3OHRA

Crystal structure of fructokinase from bacillus subtilis complexed with adp
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
294
structure length
281
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTFVCAVGREDGTIIDRIEFPTMPDETIEVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDTSQTYGTITATPAGWRHYPFLQTVNEMIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
total genus 76
structure length 281
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA01
1QQNA 4FWPA 3O1BA 2D0OA 3GDQA 3MN9A 3VENA 4BRFA 1RFQA 5AQLA 3MMVA 2PAVA 1YAGA 4M7YA 3AARA 5AZJB 4EFHA 2HF4A 2Q36A 2QWOA 1X3MA 1X9JA 4FL9A 5AQYA 1NGIA 3AY9A 1XC3A 2EWSA 2VWBA 3QB0A 1DGKN 1U6ZA 3ATUA 4H5NA 3MN7A 1T6DA 3FZFA 2NZTA 2BUPA 5JICA 2UYTA 2CGLA 4FWRA 4RTFD 2YJFA 5F0XA 5FPNA 1ZBSA 5AQKA 3GG4A 3WXJA 3U8XA 2FSJA 3FFKB 4BRAA 4RCHA 4E1JA 3F9MA 5BR9A 1LOTB 4M7XA 2V51B 4I6MA 1QQMA 3HI0A 3WXIA 1HKBA 4MLEA 4IJNA 4IJAA 1S3XA 5KQ8A 3LDQA 4CI6A 4CZIA 3ID8A 5KPRA 3AAPA 4CZKA 4H5RA 2IVNA 4PKHA 1SZ2A 5FPMA 1NLVA 4FWNA 4XH4A 2ITMA 4DCHA 1S22A 2E8AA 3H3NO 4K41A 3VGKA 1LCUA 3W0LA 3GL1A 3QFUA 2J4RA 4FPBA 4CZHA 4WQ4C 1HKGA 5B8HA 4BVOA 5AZIB 3MDQA 2E1YA 3CERA 1E4GT 1NGHA 3VF2A 4JHDA 2FSKA 5F2RA 3RSEA 5JLHA 4Y0WA 1DEJA 4BG9A 2QWLA 3CJ7A 1GLJO 2GUPA 2HF3A 4IXCA 3ZX2A 2KHOA 1ZXOA 3HM8A 3VETA 1QZ5A 1KXPA 1P8ZA 4JD2A 4FWOA 5AQXA 3BUZB 3H1QA 1K8KA 4H0PA 4WQ4A 5EY4A 1YVNA 5EX5A 5LJVA 3H46O 2ASOA 3VGLA 4BVPA 3R9PA 2V7YA 4BR5A 1ZC6A 1YUWA 1JCEA 2QM1A 2QXLA 3L4IA 3O6WA 5EXWA 3VF4A 4L3QA 4C23A 2P9KA 3H6EA 2QWPA 1GLAG 3VOVA 5JMVA 3WT0A 2YHYA 2OANA 5ADXH 2P9PB 4H0OA 3IFRA 2A6AA 3D2EA 3G25A 4BC2A 4BQLA 1XQSC 3QMLA 3UKUB 1CZAN 3VPZA 3UKRA 2YHWA 3ULEB 1JCFA 4DQ8A 4I6MB 2P9IB 3LM9A 5ADXA 4O5FA 2ZGYA 4B1UB 1OKJA 1J6ZA 1NGBA 3DXMB 4B1XB 1Z05A 1U2VA 2D1KA 4WQ5A 3VESA 4JNEA 4QS7A 4WYBA 1GLCG 4BC5A 1XUPO 1E4FT 2P9LB 3IDHA 3ZETB 4BR2A 3CJ1A 4BG8A 5BN9A 4YDUA 3MK6A 4BR7A 3BF1A 3ENOA 1GLBG 1NGAA 2VYPA 4JN4A 3O08A 3M6GA 3ZETA 5F1XA 2CGKA 3U9DA 3BF3A 3VEZA 2F9TA 1NGDA 5BRFA 5CE3A 4DB3A 2YHXA 4FO0A 4H5TA 1NGCA 2F9WA 4ISFA 5BPLA 2AP1A 2W40A 3EN9A 5AQNA 5BRDA 2A5XA 4CZFA 4BQZA 2Q0RA 4QS9A 1MWMA 3QDKA 5AQGA 1BO5O 3EZWA 2FXUA 5AQIA 3VGMA 5AQVA 3BEXA 4AM7A 5I9EB 3O80A 4BRNA 2Q1NA 2VCPA 3HBTA 5E84A 2P9PA 1K8KB 1GLLO 1MWKA 3KHYA 4FWLA 2W41A 4A2AA 3ATVA 1ESVA 3M1FA 4FSVA 2E88A 2ZWHA 5AZJA 2I7NA 1QHAA 2GWJA 3LDOA 3HZ6A 4XH1A 3SLCA 1JCGA 3UE5A 2CGJA 2YI1A 3A5MC 1NM1A 1KAZA 3LDPA 1Y64A 4BRCA 2E20A 3FGUA 1ATSA 1DKGD 2BTFA 5EVZA 1ATRA 4IWVA 3WUHA 2HMPA 4BR9A 4AM6A 1BWFO 2YJEA 4NB4A 3AAQA 3EL2A 2QWQA 2DPNA 3UKRB 3ZX0A 5BN8A 3CETA 2GEMA 5ELZA 2E2PA 2GWKA 3I8BA 4F9OA 1YXQA 4H0TB 4CZJA 5AQHA 2E2NA 3A5NC 5AFUH 1V4TA 3C0BA 2V52B 3KVGA 3EO3A 3P4IA 4PKIA 3LL3A 3JXUA 4FWKA 2Q31A 4CD1A 3FLCO 1ATNA 4RWTA 3IUCA 4BC3A 3I33A 4LC9B 2P9SB 3SMPA 3UB5A 3WXKA 4CJ7A 3A8YA 3RSEB 4EHUA 1BG3A 5AQTA 4BROA 3GE1A 3CQYA 1H1VA 1TYQA 5AQMA 5BREA 1BU6O 1GLDG 4WQ5C 2IVOA 4MO4A 4O8KA 2FSNA 3KZBA 3CJCA 4BRPA 4JHDB 4K42A 4GY2B 4IZ9A 4H0YB 1T6CA 5AQUA 3LM2A 4QS8A 4B1WB 1TUUA 2QW9A 4GNIA 4H5WA 3DXKB 4B1VA 3VEWA 3FE1A 3H45C 1WUAA 3L0QA 1NBWA 5BPNA 2D4WA 2H3GX 4BRLA 4K43A 4CBUA 1MA9B 3FZLA 2IIRA 2P9KB 1KAXA 2P9SA 1QQOA 3TU5A 4DHYA 4BRMA 2P9NB 3OHRA 1KAYA 3L6QA 3CJAA 2CH6A 4CZLA 2A3ZA 4BC4A 1HPMA 3EKSA 3EKUA 3MN6A 1NGFA 4B9QA 4BGBA 1HKCA 3DJCA 3DXKA 4XH5A 3A5OC 2P9UB 4JAXA 5BPMA 2D0PA 1R59O 3DWLA 1BOTO 3MCPA 1RDWX 2QWMA 2FF6A 1G99A 3D2FB 3D7EO 3SK3A 4BRKA 3CI5A 2GTDA 1V4SA 4FWQA 5AQJA 4FOIA 3M3ZA 2NRHA 1C0GA 3A5LC 4YDUC 4A61A 3VEYA 5BRHA 1TYQB 3BP8A 3D2FA 3VEVA 4PKGA 1U2VB 1BUPA 3LDNA 3U9ZA 2CH5A 5AZIA 3O1WA 5EOYA 5JLFA 3D2EB 3S41A 1HLUA 2Q2RA 3ZX3A 1EQYA 3FZHA 4BGAA 1T44A 4KBOA 1QZ6A 4B1ZA 5AQWA 5KPZA 3WEEB 4FWMA 5AQOA 2P9UA 4H0XB 3A0IX 3ENHA 3ZEUB 4BR0A 5AQZA 4FPAA 3SJHA 3C7NA 3H1VX 4CBXA 3O8MA 1IG8A 3SMSA 3QFPA 4PL8A 3GBTA 1HUXA 3C7NB 1BDGA 3QICA 3QBWA 2Q97A 3B8AX 5AQFA 4BRQA 3VERA 1MDUB 4EHTA 2PBDA 5KQDA 4BRIA 5AFUA 4BRHA 3TPQA 3VEXA 1TUYA 1X3NA 2NLXA 1BA0A 2A42A 1BA1A 4H0VB 4MLHA 4HTLA 4ISEA 4A2BA 2WUSA 4NO7A 2A41A 3GOIA 5AQSA 2FLOA 4CD3A 1GLFO 2E2QA 3LDLA 5LY3A 3IMXA 3VF6A 2IVPA 4IO8A 2V7ZA 3CHWA 2ASMA 2P9LA 3WQUA 3ZEUA 1SAZA 3DAWA 3FZMA 4MO5A 4BRGA 1NGEA 4H5VA 3R6MA 3FR0A 2ZGZA 3FZKA 3R8EA 3HSCA 2HOEA 5AQRA 4EIAA 4XEIA 4B1YB 1NGJA 4BR4A 3H3OB 2AA4A 2ASPA 2P9NA 3O5BA 2GELA 1D4XA 3WEEA 4CZEA 5LJWA 1GLEG 3W3DA 2ZF5O 3J8AA 3UKUA 1IJJA 5E26A 4Z94A 2A40A 1NGGA 5TKYA 3VEOA 1WOQA 2QWNA 4CBWA 4FWSA 1HX1A 4PL7A 5FPDA 1RGIA 4BRDA 2I7PA 4H03B 5AQPA 3JS6A 2FF3B 2E2OA 1Q18A 1HJOA 3CQXA 2P9IA 2YCHA 2Q0UA 3QBXA 4CZGA 3CJ9A 4JD2B 4K25A 4EAHD 1NWKA 3DXMA 3MN5A 1NMDA 3O4WA 4ISGA 1C0FA 1Z6RA 5AQQA 2E1ZA 3U4LA 3ULEA 5FPEA 1SQKA 3CIPA 5AR0A 3WQTA 3HTVA 4HWIA 4FOEA 4CZMA 3CJBA 5KPTA 4BREA 2QWRA 3WXLA 4J8FA 4M63C 4A62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GOCA 2PFUA 4KB1A 1L3SA 4OPHA 4CJQA 3GDQA 1RDAA 3MN9A 3O3FA 5AQLA 1TL3A 2ZJQL 2PAVA 1B9FA 1YAGA 1LWFA 3M8PA 1S1UA 3AARA 4CEAA 4HUEA 4CFCA 5DM6L 2Q36A 1LAWA 2QWOA 1X9WA 4DR7K 2HMIA 1X9JA 1Z25A 4FL9A 1N5YA 4IFVA 1NGIA 3AY9A 3QB0A 4LF9K 4MDBA 3ATUA 4KH5A 1RNHA 2BUPA 4GW6A 2CGLA 1MU2A 1ZBSA 3WXJA 4KPYA 2HVHA 4BRAA 4PQUA 4E1JA 4IDHA 1TAUA 4OLBA 4I6MA 1QQMA 4KH4A 3AO5A 4MLEA 2XO7A 4IJNA 3KWGA 3LDQA 5KQ8A 3ID8A 4JKDA 3CXCM 4CZKA 4I9LA 2IVNA 5FPMA 4FWNA 3L3UA 3S3MA 2BGGA 3VGKA 3L2VA 2HW3A 1LCUA 2XY7A 4F3TA 2J4RA 4CZHA 1M1KO 2O8CB 1VQ8N 4U7BA 4AHRA 4GVEA 4BVOA 1E4GT 2X74A 3DOLA 4FLWA 1RTHA 1BCMA 4BG9A 4CGIA 3R1XA 3VQBA 4CEEA 3KTQA 3ALYA 1QZ5A 1KXPA 3PV8A 1P8ZA 4GKKK 4RW9A 5FRNA 3H1QA 2A1RA 4H0PA 1WSGA 4F2SA 3H46O 1XNRK 4BVPA 5HL7L 4BR5A 4A59A 3VF4A 3MWTA 3OYBA 3P39A 3QEVA 3H6EA 2B4JA 3PX0A 2NRWA 3VOVA 4CHYA 2VWJA 2OANA 1BHLA 4ID5A 1NK4A 3G10A 1P90A 4FJHA 1TAQA 4BC2A 5HLFA 2IGIA 2QI2A 4ID1A 4Z4HA 1U47A 4DSJA 1CZAN 4BWMA 3VPZA 3F73A 3ENBA 4FJGA 1VQON 3LZJA 4W5RA 1VK0A 1GOAA 4B1UB 2OPQA 1NGBA 2LSNA 3E9OA 2QK9A 1U2VA 3DLKA 4X66K 2Z1GA 5JS2A 5GADP 3EE9A 4M42A 4JI6K 1XUPO 2O8CA 4DV0K 3TR8A 4BG8A 3RMDA 4LSLA 4KHNA 4YDUA 4BR7A 4DUZK 3V1OA 3ENOA 2DFHA 2VYPA 4ZTJA 5F1XA 4AHSA 3AA3A 3BF3A 5BRFA 5CE3A 2YHXA 3K58A 4Y1CA 4H5TA 4E1MA 3Q7CA 2AP1A 5BPLA 1KSPA 3EN9A 4DKWA 5BRDA 4LF4K 2A5XA 3HPGA 4CGJA 2E6LA 4BQZA 2Q0RA 1UA0A 1MWMA 3QDKA 2OZMA 5AQGA 4B8CA 4NXNK 2YNGA 2HHWA 5AQVA 3HT3A 3RVCA 4FJIA 5I9EB 1VSLA 4M3ZA 2Z1IA 1HNWK 2YKMA 3MWPA 3QNOA 1RDCA 3S3OA 4A57A 3KHYA 3ZT2A 4N56A 4W5QA 3NCIA 4A2AA 4H4OA 5KRSA 3M1FA 3U3GA 4J2EA 4LFCK 4EP5A 1VSJA 2I7NA 3LANA 4AF1A 4JRQA 3SLCA 1JCGA 4KV8A 1NM1A 1KAZA 2AJQA 2E20A 1ATSA 3VQ9A 2OYQA 4JKFA 3F5TA 4AM6A 2F4VK 4JI4K 1WSEA 1NG9A 2B6AA 3UKRB 5BN8A 4N47A 4MFBA 1YXQA 4CZJA 3NF8A 3TSQA 1W0HA 2W6KA 4HUFA 3VQCA 4CEZA 1V4TA 2YNIA 5C2FA 2O8DB 4R5PA 3P4IA 2GBZA 3BZCA 4I2PA 4CD1A 3FLCO 3IUCA 1T05A 1OH8A 4I7FA 3WNFA 3CPWM 3A8YA 3RSEB 2WFBA 1KTQA 3RMAA 1C1BA 3CQYA 1BISA 2UUBK 1BU6O 1GLDG 2IVOA 3G0ZA 4CW7B 3DI6A 4CIEA 4RW4A 3CC4N 2BDPA 5GINA 4JHDB 3NGZA 4GY2B 3AVLA 3KKRA 4UY8O 4GV3A 3DXKB 3VEWA 1LWEA 3L0QA 1Q82O 2GV9A 3M8QA 1OH5A 3FZLA 2O4GA 3U6FA 3ZT0A 4B3SK 3TTDA 2QA4N 3N4PA 4LH4A 3L6QA 4DTOA 1LV5A 4BDPA 1HPMA 3EKSA 4DV5K 1NGFA 1S1VA 1HKCA 2YX6A 4XH5A 3THYB 3DOKA 3C6UA 3K5LA 2P9UB 4JI0K 4FK2A 3TANA 4FJNA 2PZSA 4KTZA 2VWKA 3U3YA 1R59O 3DLHA 2QTDA 2G8IA 3D2FB 3SK3A 4K8ZA 4BRKA 5FLXO 1V4SA 4FWQA 3M3ZA 2NRHA 2Z1HA 3DRPA 4DV2K 3D2FA 4DR1K 4KTQA 1U48A 1QVFM 1LW0A 3U9ZA 1S9GA 5JLFA 3D2EB 4C1NK 4IO9L 3VQEA 4E19A 3DRRA 1EQYA 3OYCA 1K8AO 3LWLA 2OPSA 5HRSA 3PIPL 3MX5A 3QEIA 3LPUA 4H8KA 4FWMA 3K5MA 3ZEUB 4BR0A 3RMCA 4B9LA 5AQZA 3HP9A 5J2QA 3C7NA 3K5NA 1XMOK 5M1KA 4OLAA 2ZJRL 2PYJA 3ZSZA 3SMSA 4Y1DA 3AV9A 1J5OA 3GBTA 2PYLA 1BDGA 3O9SA 3L2RA 3VERA 4DFMA 3PO5A 5KQDA 1TUYA 3P38A 1EP4A 4E7KA 4KI6A 2X78A 3ZSWA 4DF8A 1KFDA 4ISEA 4J2BA 3V9UA 1S6QA 4FW1A 2E2QA 3LDLA 5LY3A 3ZSRA 4K0KK 3CD6N 2IVPA 4IO8A 2V7ZA 1S1XA 4KREA 4IFEA 3QINA 2P9LA 1JLGA 4IKFA 4W5OA 3FZMA 3DAWA 3SYZA 2XY6A 2JGUA 1SKSA 2HOEA 1S72N 4B1YB 3VTIA 4DV1K 2F8SA 3MEDA 3G71N 2YHBA 3MX2A 2ZF5O 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QQN A;  4FWP A;  3O1B A;  2D0O A;  3GDQ A;  3MN9 A;  3VEN A;  4BRF A;  1RFQ A;  5AQL A;  3MMV A;  2PAV A;  1YAG A;  4M7Y A;  3AAR A;  5AZJ B;  4EFH A;  2HF4 A;  2Q36 A;  2QWO A;  1X3M A;  1X9J A;  4FL9 A;  5AQY A;  1NGI A;  3AY9 A;  1XC3 A;  2EWS A;  2VWB A;  3QB0 A;  1DGK N;  1U6Z A;  3ATU A;  4H5N A;  3MN7 A;  1T6D A;  3FZF A;  2NZT A;  2BUP A;  5JIC A;  2UYT A;  2CGL A;  4FWR A;  4RTF D;  2YJF A;  5F0X A;  5FPN A;  1ZBS A;  5AQK A;  3GG4 A;  3WXJ A;  3U8X A;  2FSJ A;  3FFK B;  4BRA A;  4RCH A;  4E1J A;  3F9M A;  5BR9 A;  1LOT B;  4M7X A;  2V51 B;  4I6M A;  1QQM A;  3HI0 A;  3WXI A;  1HKB A;  4MLE A;  4IJN A;  4IJA A;  1S3X A;  5KQ8 A;  3LDQ A;  4CI6 A;  4CZI A;  3ID8 A;  5KPR A;  3AAP A;  4CZK A;  4H5R A;  2IVN A;  4PKH A;  1SZ2 A;  5FPM A;  1NLV A;  4FWN A;  4XH4 A;  2ITM A;  4DCH A;  1S22 A;  2E8A A;  3H3N O;  4K41 A;  3VGK A;  1LCU A;  3W0L A;  3GL1 A;  3QFU A;  2J4R A;  4FPB A;  4CZH A;  4WQ4 C;  1HKG A;  5B8H A;  4BVO A;  5AZI B;  3MDQ A;  2E1Y A;  3CER A;  1E4G T;  1NGH A;  3VF2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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