3OA3 | Genus

Total Genus 99

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	99
sequence length	253
structure length	253
Chain Sequence	MSSLNNEEWDLLISGKKATLQYPIPLLCYPAPEVVSIAQIIDHTQLSLSATGSQIDVLCAEAKEYGFATVCVRPDYVSRAVQYLQGTQVGVTCVIGFHEGTYSTDQKVSEAKRAMQNGASELDMVMNYPWLSEKRYTDVFQDIRAVRLAAKDAILKVILETSQLTADEIIAGCVLSSLAGADYVKTSTGFNGPGASIENVSLMSAVCDSLQSETRVKASGGIRTIEDCVKMVRAGAERLGASAGVKIVNETRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of an unknown aldolase from Coccidioides immitis rcsb
molecule keywords	aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Coccidioides immitis
total genus	99
structure length	253
sequence length	253
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-08-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01791	DeoC	DeoC/LacD family aldolase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3oa3A00

2Z6JA 4Z0SA 3B8DA 2TPSA 4FNTA 2ALDA 4RK8A 3L5MA 4FIQA 4R33A 1KM3A 4NXKA 3DI1A 3GLCA 1SZNA 4QISA 2GVLA 4K7YA 4EIVA 4BK9A 1GQNA 3O6YX 3C4UA 5EKYA 3S0CA 1OF6A 1WOAA 1W3TA 4X22A 1RZMA 4J9JA 3BK0A 4QNEA 1ML1A 2BX7A 2QDHA 1VLWA 3HGOA 1UB3A 2ZRWA 4O19A 1C8VA 1TJRA 2QEZA 4Y6GA 1W3IA 4QQ3A 2GQ8A 2EAWA 4JXCA 3IIXA 1I2PA 1I2QA 1M6JA 1UUMA 3CIWA 1G7VA 1QPRA 1XDLA 3HJZA 1YXYA 1ZAHA 2DORA 3NOEA 3KAOA 1QO2A 4O18A 5FEPA 4LNYA 3OA3A 5I3JA 4LRTA 4AHQA 2C18A 4JY9A 4MYAA 4OU1A 1VS1A 1PVNA 3OVQA 5EYWA 5L6UA 3I68A 3EXSA 3DHFA 3LHTA 4YCPA 2FQIA 2JK2A 4Y90A 2ZRYA 1SW7A 5FEZA 5LNRA 1LP6A 2J9ZA 1FCBA 2A5HA 5FEXA 3TXZA 3S5OA 1TRDA 5C54A 5KTLA 3NNTA 2DZTA 1SO4A 1F73A 1VGAA 2XN2A 1W54A 3L68A 4K8HA 3G24A 3A5FA 1P1XA 1W5OA 3EWUA 3OEXA 4DF1A 3LHWA 3BW2A 1X8FA 4FNPA 4BF9A 5D2WA 1ZY9A 1X1ZA 2NWRA 2PCQA 2CLLA 2GOUA 1OX4B 2Q3RA 1WBJA 2ISVA 4FB7A 4OGZA 3DU0A 2VKZG 2B7PA 4LT9A 4GJ1A 3CB8A 4LV4A 1QAPA 2A0NA 3FOKA 2GVJA 1RD5A 2V8ZA 1FWRA 1ME9A 5TBOA 3GIYA 1KV8A 1WX0A 1TSIA 4MLRA 2ZA2A 1TPC1 2NUYA 4IMEA 3STEA 4GNJA 4IXHA 4HSNA 3UWWA 1BWKA 5I3IA 1TJPA 5TIMA 1ALDA 4GUJA 1JUBA 4UTIA 3RMJA 1OX6A 1AL7A 2NX9A 4O28A 1JCYA 1IXOA 3E49A 5AOUA 1QPQA 4UMCA 4I7UA 3GKFA 3NQVA 3LI0A 3LHUA 3TV8A 3UWVA 3A21A 4Y9AA 4IX0A 3UXAA 1Q6RA 2EKCA 4D2JA 3G1DA 1JCNA 3PAJA 4AF0B 4UTWC 2ZTJA 2Q8LA 3WJYA 2D73A 4UFKA 3W3OA 2DJXA 4GUFA 1EWDA 3G1FA 3SZ8A 1GYNA 2CFFA 2A7PA 2OCZA 5C2XA 4ZL1A 5F2IA 2YFOA 4ALDA 3PVFA 3HB9A 3EX1A 1A53A 4Q4KA 1TV8A 3LTPA 1MZHA 2Y63A 5FF7A 3NDOA 4Q32A 1JUEA 2E1DA 2I1OA 4JY8A 2P1FA 3NXFA 2RDUA 4AEOA 2FB3A 3LHYA 4K8EA 2X30A 3QC3A 3ZS4A 3LERA 1DQWA 4UMAA 1W37A 1N55A 4JGDA 1NSJA 1TPB1 1SFJA 1TV5A 4UR7A 2H8ZA 3TXVA 4CQAA 4DELA 2ATMA 3PB0A 3KX6A 5CPMA 2Y7EA 1KLYA 2WNZA 2RKXA 1YPIA 5F4XA 4OHQA 5AB3A 2YFNA 3W74A 2PRHA 3NQEA 1DKWA 1TQXA 5CZ0A 1TIMA 2VFHA 1AMKA 3KFTA 4Z1AA 2X1UA 3TQ0A 1D3GA 3PUOA 3FEMA 5FI8A 2FPTA 1U5JA 5HR7A 4N9DA 3B0UX 3W87A 3I7SA 5GVJA 3FKKA 5HUPA 1RQEA 3P5ZA 2QDGA 1D9EA 4ORMA 1H5YA 2XN1A 4O52A 5G1TA 2WOQA 3TNOA 1XXXA 3KVLA 4HT3A 4QNWA 1XC4A 4YWIA 4M7SA 2IQTA 3IEBA 2CW6A 5H2ZA 1Q45A 2Y85A 2C13A 1Q6LA 1XCFA 3CU2A 5HJLA 1AK5A 1OVDA 3G8RA 4O1DA 3QF0A 2J9XA 4L4LA 1QDSA 3G3DA 1H60A 1BKSA 2ZA3A 3GK0A 3QH2A 2QJGA 4CLMA 3IVUA 1BTMA 4NJJA 2B4GA 5LNUA 3WJXA 4OQVA 1AW1A 3L66A 3DFPA 3PB2A 3LCHA 2P10A 1SQ7A 4TR9A 3KVMA 2TRSA 2ZRXA 3FA5A 2WV8A 4U4MA 4NXSA 3O63A 3QQ1A 1H7RA 1WXJA 3IIOA 2G5WA 1PE1A 4KWVA 5CPLA 1FWWA 1TTQA 4Z08A 4IJBA 3UPWA 1YTKA 2JKAA 4UTMA 1DJNA 2DZSA 4NNCA 5LZLA 5J5RA 1NAL1 3HG4A 4GC4A 2QJIA 4TU1A 1GPWA 3BARA 3SW6A 3PUDA 3NQ8A 1P0KA 4HIBA 3W1TA 3TFCA 5K9DA 2CLKA 1M7OA 4NNAA 4O0KA 4GE8A 1OK4A 3GVGA 4WQ6A 5F2GA 3U8GA 3QPYA 5I3FA 4O1BA 2QCDB 3E0IA 2VFGA 3W7KA 4E2DA 3NQ2A 5K4ZA 1W5QA 4O54A 1TQJA 1OF8A 3PG8A 4O8RA 3F1QA 1LYXA 1R2RA 4XUGA 3E12A 1B9BA 1VCFA 1I2OA 3L5AA 3LXCA 4IX2A 4CQ8A 1GEQA 4MFDA 4AAJA 2QCCA 3NYZA 1GTEA 3LCGA 1VYRA 5AC7A 3WJSA 1KFJA 4HNVA 4BWLC 1O60A 1UBSA 3IRDA 4RZ6A 1G67A 1IF2A 2ZTKA 4N6EA 2DZVA 4M5PA 3W7NA 2PURA 3S5YA 1SSDA 3WJWA 1V5XA 3N19B 3BG5A 3M6YA 4N4PA 5BOOA 4UTLA 3W76A 2Z1BA 5TQLA 1R46A 1LLZA 3TSMA 3R13A 4UFLA 3W2MA 1ZNNA 3W7OA 3TIMA 3BVJA 3LV5A 2PRLA 4O50A 4LVBA 1A5AA 5G2IA 1KV5A 2CZEA 2QCHA 3HOJA 2F84A 5EMUA 4WOZA 3N14A 4RXGA 1KM5A 1LRTA 1W8SA 4MY8A 4DF0A 5HINA 5D30A 1EUNA 4GBUA 4NQ1A 3W84A 3H55A 2ZDRA 5DELA 4EOUA 1S5WA 4UFIA 4NUWA 3PULA 1GZGA 3QRHA 1FBAA 3DHDA 3GR7A 3EX2A 1AW2A 4NZJA 5AYXA 4N6FA 3MI3A 1O94A 5D2TA 3HG5A 1FX6A 4O57A 1X1OA 3B05A 4L4MA 1SPQA 1DOSA 4PEKA 4NVTA 4K37A 4MZYA 1H1ZA 3PBVA 1H7XA 3S8HA 6ALDA 1SZGA 4JTKA 3NQMA 4ORIA 3VFLA 3W7MA 3GNNA 4XBSA 1C9DA 1GVRA 3AO0A 4PFMA 4P2VA 3L0KA 3F4WA 4JX6A 5HULA 3W72A 3OVPA 3T40A 2NXIA 3W2JA 4UTWA 1ICQA 4R7JA 2HS6A 4O1CA 4N9EA 2CWNA 3VE9A 1W1ZA 3JRKA 3TSDA 5D09A 1LORA 4XTDA 2RDTA 1LOLA 3I6RA 5D03A 2OZ0A 1ZCOA 2ZZ4A 4PC8A 1F76A 2ZYFA 4OWGA 3EEGA 3SECA 1SR9A 3DFSA 1T99A 3O8AA 5D32A 4TMCA 3EKLA 4IMFA 3RLVA 1W31A 2GVGA 1NF0A 3KOFA 3MBDA 3NG3A 4LOCA 4U28A 5AN7A 3NVTA 4ZQMA 3VCRA 3B04A 3N9RA 1FDYA 3LXBA 4N9BA 4BI5A 1OYCA 4A2SA 3R8RA 4AVFA 5HMSA 2CLIA 2Y70A 2WSYA 3RK8A 1ME8A 1EUAA 4JD4A 4W9TA 1THFD 2X16A 2V2HA 4H6KA 4O17A 4UTKA 3TH6A 3W2UA 3CM4A 1VYSX 3EXRA 4K7VA 4E2BA 4ZZ9A 3UZJA 3ABQA 3B4UA 1JULA 3M44A 3C52A 5CGQA 2Y7FA 1QR7A 4N4QA 1VR6A 1L2UA 8TIMA 2Y7GA 2Y7DA 4I7VA 5D04C 3G1VA 2BWGA 3TCEA 2E77A 5DN1A 3HO8A 2V5BA 2QUVA 4DEFA 3GAYA 5EL1A 1QO5A 3NL5A 3OHIA 5U4NA 2BZNA 5L9FA 3W1MA 4TIMA 1KBIA 1ADOA 3MMTA 3QSRA 2GQ9A 3TAKA 1Q6QA 3OVRA 2ZZ6A 3W7QA 2R8WA 1L6YA 4ZVJA 3IIPA 3UPBA 3UY8A 3KRZA 3CWNA 1LZOA 2R14A 4FIRA 3TSBA 5KZDA 3SJ3A 5AHLA 5FF4A 4WXZA 4LVAA 1YDVA 1GVSA 3LTSA 4JN6A 5F1VA 3E02A 3CT7A 3STCA 3LCFA 3WK2A 4OV4A 2CLEA 3CHVA 3FKRA 1IGSA 1LRQA 3CLMA 5I3KA 2R94A 1ZALA 3C8FA 4PL2A 3A9IA 1LTDA 3SR7A 4Z1DA 3EWWA 4M7TA 3PBWA 3RFAA 1OFPA 5IM51 1YTDA 4X9SA 4FNQA 4ZQCA 2V0TA 3LCWA 1VZWA 3TW6A 1O4UA 3RU6A 2ATSA 4JYFA 1CX9A 1EB3A 5D37A 2YR1A 3W1XA 4HNTA 3DGRA 3IIVA 3W7LA 2EF9A 3NO5A 1GG1A 1Z42A 2OT0A 5AHFA 3ZWTA 4A21A 4WOQA 3HGJA 3A23A 2HTMA 1GOXA 1SO6A 1VYPX 1H51A 4C1LA 2WKJA 3UWZA 1QPOA 3G1HA 1H62A 3WK1A 5LNSA 3B03A 4JTUA 2YPIA 2H3BA 2ZFAA 1O5KA 3AJXA 3P60A 2H8XA 2FLIA 1BEUA 1R2SA 3EX3A 1K7FA 4IGHA 4JTEA 4MIMA 3O15A 1DJQA 1HTIA 3O1NA 3N34A 2NUWA 4MY1A 3O6CA 5DLCA 1ZHAA 3LRKA 2A85A 3WK3A 1XDMA 4YMZA 3HGRA 5HNRA 2G95A 3M0ZA 4JTLA 4NT0A 3LGEA 5G1YA 1TPUA 4JTTA 2ZQ0A 3EWYA 3P74A 3QJAA 1TYGA 1W5MA 1G69A 1MEWA 4C1KA 1B4EA 1L6WA 3W1RA 4ZQNA 4MLJA 3MYPA 2CLHA 3NR0A 4LRSA 2J9YA 5BMXA 1GTHA 4MUZA 2WNQA 4P61A 1H1YA 4BWLA 3S5ZA 1FWTA 2GJNA 3W1AA 3OBKA 3TE9A 5F4WA 2QCEA 3EX4A 1QWGA 4JIQA 3KVKA 3M9YA 4GWEA 1FCUA 2C15A 2NX3A 3C2RA 3W1NA 3L21A 2O7SA 2VFIA 3W7CA 4O53A 2CLMA 4AWTA 4UNLA 2WQPA 3TUUA 1M5WA 3M5VA 3F03K 1K7XA 4MKNA 3LB0A 5KZMA 2C3ZA 3MW7A 3THAA 2QCNA 2E5DA 3NPXA 2CU0A 3BO9A 1WDWA 4DXVA 1YDOA 1RQBA 5LGZA 3C3NA 4MY9A 5U7SA 2WO5A 4O10A 3W1UA 3QZEA 2WJZA 3DBPA 2ZZ1A 1RR2A 1VHCA 2B7NA 3ANYA 3W07A 3FYPA 4FNRA 2ISWA 4KFNA 4EF9A 2AAMA 5LNVA 4EVZA 1PHWA 1G4EA 2W0UA 1ZFJA 3W7PA 2G96A 4AHPA 2ZZ7A 5KSWA 1KM1A 4O15A 1DHPA 1MO0A 5LGXA 3BW3A 1G4TA 4ZQPA 4AH7A 2JGYA 2NV2A 2QKFA 2OX1A 3H53A 1I2NA 2WSQA 3DXIA 3W7JA 3UNDA 5G2WA 1SFLA 4JTGA 3MP5A 3QPZA 3QQ0A 3M5YA 5DCEA 3S1WA 3PR2A 4HPXA 3HGSA 4POCA 1O95A 3GNDA 1A50A 1FDJA 1KM4A 1N8FA 4RJEA 4UCGA 3NEVA 4FHAA 3MHFA 3QYQA 2VFDA 1IXQA 3N2XA 1FXPA 1SW0A 2QCGA 3ZR4A 1OX4A 2A21A 4UFJA 1KA9F 3LXAA 4AMAA 3NM1A 1UASA 2NV1A 1KTCA 3MUXA 4HN4A 3N9SA 3P62A 4QJ1A 3BPWA 1FDZA 1VPXA 5FF2A 5EPDA 3N2MA 4O4WA 4UTUA 1OHLA 3GAKA 1JQXA 3MP3A 4XKYB 3TR2A 1HFBA 4N2YA 1KFBA 3GDTA 1J4EA 1JUKA 2O7QA 5LKYA 4LV9A 3LHZA 2JGQA 3BV4A 1SO3A 4A22A 2PRMA 2FTPA 4XWUA 2HMCA 3G3MA 3S1UA 2Z6IA 3I65A 3S6DA 3GDRA 3M1ZA 1P5BA 1DBTA 4NJIA 2ZRUA 1TV7A 1I45A 3P84A 4K6AA 4IMDA 4JDBA 1RVGA 1H63A 3C2VA 4FNSA 1IXPA 3S1XA 1T8XA 1KFKA 4AF0A 1JQVA 4QITA 3CTLA 3DH7A 1QCWA 2RFGA 1YDNA 2DZWA 3MI6A 3G0XA 4RKAA 3U2OA 4ADTA 1J5TA 1WOBA 4DPPA 3A22A 4DBEA 1EP2A 4H4IA 5E1QA 5BRBA 1LM1A 1YYAA 1F2JA 2Y61A 4UC5A 3W7IA 1I2RA 1TRIA 1QPNA 2V2CA 3C0JA 4LY8A 2NXHA 2Y89A 2YYTA 3TC6A 3Q2DA 2YXGA 1X7FA 1A5SA 2VENA 3ABRA 3UQNA 1XKYA 1KM2A 4N02A 3GKAA 1HO1A 4LS1A 4WJEA 1D3HA 3HPSA 4GUIA 2YZRA 1H7OA 3GB6A 1QOPA 3A5VA 1WQ5A 3FJ6A 3BW4A 3W85A 2NXGA 2OT1A 3M5XA 4IWWA 1EPXA 1FCQA 1PS9A 3GDMA 2Y62A 4Y8FA 1SSGA 2W79A 4NX5A 5CG7A 4UTTC 4WY0B 4GXMA 2Q3OA 4RLIA 3IGXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3OA3A

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