3OELA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with d-glutamate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
264
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 264
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oelA02
3KG2A 3M3FA 2UYEA 4F3GA 3PPRA 4JSOA 1EZPA 2DWJA 4YU0A 4EQ9A 4ESXA 5ICTA 1QUKA 4DXCA 2OWSA 4OYVA 1LBCA 3MVXA 1UTHB 3RQTA 4RK2A 3TAJA 3CSBA 4HCWA 1CB6A 1ZBMA 3MPLA 3RUMA 5CRYA 4TOZA 2LAOA 4EF1A 1GR2A 1MXXA 3T9HB 4OENA 4LQ2A 5DTBA 4G8MA 1VR5A 3OXNA 1IEJA 1VFDA 1SW2A 4DIGA 3GZGA 4OFLA 4PFWA 1FTKA 3K6VA 1B52A 2ZXTA 4P0IA 3H03A 2I49A 2F97A 4C1TA 1M5CA 3HHFA 1ZMGA 1B5JA 1YCJA 3HV1A 1AL3A 4IO6A 1PEBA 1JVXA 2PBWA 2Z8EA 5CBSA 2HCAA 4LQ5A 1ZIUA 3IB1A 2H5YA 3LSXA 1JETA 2F6GA 1B1XA 4M1VA 2G29A 1IZ1A 4NWDA 4F1VA 2XXTA 3ILUB 4G77A 2XX9A 4X48A 3G3FA 4OEUA 2PMSA 2XXIA 3BFTA 2W7YA 2DXRA 4KR5A 2I3WA 4ZE9A 2XHDA 2QS3A 2ZNSA 1S9TA 4JWYA 3UK4A 5H8FB 3RTWB 3H06B 1NKXA 2PT2A 2XD2A 3MQ9A 4ECFA 3PD9A 5I2NB 3U1OA 1B3HA 3PPNA 4RXLA 4AB6A 1UTBA 4U2RA 3N6UA 4QFPA 2H25A 5FHNA 1UIVA 4KD5A 5FTHA 3O29A 3QAXA 4YAHX 3PUWE 3FUZA 1P99A 3FV1A 2UXAA 1A40A 4JB7A 2XXYA 2BJJX 3HPIA 1B0LA 2VHAA 1EH3A 3U94A 3MW0A 4EF2A 1B2HA 4U1ZA 3SESA 4BDRA 4POXA 1O64A 2QS2A 1NNKA 5DYHA 1FQAA 4LA9A 4OFJA 1QUJA 1Y20A 1IXCA 3C33A 3MJNA 3B6QA 2O69A 1USYE 2ZYMA 2YLNA 3W15C 3OOAA 4JDFA 4KYDA 5DVJA 4IB2A 5IKBA 2V84A 3KJ7A 2Z8DA 1XHYA 1B6HA 5FTIA 1QULA 2NOOA 3GLBA 2Y7WA 3ONMA 2Z8FA 5I56B 2ESNA 2PYYA 4F2OA 4R6YA 4JBZA 1P1WA 2I48A 4OQOA 4HW8A 1B4ZA 1BP5A 2XD3A 2HAVA 4LZ7A 4DCYA 5H8SA 4R2FA 1XVXA 3CFXA 2DVZA 3B6TA 2XX7A 1EZOA 1YAEA 3CG3A 5JTYB 4Q30B 3H6TA 3VXBA 3OENA 2E1SA 4XIGQ 3SETA 2RKMA 5KDTB 1B46A 1LBBA 4ND9A 3ZSFA 1MQHA 4JSDA 2D5WA 1FCKA 3U72A 5K2XA 1MM7A 5I58A 4G8NA 1Y1ZA 4MF3A 4F3SA 3S9EA 3C4MA 3RLFE 3IORA 1P1UA 4GD5A 4GQOA 2ONRA 4I1DA 5L8DA 5I2NA 3A3CA 2VOZA 1GVCA 1MS7A 1FQDA 1AH5A 2ALUA 3K02A 1OQGA 4ELPA 2I58A 1B3EA 2Y7KA 1P1NA 4QFKA 3TZAA 2RINA 3RT6B 3C32A 4PETA 4RY1A 1JW1A 4WXJA 4YKKA 4C0RA 1IITA 3M3LA 5KCJA 2I4BA 4IO4A 1R6ZA 1Z7ME 1MY3A 3VLVA 1FQEA 3FZVA 1A54A 1R1NA 4IY6A 3ZS6A 3M3KA 4H5GA 3GBBA 3SERA 2OWTA 3TMGA 5DEXA 5A5XB 4R6HA 2Q89A 3TKDA 3KN3A 1WVJA 3K6WA 2QSXA 1UIUA 5TPAB 5CC2A 3TTLA 2REGA 4EXLA 4NF5B 3IO6A 3H7MA 1ZKBA 3S2VA 4HCYA 4U22A 5H8HB 4EXKA 5CBRA 5H8NA 1JW4A 3WAEA 2XX8A 4KCCA 3DP6A 3Q29A 2B65A 1B5IA 2ABHA 1DOTA 1B9JA 4FJPA 4LP2B 3LR1A 3DELB 1A99A 3FJGA 4F22A 5H8QB 3MPKA 1J1NA 2DWIA 1B7ZA 1OLCA 3GBAA 3W9VA 2G93A 2DVCA 4H65A 3TDJA 2F34A 4KYEA 1FTJA 3V5AA 1DPPA 1F9BA 2B3FA 1LAFE 4KYSA 2R9JA 4KFQA 1S7YA 3IOUA 4QFLA 1LLSA 3KFMA 1LAGE 4GIZA 3MUQA 2AL5A 3Q26A 3QK6A 4QSEA 3P7IA 3RNNA 4DDDA 2O68A 4RYAA 5J1DA 3EHUA 1D4NA 4GVOA 3KGCA 4ZZEA 5AA1A 3KJTA 3VLWA 1GTKA 1MXVA 1B0HA 3TQLA 1N3XA 1MQDA 2XXUA 4UA8A 4NF4B 2XXRA 1SD3A 3DLNA 3EPEA 3H6VA 3LC8A 5CMKA 3N26A 1Y3PA 1NL5A 2ZYNA 2DE2A 1ZTYA 3TCHA 4G4PA 3JV9A 3OO9A 3PD8A 1DPEA 4G2ZA 4QF9A 4M4GA 1POY1 1WODA 5TPAA 1MDP1 1PDAA 1TT1A 1CE2A 4IO5A 3HO7A 3VVEA 3QUFA 1B5HA 4ZEIA 3MWBA 1URDA 2QJEA 1B3LA 3VFJA 3T96B 5EYFA 1P1QA 1O7TA 2ONKE 2X7QA 3AXFA 3IOVA 4DXUA 5AA2A 3D4GA 1MRPA 2VGQA 3M8UA 1HSJA 1I6BA 5AA2D 3PPQA 2XXXA 3G3HA 5AA4B 3LSFB 4G8HA 4LZ8A 5I2KA 3E3KA 3K00A 1LGBC 1R9LA 2ZYKA 3G3IA 2OJTA 2I6EA 4R75A 4FAJA 2NWJA 3IK6B 4F3BA 1H76A 3F11A 1MPBA 3H6WA 3MAMA 1NH7A 2Z22A 4C1UA 3SEXA 3TCGA 2A5TB 3RTFB 2Q2CA 1DTGA 3MP1A 3LBSA 2DOJA 1QJMA 1PBPA 1FTOA 4IO7A 4H1XA 1LCFA 1M5FA 2QMWA 3R6UA 4NEDA 2F7BA 3TQWA 2H9BA 4OXVA 4Q0CA 4LUBA 3OEKA 1BKAA 3Q28A 4GXAA 4IO3A 4F29A 2QRYA 2Z23A 2O7UA 2X7PA 4R2BA 5CMCA 4ZE8A 2VD2A 3FJ7A 3CSGA 4MH5A 1NH8A 3IB2A 3OMBA 1B3FA 1QKBA 3OO7A 1HSLA 2YJPA 3O97A 5M2VA 3TEPA 4I8CA 1B7UA 3B6WA 4JWOA 2O1LA 3K6XA 3FD3A 2Q2AA 1SYIA 3L6GA 2P1SA 1UTHA 4F18A 1Y3NA 1Y4TA 4R9FA 3PPOA 4Z7EA 3KSXA 1JEUA 3CRBA 2THIA 2UVIA 1LCTA 4H0WA 1VFEA 4ELOA 4NMYA 2DYXA 4QSDA 4U1OA 3T9VA 2Q9TA 2ONSA 4MLQA 2QS4A 3O6GA 3I6VA 1D9YA 3KEIA 4IO2A 3CFLA 2ANJA 3Q27A 3C36A 4YMAA 1N7XA 1PB8A 2F5XA 3G3GA 2WKYA 2HXWA 1FW0A 4JWXA 5DT6A 2B3BA 3C31A 4R72A 1N84A 3K4UA 3EHSA 4OVJA 3LSLA 5LOMA 4BDQA 4BDOA 1B4HA 3T66A 1SQYA 1RYXA 3ZKKA 1MH3A 2A5TA 3WAFA 2Y7RA 4F39A 5FHMA 3VDFA 2Y84A 3JZJA 1S50A 3CG1A 5ICQA 2XXPA 1LSTA 4OMBA 1N04A 1DMBA 1O63A 5L9MA 4KPTA 2PX1A 4LATA 4PFTA 3KOSA 2FYIA 4X1BA 5JEIA 1B1HA 5FHOA 2DP8A 4ESWA 2GFEA 2O84X 5H8FA 3G3KA 5TU0A 2QPQA 4PE5B 1H43A 2I4CA 2NXOA 3R26A 4XXUA 1QW0A 4ONYA 3U93A 2V3QA 1HSEA 1MY4A 1YPNA 4RJZA 3MZBA 4RA1A 4R9GA 2O6AA 3VV5A 2A5SA 1SVXB 1B3GA 2ZNTA 3UP9A 1R9QA 5AA3A 1SW1A 3EHTA 3BKIB 3TYHA 1GV8A 3B7DA 3CR9A 1ELJA 4F31B 2DWAA 3A3UA 3FVNA 3V89B 3MBPA 2H4IA 4G68B 4ZS9A 3CVGA 3PU5A 4NF6B 4OHNA 1H3DA 3W9WA 3T93B 2RCAA 2M8CA 4O3CA 3PV0E 1B58A 3QYTA 5TP9B 1MXWA 4QFOA 1LAHE 4YB7A 3UA8A 2UVHA 1I6AA 4OEVA 1IQ7A 3O9PA 1B40A 2V3UA 4ZEKA 1MY1A 3O6HA 4BDMA 1TFAA 5HM4B 4GF8A 5I56A 3FV2A 4GLIA 2R71A 3E13X 1QVSA 1P1OA 2CZLA 4E0XA 3C34A 3THIA 3UIFA 2O1MA 1XS5A 1XOCA 4FEDA 1NMUA 2H99A 4OFOA 4WEPA 4ZEDA 2F36A 4XKQA 5JTYA 4QFNA 1MG1A 3DP8A 4GOTA 1MQIA 4DE8A 1JEVA 5KDTA 2IA4A 3MVWA 1LFGA 1TFDA 1LB8A 4OZ9A 1YTVA 1BLFA 4YB6A 2VD3A 1PC3A 3N94A 2DQVA 1AIVA 3I3VA 2ZNUA 3H4ZA 1SW5A 5BWJA 4PP0A 3K01A 3ECRA 3ILTB 1II5A 4GRKA 1LB9A 4TQUQ 3VE1B 3PUXE 5CI5A 4NF8B 2XXVA 1NNPA 5JK4A 4OERA 2DS9A 4KHZE 3FXUA 3H3GA 2OCUA 3O28A 1SBPA 4N13A 3HSTA 2F35A 3TFLA 2DE4A 4E0WA 4PFUA 3S4UA 1A8EA 5EHMA 3VLUA 1A7LA 3TTKA 3MZ9A 2R6GE 1A55A 5EHSA 4AB5A 1US5A 3KN8A 3KOTA 3MP6A 3USDA 3PPPA 3T9XB 3C35A 2FNCA 4F3PA 3OD7A 3KZGA 1XVYA 2P2AA 5A5XA 3VVFA 4R6KA 1RKMA 4UACA 5F7VA 2DWHA 3UORA 3IAZA 4DXBA 3DM0A 3O66A 4NF5A 4QRZA 2H98A 1UTBB 3K1MA 1MPCA 2OLBA 3PMWA 4OETA 3TTMA 1M5DA 5H8HA 4Q5TA 3LUYA 4LVQA 3MVYA 1OIBA 3QUJA 3MZ1A 5H8QA 1Q35A 1IXIA 3CFZA 1ATGA 2HFBA 1ZJLA 1B7HA 2OBGA 3TUSA 3RN8A 1N76A 5ELVA 1N3WA 1PBQA 3IB0A 5ITPA 4PFYA 1FTMA 3K6UA 4H5FA 1SI1A 4RNSA 2HZKA 4R73A 4FATA 3V8XB 4EUOA 4YKPA 3TPAA 2CMOA 3IO4A 2O51A 4WEDA 4KI0E 1FQBA 5HBCA 3KSJA 5IAIA 4GL8A 3BFUA 1JW5A 2Q88A 3FGSA 4KQPA 5I57B 3SEVA 4P0GA 3E9XA 4ZEFA 1B32A 4NF8A 3OEMA 3OELA 3CI8A 2VP1A 1NFTA 3FATA 1MH4A 2I3VA 3UGWA 4XKRA 3ODBA 3OO6A 4NF4A 2YPNA 4QSCA 2QL3A 3T9UA 1EZ9A 3EF7A 3V83A 5BUUA 4DZ1A 1IUDA 4BDLA 3HHGA 1I6QA 2GH9A 3FIRA 3SEUA 3I5OA 3PUZE 3IOWA 2GRVA 5CMBA 5I84A 3SEYA 3PUVE 3TELA 2V3TA 1MXZA 1MXYA 2FA7A 5B7DA 5I58B 4ZZAA 5DVFA 4U4SA 1PB9A 4MBPA 4MLVA 2PT1A 1I69A 3RY3A 4POWA 3JYRA 2GHBA 4DLDA 3H6UA 4NWCA 4ZECA 3IX1A 4BLAA 1VSOA 4XTCQ 3PMVA 4U21A 3KBRA 2RC9A 1MM6A 2GHAA 1OVTA 1ZU0A 3N5LA 4O3AA 1Q1KA 2UVJA 4H67A 2I0BA 4F1YA 3HCQA 4HTGA 4I9DA 1MY2A 2I0CA 4LONB 5ITOA 1POTA 3D4CA 4FORA 5KCJB 3IL1B 3Q25A 2AIXA 4JXIA 4BDNA 1JVYA 1PB7A 3O2AA 2F7CA 4ELQA 1OVBA 3TODA 4U4XA 3RT8A 3TCFA 1MQGA 2HZLA 2ZMBA 5AA4A 4YICA 4RPNA 1WDNA 3QIMA 5DEXB 3FVOA 1Y1MA 3OSRA 5AE4A 1AMFA 5L9OA 4K3FA 2QMXA 3SKPA 2Y7PA 5F1QA 3PMXA 3RPWA 4I62A 2PVUA 2HEUA 1RYOA 1H44A 4MFIA 1L5TA 5H8NB 1MY0A 4IY5A 5I57A 1B05A 3QSLA 4F19A 1US4A 3DP4A 3GXAA 3TTRA 3A09A 3FVGA 2XXQA 1DTZA 4G68C 1UQWA 4OESA 4QHQA 4YKJA 1TWYA 4GWOA 2F78A 3CIJA 3FVKA 3C9HA 4ZDMA 4XKPA 4XKNA 1D3KA 4U23A 1QUIA 1MPDA 1MQJA 4YB5A 1MDQA 4O3BA 3N6TA 4P11A 2OZZA 2REJA 1NNTA 1N7WA 1GGGA 3VVDA 4ZEBA 4OWDA 2NUVA 1DSNA 1IXHA 3K2DA 4FE8A 4PQJA 4H8IA 3E4RA 4TLMB 3S9NC 3K1PA 4LZ5A 4GFRA 3IJXB 4HS7A 1URGA 1A8FA 1EU8A 3LSWA 4ELRA 3EN3A 3QXMA 3FXRA 3G3JA 4KCDA 3G7WA 4GL0A 2QS1A 1SW4A 1LAXA 4N6PA 4OTEA 4FEBA 2D3IA 5I59B 3K1NA 1URSA 3OO8A 3MP8A 1JQFA 2RF1A 2D21A 3L6HA 1FQCA 2AL4A 4YKIA 2ZYOA 1H45A 1D9VA 4F2QA 3U92A 1SI0A 1IXGA 2F6PA 1N0TA 1QKAA 5HPQA 1SDXA 4FECA 4H8JA 1M5BA 3IJOB 4THIA 4GXSB 1B51A 4EQ7A 4N07A 3BBRA 1OLAA 3SEWA 4L17A 2V25A 1FTLA 3FASA 1LFHA 3IR1A 1LFIA 3HN0A 1ANFA 4R74A 1T0KA 2RC7A 1FQFA 5DVIA 4IGTA 4EDPA 2AYSA 1Z7NE 1ZLQA 1USYH 2F8DA 2F7AA 1Y3QA 1JNFA 3FJMA 1XT8A 1M5EA 2HAUA 4NTLA 5K2YA 3VXCA 5AA2B 3TTNA 4X1DA 5B70A 4YZZA 3S9LC 4X9TA 1OQHA 3UN6A 4NE4A 5ISUA 2Q8JA 3MC2A 2HQ0A 4EQBA 4FIMA 1BIYA 4Z0IA 2RCBA 5I2KB 4TLLB 1VE4A 2P0SA 3IOTA 2OK2A 2IEEA 3KN7A 3T22A 4RPOA 3EQ1A 3PUYE 4DCXA 2DE3A 4RK9A 3S9MC 1XC1A 2E0SA 5CMMA 3R7XA 3ZKLA 2V93A 4Q8RA 3RGYA 3PGFA 3O6IA 2XXWA 1Y9UA 3U8QA 4YMBA 3FXQA 1MXUA 1Y4CA 3K0VA 4ISUA 1OMPA 4IGRA 1AOVA 3OSQA 1TXFA 2UYFA 1SYHA 3SDFA 1IIWA 2XXHA 4AQ4A 4H6DA 5I59A 4G68A 1KWHA 2RC8A 5CM6A 4NF6A 1BTJA 4WKMA 2DXYA 2UVGA 5L9SA 1NNFA 2KLFA 2O7IA 5KZTA 5TP9A 2NVUB 2Y7IA 2DSFA 3MVZA 4F1UA 2X26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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