3OHRA

Crystal structure of fructokinase from bacillus subtilis complexed with adp
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
294
structure length
281
Chain Sequence
b'AMLGGIEAGGTFVCAVGREDGTIIDRIEFPTMPDETIEVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDTSQTYGTITATPAGWRHYPFLQTVNEMIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPIILGGGVMQQQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Putative fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 281
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2010-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ohrA01
1Z05A 3CQYA 1DKGD 4CZHA 1CZAN 1K8KB 2PAVA 4LC9B 5AQHA 3WEEB 2Q36A 3FZFA 1GLFO 3CI5A 3ZX3A 3VEVA 2E2PA 4A2AA 3LDOA 4FWPA 5LY3A 2A6AA 3KZBA 5E84A 5AQZA 2FSJA 4FOIA 2NZTA 3R6MA 1V4TA 2I7PA 1GLJO 3D2EA 4BQZA 3SJHA 4BRFA 4I6MB 3C0BA 2P9NA 3D7EO 3LM9A 3VEZA 4BRDA 4EHUA 3VEOA 4A61A 4BC2A 2CH6A 2BTFA 3AAPA 2QXLA 3LL3A 2AP1A 2P9IA 2HOEA 3BF3A 1NGGA 3RSEA 1C0GA 1U6ZA 3CJ1A 1H1VA 5JMVA 3WQTA 3L0QA 4C23A 3UE5A 2E2QA 5AZJB 4O5FA 3C7NA 4FO0A 4ISFA 4BC3A 3W3DA 3AARA 3EO3A 3MDQA 2YCHA 1U2VB 4FPBA 4GNIA 4Z94A 4H5NA 3DAWA 4ISEA 4AM7A 3H3OB 3R9PA 3QFPA 4GY2B 4IJNA 2E8AA 5B8HA 4WQ4A 3OHRA 1V4SA 3H46O 3ATUA 4BRCA 3O08A 4BQLA 2E1YA 1XQSC 1XUPO 3B8AX 2QWLA 3VGKA 1OKJA 3VEYA 5KPZA 3EL2A 2IVOA 3H1VX 5AFUA 1SQKA 1NGFA 3WEEA 5AQGA 5I9EB 3VERA 3FE1A 1NM1A 5AR0A 3VOVA 4A62A 1QZ6A 5BPLA 1BA0A 2HF4A 5EY4A 4BG8A 3MN7A 4BC5A 2ZF5O 4CZLA 1KAXA 2ZWHA 2VYPA 4RWTA 3O4WA 5EOYA 3IFRA 3MK6A 3W0LA 1BO5O 5AQUA 2P9PA 2P9KA 1JCFA 1GLBG 5BRDA 5AQWA 1YUWA 3VESA 2GUPA 2PBDA 4BRQA 3CJ7A 4BR0A 4WQ5A 2QWPA 2YHWA 3MN9A 3BP8A 3WXIA 3S41A 2F9TA 3HM8A 2HF3A 3M6GA 3FZHA 4XH4A 3CHWA 3EN9A 3CJBA 1JCEA 1QQMA 4IO8A 4M7YA 5AQQA 3A5MC 4FWKA 2A3ZA 1RFQA 2V7YA 1HLUA 4XH5A 4RCHA 4CZMA 4JN4A 2ZGYA 3KHYA 4FSVA 2E1ZA 1NGEA 2IIRA 5AZIB 3O80A 3SMSA 2FSNA 2V52B 3ZETB 3FZKA 1WOQA 4CBXA 2QWQA 3ZEUB 1ESVA 1Y64A 5EXWA 3WXKA 2ASPA 3CJ9A 2QWMA 5AQYA 1E4FT 3O5BA 4PKGA 1QZ5A 4JD2B 3MN5A 2GWKA 4Y0WA 4DQ8A 4MO4A 3UKRA 1MWMA 4BRAA 1ZC6A 3FFKB 1SZ2A 3G25A 4EHTA 1NGJA 3VEXA 4B9QA 1BOTO 3GDQA 2GWJA 4CZIA 3TU5A 3IMXA 4FPAA 2CGLA 4NB4A 1P8ZA 2AA4A 3QDKA 2D4WA 3I8BA 3J8AA 1EQYA 3GOIA 3LDNA 5TKYA 4DCHA 3ENOA 4BR9A 1KXPA 4B1UB 4H5TA 3VF4A 4IZ9A 4BG9A 4BGBA 1KAYA 3QMLA 1JCGA 3D2FB 4IJAA 2E88A 4PKIA 5FPDA 3DXKB 1S22A 3L4IA 1YAGA 1QQOA 4JAXA 4FWNA 2BUPA 5BPNA 1TYQB 3ULEB 5F0XA 5F2RA 4A2BA 5ELZA 1WUAA 5AQXA 3UKUB 2P9SB 4BROA 4QS8A 3R8EA 1QQNA 3A0IX 4H0XB 4FWQA 3AY9A 4JNEA 1NLVA 4MLEA 4CZKA 5AQTA 1TUYA 5AQRA 1K8KA 5AZIA 4CZFA 1Q18A 4BVOA 4BRNA 3WQUA 4IWVA 3H1QA 2E20A 5ADXH 3MN6A 1ATNA 5JLFA 3TPQA 2V51B 2Q1NA 3CIPA 4BRIA 3GE1A 2P9LB 3HSCA 2NRHA 2WUSA 4QS7A 4H5RA 5AQMA 2J4RA 2W40A 1NMDA 5AQJA 2OANA 4K43A 2Q97A 2VCPA 4JD2A 1NGAA 2FLOA 5LJWA 3GL1A 4WQ4C 4I6MA 4FOEA 1TUUA 3H6EA 5BPMA 1KAZA 1LCUA 3DJCA 1X9JA 5JLHA 3HZ6A 2Q0UA 3CETA 5KQ8A 5FPNA 1YXQA 3D2EB 4MO5A 5FPEA 1IJJA 3HTVA 2P9NB 4CI6A 1QHAA 3VGMA 3U9DA 1HKCA 5AQOA 2A42A 3ZX2A 4CBWA 3CERA 3VGLA 4FWSA 2QWNA 3SMPA 3VETA 5AQIA 1MDUB 5AZJA 5AQPA 5EVZA 4BC4A 4EIAA 2FSKA 2KHOA 1GLLO 3JS6A 3RSEB 2FXUA 2E2NA 2YHYA 3SK3A 4BRPA 3CJCA 4PL7A 3CJAA 2Q0RA 1U2VA 5AQFA 3FZMA 4NO7A 3O8MA 4H03B 1T6DA 2A41A 5BRHA 2I7NA 3VENA 3ULEA 1G99A 3H45C 3QICA 3U4LA 4DHYA 4FWMA 2YHXA 4WQ5C 3U8XA 4FWRA 4FL9A 3A5OC 2ASOA 2QM1A 5BN8A 2IVPA 5AQNA 3ID8A 3LDLA 3MCPA 3QBXA 1XC3A 3LM2A 4B1ZA 4EAHD 4H5VA 4H0YB 4BR7A 1NBWA 3QBWA 2YJFA 4K25A 3DXMB 4EFHA 3I33A 2GELA 3H3NO 1GLDG 2P9LA 4HTLA 2F9WA 3FGUA 4PL8A 2CGJA 4PKHA 5LJVA 4K41A 3LDPA 1Z6RA 1HPMA 4AM6A 3BF1A 1MWKA 3HI0A 2D1KA 3M1FA 1HX1A 4BRMA 5AQLA 1HKBA 1X3NA 5EX5A 4J8FA 3IUCA 2P9UB 2ITMA 3O6WA 3WXJA 4BR2A 4CD1A 3QB0A 4HWIA 3VPZA 3WUHA 5CE3A 4CZGA 2P9PB 2P9KB 3MMVA 2QW9A 4H0PA 1HJOA 4JHDB 3ENHA 1NGCA 1ZBSA 3M3ZA 4H0TB 4BRKA 4B1VA 1NWKA 4BR5A 4XH1A 2GTDA 5F1XA 1J6ZA 3LDQA 4L3QA 2D0PA 2A5XA 4BRLA 3VF6A 1ATRA 1DGKN 4B1XB 1BUPA 2D0OA 1RGIA 3KVGA 4F9OA 3HBTA 3ATVA 5AQKA 2EWSA 3EZWA 3O1WA 2GEMA 4BRGA 4O8KA 1D4XA 5AQVA 3IDHA 5ADXA 5KPRA 1DEJA 5E26A 3ZETA 1GLCG 1S3XA 2V7ZA 3A8YA 4RTFD 3ZEUA 1C0FA 4IXCA 4CJ7A 4CZJA 4DB3A 1YVNA 3QFUA 3BUZB 4BR4A 4E1JA 5JICA 2NLXA 4CZEA 3WXLA 1NGIA 3DXMA 4BRHA 2QWOA 5BN9A 2VWBA 4H5WA 2FF6A 3DWLA 2Q2RA 1LOTB 1RDWX 3SLCA 2ZGZA 1ZXOA 3FR0A 2FF3B 4XEIA 1NGDA 5AFUH 4B1YB 5KPTA 1NGBA 3VEWA 3JXUA 4QS9A 3GBTA 1T6CA 3O1BA 2CH5A 3UB5A 3UKRB 3WT0A 4B1WB 3L6QA 4CBUA 4WYBA 3FZLA 1SAZA 4M7XA 2ASMA 2UYTA 2P9UA 4YDUA 1GLEG 1T44A 4BVPA 3EKSA 2E2OA 2P9IB 3U9ZA 2DPNA 4H0VB 1MA9B 3F9MA 5BREA 5FPMA 4JHDA 3D2FA 4BREA 3DXKA 1ATSA 1R59O 2A40A 3EKUA 2YJEA 1BG3A 1E4GT 2IVNA 3C7NB 1IG8A 4H0OA 4KBOA 5AQSA 1BA1A 3FLCO 1NGHA 1TYQA 5BR9A 3A5LC 1BWFO 4CD3A 3UKUA 2P9SA 1HUXA 2YI1A 3P4IA 4BGAA 2QWRA 1BDGA 1GLAG 3CQXA 4MLHA 1X3MA 3GG4A 1HKGA 2CGKA 5BRFA 4YDUC 4M63C 2HMPA 4ISGA 2Q31A 3VF2A 5KQDA 3A5NC 4FWLA 4FWOA 2W41A 3ZX0A 3AAQA 4K42A 2H3GX 3BEXA 1BU6O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LPUA 3CQYA 1DKGD 3OYKA 2LSNA 1KCFA 4C8NA 4JS5A 3SQ0A 3WEEB 2Q36A 5GADP 3TTFA 2E2PA 3L3VA 4A2AA 2KZZA 5LY3A 2A6AA 4L8RB 2D5RA 4KHUA 3R6MA 1V4TA 1K6YA 3DYAA 4BQZA 4FLUA 2QEXN 4I6MB 4EHUA 3VEZA 4CFCA 4DV4K 1S1XA 4DTNA 3KK2A 1I3AA 2CH6A 4O5BA 1QVGM 1Q86O 4LFAK 4XIUA 5E41A 4DTUA 4LF7K 2P9IA 3QEWA 1UAXA 3SUQA 4Z4IA 3P83D 1VQMN 1C0GA 3EYZA 1H1VA 4C23A 3UE5A 2E2QA 5CY4A 3SJJA 3C7NA 4LFCK 4Y1DA 3AARA 3EO3A 3HPHA 4CGDA 3RR8A 1S5JA 2QKKA 3NVKA 1U2VB 2DFEA 4FPBA 4DWIA 3DAWA 1B9DA 3OYFA 4B3RK 4GY2B 4IJNA 3U3GA 1UOCA 4WQ4A 4CF2A 1ASUA 1V4SA 4OLAA 4EP5A 3B8AX 4N5SA 1RBUA 2QWLA 4CHZA 3CCLN 3VEYA 1SKWA 3TSUA 4BY9C 1NGFA 3SYZA 5I9EB 3VERA 1NM1A 2HBLA 1BA0A 4ICLA 3SUNA 5EY4A 4FJGA 2ZF5O 1KAXA 3DRRA 1RTDA 1W2BM 4GV6A 2ZD1A 5J2QA 1A5VA 1IH7A 3IFRA 1GOAA 4CEAA 5AQUA 3WNHA 1IKWA 5AQWA 3OVNA 2F7TA 2PBDA 3ZSXA 3SAHA 4R5PA 1N32K 3AA4A 2OTLN 4CGGA 3OYGA 3MN9A 3S41A 4ID5A 3FZHA 1S1WA 1XWLA 4ID1A 3TAQA 3ULDA 4RG8A 3MX2A 4M7YA 3OYDA 5AQQA 3DRSA 2WTUA 1HNZK 1OH7A 1EX4A 1RFQA 4IOAL 1VSFA 3O3FA 1HLUA 1D9FA 3O3GA 2O4IA 4XH5A 4Z4FA 4BACA 4JN4A 4F2SA 4CJ3A 3TSQA 2E6LA 3RMCA 5AZIB 4W5RA 3TI0A 4R79A 2XY8A 1YIJN 4I9QA 1HRHA 4CBXA 5J1EA 2QWQA 3ZEUB 1ESVA 4HUFA 5EXWA 1P90A 4FJHA 3IKMA 3VQ7A 3NFAA 1RBTA 3O5BA 2NRTA 4JD2B 1VRUA 4BWJA 4MO4A 4BRAA 2X78A 3O9RA 2X74A 3R1XA 3G25A 3KJVA 1NGJA 3VTIA 4B9QA 3QEVA 3L2VA 4O8UA 2FBTA 1KSPA 4FPAA 5KRSA 3QDKA 3J8AA 1EQYA 1JLBA 1KXPA 4IZ9A 1QHTA 5C24A 1KAYA 3RRGA 1JCGA 1C1AA 4E7KA 1S22A 4G1QA 3FFIA 2O8DA 4LFBK 4CERA 3AA5X 4AH9A 3ULEB 1KLMA 2HHTA 1WUAA 3OYAA 5AQXA 2P9SB 4FZYA 1QQNA 1HQEA 4AHVA 4DR4K 2O8EA 5CR4A 3BDPA 3KD1E 4CGHA 4MLEA 1UA0A 4CZFA 4IOXA 3VQ9A 1VQLN 3TAEA 2DFFA 3WQUA 3NMUA 3BY5A 1NK7A 5JLFA 3OJSA 1JKHA 5M1PA 3HSCA 2J4RA 3AVBA 4JI7K 3THXB 2FBXA 3NF7A 4CJSA 3N4PA 2FLOA 4WQ4C 4I6MA 3TAMA 5BPMA 1LCUA 3OTOK 1TK5A 3CM6A 3HZ6A 1TAQA 2QXFA 3CMAN 3KTQA 1YXQA 4MO5A 4OO1J 1IJJA 3HTVA 2P9NB 3O3HA 1B92A 1HKCA 3ZX2A 2A42A 3K5LA 4GVMA 3VETA 1R0AA 3C6AA 4HCBA 3F2KA 5AQPA 2FBYA 4BC4A 2FSKA 4CESA 1MU2A 2BDPA 2YHYA 5DM6L 4FVMA 3CJCA 1U2VA 4JI6K 4DU1A 2O8BB 3AO5A 3KKSA 1Q9YA 5JVHL 2A41A 4CJPA 5BRHA 4UY8O 1JLGA 2YHXA 3O4QA 4BDYA 3DLHA 4FL9A 2ASOA 1NK9A 3IRXA 1VQ4N 1KFDA 2IVPA 3HP9A 2VG7A 4DQQA 3MCPA 4IFEA 5KGWA 4DLEA 3L2RA 4Z4GA 1ASVA 3LM2A 4K8ZA 4H5VA 3B6OA 4KRFA 5JS1A 4C8MA 4CECA 1JLQA 4K25A 4DV1K 3DXMB 4EFHA 4KH6A 4QAGA 3FGUA 4PL8A 3ZSZA 1RBVA 3K9KA 1NK0A 1JLEA 3PIOL 3D0PA 3OA9A 1Z6RA 3CCUN 4KTQA 3M8PA 4B3SK 1VK0A 1U45A 3BF1A 4CIFA 1T7PA 1VQKN 3M1FA 4DQSA 1DTQA 1NNEA 4J8FA 3IUCA 4BR2A 2ITMA 4CD1A 3QB0A 3EY1A 1N36K 4CF0A 3J7ZO 3WUHA 4FM2A 4CIGA 2P9PB 2QW9A 3IG1A 4JHDB 3PX6A 1NGCA 4BRKA 1NWKA 3HJFA 3I56N 4BR5A 3VQCA 1VSLA 2GTDA 4NYFA 4FJ9A 2NRVA 2P51A 3HPGA 2D0BA 4BRLA 5GAEP 5CZ1A 1DGKN 3VQDA 1A5WA 3HBTA 2G8IA 4X66K 3O1WA 4C8OA 4O8KA 4CHPA 1KTQA 3U3YA 3ZSOA 4CF9A 4DR5K 3LP0A 1ITGA 1ZBIA 1DEJA 5E26A 3ZEUA 1JLFA 3L2WA 1IKXA 5DM7L 3E9PA 1REVA 5M1NA 4DB3A 4JYAK 4MQ3A 3QFUA 1XMOK 3QIPA 2KQ2A 1VQ5N 4UQGA 4HUEA 4DFKA 5BN9A 1XC9A 2FF6A 1BL3A 3SAFA 4EZ6A 3FR0A 4B1YB 5AFUH 4XEIA 4B9VA 4JRQA 2RE2A 3GBTA 4YOWA 4B9TA 2HBKA 5H1SQ 2IAJA 2CH5A 3RMBA 3UKRB 3L6QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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