3ONIA

Crystal structure of the second bromodomain of human brd2 in complex with the inhibitor jq1
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
LSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Selective inhibition of BET bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain containing 2, isoform CRA_a
total genus 43
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3oniA00
5F61A 5FH6A 5D3NA 4UIZA 4YYHA 3HMFA 4A9MA 5AD2A 5EWDA 5EV9A 4NQMA 4NR6A 4QR3A 5K29A 3UW9A 4YBTA 4QEUA 5FFVA 3UVXA 5HRVA 3I3JA 4O7AA 4HXKA 5AD3A 2R10A 5HJCA 4QUUA 5EI4A 4YADA 3O34A 5JI8A 4HXPA 3JVKA 1X0JA 4UIYA 4PTBA 4NYWA 5ENCA 5C89A 5CQ8A 4A9IA 4YYNA 5FFWA 5ENBA 2I8NA 4WHWA 5AMFA 5LKTA 5I40A 5C87A 3UVDA 4TU4A 4O70A 4ZQLA 3U5OA 2DATA 4BW2A 3P1FA 3O37A 4YH4A 2OUOA 4LYWA 4TT6A 4MR5A 4QSVA 5E3DA 3SVFA 1ZS5A 4NYXA 4TQNA 3UV5A 4A9NA 3QZSA 5D3LA 4QC3A 4UYFA 4QZSA 4TT2A 4MR6A 4NUEA 4YK0A 4O7FA 5A5QA 1JM4B 4QSTA 4A9EA 5IG6A 4NR5A 4NUDA 4TYLA 4PS5A 5EP7A 4YH3A 4Z6HA 5EWVA 4LRGA 5FG5A 4X2IA 4UITA 4ZW1A 4LYSA 4HXSA 4NR7A 3SVGA 5A5SA 4CL9A 4UYEA 3MQMA 5A5OA 5A5RA 5LUUA 4HXRA 3GG3A 5HEMA 5L8TA 4UIWA 5CS8A 5I80A 5HQ6A 4YAXA 5IGMA 2YQDA 5BT5A 5I7YA 4Z1SA 2RNXA 5CZGA 4NUCA 4QC1A 4C66A 4YBMA 5LVRA 5KHMA 4QR4A 4NR9A 4TU6A 4BJXA 2WP1A 5KO4A 1F68A 4KV1A 5EISA 2YEKA 4CUSA 5I1QA 5AMEA 4NS5A 4LC2A 4TTEA 5CQ5A 4A9KA 4O7CA 5I86A 5FH7A 4ZC9A 5E3GA 4IORA 5FE2A 2DKWA 4UIUA 5DYAA 4Z93A 2RFJA 4O71A 5A82A 5ETBA 5BT4A 3FKMX 5D26A 4BW1A 2R0VA 5EPBA 2RO1A 4AKNA 5FE0A 5DYXA 5H1UA 5DYUA 5I88A 4HXLA 5FE7A 5FE1A 4QEVA 4O78A 5IBNA 4QY4A 5FB1A 5DKDA 5C4QA 5E0RA 4FLPA 4QSQA 5EPSA 5CRMA 2I7KA 4MR3A 4O75A 5A81A 5F1LA 3G0JA 4HBXA 3S92A 3DAIA 5HRXA 5HFQA 5G4SA 4CUQA 5CUGA 3G0LA 5E9LA 5IGNA 5EVAA 4KV4A 5ENFA 3MB4A 5EA1A 5J0DA 3ONIA 5I89A 2DVRA 4YYIA 4PCIA 4TZ8A 4MEOA 5ACYA 2RNWA 3AQAA 4HXOA 4OUFA 4O72A 5E9MA 5FE5A 4Q0OA 4XUBA 4LR6A 5CGPA 5G4RA 4A9JA 5L99A 2D9EA 5FB0A 4NR8A 5CU8A 5D3TA 4A9FA 4N4HA 4XUAA 5KTWA 4MEPA 3LQHA 4UYGA 3UV4A 1E6IA 4MR4A 1JSPB 4DONA 4GPJA 4NRAA 5L8UA 5JWMA 4XYAA 4KCXA 4HBYA 4WHUA 5IGKA 4OGIA 3LJWA 4RVRA 5E9KA 5DW2A 5FE6A 5H1VA 4HXMA 4MEQA 2NXBA 3UV2A 5CUAA 4HXNA 3U5MA 5D3RA 4YABA 5C8GA 2GRCA 3JVJA 2E7NA 4XY8A 4LYIA 4WIVA 4QYLA 4MENA 5DKCA 5LJ0A 4F3IA 5CQ4A 2RI7A 5D0CA 5A5NA 4LZ2A 4UYFB 2YDWA 5F1HA 2L85A 2DVQA 4O7EA 5L98A 5FFYA 5F5ZA 4PKLA 5F3AA 5II2A 3SVHA 4UIVA 3U5JA 5IIDA 4QBMA 3QZVA 5D24A 5FBXA 5A83A 3Q2FA 4NRBA 4YY4A 4IR3A 4YYGA 2KTBB 5DLXA 5F36A 5CUDA 5CPEA 4CUTA 5CY9A 3MULA 3P1CA 4PCEA 4CLBA 2R0SA 3NXBA 5D3PA 3S91A 4QEWA 4YBSA 4UYHA 5A5PA 3P5OA 4QSSA 5COIA 5LVQA 5EU1A 5E9YA 5L97A 2F6NA 4UYDA 5LKZA 2E3KA 4OGJA 4Z6IA 4CFLA 5LJ1A 5LKXA 5CQTA 5DKHA 5E74A 4UIXA 5HCLA 3O33A 4IR4A 5HQ7A 4CURA 3HMEA 5FG4A 3IU5A 5CUCA 4A9HA 5FE9A 5EWCA 4LZSA 3UVYA 3IU6A 2D82A 4QSXA 2L84A 5TB6A 2DVVA 5IGLA 5F2PA 5HENA 5CUEA 3LQJA 2OO1A 4O76A 5F25A 5HM0A 4A9OA 2F6JA 5EWWA 5KU3A 3U5NA 4BHWA 4J0RA 5KTUA 4NR4A 5I29A 3MXFA 3P1DA 2RNYA 5DFBA 3P1EA 5EM3A 4PY6A 5F62A 5CP5A 2YEMA 3Q2EA 4IOOA 3U5KA 4IOQA 4C67A 5ENGA 4E96A 4TZ2A 5ENJA 3DWYA 3JVMA 5I83A 2MJVB 4IR6A 5HFRA 4QSRA 4HBVA 5CQAA 2L5EA 5TCMA 5DFCA 1N72A 3TLPA 3UVWA 5A7CA 5E9IA 5HELA 5C85A 2G4AA 3O36A 2DVSA 3K2JA 2LSPB 4J1PA 4IR5A 4YYDA 4O7BA 5FE3A 4ALGA 4QNSA 5FG6A 3U5LA 5CFWA 3AADA 4Z1QA 5ENIA 5EICA 4YY6A 2FSAA 5HQ5A 5ETDA 5KTXA 2YELA 5F60A 4TS8A 5DX4A 1WUGA 4ALHA 4YYMA 5FDZA 3HMHA 4LDFA 5EWHA 5DW1A 5E7DA 5DYCA 3O35A 5CQ3A 5DBMA 2H60A 5H1TA 4QYDA 4NXJA 5HLSA 5DY7A 2E7OA 5D7XA 2DWWA 4BW4A 3JVLA 5ENEA 4QUTA 5D3JA 4J3IA 3LXJA 4O74A 5LJ2A 4N4FA 4NQNA 5FH8A 3MUKA 3RCWA 3D7CA 5BT3A 5L96A 4XY9A 5D3SA 1EQFA 4N3WA 5II1A 2YYNA 5LKUA 5FE4A 2YW5A 5C7NA 2N9GA 5F63A 4QSPA 5FE8A 4CUUA 4QSUA 4A9LA 4TT4A 4CFKA 4N4IA 4CUPA 4BW3A 5CRZA 5ENHA 5E9VA 4YYJA 4YYKA 4QB3A 5EK9A 5CUBA 2WP2A 4YC9A 5D25A 2OSSA 5D3HA 4YATA 4HBWA 4J0SA 1WUMA 4LZRA 5DFDA 3QZTA 4Y03A 5EGUA 4N4GA 5E73A 5CQ7A 4NYVA 5EQ1A 4NRCA 4QSWA 5I7XA 5EPRA 4Q0NA 5A85A 5HRWA 3MB3A 2RS9B 5CQ6A 4QR5A 5DLZA 5H85A 4O77A 2R0YA 5CTLA 3ZYUA 3LQIA 3U5PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F61A 5FH6A 5D3NA 4UIZA 4YYHA 3HMFA 4A9MA 5AD2A 5EWDA 5EV9A 4NQMA 4NR6A 4QR3A 5K29A 3UW9A 4YBTA 4QEUA 5FFVA 3UVXA 5HRVA 3I3JA 4O7AA 4HXKA 5AD3A 1ZKRA 2R10A 4QUUA 5HJCA 5EI4A 4YADA 3O34A 5JI8A 4HXPA 3JVKA 1X0JA 3D1DA 4UIYA 4PTBA 4NYWA 5ENCA 5C89A 5CQ8A 4A9IA 4YYNA 5FFWA 5ENBA 2I8NA 4WHWA 5AMFA 5LKTA 5I40A 5C87A 3UVDA 4TU4A 4O70A 4ZQLA 4AKIA 3U5OA 2DATA 4BW2A 3P1FA 3O37A 3VKGA 4YH4A 2OUOA 4LYWA 4TT6A 4MR5A 4QSVA 5E3DA 3SVFA 1ZS5A 4NYXA 4TQNA 3UV5A 4A9NA 3QZSA 5D3LA 4QC3A 4UYFA 4QZSA 4TT2A 4MR6A 4NUEA 4YK0A 4O7FA 5A5QA 1JM4B 4QSTA 4A9EA 5IG6A 4NR5A 4NUDA 4TYLA 4PS5A 5EP7A 4YH3A 4Z6HA 5EWVA 4LRGA 5FG5A 4X2IA 4UITA 4ZW1A 4LYSA 3VKHA 4HXSA 4NR7A 3SVGA 5A5SA 4CL9A 4UYEA 3MQMA 5A5OA 5A5RA 5LUUA 4HXRA 3GG3A 5HEMA 5L8TA 4UIWA 5CS8A 5I80A 5HQ6A 4YAXA 5IGMA 2YQDA 5BT5A 5I7YA 4Z1SA 2RNXA 5CZGA 4NUCA 4QC1A 4C66A 4YBMA 5LVRA 5KHMA 4AI6A 4QR4A 4NR9A 4TU6A 4BJXA 2WP1A 5KO4A 1F68A 4KV1A 5EISA 2YEKA 4CUSA 5I1QA 5AMEA 4NS5A 4LC2A 4TTEA 5CQ5A 4A9KA 4O7CA 5I86A 5FH7A 4ZC9A 5E3GA 4IORA 5FE2A 2DKWA 4UIUA 5DYAA 4Z93A 2RFJA 4O71A 5A82A 5ETBA 5BT4A 3FKMX 5D26A 4BW1A 2R0VA 5EPBA 2RO1A 4AKNA 5FE0A 5DYXA 5H1UA 5DYUA 5I88A 4HXLA 5FE7A 5FE1A 4QEVA 4O78A 5IBNA 4QY4A 5FB1A 5DKDA 5C4QA 5E0RA 4FLPA 4QSQA 5EPSA 5CRMA 2I7KA 4MR3A 4O75A 5A81A 5F1LA 3G0JA 4HBXA 3S92A 3DAIA 5HRXA 5HFQA 5G4SA 4CUQA 5CUGA 3G0LA 5E9LA 5IGNA 5EVAA 4KV4A 5ENFA 3MB4A 5EA1A 5J0DA 3ONIA 5I89A 2DVRA 4YYIA 4PCIA 4TZ8A 4MEOA 5ACYA 2RNWA 3AQAA 4HXOA 4OUFA 4O72A 5E9MA 5FE5A 4Q0OA 4XUBA 4LR6A 5CGPA 5G4RA 4A9JA 5L99A 2D9EA 5FB0A 4NR8A 5CU8A 5D3TA 4A9FA 4N4HA 4XUAA 5KTWA 4MEPA 3LQHA 4UYGA 3UV4A 1E6IA 4MR4A 1JSPB 4DONA 4GPJA 4NRAA 3D1BA 5L8UA 5JWMA 4XYAA 4KCXA 4HBYA 4WHUA 5IGKA 4OGIA 3LJWA 4RVRA 5E9KA 5DW2A 5FE6A 5H1VA 4HXMA 4MEQA 2NXBA 3UV2A 5CUAA 4HXNA 3U5MA 5D3RA 4YABA 5C8GA 2GRCA 3JVJA 2E7NA 4XY8A 4LYIA 4WIVA 4QYLA 4MENA 5DKCA 5LJ0A 4F3IA 5CQ4A 2RI7A 5D0CA 5A5NA 4LZ2A 4UYFB 2YDWA 5F1HA 2L85A 2DVQA 4O7EA 5L98A 5FFYA 5F5ZA 4PKLA 5F3AA 5II2A 3SVHA 4UIVA 3U5JA 5IIDA 4QBMA 3QZVA 5D24A 5FBXA 5A83A 3Q2FA 4NRBA 4YY4A 4IR3A 4YYGA 2KTBB 5DLXA 5F36A 5CUDA 5CPEA 4CUTA 5CY9A 3MULA 3P1CA 4PCEA 4CLBA 2R0SA 3NXBA 5D3PA 3S91A 4QEWA 4YBSA 4UYHA 5A5PA 3P5OA 4QSSA 5COIA 5LVQA 5EU1A 5E9YA 5L97A 3ERRA 2F6NA 4UYDA 5LKZA 2E3KA 4OGJA 4Z6IA 4CFLA 5LJ1A 5LKXA 5CQTA 5DKHA 5E74A 4UIXA 5HCLA 3O33A 4IR4A 5HQ7A 4CURA 3HMEA 5FG4A 3IU5A 5CUCA 4A9HA 5FE9A 5EWCA 4LZSA 3UVYA 3IU6A 2D82A 4QSXA 2L84A 5TB6A 2DVVA 5IGLA 5F2PA 5HENA 5CUEA 3LQJA 2OO1A 4O76A 5F25A 5HM0A 4A9OA 2F6JA 2EJNA 5EWWA 5KU3A 3U5NA 4AKGA 4BHWA 4J0RA 5KTUA 4NR4A 5I29A 3MXFA 3P1DA 2RNYA 4AKHA 5DFBA 3P1EA 5EM3A 4PY6A 5F62A 5CP5A 2YEMA 3Q2EA 4IOOA 3U5KA 4IOQA 4C67A 5ENGA 4E96A 4TZ2A 5ENJA 3DWYA 3JVMA 5I83A 2MJVB 4IR6A 5HFRA 4QSRA 4HBVA 5CQAA 2L5EA 5TCMA 5DFCA 1N72A 3TLPA 3UVWA 5A7CA 5E9IA 5HELA 5C85A 2G4AA 3O36A 2DVSA 3K2JA 2LSPB 1PUOA 4J1PA 4IR5A 4YYDA 4O7BA 5FE3A 4ALGA 4QNSA 5FG6A 3U5LA 5CFWA 3AADA 4Z1QA 5ENIA 5EICA 4YY6A 2FSAA 5HQ5A 5ETDA 5KTXA 2YELA 5F60A 4TS8A 5DX4A 1WUGA 4ALHA 4YYMA 5FDZA 3HMHA 4LDFA 5EWHA 5DW1A 5E7DA 5DYCA 3O35A 5CQ3A 5DBMA 2H60A 5H1TA 4QYDA 4NXJA 5HLSA 5DY7A 2E7OA 5D7XA 2DWWA 4BW4A 3JVLA 5ENEA 4QUTA 5D3JA 4J3IA 3LXJA 4O74A 5LJ2A 4N4FA 4NQNA 5FH8A 3MUKA 3RCWA 3D7CA 5BT3A 5L96A 4XY9A 5D3SA 1EQFA 4N3WA 5II1A 2YYNA 5LKUA 5FE4A 2YW5A 5C7NA 2N9GA 5F63A 4QSPA 5FE8A 4CUUA 4QSUA 4A9LA 4TT4A 4CFKA 4N4IA 4CUPA 4BW3A 5CRZA 5ENHA 5E9VA 4YYJA 4YYKA 4QB3A 5EK9A 5CUBA 2WP2A 4YC9A 5D25A 2OSSA 5D3HA 4YATA 4HBWA 4J0SA 1WUMA 4LZRA 5DFDA 3QZTA 4Y03A 5EGUA 4N4GA 5E73A 5CQ7A 4NYVA 5EQ1A 4NRCA 4QSWA 5I7XA 5EPRA 4Q0NA 5A85A 5HRWA 3MB3A 2RS9B 5CQ6A 4QR5A 5DLZA 5H85A 4O77A 2R0YA 5CTLA 3ZYUA 3LQIA 3U5PA
chains in the Genus database with same CATH topology
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