3O6IA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6iA02
3B6WA 3PUZE 3N6UA 1D9VA 4H1XA 3S9LC 4TOZA 2QMWA 1FTJA 3K6VA 4N13A 4U4SA 1ZJLA 4FEDA 3RTWB 4G8MA 1RYOA 2V3QA 4KYDA 5EYFA 1SQYA 4LUBA 3PD8A 2DOJA 2R6GE 4OFOA 5L9MA 3DP6A 4H8IA 1MH4A 3TMGA 1FW0A 1IXHA 2DVCA 4HS7A 3SDFA 4H8JA 1S7YA 2H99A 4K3FA 3KZGA 2XXYA 3BFTA 2P2AA 4DCYA 3KN7A 1Y1MA 4LVQA 1LAXA 3FJMA 4IO3A 4XKPA 4OQOA 1MH3A 3G3JA 4FORA 2HAUA 1NH7A 4KD5A 4MH5A 2DS9A 3VV5A 1Z7NE 3W9VA 3IOVA 4C0RA 3E4RA 4GD5A 2UVJA 3W15C 5CBRA 2ONRA 1Y4CA 3VXBA 4MLVA 3QUJA 3TPAA 1A99A 1O64A 3O28A 3JZJA 2XXRA 3MW0A 3OEKA 1Y9UA 4NF4A 4YKJA 2OZZA 3OO9A 1P1WA 4M1VA 1B4ZA 3CIJA 4XTCQ 2PT2A 3UP9A 1JVYA 1PB7A 3H6UA 5DEXB 2X26A 2DWHA 1YTVA 1DTZA 2D3IA 3IORA 3TTLA 4EXKA 4LONB 1QW0A 3IK6B 3G3KA 2R9JA 1XHYA 2Q2AA 3HPIA 2ZNUA 3EPEA 3OO8A 4OMBA 1QVSA 3T96B 3BBRA 3C32A 3GZGA 3MVYA 2GHAA 3JYRA 3HHGA 3G7WA 4H65A 4YB5A 3K00A 3K1MA 1A7LA 4G77A 1ZIUA 3DLNA 2D5WA 4LA9A 3S4UA 3TDJA 4FEBA 4C1TA 1NNPA 3ODBA 1MPCA 1H43A 1IZ1A 1NNFA 3PMWA 4POXA 1HSJA 4IO4A 1VR5A 2F36A 2ZMBA 4YMAA 4TLLB 1ELJA 1XOCA 2DYXA 3RGYA 1CE2A 4BDLA 3DELB 4IY6A 2O1LA 3FATA 2XX8A 2V93A 5TPAB 5I57B 4FECA 1PEBA 1B05A 1GVCA 3TCFA 2CMOA 4RYAA 3PPPA 1ANFA 4BDQA 2UXAA 2XXHA 3QXMA 4H5GA 4KYSA 4WEDA 2ZYKA 1MG1A 5H8NA 4AB5A 1PBPA 1Q35A 2I48A 3ZS6A 1B7UA 1GTKA 4OFLA 4QFKA 3VVFA 4OYVA 2NUVA 2AYSA 4DDDA 3FJ7A 1FTOA 1XVXA 1JEUA 3CFZA 3RT6B 3MP1A 4RK2A 5CI5A 1YCJA 4AB6A 1IXIA 1R9QA 5JK4A 1MQGA 4IB2A 1QKBA 2NXOA 2PYYA 1D4NA 4PQJA 4H5FA 1FQDA 2ZNSA 3F11A 4EQ9A 3PMVA 4YKIA 4RPOA 1MY1A 4ZEIA 4ESXA 4X1BA 2WKYA 2OWTA 1IUDA 2RC8A 4GLIA 1M5DA 1ZKBA 1I6BA 3LC8A 1LB8A 3KN8A 2QS1A 3FVOA 2I4CA 2ZXTA 4GOTA 2XXXA 1MM6A 4GXSB 1MXZA 3T9HB 2OBGA 1B1XA 1LFGA 2XHDA 2O51A 3KEIA 4YB6A 3SEVA 3T9XB 3N26A 1IQ7A 3G3FA 4DXUA 1SYHA 4KQPA 4P0GA 2Q89A 3MBPA 4G8NA 4C1UA 4ELQA 2DQVA 3T9UA 5B70A 1AH5A 1MXUA 3DP4A 1SI1A 3H03A 3IB2A 2O7UA 1MS7A 4H67A 3L6HA 3JV9A 1SW5A 2VOZA 3CRBA 1OVBA 4QSDA 3Q28A 4NWCA 1F9BA 3B6QA 3RN8A 4PE5B 2ABHA 4OVJA 5CMBA 1LB9A 4QSCA 1SW1A 3LSWA 1B3EA 3RLFE 5JTYA 3R7XA 4U23A 3Q25A 5CM6A 4YKKA 5H8QB 1A8EA 4YKPA 1SYIA 4IGTA 3TKDA 4ZEDA 2UVHA 3EHSA 1AOVA 3T66A 2X7PA 2V25A 4I9DA 3QIMA 5KCJB 1OIBA 2B65A 3PUWE 3FV1A 1H45A 3SEWA 1Y3NA 2AIXA 3M8UA 3MZ9A 2R71A 5DVIA 4EF2A 4YB7A 1MXVA 2UVIA 1R1NA 2HQ0A 4GVOA 2FNCA 4YAHX 2DWAA 4F18A 1AIVA 3IX1A 4R6HA 4Z0IA 2H4IA 3OD7A 4RJZA 2QSXA 3TCHA 1UTHB 1R9LA 2QRYA 4NMYA 1AMFA 4X48A 3VLUA 1OQGA 3I3VA 5H8FA 2QJEA 2A5TB 5AA2A 4QFLA 2XXUA 5I59B 4HCYA 2AL5A 1Z7ME 5H8HB 3HSTA 2REGA 2XD2A 4GL0A 1R6ZA 2M8CA 1S9TA 5HPQA 5FHMA 4NF5A 1ZBMA 4G68A 2ZYOA 2I3VA 3H4ZA 1KWHA 1USYH 4JSDA 1LSTA 3FJGA 2XXWA 3QAXA 4YU0A 1UTBA 5K2YA 3MVXA 4FE8A 3LUYA 3VLWA 4ELOA 4F2OA 4ZEKA 4OEUA 5I56B 3KFMA 2UYEA 1OLCA 3FVGA 2XXVA 3I5OA 3PUXE 2HZKA 4QF9A 3V8XB 4O3CA 2F6PA 4U1ZA 4ISUA 1N3WA 1MXYA 3TTNA 3PD9A 3K2DA 2NVUB 4F39A 2F34A 4IO6A 1N7XA 5I84A 1B3GA 1QKAA 3IAZA 3MQ9A 1FTLA 4OENA 1MY4A 4O3BA 3OOAA 4ECFA 3G3HA 2G93A 2RF1A 4LQ2A 4OFJA 3SEXA 3A09A 2F78A 3V89B 2DWJA 3SEUA 4U1OA 2O84X 2DP8A 2F7CA 1B5HA 3H7MA 3KSXA 4ZE8A 4JBZA 4KHZE 4F19A 1OVTA 2XXQA 3IO4A 1TXFA 4QHQA 3PPNA 4U4XA 5AA4B 1FQAA 3FXQA 3TTRA 4NF6B 4JWYA 4PFTA 5I58A 2OK2A 3QK6A 1BLFA 4ZS9A 2DSFA 2VD3A 4F1UA 1D3KA 1US5A 5K2XA 4PFYA 2I49A 5I2NA 5ICQA 4QFOA 3C33A 5ITPA 3GXAA 1JETA 3IR1A 1FTMA 1LLSA 3MC2A 4JSOA 4ND9A 3Q27A 1RYXA 5KDTB 3TELA 1B58A 3K0VA 3A3CA 1PB8A 3EHUA 2DE4A 3EQ1A 1XT8A 4JDFA 4U2RA 1GR2A 1MQJA 4F3GA 3IJOB 4F3SA 3IB1A 4F2QA 3H6VA 3P7IA 3USDA 2OWSA 2Y7RA 2F6GA 5JEIA 1MDP1 3V5AA 1SVXB 3O9PA 3R6UA 5DEXA 3ZKKA 2ZNTA 4OHNA 1MY3A 1WDNA 1DSNA 3TCGA 3VFJA 3H6TA 5FHOA 3CVGA 2VGQA 3QUFA 4FAJA 1MY2A 3HO7A 3QYTA 4IO2A 5TU0A 3SESA 4KPTA 4OERA 3M3LA 2O1MA 4IY5A 3PV0E 1A54A 4JXIA 4LZ7A 2E0SA 3MZBA 4P0IA 2P1SA 3SEYA 3C31A 4OEVA 3WAFA 2ZYMA 2HXWA 1URGA 5AA1A 5HM4B 5ELVA 3N94A 1M5BA 1LCTA 4YICA 5FTHA 2PMSA 3T9VA 1B32A 4F3PA 2I58A 5EHMA 3OSRA 1XC1A 4GXAA 4X1DA 4EUOA 2QPQA 1H76A 5IKBA 4RNSA 4HTGA 2Z22A 1JVXA 2OLBA 2THIA 1JW4A 5I2KA 4OXVA 1LAHE 5CBSA 4I8CA 3OELA 5F7VA 2OJTA 1M5EA 3RT8A 4IO5A 1N7WA 3S9MC 4ZZAA 3H6WA 2F5XA 1SBPA 4QFPA 1QULA 1NMUA 4XKQA 1OMPA 1ZTYA 1IXCA 2XX9A 1IITA 4NTLA 4JB7A 2VHAA 1NFTA 1FQCA 3GBBA 2Z8DA 4LATA 4NWDA 2O7IA 2DXYA 1DPEA 4QSEA 3OO7A 4IO7A 4DXCA 2H98A 4GRKA 3KN3A 3E3KA 4DE8A 1URDA 1T0KA 3R26A 3TUSA 2GH9A 1HSEA 2XXPA 3C35A 4RXLA 4R9GA 3KBRA 3LBSA 3KOTA 2AL4A 4F3BA 2IA4A 3H3GA 2Q88A 3UN6A 3A3UA 4OZ9A 3IJXB 4EXLA 1DMBA 1LBBA 3KSJA 5F1QA 3TFLA 1EU8A 3IOUA 4WKMA 1LFHA 3FV2A 1O63A 4Q5TA 1P1OA 1BKAA 3KJTA 4RA1A 2UYFA 1TFDA 4R2FA 1ATGA 4L17A 1MPBA 3FVNA 1N0TA 2O69A 1NKXA 2VD2A 1DOTA 3O2AA 3EHTA 2HFBA 3O66A 3HCQA 2DE3A 3LSLA 1JNFA 5TP9A 3EF7A 3PUYE 3K4UA 4BDNA 1B7ZA 5CRYA 3LSXA 4WEPA 1MY0A 2O6AA 1VFDA 1A8FA 4LP2B 1B3HA 3UIFA 3H06B 4KYEA 1TWYA 3T22A 4XKRA 2RC7A 4QRZA 4NF8A 3K1PA 2Z8EA 2B3FA 1EZ9A 5CC2A 3N5LA 4ZECA 1Y20A 1MDQA 4FJPA 4O3AA 5JTYB 3TTKA 5B7DA 2QS2A 2NOOA 2F8DA 1YPNA 3PMXA 4GWOA 1BIYA 1P1NA 3BKIB 3K6UA 4R75A 4KI0E 4FIMA 4YMBA 3FVKA 1MRPA 2ESNA 1D9YA 3FIRA 3G3IA 1WODA 4HCWA 2BJJX 3KGCA 1OLAA 1B52A 3ILTB 3OEMA 3E9XA 4GF8A 4G2ZA 4THIA 3O6HA 2ALUA 2IEEA 4RPNA 1QUJA 4WXJA 3OENA 1CB6A 2Q9TA 5KCJA 4NE4A 2QMXA 4LZ5A 1B2HA 1O7TA 5EHSA 2A5SA 1B0LA 3E13X 3S2VA 4R6YA 4E0WA 4ESWA 5L9SA 3ZKLA 3RQTA 5AA3A 4DIGA 5A5XB 1TFAA 4G68B 2OCUA 1UTHA 2PBWA 5CMCA 5IAIA 1JW1A 1HSLA 3PUVE 3VE1B 4MF3A 5I59A 4BDMA 3FZVA 5H8HA 1B9JA 1JQFA 3TQWA 5ISUA 1PB9A 4MLQA 2DWIA 4ZZEA 1IEJA 2F7AA 3MP6A 3B7DA 3DP8A 3MPLA 3BFUA 1SI0A 3S9NC 1I69A 1LFIA 2RINA 3U92A 2CZLA 5I56A 2RCAA 1B5IA 1P1QA 4PFWA 3DM0A 1I6QA 2H9BA 1FQFA 2O68A 1NNKA 3K1NA 2H5YA 3ECRA 2XXIA 3KG2A 3LR1A 3O6IA 2W7YA 1VSOA 4XKNA 2YPNA 4YZZA 5M2VA 3D4GA 4EQBA 1L5TA 4OWDA 1PC3A 3CSGA 1VE4A 3TTMA 2HZLA 5CMKA 4I1DA 4E0XA 4M4GA 2ONKE 3KOSA 5I58B 3IL1B 3V83A 5DVFA 2RKMA 3IOWA 5I2NB 3THIA 1LBCA 3W9WA 4XIGQ 1NNTA 5BWJA 5AA4A 2Y84A 4NF6A 3CR9A 3VLVA 2RCBA 4KCDA 3CFXA 4NF4B 2V84A 1EZOA 2XD3A 3K02A 4NEDA 3MPKA 3WAEA 2HEUA 3K6WA 1B5JA 3VVDA 2Y7IA 2V3UA 2XXTA 4ZEBA 3TQLA 3S9EA 3Q29A 5ICTA 1USYE 1JW5A 1RKMA 4AQ4A 3N6TA 2B3BA 5KZTA 1MQDA 3VDFA 1UIVA 3C9HA 2HCAA 5KDTA 3PPQA 3D4CA 3L6GA 1NL5A 1SW2A 3SERA 3K6XA 2QS4A 4FATA 4MBPA 2ONSA 3FXUA 4HW8A 5CMMA 1P1UA 1JEVA 1Y1ZA 4U22A 1POTA 3SETA 4ZE9A 4LQ5A 3G3GA 3O29A 2I6EA 1H3DA 1TT1A 1URSA 4POWA 3O6GA 1MXWA 4GFRA 1B3LA 2Q2CA 4Q8RA 2HAVA 3UA8A 1A40A 3PGFA 2Z8FA 2REJA 1QJMA 3K01A 3CI8A 1VFEA 2RC9A 5AA2D 1B7HA 1PDAA 4R72A 1IXGA 4G68C 2NWJA 2F7BA 2XX7A 4KCCA 1QUKA 4DCXA 4BDOA 3PPOA 1SD3A 3TZAA 4F31B 1SW4A 1Y4TA 5AE4A 3OO6A 3GBAA 4GIZA 4ZDMA 1B6HA 1B0HA 2X7QA 5LOMA 5I2KB 3MJNA 1N04A 5TPAA 2H25A 5I57A 5H8NB 1FQBA 3MAMA 3MZ1A 3B6TA 1SDXA 4F1YA 4QFNA 2Q8JA 5L8DA 1PBQA 4IGRA 2PT1A 4TLMB 2I3WA 3RTFB 1BP5A 1M5CA 4R74A 4Q0CA 2DVZA 4R6KA 1UQWA 3MP8A 4UACA 3C4MA 2UVGA 2D21A 1P99A 1DTGA 1GGGA 4ELPA 1XS5A 5J1DA 2G29A 5DTBA 1XVYA 2I4BA 4JWOA 1Y3QA 2GFEA 3OSQA 2VP1A 3C36A 1POY1 3MVZA 1OQHA 4UA8A 1B40A 5BUUA 3FD3A 4MFIA 3CG1A 1MM7A 4N07A 3TYHA 3U93A 3HHFA 4ONYA 1UIUA 1LAGE 1J1NA 2PVUA 2LAOA 4LZ8A 4H0WA 4I62A 4EF1A 1GV8A 2YJPA 3UGWA 4XXUA 1FCKA 4KFQA 4G4PA 1ZU0A 2Y7KA 4PP0A 1MPDA 1B4HA 1EH3A 1FTKA 4PETA 2Z23A 1FQEA 1YAEA 1N76A 4F22A 2GHBA 2Y7WA 5TP9B 3IOTA 3OXNA 1Y3PA 3MUQA 1ZLQA 4KR5A 1LCFA 3Q26A 4OTEA 4OESA 4RK9A 4DXBA 2F35A 5ITOA 3SKPA 1I6AA 4EDPA 1M5FA 3TEPA 1BTJA 4X9TA 1MQIA 3ILUB 3RUMA 3MVWA 3FUZA 2QS3A 4PFUA 4NF8B 2FA7A 1N3XA 4ELRA 3MWBA 2I0CA 3ONMA 1LAFE 2P0SA 3IB0A 1Q1KA 1A55A 1EZPA 2PX1A 3M3FA 1QUIA 4Q30B 4R9FA 2GRVA 2DXRA 3GLBA 2QL3A 3U94A 1S50A 3FGSA 3RPWA 2I0BA 3LSFB 1II5A 1IIWA 3UORA 3M3KA 4H6DA 2KLFA 2F97A 3O97A 3T93B 2YLNA 5H8QA 4G8HA 4RY1A 1MXXA 3AXFA 1DPPA 3QSLA 4BLAA 3CSBA 3U1OA 1MQHA 1H44A 3RNNA 4BDRA 1NH8A 3CFLA 4TQUQ 4JWXA 3EN3A 5H8SA 4R2BA 3RY3A 4F29A 4ZEFA 5H8FB 5AA2B 1B51A 4GQOA 5FTIA 4OETA 4GL8A 4NF5B 3TODA 1WVJA 1B46A 2Y7PA 1N84A 5DYHA 1US4A 4F1VA 5FHNA 2ZYNA 1UTBB 2E1SA 5DVJA 2A5TA 3ZSFA 2V3TA 3KJ7A 3PU5A 4R73A 5HBCA 1B1HA 3TAJA 3VXCA 4U21A 5A5XA 4N6PA 3HV1A 3PPRA 3IO6A 3FASA 4P11A 1ZMGA 3C34A 3U72A 3UK4A 2FYIA 3OMBA 4DLDA 5DT6A 2ANJA 1B3FA 1LGBC 2DE2A 3FXRA 4Z7EA 5L9OA 3I6VA 1AL3A 4DZ1A 3VVEA 4EQ7A 3U8QA 3CG3A 3HN0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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