3OJPA

D52n mutant of hen egg white lysozyme (hewl)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTNYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title D52N Mutant of Hen Egg White Lysozyme (HEWL)
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ojpA00
5FHWA 4MR1A 1TCYA 3WVYA 1LMPA 3HFMY 4BAFA 1LSFA 4H91A 4KL7A 5HMVA 3QNGA 4ANRA 4OWAA 5C6JA 1WTMA 2W1MA 1LZ4A 5C6LA 5D5FA 4H8XA 1CKDA 2W1LA 2F4GA 4P2EA 4HTNA 2YBMA 1OUJA 1QTKA 4NHSA 4UWNA 4M6DA 3P64A 5APFA 1IORA 1AZFA 1NHEA 1CKCA 2DQIY 1QSAA 4NSGA 2Z18A 1LZ8A 4H93A 4U3XB 1BGIA 3TXEA 1D9UA 1IY3A 5E4PA 1LJFA 1B7LA 1D0MA 4GLAA 3GXRA 1VEDA 5F14A 1HEPA 1Z55A 4YF2A 3F6ZA 1J1OY 1LZTA 1AT5A 1HF4A 4NGZA 4LGKA 5APDA 4YEMA 4H8YA 4NGYA 1LMAA 4H9BA 1E8LA 4NGIA 3TXBA 3TXJA 3WPLA 2CDSA 5D5CA 2BLXA 1IX0A 1DPWA 1IY4A 1F6SA 4WL6A 5LA5A 1GFUA 4ETCA 1IWVA 2N5ZA 3E3DA 5KXNA 4J0LA 1AT6A 5I5QA 1OQMA 1GB7A 4LT0A 1B5UA 2EPEA 5KXSA 2BQAA 1G7HC 4NWEA 4D9ZA 1JEFA 1TEWA 3LN2A 2MEFA 1ZMYL 2WARA 2CGIA 1EQ4A 3EXDA 1JISA 5B06A 1D6PA 1OUEA 2YBHA 1GF0A 1LZSA 1LYSA 1GWDA 4IASA 4B4EA 5IHGA 2DQDY 4B4JA 2DQFC 4J1BA 4TTDA 5LA8A 4A7DA 2BQJA 5KXPA 4G4CA 1B5ZA 4II8A 4EMNA 4GCEA 4XYYA 4GN4A 4TUNA 3T36A 3ZEKA 4XJDA 4N1CC 1LSPA 4WLYA 5LVHA 2W1XA 4DWXA 3IJUA 208LA 134LA 4W96A 1GBOA 2BAAA 3ZVQB 4BAPA 3ATOA 2D4JA 2IHLA 2LHMA 4TSBA 1GPQC 1LJJA 3WU9A 2F4AA 1HENA 2XTHA 1YQVY 1GBZA 3W6FA 1LZCA 2CJLA 2YSSC 153LA 4PGJB 3TMXA 2CWIA 1IP2A 2YBNA 3WVXA 1HMKA 3ATNA 4HV2A 2BQHA 1MELL 1HEOA 1JJ0A 1GF6A 2EIZC 4GN5C 1B0DA 1GFEA 1DZBX 1HERA 6LYTA 1IR7A 1LSZA 2HEBA 2ZQ4A 1VDQA 1YIKA 5AMYA 3W6DA 4B1AA 5B1GA 1GE1A 1NBZC 3A8ZA 3A6CY 1DI3A 4XJBA 1LKRA 4WOAA 4XJGA 2ZWBA 4DD9A 2C8OA 1LMTA 1QTEA 1OUAA 1NDGC 1B7SA 1IWZA 4DDCA 3A3QA 5ILCA 2NWDX 2X0AA 4LT2A 4ML7A 3CSQA 2LYMA 3WU8A 1JSEA 4LFPA 3AGIA 1IIZA 4NIJA 1UIEA 3GXKA 4H9HA 2LYZA 1LMQA 1JKAA 4I8SA 1OUGA 1NDMC 1XEIA 1GFJA 1YAMA 1UC0A 1D0LA 2Y8PA 4WM1A 3EO5A 4E3UA 4G9SA 5IDDA 3TMWA 1F6RA 1GFVA 1BB3A 1YAPA 2ZYCA 1LKSA 4HJZA 1TDYA 5I53A 1LMOA 1DQJC 1HELA 2HECA 4ETAA 2ZYPA 1W6ZA 2DQEY 4R0FA 1A4VA 1GFRA 1NWGA 1JIYA 2LZTA 1VDSA 4N8ZA 1LZ6A 5FSTA 5LYZA 1NMMA 3AZ4A 4Z41A 4CFPA 132LA 1GBWA 4OWEA 1OUHA 3CSRA 1HHLA 2HU3A 4NGKA 1GFTA 4LYZA 1IP4A 1UCOA 4WL7A 1LSYA 1FLWA 2Z39A 1YAOA 4ZEEA 4XJFA 4Z98A 1IWWA 2BQKA 3M3UA 5I4YA 1LAAA 4NG1A 4Z46A 2HUBA 1JTTL 1I1ZA 3LZTA 1C08C 3AYQA 1GEZA 4M4OA 3WUNA 1WTNA 5M1YA 5II3A 1GXV2 1LJEA 5I54A 3LYMA 5KXRA 5HNCA 2EQLA 4NSJA 3RT5X 2F2NA 3WW6A 1RE2A 4FDYA 1HEQA 1C45A 1B5XA 3BKVA 1AM7A 1LZ1A 4LYMA 1KXWA 4WLDA 3A95A 4GCBA 1QUSA 2DQCY 2LZ2A 2BQEA 3MGWA 5DM9A 1W08A 5KKJA 1I56A 3CT1A 1SQ2L 5B05A 3B0OA 1D6QA 1IC5Y 1C7PA 1B7MA 2A7DA 1B9OA 1JTPL 1DKKA 5KXTA 2DQHY 5L3IA 4H1PA 4NFVA 1IWYA 5EBHA 4NHIA 1GFGA 2BQDA 4NGJA 1LMCA 5KXKA 4NGWA 1YAQA 3B0KA 3M18B 2FBDA 4UWVA 3HBHA 5FEKA 5J7CA 1B2KA 1TAYA 1GE4A 1HFZA 4Z3MA 3QY4A 1FDLY 3TMUA 5KXMA 3AB6A 1RCMA 1HNLA 3G3BB 4DDBA 3FI7A 5B59A 5F16A 2DQAA 4R6CA 2HU1A 4HPEA 3G3AB 4NEBA 3W6CA 2D91A 2MEDA 1B7QA 5LVJA 4XJIA 1GB3A 4BS7A 4NGOA 1BWJA 1KIQC 1REYA 2ZNXY 1FLYA 1UIDA 1VATA 3EBAB 1LYZA 3IJVA 1UIHA 4RW1A 4XJHA 4YOPA 1CJ7A 2DQJY 1IP7A 1JUGA 1GF3A 2H9JA 4AGAA 4RW2A 2C8PA 3A92A 2HEEA 2DBTA 2Z2EA 3BKHA 4CJ2A 1LSMA 2G4PA 2H9KA 3P66A 4H9AA 2D4KA 4WM3A 3LHMA 3N9CA 3AW6A 3A91A 3W3EA 1IWTA 1GB6A 2B5ZA 1JPOA 1GEVA 1EQEA 2VB1A 193LA 2MEGA 4LYOA 2MEIA 5FDJA 4G4BA 4WO6A 3LYTA 1WVUA 1H87A 4QY9A 4XENA 1H6MA 1LJ3A 2ZNWY 1DXJA 1G7LC 1UUZC 1YKXX 3CT5A 3T6UA 1AKIA 1C10A 1HC0A 1NQIA 3N9EA 3HBDA 1LSBA 1GF4A 3WW5A 5APCA 3RU5A 4YENA 1ZVHL 5L9JA 5LINA 1LHMA 1XGTC 1BQLY 1LJ4A 1WVVA 3FE0A 1XSFA 4LYBA 4GCCA 4G4HA 1NF5A 2YDGA 1LHJA 3VWOA 1XGUC 4NWHA 4PHIA 5F9XA 4DYGA 3B72A 1FLUA 1RI8B 3A93A 2MECA 1IO5A 1XGRC 1GB5A 1NBYC 4NHTA 3WPKA 3N9AA 3W6AA 1CKGA 5A3ZA 3A96A 5KXZA 1J1XY 4OWCA 1IOSA 4B0DA 9LYZA 2W1YA 1UACY 4HTKA 3KAMA 1EL1A 4H90A 1OP9B 1ZVYB 4EOFA 4HTQA 4ET8A 1BB7A 1CKFA 1IOTA 2MEHA 1GHLA 1HFYA 1A2YC 1T3PA 5LXWA 4HV1A 3RNXA 4HSFA 1KIPC 2G4QA 3EMSA 4PPOA 1GFAA 4TSCA 1JKCA 2FYCA 3TXGA 4MSTA 1KIRC 1HEWA 1REMA 4HJYA 4PRQA 1GFKA 4OWHA 5HMJA 4WM4A 2Z12A 4LYCA 4LT1A 1V7SA 2LYOA 5LIOA 1JWRA 5KKIA 4H94A 135LA 3AGGG 5LVIA 1QSWA 4B49A 4DD7A 5FELA 1G7JC 1LCNA 1GF8A 4NHPA 1IC4Y 3RW8A 3WPJA 4ETEA 1LTMA 1V7TA 1GBSA 1OUIA 3P4ZA 2I6ZA 5LVKA 4I0CA 1DPXA 3TXDA 5HQ1A 4X3BA 3P68A 1CJ8A 4NSIA 3D9AC 3J6KA 1SLYA 1GB9A 1LZAA 2BPUA 1GAZA 1HMLA 4C3WA 4KPMA 3AJNA 3WH1A 1JTOL 2BLYA 4OW1A 1IOCA 5FCPA 1BB6A 2D6BA 2HTXA 3A6BY 4HJVA 1CJ9A 4AXTA 5KXLA 5LYMA 1KXYA 2FBBA 1CNSA 1G7MC 1XGPC 1YILA 2HEDA 4WG7A 3WUMA 1IVMA 4H9IA 1GE3A 1UBZA 4DD1A 3AZ5A 4HPIA 4NY5A 5I4XA 2ZILA 5F81A 5LAFA 2F30A 4FJRA 4IJ4A 4WM2A 4WG1A 3W6BA 1LJKA 4OWBA 1DKJA 4YEOA 2XBSA 4ZFPA 1QUTA 2FYDA 1YL0X 2BQGA 4PRUA 5DN4A 3TXKA 3WULA 4H9EA 3SP3A 4H9FA 4TWSA 2EKSC 3AGHA 1GDXA 1LZEA 4QEQA 4TX7A 1GAYA 4KXIA 4W94A 4CGEA 1DI4A 1FLQA 1GFHA 1HSWA 4GLVA 3W6EA 1GE2A 2H5ZA 1JITA 1D0KA 1HEMA 4O34A 5DLAA 1UIGA 3TMVA 1FKVA 4YM8A 1LZ9A 4ZIXA 4QGZA 1JHLA 1C43A 5K7OA 1XGQC 5I4WA 4B4IA 4RLNA 2PC2A 5E9RA 3WXUA 3WXTA 5B1FA 3TXHA 1QQYA 4DT3A 1B5VA 4HP0A 4WO9A 2I25L 1BB5A 2Q0MX 5LYTA 2YBIA 1B5YA 3WU7A 1OUDA 4WMGA 4GCFA 5F9UA 5KXOA 5HNLA 5KXXA 3D3DA 4C5FA 2DQGY 4GCDA 1BVKC 4ETDA 3A67Y 5LVGA 1FBIX 1LZ5A 5L3HA 1ZV5L 4UWUA 4IATA 2BQLA 2MEEA 1XEKA 4PJ2C 4DD2A 1LSAA 1XFPL 4N1EI 1GB0A 3TXIA 5JENB 1LJIA 5APEA 1WQNA 1LHLA 1LYOA 3A94A 1G7IC 1B7NA 1JKDA 1LZNA 1JSFA 1GBXA 2YVBA 4H8ZA 4N9RA 3WYHA 1GXXA 194LA 1LHKA 2YBLA 4DD0A 1MLCE 1UIFA 1GD6A 3OK0A 4LFXA 1P2CC 1I20A 1QIOA 2BQIA 1F10A 1IOQA 1LHHA 2BQBA 2ZIJA 3B0IA 2GV0A 2I26L 5KY1A 1O23A 2BQCA 3IWRA 4G49A 3WUAA 4DC4A 3RZ4A 5LAGA 2MEBA 3AZ7A 3CB7A 4QDNA 1LHIA 1VFBC 1GB8A 3WMKA 3A90A 4H9CA 1LJHA 4L41A 1C46A 4KT3A 5A3EA 7LYZA 1OUFA 1IP5A 1B7RA 1IWXA 2Z37A 1IP1A 1BWIA 1LJGA 1WQOA 2MEAA 4NGLA 1NKHA 4LYTA 4LZTA 1UIAA 1DI5A 4RDSA 1GBYA 1LZBA 2RSCA 4ET9A 1IC7Y 1IP3A 4N0JA 5KJ9A 5IELA 2DKVA 1CJ6A 2AUBA 1IP6A 1J1PY 1UA6Y 1ALCA 1WQQA 4OOTA 1GF5A 2ZIKA 5B07A 1LSCA 1WQMA 2BQOA 2BQMA 3LYOA 4NHQA 1GDWA 4ETBA 1F0WA 5KXYA 1LSGA 1LYYA 2HEFA 5HLLA 1GF9A 1TBYA 3CSZA 1BB4A 4CHXA 1YANA 4BADA 154LA 1REZA 1B7OA 1INUA 4NG8A 1XEJA 1YROA 1LZGA 3A34A 3LYZA 5DN5A 4WM5A 1HFXA 4DD3A 1LJNA 1YKZX 1BHZA 1KXXA 1JJ1A 1LSDA 2XJWA 1WQPA 3K3TA 2YBJA 2Z2FA 2BQFA 2XBRA 3QE8A 1UICA 3B6LA 3HBEX 5T3FA 2BQNA 3TXFA 4NGVA 1EQ5A 1LMNA 4MCKA 1GF7A 1LZRA 4DDAA 1BVXA 3P65A 1B7PA 1JJ3A 2Z38A 3J4GA 4WLXA 1HSXA 3AW7A 4RLMA 1LSEA 3WL2A 1N4FA 2IFFY 2Z19A 1LPIA 1LSNA 207LA 2A7FA 4NSHA 4GN3A 1RJCB 1QDRA 4XN6A 5ILFA 1B5WA 4N5RA 133LA 6LYZA 8LYZA 2ZQ3A 1LZYA 4J1AA 3CQLA 3ULRA 1IEEA 1UIBA 4LT3A 1GB2A 3CT0A 1YKYX 3ZVQA 5C6IA 1VDPA 1T6VL 1YL1X 1VAUA 3OJPA 3LZ2A 1RFPA 3A3RX 1OUBA 1LOZA 1PZYA 5DL9A 3AZ6A 5KXWA 4OOOA 1BWHA 1REXA 1WQRA 2D4IA 2G4NA 2HEAA 4XADA 1IR9A 1FN5A 1GE0A 1PS5A 1IWUA 4H92A 1LZDA 4WLTA 1CKHA 4J7VA 1IR8A 1JKBA 1VDTA 4WM6A 1OUCA 1FKQA 1QDTA 4CFOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MR1A 1TCYA 226LA 256LA 1LSFA 1DYCA 4H91A 1LZ4A 5C6LA 176LA 4HTNA 2YBMA 1OUJA 4UWNA 1DYFA 2Z18A 1QTCA 3DKEX 4U3XB 1CV5A 3TXEA 1IY3A 1OV7A 3GXRA 3HUKA 2B6XA 1PQMA 4YEMA 4H8YA 4H9BA 3TXBA 3WPLA 2CDSA 2BLXA 1F6SA 1LWKA 1P2LA 1L10A 1L97A 1CV6A 200LA 5KXNA 1D3FA 2BQAA 1G7HC 2ANXA 4NWEA 181LA 4D9ZA 1TEWA 2MEFA 2CGIA 5B06A 2YBHA 1GWDA 4J1BA 5LA8A 4G4CA 1SWYA 4XYYA 3T36A 1G0GA 1L09A 3L64A 3IJUA 208LA 134LA 1GPQC 198LA 109LA 1LZCA 1IP2A 1HMKA 3ATNA 2BQHA 3FADA 250LA 1JJ0A 4GN5C 248LA 1B0DA 1GFEA 1DZBX 3CDQA 126LA 6LYTA 2ZQ4A 1L44A 1YIKA 3DN3A 5AMYA 1L95A 1C6KA 2C8OA 178LA 1IWZA 2NWDX 2X0AA 4LT2A 4LFPA 2LYZA 1LMQA 4I8SA 1OUGA 1NDMC 1XEIA 1CU6A 3C8SA 1QTZA 1QUHA 1UC0A 3SBBC 1D0LA 3C8RA 3TMWA 1DYDA 4I7KA 2ZYCA 1LKSA 3C83A 1TDYA 1CV1A 1D9WA 1L11A 1LYIA 2DQEY 1L91A 1NWGA 1VDSA 5FSTA 2XQOA 1T8GA 3GUMA 4OWEA 1OUHA 4LYZA 1IP4A 1FLWA 4Z98A 1LAAA 1I1ZA 3AYQA 162LA 1WTNA 3SB7A 5M1YA 2F2NA 2LZMA 1B5XA 3HTBA 4GCBA 1QUSA 5DM9A 3MGWA 2BQEA 1I56A 113LA 3B0OA 1IC5Y 1C7PA 2B74A 5KXTA 2DQHY 5L3IA 152LA 142LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FHW A;  4MR1 A;  1TCY A;  3WVY A;  1LMP A;  3HFM Y;  4BAF A;  1LSF A;  4H91 A;  4KL7 A;  5HMV A;  3QNG A;  4ANR A;  4OWA A;  5C6J A;  1WTM A;  2W1M A;  1LZ4 A;  5C6L A;  5D5F A;  4H8X A;  1CKD A;  2W1L A;  2F4G A;  4P2E A;  4HTN A;  2YBM A;  1OUJ A;  1QTK A;  4NHS A;  4UWN A;  4M6D A;  3P64 A;  5APF A;  1IOR A;  1AZF A;  1NHE A;  1CKC A;  2DQI Y;  1QSA A;  4NSG A;  2Z18 A;  1LZ8 A;  4H93 A;  4U3X B;  1BGI A;  3TXE A;  1D9U A;  1IY3 A;  5E4P A;  1LJF A;  1B7L A;  1D0M A;  4GLA A;  3GXR A;  1VED A;  5F14 A;  1HEP A;  1Z55 A;  4YF2 A;  3F6Z A;  1J1O Y;  1LZT A;  1AT5 A;  1HF4 A;  4NGZ A;  4LGK A;  5APD A;  4YEM A;  4H8Y A;  4NGY A;  1LMA A;  4H9B A;  1E8L A;  4NGI A;  3TXB A;  3TXJ A;  3WPL A;  2CDS A;  5D5C A;  2BLX A;  1IX0 A;  1DPW A;  1IY4 A;  1F6S A;  4WL6 A;  5LA5 A;  1GFU A;  4ETC A;  1IWV A;  2N5Z A;  3E3D A;  5KXN A;  4J0L A;  1AT6 A;  5I5Q A;  1OQM A;  1GB7 A;  4LT0 A;  1B5U A;  2EPE A;  5KXS A;  2BQA A;  1G7H C;  4NWE A;  4D9Z A;  1JEF A;  1TEW A;  3LN2 A;  2MEF A;  1ZMY L;  2WAR A; 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 2HED A;  4WG7 A;  3WUM A;  1IVM A;  4H9I A;  1GE3 A;  1UBZ A;  4DD1 A;  3AZ5 A;  4HPI A;  4NY5 A;  5I4X A;  2ZIL A;  5F81 A;  5LAF A;  2F30 A;  4FJR A;  4IJ4 A;  4WM2 A;  4WG1 A;  3W6B A;  1LJK A;  4OWB A;  1DKJ A;  4YEO A;  2XBS A;  4ZFP A;  1QUT A;  2FYD A;  1YL0 X;  2BQG A;  4PRU A;  5DN4 A;  3TXK A;  3WUL A;  4H9E A;  3SP3 A;  4H9F A;  4TWS A;  2EKS C;  3AGH A;  1GDX A;  1LZE A;  4QEQ A;  4TX7 A;  1GAY A;  4KXI A;  4W94 A;  4CGE A;  1DI4 A;  1FLQ A;  1GFH A;  1HSW A;  4GLV A;  3W6E A;  1GE2 A;  2H5Z A;  1JIT A;  1D0K A;  1HEM A;  4O34 A;  5DLA A;  1UIG A;  3TMV A;  1FKV A;  4YM8 A;  1LZ9 A;  4ZIX A;  4QGZ A;  1JHL A;  1C43 A;  5K7O A;  1XGQ C;  5I4W A;  4B4I A;  4RLN A;  2PC2 A;  5E9R A;  3WXU A;  3WXT A;  5B1F A;  3TXH A;  1QQY A;  4DT3 A;  1B5V A;  4HP0 A;  4WO9 A;  2I25 L;  1BB5 A;  2Q0M X;  5LYT A;  2YBI A;  1B5Y A;  3WU7 A;  1OUD A;  4WMG A;  4GCF A;  5F9U A;  5KXO A;  5HNL A;  5KXX A;  3D3D A;  4C5F A;  2DQG Y;  4GCD A;  1BVK C;  4ETD A;  3A67 Y;  5LVG A;  1FBI X;  1LZ5 A;  5L3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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