3OADB

Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
171
structure length
171
Chain Sequence
SLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALARH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 171
sequence length 171
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3oadB00
4RCEA 2ZJMA 2CEJA 5P7NA 4FLGA 5P87A 3HVGA 2SAMA 1LYAB 1BVGA 4DJQA 3SM1A 5P7YA 4DV9A 5P4QA 1UH7A 2UPJA 3CKRA 4I12A 3UQWA 2V12C 3LIVA 1D4HA 1NPWA 5OYYA 5P3HA 2G20A 4KE1A 2UXZA 1RNEA 1SMEA 5P1AA 5P6UA 1TCXA 5AHAA 5P5LA 3QVCA 1KJFA 4J5JA 1GVTA 5P37A 4YCTA 5P4YA 4I0DA 1B6KA 4CPWA 5P0VA 5P49A 5P0OA 5P52A 2IKOA 3NDUA 3KMYA 3O9AA 3Q3TA 2R3WA 4MC6A 3EKPA 5P1TA 4Y48A 2P83A 5P67A 4AZYA 3ZKIA 3HLOA 1WKRA 3NU3A 4B77A 3BXSA 5P5AA 4K4PA 3PLLA 2VIEA 4EXHA 3OUBA 4JP9A 5P7XA 5P8PA 4ZE6A 5P63A 5PEPA 4B05A 5P3XA 4FRJA 2RKGA 3VYDA 3PSUA 3TPPA 4B78A 5DQ1A 1RPIA 4BELA 5P81A 1G35A 5P4GA 1B6PA 5P3AA 5OZ7A 1MEUA 1PPLE 2PYNA 5DQ4A 3WZ6A 5OZ4A 1LF2A 5P68A 3O9LA 3MSLA 2OHKA 5P4ZA 3GI6A 5COPA 2QNNA 1MT8A 1LEEA 3PWRA 2QD8A 3HVPA 3S43B 1FLHA 4GJ6A 3URJA 4R92A 5P6DA 5P8HA 1KJ4A 1HSGA 2JJIA 3DV5A 4WY6A 4ZIPA 1YTHA 4HVPA 2G1YA 1IZDA 1D4KA 1HBVA 4HE9A 5P13A 1VIKA 5P0IA 2R43A 2Q3KA 4J1HA 2AODA 2HM1A 2BQVA 3OU4A 1EPPE 4WTUA 2IL2A 1W51A 4D85A 1HPXA 1T7KA 4XX3A 5P7OA 1YT9A 4NPTA 5P12A 5P0NA 5P6IA 5P31A 5P4WA 5DQCA 4DJOA 1ZSFA 5P8LA 3KFSA 3LPKA 2V10C 3IXJA 2JJJA 4I0FA 4FE6A 5P70A 4AA9A 1FKNA 4DJYA 2I4QA 4DQFA 2OHSA 4LXKA 5P5TA 4OBZA 3IN3A 3IGBA 5P20A 4ZPFA 4DJVA 8HVPA 4LXMA 5AH8A 4ZSQA 4FS4A 5I3WA 1XDHA 2IQGA 1D4YA 5IVSA 2RSPA 5P0XA 5OZ8A 1EPQE 5P1WA 5P6KA 1FMXA 3UDHA 5P25A 4YCYA 3UQXA 3OOZA 4Y39A 2P3DA 2WF0A 3BXRA 1QRPE 1MTRA 3OHFA 1Q9PA 4H3GA 5P5PA 2V16C 1UH9A 1E5OE 1WBKA 5C9DA 2ZJJA 3EM4A 2UY0A 3MWSA 3ZKQA 3SA8A 2OF0A 3KM4A 5P19A 3SA5A 2OHQA 3NR6A 2ZDZA 3ZKNA 2QAKA 5P1JA 3N3IA 1WBMA 3OOTA 4LP9A 2OHNA 4Y37A 3LIZA 4EYRA 3QN8A 1CMSA 4R95A 2BJUA 1XL2A 4Y3PA 4QJ8A 1SIVA 3INDA 4BFBA 5P0WA 4Y4GA 2R8NA 4Y3AA 5HD0A 5P5NA 2XFKA 1NSOA 5OZVA 5DR7A 4YOBA 3DOXA 5P2ZA 5P6YA 5BRYA 4MC2A 5ER1E 1ZAPA 5P6LA 3BGCA 3IXOA 3G6ZA 2VIJA 4RLDA 5P5MA 4X7IA 4Y43A 2R5QA 2AOJA 1EBWA 5P7DA 5P3SA 3UDPA 5P28A 4FSLA 3OWNA 5P3MA 1N49A 3UDRA 4RROA 3PSGA 4QJ2A 2J9JA 4NJTA 3K5CA 1LYBA 4YE3A 1AXAA 2WF2A 5P5FA 5OZUA 5P1IA 5OZMA 1AVFA 1KJHA 3NXEA 3SPKA 2F8GA 5P0RA 5KR1A 3T6IA 3VF5A 4YD5A 5P60A 4E43A 5P06A 2G27A 5P6WA 2QU2A 1BV9A 3EKVA 3TPRA 1EBZA 3JVYA 1LYAA 4ZLSA 5HDVA 1XS7D 5OZCA 3LITA 5P02A 3NWXA 1APVE 5P3GA 5P0SA 3UCBA 1IVPA 3O9HA 1BVEA 5P79A 5P50A 1BDRA 2EWYA 4Y4AA 2AOHA 1DW6C 2WEZA 3GI5A 3RVIA 5P8EA 5F00A 5HCTA 5UPJA 3VF3A 2B8VA 2WECA 3IVHA 2AVQA 3S7MA 5P1OA 5I3XA 4Y54A 4Y3FA 2IGYA 5P7JA 5P0YA 2NR6A 2AVSA 4Y38A 3VYFA 4R5NA 4D89A 2AOIA 3PMYA 1ENTE 4I0JA 2OAHA 5HVPA 3DCKA 4B0QA 5P4FA 2OHLA 5P8VA 4GJBA 2VA7A 5P8JA 1A94A 5HE7A 4D8CA 2IDWA 4N00A 5OZXA 2QHCA 1EPLE 5OYXA 5P3KA 3T7PA 4Y3EA 4Y6MA 5P34A 3TLHA 1W5YA 5DR3A 3RSXA 1XN2A 2WF1A 5P0KA 5AH9A 4ER4E 2ER7E 5P4UA 1DIFA 5P6OA 3G70A 2G26A 2Q15A 2VS2A 1IZIA 4Y36A 2IS0A 3WB5A 4QGIA 4DJXA 5P2HA 4FM7A 5P2VA 5P5GA 1HPOA 4RRSA 4DQCA 1PSNA 4M8YA 3S43A 3QBHA 3NUOA 3BVAA 1PROA 5P14A 5P3ZA 4ACUA 4GB2A 4BEKA 3PCZA 3U7SA 1PSAA 1FQ8A 3CYWA 4RYCA 7UPJA 4HDBA 5SY2A 1K6CA 2H6SA 2V13A 2IRZA 4J1IA 5P89A 1K6PA 1MVPA 3CYXA 4R93A 4LXAA 2QZWA 4Y5KA 5KQXA 5IS4A 4PYVA 3T11A 7HVPA 5OZJA 2ER0E 3KFRA 4DJPA 1OHRA 4FAEA 2FDEA 1GNNA 4RCDA 4Y45A 2AVMA 4GJCA 3RTMA 3TTPA 4YDGA 2QI0A 4Y3WA 1GVVA 3S56A 5P78A 1B11A 1ODXA 5OYTA 5P8BA 1ZBGA 3FSMA 4X2LA 3O9DA 4Y3GA 3GI4A 4J1EA 2QD6A 5OYVA 4PZWA 5P3JA 2IEOA 4S1GA 5P2EA 1TCWA 3NU6A 1HXBA 1C70A 2QI4A 5P66A 2VNMA 5P72A 5DR8A 2VJ9A 1MUIA 1QBUA 5P33A 1LS5A 3D91A 2OHPA 5P43A 1KJ7A 1T7JA 4KUPA 1OEXA 5P7QA 2F3EA 2VA6A 4DQBA 5KQFA 2Q11A 4Y3HA 2OHUA 4Y5EA 3SQFA 2I4UA 5P8MA 2APRA 3OAGB 1T7IA 2QMGA 2O4SA 1BIMA 3KFNA 5OZDA 2QZKA 1HPSA 3D1ZA 2QK5A 3OTYA 4LBTA 2QI5A 1F7AA 1A9MA 5P6XA 3OY4A 4YD6A 1Z1RA 4LC7A 3CKTA 5P07A 1LYWB 4L6BA 4YBIA 3ER5E 2I0AA 1FQ5A 3O9CA 1GNOA 5P84A 1YG9A 3NU4A 5P7FA 5P4KA 2CEMA 3DV1A 2HS1A 5P2BA 5P1SA 4H3IA 4CMSA 4OBKA 2PWRA 3OTSA 5T4SA 1U8GA 4DJWA 3VSWA 5P46A 3EM3A 4GJ5A 1UPJA 1W5VA 4EWOA 5P29A 5OZ1A 1XE5A 3KT2A 4UPJA 5HDZA 4KE0A 1T6GA 3OXVA 3IVIA 4OC6B 1YM2A 3EL5A 2WEAA 5OZLA 2AZBA 1XE6A 5E5KA 3K1WA 4CP7A 3L3AA 5JFUA 4BFDA 3VV8A 4M8XA 3GGXA 5DGWA 4QLHA 3PM4A 2V11C 1ZP8A 5OZTA 1HVJA 3VG1A 3FNTA 1FIVA 4DJRA 1ZJ7A 5P7ZA 5P4PA 3U71A 3ER3E 4Y3JA 4I11A 3Q6YA 3LIQA 5P2KA 5P3BA 4JPCA 5P2RA 3URIA 3R0WA 4CPQA 3WSJA 1GVUA 1K2CA 4Y3ZA 2B42A 5F01A 1HVHA 2IENA 5P75A 4DJUA 5P5XA 1HWRA 3PRSA 2HB2A 1DAZC 4Y3TA 4NJSA 5HDXA 3EBZA 4Z22A 3S45A 4KB9A 2CENA 1QS8A 3EKQA 1HIIA 4DPIA 5P62A 2QNPA 5P56A 5P5BA 5P5VA 4ZSPA 5HDUA 2B7ZA 2G1NA 3KT5A 5P3VA 3TOFA 3EL9A 3APRE 5ER2E 2ZE1A 3KFPA 3D1XA 1HTGA 2XFJA 1BDLA 1C6XA 2AOCA 1C6YA 5OZSA 3D3TA 3UDMA 4J0ZA 1EBKC 5P59A 5P8KA 4Y3NA 5P1DA 5AGZA 5P1MA 3D20A 1BBSA 2JYSA 5P65A 3CIDA 3S54A 3ZMGA 1F34A 3ZPUA 1K6TA 2G94A 2AVOA 3OXXA 3S7LA 5HTZA 3IXKA 3EKTA 3K4VA 3NWQA 5KR8A 4RYGA 1D4LA 2AOFA 2AZCA 2PC0A 5P6TA 3URLA 5EZXA 1APTE 3CMSA 4Y4ZA 5OZOA 5P69A 4OBFA 5P22A 1T6EX 5P38A 4GJ8A 2Z54A 3T3CA 3NU5A 5OYQA 9HVPA 2FLEA 3G72A 5P2GA 3SAAA 1QBRA 4J0TA 1DMPA 5OYRA 5P1XA 5P1GA 3TOGA 2FS4A 3KDCA 2AVVA 2PSUA 4U8WA 3OHHA 5BS4A 5OZ5A 2NXDA 4Y3RA 2QHZA 2ER6E 4DPFA 5P61A 3PB5A 5HCOA 3EL1A 1ZLFA 3EKXA 3ECGA 5P11A 3UTLA 3JW2A 5P7GA 3OUCA 4Y57A 5IE1A 2QHYA 3PGIA 3SKFA 2I4VA 3S2OA 3OU3A 3RTNA 4DUSA 3SABA 3ZOVA 1FEJC 1TQFA 4XX4A 1MTBA 5AH7A 1SDTA 2QMFA 4NPUA 5P3OA 1W5XA 3EXOA 2ZHTA 4Y5GA 4GJ7A 1IVQA 1ZSRA 1ZPKA 2P3BB 4I1CA 1HXWA 5DQ2A 5P7BA 3OADB 3OQDA 2HC0A 2Q64A 5P0JA 5P7UA 4GJ9A 1LV1A 3K5FA 3SA7A 3VEUA 1MESA 4TRWA 4J0VA 4J0YA 3QS1A 3O9IA 1IDBA 1FQ6A 2QMPA 4RVXA 5P5KA 4Y56A 2QCIA 5DR1A 4Z2ZA 5P0EA 2O4PA 5P2SA 4Y5LA 2B7FA 5P7PA 3LIXA 2HS2A 1BXOA 5P73A 2HIZA 4Y3LA 4Y5CA 5P3WA 3L5DA 3PBZA 3GGUA 3TKWA 3PSYA 1BWBA 2A4FA 1YM4A 5P0PA 1FQ7A 3FV3A 5P7EA 5P26A 3OAGA 5P30A 1FFFC 5P5JA 4YHQA 1SDVA 3IA9A 3PBDA 5ISKA 5P0TA 1AJVA 5OYUA 2R5PA 4Y4WA 5P5SA 5P1ZA 2I4XA 2WEDA 5OZPA 4J17A 5P00A 5COOA 5OZ6A 5P0HA 3OU1B 2Q54A 2G1RA 5P7HA 1MPPA 5IVTA 5COKA 3S85A 6UPJA 4JPEA 5P09A 5P6FA 5P5CA 4Y4TA 4ZSRA 4YCKA 5P80A 1HHPA 3OUDB 1EC3A 1HIHA 4FRSA 5I3YA 1SP5A 1SIPA 4DQGA 1DPJA 5J25A 2ZJKA 1W6IA 5OZIA 4OC6A 5OZQA 3H5BA 5P17A 5OZAA 3L59A 5P4EA 1AM5A 5P3NA 5KAOA 2RKFA 4L7HA 3UDKA 5HU1A 2QI3A 4TRZA 5DR0A 4FSEA 3UQUA 5P6SA 5P57A 2VA5A 4FM6A 2BPYA 2AQUA 1HVIA 5BWYA 1YX9A 2AIDA 3SM2A 5P76A 1HSHA 3L5FA 2ZHSA 3L5EA 4Y41A 4L1AB 3ZKSA 1K6VA 5P0CA 1MRXA 3I6OA 1A30A 1B6MA 5P7LA 4I0GA 3MXDA 5P6QA 1YTJA 1HIVA 3U6AA 3PVKA 1AZ5A 4I0EA 4CKUA 3WB4A 3TPLA 1GKTA 4EP3A 4Y58A 4QJAA 3PI5A 3AUPA 2OHTA 5P8DA 4XXSA 5P71A 5IVQA 4TRYA 3IAWA 1XN3A 1E80E 5P8AA 1A8GA 3INFA 3PI0A 3O9LB 5P45A 4OBDA 1B5FB 2ZHUA 4FL8A 4J1FA 4I8ZA 4EQ0A 2VIYA 3IN4A 4IVTA 4DFGA 5P6BA 5P35A 5P8IA 3CKPA 4XKXA 4RRNA 1AJXA 4K4QA 1B6LA 3OQAA 5P8RA 3GGAA 4TVHA 5OZGA 2Z4OA 5P88A 5I3VA 5P7RA 3OU4B 4Y5PA 2JE4A 5SY3A 3QIHA 3OXWA 3OQKA 2QI1A 3TPJA 3TNEA 5P2QA 1YTIA 5P5QA 1HTEA 4Y51A 1IBQA 3FIVA 1GVWA 1HSIA 3EC0A 5P64A 5OZNA 1HEFE 3VYEA 4A4QA 1LF4A 4ER2E 5P4XA 4LL3A 1EC1A 5P2AA 5P6EA 5DGUA 5P1QA 1D4SA 1VIJA 5P47A 5P6PA 3TKGA 1CZIE 5FIVA 2WKZA 1G6LA 2NMZA 4J55A 4APRE 5P2WA 3KA2A 3DK1A 6FIVA 3LZVA 2WJOA 3SA6A 1EAGA 1FQ4A 1RV7A 5P1HA 3QRVA 5P1PA 1HVSA 3QPJA 5P2OA 2JXRA 5P54A 5KOQA 5OYWA 1SDUA 2AOGA 2NTRA 4B72A 4B00A 3ZKMA 5ENMA 4LAPA 4RCFA 2V0ZC 2ASIA 1E81E 4ZSMA 5P44A 4RVIA 2ZJNA 4Y5AA 3UDNA 2I4WA 5P4JA 5OZ2A 1ODWA 4YBFA 4Y3MA 3QBFA 3DM6A 2P3BA 1XL5A 4J54A 3LHGA 3NU9A 2FDPA 1EPRE 4B1EA 5ISJA 4EXGA 3UDJA 4Y4DA 3SACA 2O40A 1Z8CA 5P08A 3SA9A 5P7SA 3NLSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RCE A;  2ZJM A;  2CEJ A;  5P7N A;  4FLG A;  5P87 A;  3HVG A;  2SAM A;  1LYA B;  1BVG A;  4DJQ A;  3SM1 A;  5P7Y A;  4DV9 A;  5P4Q A;  1UH7 A;  2UPJ A;  3CKR A;  4I12 A;  3UQW A;  2V12 C;  3LIV A;  1D4H A;  1NPW A;  5OYY A;  5P3H A;  2G20 A;  4KE1 A;  2UXZ A;  1RNE A;  1SME A;  5P1A A;  5P6U A;  1TCX A;  5AHA A;  5P5L A;  3QVC A;  1KJF A;  4J5J A;  1GVT A;  5P37 A;  4YCT A;  5P4Y A;  4I0D A;  1B6K A;  4CPW A;  5P0V A;  5P49 A;  5P0O A;  5P52 A;  2IKO A;  3NDU A;  3KMY A;  3O9A A;  3Q3T A;  2R3W A;  4MC6 A;  3EKP A;  5P1T A;  4Y48 A;  2P83 A;  5P67 A;  4AZY A;  3ZKI A;  3HLO A;  1WKR A;  3NU3 A;  4B77 A;  3BXS A;  5P5A A;  4K4P A;  3PLL A;  2VIE A;  4EXH A;  3OUB A;  4JP9 A;  5P7X A;  5P8P A;  4ZE6 A;  5P63 A;  5PEP A;  4B05 A;  5P3X A;  4FRJ A;  2RKG A;  3VYD A;  3PSU A;  3TPP A;  4B78 A;  5DQ1 A;  1RPI A;  4BEL A;  5P81 A;  1G35 A;  5P4G A;  1B6P A;  5P3A A;  5OZ7 A;  1MEU A;  1PPL E;  2PYN A;  5DQ4 A;  3WZ6 A;  5OZ4 A;  1LF2 A;  5P68 A;  3O9L A;  3MSL A;  2OHK A;  5P4Z A;  3GI6 A;  5COP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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