3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
1Z1PA 1LAGE 1XS5A 4I62A 1N7WA 1QYQA 4Q7UA 3OO9A 4ORNA 4U21A 2Q89A 1R9LA 4JB7A 4EDSA 2G16B 4R72A 4OQWA 2F5XA 1DMBA 2O2BA 5ITOA 5ICTA 3E9XA 4X1BA 3MUQA 1B5HA 2ZXTA 3E3KA 4IGTA 3H7MA 2HXWA 4W6CA 5F9GA 4AS8A 1B52A 4KPTA 2G93A 4OY4A 4W6FA 2OWSA 3S9MC 3K02A 1WODA 3FJ7A 1W7TA 1EZ9A 5DTBA 2HCAA 5FTHA 3C4MA 3AI5A 4HE4A 3C34A 2IOVA 1YZWA 3U1OA 5EHSA 3G7WA 1OXFA 3SVNA 4X48A 4EQ9A 4KW8A 4KR5A 3EVVA 3GLBA 3WLCA 4JFGA 4FAJA 1YHGA 1AIVA 4LQ5A 5DRGA 2EMDA 3O2AA 4P0IA 5AA4B 4QFPA 2GX2A 2H25A 5ITPA 2I58A 2A48A 4TLMB 2YE1A 3RUMA 1IIWA 3MVXA 3MVZA 3A3UA 4W6TA 3LSWA 2A52B 2I4BA 3ZS6A 3AKOA 4W6LA 1PB9A 1BTJA 3SESA 1F9BA 1LB9A 3PUXE 3VVEA 5AE4A 1IEJA 2V84A 2F36A 3EPEA 1MY0A 2YE0A 3GB3A 2ESNA 3N5LA 4C0RA 3LR1A 1MM6A 5JK4A 4DZ1A 2UVIA 4TZGA 2FZUA 1H76A 4W6RA 3FUZA 3K6VA 1NNFA 1OMPA 3SSVA 2I6EA 1JW5A 2F34A 1FW0A 4H67A 4QFOA 4OEVA 5CMKA 2DUEA 2XXYA 3FVOA 4KI0E 4U1ZA 1B0HA 1M5DA 4IK9A 5I56B 2Q2AA 2R6GE 4N07A 1TT1A 1JC1A 1B32A 2QS1A 5DVIA 4W6MA 4JWYA 4F2QA 4R6BA 3R26A 2VADA 4GF6B 4IO7A 4P0GA 1LFIA 2ONKE 4W75A 3T9VA 2FWQA 1MQGA 3NT3A 4H48A 2F97A 1MXVA 4W6PA 4NF5A 2HJOA 4K3FA 1QW0A 4KCCA 3DQIA 1A40A 1Q73A 1M5CA 1B58A 4N6PA 4G68A 4EXLA 3KN8A 1D4NA 4FATA 3ZULA 3VV5A 2HRSA 1BFPA 4DIGA 4XKNA 3P8UA 3HHFA 1ZLQA 2FL1A 2G3OA 4W69A 4JWXA 4YMAA 3TTKA 1CV7A 3G3IA 5I59B 3CRBA 3CVGA 4OQOA 4YKPA 2QPQA 4W7RA 5BWJA 3IO6A 2AHAA 2Z8DA 2ICRA 3DPWA 4JDFA 5DTYA 1Y4CA 1WDNA 1LBBA 1A99A 3SEVA 3QUJA 5K2XA 5DT6A 4Z4KA 4Q8RA 4HW8A 5LTQA 3DQ7A 4JF9A 2OLBA 4ZZEA 4EQBA 3PJ7A 1N3XA 1OLAA 4ZBLA 4LJDA 3H6VA 3TTLA 3DQ4A 4KGFA 5H8FA 3CG3A 2LAOA 1LBCA 2HQKA 3WAEA 5DPIA 3CI8A 4HCYA 3M3KA 3U72A 2X26A 3JZJA 1UISA 2WSNA 3EK7A 1NKXA 3CFXA 5TU0A 2ALUA 3A09A 3KEIA 1SBPA 4G2ZA 2ONRA 3UIFA 2VVJA 1ZKBA 1B6HA 1JBZA 1GTKA 2PVUA 3QSLA 4ZF4A 4DXPA 3N6UA 1W7UA 3T9XB 4LA9A 2ZNUA 4GVOA 4ZS9A 2ARLA 4U4SA 4ZF3A 1EMAA 2HGYA 1GL4A 3RWTA 2AIXA 1SQYA 3O66A 4IO2A 2O51A 2P0SA 4OESA 5CM6A 4DE8A 1P1UA 4W6UA 4R9FA 3TELA 2EMOA 4KYDA 1RMPA 2Q8JA 1GGXA 4ZEDA 3EVRA 4LW5A 3OO8A 4G68C 2AWLA 1H3DA 3E5TA 1PBPA 1AL3A 3DLNA 4L1IA 2RF1A 4UACA 1GVCA 1KYSA 2OJTA 1GGGA 4PFYA 3TEPA 1EZOA 2V25A 2CMOA 4XKQA 1UTHA 2A54B 1NFTA 3QXMA 3OEKA 4M1VA 3U94A 4OGSA 2JADA 5EB6A 3CR9A 3S2VA 3RN8A 3S9EA 2QL3A 3CSGA 2X7PA 2THIA 5HZUA 4FJPA 4G68B 5EHUA 2DDDA 1LAXA 1Y1MA 3C9HA 2POXA 2OJKA 1MQHA 2F7CA 3MVWA 2GX0A 3B6WA 3UP9A 4ZINA 5B7DA 3IK6B 5I2NB 4W6KA 4PFEA 3VLVA 4LJDC 3S05A 1B1HA 2ABHA 4JSOA 1N7XA 2V3UA 4W74A 3U8AA 4O3AA 1F09A 4DXNA 3K1KA 1FTOA 4JEOA 4U4XA 2QSXA 5F7VA 3SRYA 4F3SA 3T22A 4LQTA 1LAFE 2WHTA 1Q1KA 1B7HA 4U23A 5CMBA 1NL5A 3SG6A 3OO7A 1US5A 2O1LA 4G77A 1Y4TA 3RT6B 1KP5A 4Z7EA 2ZMBA 1SW4A 5FTIA 4F2OA 4ZECA 3CG1A 1L5TA 3IAZA 2O24A 2O69A 4YKIA 1N84A 1IITA 1QKAA 2DYXA 5H8FB 3DQ1A 4P11A 2XX8A 5J2OA 3RLFE 4IZNA 4IK4A 1R9QA 2ZMUA 3MVYA 4LVQA 3CFAA 1MXUA 3PPPA 3GL4A 3PJBA 4GQOA 1B46A 3GBAA 1JW4A 3O6HA 4IO4A 1ZMGA 1ZGPA 3RQTA 1T0KA 4IO6A 1R1NA 5CI5A 4ELOA 3ZSFA 1CB6A 2X7QA 2UYEA 1LFGA 2B3QA 3IL1B 4JC2A 3D4CA 3T96B 3MW0A 2Q88A 1YTVA 3PIBA 4ZB1A 3MZ1A 4ESWA 3RY3A 3K0VA 1Y9UA 4U1OA 5I58A 4BLAA 1QULA 3C33A 1QUJA 3UG0A 2ZO6A 4W6JA 2PMSA 1UTHB 4KHZE 3CFFA 1QJMA 3KCSA 4ZF5A 2Y7RA 4ZEKA 2OKWA 3SDFA 3IB2A 1SDXA 3C35A 5H8NA 3QK6A 2Y7KA 2HFCA 4W6OA 3C36A 5DU0A 1RYXA 2HCGA 2GFEA 5T3IA 2VVHA 3IB0A 3DQEA 1R6ZA 3KSXA 1SW2A 5ELVA 4ZEIA 5FHNA 4KD5A 2DWAA 4JWOA 2H5OA 3CSBA 3PUWE 4EN1A 1Y3PA 4PFWA 2XX9A 2F7AA 1MS7A 2ZMWA 3LUYA 4LP2B 3O78A 1ZGOA 1EMCA 2OBGA 1TXFA 2VAEA 1DOTA 2HAVA 3AI4A 2P4MA 1D9YA 4ZE9A 2OZZA 1S6ZA 4WEDA 4RA1A 4IK1A 3OMBA 2NOOA 3QIMA 1W7SA 3LA1A 4NWDA 4NWSA 3MZ9A 2OWTA 2CZLA 2R9JA 4B30A 5L9MA 4OFOA 4R73A 2QS2A 1M5EA 4YB5A 3DM0A 2Z6XA 1MPBA 3MP8A 4X9TA 1N0TA 4YB6A 4RK2A 3KCTA 3DQ2A 2AH8A 5AA1A 3CIJA 2A5TA 3RTWB 3JV9A 3H6TA 2A50B 4OMBA 4R75A 3DQ6A 2IE2A 2XXTA 3H03A 2KLFA 3IOTA 4U2RA 4NF6A 1BIYA 1B4HA 1HSEA 1B5IA 1SYIA 4DLDA 2I0CA 4KAGA 5L9OA 3SG5A 4OVJA 1JQFA 3S4UA 4QHQA 1B5JA 3SVBA 5TPAB 3C31A 1XQMA 4YKKA 4W76A 2PXSA 3KFMA 3MBPA 5HBDA 1VE4A 2HQZA 5I58B 3MJNA 5CMMA 2RC9A 4GXSB 2IB5A 1ANFA 4Z0IA 3VLWA 3FV2A 3FZVA 4LUBA 2OKYA 5EBJA 3TQLA 1NNKA 2RH7A 3CD9A 3HN0A 3CFLA 5HZOA 3SKPA 1FQCA 3ST0A 1MQJA 4PPJA 3A3CA 2H9BA 1CE2A 3G3FA 5DRFA 2Y7IA 4W7DA 3LVAA 4W72A 2RKMA 1EMBA 3UK4A 5DEXB 4LQUA 2XXUA 4F1VA 4R6KA 2ZYMA 1XMZA 5EHMA 1HSJA 3GEXA 1J1NA 4KA9A 3U0MA 2HEUA 2QS3A 4YKJA 3T93B 2BJJX 1QKBA 3ZUJA 3DQ9A 4MLQA 3G3KA 3V83A 3B7DA 2E1SA 4JXIA 2YLNA 4KW4A 3RNNA 3UGWA 4XIGQ 2PXWA 4B5YA 4G8HA 2DDCA 1Y3NA 1RM9A 1ELJA 3B6QA 1FCKA 1OQGA 3SSPA 2DWJA 2WKYA 3QYTA 3E4RA 3DQMA 1IXCA 1C4FA 1URGA 3IJXB 2QT2A 4NF4A 4OXVA 2QLGB 3M22A 4IO5A 2QLIA 1EMKA 2D5WA 4YU0A 4ZEBA 1O64A 2UYFA 1G7KA 1I69A 3W1CA 3TTRA 3H6WA 3PPRA 3BXBA 3U0KA 4KF5C 1MDQA 4TOZA 1UQWA 1DPEA 1Y20A 1FQAA 2A5TB 4EF2A 1UTBA 4RK9A 2VD2A 3G3GA 2DOJA 4MF3A 2ZYOA 5DPGA 1O7TA 1TWYA 3PPNA 3IX1A 5H89A 3PD8A 4H65A 2B3BA 3GZGA 1B7UA 4GD5A 2A56B 1XVXA 3EK4A 3T9UA 2H8QA 4DXBA 3BXCA 4R74A 4ELPA 2H5YA 5DY6A 3OENA 3SSKA 3W9WA 1JVXA 4F1UA 1OXDA 4L12A 2B3PA 4H1XA 2XXHA 5CRYA 5DVFA 3OEMA 3I5OA 3EKJA 2VHAA 2Y7WA 2OK2A 1N3WA 1OQHA 4XVPA 2XXPA 1SI1A 2Z6YA 4QFLA 1Y3QA 1UIUA 4XOWA 4H8JA 3U93A 3V5AA 3QUFA 1MQDA 1XAEA 1LCTA 1A7LA 1BKAA 4GXAA 3W9VA 3OSRA 1EMFA 2O6AA 3FATA 1N04A 2DE2A 2M8CA 2VOZA 1JC0A 3FVNA 3IOVA 4RXLA 1ZTYA 4RYAA 4XOVA 2YJPA 3C32A 2NVUB 1MG1A 3TYHA 5EJUA 4DXOA 2V93A 5EXUA 3U8QA 4F18A 4IB2A 4BDUA 1AH5A 2PX1A 4J88A 4Q7RA 3M8UA 3K6WA 4BDOA 2XXQA 4OHNA 2HPWA 2Q9TA 3CD1A 1H6RA 2H9WA 2NXOA 5IAIA 1KYRA 4KCDA 3MAMA 4FE8A 3SEWA 3TUSA 4BDMA 3FXUA 3IP2A 1D3KA 1IUDA 3EHUA 4P76A 1B7ZA 3PMXA 4MLVA 4W7EA 3SVDA 1MXWA 3DQ8A 1UTBB 5F1QA 3TAJA 5A5XA 3G3JA 3GJ2A 1SI0A 3BXAA 5KTGA 3LS3A 3U0LA 2DE4A 3V3DA 4XKRA 5DQMA 2H5RA 3L6GA 3SVEA 4XXUA 3GBBA 1RRXA 3DQ5A 3SEUA 5CMCA 2GW4B 2Q6PA 1TFDA 4AQ4A 4IO3A 1SYHA 4FIMA 4LZ8A 1P1OA 3OO6A 4OENA 2G6EA 1LAHE 1M5FA 2XHDA 1MXYA 2FNCA 5I2KA 4PPKA 1AMFA 3BKIB 2A46A 3PMWA 1HUYA 4OYVA 1A54A 1PBQA 1Q4BA 2G5ZB 2WURA 3KN7A 4TLLB 4KEXA 3T66A 2QS4A 1QVSA 2XD2A 3K6XA 4NF5B 2DUIA 4R2FA 3KJTA 3SVOA 4IK5A 3PD9A 3K4UA 2HFBA 2D21A 1S9TA 3K2DA 2Z1OA 4ONYA 1RKMA 4MBPA 4EULA 2V4EA 4AR7A 2IEEA 3SG2A 1A8FA 5JTYA 3CFZA 3Q28A 2DP8A 2A53B 4Z4MA 3E5WA 1A55A 3JYRA 4QSDA 5ICQA 1MDP1 4G4PA 1NH7A 1YPNA 4E0XA 3LSXA 3DPXA 3U8CA 3U0NA 3M3FA 1FQDA 3ILTB 2AL5A 4H3MA 2Z6ZA 2PYYA 4X1DA 2P1SA 1B05A 3GXAA 1DSNA 1B3GA 1FTKA 4GOBA 2VP1A 4H5GA 5DVJA 1D9VA 1JEUA 1H43A 5DTLA 2Z23A 2H98A 4ELQA 2H5QA 5BUUA 2QLEA 3TMRA 2ANJA 5EXBA 1VSOA 1MOUA 3FJGA 1LFHA 1XT8A 1EMMA 1XA9A 5DPJA 4JSDA 2DD9A 4R6DA 3TFLA 4BDRA 3LBSA 4ZEFA 2YPNA 3H6UA 3HO7A 2DXRA 2XXXA 2P2AA 4MFIA 1Z7ME 3ZKKA 4NE4A 5CBSA 3VE1B 1OIBA 5HM4B 3SS0A 4W77A 3HCQA 4RPOA 2AWJA 5DQBA 3N26A 4OJ0A 4H5FA 4JGEA 4NMYA 2NWJA 1Q4CA 4RTCA 3U92A 1QUIA 4UTSA 3EHTA 1MY2A 1KYPA 3HSTA 3H06B 3EF7A 3IR1A 1FQFA 1VFDA 4ZE8A 3Q29A 4F3PA 2F6GA 4G8MA 2VGQA 4G8NA 1ZUXA 3ED8A 3VLUA 3CB9A 4W6IA 3TQWA 4LONB 1XOCA 2IA4A 3OXNA 3PJ5A 1FQBA 2YDZA 1Q4DA 4IK3A 4QF9A 3AXFA 2OTEA 2DWIA 3K1PA 4F31B 3I3VA 4Q5TA 3DQAA 4ISUA 2I3WA 3K1NA 3UN6A 4WKMA 3NT9A 4EXKA 4THIA 1US4A 1NNTA 4Q9WA 4I1DA 3PPQA 1URDA 5DTZA 3MWBA 5DYHA 5I57A 3TTMA 1I6BA 3R6UA 3WCKA 3TCHA 3TTNA 3FVGA 2XXIA 1PDAA 3IR8A 3ST3A 1KWHA 1HSLA 4GOTA 2G6XA 1LLSA 3U8PA 4WXJA 1B2HA 3GJ1A 3BFUA 1MH4A 2O29A 2ONSA 4MH5A 2I3VA 3MQ9A 4KQPA 4KW9A 2WSOA 1F0BA 1P1NA 4W7AA 3DELB 4R6YA 3EK8A 1B3EA 4R2BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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