3O9LB

Design and optimisation of new piperidines as renin inhibitors
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
171
structure length
171
Chain Sequence
SLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALARH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 171
sequence length 171
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3o9lB00
5P2IA 3PLLA 1HWRA 4Y5EA 1QDMA 1W6HA 5P5GA 5OZEA 3CICA 1GNOA 2QD7A 5P1TA 4DI2A 1HTGA 4OD9A 2PC0A 3LINA 5HDUA 1HPVA 3SA3A 2I4WA 4RCEA 5P1ZA 5P89A 5P59A 1HPOA 4FCOA 4PHVA 3PB5A 2R43A 4R95A 1A8KA 2IGYA 1BDQA 4EP3A 5P58A 3EM3A 1F7AA 1MRWA 4HVPA 5P6NA 5SXNA 1YM2A 4Y57A 2NXDA 5P53A 2ZYEA 1HVRA 1NPVA 5P66A 5P6RA 3S43B 2OHSA 4ZE6A 1DIFA 3QS1A 4I8WA 5JFPA 5P3BA 4YOBA 2VNMA 3TLHA 4Y5AA 2FXDA 5P5DA 4HE9A 5OZJA 3PMYA 4GJ7A 3VV6A 3TPLA 3D20A 3OUCA 3EBZA 3TNEA 4FRIA 2QNQA 5OZCA 3KA2A 5P77A 4EHCA 2AQUA 4DPFA 3PM4A 1FKNA 1TSUA 3I25A 3UDNA 4GJ5A 5P1WA 4J0PA 3OUAA 5P4OA 3LZSA 5P1XA 2B7ZA 4IVSA 4KUPA 3TOFA 6UPJA 1TQFA 3KMYA 4OBHA 3FSMA 3MSLA 2PH8A 5P3YA 4I0HA 2Q15A 3IN4A 1HXBA 5P8JA 2V12C 1META 3HVPA 3SA6A 2BPXA 2Q5KA 4YHQA 4Y5NA 2Q55A 5P0UA 2V13A 5P8TA 1BWBA 2QZKA 2UXZA 2QD8A 2P83A 2WL0A 3ECGA 2BKSA 3OGQA 3FNTA 4D8CA 3BC4A 3EM4A 4H1EA 3WZ7A 2HM1A 3EXOA 5P5LA 1N49A 4FSEA 1HEGE 3I8WA 4Y4GA 3QROA 5P36A 5P2SA 2Q63A 3O9EA 5OYSA 1HSGA 5P0BA 1W5XA 5P72A 1W50A 5HDZA 4I0DA 1B11A 2WF2A 3ST5A 1HSIA 2OHLA 2FIVA 3OUBA 1LYWB 5DR7A 5OZ1A 4DPIA 4DQGA 3OAGB 5P5OA 1VIJA 5P6LA 4K9HA 1IZDA 4I0EA 3OQAA 1ZJ7A 3UF3A 1Z8CA 2BBBA 4EP2A 2QAKA 3SKGA 2JE4A 2R5QA 5J25A 4GYEA 3S8IA 2JXRA 3URIA 5P2MA 2PYMA 1E81E 4HEGA 4UPJA 4QGIA 4FRJA 3GGUA 3S2OA 2WHHA 3QP0A 3SM2A 5P7AA 5ENMA 5P4IA 2AIDA 3QBFA 4Q1WA 5P2AA 2P3AA 5P1NA 4ZLSA 3SABA 3RVIA 3UHLA 3OU4A 3G6ZA 5P4TA 1TCWA 1XE5A 1OD1A 3L5EA 4Y3ZA 2FGUA 5COOA 1RPIA 2B7FA 5P4SA 1NPAA 1K6CA 4Y3MA 5P4QA 2VIEA 5P4EA 5OZ4A 4F75A 5OZSA 3LITA 5P32A 2ASIA 4Y5KA 3KDBA 3URLA 5P1DA 4YD3A 1SIVA 4L7JA 5P5TA 2A1EA 2G1RA 2QMFA 4R93A 5OZVA 1BVGA 5P3RA 4B0QA 4Y35A 3UDRA 4FAFA 4NKKA 4FRKA 5HDXA 5P3IA 4Y39A 1TW7A 5P3UA 3TTPA 5P1EA 5AHAA 2F3FA 1K2CA 5OZZA 3D1XA 1IBQA 5KR1A 3GI5A 5CONA 3O9LA 3UDPA 2QNPA 1QBSA 3R2FA 1B6PA 1AZ5A 5EZXA 2VIJA 2FS4A 5P11A 2PSVA 5JFUA 3CKRA 5P79A 3WB5A 2VIZA 4LC7A 2IRZA 4A6CA 2OF0A 1BV7A 5P6JA 1EBWA 1QBUA 3RTHA 5DQCA 4X7IA 2O4LA 3KFPA 4YD5A 2ZHVA 5P75A 4GMIA 5P5ZA 5P7KA 5P0PA 5P8BA 4KE0A 2P3BA 5P08A 5B18A 3PJ6A 4H3FA 3WZ6A 3L3AA 5P82A 2V16C 5SY2A 1B5FB 5P1CA 3HAUA 4ER2E 3HAWA 5BS4A 2OHKA 1T7JA 4J55A 1APTE 4CPQA 4ZSRA 5P2TA 1FG6C 3UQWA 3EM6A 5P1KA 3NLSA 1SDVA 1GVUA 1HTEA 2HS1A 3BRAA 4Y4AA 1MSMA 5P6MA 3PMUA 5OZPA 3S45A 3S7MA 3IA9A 5P00A 1APUE 3ZLQA 2VA7A 3EKXA 1FMXA 4Y3FA 5HE4A 5C9FA 5P6OA 3O9GA 1WBKA 4J1HA 5KQFA 1WKRA 4Y3DA 5I3WA 4I11A 3NUJA 5F00A 4MC6A 5OZ6A 3CMSA 5P8EA 3LPJA 4GJ6A 2O40A 5DR4A 1QBTA 4R5NA 5P56A 4CKUA 2VA6A 4JP9A 4YCKA 4YDGA 5P4HA 3UTLA 3NDWA 4M8XA 4YA8A 3K1WA 3DUYA 9HVPA 5P39A 1HTRB 5P4DA 1UH9A 2ER0E 5P3QA 2XYEA 5ISKA 4LXMA 4R91A 4BEKA 2AOCA 4WY6A 3QBHA 2HC0A 5P7HA 3U71A 4GB2A 4LP9A 5P2FA 5P0AA 5P5UA 5OYRA 5P1IA 3VUCA 5P1OA 1HTFA 1C6ZA 2XYFA 2ZJLA 2I4DA 5P3FA 3C9XA 4HA5A 1OEWA 2QNNA 4FGXA 5OZ9A 5I3VA 3APPA 2O4PA 4TVGA 5OZXA 2PK6A 5P3OA 3TPPA 4WY1A 3Q4BA 3TPJA 3SA4A 3AUPA 5P3ZA 2PQZA 5OZMA 5HE5A 2AODA 2ZJKA 5P17A 1B6MA 1LYBA 3BXRA 2AVQA 3QIHA 5OZIA 3VF5A 3EKVA 1SP5A 4LAPA 4A6BA 1LZQA 2V11C 1EC3A 5P7WA 3GI0A 2O4NA 3PHVA 3EL5A 5P48A 4ZPGA 1TSQA 5P7CA 3K5FA 1HVIA 3H0BA 1HHPA 3OHHA 1BIMA 2ZGAA 5P8QA 4EXGA 1ME6A 1BXQA 4AA9A 2JJIA 3OK9A 5P1AA 2XFJA 4S1GA 4Y3QA 5DR3A 5P03A 1FIVA 4DJOA 4QJ9A 4HZTA 4J1KA 4I1CA 5IVRA 5FIVA 2G1YA 1LF2A 4HDBA 3SQFA 1E5OE 1SGZA 5KR8A 3R0WA 2WF4A 5P7QA 4D85A 1PSAA 5I3XA 1FF0C 3CKTA 2NNPA 1SGUA 4FSLA 3QVCA 4Y5MA 7HVPA 4Y3XA 4Y3PA 1CZIE 3G72A 5P62A 1MEUA 2SAMA 5AHCA 3OXXA 1K1UA 4DUSA 2G22A 5TOLA 3LNKA 5P0HA 1IVQA 4Y3SA 5P5VA 1PFZA 2IKOA 3INEA 2AZCA 3UFLA 3VSXA 4FL8A 5P6SA 5OYQA 2RKGA 3PBDA 3NU3A 4PEPA 3T11A 2R3TA 5P4FA 1FB7A 3VFAA 5P6QA 1EPOE 5P04A 1SDTA 5P0JA 5P7PA 1PSOE 3N4LA 3BXSA 4RLDA 2A4FA 3UQRA 1FQXA 1D4IA 5P2XA 5P6EA 1DAZC 2FLEA 5OZTA 1YTHA 2UPJA 2QCIA 3O9BA 1MPPA 1HEFE 4OBGA 1GVTA 5P0VA 4OBZA 4YOAA 5P5MA 1MT8A 5P8OA 2QMGA 3DM6A 3ZMGA 3OU4B 3UDKA 1XS7D 5P42A 5P8IA 2IKUA 1ZSFA 2J9JA 2R38A 3KFNA 3Q3TA 5P26A 1F34A 5P68A 5P30A 3U7SA 5OYUA 5AH8A 2QU3A 5P3MA 5P7YA 2V10C 1YTIA 5P7LA 3HD8A 2G24A 4CPXA 4DQEA 4GJAA 3NXNA 5T4SA 3D1YA 5P8VA 3GGXA 5P51A 4H3GA 3UPJA 5P6ZA 2IL2A 2QI6A 2IEOA 5P43A 5P5BA 2BPZA 2PMAA 2Q64A 5IVSA 2OAHA 4LL3A 1C6YA 5P5XA 5P5YA 5P47A 4YBIA 1T3RA 2P8HA 4I0GA 4B00A 3O9LB 1CMSA 5P22A 1SMEA 5F01A 1MT9A 3I7EA 1JLDA 5P3KA 3LIXA 5IS4A 4BELA 2BKTA 1AIDA 1EC1A 2I4VA 4DH6A 5P0XA 2Z54A 5P8RA 1HVHA 4QJAA 2G69A 2NTRA 5P0DA 3LIYA 1GVXA 2WEDA 3SA7A 5ENKA 5OZDA 1HPSA 5P23A 1HOSA 2P3BB 4J1FA 4U8WA 1DP5A 3DCKA 5COKA 3IGBA 3S7LA 5P0GA 5P06A 3EKTA 5DGUA 5DGWA 5JG1A 3OQFA 5P7TA 2ZHUA 4EQ0A 4QJ7A 4Y5BA 5P76A 1AM5A 5P20A 5KR2A 4DJVA 4DFGA 4DQHA 3OQKA 5P1FA 3OXWA 3VEUA 3L5CA 5OZNA 1ENTE 5P1VA 5P4UA 2OHMA 2QI7A 4M8YA 5OZ2A 5P38A 2FDEA 5P8LA 5C9DA 3R4BA 4XX4A 3L58A 1HIHA 4B70A 4Y56A 1PPME 3OU1A 3EL0A 1D4YA 4PYVA 5P61A 1EEDP 3BUGA 4FM6A 3PWRA 1W5WA 1AVFA 1XDHA 4CPTA 2R3WA 5P0NA 4AMTA 5DPZA 4EXHA 4L7GA 5P0QA 4I8ZA 5ER2E 4LBTA 4ER1E 3PVKA 1LF3A 1EC2A 4Y4BA 1W5VA 2RSPA 5P8GA 2IDWA 4B05A 4Y4WA 4Y5PA 1G0VA 5P5IA 1XL2A 3FIVA 1M0BA 4IVTA 4RRSA 3QRSA 4OC6A 2BPVA 5OZ7A 2MIPA 3L5FA 4EPJA 2HPEA 4MC1A 1FQ4A 2WECA 5P1QA 5P7JA 1K6TA 3BUFA 2AOEA 5P2KA 5P02A 5SZ9A 5P4CA 3TL9A 2JYSA 2WEAA 3D1ZA 3IXJA 5AH6A 5P54A 2AZ9A 2VJ9A 5P5SA 3NU6A 4EYRA 5P1HA 5KQZA 1BVEA 2B60A 2Q54A 2ZHTA 4NJSA 1B6LA 3PI5A 5HU0A 4YCYA 3KF0A 3EKWA 3KM4A 2PH6A 5P3SA 3L5BA 3CYXA 5P6TA 3PWWA 2FXEA 3UDJA 4RCDA 5OZBA 2NMYA 5P3WA 5P37A 3SLZA 4B78A 2G1OA 5P3GA 3EL9A 1WBMA 3OADA 5P67A 1BDLA 2PYNA 2AOHA 3GGAA 5P55A 3OU3A 5P7ZA 2VS2A 4D83A 4DJXA 1DPJA 1HVSA 1EBKC 5P3TA 2FNSA 5P8HA 3R0YA 5OZHA 3G70A 5P6AA 3EL4A 3CIDA 5P80A 5P6WA 5P5JA 5P3AA 5P8KA 3U6AA 1UH7A 3ZL7A 2J9KA 3VLAA 3LZYA 3WZ8A 5CLMA 3LIQA 5KR0A 3JVWA 5P5QA 5C9BA 4J54A 5P6YA 4Z4XA 2VIYA 1HXWA 1AAQA 3F9QA 5P3JA 5P8DA 4J5JA 5P0OA 3INHA 1FFIC 4Z50A 5P40A 3UQUA 5I70A 5E5KA 2I0AA 5P1MA 1ZP8A 5DR8A 2ZJJA 4YD4A 5P05A 5P7XA 1OEXA 3APRE 2NMZA 5OZ3A 4YE3A 2FGVA 5P1UA 3I2LA 4Y48A 5P5PA 1EPRE 2BQVA 5P0IA 3OTSA 1MESA 4ACXA 3O9CA 1K6VA 5P2UA 3IN3A 4EJ8A 5P7OA 5EZZA 3NWQA 3RTNA 4Y53A 1KJGA 2AOIA 4F76A 2P3DA 5P2YA 2G27A 1U8GA 3SAAA 5P4WA 1MSNA 2BPYA 3TKWA 1FQ5A 3S43A 5P49A 3N3IA 5DR1A 1SIPA 3S56A 3SA9A 3UDHA 3HW1A 3NYGA 3O9FA 4NPTA 1GNNA 5HTZA 4RRNA 2QHCA 5IVTA 3LPIA 5P19A 4D88A 3SKFA 3EKYA 4J1CA 3MSJA 2WF0A 1LEEA 4MC2A 2ER9E 4JPCA 4DJUA 5P0WA 5P46A 1FEJC 2HIZA 3RTMA 3VF7A 2Z4OA 5P6BA 3WSJA 3KT2A 3WB4A 2J9JB 5P15A 3OOZA 3NWXA 1HSHA 5P7GA 5P87A 2QHYA 5IE1A 5P5EA 3R1GB 4EWOA 2FMBA 2F81A 5P2WA 5P12A 1MIQA 5P3EA 4Y38A 3KFSA 2I4UA 4KB9A 3PGIA 1NH0A 4YCTA 2PWRA 5P1JA 2ZJMA 3PSYA 5P6XA 4K4QA 1NPWA 5KOQA 5P60A 4Y4TA 5P7BA 3EKQA 5P6DA 3D3TA 5OZAA 4YBFA 3KMXA 4OD9B 5HCOA 1FQ6A 5P3NA 4H3JA 3UDMA 4RVXA 3RU1A 1SBGA 5HVPA 2RENA 3OXCA 3O99A 2ER6E 5P1RA 2F3EA 3CYWA 2QK5A 3PCZA 2XFKA 2FDDA 1D4JA 4EJDA 5KQXA 1ER8E 5P6KA 3VLBA 2VJ6A 4NPUA 5P5WA 5P0MA 4E43A 5P0EA 3VF3A 4APRE 1LYWA 5P74A 4Y6MA 1BWAA 4APEA 2IS0A 1LV1A 2G20A 3NDXA 5SY3A 3SFCA 1ZSRA 4LXAA 5P5CA 4I0ZA 5P34A 1HVKA 2RKFA 4R8YA 4Y3GA 5P6HA 4AUCA 1EBYA 2G1SA 2H6TA 1C6XA 3TOGA 5P4NA 4TRZA 2RMPA 1T6EX 1XE6A 3Q5HA 4DQCA 4L1AA 4DJPA 4OBDA 1FQ7A 1LYAA 1EC0A 1B6KA 2IENA 3ZKIA 5OZYA 5P33A 2UY0A 2QMDA 3OQDA 5P2VA 1EAGA 3ZOVA 5P8CA 4Y3NA 8HVPA 3PLDA 5P64A 5ISJA 1C70A 3FV3A 4EJKA 5AHBA 3BGCA 4OBFA 3ZPUA 5P1PA 4HDFA 5P4GA 3MWSA 3UDQA 3Q70A 1MUIA 1ZLFA 4Y3HA 1FMUA 5E5JA 5P3XA 4OC6B 1GNMA 6FIVA 2QHZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P2I A;  3PLL A;  1HWR A;  4Y5E A;  1QDM A;  1W6H A;  5P5G A;  5OZE A;  3CIC A;  1GNO A;  2QD7 A;  5P1T A;  4DI2 A;  1HTG A;  4OD9 A;  2PC0 A;  3LIN A;  5HDU A;  1HPV A;  3SA3 A;  2I4W A;  4RCE A;  5P1Z A;  5P89 A;  5P59 A;  1HPO A;  4FCO A;  4PHV A;  3PB5 A;  2R43 A;  4R95 A;  1A8K A;  2IGY A;  1BDQ A;  4EP3 A;  5P58 A;  3EM3 A;  1F7A A;  1MRW A;  4HVP A;  5P6N A;  5SXN A;  1YM2 A;  4Y57 A;  2NXD A;  5P53 A;  2ZYE A;  1HVR A;  1NPV A;  5P66 A;  5P6R A;  3S43 B;  2OHS A;  4ZE6 A;  1DIF A;  3QS1 A;  4I8W A;  5JFP A;  5P3B A;  4YOB A;  2VNM A;  3TLH A;  4Y5A A;  2FXD A;  5P5D A;  4HE9 A;  5OZJ A;  3PMY A;  4GJ7 A;  3VV6 A;  3TPL A;  3D20 A;  3OUC A;  3EBZ A;  3TNE A;  4FRI A;  2QNQ A;  5OZC A;  3KA2 A;  5P77 A;  4EHC A;  2AQU A;  4DPF A;  3PM4 A;  1FKN A;  1TSU A;  3I25 A;  3UDN A;  4GJ5 A;  5P1W A;  4J0P A;  3OUA A;  5P4O A;  3LZS A;  5P1X A;  2B7Z A;  4IVS A;  4KUP A;  3TOF A;  6UPJ A;  1TQF A;  3KMY A;  4OBH A;  3FSM A;  3MSL A;  2PH8 A;  5P3Y A;  4I0H A;  2Q15 A;  3IN4 A;  1HXB A;  5P8J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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