3OELA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with d-glutamate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
264
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 82
structure length 264
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA02
3JYRA 3CRBA 3FVOA 4YMBA 1US5A 4KHZE 4ISUA 4O3CA 4JWOA 3HHFA 4OQOA 3V8XB 4WEPA 3SEWA 2X26A 1MDP1 3RY3A 1B3FA 3RQTA 2HXWA 5CM6A 4H65A 2UYEA 1WODA 1M5CA 3IOUA 1US4A 4OHNA 3ILTB 2F97A 3ODBA 3H6VA 2RF1A 5F1QA 3E9XA 2DWIA 3G3FA 1SI1A 2UVGA 3MP1A 4NEDA 4G68C 2OLBA 2DP8A 5I84A 4KCDA 1A8EA 3JV9A 4OYVA 1II5A 3A3UA 3T22A 3TTLA 1H43A 1MH3A 4NF8A 2GH9A 3OENA 1FQEA 5AE4A 3O66A 5I2KA 2QS1A 3TFLA 4MH5A 1Q1KA 1UIUA 4F31B 3K01A 5TPAA 1MH4A 3KJTA 4L17A 2V84A 3ZSFA 3MQ9A 1NFTA 5JEIA 2XXHA 1MQIA 3SERA 1MPBA 3LC8A 3M3LA 2LAOA 1N04A 4ZEFA 1NL5A 2ZYMA 3VVFA 1UTHA 2F78A 4F39A 1A54A 1UIVA 4X1BA 5L9SA 1MPCA 2F8DA 4GD5A 3SEUA 4O3BA 2H5YA 4OXVA 2RKMA 1B7ZA 1VE4A 1B32A 5CMKA 3U1OA 1H45A 1B0LA 5I58B 3FUZA 4NF8B 1ZTYA 4BLAA 4BDOA 5I2KB 3TTMA 3C31A 4DIGA 1FQAA 3CVGA 4Q8RA 2RC7A 1JW1A 3T96B 3SEYA 4HCWA 1M5BA 3LSWA 4DXUA 1OLCA 5CBRA 2CMOA 4ZEDA 1D9VA 1UTHB 4G4PA 3TPAA 3FXQA 3K6UA 4NTLA 3DLNA 4N6PA 1LAXA 4NE4A 1MM6A 2RC8A 1USYH 4FEDA 1N7XA 4FAJA 3FASA 1SW5A 1Z7ME 2VGQA 4KYEA 2NWJA 1J1NA 3QAXA 4Q5TA 2H98A 2XXPA 1B5IA 1LGBC 4U1OA 2Q2AA 2ZYOA 3CIJA 4YAHX 1LBBA 3HO7A 4GLIA 5H8FA 1FTJA 2HAUA 3OO9A 3N94A 1N84A 3RNNA 5EHMA 1MQJA 1WVJA 2B3BA 2ZNSA 2O68A 4F1VA 1LB8A 4PE5B 3PPOA 2YJPA 4RXLA 1MRPA 3H6TA 1BKAA 4YB6A 1EZPA 1LSTA 3RT6B 2AL4A 2R71A 1B52A 3K4UA 1L5TA 3MJNA 3QUFA 2I49A 1JVXA 4HCYA 4POXA 3K0VA 5CC2A 4G8NA 1P1QA 5H8FB 3UK4A 1RYOA 3WAEA 3OD7A 4EF2A 2O51A 3UIFA 2I3WA 2PYYA 4XIGQ 2UVHA 3MVWA 4I8CA 2DYXA 1PB8A 3FV2A 1AH5A 5B7DA 3S9NC 3TCHA 3K02A 4GL0A 4OWDA 4QFKA 4QSCA 1GR2A 4R2BA 1I69A 4PFWA 4PFUA 3LUYA 1ATGA 4GVOA 4X48A 4WEDA 4GXAA 3DELB 3U94A 3K00A 3O28A 2P0SA 1A8FA 2DE2A 4O3AA 1KWHA 3T9UA 4ZE9A 4FORA 3IOVA 3C34A 1O63A 1B46A 2IA4A 3KZGA 3IX1A 1PB9A 2E0SA 2O84X 2XXUA 3RTWB 2F7BA 1YAEA 1SI0A 4MFIA 4PFTA 3OELA 3L6GA 3OOAA 2ONRA 4N07A 3TELA 2F34A 1FQCA 3QK6A 1PBQA 3FVKA 4KFQA 4KPTA 3CG3A 1PB7A 1M5FA 4DZ1A 3O6GA 2NVUB 3UP9A 3SESA 1QUJA 2V3UA 2AYSA 4IO4A 4GFRA 3MAMA 3MUQA 2W7YA 1DTGA 3TEPA 3CFZA 3BFUA 2Y7WA 4F2QA 1QULA 1URSA 4U22A 2ALUA 1A7LA 3K2DA 2Y7KA 1XC1A 3B7DA 4ZZEA 1ZU0A 5ELVA 4EQ7A 3THIA 4HTGA 1QKBA 1SDXA 1NNPA 1Y4TA 1ANFA 3PPQA 2KLFA 4IO5A 3VLUA 2M8CA 3Q25A 3KEIA 3C4MA 4FATA 2QJEA 4UA8A 1IUDA 4FEBA 2HAVA 3I5OA 2REJA 4UACA 3IOWA 1B51A 2P1SA 5A5XA 1MQGA 1VSOA 3G3IA 3OMBA 1B40A 1FQDA 4LZ8A 3FVNA 3MW0A 3U72A 2THIA 2F5XA 4RPNA 4GIZA 2DWAA 3K6XA 1MY0A 4X1DA 1DMBA 3LBSA 3ONMA 4F3SA 4NF5B 2D3IA 1IQ7A 4U1ZA 2H9BA 2F6PA 1FCKA 4EQBA 1N3WA 3VXBA 3CSBA 4Q30B 2I58A 1MQDA 3LR1A 1LCTA 4ONYA 3G3GA 3IJOB 3SDFA 3K1NA 3MVZA 4DE8A 3R6UA 4F29A 3FJGA 3PUZE 5A5XB 3TQLA 3SKPA 1TXFA 1NNFA 1R1NA 4F2OA 3D4GA 2X7QA 1Y3QA 5K2XA 3H06B 4RPOA 5IKBA 4EXLA 1P1NA 3H4ZA 4K3FA 3O6HA 1S9TA 1DTZA 3CFLA 2PMSA 2VD3A 3S9LC 2DVZA 1YCJA 3CR9A 4H1XA 2F7CA 3EPEA 1A40A 1H44A 4ND9A 5ICTA 4M4GA 4TLLB 5CI5A 4IO2A 5DVIA 4I62A 2DS9A 3P7IA 5BUUA 2HFBA 3ECRA 3RPWA 1DOTA 5L8DA 5ITPA 4Z0IA 5I58A 5CMCA 4JSOA 4YB5A 1XVXA 5DVFA 4R74A 2DXYA 3DM0A 2RCBA 2ZNTA 3SEXA 3GZGA 3PGFA 4RK2A 1NMUA 3L6HA 1JVYA 2QSXA 4P0GA 1TWYA 1XHYA 1LCFA 4EF1A 1URGA 1JW5A 4AB5A 4P0IA 4POWA 3H7MA 3E4RA 3HHGA 3T9XB 3TTNA 4THIA 4ZS9A 3RUMA 4YKPA 5H8QA 1POY1 2RINA 4OESA 2I4BA 1Y3PA 5I2NA 1Y9UA 5JK4A 3PPPA 3O2AA 2R6GE 4WKMA 1JEUA 3N26A 5FHNA 3FVGA 3VLWA 1ZLQA 4H8JA 3S4UA 3MZBA 1FTOA 2PBWA 1XOCA 1FQBA 3TQWA 1B3HA 4QSEA 4R6KA 1PBPA 2R9JA 4PP0A 4RJZA 4NMYA 1IXCA 4N13A 4R73A 1MXWA 1R6ZA 4GQOA 1LFIA 1BIYA 4EQ9A 4BDQA 5AA1A 4XKRA 1ZMGA 5H8QB 1FQFA 4TOZA 4LVQA 1B5JA 5I2NB 3IB1A 1POTA 5AA2D 4X9TA 3FGSA 3KN3A 5AA4A 3TKDA 3V83A 1JEVA 3N5LA 4DLDA 2HZKA 4F3GA 3KBRA 3RN8A 5DVJA 2XXQA 5FTIA 3O97A 1USYE 3RGYA 4OEVA 2YPNA 3H6WA 4E0XA 1B05A 1FW0A 1WDNA 4AB6A 1FTMA 2BJJX 2Y7RA 1GV8A 2VHAA 4H8IA 2OZZA 1SW4A 5FHOA 4GWOA 1LLSA 3IO6A 3DP6A 3S9MC 3KJ7A 4G8HA 3KOSA 2O1LA 2GHAA 3QYTA 5KCJA 4OENA 2V93A 1GVCA 4RK9A 2Y7IA 3N6TA 4KR5A 3HPIA 3T9HB 2XD3A 3PUXE 1DPEA 5AA4B 2UVJA 1JNFA 4M1VA 3IB2A 3A3CA 3PPRA 4IO7A 3UN6A 2QS3A 3IOTA 2H99A 2PVUA 4QFNA 1B2HA 2DWJA 2ESNA 3Q26A 5L9MA 4HW8A 3QXMA 3HV1A 3MP8A 2I0CA 4YICA 4RYAA 1B3LA 1CE2A 3PV0E 3EHUA 4Z7EA 1IZ1A 3LSLA 4I1DA 3VE1B 1YPNA 5KCJB 2OWSA 3KOTA 3OSRA 1EZOA 1BLFA 1AIVA 4ECFA 5DT6A 4EXKA 4YB7A 4OMBA 1NH7A 3PMXA 2QMWA 3KFMA 2PX1A 4OTEA 4MBPA 3TODA 4WXJA 3O9PA 2F6GA 4PQJA 4YZZA 4JDFA 4R6YA 4ZEBA 5HM4B 3KN8A 4FJPA 3C36A 2UVIA 1Y4CA 1QUKA 1A99A 4OFLA 3M3KA 4GRKA 4U4XA 4C0RA 1B0HA 3M3FA 1PEBA 3I6VA 4LA9A 4F18A 4QHQA 3FJMA 3K6WA 2O7UA 1DPPA 4XKNA 1S50A 3G3KA 4ZECA 5CMMA 3TCFA 1A55A 2QS4A 3KN7A 2D21A 2F35A 1LAGE 2ZNUA 1EU8A 3N6UA 3QIMA 4RNSA 4H5GA 4F3PA 4KQPA 4ESWA 4R9FA 5H8NA 2Y84A 1LAFE 1GTKA 1LFHA 1QUIA 1QVSA 3VLVA 3G3HA 3MVXA 3FV1A 2A5TA 1F9BA 3MP6A 5LOMA 3LSFB 4IY6A 2ONKE 4NF6A 4U2RA 3GXAA 1QW0A 2Y7PA 1ZJLA 3PUWE 2O7IA 1N76A 3F11A 1Y1MA 1AMFA 1SYIA 3W9VA 4LZ7A 5CRYA 3MBPA 1TT1A 1SD3A 1SW1A 1PC3A 3KSJA 3U92A 3ILUB 3EHTA 3CFXA 4NF5A 3MZ1A 3WAFA 4JXIA 3PD9A 3UORA 1PDAA 4C1UA 3TUSA 4U23A 3R7XA 3FATA 4ELQA 5H8NB 4IGRA 5DYHA 1CB6A 1DSNA 1M5DA 2XXYA 5EHSA 2XX9A 2QPQA 5FTHA 2XXXA 2OWTA 1HSEA 4KYSA 2A5TB 5FHMA 3H3GA 3VVDA 4NF6B 2D5WA 1IXIA 1B7UA 3TDJA 2QS2A 1MXXA 3TAJA 2Q88A 3EHSA 3V89B 2QRYA 3IJXB 3IL1B 1NKXA 3FZVA 3MZ9A 4AQ4A 2DWHA 3CSGA 1OLAA 4R9GA 4YKJA 1SBPA 2RCAA 2HEUA 1HSLA 5TU0A 4XTCQ 1FTLA 3K1MA 4R75A 2I4CA 3USDA 2HQ0A 4QF9A 4YMAA 1ZIUA 1OQGA 3OEKA 4TLMB 4DCXA 3SEVA 5F7VA 1P1WA 3PMVA 1RKMA 3M8UA 2DXRA 3GBAA 1MXYA 2V25A 2ANJA 3ZKKA 2Q9TA 4DCYA 4DXCA 3S9EA 4OZ9A 2FYIA 1ELJA 2RC9A 4KI0E 2DOJA 1OMPA 5BWJA 1NH8A 3BKIB 3U93A 3TTKA 3CG1A 1QJMA 3FD3A 3DP4A 1LBCA 3R26A 2F36A 2XXRA 4JB7A 1R9LA 2XX8A 2UYFA 2X7PA 4IGTA 1BTJA 4KD5A 5KDTA 2B3FA 2YLNA 3O6IA 2F7AA 4LP2B 3T66A 3VV5A 4YKIA 4PETA 4Q0CA 1D3KA 2DQVA 3OO6A 4ZEKA 4E0WA 4F19A 4ELRA 3FJ7A 2PT1A 1SW2A 4RA1A 4FE8A 1VFEA 1MY3A 1B4ZA 3PMWA 4LONB 4G8MA 5B70A 3FXUA 4ZEIA 3UGWA 3OSQA 4MF3A 2NXOA 3UA8A 2XXIA 4IO6A 4JWYA 4F22A 4DDDA 1B1XA 2FA7A 3D4CA 4QRZA 4JWXA 3TMGA 4BDMA 3BBRA 2OJTA 4OVJA 1HSJA 1MY4A 2OBGA 4F1UA 1ZBMA 5H8HA 5KDTB 1M5EA 3CI8A 2Z22A 5L9OA 1XT8A 3B6TA 4FECA 4ZE8A 4NWCA 2H4IA 1NNTA 3Q29A 3KGCA 1TFAA 3IB0A 4OFOA 2QL3A 2GFEA 4U21A 3C9HA 4R6HA 1B3GA 3Q28A 1B4HA 4BDLA 3VVEA 3GBBA 2OCUA 2DE3A 1MY1A 3IK6B 1LAHE 2ZYNA 5AA3A 3RLFE 1OIBA 3VDFA 1URDA 1Z7NE 5I59A 1FTKA 2AIXA 3V5AA 4YU0A 1JQFA 5HPQA 5TPAB 2DSFA 1VFDA 2E1SA 3PU5A 5H8HB 4QFPA 2ONSA 1MQHA 4H0WA 5HBCA 3TYHA 5ICQA 2GHBA 3O29A 2XXWA 4G77A 1MXZA 2ZYKA 3I3VA 4FIMA 1AOVA 2VOZA 3EF7A 2Z8FA 5M2VA 4LQ2A 4ELPA 2REGA 3IR1A 3E3KA 5ITOA 4G68A 3SETA 2CZLA 4LZ5A 5AA2A 5I59B 4LUBA 2O1MA 3A09A 4PFYA 4JBZA 1B6HA 1IEJA 1OQHA 3HSTA 3IORA 3RT8A 3OO8A 2ABHA 2V3TA 1B5HA 4QFOA 4BDNA 2G29A 3QUJA 2B65A 2WKYA 4TQUQ 3TCGA 4G2ZA 1EH3A 3ZKLA 4HS7A 4H67A 2V3QA 3MVYA 5CMBA 4JSDA 1H76A 2XD2A 1UTBA 1EZ9A 1IIWA 4G68B 4GL8A 3ZS6A 1MY2A 5AA2B 2Q8JA 4GOTA 4IO3A 3RTFB 4LQ5A 1I6AA 3LSXA 4GXSB 4IY5A 3GLBA 1YTVA 2DVCA 3OEMA 2GRVA 4ZDMA 3TZAA 2DE4A 1BP5A 2O6AA 5J1DA 3H03A 1GGGA 4P11A 2I6EA 4EUOA 1NNKA 3JZJA 4BDRA 4RY1A 1N3XA 1I6QA 1SYHA 1IXHA 4MLQA 1OVTA 3VFJA 1UTBB 4R72A 1B1HA 4U4SA 2NUVA 5I57A 2I0BA 4ELOA 1RYXA 3OXNA 4C1TA 4KYDA 3KG2A 2XXTA 3VXCA 1IITA 3MPKA 4H6DA 3S2VA 5DTBA 1IXGA 2IEEA 1MXVA 3T9VA 2G93A 3FXRA 5KZTA 3DP8A 1R9QA 1Y20A 1O7TA 1OVBA 1Y1ZA 2FNCA 4NF4A 3PUYE 5DEXA 2XXVA 5I56A 3IO4A 3MPLA 1T0KA 1O64A 3C33A 4OERA 3FIRA 3T93B 3IAZA 2XHDA 4KCCA 4F3BA 1MXUA 1B9JA 4F1YA 1XVYA 2HCAA 5I57B 2Z23A 4EDPA 2A5SA 4QFLA 1MDQA 1ZKBA 4LATA 3W9WA 3HN0A 3BFTA 1MG1A 5K2YA 2I48A 3EN3A 3OO7A 4NWDA 1D4NA 1MM7A 1TFDA 4R2FA 5IAIA 5CBSA 3AXFA 1MS7A 3C35A 3KSXA 2Q2CA 1N0TA 3K6VA 4MLVA 2HZLA 3H6UA 1XS5A 4YKKA 4NF4B 5DEXB 1D9YA 1S7YA 3PUVE 5I56B 5JTYA 2O69A 5TP9A 1N7WA 3G3JA 1UQWA 2NOOA 3Q27A 1B58A 1JW4A 3G7WA 1B3EA 1Q35A 2ZMBA 4QSDA 1H3DA 3TTRA 3W15C 2Z8EA 1P99A 4OETA 3PD8A 1LB9A 3C32A 2VD2A 1P1OA 4IB2A 2PT2A 5EYFA 4OFJA 4H5FA 3U8QA 1B7HA 5H8SA 2I3VA 2AL5A 1SVXB 2P2AA 4XKPA 2QMXA 1LFGA 3PPNA 3B6QA 1AL3A 2Z8DA 3HCQA 4XKQA 2UXAA 3QSLA 1P1UA 2OK2A 3MWBA 4DXBA 1MPDA 5JTYB 3E13X 1JETA 5TP9B 1SQYA 3K1PA 4I9DA 1Y3NA 2Q89A 2XX7A 4XXUA 2VP1A 1VR5A 4GF8A 2ZXTA 1QKAA 4OEUA 1I6BA 3B6WA 5ISUA 3EQ1A 2H25A 3MC2A 4ZZAA 4ESXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JYRA 3CRBA 3FVOA 4YMBA 1US5A 4KHZE 4ISUA 4O3CA 4JWOA 3HHFA 4OQOA 3V8XB 4WEPA 3SEWA 2X26A 1MDP1 3RY3A 1B3FA 3RQTA 2HXWA 5CM6A 4H65A 2UYEA 1WODA 1M5CA 3IOUA 1US4A 3FXBA 4OHNA 4PE3A 3ILTB 2F97A 4PAFA 3ODBA 3H6VA 2RF1A 5F1QA 3E9XA 2DWIA 3G3FA 4GWUA 1SI1A 2UVGA 3MP1A 4NEDA 4G68C 2OLBA 2DP8A 5I84A 4KCDA 1A8EA 3JV9A 4OYVA 1NUZA 1II5A 3A3UA 3T22A 3TTLA 1H43A 1MH3A 2B4LA 1NI9A 2GH9A 4NF8A 3OENA 1KZ8A 1FQEA 5AE4A 3O66A 5I2KA 2QS1A 3TFLA 4MH5A 1Q1KA 2XWOA 1UIUA 4DI3D 1RDYA 4F31B 3K01A 5TPAA 1MH4A 3KJTA 4L17A 2V84A 3ZSFA 4OVPA 3MQ9A 2PCRA 1NFTA 5JEIA 2XXHA 1FBFA 1MQIA 3SERA 1MPBA 3LC8A 3M3LA 2LAOA 1N04A 4ZEFA 1NL5A 2ZYMA 3VVFA 1UTHA 2F78A 4PDHA 4F39A 1A54A 3RYDA 1LBXA 1UIVA 4X1BA 4LN5A 5L9SA 1MPCA 2F8DA 1YZ0A 4GD5A 3SEUA 4O3BA 2H5YA 4OXVA 2RKMA 1B7ZA 1VE4A 1B32A 1FBPA 5CMKA 3U1OA 1H45A 1B0LA 5I58B 3FUZA 4NF8B 1ZTYA 4BLAA 4BDOA 2QVVA 1FPFA 5I2KB 1EYIA 3TTMA 3C31A 4DIGA 1FQAA 3CVGA 4Q8RA 1LBWA 1FRPA 2RC7A 1JW1A 3T96B 3SEYA 4HCWA 2XWIA 4MIJA 1M5BA 3LSWA 4DXUA 1OLCA 5CBRA 2CMOA 4ZEDA 1D9VA 1UTHB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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