3O97A

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with indole acetic acid at 2.68 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
Knots found
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of the complex of C-lobe of lactoferrin with indole acetic acid at 2.68 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2010-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o97A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o97A02
1NL5A 1P99A 2Z23A 3HO7A 3H06B 1BP5A 3IOVA 3I6VA 1M5CA 3MP6A 1B5HA 2XXTA 4R2BA 3QIMA 2VP1A 2ALUA 3KBRA 2UVIA 3BFTA 2RCAA 1QUKA 2XXPA 1MXYA 1MY1A 3SDFA 3U92A 2Q9TA 1T0KA 3KGCA 1MPDA 3B6WA 4THIA 1FQAA 3C31A 1H76A 4WKMA 1YCJA 1IXHA 4ZEFA 3MVXA 2PMSA 1CE2A 3VVEA 1PDAA 1EZPA 4QHQA 2VHAA 4R6HA 3K1NA 3TKDA 4UACA 5CI5A 1XS5A 3IO6A 4L17A 1OVTA 4PFYA 2H25A 3T9VA 3MP8A 4NF5B 1FQBA 4PP0A 1S7YA 4QF9A 4BDLA 3HV1A 3TTNA 5A5XB 5KCJA 1SBPA 4H65A 2XXHA 3PV0E 3MQ9A 4DDDA 3DP6A 4R75A 3V8XB 2Z8EA 1A8EA 3ZSFA 1AIVA 1PBPA 4LQ5A 5L9MA 5I59A 3W15C 1S50A 2DVCA 1N7XA 5TP9B 2H5YA 3TQLA 1HSJA 3PD8A 4QSCA 2F97A 3KN7A 1RYXA 2V25A 4F22A 3G3KA 1MRPA 4GD5A 5I56A 4GXSB 3MC2A 1JW4A 3B6QA 1AOVA 1ZBMA 1QKAA 2PX1A 1QJMA 4QSDA 3M3KA 4YB5A 2FA7A 1UIUA 1B0HA 3MP1A 4I9DA 4ZE9A 2Z22A 1Y3QA 3FVKA 2YLNA 3FVGA 5DEXA 4Q0CA 5JEIA 3MPLA 3FATA 1Y1MA 4LZ8A 3PPNA 2XD3A 3MVZA 3O29A 2DSFA 1UTBB 3K6UA 5DTBA 3N6UA 3TAJA 3E3KA 4KQPA 2XHDA 5I59B 1FQEA 4YKKA 3T96B 5AA2A 5AA4A 1B7UA 4H8JA 4F18A 2OBGA 3TUSA 4RNSA 1M5DA 4GIZA 1O64A 4AB5A 4BDNA 3R26A 1GV8A 1P1NA 4IO3A 4OETA 4P0GA 3T9UA 4Q30B 2H9BA 1FW0A 1USYH 2F34A 4GWOA 3IORA 1A99A 3KJTA 3USDA 4WEPA 1YTVA 1DTZA 3EF7A 1NFTA 4MLVA 2Z8DA 3FASA 1LFGA 4BLAA 1NNPA 1BTJA 1O63A 3PPPA 5HPQA 1MQGA 2OK2A 5AA2B 3CG3A 3CI8A 1B7ZA 1LAHE 3QSLA 5BWJA 4U23A 2UXAA 2RINA 2X7QA 1IZ1A 3OXNA 4RK2A 2I6EA 2DYXA 1B0LA 2XXXA 2UYEA 1R9QA 5L9OA 1NKXA 4DIGA 3U93A 4Z7EA 4NMYA 2ZMBA 2DXYA 4XKPA 2VOZA 4G2ZA 2X7PA 4IO4A 4KYEA 1I6QA 1B1XA 4TQUQ 4F1VA 3TYHA 5EHSA 4HTGA 3IX1A 2RCBA 4IY5A 2E1SA 1P1QA 3O28A 3P7IA 1JEVA 1LFIA 2NXOA 2Q2CA 3MZBA 4NF8A 4F19A 5FTHA 4AB6A 3GXAA 3G3IA 3IO4A 1H45A 2PVUA 3T9HB 1B4ZA 1A40A 3A3UA 5AA2D 4ZZEA 1MS7A 5FHNA 2XXIA 1URSA 1LB9A 1B7HA 4OESA 4Q5TA 3TCHA 5ITPA 2GRVA 3CFXA 4FECA 4BDQA 2DP8A 3C32A 4G68A 1SDXA 4PETA 1N04A 1QUIA 4ZEDA 1SYHA 4IB2A 3L6GA 2O51A 1LB8A 1GGGA 2ZNUA 2AL4A 1MPBA 3HSTA 4POWA 1Y20A 4DXUA 4U1ZA 3ZS6A 2O1MA 5I57B 3O66A 1IXGA 4DCXA 1P1OA 1PBQA 3VLVA 2ZXTA 2FYIA 4R6KA 1XOCA 2DE4A 4IO6A 4JSDA 3FD3A 4OERA 4FAJA 1FTOA 3H4ZA 3M3FA 1Y3NA 3KEIA 4G68B 4NTLA 2HAUA 2XD2A 3S2VA 1MH4A 2XXYA 4JWXA 5ITOA 2OWSA 4GL0A 2F7BA 1D9YA 4ZEIA 4PFUA 4U4SA 1MQIA 5EHMA 3PUZE 3RY3A 4R9GA 5DVFA 3V89B 4JDFA 2O69A 2Q88A 2DWAA 3BKIB 1PB7A 3N5LA 4RA1A 3KSXA 1ZTYA 4EUOA 1NNFA 4EQBA 1UIVA 3LSXA 3HPIA 3B7DA 5ISUA 3H3GA 3Q26A 3R6UA 3MJNA 4EXKA 1HSEA 2Y7RA 1D9VA 1OVBA 1JNFA 1SVXB 4OQOA 4E0WA 3V5AA 1FCKA 3T66A 1SD3A 3Q29A 5CMKA 2IA4A 2QS1A 3N26A 3FJGA 3K02A 3O9PA 1MY0A 2Q89A 4KCCA 3EN3A 2B65A 3H03A 2QJEA 1JW5A 4RXLA 2ONRA 2HFBA 1LBBA 5CMCA 2Y7KA 2NOOA 3D4CA 2QS2A 4ZEKA 1FTJA 1LCFA 4OEUA 4BDOA 4UA8A 3VXBA 5BUUA 4TLLB 4PFWA 4GQOA 2UVJA 3UP9A 4PFTA 2OZZA 5TPAB 2O6AA 2FNCA 4HCYA 4H5FA 3QYTA 2GHBA 1Z7NE 3G7WA 1EZ9A 5H8QB 2I58A 1A55A 3O6HA 5F7VA 3Q28A 3EHUA 3Q25A 3SEYA 2PYYA 2UVHA 1P1UA 3K6XA 3FJ7A 3FV1A 4HW8A 3FVOA 4OFLA 2A5SA 2ZYMA 1MM7A 3RT6B 4Q8RA 2F7AA 3UIFA 1SQYA 3CSGA 5HBCA 5CMMA 4RJZA 4N07A 4NF4B 1B9JA 3MZ9A 4NE4A 4MLQA 4GRKA 1M5FA 3FXRA 3TCFA 1B46A 2HEUA 1TXFA 4H6DA 3GZGA 1FQFA 3ONMA 5DVIA 3QUFA 3K0VA 2H4IA 3OSQA 4U1OA 3VE1B 1NNKA 2F8DA 3W9VA 1BIYA 3T93B 4ZECA 5TU0A 3PUYE 1I6BA 4KYSA 1TFDA 1Z7ME 1IEJA 2BJJX 2R9JA 2HZKA 3SEVA 4OTEA 4C0RA 3F11A 1SW4A 2G29A 1MM6A 3K1MA 3VFJA 1B4HA 1IIWA 3QAXA 3CSBA 4U22A 2NVUB 3IL1B 3IOTA 3VLUA 4OEVA 2F6GA 3U8QA 3IOWA 2H99A 2RC7A 1WODA 4OZ9A 4RY1A 4F3SA 3TQWA 2Y7IA 3D4GA 4DZ1A 4FEBA 1MQJA 3FV2A 3H6TA 1D3KA 3S9LC 3KN3A 3TZAA 2DXRA 1IXCA 4F3BA 1GTKA 4H5GA 1LGBC 2NUVA 3LBSA 3O2AA 5JK4A 3V83A 4NF6A 3OOAA 4F1YA 3HN0A 3SEUA 3PUXE 4GLIA 3VLWA 3FUZA 2OCUA 5B70A 3B6TA 1EH3A 2ANJA 4OVJA 3C33A 3UGWA 2XX8A 3GBBA 4ZE8A 2DWIA 5KCJB 2XXWA 5KDTA 3U72A 2O1LA 2QMWA 1LBCA 3CR9A 3IJXB 2I3VA 3EHTA 4FATA 3SESA 4N13A 2RF1A 2I3WA 1MXXA 1XVXA 5AA3A 1ZLQA 1UTHA 2F36A 3TTRA 2VD3A 5L8DA 1OLAA 3RGYA 1MXUA 3WAFA 1XC1A 1FQCA 4YKIA 4NF6B 5I56B 2YPNA 3I3VA 2R71A 3ZKKA 5I84A 5H8FA 4KHZE 3MVWA 4QFPA 5AA1A 5H8NA 1O7TA 4YAHX 2O68A 2XXUA 5DEXB 4F39A 4KPTA 1L5TA 4H1XA 5KDTB 4GL8A 3PMVA 1QULA 1OIBA 2XXVA 3PMWA 1B5JA 1UQWA 3LSFB 4XTCQ 5CM6A 4RK9A 4K3FA 4ISUA 4QFOA 1EZOA 4X1BA 3KG2A 3MBPA 2QMXA 1ELJA 1IUDA 2V93A 2E0SA 4R2FA 5AA4B 4ELPA 1II5A 1B3HA 2Q8JA 4NWDA 5CRYA 4RYAA 5L9SA 2QRYA 2V84A 4YKPA 2I0BA 3T9XB 3LR1A 3OSRA 5H8FB 4M4GA 4ONYA 2B3BA 5J1DA 5H8NB 2HAVA 4R9FA 3QUJA 1XHYA 3LUYA 3MWBA 3IB0A 2REGA 2ESNA 3THIA 1RYOA 3TCGA 3VXCA 3MAMA 1DPEA 3MVYA 4EXLA 2VGQA 1LLSA 2OLBA 1N3WA 3PGFA 1CB6A 1MH3A 2NWJA 3ECRA 3FZVA 3H6VA 1Y4CA 4LZ7A 1DTGA 5I2NA 3U1OA 1MXZA 1B05A 5K2YA 1B3GA 4JWYA 4LVQA 2P0SA 1VR5A 1P1WA 4I1DA 1B1HA 4MH5A 3E9XA 2UVGA 3JZJA 5FHOA 4YB6A 3TDJA 1LAGE 1PEBA 4FORA 1LSTA 4HS7A 3KJ7A 3MPKA 3TELA 3W9WA 3SEXA 1LAFE 1BKAA 4IGTA 1IXIA 3VDFA 3KOTA 1TFAA 4P0IA 2QL3A 1JETA 2QPQA 2HQ0A 3PD9A 1QW0A 1RKMA 2R6GE 4H8IA 1OMPA 4NF8B 4X1DA 4F31B 3A3CA 3FXQA 1FTKA 2DWHA 4IO5A 4G77A 1LCTA 4F1UA 5CC2A 1QVSA 5DYHA 3RT8A 5H8HA 1ZU0A 1M5EA 2REJA 5CMBA 5EYFA 1N7WA 2ONKE 1VSOA 4C1TA 3Q27A 2Q2AA 3H6WA 3PMXA 2DQVA 1I6AA 2ZYNA 4XIGQ 3M3LA 4DLDA 1D4NA 5IKBA 3RN8A 1KWHA 1SI0A 4PE5B 1VE4A 4YU0A 4GXAA 3VVDA 2W7YA 3DLNA 1PB8A 3S4UA 3ILUB 3OD7A 3BBRA 4QSEA 3SKPA 3K1PA 4G8MA 4U2RA 4DCYA 4JWOA 2V3UA 4H67A 5I58A 4OENA 4ELOA 3KN8A 3ZKLA 4FJPA 4WEDA 1JVXA 2D21A 3IJOB 2UYFA 3HHGA 3IB2A 4ESXA 2KLFA 4YZZA 2XXQA 4FE8A 4ELRA 2QS3A 4LP2B 1Q35A 2D5WA 3SEWA 4LATA 4LZ5A 3RTWB 4IGRA 5ICQA 3K2DA 2A5TA 2P1SA 1JQFA 3TEPA 2DWJA 3FJMA 3DELB 1ZJLA 1MQHA 3CFLA 5I2KA 2PT1A 3QXMA 5F1QA 2ONSA 4ELQA 1LAXA 3E13X 4F2QA 3RNNA 3UA8A 2I0CA 3IAZA 4ZDMA 1N0TA 4PQJA 1A7LA 4C1UA 3PUVE 3MW0A 1NH7A 4OYVA 1F9BA 1MXWA 4QFKA 3DM0A 5DVJA 3LC8A 2HZLA 3FXUA 4GOTA 1MY2A 3KFMA 4QFLA 3G3GA 5ICTA 1US5A 3A09A 3PPQA 4EDPA 2GFEA 1DOTA 1PC3A 3OO9A 1URDA 5H8SA 1XVYA 4NWCA 3RTFB 1NMUA 3TFLA 3DP8A 3FGSA 1QKBA 2CMOA 4JBZA 1Q1KA 3SERA 1WDNA 5I2KB 4MFIA 4P11A 2F5XA 4GF8A 4NF5A 1B52A 4KFQA 3GBAA 3LSWA 3TTLA 1NNTA 4LA9A 5A5XA 3CVGA 5LOMA 2RKMA 3KSJA 1FQDA 3JYRA 3S9NC 3FIRA 4JSOA 1TT1A 1Y4TA 4YMBA 2Y7PA 3TMGA 5TP9A 4Z0IA 3C34A 1H44A 2DVZA 2QS4A 4EQ9A 3EPEA 4RPOA 1ZKBA 1DMBA 4I62A 1ZMGA 2D3IA 2Z8FA 2O84X 4WXJA 4OFJA 2ZNTA 2ZYKA 4OXVA 4EF1A 4RPNA 2THIA 3PU5A 1UTBA 1DPPA 3KOSA 3EHSA 3K4UA 3L6HA 3CFZA 2I48A 3N6TA 3TTMA 1SI1A 3G3FA 4BDMA 4F3GA 1FTMA 1MY4A 5JTYA 4ZZAA 1HSLA 4DXCA 3HCQA 4M1VA 4YKJA 1XT8A 4KD5A 3ILTB 2RC9A 2F7CA 3I5OA 2AL5A 5M2VA 2H98A 3K6VA 4JXIA 1ANFA 2HCAA 2F35A 1N3XA 3RQTA 3SETA 4H0WA 3TPAA 3AXFA 4TLMB 3OMBA 1EU8A 4LQ2A 1IQ7A 1OQGA 3RLFE 5JTYB 1B3FA 1GR2A 3K00A 4O3CA 1MXVA 2ZYOA 2I4BA 2CZLA 4X48A 1PB9A 1MQDA 1B58A 3C35A 5B7DA 3TTKA 1N76A 2DE3A 1BLFA 2ZNSA 3O6IA 4IO2A 1B6HA 1H43A 3MZ1A 4I8CA 3E4RA 1UTHB 3CIJA 3MUQA 3C4MA 4IY6A 4OFOA 4OMBA 1WVJA 3G3JA 1NH8A 4XXUA 1MDQA 3DP4A 2HXWA 2XXRA 1B2HA 2WKYA 1J1NA 1R1NA 3OO6A 3U94A 2G93A 1Y3PA 3OEKA 5DT6A 2V3QA 3CRBA 1POTA 3IK6B 3IR1A 3O97A 4KCDA 1VFEA 2I49A 5FHMA 4ZS9A 1JVYA 4AQ4A 4DE8A 3M8UA 3O6GA 4GFRA 4OWDA 1OQHA 1AL3A 1SW2A 1Y9UA 4LONB 2V3TA 1S9TA 1MDP1 2GHAA 4QFNA 1H3DA 4R74A 4NEDA 4QRZA 5K2XA 3CG1A 1JW1A 1MPCA 1R6ZA 1QUJA 1B51A 2GH9A 4ESWA 3RPWA 1SW1A 1VFDA 5CBRA 3FVNA 3S9EA 4EQ7A 3PPOA 2XX7A 5IAIA 1MG1A 2X26A 4F3PA 3C36A 2I4CA 4R72A 5KZTA 5I57A 5FTIA 5HM4B 1N84A 3S9MC 4G8NA 3TODA 3VV5A 4R6YA 4FIMA 1POY1 4X9TA 2PBWA 4F29A 2F78A 2DOJA 1OLCA 3OO8A 4KI0E 2DE2A 1SYIA 4TOZA 4ZEBA 2RC8A 3QK6A 3EQ1A 3ODBA 4G68C 5I2NB 4N6PA 1USYE 4R73A 2IEEA 4ECFA 1A54A 5ELVA 3OENA 3UK4A 1B32A 1Y1ZA 4E0XA 2P2AA 1AH5A 4ND9A 4LUBA 2O7UA 1R9LA 3WAEA 1URGA 3PUWE 2AYSA 2M8CA 4BDRA 4GVOA 4FEDA 4HCWA 3K6WA 3OELA 4YMAA 3RUMA 4POXA 2F6PA 4JB7A 3R7XA 5AE4A 4G4PA 1SW5A 1JEUA 2QSXA 1MY3A 1GVCA 3OO7A 1LFHA 4OHNA 2O7IA 1AMFA 1B3LA 1FTLA 5H8HB 1B3EA 5CBSA 2VD2A 4EF2A 4XKRA 1DSNA 3H6UA 3N94A 4MBPA 4O3BA 1B40A 4XKNA 2YJPA 3IB1A 2OJTA 4U21A 1ATGA 1B5IA 5TPAA 3T22A 1YAEA 2LAOA 4U4XA 1US4A 1TWYA 1M5BA 4MF3A 5H8QA 2PT2A 4KR5A 2XX9A 4YB7A 3H7MA 4G8HA 3BFUA 2OWTA 1I69A 3UN6A 2AIXA 5I58B 4YICA 4XKQA 3HHFA 3KZGA 4O3AA 3G3HA 1ZIUA 3UORA 4NF4A 4F2OA 4KYDA 2ABHA 2B3FA 4IO7A 1YPNA 1A8FA 3GLBA 3OEMA 2Y7WA 4DXBA 3JV9A 2A5TB 3VVFA 3IOUA 1IITA 2Y84A 3LSLA 2DS9A 3PPRA 3C9HA 3K01A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NL5A 1P99A 2Z23A 3HO7A 4QBAA 3H06B 1BP5A 3IOVA 3I6VA 4OANA 1M5CA 5LDZA 3MP6A 3A29A 1B5HA 2XXTA 4OVPA 4R2BA 3QIMA 2VP1A 2ALUA 3KBRA 2UVIA 3BFTA 2RCAA 1QUKA 2XXPA 1MXYA 1MY1A 3SDFA 3U92A 2Q9TA 1T0KA 3KGCA 1MPDA 3B6WA 4THIA 1FQAA 3C31A 1H76A 4WKMA 1YCJA 1IXHA 1LBZA 4ZEFA 4H45A 1YXIA 3MVXA 2PMSA 1CE2A 1NI9A 3E78A 3VVEA 1PDAA 1EZPA 4QHQA 2VHAA 4R6HA 3K1NA 3TKDA 4N17A 4UACA 5CI5A 2DDKA 1XS5A 3IO6A 4L17A 1OVTA 3B50A 4PFYA 2H25A 3T9VA 3MP8A 4NF5B 1FQBA 2FIXA 4PP0A 1S7YA 4QF9A 4PDDA 3RYDA 4BDLA 5I3SA 3HV1A 3TTNA 5A5XB 5KCJA 1SBPA 4H65A 3PV0E 1NV3A 2XXHA 3MQ9A 3DP6A 4DDDA 4R75A 2WEFA 3V8XB 2Z8EA 1A8EA 3ZSFA 1AIVA 1PBPA 1FPLA 4LQ5A 5L9MA 5I59A 4GWUA 3W15C 1S50A 2DVCA 1N7XA 3HFUA 5TP9B 2H5YA 3TQLA 1HSJA 3PD8A 4QSCA 2F97A 2ZZVA 3KN7A 1RYXA 2V25A 4F22A 1EYIA 3G3KA 1MRPA 4GD5A 5I56A 4GXSB 3MC2A 1FPJA 1JW4A 3B6QA 1AOVA 1ZBMA 1QKAA 2PX1A 2VPOA 1QJMA 4QSDA 3M3KA 4YB5A 2FA7A 1UIUA 1B0HA 3MP1A 4I9DA 4ZE9A 2Z22A 1Y3QA 3FVKA 3LUZA 2YLNA 3FVGA 5DEXA 4Q0CA 4O7MA 5JEIA 3MPLA 3FATA 1Y1MA 3CHGA 4LZ8A 1IMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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