3OADA

Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3oadA00
5P6KA 5P6IA 6APRE 2FNSA 3SO9A 3MSJA 5P0JA 3GI0A 2ZHUA 1HTRB 2Q63A 1HXWA 5P2VA 1MTBA 3VG1A 5P5AA 3URIA 4HDBA 4I0EA 1SGUA 4JOOA 2NXDA 3QBHA 4Y4JA 5P7ZA 3SKGA 3URJA 3PB5A 4I1CA 5I70A 4Y3FA 2IGYA 5OYRA 5OZ0A 5P65A 2AVQA 3PWWA 3TPLA 1GNOA 2G27A 1B6LA 4PEPA 3SABA 5OZGA 3I6OA 4GJ8A 5P8MA 3CKTA 3HZCA 3O9HA 4F75A 2JYSA 4Q5MA 1DIFA 3PMUA 3EKWA 1NSOA 2G1OA 1EBZA 5KQYA 1IZHA 1YX9A 3KFPA 1K6TA 3UQUA 5P0QA 4KE1A 1D4SA 3Q70A 3CIDA 5OYXA 5P41A 2QI4A 2XFJA 4FM6A 3HD8A 3SA8A 1XL2A 1BDLA 5P6VA 2R9BA 5P0AA 2ZHRA 3UQXA 3OOTA 3PSUA 4GJDA 5P03A 4Y4WA 4GJAA 4DI2A 4YDGA 2VIZA 2NNKA 5P0UA 3L5CA 5P8RA 3VFBA 1T7JA 1F34A 5P4BA 5ENMA 4NJUA 1E5OE 3VSXA 5P3FA 2WHHA 5P6GA 1T6EX 4I8WA 5P68A 3EKVA 2IS0A 1PFZA 3QVIA 1D4LA 5P2CA 2WF3A 5P4YA 2VA7A 2R43A 5P2MA 3S43B 3D20A 3OUDA 5P0YA 1FLHA 4D83A 1PROA 5P6MA 5P10A 5F00A 1BILA 2F3KA 3RSVA 5P49A 5P86A 5J25A 3T3CA 5HE5A 4YBFA 1IVPA 2ER9E 3LPJA 2QI0A 3NR6A 1G6LA 4Y57A 3UTLA 1DPJA 5P35A 5P3RA 3ST5A 3OADA 1XN3A 5BRYA 5AHBA 5P2AA 4GJBA 5JODA 1HIVA 1KJ7A 3U6AA 4Y50A 4Z22A 3TTPA 3NU3A 1AAQA 2F3FA 5P4LA 2QCIA 5P42A 1XE5A 5P5RA 1K6VA 2FDPA 3FIVA 1SGZA 2PK6A 1HVSA 1LYAB 1ZPAA 2H6TA 2APRA 4NJVA 2QD8A 5P3ZA 1TCXA 4R93A 2PMAA 5HDVA 2BB9A 3VLAA 3UFLA 4Y37A 3ZPSA 5P01A 4XX4A 5P69A 1WBKA 3EL5A 3IXJA 4Y9WA 1VIJA 5C9FA 2O4LA 2VNNA 1HTFA 5OZ6A 4QJ9A 3KDCA 3LIXA 1C6XA 4EJ8A 2BPVA 4RCFA 4OBGA 5P40A 2G20A 1MPPA 3DK1A 5OZCA 4E43A 2AZ8A 3I2LA 4B0QA 5EZXA 2VNMA 2BPZA 1BXQA 5HDXA 2ZJHA 4OBKA 3O9FA 4GYEA 1MVPA 2QHYA 5P5GA 1AJXA 4PYVA 5P33A 4DQGA 2V16C 1BVEA 3Q5HA 5OYTA 2B60A 5OZJA 4BFDA 1M4HA 5P78A 1FKNA 4PZXA 5P17A 4F76A 3O9GA 1UH8A 4CPSA 2SAMA 1A30A 2NMZA 3OXXA 1C70A 5P2JA 5P4RA 5P0LA 2QZXA 5OZSA 3L5FA 1F7AA 5HE4A 3NYGA 1K6PA 4EWOA 2ER7E 2QNPA 4KE0A 5P14A 1A8KA 1SMEA 2HB3A 5OZDA 4ZE6A 2IRZA 4Y3SA 5P36A 4I0HA 4LP9A 3OTSA 4J0ZA 1OD1A 4EXGA 1HSGA 5P4PA 5P2IA 3SLZA 2AOHA 5P52A 2NMYA 1B6JA 3KFSA 3TKWA 2V12C 5P3UA 3OQKA 5P8VA 4M8XA 2FIVA 5HCOA 3PLDA 3EM3A 5P5UA 4HEGA 7UPJA 3PSYA 2G1SA 1ZSRA 3K4VC 3PSGA 2QMFA 1TQFA 3NWQA 1AZ5A 1IBQA 5P5ZA 2QMGA 2XYEA 5P5XA 5P8HA 2HAHA 1ME6A 5P1VA 5IVSA 3RSXA 5KOSA 5P7YA 4D85A 2BKSA 2HB4A 4Y39A 2FMBA 5P8CA 1D4YA 4L7GA 5P3HA 5AGZA 1LYWA 3UDYA 2V00A 3VYDA 5P61A 5P4TA 2BPYA 5P3GA 2I4DA 5P76A 1YM4A 1FMXA 2AOCA 1GVWA 5P1QA 5P3NA 5P3SA 2AVVA 5P1SA 4F73A 1YT9A 1B6KA 1M43A 4ER2E 4Y5AA 2QHZA 1W51A 5OZZA 4A6CA 5HU1A 4GJ9A 4Y5EA 5KR1A 5P4HA 3FSMA 3VF3A 3RTHA 2VIJA 1GKTA 4ZSPA 4CPQA 5AHCA 2F3EA 1FQ8A 4EJDA 4ZPFA 4GIDA 1RPIA 5P04A 1BXOA 3BXSA 3SQFA 2OHRA 3NDXA 3PBDA 1W5YA 5OZAA 3S56A 1G2KA 1FF0C 5P0RA 2HB2A 4J1EA 4ZSRA 5P5MA 3KFNA 4J0TA 4B70A 3OAGA 5P5BA 2F80A 1ZJ7A 2ZHSA 5P7NA 1C6ZA 6FIVA 5P6UA 4RVJA 3EKXA 4Y58A 4AA8A 5P3VA 4HA5A 3QP0A 2PWCA 2VA6A 1BIMA 2OHLA 5BS4A 5P3CA 3GI5A 5ENKA 4K4RA 2R8NA 2VIYA 3N4LA 1HWRA 9HVPA 5P2NA 3FX5A 5P19A 2Q11A 5HVPA 2ZJIA 2AOFA 5P8NA 2I0AA 4R8YA 2Z4OA 3OU1B 2ZYEA 5P37A 4Y4TA 3LIVA 5P3MA 3LPIA 2FDEA 3PMYA 4TRZA 1CPIA 4ZPGA 3QI1A 5P83A 5P7LA 5P85A 5P1LA 3ZLQA 1FQ6A 3L5BA 1BBSA 5DQCA 5OZ3A 1FQ7A 5F01A 3DV5A 1LYBB 2P3CA 2AODA 4LHHA 1GVVA 3VSWA 3K5DA 3T11A 3MXEA 3PBZA 4RGHA 1M0BA 2QU2A 4K4QA 4H3FA 2XFIA 3D1XA 4J55A 3B80A 3HBOA 5P38A 2QZKA 3TOFA 3SA5A 5DR1A 3UDQA 3EKQA 3BXRA 5P6HA 5P5QA 2BPWA 5P81A 4OC6B 4NJSA 3OHFA 1Z1RA 1HIIA 3OU4B 5P4WA 5P5SA 3ER3E 4Y5CA 5C9BA 3NWXA 4FRIA 3ZKXA 4D8CA 2QI5A 5P4GA 2R38A 5OZQA 5OZTA 3VYFA 5P5YA 2Q55A 3EL1A 2G1NA 2I4XA 1K2CA 3I7EA 1MSMA 1B6MA 5P79A 4Z4XA 5P24A 4YBIA 5E5JA 5P73A 1T6GA 4Y3EA 5P7RA 1HSIA 3NDUA 2HC0A 1MSNA 3O9AA 5P8JA 5P6EA 5P1RA 3TPPA 3ZKMA 5P05A 5P5VA 1PSOE 2HS2A 4DV9A 5P7BA 2AOGA 3IA9A 4RRSA 3VF7A 5P1NA 1BVGA 3R4BA 3ZKNA 4OD9B 4Y48A 5P3OA 1UH7A 4B1CA 1MT9A 3PWRA 2H6SA 2QU3A 4EPJA 1OEWA 2B7ZA 1CZIE 3INFA 5P31A 5OZWA 3PI0A 3GI4A 4XX3A 5P8LA 5P6RA 4FRJA 5P3AA 1HTEA 2IQGA 2OHSA 5P0GA 5P6SA 1G35A 3OQDA 5OYVA 5P22A 2QI1A 5DR3A 1ODYA 4ZIPA 2XYFA 4GJCA 1HVCA 3LIZA 4RZ1A 2WF0A 3K5CA 1YTIA 5OZRA 3Q4BA 1W6HA 1HEGE 3OU3A 4J0VA 5TOLA 5P15A 3O9IA 5P47A 3QRMA 3T7XA 5P0ZA 5P2WA 5P8SA 3OXVA 3ZPUA 4B1DA 1RL8A 1NPWA 2G69A 5HD0A 4FM8A 1META 4RLDA 5P34A 4DPIA 4JPEA 5P7AA 3LZSA 5ER1E 1OHRA 2RSPA 5P3XA 4R92A 5I3WA 3TH9A 3KA2A 5P5CA 2WF4A 2ZGAA 5P26A 2I4VA 4M8YA 4R5NA 5P5FA 5P25A 4H3IA 3IXOA 5P29A 5P8BA 5IVTA 3HAUA 1FEJC 2ZHTA 5P4SA 3NU5A 3TOHA 2WECA 4JP9A 4Q1WA 5P0CA 1EBKC 5P7VA 2G94A 2BQVA 3B7VA 4YD5A 5CONA 5JFUA 5P2XA 5JFPA 4HE9A 5P09A 5P0WA 1E80E 5P2QA 3QRSA 4DFGA 2ZJLA 1J71A 3FNTA 4AA9A 3EXOA 5P6JA 5P8PA 5P72A 3OQAA 2FNTA 1MUIA 3OHHA 4RCEA 5P70A 5P4NA 4RVXA 2PH6A 5P5EA 4XKXA 5OZ9A 2UPJA 3TOGA 4Y3PA 4APRE 4J1HA 5DR0A 2ANLA 5P0MA 3KDBA 1ODWA 5P4FA 2Z54A 1PSAA 3KMXA 4FCOA 5HDZA 2AOIA 5P7EA 3KDDA 5P1YA 5P2RA 4QGIA 3OXCA 1ZSFA 1WBMA 3WB4A 2F8GA 2P3AA 5P5HA 4R91A 1A8GA 2B8VA 4RYGA 4HLAA 2V10C 3INHA 5DQ4A 4L1AA 2OHQA 5P7QA 4I12A 4Y44A 3T6IA 3R0WA 4BFBA 3DM6A 1B11A 3PI5A 5P4IA 3FNUA 1G0VA 2J9JA 1FB7A 1AJVA 5P8IA 5P18A 1DW6C 4H3GA 5P64A 3VUCA 3ZOVA 2UY0A 3OQFA 1UPJA 5OZ8A 5CLMA 2RMPA 3R0YA 2ASIA 4D88A 2WEDA 5P4JA 1IZIA 2O40A 1AXAA 1GNMA 5P3IA 5P2SA 4FE6A 5OZEA 2I4WA 3EL9A 5DR4A 5P5OA 5P2BA 5P82A 3FV3A 1BDQA 4Y54A 3UQPA 2FS4A 5P6AA 4EYRA 2AIDA 5P50A 2QNNA 1LS5A 2G24A 4DJVA 4A4QA 5COOA 5ER2E 5P3QA 2AQUA 3S45A 4HDPA 5KQFA 5OYUA 3S2OA 3WZ7A 2BJUA 5IVRA 5OYYA 3L3AA 2FDDA 5P7UA 5P2TA 3LITA 4RCDA 1HSHA 5I3XA 4NPUA 4EHCA 5OZ4A 5OYWA 2IL2A 5P7SA 3TPRA 5OYSA 3O9LB 5SY2A 3UDKA 1MTRA 1EBYA 5OZLA 4Y5BA 2ZE1A 5HU0A 5DPZA 3CKRA 5P2GA 2WEBA 3DV1A 3GGVA 3IAWA 4NJTA 5DR7A 5P5DA 1K2BA 5JG1A 2OHPA 3I8WA 4TVGA 3EM4A 3KM4A 5KAOA 2P83A 1EPME 2P3DA 3CIBA 3S43A 3PEPA 1HTGA 3O99A 2ZJNA 3BVAA 3WSJA 3BVBA 5P0NA 3CYXA 5P89A 3S8IA 1XDHA 5P1CA 3IVHA 5P7JA 1EC2A 6UPJA 5ISKA 4J1FA 2QNQA 5P71A 3ECGA 3TL9A 3H5BA 5P3LA 4OBHA 1EBWA 5P1BA 1A9MA 5UPJA 5P88A 2OHMA 2ZDZA 4Y4UA 4DJWA 3QROA 4ZSMA 3FKTA 3VV6A 4J54A 3WB5A 1A94A 2FXDA 4TRWA 3IN3A 4DQFA 4CPTA 4Y3QA 5P0HA 5P13A 1D4JA 3OWNA 3VV7A 4Y3YA 2V0ZC 1LYAA 1APWE 2AVMA 3S54A 3ZPTA 4B1EA 3UF3A 1XS7D 5P46A 4QJ2A 3SA4A 5PEPA 3NXNA 3Q6YA 3OGQA 5P1GA 5P0OA 3SM2A 4QJ8A 2AOJA 2QZLA 2BPXA 4I8ZA 3ZKSA 3PHVA 3RTMA 1APVE 5P7GA 4QJAA 5P6BA 3SAAA 1ZTZA 4S1GA 1SDTA 4L7HA 4DQCA 5OZKA 4MC1A 4EJKA 3KYRA 5KQXA 2P3BB 4Y3LA 1LF4A 2ZJMA 4COEA 2Q3KA 1HHPA 5P2UA 3PJ6A 5P1UA 5BWYA 4WY1A 4OBJA 3WZ6A 4Y4EA 5OZ1A 4L7JA 3SPKA 1QS8A 4RVIA 2PC0A 5AHAA 4FSLA 1B5FB 5P1JA 5OZUA 3LINA 4MC6A 2CENA 2VS2A 4L6BA 3BUGA 4Y3AA 3EMYA 2FGVA 3UCBA 4Y36A 1FFFC 5OZBA 5SY3A 1HVJA 4FRKA 4Y5MA 3NU6A 4Y4GA 2CEJA 3APRE 1BV7A 5OYQA 2QP8A 5C9DA 3LIQA 3PWMA 4Y3GA 3DCKA 4Y5GA 4AMTA 2R5PA 5P0PA 5P1TA 5P7TA 3TKGA 4I0ZA 5P1IA 5P8EA 3QAAA 1GVXA 4PPHA 3SACA 4TRYA 5KR2A 1VIKA 3M9FA 2FGUA 4K4PA 4DQHA 2HS1A 5P6OA 4ZSQA 5P02A 5P32A 1QRPE 4I0FA 5P3TA 5P75A 4YHQA 5ISJA 1SIVA 1K1TA 4Y41A 4WTUA 2R5QA 4YD7A 5KOQA 3OUAA 1HOSA 5P6ZA 5P3YA 3EC0A 4OBZB 5P0EA 1YTGA 2P8HA 1MESA 3DOXA 2NXMA 5P12A 2G21A 1ZLFA 5P2FA 2QK5A 1W5WA 2VIEA 1IIQA 1CMSA 3JVYA 5P6YA 4CPXA 4Y3ZA 1GNNA 2IEOA 4RRNA 4U7VA 1HEFE 2PH8A 5P6TA 5P0FA 4Y43A 4Y45A 5OZNA 5P2OA 1AM5A 1APTE 3WZ8A 3S7LA 4Y5KA 5HE7A 5P4XA 5P54A 1FG6C 5P6CA 1BWAA 4LC7A 2VJ6A 3CYWA 5P1DA 3IVIA 2WF2A 2R3TA 4X2LA 2ER0E 1N49A 3LIYA 1ENTE 1WKRA 3Q3TA 4LXMA 3PVKA 1EC0A 3ZKQA 3UPJA 3GI6A 2VJ7A 4Q1YA 4GJ6A 5P7IA 3HDKA 2QI7A 4NKKA 4CPRA 1LF3A 2NPHA 2B8LA 4Y4DA 5P6WA 3U7SA 5P23A 3LHGA 4Y5PA 4FM7A 5P2ZA 3KF0A 2WJOA 2AVOA 4WY6A 2OHKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P6K A;  5P6I A;  6APR E;  2FNS A;  3SO9 A;  3MSJ A;  5P0J A;  3GI0 A;  2ZHU A;  1HTR B;  2Q63 A;  1HXW A;  5P2V A;  1MTB A;  3VG1 A;  5P5A A;  3URI A;  4HDB A;  4I0E A;  1SGU A;  4JOO A;  2NXD A;  3QBH A;  4Y4J A;  5P7Z A;  3SKG A;  3URJ A;  3PB5 A;  4I1C A;  5I70 A;  4Y3F A;  2IGY A;  5OYR A;  5OZ0 A;  5P65 A;  2AVQ A;  3PWW A;  3TPL A;  1GNO A;  2G27 A;  1B6L A;  4PEP A;  3SAB A;  5OZG A;  3I6O A;  4GJ8 A;  5P8M A;  3CKT A;  3HZC A;  3O9H A;  4F75 A;  2JYS A;  4Q5M A;  1DIF A;  3PMU A;  3EKW A;  1NSO A;  2G1O A;  1EBZ A;  5KQY A;  1IZH A;  1YX9 A;  3KFP A;  1K6T A;  3UQU A;  5P0Q A;  4KE1 A;  1D4S A;  3Q70 A;  3CID A;  5OYX A;  5P41 A;  2QI4 A;  2XFJ A;  4FM6 A;  3HD8 A;  3SA8 A;  1XL2 A;  1BDL A;  5P6V A;  2R9B A;  5P0A A;  2ZHR A;  3UQX A;  3OOT A;  3PSU A;  4GJD A;  5P03 A;  4Y4W A;  4GJA A;  4DI2 A;  4YDG A;  2VIZ A;  2NNK A;  5P0U A;  3L5C A;  5P8R A;  3VFB A;  1T7J A;  1F34 A;  5P4B A;  5ENM A;  4NJU A;  1E5O E;  3VSX A;  5P3F A;  2WHH A;  5P6G A;  1T6E X;  4I8W A;  5P68 A;  3EKV A;  2IS0 A;  1PFZ A;  3QVI A;  1D4L A;  5P2C A;  2WF3 A;  5P4Y A;  2VA7 A;  2R43 A;  5P2M A;  3S43 B;  3D20 A;  3OUD A;  5P0Y A;  1FLH A;  4D83 A;  1PRO A;  5P6M A;  5P10 A;  5F00 A;  1BIL A;  2F3K A;  3RSV A;  5P49 A;  5P86 A;  5J25 A;  3T3C A;  5HE5 A;  4YBF A;  1IVP A;  2ER9 E;  3LPJ A;  2QI0 A;  3NR6 A;  1G6L A;  4Y57 A;  3UTL A;  1DPJ A;  5P35 A;  5P3R A;  3ST5 A;  3OAD A;  1XN3 A;  5BRY A;  5AHB A;  5P2A A;  4GJB A;  5JOD A;  1HIV A;  1KJ7 A;  3U6A A;  4Y50 A;  4Z22 A;  3TTP A;  3NU3 A;  1AAQ A;  2F3F A;  5P4L A;  2QCI A;  5P42 A;  1XE5 A;  5P5R A;  1K6V A;  2FDP A;  3FIV A;  1SGZ A;  2PK6 A;  1HVS A;  1LYA B;  1ZPA A;  2H6T A;  2APR A;  4NJV A;  2QD8 A;  5P3Z A;  1TCX A;  4R93 A;  2PMA A;  5HDV A;  2BB9 A;  3VLA A;  3UFL A;  4Y37 A;  3ZPS A;  5P01 A;  4XX4 A;  5P69 A;  1WBK A;  3EL5 A;  3IXJ A;  4Y9W A;  1VIJ A;  5C9F A;  2O4L A;  2VNN A;  1HTF A;  5OZ6 A;  4QJ9 A;  3KDC A;  3LIX A;  1C6X A;  4EJ8 A;  2BPV A;  4RCF A;  4OBG A;  5P40 A;  2G20 A;  1MPP A;  3DK1 A;  5OZC A;  4E43 A;  2AZ8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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