOOA 4PFYA 4Q0CA 3KZGA 1A8FA 1Y1ZA 3H3GA 4ELOA 4YKJA 1MH4A 4GWOA 3RQTA 3LSFB 4JDFA 3H6TA 3PMVA 1MQHA 4ZEKA 4R2BA 3CRBA 2QS2A 3KSXA 2XX7A 3T9VA 3K2DA 3MP6A 2OLBA 2O1LA 3VLUA 1Z7ME 3CG3A 2REGA 1LLSA 4QFLA 4WXJA 2H99A 3EHTA 3IK6B 3JZJA 4KQPA 1XOCA 2XXYA 4N07A 3U94A 1POTA 4OFLA 1US4A 2NUVA 1B5HA 4R6KA 3M8UA 2FNCA 3BBRA 4P11A 3N6TA 1PB8A 3GZGA 3MZ9A 5H8QB 4FAJA 1UIUA 4ZZEA 1MG1A 1OQHA 5I59A 1B32A 4YICA 4F3SA 3VE1B 2ZYNA 2E1SA 1MY3A 1B46A 3LC8A 3QUJA 1AOVA 4ELPA 5L9SA 3KN3A 4NTLA 2O51A 3I5OA 5I2KB 1DPPA 4PFWA 3SEYA 3EN3A 1TT1A 4IY6A 4TLLB 4E0WA 3K6WA 1WDNA 1NNPA 3JV9A 3LSWA 2Z23A 3CVGA 3MBPA 1URDA 1GVCA 3U8QA 4OYVA 1YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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