3ORIA

Mycobacterium tuberculosis pknb kinase domain l33d mutant (crystal form 1)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
281
structure length
267
Chain Sequence
RYELGEILGFGGMSEVHLARDLRDHRDVAVKVLRADLARDPSFYLRFRREAQNAAALNHPAIVAVYDTGEAETPAGPLPYIVMEYVDGVTLRDIVHTEGPMTPKRAIEVIADACQALNFSHQNGIIHRDVKPANIMISATNAVKVMDFGIARAIGTAQYLSPEQARGDSVDARSDVYSLGCVLYEVLTGEPPFTGDSPVSVAYQHVREDPIPPSARHEGLSADLDAVVLKALAKNPENRYQTAAEMRADLVRVHNGEPPEAPKVLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine protein kinase
publication title Allosteric activation mechanism of the Mycobacterium tuberculosis receptor Ser/Thr protein kinase, PknB.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 85
structure length 267
sequence length 281
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oriA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oriA01
4ZK5A 2NO3A 2OGVA 4M84A 4U3ZA 2XS0A 4U40A 5FLFA 5TF9A 2C6LA 3SLSA 3E63A 2J50A 4X3FA 4D9TA 3E7OA 4YZ9A 3PIYA 1WFCA 2VO6A 1H1SA 2X9FA 5D10A 3OEFX 3CY3A 3H30A 4GK2A 5DOSA 3S3IA 4RX5A 2Z02A 5EHYA 3I81A 2HZ0A 2YLFA 3WARA 3NCZA 5EYCA 1NVRA 5AM6A 5AP4A 2CNVA 4FEVA 2BTSA 3KMUA 3WF7A 3ULZA 5E8UA 2R3HA 2OFUA 3BX5A 5EM5A 5FXRA 1ZAOA 3ERKA 4AGCA 2HWOA 3UO4A 4NSTA 2A1AB 2PU8A 4CXAA 4D28A 5M4UA 2BDFA 2X81A 3Q9YA 5CU4A 5IMXA 3TZ8A 3BCEA 5IA0A 2YCFA 3EFJA 2VTQA 2J0LA 4X6QC 4C4EA 4J1RA 4MEDA 4EZ5A 2XUUA 2GNIA 3EQHA 2Q83A 3CLYA 2R0IA 3R30A 2B1PA 1DS5A 4YLKA 1H4LA 3CR0A 5GJDA 3ZDIA 4EQUA 3D14A 4IXPA 4O7YA 2XNGA 3DJ7A 2BIYA 2PMLX 3SRVB 5HQ0A 4BCIA 1R0EA 4YC3A 3ZEWA 2W1CA 3IDCA 3W2QA 4BBEA 4XBRA 2CKOA 3M1SA 5LWMA 3TUDA 3PDTA 2BFYA 3RCJA 4IEBA 3F3VA 3R9OA 2CJMA 3Q96A 2HY0A 4JG7A 5T6KA 1JOWB 2FSLX 4IWPA 3FZPA 3N9XA 4ANNA 5M56A 1VEBA 4UZDA 1OI9A 3A7FA 3MH0A 4F65A 2JKMA 3QAME 2EB3A 3QCQA 3BWFA 3BGQA 3V8SA 3ZRKA 1PY5A 2XKDA 4EHVA 5KHXA 4QMPA 2VN9A 2G1TA 5JQ8A 3HAVA 1J7LA 4NJ3A 3RPYA 4TYEA 3OC1A 2V22A 4AS0A 2VO3A 4NFMA 3UQGA 2CGXA 4CKIA 2HXQA 3V5TA 4U44A 3VIDA 4FMQA 2YM6A 5HNGA 3TT0A 4IIRA 4DBNA 4DLJA 5J1VA 4APPA 3R8LA 4V0GA 3TV7A 1FVVA 4M66A 5DEWA 1UVRA 4WRSA 3UQFA 2V7AA 1YXSA 3RM6A 3UC4A 4HVHA 4IQ6A 1U46A 2CKEA 4K9YA 5D9HA 2DQ7X 2XRWA 2E9PA 4PMTA 4AFEA 4NM7A 3Q5ZA 4BWPA 1L3RE 2R3JA 4DH5A 3CPCA 2B9JA 3BU3A 4PP9A 4AZFA 3MJ1A 5AAFA 3AD5A 3GU6A 2VU3A 2YIXA 1V0OA 4YJPA 2VRXA 4G2FA 5TKDA 4EH5A 1APME 4QMMA 4BR3A 3IW8A 3PA4A 3QQJA 3CEKA 4MD8E 4PTEA 4IBMA 3PZEA 2XKEA 4Q2AA 1YXXA 3JVRA 1NT2A 4DCAA 3LM5A 2BR1A 3NYXA 4D9UA 1Q24A 4A07A 2QOCA 5BQ0A 1WBTA 4C38A 3VVHA 4HW7A 5KMOA 3F3ZA 3ORZA 4U41A 3QX2A 2J9MA 5DVRA 2IW9A 4RIXB 1SVEA 4O1OA 5HIDA 2PMNX 5FGKA 4KD1A 4PL4A 3VUDA 5C1QB 4DGMA 1JAMA 2NPQA 2OF4A 2X7OA 2YFXA 5JGBA 4EEVA 4F99A 5ETCA 3QZIA 4F1OA 5BNJA 4XG8A 2VTPA 3TI1A 3VUIA 4GJ2A 5KMKA 1Q3WA 2FSTX 5CNOA 3ZLYA 5FTGA 3G51A 5M09A 2VTSA 4NCTA 3BLRA 4GUBA 2W5HA 5EI2A 5HE2A 5EKNA 1GZNA 2PUIA 3D2KA 3NNWA 3SA0A 4AW1A 4WSYA 4KIPA 2CCIA 2UZLA 4GYIA 2BMCA 2EXCX 3FI2A 4QTAA 4WG3A 5AUUA 4KBAA 3IDBA 3OD6X 3OBJA 5GJFA 4YSJA 3TZ9A 2CN5A 4D4RA 2B9HA 5AIRA 1UNGA 3AC8A 4I0SA 5ACBC 4EQMA 3BV3A 3V5JA 5AP3A 2QKRA 4PPCA 5IEXA 5IH4A 3NDMA 3D0EA 3MI9A 2XP2A 3ZSGA 1OIUA 3E62A 1ZY5A 3U6IA 3U6HA 4J7BA 4MXXA 3DJ6A 4YPSA 4H58A 3OVVA 2XK9A 1H1QA 4FTKA 3P5KA 3W2OA 2IZRA 2UW7A 3A7IA 2OZAA 5CAUA 1OUYA 4AF3A 3NNUA 5HD4A 1OB3A 4EH2A 5G6VA 3WIKA 5IUHA 3MFSA 2QCSA 3VBTA 5AR7A 3E3BX 4L46A 4RPVA 3GU8A 3D5VA 4IX3A 4EZ7A 2J51A 3D7TB 3QTXA 1B38A 5FD2A 3PYYA 3RKBA 3B8QA 5T68A 5E8XA 5L6OA 5EW3A 3KA0A 4JG6A 3FY2A 3R9DA 5IA4A 3EKKA 3HNGA 5HKMA 5LVMA 3SC1A 4J71A 3JPVA 1E9HA 2QO7A 3ACJA 3VS3A 2VGOA 4KS8A 4F7NA 2ZB0A 4UV0A 3FXZA 3FMKA 2CHLA 3LCSA 2WTVA 4TPTA 1YXTA 2WZJA 5HG7A 2XJ1A 4HGLA 5HVJA 3TZ7A 4Y5QA 3DB6A 2WHBA 1A48A 5BX0A 5L8KA 3GGFA 4G3EA 5C4LA 3PWYA 2BZIB 2PVYA 3LFAA 4C4JA 3QHRA 2RG5A 1ZOGA 3KL8A 5AV2A 4J99A 2W0JA 5AR2A 3UOHA 4BDKA 2O5KA 3BGPA 4BIBA 2J0JA 3U6JA 4E6AA 4EC8A 4RG0A 5LOHA 3BWJA 3E88A 4HYUA 2RKUA 3F5UA 1GY3A 4KB8A 2GNGA 4ZLYA 4PNIA 3FMHA 3H10A 5DA3A 5EI6A 4U0IA 3VAPA 3BHHA 3QKKA 3AC1A 4YBJA 3FJQE 3VJOA 5B2MA 2GHMA 3ORKA 3Q4UA 3RINA 2REIA 4DA5A 4C35A 3GB2A 5CEIA 4MXAA 5AP2A 4FNWA 2YZLA 4BICA 2OICA 3TG1A 5KNJA 4AT3A 4DG0E 2QHNA 3NWWA 4WT6A 1FOTA 3GCUA 2BHEA 3ETAA 4OAVB 2J0MB 3QRUA 4IDTA 3HV6A 3TTJA 3R1QA 4FEUA 4MCVA 3R7EA 4M69A 1P14A 3TZMA 3P0MA 4ZTRA 3RBWA 4Y5HA 2YACA 4XG9A 5F4NA 4RVKA 3C13A 2C6DA 3DXPA 1OITA 1PJKA 4UYAA 3JS2A 3HECA 2HY81 4O7TA 2F2CB 2HK5A 5HO8A 3QXPA 3B2WA 4E26A 5CEKA 3GCPA 3CQEA 3MWUA 4U9AA 2Y0AA 3KULA 1YWVA 3ZRMA 2V62A 2ITVA 1R0PA 3VO3A 1SNXA 2KTYA 1W84A 4E5WA 4PQNA 1J7UA 2XH5A 4GW8A 2X7FA 4UBAA 2ITTA 3FXXA 5FDPA 4QMTA 4MVFA 4XLIA 3MB6A 4ZSLA 2E9VA 1HCKA 3ZEPA 3QYZA 4QQTA 3R8VA 5D11A 1O6YA 4FIHA 3DFCB 4L67A 2EU9A 2XNMA 3NUXA 2GQRA 2PVNA 5I3RA 3ZSIA 3OCTA 1H0WA 2YN8A 3P23A 4LUEA 2ETMA 5FEEA 3R83A 3SX9A 5BVOA 1W82A 3OY3A 3BGZA 4O1PA 2VTJA 1H0VA 1YKRA 4DAWA 2VAGA 3OWPA 3BBTB 3I79A 4OR5A 3UJGA 5CI7A 4E1ZA 2OJGA 3TN8A 4EC9A 2X6EA 2XYUA 2ITQA 1CSNA 3K54A 4YJVA 4N6ZA 4BI1A 4C2VA 4UEUA 1RJBA 4Q5EA 4UMPA 1AD5A 4RC2A 1UA2A 4NW5A 5HBJA 2BCJA 1PXKA 3D5UA 3RTPA 4F6UA 4GYGA 2W1DA 3QGWA 4O38A 4TYIA 4MXZA 3HVCA 4X6RA 2NP8A 1GIIA 3V04A 2CN8A 3UP2A 3QC9A 4IB5A 3I0OA 4R7BA 4M68A 3QHWA 4ZOGA 4E6QA 4U42A 3TXOA 2XYNA 4DEDA 4JRNA 1WBVA 4OLIA 5BYYA 1H1PA 3IO7A 5KMMA 5DNRA 3RZFA 3Q6UA 4D1ZA 4F64A 4FV8A 4IM2A 2ZMCA 4ZP5A 2GNLA 4O96A 4GH2A 3N4UA 3UZPA 4NIFB 4FSNA 3R00A 4M7IA 2X2LA 2WOTA 2W4JA 4UALA 3R8PA 5IA2A 3QTIA 1LEWA 2R3NA 2P4IA 1FQ1B 4J8NA 3TL8A 5IPJA 3D9VA 4G3CA 4TZRA 5JFVA 3WE4A 1XH6A 3OROA 4YLLA 3D5WA 3FI4A 3GP0A 3KKVA 4I92A 4UXLA 1V0PA 4U97A 2AC5A 2YITA 3Q52A 4AA0A 2FSOX 2RF9A 3EQIA 2A4LA 3OY1A 3QWJA 4K8AA 3HMOA 5HG5A 3ZLXA 4AN2A 3JR1A 3PXYA 4KNBA 3R1SA 4GUEA 3OF0A 5J9ZA 1H28A 4YSMA 2QLUA 3BQRA 2JIUA 1NW1A 3TM0A 4F70A 4EK3A 5L6WL 4L8MA 2VV9A 4QQCA 3F2RA 4HZSA 1BYGA 4G17A 3DK7A 3P1AA 4LRKA 5ANKA 4RWIA 3NIEA 1ATPE 1KOAA 1VYZA 5I5ZA 3ENMA 3DDQA 4P2KA 1OKZA 5G1XA 2WGJA 1ZYJA 3T3VA 3E8EA 3WZKA 2QOOA 4IC8A 4K77A 3CD8A 5AFVA 1XBCA 2R3KA 4I0TA 3F7WA 3PPJA 4ONAA 2BKKA 4JI9A 2GU8A 3VWAA 4EWHA 3GC8A 5BUIA 2JAVA 2PWLA 1TQIA 4CNHA 1JWHA 5GZ8A 2E9OA 1Q4LA 4BCKA 4F9CA 1JKLA 4C7TA 5BMMA 3KY2A 3KF4A 3HV7A 5KX8A 4IH8A 4F9WA 3ODZX 2C30A 5AP1A 2PE1A 4O81A 3RCDA 3PSCA 5HVKA 4K1BA 5IU2A 2YERA 1Q97A 3UP7A 3QZGA 4AT4A 5I9WA 5DI1A 4ANSA 3PXKA 1M17A 3IG7A 4QP6A 4O7LA 3R6XA 1PYEA 5AR5A 1PXLA 4MNEA 4JQ7A 3W32A 4E6DA 2IPXA 2GS2A 3PY0A 3HAMA 5H8EA 3DS6A 4C4FA 4JOAA 2EXEA 4CCBA 3F5XA 2B53A 3PA3A 3LFDA 1URCA 3DJ5A 3A7GA 4HVIA 4YR8A 5CEPA 5CSHA 3ZM9A 2XIKA 4X2KA 4BHZA 2G15A 3FLNC 3MH2A 4FVQA 4J97A 5A6NA 3VS5A 3ORMA 5EKOA 3DBCA 2YM4A 4FKTA 3W2SA 5JFWA 3FC2A 1PXNA 4IX6A 4MXYA 4F1TA 3UO5A 4I5MA 4B8MA 5M4CA 5AV1A 1DI8A 4YTIA 3ZUUA 2OIQA 5H3QA 2YM8A 3MH1A 4H3PA 1K3AA 2VWIA 4Y73A 3UOJA 4DH3A 5F1ZA 3H4JA 4ZTHA 4FZFB 4BKJA 4FG9A 4D0XA 2WKMA 2ZAZA 4OBOA 2Y4IB 4YMJA 4I6HA 4M3QA 1STCE 2WMTA 3SXSA 3VUKA 2A19B 4JDHA 3VS1A 4FK6A 4CFWA 2C6EA 4EQCA 3OBGA 3EQBA 2VUWA 3BHUA 3IGOA 4J52A 4JG8A 4R3RA 4FA2A 2ZM3A 2BKZA 4ZZNA 4BDHA 3OOGA 4JDIA 3V5WA 1ZOHA 2QO9A 3SVVA 4FTCA 5A4EA 3DBEA 4LMNA 4F0FA 5AAGA 4D5KA 4AT5A 1WZYA 3LPBA 4A9RA 4U8ZA 5HZNA 2FUMA 3R9RA 3AMAA 3PLAE 2WMQA 4Y85A 2W1FA 2ZOQA 3DBDA 4EHEA 5BUEA 3LIJA 4KIQA 5AADA 3HRFA 5M07A 5DIAA 4DINA 3SRVA 4M8TA 3N51A 5K3YA 3SXFA 3FMMA 4GG5A 3NAXA 5HD7A 2YLEA 2WQOA 1CTPE 3UMXA 2GMXA 3CSVA 1ZY4A 2ITPA 1G8AA 4FIIA 4C0TA 4CV8A 1MRYA 2BZKB 2J90A 5IUGA 5CY3A 5JH6A 3NW5A 3L8PA 5CVGA 3FWQA 1U59A 4FEQA 4GFGA 2ZDUA 3LKMA 4L7SA 2C0IA 3KRXA 4P5QA 3ZSHA 3RM7A 5C03A 2YEXA 4G34A 2UUEA 3NCGA 3HV4A 4YZDA 3O71A 3R73A 4AP7A 4FIJA 4D58A 2BDWA 2OF2A 3RK7A 2XIZA 5FG8A 4G5PA 2OK1A 3HP5A 3HMNA 4AW0A 1ZMUA 4QPSA 3VW6A 4EL9A 5J7BA 1XWSA 3O51A 3EQFA 5B2KA 4FL2A 4QMVA 1IRKA 3ALOA 3DNEA 3RNIA 5AEPA 3WF9A 4P5ZA 2XRUA 4M14A 5AA8A 4TWPA 4ZY4A 3HL7A 4OT6A 1KOBA 2JBOA 2JKKA 4CYJA 3OTUA 4EORA 3O23A 3E8DA 3HUBA 4DEEA 5EM7A 4F6WA 4YBKA 3ZS5A 3ZH8A 2I40A 4RZVA 5HLWA 4A9UA 2R3FA 2BRNA 5ITAA 4YU2A 3NZ0A 3ORPA 4KUJA 4BGQA 2IVVA 5BYLA 4FT0A 3EB0A 4CLJA 4NH1A 3EZVA 3KRWA 3DZQA 4XEYA 3BYSA 3BHTA 2BZJA 3UG2A 2ZV2A 3R63A 2FH9A 3ID6C 3QLFA 4U6RA 1ZMWA 2CLXA 4XRJA 2A0CX 3UVPA 3DTWA 4AZWA 4RIYB 4C3RA 4W9XA 5C01A 1P4FA 4BDDA 3ACKA 5AV0A 3ZUVA 3BHVA 3SQQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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