3OHRA

Crystal structure of fructokinase from bacillus subtilis complexed with adp
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
294
structure length
281
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTFVCAVGREDGTIIDRIEFPTMPDETIEVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDTSQTYGTITATPAGWRHYPFLQTVNEMIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
total genus 76
structure length 281
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA01
5EXWA 3IFRA 1SAZA 4CZEA 1T44A 3EZWA 4PKGA 4BC2A 1NGDA 4PL8A 2BTFA 2V7ZA 2ITMA 5AQVA 5BR9A 1X9JA 4EAHD 1V4SA 1NWKA 5AFUA 4C23A 3VOVA 3TU5A 3R8EA 1GLDG 2ZGYA 4K42A 1HJOA 3LL3A 3QDKA 5LY3A 1G99A 4BRNA 4BRDA 4BROA 1XQSC 2ASOA 4BR5A 4H0XB 3BF1A 2F9WA 3H1VX 4DB3A 3H6EA 3MN6A 4F9OA 2FF6A 3RSEA 5CE3A 4O8KA 1GLJO 2BUPA 1YAGA 2NRHA 3VF2A 4FWSA 4CBWA 3WEEB 4CZLA 3CQXA 4BC5A 4GNIA 1MA9B 2P9UA 3R6MA 4DHYA 3CJAA 3CJ1A 5BN8A 3SLCA 1K8KB 2E88A 5JLHA 3AARA 4FSVA 4H0YB 2E20A 3MN7A 5KPZA 2QXLA 3CIPA 4HWIA 1R59O 2A41A 1HPMA 3LDNA 3O1BA 4FWRA 2AA4A 3CQYA 3EN9A 3EKUA 3QMLA 4BR0A 5FPNA 3FZHA 3GBTA 1NGCA 1RDWX 4FWQA 2PBDA 5BREA 2E8AA 1NMDA 4IZ9A 1ESVA 3FLCO 1Y64A 3D2EA 2CGLA 4MO5A 4MO4A 5BN9A 3C0BA 3ZETB 1NGAA 4JHDB 3EL2A 1BA1A 2A6AA 1JCEA 3P4IA 4YDUA 5EX5A 1GLBG 3ZX2A 3WQUA 4FWMA 4DQ8A 1E4GT 5BPNA 2QWOA 1NGHA 2ZWHA 3DXKA 1JCGA 5AQHA 3H46O 4WQ5C 2AP1A 3CI5A 3D2FB 4WQ4C 1NGFA 4JD2B 2GWJA 4JAXA 4LC9B 4FO0A 1BOTO 4H0PA 4BRLA 4B1XB 2E2PA 3H1QA 1E4FT 2P9PA 3IUCA 5AZIB 3M1FA 3DAWA 1XC3A 4BG9A 3QBXA 2WUSA 3H45C 3UKRA 4B1WB 4DCHA 3VERA 3FZLA 1YVNA 1LOTB 3VEXA 4H03B 1TYQB 2FF3B 3CERA 3DXMA 4AM6A 4BREA 4FPAA 1NGBA 1RGIA 2IIRA 3O4WA 3QBWA 2D1KA 4ISGA 5AQMA 1BWFO 3I33A 5AQKA 3VEWA 3W0LA 5BRHA 3UKRB 2UYTA 1HKCA 1NGGA 5EOYA 3M6GA 3KVGA 4BRPA 3LM2A 2A42A 2Q97A 4BRGA 2FSNA 1J6ZA 3ENOA 3A5OC 4FWPA 4CZHA 4XH4A 1MWKA 4CD3A 4A61A 3M3ZA 4M7XA 4Z94A 4AM7A 2I7NA 2YCHA 5E84A 2P9KB 3AAPA 5KPTA 4I6MA 1X3NA 4B1UB 1D4XA 1DEJA 4K25A 3BEXA 3MN9A 3FZFA 1MWMA 3VGLA 3L6QA 1EQYA 2W40A 1HX1A 4BR7A 2P9NB 3CJ7A 4M7YA 3HTVA 4BGAA 3A5MC 2VCPA 5AZJA 4HTLA 2F9TA 3BUZB 3C7NA 4PKHA 1ATSA 4BC3A 1QQOA 3L0QA 3MMVA 4BRFA 2QWQA 2ASPA 4CZMA 4IJAA 2P9PB 5AZIA 5FPDA 1KAYA 3WXLA 4NO7A 2I7PA 3VENA 1Q18A 2V51B 3IDHA 1BA0A 3J8AA 4A62A 3O08A 3WUHA 2QWMA 1Z6RA 2FXUA 3WXKA 1HUXA 1SQKA 2GWKA 2KHOA 1NGIA 3LDQA 4BR4A 5AFUH 2ASMA 4QS8A 5B8HA 1P8ZA 3OHRA 1OKJA 3LDPA 3A8YA 4EHUA 5AQUA 4JNEA 2QW9A 4BR9A 1BU6O 2P9KA 5ADXA 3UKUA 1MDUB 2YI1A 1DGKN 1NLVA 1Z05A 1HKGA 4MLHA 3UKUB 4ISFA 2P9IA 2NZTA 2HF4A 2PAVA 3FZMA 1CZAN 3HBTA 4CI6A 3WXIA 4BGBA 5KQ8A 1QZ5A 4NB4A 3CJ9A 3QICA 5AQGA 1T6CA 3F9MA 3EO3A 3ULEB 1YUWA 4BRAA 3JS6A 2HOEA 3SMSA 4EIAA 4H5RA 1GLFO 1U2VA 2H3GX 4PL7A 4A2AA 3VGKA 5AQLA 1GLCG 5FPEA 2GTDA 4FWKA 4B1ZA 3HI0A 4JHDA 2GUPA 5BPMA 3CJBA 3FGUA 4L3QA 3H3OB 5BRFA 4O5FA 1NM1A 5KPRA 4BVPA 4CJ7A 3O1WA 2P9IB 4H0OA 5E26A 3FR0A 3D2FA 4QS9A 2GELA 4EHTA 3VEYA 5LJWA 1ZBSA 3FZKA 4H5TA 3GL1A 2A3ZA 3ZEUB 4H0TB 1K8KA 2ZF5O 3UE5A 3ZETA 5KQDA 4FWLA 1S3XA 1HKBA 2P9SA 1LCUA 3CHWA 2J4RA 3R9PA 4GY2B 1BUPA 4WQ5A 3O6WA 5AQPA 3MK6A 1C0GA 2D0PA 2YJFA 3VEVA 2P9LB 4EFHA 1NBWA 1ZC6A 1IG8A 2Q0RA 2Q31A 3KHYA 3VF6A 4E1JA 1XUPO 4CZGA 2QM1A 1U2VB 4BQZA 5AQOA 2E2NA 3LM9A 5AZJB 4B1YB 1ZXOA 5TKYA 5JMVA 2QWRA 2D4WA 3BP8A 4IO8A 3ZX0A 4RCHA 4BRIA 2V52B 3VEOA 3A5LC 1RFQA 4MLEA 5AR0A 3CETA 1C0FA 5BPLA 4JD2A 3DXMB 4H5WA 4H5VA 1QHAA 3VPZA 4BC4A 1H1VA 3MN5A 2A40A 3EKSA 3W3DA 1S22A 4FOIA 2NLXA 3WT0A 5F0XA 3MCPA 3GOIA 5AQZA 3U8XA 2E2OA 5ELZA 4CD1A 4IJNA 4CZIA 2W41A 5EVZA 1WOQA 3TPQA 4CZKA 3C7NB 3KZBA 3S41A 1KAXA 5EY4A 3ZEUA 5BRDA 2A5XA 3DXKB 3O8MA 1KXPA 3IMXA 5AQTA 1KAZA 2VYPA 2YHWA 2ZGZA 1X3MA 5F1XA 5AQIA 4BQLA 4IWVA 2QWLA 4A2BA 4FOEA 1QZ6A 4CBUA 2DPNA 3QB0A 3D2EB 3AAQA 2FSJA 1NGEA 2P9UB 3ENHA 4KBOA 4B1VA 4BRCA 3H3NO 3L4IA 3DJCA 2YHYA 3DWLA 3WEEA 4JN4A 1TUUA 3ID8A 4K43A 2P9NA 3GE1A 3B8AX 3VETA 3WXJA 3LDLA 1TUYA 3CJCA 1BG3A 2Q36A 1NGJA 3LDOA 4I6MB 2YHXA 5AQXA 3FFKB 4H5NA 4Y0WA 1ATNA 1QQMA 3MDQA 3SK3A 4XEIA 3U9DA 1WUAA 2IVOA 3GG4A 5AQYA 4PKIA 1V4TA 1SZ2A 3VF4A 4BRMA 3HSCA 2VWBA 4ISEA 5LJVA 1DKGD 2GEMA 3GDQA 4BR2A 1T6DA 3I8BA 4BRHA 1GLLO 2E2QA 2Q0UA 3RSEB 3QFUA 5AQWA 2IVPA 2OANA 4BG8A 4BRKA 3HM8A 1BDGA 1BO5O 2P9LA 3A5NC 5AQFA 4XH1A 5F2RA 2V7YA 3D7EO 1TYQA 4H0VB 3O5BA 4WYBA 4FPBA 5JICA 4IXCA 3WQTA 2IVNA 5AQSA 3FE1A 5AQNA 3UB5A 3VESA 1U6ZA 2P9SB 5AQQA 4RWTA 1JCFA 2QWNA 4RTFD 1ATRA 3ZX3A 5AQRA 4CBXA 5JLFA 3JXUA 3QFPA 4M63C 2CGKA 4FWNA 2HMPA 3U4LA 2CGJA 4BVOA 2E1ZA 2CH5A 2Q1NA 3VGMA 1QQNA 1IJJA 4YDUC 3ATUA 3U9ZA 4FWOA 1GLAG 4QS7A 5I9EB 3A0IX 3O80A 3ULEA 4BRQA 3ATVA 3SMPA 2FSKA 4FL9A 3BF3A 5FPMA 4XH5A 2FLOA 4WQ4A 4B9QA 3G25A 2EWSA 2CH6A 3AY9A 4J8FA 2Q2RA 5AQJA 2YJEA 4CZFA 2E1YA 2QWPA 2D0OA 4K41A 4CZJA 3HZ6A 5ADXH 1HLUA 2HF3A 1YXQA 1GLEG 3VEZA 3SJHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IFRA 1SAZA 4K0KK 3EZWA 1W97L 3G4SN 2HHSA 1RDDA 1WNSA 4JKEA 3OYDA 5GINA 1X9JA 4EAHD 4BE1A 4M45A 4Z0UA 1NOZA 4C23A 3SAHA 4K42A 2ZGYA 4ICLA 3CC4N 5HRRA 3LL3A 4C8KA 5KTQA 1YI2N 3BF1A 4KH6A 3PIOL 2ZM6K 1VSKA 4H8KA 1GOAA 1EETA 3P31A 3VQ8A 3L8BA 3LALA 1YAGA 2NRHA 3VF2A 3ZCMA 4CF0A 3ZYYX 4BC5A 3R6MA 3DLGA 3V9ZA 3CJAA 3CJ1A 1L3TA 2E88A 4LF9K 3V1OA 1JKHA 4H0YB 2E20A 2OTJN 2W6LA 3TTFA 2A41A 3THVA 1HPMA 3LDNA 4JKBA 3TARA 3O1BA 4FWRA 4FYDA 5HRSA 3EKUA 3QMLA 5FPNA 3FZHA 4EZ6A 1NGCA 1KSPA 1ILYA 5BREA 1UAXA 1Q8IA 2GUIA 1VRUA 2YNGA 1HRHA 1S5JA 4C8MA 3FLCO 1U49A 1RT3A 4MO5A 3OYGA 3ZETB 5SZTA 1BA1A 3VQAA 1GLBG 4FWMA 4GVEA 3L2VA 3CI5A 3SUNA 3TABA 4WQ4C 2GWJA 4X66K 4JAXA 1TL1A 2ETJA 4FZZA 1VQ5N 5M1NA 4ILJA 3IUCA 2FBTA 3M1FA 3DAWA 1B9DA 1F21A 3OYJA 4JK7A 3QBXA 4FM0A 5M1KA 4DCHA 4K8XA 3VERA 1UWBA 3FZLA 4NCAA 1TYQB 3NBPA 3DXMA 3TAFA 4BREA 2R7YA 3K9JA 4IOXA 3CQ8A 4W5NA 2UYTA 1NGGA 1NMNA 3BY5A 1HNIA 2VG6A 5HOOA 4K8ZA 4N76A 4BRPA 3NDKA 3L4QA 4BRGA 1A5WA 5CHIA 1RTHA 1CLQA 1T05A 2HBKA 3M3ZA 2YX6A 4M7XA 4E1NA 4AM7A 1RBUA 2YCHA 5E84A 4PY5A 1XI1A 4I6MA 3CD6N 3RRHA 3L2UA 3FZFA 4I7FA 2HBJA 4FLUA 3DOLA 3I0RA 1HX1A 4M7YA 1YJ9N 3AVBA 3CG7A 1YJNN 3T3FA 3SUOA 4DLGA 3MMVA 3U3GA 4IJAA 2P9PB 5AZIA 2I7PA 2V51B 3IDHA 4WCEL 1ZBLA 1WSIA 5GIOA 1NJZA 3LP1A 3QLHA 4DV0K 1CXQA 1Z6RA 3LP0A 4O55A 2FXUA 1SKWA 2GWKA 3VQBA 3C6TA 5C24A 1KC8O 2KHOA 4JKCA 4BR4A 2ASMA 4QS8A 5AJ3K 1OKJA 3AVFA 3VQ6A 4JKDA 1BI4B 4EHUA 4OX9K 4KKOA 1BL3A 2QW9A 3ZT4A 3PIPL 4IBNA 4AHTA 3ZT1A 4OJRA 1KLNA 1NLVA 2YI1A 1KFSA 1FKPA 1HKGA 1Z05A 3UKUB 3HT3A 3M8RA 4E7JA 4I9QA 2KZMA 4FLTA 3HP9A 4FW1A 2OZMA 4CF1A 3HBTA 2PAVA 4PA1A 4CI6A 1CZAN 3WXIA 1VSMA 4BGBA 4DSLA 1IKWA 4CIGA 3QICA 4CHZA 2VQEK 4DTMA 1IBLK 2FBVA 4KFBA 3EEQA 3F9MA 5FROA 2BH1A 2HOEA 4ILGB 1VQLN 4H5RA 4A5AA 1U2VA 2KKZA 1KQSM 4B1ZA 3AA2A 4CHNA 3SPZA 1L5UA 2QKKA 3VQ4A 5BPMA 3AV9A 3CJBA 2DFFA 3S3NA 4L3QA 3H3OB 4O5FA 4GKJK 1JL1A 4JI8K 2HHXA 2VG5A 2LSNA 4PHTX 1Q82O 2YHAA 4GV9A 4JKHA 3V9WA 2KFZA 3H08A 4JI5K 4EHTA 3OW2M 4QAGA 1KLMA 4O44A 2ZQBA 2GV9A 4U7BA 3L3VA 4NXNK 1K8KA 2ZF5O 3UE5A 4FWLA 1RTJA 3AVIA 3CFPA 3CHWA 2J4RA 3VMFB 3MXMA 3BZCA 1BUPA 1TV6A 4HCCA 2X6NA 1RTIA 3OYBA 4BDZA 1C1BA 1C0GA 3NH0A 4OPHA 1N36K 4DQQA 4B3MK 2OA8A 5FRNA 4EFHA 1YT3A 1NBWA 1ZC6A 2YKNA 2Q31A 1O13A 3VF6A 3ZT0A 4CW7B 3CM6A 1RDCA 3VQCA 4CGIA 1JJ2M 5DMRA 2Z1IA 1UOCA 1ZXOA 1YTAA 3TTDA 2D4WA 4DUYK 3ZX0A 1SKRA 4F2SA 4CJ3A 3Q7CA 5AR0A 4MLEA 2XRIA 4M3RA 3KLIA 3CETA 4RW8A 4DG1A 1C0FA 4CFDA 1VSDA 3J7AP 1S1TA 1QHAA 4CF9A 2A40A 2XY8A 1U48A 1S6QA 2YV0X 2XY7A 3WT0A 5F0XA 4HTUA 3U8XA 4AILC 2E2OA 5ELZA 4YFUA 3T19A 3KLHA 3DI6A 1TKXA 4CZKA 3DLKA 5EY4A 3ZEUA 2A5XA 1KXPA 1X9SA 5AQTA 4J2BA 4DTUA 5F1XA 5AQIA 1IH7A 4CEZA 5CZ1A 4E7LA 1RDAA 3IAYA 5JVGL 1QZ6A 4DTRA 4FZYA 2DPNA 3QB0A 3ENHA 3P38A 4B1VA 4CJPA 4DFKA 4ELVA 4F4KA 1HNVA 2JLEA 3NMUA 4KTZA 2WOMA 1VSLA 3ID8A 2P9NA 3GE1A 3VETA 3WXJA 5J1EA 2RE2A 1NK6A 1BG3A 2FBYA 3RVCA 4DSFA 5I3UA 4Y0WA 1ATNA 2P51A 1N5YA 1BISA 1U45A 3ZSYA 4PKIA 4B9TA 4OLAA 2O8FB 1SZ2A 4BRMA 3C95A 3GDQA 4DSJA 3A2FA 3I8BA 2ZJPL 3RSEB 3O9SA 1RT4A 5IWAK 2OANA 3DRRA 4J2AA 1DLOA 3I0SA 1BO5O 2P9LA 3A5NC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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