3OBT | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	420
structure length	412
Chain Sequence	SAMASINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNSAIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAECSQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEPP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Clostridium botulinum
publication title	Botulinum neurotoxin serotype D attacks neurons via two carbohydrate-binding sites in a ganglioside-dependent manner. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Botulinum neurotoxin type D
total genus	104
structure length	412
sequence length	420
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2010-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3obtA01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3obtA02

4PC4A 4BOWA 2KH2A 2ZGOA 2MLLB 3UD8A 1A8DA 1IOAA 1IS3A 4LO2C 1VALA 2PHUA 1UZZA 3UJ4A 4HA2A 2YZ4A 2VW2A 3SITA 4YFWA 3RSJA 3WG4A 3R05A 1N1SA 3HR9A 2P34A 4EB2B 2I1BA 4LO3C 3FJHA 3BIWE 3OGGA 3ZSJA 1H9PA 4ATEA 3S8JA 4TZDA 1WBLA 4BQ1A 2D6PA 1BLAA 1RITA 3POKA 1ENQA 3PVNA 4PQ9A 3AX4A 2ZQOA 5F90A 1NZKA 5EG6C 3E8LC 3B9CA 2L5XA 4XXPA 3FJEA 4GKXA 2DRZA 1JYCA 1UPSA 1HQWA 3M3CA 1JT4A 2NM1A 2HW9A 1YBIA 4YW4A 4LBOA 2GALA 3AP6A 4I1BA 4YZ4A 4ZFYB 1CVNA 4F83A 4XFSA 4BM8A 2D23A 2PELA 2Q3NB 4PBPA 1NLSA 1FNYA 4H04A 1CVSA 2NYYA 3AJ5A 3P53A 2FHRA 3O12A 4ZKTB 1LGCA 2ESUA 2ZAAA 3BB2A 3CA1A 2KKIA 3AKHA 1IILA 1GZWB 1MZ5A 1A78A 3CA0A 1ILR1 4I30A 4BMBA 4I0YA 1IRAX 4K1ZA 1UN1A 2JD4A 1TWMA 5GLTA 4J2KA 1JHNA 2AQZA 1QQLA 2AFGA 4LBQD 1SBEA 4XJ8A 3NBDA 2IHOA 1S0IA 1EVTA 2YY1A 5CNAA 1WW7A 1BZWA 3WMUA 4L8QA 3D7WB 3NBCA 4U36A 4YG0A 1QF3A 4R9CA 5GZEA 4Y1XA 1GKBA 1KDKA 1N3PA 4FOYA 4Y26A 4A7YA 1GNZA 1Q04A 5DUYA 3W59A 1F31A 3ZSKA 4PBOA 5LK5A 4JKQA 3UD9A 2VLCA 2ZQNA 3WUDA 3WZ1A 5BP5A 1W3FA 5JVVA 3VT1A 2EAKA 1Z78A 4X3AA 3CQAA 3V65A 3T2TA 1S0EA 4QALA 1DQ0A 1G9AA 5BYNA 4I4SA 4FP3A 5GLWA 4QBCA 4TLPA 5FRAA 1Q8SA 4R9AA 2EXJA 3BX1C 3FJKA 2Y9XE 3WOGA 1SLTA 3AH4A 4Y24A 1W6MA 5DUUA 4QD2C 5EWSA 5CA6A 2UWAA 1APNA 2UUSA 1ULFA 3O3QA 2DVAA 1S0JA 1W6MB 2KI6B 3VKMA 3PVEA 3F1RA 4I7IA 1AJKA 4KEKA 3ZXJA 2DU1A 3FJAA 3VT0A 1BFBA 1EYLA 3AYAA 1GSLA 2Z49A 1S0GA 1AVXB 5F8WA 4QC4A 5IK5A 2R1BA 1WUVA 4FVVA 5GAQA 3BAQA 2KLLA 1W6QA 5SV8A 3SLIA 1ISVA 1LHVA 2DRYA 1NXD1 1W6QB 3OPZA 1RINA 1FQ9A 1KQRA 1DYPA 1G9CA 3HBWA 5F8SA 4XHBA 3A22A 1R1ZA 2WT2A 3UJQA 4J23B 1MD6A 3VT2A 1TOOA 4IHZA 3A0KA 3F62B 4Q8KA 1WW6A 1ULEA 1VIWB 1RZOB 3N0KA 4DRRA 2YXSA 4I4RA 1LHNA 3WDVA 3HSMA 2C9AA 5T5OA 1DQ2A 5H9RA 3WHTA 1GLHA 2DUPA 2R0FA 4LBNA 4G9MA 4IQPA 3S8KA 1A3KA 5JOXA 4ASMB 4YM2A 2HWMA 3BA5A 1S0BA 1QDCA 4I4YA 1M2TB 5DZFA 1PZZA 2OUHA 2ZMKA 4Q1PA 2PHFA 3A4UA 1JXNA 1SLIA 3BRFA 4OZXA 3L2YA 4D0TA 1I3HA 1V6VA 4Z9WB 4I6IA 4XILA 5BVPI 1WD3A 3M3EA 5D62A 4I37A 1ULGA 1JT7A 3I8TA 5E89A 3MW2A 4IYBA 3KMVA 2E7TA 1DFCA 4JP0A 2DV9A 3TB0A 2X2TA 1YXWA 1SFYA 1W6NA 5DXDA 1AXKA 3ZYPA 3T8SA 1W6NB 4P0LA 1CN1A 4Y1UA 1WBFA 1QQKA 4OEEA 4ISQA 3C2UA 4Y1YA 1QOTA 2K43A 5T5PA 3VKOA 2A6YA 1WBCA 5BXTA 5DSSB 4I1EA 4ZA3B 2D3PA 2GNDA 1QOSA 6I1BA 1RY7A 4FPCA 1BXHA 1WCSA 4JRAA 3BAUA 1OQ1A 2P37A 1VLNA 3NBEA 4YGCA 1DZDA 21BIA 4HANA 1BFFA 3N7LA 4EFPA 1LOCA 2P3KA 4D69A 5F9TA 4YZ5A 5HPZA 2UWBA 2HYKA 5FZUA 2ZA9A 2GN7A 1IJTA 1GZCA 2ZGPA 1ISWA 5EHAA 3U4XA 4IZEA 3O0XA 4Y1ZA 3ZXLA 1TP0A 4GKYA 1IS5A 2A7AA 4CTEA 4UW3A 4XDQA 4QKRA 3FJ9A 2OVUA 2DWRA 3BRGC 4JCKA 4XZPA 5BP5C 1MS8A 1AX0A 3CA6A 5IK7A 5GJ6A 3M2MA 3I2XA 4K1YA 5BXSA 2D3SA 4DS0A 2NMOA 4GP0A 3AZYA 4XHXA 1HWMB 1ZA4A 1PUMB 2VSEA 3RRDA 4YZ2A 2DVBA 1CR7A 1KJLA 2W39A 4KBBA 3JUUA 3ZX7A 1LTEA 2XB6C 5H9SA 3ENRA 1BKZA 2ZGLA 5FREA 1N4KA 3B3QE 2R9KB 1N47A 4DCKC 1DZQA 1ISZA 1JW6A 1DBNA 1B09A 1SZ6B 1KRIA 1V6UA 3O4CA 3FGMA 3SH3A 4Y1VA 1IT0A 1G86A 1XHBA 3P6JA 1Z4SA 4BMEA 1AVUA 5BXRA 2AR6A 1OKQA 1HWNB 3O4DA 5DUXA 1LOGA 4H55A 2A6VA 3FLPA 2WSUA 4CZSA 1F5FA 3PHZA 4LBQA 2ES3A 3CAHA 4ZLBB 3D4KA 1FMMS 5BOWA 3HMYA 3MW4A 4P9WA 3NV1A 4LBQB 1WBAA 5GZGA 2R1DA 3OBRA 1O4YA 3PVOA 1RMLA 3QLQA 3OJMA 4LBJA 1SLAA 5CAZA 4LO7B 1V6XA 2FFUA 3AZWA 1JLXA 4ZGRB 4PCRA 2A3YA 1WLCA 4I4QA 1LHOA 1DFQA 4LBMA 2CWSA 4NOTA 2I2SA 1LOAA 2E51A 1S0FA 3POWA 3O5WB 4ZXKA 4X39A 4FPOB 4XJZA 2E4MA 3FFZA 3IAGC 1DQ4A 1Q56A 4LO0A 4IONA 4P6AA 1YYNA 1BARA 1FX5A 1MS4A 3WLUA 1QOOA 1GZ9A 4D0ZA 4GAFA 2CL2A 4ATFA 1JBCA 3WHUA 2W68A 1HWOB 3FJJA 1G7YA 2A71A 3I4IA 4AGVA 3CNAA 5GZFA 3B9UA 2QN4A 4YZ3A 4YW1A 1ENRA 1V00A 2SLIA 2DU0A 2KI4A 5KXDA 2ZGNA 2HZ9A 3WDYA 3BAOA 3V64A 1JUIA 4EFRA 4CJMA 3VKNA 5HCBA 4Q2FA 3AP5A 1LESA 4YGDA 2EALA 3N3HA 1AVAC 4H9WA 1DJSB 2DVFA 2ZHKA 5E8AA 2D44A 1II4A 4JC1A 2VU9A 1Y7BA 4P14A 4Q8LA 4YW2A 1QMJA 2GMMA 4LBLA 2E53A 2JDZA 3WV6A 4G9NA 2M49A 3SNVA 3A0NA 3ZXKA 5GALA 5IK4A 4A7ZA 1GNHA 4QKSA 3AKGA 1QU0A 3CA3A 1XZZA 5DUVA 4M3CE 4FPEA 1HKDA 1QXMA 3OYWA 5GZDA 1PZ7A 2FDBM 3O4AA 2D3RA 2FFVA 3OYWB 1PZ9A 1C1LA 5FZYA 1GANA 2Y9GA 4X38A 2VXTI 3POSA 4P9YA 1MVEA 5BQUC 4UW6A 4OWKA 1IS4A 2ZGQA 3MALA 3WG2A 4NO4A 5DG2A 3APBA 2VW1A 2ZHLA 1HWPB 4OW4A 2ZR1B 4DFSA 2D43A 4OWJA 1N3OA 2ZGTA 1W3GA 1VCLA 4GWNA 4XIOA 3IMNA 4FQ4A 3IKWA 3RTJB 1U0AA 4FPKA 1LHUA 4IY9A 2AUYA 2BEBA 2Q5TA 2P3JA 3N7JA 1JT3A 5JDBA 1SLCA 1FWVA 1D0HA 4RL7A 4WV8A 1ISYA 4GAIA 1OQLB 2P23A 4ENDA 2RG9B 1ULCA 1XYFA 2YROA 2UWCA 1UX6A 4XBNA 4YGBA 2A6ZA 4K20A 3AP7A 1Q8PA 1V6LA 2WT1A 1KJRA 2R49A 2VH9A 3WVJA 3RMYA 2A70A 2ENRA 4LO1A 3PJQA 5E88A 5T5LA 2Y9FA 2B7YA 2LTNA 4Q27A 4YM1A 4K21A 1LECA 2R16A 1V6IA 2X2SA 3Q7YA 1MS9A 4BLIA 3KQRA 3WO4A 3WO2A 4XXAA 1NUNA 1V6JA 3BA7A 9ILBA 3V79C 4I2SA 1SR4A 4XJWA 2JJ6A 3WDWA 1MVQA 2FMDA 3ZVXA 1ABRB 1VAMA 5JOYA 3QYDA 5GLUA 1AXYA 4R9BA 5FNXA 4XYXA 4MYEA 7I1BA 1YI7A 4YW3A 1PZ8A 1QNYA 1FYUA 2G4IA 4ISRA 3NWKA 3HALA 4XE9A 1F9KA 3Q7XA 1YTOA 4C1WA 3RTIB 1CPMA 4YW5A 2GZBA 3B69A 1JY0A 1JYIA 1HIBA 1N3QA 3Q9OA 5IUQA 4OEFA 4LO2A 3NV3A 3AKFA 4I4UA 1N1TA 3UJ0A 4TYSA 3DGTA 4M01A 2DUQA 4G6JA 1AXZA 3SH5A 3I2AA 4DQAA 3OBTA 4AVTA 1JT5A 4P0KA 1SCRA 5IK8A 4LO3A 5GLVA 4LO0C 1C4RA 1J0SA 2D22A 1JTCA 1V6KA 3IM5A 1IS6A 3M1HA 2QYIB 3V0BA 4UW4A 2CYFA 3VKLA 1TIEA 1AZDA 5JOWA 4FPHA 1JOJA 1YO8A 5CBLA 3V0BB 3ILRA 2GMPA 2WNEA 1ENSA 1SBDA 5FNWA 2NMNA 3FJIA 1FATA 3CRIA 1LOEA 1C57A 3ZSMA 5GLZA 5DZGA 3UJOA 2ZGSA 3AKIA 4XBLA 2NVHA 3QR5A 3B01A 4I4PA 1DQ5A 4KC3A 5HCAA 2ET2A 2VY0A 1W0OA 1UL9A 3K1XA 2ZABA 3NV2A 1IRPA 1EV2A 4C1XA 2RHPA 2GN3A 3ZSLA 2CNAA 2FO1A 4M3CF 2AENA 8I1BA 1EPWA 2JE7A 3CRHA 2DTWA 5HCFA 2UURA 4I4OA 2EIGA 3LCPA 2V5YA 3AXEA 4FPGA 3RG0A 3LTQA 4G6MA 1OFSA 1LODA 4WBCA 4Z8SB 3AYEA 2DS0A 1AFCA 1LEMA 3AH1A 4Q26A 3WUCA 3FJBA 1JLYA 4UW5A 3JRRA 3AH2A 3POYA 4I4VA 3QCWA 3O5SA 1BLDA 1S0LA 2OW4A 3SNMA 4I8MA 1QKQA 3WINA 1UAIA 2ZGRA 2AAIB 3W9TA 4JAWA 3UK9A 1FV2A 1HCDA 4WVWA 5IT6A 3ZXDA 1DGLA 1Q1UA 3Q7WA 1URXA 3ZXEA 2D7RA 3VSZA 3AFKA 3OJVA 4SLIA 5EYXA 1L2HA 2F2FA 41BIA 1AX1A 5F8YA 3O4BA 3VKFC 1XG6A 1W0PA 2C5DA 4F34A 3MEPA 3PUBA 4FPYA 1CQ9A 1E0OA 4Q9GA 4DENA 3ZYRA 1G9DA 3VUOA 4YGEA 2PHTA 3CRGA 2AREA 1YIFA 3P6IA 4ITCA 3WDTA 3W58A 1WW5A 3BAVA 3FJCA 3OJ2A 5DVHA 4GOVA 1FN0A 1CIWA 2ZACA 2P39A 1DQ6A 1SCSA 4BLJA 1S0CA 4R9DA 3AP4A 4QD2B 2F8XC 5BXPA 4XMAA 1MS3A 3GALA 3I29B 3AZVA 3BOPA 2ERFA 4Q91A 1CONA 1KITA 1SR4C 3FJFA 1Q8VA 4XJ9A 3FLRA 1FNZA 3R4UA 1ULDA 2TEPA 3MPPG 3VEQA 1DHKB 4FP2A 3AJ6A 2PHXA 2UU8A 1LGBA 4HL0A 2GNMA 5KXCA 4XKIA 3A23A 1DLLA 1Z0HA 4DEPA 5KXEA 3BADA 4I4XA 4P0JA 5E24E 3O0WA 4BPZA 2K8RA 1GV9A 3ATGA 4YZ1A 2RSTA 1M16A 4Z8BA 4LBKA 3ILFA 3IN9A 1SLBA 2WRYA 4G1RA 4YM3A 4Y20A 2H0BA 1Q03A 4IZXA 2WKKA 1DQOA 2LIEA 4FOVA 3ZC9A 4AVSA 2PHRA 4Y20B 5F5QA 2GMEA 1W3AA 1J1TA 4AGGA 4Q9PA 3ILAA 2EXKA 2Z42A 2DVDA 3CU1B 1MC9A 4RA0A 1FMZA 4ZBVB 4XTPA 2D6MA 3OJBA 4OUJA 2D7FA 2ZHNA 1SBFA 4A7KA 4R6UB 1Z2VA 4M00A 1LCLA 3VSFA 1ZM1A 3IPVA 2D6OX 1TWEA 3IPVB 1KDMA 1S0DA 4YG3A 1O4ZA 3MW3A 3FJ8A 2K4AB 2VUAA 3FJDA 1BASA 4FOQA 4I96A 5L73A 1X50A 2JECA 1PC8B 2ZKNA 3R4SA 3AP9A 3ILNA 3IM6A 3BRDA 4PF5A 4ZFWB 1GZWA 4L4IA 4JKXB 4U2AA 4QBVA 1N1YA 3N36A 3BAHA 3LSDA 1D2SA 2Q9XA 1H9WA 1AX2A 1MR5A 3USUA 4M3CA 3OGFA 3M3QA 3WG1A 2ARXA 3V0AA 2Y9WC 3USUB 4FPLA 2BEAA 4M3CB 2P2KA 1UKGA 4EKXB 3B00A 2NTDA 3A07A 1MS0A 3V0AB 1LU1A 1YF8B 3FUOA 1IOBA 2WSVA 1RG8A 2LIQA 2IWTB 3O0VA 2E7QA 1AVBA 3BTAA 1CPNA 3UL2A 1BA7A 3WINC 1G8WA 5FZZA 1DQGA 3OY8A 3WCRA 4J2XA 2LALA 4X37A 2WT0A 1BJQA 4YLZA 3OY8B 1UMZA 1RIRA 4EEEB 4KEIA 3ZPYA 1CE7B 2W52A 3IIRA 1G9FA 2YMZA 2D6LX 2F2FC 1AF9A 3H6SE 2V73A 1I1EA 1SLLA 1HKNA 3WDUA 4XIKA 4AYUA 2DTYA 2XG3A 2SBAA 4IY8A 4XFTA 4GWMA 3T1LA 1K5VA 3WO3A 1DYKA 1GGPB 1K5UA 1TTUA 1MS5A 1W6PA 3AZXA 4OEGA 3UDAA 4XBQA 2EF6A 1W6PB 1IKPA 1WLWA 1FV3A 1MS1A 3AJZA 1IHKA 2GO2A 4D8HA 4W65A 4WZFA 3AZZA 4KEJA 2VW0A 4CRQA 2JE9A 3WCSA 1LOBA 2MC2A 4GOYA 2J3PA 4JQ0A 2NP0A 2R0HA 1P63A 3BODA 1DZCA 3FBYA 2ZMLA 3N35A 2PHWA 2AXMA 4GXLA 1Q8QA 2DVGA 4AVVA 1LOFA 2A3WA 2AYHA 4HR6C 4FOWA 1ONAA 3BA4A 3WMVA 3T1MA 2KM2A 4XTMA 1XQNA 5T5JA 1UZYA 5DZEA 3AYDA 4AWDA 2WJSA 5T50A 5B2HA 3TAYA 4Q1RA 4LO7C 4YFZA 1DIWA 1LEDA 1N1VA 2P3IA 2VSAA 3KM5A 5JMCA 3VV1A 2CY6A 1G9BA 1G82A 4XFUA 4J2SA 2DYCA 2ERMA 1WLDA 2ARBA 2NZ9A 4FPFA 5JOZA 1HCEA 2WBCA 5KXBA 1BYHA 2YUGA 2BQPA 1ISXA 2E4MC 3RQ0A 4USPA 3C9ZA 4DRVA 2XOAA 4P9XA 3IM0A 3VWCA 2AGSA 3GNEA 3CA4A 3WDXA 4XJUA 2ZBJA 3ZXFA 3TC2A 5DZUA 5EC5A 3HN1A 3LSEA 1GBGA 1PUUB 5DUWA 2D24A 1Q8OA 4WVVA 5H9PA 1PWAA 2ZHMA 5GM0A 1HLCA 4FPJA 5T54A 1I1BA 1MZ6A 4ZOTA 2YV8A 1BFCA 2W08A 2BFHA 1LENA 1W6OA 4OWLA 2WLQA 2Z48A 2A5ZA 3FLTA 1SACA 2DREA 2FGFA 1W6OB 3ASIA 3HOMA 2D7IA 3SISA 5JLVA 4XJAA 4YM0A 2JKBA 2E6VA 3PG0A 1IKQA 1WD4A 1WW4A 1HQLA 1QDOA 4FQZA 5D63A 3NBNA 3O44A 1QNWA 3JUTA 4AN6A 1MACA 1DQ1A 3AK0A 5EXOA 2GNTA 1T9FA 1FWUA 1KNMA 2ZMNA 5T52A 3H6QA 1GICA 4GA9A 4GALA 4YG6A 3WG3A 2A75A 2CWMA 1BFGA 3N7MA 3ZXGA 4ZFUB 3N7KA 4I3NA 5T55A 2RQ9A 1R8OA 3SH4A 4AGRA 2VXRA 4DPNA 1HDKA 2ZZJA 3WNXA 2HWAA 5BQUA 2ZGKA 1FAYA 4USOA 4LO8B 2CTVA 3PMEA 4XOGA 3H6RA 1T4QA 2GDFA 1AXMA 1V6OA 3H6RB 1S1AA 1LJ7A 2EXHA 5CB7A 3O4OA 1ONKB 4L4HA 4II0A 3WA1A 2D1ZA 3EF2A 3H0OA 1ITBA 2DURA 1TEIA 2ZGMA 2GNBA 3FUQA 2EXIA 3BAGA 31BIA 1AVWB 3CA5A 1GYKA 1CJPA 3A21A 3JU9A 5DG1A 2A6XA 4EFQA 2D6NA 3AXDA 1JQZA 1JN2P 2A6WA 5I1BA 1LHWA 2AH2A 5D61A 2NN8A 4LO1C 2D6KA 5H9QA 1C1FA 1LGNA 1V6MA 4XMIA 1V6WA 3RMXA 3NV4A 3INAA 5EYYA 3D5OA 1CESA 2D20A 5G00A 1LULA 5GZCA 1H30A 3RS6A 1BQPA 1FGAA 3AJYA 1V6NA 3NJ5A 4HJJA 4Y22A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3OBTA

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