3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
3NEDA 4KW4A 3WLCA 1B3FA 2B3QA 4KPIA 3O78A 3TMTA 4U1OA 3FVOA 3SEWA 4R74A 4IY6A 3O6HA 5F1QA 1Q35A 2RF1A 3B6QA 3CFAA 3GBBA 3A09A 4QFNA 2ZNUA 3DQ1A 3B7DA 4Q30B 2QLIA 4QSEA 3MP6A 4LJDC 1DPEA 4W76A 1NNTA 3PIBA 2NVUB 3M3KA 3H1RA 2I4CA 2DD7A 4NF8B 1URGA 2Z22A 2QLGA 3S9MC 4ANJA 4O3CA 2FL1A 1DSNA 4H47A 3OD7A 4AB5A 3LUYA 4KYEA 5AA2B 5BTTB 2V4EA 3EVUA 2OWTA 1MQJA 4PFWA 4HCYA 1B1XA 3KN3A 1LFIA 3OXNA 3RQTA 4W7XA 1LGBC 1OQGA 4IK9A 1NFTA 1NNPA 5EHMA 5DQBA 2QSXA 2F6PA 3NF0A 1L5TA 2WIQA 1R6ZA 2HFCA 2XXXA 3CFLA 3RUMA 2WHUA 3FASA 1I6AA 1OVBA 1YZWA 3HCQA 4N13A 2NXOA 5HW9A 5EXUA 4JFGA 2OCUA 3FIRA 2DXRA 1Z1PA 2RH7A 1N0TA 4NMYA 4C1UA 4LP2B 2DSFA 2XD3A 4DKMA 3P28A 1BFPA 3ED8A 3BXAA 3DM0A 2A47A 4RJZA 3PJ7A 5F9GA 1RKMA 2P2AA 2DUGA 2A56B 4BLAA 3DQ3A 1FTMA 1TFAA 4GWOA 2YE1A 4BDRA 4U1ZA 4IO2A 5EJUA 4OZ9A 3E5TA 3C34A 2GW4B 1QKBA 2YE0A 4R6DA 2I0BA 5HM4B 1URDA 5ITOA 1EMBA 3PPNA 3CD9A 4ZS9A 4IGRA 1IXHA 3TYHA 4OHNA 4W6FA 5DTXA 2QS3A 3CG3A 4XKNA 2H5RA 3ZUFA 4HQCA 4ZZAA 5BUUA 3WAFA 4EULA 3OEMA 3D4GA 3FGSA 3NT3A 1BP5A 1MXUA 4HW8A 5L8DA 1ZU0A 4ZEKA 3IB0A 3QIMA 1MPBA 4I1DA 1WVJA 1QUIA 4YKPA 3O66A 3FUZA 3VXCA 2QJEA 2Y7WA 3DQ8A 3Q28A 3FXRA 3JV9A 2ONRA 3A3CA 3BFTA 5BTTA 1B1HA 3FVGA 1EMCA 1IIWA 2DWAA 3LSWA 2ICRA 1KYRA 3H1OA 3MAMA 3R26A 3SG4A 1MXXA 4RA1A 1B9CA 3CIJA 2VVJA 1DPPA 1FCKA 5FHOA 4H1XA 5K2YA 4W6OA 5CMMA 4KD5A 3D4CA 1HSEA 3ZKLA 4F29A 5DVFA 3U72A 3MVXA 1CV7A 1EMMA 3K6XA 2O29A 1B58A 3VE1B 4C0RA 1MPCA 3VK1A 1O63A 3RY3A 3DQKA 2HCAA 3FATA 4QFLA 3SSPA 3TQLA 4O3BA 3UG0A 4OWDA 3C35A 4ISUA 3T9UA 2BJJX 3OSRA 3U0LA 4KI0E 4DLDA 3CG1A 4C1TA 4JXIA 3DELB 4AR7A 4HCWA 3DQJA 5HGEA 3DPXA 2V4EB 4JEOA 1QKAA 1SI0A 3TTLA 1PEBA 1OXFA 4NF4B 2AHAA 3E5VA 1MY0A 3RPWA 3UIFA 3H06B 3KCTA 1SI1A 2O7UA 3SEYA 3T9VA 3PMXA 1TXFA 2DD9A 4PETA 4R72A 2Q9TA 1KYSA 4W6RA 4DXPA 3HO7A 4W6DA 3UGWA 2HQZA 5LTPA 2XXIA 3LS3A 3G3JA 3TDJA 1ZIUA 4HE4A 1R1NA 5H89A 1EMLA 5TPAA 2H5PA 2UYFA 3VLWA 4QRZA 4U4SA 3U0MA 4ZEIA 4L12A 1QJMA 1Y3NA 1JQFA 4HTGA 5CMBA 3T66A 3IOUA 4ELPA 3SG6A 1MOUA 2RC7A 3UORA 4EQ9A 3SKPA 1Q4CA 3U8CA 1SVXB 3QYTA 4KW8A 1A7LA 1NH8A 3N94A 3H6UA 4OEUA 5LK4A 4PPLA 3LSAA 5H8NA 2FZUA 2F5XA 1Z7ME 5FHMA 4NF6B 1LCTA 4FECA 2F7AA 5I2KA 2QS2A 2YDZA 2O6AA 4W6TA 3KFMA 4FATA 4ELQA 1H6RA 5HZTA 3OSQA 4MLVA 3U92A 3TQWA 1ZGPA 4NF4A 1LCFA 4W6CA 2DWHA 3K0VA 3U1OA 3U8QA 4H65A 2QT2A 3H6VA 2OTBA 3U0KA 5DRFA 1MDQA 4ZF3A 2GX2A 3PMVA 1FTKA 4H6DA 4F39A 4G8HA 4XGYA 2VOZA 1S9TA 1B32A 3HHFA 4RYAA 4THIA 1USYH 3RGYA 1IZ1A 1H44A 3AI4A 3AKOA 2B3PA 5H8FB 3KOTA 4OXVA 4RPOA 4PPKA 4EDSA 3DQ9A 3PUZE 5FVFA 3VLVA 1USYE 5H87A 1OQHA 3U8PA 2Q2CA 2E0SA 3R6UA 3V8XB 4NWCA 1US4A 2H99A 1FW0A 3RN8A 1TWYA 1Q4EA 4IK1A 4F1VA 1SW2A 2XXPA 1LBCA 2XXHA 3DQDA 3DPZA 4DIGA 2B3FA 4X9TA 1QUKA 2YJPA 2PBWA 3MC2A 1BIYA 1B51A 4F22A 5KCJB 3DQFA 3UP9A 3VDFA 4IK5A 2YPNA 4PFUA 2B65A 4ONYA 2XXUA 2DXYA 2GHBA 3USDA 4ZINA 2QU1A 5I2KB 3U0NA 4LJDA 4R6YA 4XIGQ 4H3NA 4DXQA 5DRGA 3PGFA 4W73A 4L1IA 4I2YA 3ZULA 3IR1A 2RKMA 4TLLB 4GD5A 3CFHA 3KJ7A 2A5SA 2ZMUA 1YAEA 3H4ZA 2RCBA 3DQMA 4J8AA 5KTGA 1Q1KA 2I0CA 2ZNTA 3K1NA 4GXSB 3KZGA 3BBRA 2G2SB 1A55A 4GF6B 4QFKA 3P8UA 2HCGA 2VGQA 3ECRA 3T96B 3CSGA 4POXA 2I3VA 1MQIA 4J89A 4WEDA 2G16B 4EDPA 2W7YA 5H8NB 2HAUA 1YHGA 1QULA 1R9LA 1O64A 4NF6A 5DVIA 2XHDA 2DUEA 1H3DA 5DY6A 4OERA 1EMGA 2UYEA 2F8DA 3CVGA 3M3LA 3OO7A 2Y7PA 2A48A 2DUHA 5CMKA 1CB6A 3TMRA 4EMQA 4H8JA 4W6MA 2PT1A 1SW1A 4LONB 2I4BA 3UN6A 3EK4A 4ZE8A 4F3GA 4F3PA 3TKDA 2WURA 4JRBA 2F97A 4KW9A 3ST3A 3EHSA 4PFTA 4R6BA 2P0SA 2ONSA 3IOWA 4O3AA 4F31B 5H8HA 4JB7A 2H8QA 2WHSA 4N3DA 4PQJA 4W6SA 3MGFA 1B46A 3N6UA 4YICA 1FTJA 3S05A 5HZOA 1A8EA 2WHTA 1W7TA 4G68A 3MVYA 2VVHA 4FE8A 3W15C 3RWAA 2AH8A 2XXTA 2HZKA 2I3WA 4LJBA 1ZUXA 3E4RA 2Z6XA 2F78A 4P0IA 3GJ2A 3OGOA 3C9HA 5ELVA 5I2NA 3T9XB 5FVGA 4Q7RA 2H9BA 2Q2AA 3FJ7A 1O7TA 1HSLA 1LAFE 1VSOA 1AOVA 1GGGA 5L9OA 1MY2A 1PC3A 4LQ2A 4R73A 4GLIA 1ZTYA 3CSBA 1B05A 4G68C 4FORA 1XSSA 3IO6A 2HJOA 2PXSA 3SSVA 3ADFA 3LVCA 4OYVA 2V84A 1LB9A 3GEXA 4QHQA 1YHHA 1TT1A 3G9AA 2FNCA 2R6GE 3QAXA 4ELOA 3P7IA 3SEUA 5H8FA 1YPNA 3MUQA 2ALUA 1PB8A 1MYWA 4R6HA 1W7UA 2V3QA 3LA1A 4IB2A 2OKYA 3E9XA 4DDDA 2H4IA 5DVJA 3K01A 3KSXA 4YB7A 3K02A 3PUVE 3C32A 3FD3A 2H98A 1QUJA 4KF5A 2QZ0A 4W6IA 1XOCA 3IO4A 3MZBA 1DTGA 3GLBA 2ARLA 4DCYA 5BWJA 4ESXA 2XXQA 3IAZA 4QSCA 3G7WA 5CBSA 2YFPA 2IOVA 1B9JA 1AMFA 2FA7A 4GRKA 1EMAA 5DPHA 5CBRA 1RRXA 4YZZA 5DT6A 3EKJA 4G2ZA 2VAEA 1N7WA 3U93A 1MG1A 3M3FA 4JC2A 1YJFA 5DPJA 3DQCA 1S6ZA 1P99A 1EH3A 1S50A 4GQOA 2D3IA 3MP8A 1NKXA 4GF8A 3OEKA 2QLEA 5HBCA 3CR9A 1N3WA 4POWA 3Q25A 2QPQA 4ZBLA 3DP4A 5DQMA 2D21A 5DYHA 3TTKA 3SSYA 1D4NA 1N7XA 4W7FA 4OENA 2PT2A 4KF4A 4TZGA 1P1QA 5J1DA 1PB9A 3CRBA 5H8HB 5AA4A 4XKRA 1I6BA 1T0KA 4YMAA 1P1OA 3TAJA 4GOTA 2QS1A 3VHTA 1VFEA 2R9JA 2HZLA 3PPRA 5KZTA 1B0HA 3L6HA 4PP0A 3PJBA 3K4UA 2Q88A 5CC2A 3VVDA 4MLQA 3S9LC 1IEJA 1JW1A 3UK4A 4KF5C 4X1DA 3VVEA 2DUIA 4IO6A 4RK9A 1MS7A 1UISA 3Q29A 1EMFA 1OLAA 1QW0A 3FXUA 1XQMA 4OMBA 3O6GA 1A54A 2RINA 1KP5A 3I3VA 3CI8A 4OEVA 3EHUA 4NWDA 1MY3A 2C9IA 4DXBA 5JTYA 1IXCA 2XXWA 2DE4A 2UVGA 4F3SA 2B3BA 4XTCQ 4X48A 3UFZA 5DTBA 4YB6A 1NMUA 1DMBA 2XXRA 1MRPA 2RCAA 4H8IA 2WSNA 4UACA 2Q57A 1JEVA 1XC1A 4NEDA 3VICA 3S2VA 3DQEA 5FTHA 5I57A 4ZEDA 3EVVA 4W6KA 5L9MA 1Q4AA 2IA4A 5JK4A 2O1LA 3O9PA 3FJGA 3RT8A 3SETA 2OZZA 3V5AA 5TPAB 4LJCA 3SSTA 4LQTA 4ZIOA 4H0WA 1B5JA 5A5XB 4F18A 4OY4A 4UTSA 5I2NB 4ZFSA 4DXUA 4PFYA 2Y7KA 5AA4B 5L9SA 4KA9A 1RMMA 3SV5A 4U21A 4J88A 4KFQA 4R2BA 4YAHX 2O1MA 2OJKA 3VHTB 2VHAA 3IP2A 2ZO6A 2Z6YA 1POTA 1QVSA 2UVIA 1B3LA 1MY1A 1P1UA 1RYXA 3PUWE 3Q26A 1LAXA 5DPGA 2XX9A 2O7IA 3DQ4A 3VFJA 2PX1A 1Z7NE 4OTEA 3VV5A 2VVIA 1QYQA 5EBJA 5EB6A 2QMWA 1ZGOA 4EXLA 2HQKA 2PXWA 3KN7A 2UVJA 5I56A 1NNKA 3THIA 2ESNA 4LQ5A 2HAVA 1EMEA 1FQFA 2CMOA 4DXIA 1MQHA 4WEPA 3W1CA 3KSJA 3MPKA 2I6EA 3PUXE 2POXA 4GFRA 3B6WA 3IJXB 5JTYB 1MOVA 1ELJA 3ZSFA 3GZGA 3SVBA 4EXKA 4Q0CA 4M4GA 4W6NA 1SDXA 3SSHA 2ZMWA 2HGYA 1EZPA 4H5FA 2HQ0A 1EZOA 2ZYMA 3MW0A 1IUDA 4ESWA 1WODA 3ZKKA 1N76A 2VP1A 4JBZA 4IZNA 1IXGA 3MWBA 2NWJA 2VD2A 3FXQA 4LVQA 5AA3A 1LLSA 2G3OA 4L17A 4GESB 1IITA 4GL0A 1QXTA 2QL3A 4ZDMA 1MM7A 4RNSA 4PFEA 3CD1A 3SERA 4G4PA 1P1NA 4FEBA 4QF9A 4W6JA 2EMDA 4QSDA 4XXUA 3KGCA 1HSJA 1JC0A 4Q9WA 3DP6A 1FQEA 4Z4MA 3H7MA 3S4UA 4W74A 2X26A 1FQDA 4XKQA 3K1MA 5B7DA 2E1SA 3GBAA 4R9GA 3TTMA 1B3GA 5ICTA 3R7XA 2V93A 4MBPA 3MBPA 4NTLA 4W7RA 3K6UA 1US5A 2WKYA 3ILTB 4KHZE 4YKIA 3DQ5A 4XOWA 2HFBA 4W7AA 4GVOA 2FYIA 3DQHA 2H5YA 4JDFA 3NEZA 5AQBB 3VXBA 3IB1A 2Z8DA 3H03A 2XXVA 3BKIB 3W9WA 4F19A 3QK6A 1LAHE 2A52B 5K2XA 1ZJLA 2OGRA 3MQ9A 4EF1A 3IR8A 2DUFA 1B7UA 2O84X 1GR2A 4P11A 2OWSA 4W7DA 1TFDA 2DWJA 3LSLA 4W77A 2AL4A 3NT9A 1OVTA 3IX1A 3BXCA 1CE2A 3HV1A 2QLHA 2HGDA 5BQLA 2G5ZB 2CZLA 3VVFA 5IAIA 4BDQA 2XX8A 1MPDA 1UTHA 3KN8A 1OIBA 4EQBA 5I56B 3RNNA 5DTLA 3L6GA 2HPWA 1D9VA 2UVHA 4W6AA 1JBYA 4LATA 2FWQA 3ST2A 2I58A 4GOBA 3IORA 2A5TA 2M8CA 4JSOA 4YMBA 5ICQA 2Z6ZA 4OJ0A 4Q7UA 1XHYA 3BFUA 1XS5A 4ZE9A 3EKHA 4R75A 1BTJA 4HS7A 4GIZA 1MXVA 3G3HA 3TCFA 3EVRA 3TEPA 2ANJA 3ONMA 4KGEA 1SYIA 4N07A 4FEDA 1PBPA 1JVXA 4G68B 3N26A 3KJTA 5ISUA 3PPPA 3JZJA 3U8AA 2HXWA 1RM9A 1FQBA 4RYSA 1M5FA 3O77A 1UIUA 1YTVA 4OETA 2VZXA 4KGFA 3RTWB 4F2OA 2NOOA 1Y4TA 3KBRA 4W6PA 1JBZA 1M5CA 3OOAA 1URSA 1YJ2A 2A46A 1MY4A 4ZEFA 3HPIA 2HRSA 1UIVA 4KCDA 4ECFA 1B4HA 1XVYA 3SVOA 3I19A 3PPQA 1XMZA 1H45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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