3O9LA

Design and optimisation of new piperidines as renin inhibitors
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3o9lA00
5P03A 5JFUA 4DJOA 3VSXA 2Q63A 5P3HA 3VUCA 3GI5A 1D4YA 5P69A 4MC6A 4YD7A 3UDKA 1PSNA 4B1EA 5DQ4A 2O4KA 5P31A 2UXZA 2HB4A 4GJBA 5P0TA 4Y3YA 2UY0A 4J1HA 5OZZA 5P6BA 3OU4B 1FKNA 1RL8A 5DQ1A 4DJXA 2WF4A 2WEBA 1LZQA 1SMEA 2R8NA 4PHVA 4QJ8A 5IVTA 3EM3A 5SY3A 4L6BA 5P8IA 3OU1B 2P3DA 4OBFA 2ZJIA 5P56A 4Y3NA 3UDQA 1PSAA 5P1AA 3ZOVA 4ER4E 5P0MA 2AQUA 3OK9A 5P4KA 5DQCA 5P5QA 3ZL7A 3BUFA 2R38A 2JXRA 3IN4A 5P8SA 4LL3A 5P4CA 4DPIA 2O4LA 1ZTZA 1QDMA 1ZAPA 5P5EA 2AOFA 3ZKXA 2PWRA 5OYYA 3PMYA 4XXSA 2IS0A 5P7CA 4KE0A 1TQFA 4B77A 1IZDA 2QU2A 4Z22A 3H5BA 1QS8A 2P3BB 5DR7A 3QAAA 4Y4GA 4FAFA 3VYFA 5P3GA 3LHGA 5P5NA 1MT7A 4FS4A 1MPPA 2Q64A 5OYVA 2Q55A 4L7JA 1T7IA 5COPA 2I4QA 2AVSA 5P76A 5P5TA 5ISKA 3NDXA 3IXJA 1B6PA 4Q1WA 4GYEA 4RVIA 1WBMA 5KR1A 4YD5A 2QI3A 3F9QA 5P5FA 5I3YA 5JFPA 3LIQA 4Y3EA 4CKUA 5P6EA 3APRE 4NJTA 2OAHA 3SA4A 3PI0A 3QBFA 1B6JA 3KFRA 1MSMA 4K8SA 1FFIC 5P4VA 3I6OA 2AZ9A 4A6CA 4YOAA 4HDPA 5P73A 3LIVA 3RU1A 2BPXA 2FLEA 3URIA 1JLDA 2XFJA 5P47A 2FMBA 4DQCA 5P1HA 3U7SA 5J25A 1IZIA 5P82A 3HLOA 3CICA 4RVJA 1K6TA 5P2BA 4RYGA 5P7RA 5P6JA 2IKOA 2OHLA 3JVWA 5P7YA 5P1FA 3DOXA 3L38A 3PM4A 1DAZC 4Y36A 2IL2A 4R92A 3VYEA 5P0PA 3BUHA 2SAMA 4DJRA 5P36A 3EL4A 1HTGA 3UQPA 5P0OA 1MTBA 5P0VA 2AOHA 2R3WA 5P19A 2H6SA 5P3XA 1FLHA 5P3AA 1BAIA 1FQXA 3NXEA 3EC0A 4YD6A 4APRE 5JODA 1YTHA 2JE4A 3FV3A 4Y3AA 3PWWA 3Q70A 3WSJA 3GI0A 4DVFA 5P1ZA 1GVTA 5TOLA 2R5QA 1EBKC 4Y3QA 4Y4ZA 5P7ZA 1EPRE 5P4SA 4D89A 4KUPA 4YCYA 5HVPA 4Y39A 2PYMA 1D4SA 2WECA 3GW5A 1LYBA 4NJUA 5P65A 4I0HA 5OZFA 5KQXA 4M8XA 2VJ9A 3VV7A 3R0WA 5P1KA 3TPJA 5P6PA 4AA8A 5P2EA 3T3CA 5P7JA 3VFBA 5P6QA 5AHBA 5P1WA 2P3CA 2G22A 4IVTA 3K5CA 3BGBA 4PZXA 5P54A 5P2HA 2ZHRA 3R2FA 4L7GA 3OU4A 2ZDZA 3CKPA 3TPPA 3K4VC 4Q1NA 4EP2A 5OYRA 3EKTA 3D3TA 5P66A 5P6RA 3QIHA 4Y3MA 5P00A 3OU1A 2HAHA 5P2LA 4PEPA 3INDA 3SKFA 3NLSA 3UF3A 5P44A 5P7MA 2I1AA 2ZJHA 2ZHVA 1B6LA 5P0JA 3UFLA 1HSIA 5P55A 1VIKA 3KYRA 2AOIA 2BPWA 4PYVA 1META 4NJSA 5P0HA 5P8CA 5P5BA 3SA8A 5CONA 1TCWA 3S45A 3PVKA 3T7XA 4ER2E 5P71A 1OD1A 5OZ8A 1LYAB 1A30A 4FRJA 4Y35A 4ZLSA 5OYUA 2P3BA 1XS7D 4H1EA 3VF3A 2VIEA 3HW1A 4J0PA 4Y38A 5OYWA 4DJPA 4YA8A 5IS4A 1MVPA 4B1CA 3O9LB 1ZPKA 4FSLA 4YCTA 5P4PA 2ZHTA 5P09A 5P24A 5P7PA 2RMPA 1AXAA 5I3VA 4DJUA 5OZRA 3PHVA 3NU5A 4YD3A 3OOZA 1HVKA 4RRNA 1B6KA 5P50A 3QRVA 3ZPTA 2G27A 2IEOA 3B80A 4Y5NA 2QP8A 4K4QA 1HSGA 3JVYA 5P6WA 1HIHA 1AJXA 5P6DA 1FMXA 1BWBA 3O9CA 5ENMA 5EZXA 3SO9A 4X2LA 5P3ZA 2O4NA 4B72A 4DV9A 3KMYA 3FNTA 4Y3FA 4JPCA 5P0IA 2I4XA 2F81A 5P37A 5IE1A 1KJHA 4Y4EA 3NDUA 3TL9A 3K5GA 5P2GA 3R1GB 4GB2A 4D83A 2QAKA 2CEJA 5P1EA 3BC4A 5HTZA 1ENTE 5UPJA 5P5UA 3MWSA 2AOCA 3TKWA 3SAAA 4WY6A 2V12C 3OTSA 3QRSA 5P5YA 5P5OA 4Y3GA 1YM2A 3DM6A 2G1OA 4LP9A 3MXDA 4GIDA 3OU3A 5P30A 4YDFA 2OHUA 3K4VA 1HWRA 3LPJA 3UDYA 4A4QA 5P3LA 2QMGA 2IDWA 5PEPA 5P4FA 2R43A 3KDCA 2ER7E 3L5FA 5P8VA 2QK5A 5P6VA 1D4HA 2F3EA 5OYXA 4AA9A 1B11A 5P10A 4MC2A 5P7GA 2AOJA 2IGXA 3I25A 3UQXA 5P3KA 5P2VA 1CMSA 3OADB 1W51A 4LC7A 2I4UA 5KOSA 2WF1A 3LIXA 3O9IA 5P38A 3NDTA 4J1FA 3GGAA 5P6HA 3A2OA 4EXHA 3QI1A 1BV7A 5OZ3A 5P7NA 3S43B 2Z54A 5P1LA 5P5RA 4XX4A 3UQWA 1HRNA 3URLA 5P6SA 2QU3A 5P6ZA 4CPRA 2NR6A 5P4TA 2ANLA 4LXAA 3L5BA 5P41A 5P7AA 2QHYA 4ZPGA 3EKWA 3IAWA 5P7SA 5IVQA 4B0QA 5P6YA 8HVPA 5P33A 4DJWA 3EKXA 1KJ4A 5P34A 4I1CA 2QMPA 3PWMA 4GJDA 3INFA 3RTNA 3VV8A 4FM8A 1TSUA 5P0QA 2AZ8A 5ENKA 3VLAA 4FGXA 3NDWA 1FQ4A 1K6PA 2QI1A 1YG9A 5P0RA 2BQVA 4QJ6A 3UDRA 4YBFA 5P81A 2ZJKA 5OZEA 3CIDA 2P83A 4XX3A 5APRE 3VSWA 5AH8A 1K1UA 3IVHA 1YTGA 5AHCA 4Y3SA 5P0ZA 2VKMA 3BRAA 2BJUA 4J0YA 2HPEA 3ZMGA 2QZLA 1E81E 4CP7A 2FNSA 1HTFA 3PI5A 5P08A 2ER6E 5FIVA 4R93A 5P15A 1FMUA 2BPZA 2FIVA 5P43A 1ODXA 1C70A 5P22A 4Y57A 1AJVA 3WZ6A 4GJAA 5AHAA 4Y5PA 2HS2A 5KQYA 1G35A 4J54A 2WKZA 1HTRB 2AOGA 4Q5MA 1LYAA 2I0AA 4B05A 2ER9E 5OZDA 2B60A 3KFNA 2PQZA 4Q1YA 3NYGA 2QD6A 4RGHA 3PGIA 4Y3ZA 3TPLA 1OHRA 3O9LA 1EC0A 4ZIPA 2QHZA 4FRSA 3VEUA 1BDLA 1T7JA 2MIPA 2OHMA 5OZAA 2JYSA 4Y3XA 3C9XA 3S56A 3HBOA 3SACA 2V10C 1W50A 5P16A 1SGUA 4OD9B 2Q15A 4KB9A 4NPUA 1PPME 5P29A 1CPIA 2CENA 2NNPA 1HXBA 3Q6YA 5P4XA 1GVUA 1FQ6A 1LV1A 1HVHA 2OF0A 3ZKSA 3PCWA 5P4NA 5P2OA 2F8GA 4Y44A 5P14A 1FQ5A 1ME6A 5P8RA 4Y5CA 3ER3E 5OZTA 1EPNE 5P3JA 1ZSFA 4WTUA 2QZXA 5OZYA 5P18A 5P2TA 5KR0A 3ZKNA 3MSJA 4H3JA 2ZGAA 3OY4A 4Y3RA 5P2JA 7UPJA 5DQ5A 3HDKA 2O4PA 2PK5A 5P6TA 5ER2E 5AH9A 1U8GA 1LEEA 1K2CA 3NWXA 3EBZA 1LYWB 5P4YA 5P3DA 2Q54A 5P5VA 5P42A 5P7QA 2IKUA 2IRZA 2CEMA 5HCOA 5OZ5A 5P8PA 5P3NA 5P3YA 3I8WA 4QJAA 5P5ZA 5P87A 5P4IA 5I70A 3INHA 1HPVA 5P7UA 3UDMA 3D91A 5P0XA 3K5FA 3N4LA 4I10A 5P01A 5P3CA 2XFIA 4Y5LA 3LZUA 1DW6C 1HVSA 3UQUA 1KJGA 3URJA 5P2UA 3EL0A 5P3VA 2VIZA 1EAGA 4AZYA 4UPJA 3PRSA 5P0SA 1DMPA 5P3RA 5P8UA 3EM6A 4TVHA 5P05A 1SDUA 3KT5A 3NUOA 1BILA 4LAPA 1HPOA 1UPJA 3S53A 4I12A 3VLBA 3RSVA 3S43A 5P59A 1RNEA 3OAGB 1MEUA 3ZKMA 5P4EA 3L5CA 1BVGA 4Y4JA 5AH7A 3ZKGA 2ZJMA 5DR8A 1MESA 1C6XA 4HDFA 3O9EA 4U7QA 1M0BA 4DJVA 5P28A 3T6IA 2V16C 1HIVA 3BXSA 5P4UA 1E5OE 2NXLA 5P0NA 4Y4BA 3L5EA 2O4SA 5P2FA 4MC1A 1W5VA 3G72A 4YD4A 3TKGA 3D1ZA 4Y54A 1BDRA 5DR4A 1IZHA 4FLGA 5P1GA 1DIFA 2JJIA 3ST5A 4ACXA 3EKVA 2J9JB 3OUCA 5P8TA 1TZSA 1WBKA 1Q9PA 5P1CA 5P1VA 3NU9A 3KN0A 4NJVA 3TOFA 3BUGA 2QI0A 1FMBA 4I8WA 4GMIA 4PZWA 3OQKA 1F34A 5P1DA 2WEZA 2QI6A 1YTJA 4I0ZA 3ECGA 5KR2A 2G94A 1IVPA 3S7LA 5P5GA 4Y5BA 5P0LA 3S85A 2A1EA 3AIDA 4OC6B 1SBGA 3QPJA 5JG1A 5P2NA 2IGYA 4EQJA 3S7MA 2HB3A 2G24A 3NU3A 2NPHA 1VIJA 3PWRA 5T4SA 3Q3TA 3RTHA 2OHRA 2I4DA 3OHHA 2R9BA 5B18A 1T7KA 1EEDP 5P2WA 5HD0A 2WF2A 4J1IA 1RV7A 4Y51A 1G2KA 3PEPA 5P0GA 4CMSA 1T6EX 4CPXA 1ER8E 5P72A 4I0DA 1QRPE 5P7EA 4Y3DA 5P58A 4HDBA 5COOA 3CYWA 1D4IA 5P6OA 2HB2A 1RPIA 3FIVA 2QD8A 3I2LA 3VCMA 1GVXA 1KZKA 1MTRA 2V0ZC 1J71A 3IXKA 4TVGA 1XE6A 1A94A 4NKKA 2PC0A 4I0GA 2OHNA 3M9FA 5P40A 5OZ4A 1FB7A 4J0TA 3O99A 1K1TA 1YM4A 1EC2A 3KF0A 4Y56A 1YT9A 4OD9A 5HDVA 1HVIA 3IA9A 2VA5A 4DFGA 3QBHA 4GJ5A 4OBJA 1EC3A 3SQFA 5P8QA 3LPIA 2PSVA 3NXNA 5P5PA 4F74A 3VFAA 4RCEA 3UQRA 2NTRA 1MT9A 4K9HA 4XKXA 4Y3TA 4L1AB 3IN3A 1HIIA 1M4HA 5P52A 4IVSA 3EL9A 3MSLA 4L7HA 3DCRA 3OXXA 4I0FA 2OHPA 5P6LA 4FRIA 3KDDA 4LBTA 5P74A 4RROA 1FIVA 4Y4XA 4CPSA 2J9KA 3G70A 4LHHA 4EYRA 4RCDA 4EJ8A 1AZ5A 2V11C 5P4RA 5P8DA 3VG1A 1W6HA 5P8LA 5P53A 3GGXA 3R0YA 4J1EA 4QJ9A 3OXCA 1UH9A 5P63A 4S1GA 4Y4AA 5P0DA 2NMYA 2PYNA 3ZKQA 2QNQA 3SKGA 3RVIA 3EKQA 2VIYA 1KJFA 3EKPA 3BVAA 3OWNA 1EPPE 1NPAA 5KQFA 5P5WA 5P1NA 3PB5A 4Y5EA 5P02A 3KFPA 1FQ7A 3TOHA 1APVE 5P3QA 4X7IA 3UDJA 5F00A 3T7QA 3OAGA 3Q4BA 2BPVA 4ZE6A 3QVCA 3PSGA 4YBIA 4APEA 2HIZA 1RQ9A 5KAOA 2R3TA 3FNUA 4DQEA 3SFCA 2Q3KA 3T7PA 5P07A 3EL1A 5P3UA 2QCIA 3K5DA 3FKTA 2F80A 3HZCA 5P7TA 5P5HA 1YTIA 2Z4OA 2PK6A 5HU0A 2AODA 5P70A 1MUIA 5DR3A 3G6ZA 4FCOA 5I3WA 2V00A 1FQ8A 5KR8A 5P80A 4B1DA 2APRA 3OTYA 2RSPA 3K1WA 4OBHA 2J9JA 2WEDA 4H3FA 4GJCA 2VIJA 4ZEAA 3PBZA 5P06A 2NMZA 5C9FA 1BXQA 1BBSA 2XFKA 4TRZA 4YOBA 2QZWA 4YE3A 4Y3PA 5IVSA 2QNPA 5P2YA 4DQFA 5P0EA 5OZ1A 1N49A 1XE5A 5P60A 5P2IA 1OEXA 3L58A 4HVPA 1MIQA 4EWOA 4J1KA 1BDQA 2XYFA 3SLZA 2WF0A 3QRMA 4Y41A 1HVJA 3LIZA 4YHQA 4OC6A 1W5YA 3NSHA 5P79A 5P32A 3KMXA 3OOTA 2G1NA 4LXKA 2G21A 3PLDA 1HVLA 5P1OA 3FX5A 1FFFC 5P23A 4Y37A 5P62A 5P5SA 5P0UA 1SP5A 1ODWA 4QJ2A 5P7BA 4HEGA 5P48A 2G1RA 3ZPUA 2EWYA 4OBGA 5OZSA 5P4AA 5P3TA 3T11A 5HE4A 3NU4A 3SA9A 1IZEA 5P51A 1D4JA 5P17A 3ER5E 3CKTA 3UDPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P03 A;  5JFU A;  4DJO A;  3VSX A;  2Q63 A;  5P3H A;  3VUC A;  3GI5 A;  1D4Y A;  5P69 A;  4MC6 A;  4YD7 A;  3UDK A;  1PSN A;  4B1E A;  5DQ4 A;  2O4K A;  5P31 A;  2UXZ A;  2HB4 A;  4GJB A;  5P0T A;  4Y3Y A;  2UY0 A;  4J1H A;  5OZZ A;  5P6B A;  3OU4 B;  1FKN A;  1RL8 A;  5DQ1 A;  4DJX A;  2WF4 A;  2WEB A;  1LZQ A;  1SME A;  2R8N A;  4PHV A;  4QJ8 A;  5IVT A;  3EM3 A;  5SY3 A;  4L6B A;  5P8I A;  3OU1 B;  2P3D A;  4OBF A;  2ZJI A;  5P56 A;  4Y3N A;  3UDQ A;  1PSA A;  5P1A A;  3ZOV A;  4ER4 E;  5P0M A;  2AQU A;  3OK9 A;  5P4K A;  5DQC A;  5P5Q A;  3ZL7 A;  3BUF A;  2R38 A;  2JXR A;  3IN4 A;  5P8S A;  4LL3 A;  5P4C A;  4DPI A;  2O4L A;  1ZTZ A;  1QDM A;  1ZAP A;  5P5E A;  2AOF A;  3ZKX A;  2PWR A;  5OYY A;  3PMY A;  4XXS A;  2IS0 A;  5P7C A;  4KE0 A;  1TQF A;  4B77 A;  1IZD A;  2QU2 A;  4Z22 A;  3H5B A;  1QS8 A;  2P3B B;  5DR7 A;  3QAA A;  4Y4G A;  4FAF A;  3VYF A;  5P3G A;  3LHG A;  5P5N A;  1MT7 A;  4FS4 A;  1MPP A;  2Q64 A;  5OYV A;  2Q55 A;  4L7J A;  1T7I A;  5COP A;  2I4Q A;  2AVS A;  5P76 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5P2R A;  3DK1 A;  3UDH A;  4Z50 A;  5P2S A;  2QI4 A;  4CPQ A;  3PMU A;  1IDB A;  1AM5 A;  5P4B A;  4EXG A;  4H3I A;  3MSK A;  1LYW A;  1BVE A;  2NXM A;  1HEF E;  3L59 A;  4FAE A;  4QGI A;  3BHE A;  4JP9 A;  4ER1 E;  3DUY A;  5KQZ A;  5CLM A;  2ZHU A;  3PCZ A;  1K6V A;  5HE7 A;  4ZSR A;  5P20 A;  3SA6 A;  5P0W A;  3DV1 A;  1F7A A;  5SXN A;  1BIM A;  5P0C A;  3NR6 A;  5F01 A;  5P2X A;  5P46 A;  1NPW A;  3KM4 A;  1IVQ A;  4MC9 A;  1SIP A;  4Y4D A;  3KFS A;  1APW E;  3EMY A;  2UPJ A;  5P61 A;  5OZV A;  1IIQ A;  1HTE A;  1SIV A;  5P3F A;  4F73 A;  3HVG A;  3DCK A;  4WY1 A;  3ZPS A;  5OYT A;  3U6A A;  4LXM A;  5P64 A;  2AZC A;  1HBV A;  5DGU A;  5P6U A;  5OZL A;  3OHF A;  5OZH A;  2HS1 A;  3CKR A;  5P85 A;  5HCT A;  5P8B A;  3L5D A;  5P7I A;  1IDA A;  4NPT A;  5P8A A;  2I4V A;  5P2C A;  2BPY A;  4ZSM A;  4Y5K A;  3GGU A;  4DI2 A;  2IEN A;  4Y4U A;  3SA5 A;  3SM1 A;  2XYE A;  4BEK A;  2V13 A;  5OZK A;  2BKT A;  2HM1 A;  1QBS A;  3EKY A;  4Y45 A;  2VJ6 A;  5P1R A;  2G20 A;  5P3I A;  5P3E A;  1GNO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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