3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
1QUJA 1BFPA 4LZ8A 3O97A 1F09A 1FQDA 1I69A 3MPLA 3RY3A 1A99A 3O66A 5BTTB 2Q89A 3FASA 1GL4A 4OESA 2VADA 4ORNA 4C1UA 4EN1A 1LFGA 4BDNA 4ZZAA 4HVFA 3F11A 3LVDA 3A09A 4R6BA 2QLIA 5AA2B 2NOOA 3EN3A 5DQBA 3FUZA 3FVOA 4Q5TA 2V93A 4W7XA 3CIJA 1W7UA 2O1MA 3E3KA 4LZ7A 1P1NA 3PUVE 4H3MA 4L12A 4W6LA 2P4MA 1Y4CA 3UG0A 1H44A 2QJEA 3IORA 4U2VA 1NL5A 2ZMBA 4TZGA 2V3TA 4POWA 1LB8A 5KDTB 1HCJA 2G6XA 3PPOA 3SVNA 3SVRA 5I59B 2RCAA 4F1UA 3USDA 1IXCA 1JW1A 1NH7A 3SSYA 4K3FA 2H5QA 1SI0A 2UVHA 2ICRA 2V25A 1FW0A 4IGRA 1BP5A 3WCKA 3O28A 4W76A 3Q26A 4PE5B 4OJ0A 4Q9WA 1OIBA 3U93A 2VD2A 2RF1A 3GJ1A 1ZKBA 5CBSA 2UVIA 4AQ4A 1QVSA 4PQJA 2NXOA 1XA9A 4W74A 2ZNSA 5AA1A 4XKNA 4JC2A 1W7TA 3FGSA 4I62A 2B3FA 4W6JA 4JRBA 4GD5A 4ZEKA 4W6BA 1NKXA 4XKQA 1B3FA 1MQGA 2F7CA 3S4UA 2A50B 4O3CA 5KDTA 1P1UA 1UIUA 3SV5A 1B5JA 3T9HB 3S9MC 2Z23A 1D3KA 1S9TA 4EMQA 1Q4AA 1VE4A 3CRBA 1N76A 3B6TA 4Q9XA 3EKJA 3IJOB 4NF6A 4GRKA 4RYAA 2F34A 3RT6B 4BDRA 2HPWA 3C4MA 3P8UA 3N6UA 1EZ9A 4P1QA 3U0NA 3CGLA 1JBYA 3CR9A 3DQHA 3DQUA 1FQBA 2HGYA 4MLQA 3PD9A 4NF4A 4IO5A 4ELRA 2F6GA 1DOTA 1SW4A 4ESXA 2P1SA 3SEYA 2QZ0A 4LP2B 4TOZA 3LVAA 1LAFE 1ZBMA 1ZIUA 1B9CA 1KP5A 4XTCQ 3KN3A 4HQCA 2DWIA 4ZEIA 3LS3A 3M24A 5K2XA 1EU8A 1SW1A 4RPOA 3SVUA 3LSLA 2THIA 1P1WA 4XKRA 4PFWA 3UIFA 1SI1A 2QS1A 4PPJA 1JVYA 4KHZE 3D4GA 3MBPA 1II5A 3PMVA 4JEOA 4JSOA 1ELJA 2DP8A 4MBPA 4IY6A 1FQFA 3VFJA 5H87A 3SG6A 2AWJA 4I2YA 5EXBA 2B3BA 4G68A 4IO6A 3M22A 1Q1KA 1A40A 5H8NB 1MXVA 4F39A 3CFHA 3CFLA 1B0HA 2DWHA 4X1DA 1W7SA 3DLNA 1QYQA 3I5OA 4RTCA 5LK4A 4DXQA 4G8HA 3OXNA 1N3WA 1B4ZA 4ZECA 3IOTA 3DQ1A 3OEMA 1B9JA 3EQ1A 4OERA 3M8UA 3T96B 3TFLA 2FZUA 3I6VA 4GQOA 1A55A 4YMBA 2UVJA 4IO3A 4W6TA 4GOBA 1B7ZA 3M3KA 3DQ7A 1GFLA 2D3IA 5ISUA 3MGFA 2GX2A 5L9MA 3SVSA 5H8FA 2O7UA 1F0BA 1GGGA 4U22A 2P2AA 3SESA 3EHUA 2NVUB 1ZGPA 2IB5A 4Z4MA 5HZOA 3K2DA 5EHMA 2XXVA 4KF5C 1TFAA 2Y0GA 4G8NA 2AWKA 5AA4A 2RKMA 4W7DA 5FHMA 2VVJA 4OYVA 1Z1QA 3DQDA 3GBBA 2E1SA 5H89A 3QUJA 4XXUA 4W7FA 2WHUA 2DD9A 5A5XA 4P76A 3C33A 2NWJA 2WKYA 4N13A 5ICTA 3H6UA 4W73A 3O78A 1YHGA 4C1TA 5L8DA 2WIQA 4GXAA 3S9LC 1B40A 1JVXA 4X9TA 2WHSA 3ILTB 4BDOA 1B46A 1IXIA 3HSTA 2IEEA 3S05A 4RK2A 2OCUA 4W6IA 4ECFA 2Y7WA 1TFDA 2AYSA 3N26A 2HGDA 1POTA 2B65A 2AHAA 1FTOA 3LSFB 3TUSA 3G3IA 1XMZA 2ZO7A 1D9YA 1HSJA 3O6IA 4O3AA 4ZEDA 3NT9A 3SRYA 4YKIA 2GRVA 5I56B 3ECRA 3FV2A 4KPTA 1N04A 2A5SA 3KJ7A 3RT8A 4U2RA 2AWLA 2O51A 2HQ0A 3HV1A 3SG2A 3LUYA 5I84A 2YFPA 1R1NA 1ZTYA 2WHTA 4DLDA 4ANJA 3BKIB 4YZZA 1USYH 3TCFA 2DQVA 3DQKA 3A8SA 3DQ8A 1QULA 4H0WA 1H4UA 1Q4EA 3E4RA 3K6UA 3E5TA 4ESWA 2QLGB 4R75A 4OFOA 1AL3A 3KOTA 1B51A 2REGA 2DS9A 2BJJX 2HFCA 3VHTB 3C35A 2GW3A 3B7DA 3TMGA 3ONMA 1Q4CA 1BLFA 2QS2A 4RYSA 4F22A 3ED8A 5CMBA 2CZLA 2POXA 5JK4A 3U92A 3KCTA 4H5GA 3MWBA 2Y7KA 2Z8FA 4PFUA 4W6RA 4DXMA 3EHSA 3OSQA 3FATA 3NEZA 1ANFA 5DPIA 3MJNA 3BXAA 4GLIA 4N6PA 5H8QB 2I6EA 4PFEA 1MQJA 3KGCA 4LZ5A 2FNCA 2OBGA 4NWDA 5TPAA 4BDQA 4QRZA 4G68C 5IAIA 2UYEA 3VHTA 4YB6A 2QU1A 4EULA 3OSRA 2H5YA 4U1OA 4GESB 1PB8A 3SVDA 1MXXA 2VHAA 3C34A 3SSVA 4W75A 1Z7ME 2HXWA 1MOVA 3CSGA 3JYRA 1RMOA 3MQ9A 5IKBA 3PU5A 4YKPA 3H6WA 3W1CA 2DWJA 1JNFA 1I6QA 2ZYNA 1NNTA 3I19A 1BTJA 1JETA 2HCAA 2WURA 2V84A 4F2OA 4P0GA 2YJPA 4W6PA 4JWYA 4R2BA 5KCJA 2Z8EA 3PMXA 5HM4B 3EK8A 4I1DA 4E0XA 5H8QA 4IGTA 2EMOA 5H8HA 4R6YA 1EMFA 2IE2A 1IXGA 2DE2A 5EXUA 4F3GA 3TYHA 2UYFA 4F31B 4NWSA 4DXPA 5H88A 3PJBA 4PP0A 1SW5A 2I58A 3GEXA 4POXA 3LC8A 4GIZA 3NT3A 4EF1A 2DWAA 1LFHA 3P7IA 4H5FA 4OZ9A 2PT2A 3SS0A 2G3OA 2G3DB 4W7RA 4ONYA 2PVUA 3N6TA 2Y7IA 2C9IA 1YTVA 1EZOA 2H25A 1HUYA 1FTJA 1OVBA 3WAFA 3TQWA 3PD8A 2UVGA 1MY4A 2HQKA 2R6GE 4IY5A 4OFLA 2ABHA 4WEDA 1B3LA 3EK7A 1IUDA 4FATA 4DZ1A 1XAEA 4MLVA 1M5CA 1R9LA 3IR1A 4W72A 2Z6ZA 4U21A 4GL0A 3SVBA 1S50A 2ZNTA 3A3CA 3V89B 1B7HA 4LQUA 1LAXA 4XVPA 4LJCA 1Y3QA 3UN6A 3V3DA 2VGQA 4OMBA 4G77A 4I8CA 3BFTA 3RUMA 2PYYA 3FJGA 5AA3A 4JDFA 2F8DA 3D4CA 3DP4A 4W6KA 4PPLA 4ZIOA 1EMBA 5JEIA 1JEVA 3DP8A 2OKWA 4QFKA 3GB3A 3FJ7A 3FV1A 3IOUA 1JW5A 2XXPA 2WSNA 2Y7PA 2V3UA 1QUIA 3O9PA 1YFPA 4H47A 1YZWA 1MH3A 4HE4A 1LAHE 5EXCI 5LTRA 4KF5A 2I0BA 1GTKA 3VLUA 5DVFA 3V8XB 5EHUA 3AKOA 2F7AA 4WXJA 2H9BA 4JWOA 1NFTA 2REJA 1H43A 1C4FA 3DPWA 3H1RA 5EB6A 2YDZA 2XXQA 1F9BA 3PIBA 3P28A 3S9EA 4R2FA 2AWMA 1MQDA 1CE2A 4OTEA 1JW4A 2ZYMA 2DVZA 2XXTA 3ST4A 4KCDA 4ZZEA 2XXIA 5CMMA 1ZMGA 3U0LA 4NF6B 5FVIA 2XXHA 2Q88A 4IK4A 4ZS9A 4W6CA 5AE4A 1LBBA 4LQ2A 4XGYA 4EUOA 5DTXA 2DE3A 2G93A 4QFLA 2H5RA 3K0VA 3ST2A 2O68A 3TQLA 1IITA 3RN8A 4OGSA 2O69A 1IIWA 4FIMA 4NF4B 3TTRA 5J1DA 1EMMA 4OQWA 4R6KA 4W6GA 2V4EC 4GFRA 2BTJA 2XXUA 3TAJA 3H06B 3CI8A 2X7PA 4KEXA 2G2SB 3SVOA 3ZTFA 3V83A 4HCWA 1QKAA 5B70A 4OEVA 4DIGA 1G7KA 1MM6A 1I6BA 3RNNA 3HPIA 1FQEA 5DRGA 2HZKA 2OK2A 5DRFA 4QFPA 1UTHB 3QSLA 3TPAA 4LQ5A 1PEBA 1QY3A 1YHIA 1MH4A 4G68B 4KGFA 2EMNA 4FEDA 3TKDA 1QUKA 4I9DA 1MY0A 5DY6A 2O29A 4DXOA 1USYE 1SDXA 3O29A 4U1ZA 1DSNA 2ZO6A 3SEUA 3FXQA 3TMTA 1B1XA 2I4BA 4DXNA 3I3VA 2Q9TA 3SSHA 1ZJLA 3RPWA 2DXYA 3S9NC 2H4IA 2OWTA 1EMKA 3M3LA 2Z22A 3K1PA 1N7XA 4JGEA 1WDNA 5F9GA 4DXUA 3EVVA 3UK4A 1MPBA 5H8FB 3RTWB 2RINA 1UTHA 3DQ5A 4J8AA 4LW5A 3LSWA 4F18A 2PXWA 4Q8RA 3L6GA 5AA4B 2OJKA 4KI0E 3IP2A 4FEBA 5ICQA 4HQ9A 3SSTA 1TWYA 3IR8A 2QL3A 3B6QA 3RGYA 1T0KA 4H8JA 5CRYA 1B3HA 4JBZA 1RM9A 3VV5A 1SYHA 5A5XB 4F3PA 2C9JA 2QS3A 3CVGA 5FVGA 5HBCA 3O77A 3OEKA 4P0IA 4OY4A 3BXBA 1YPNA 3G3KA 5K2YA 3QXMA 3DQMA 4NWCA 3W9WA 3N5LA 3QAXA 1XC1A 4F3BA 3OELA 1EMCA 3WLCA 1I6AA 3MAMA 3H03A 4QFNA 4XIGQ 2DDCA 2A47A 1QKBA 1LAGE 3U8QA 5JTYA 1N7WA 1QYOA 3SG5A 2A48A 2XXYA 3E9XA 4TLLB 2GX0A 4EXKA 2AL5A 1NMUA 3GZGA 2B3QA 2G6YA 3DQCA 4EDPA 2F5XA 2ARLA 4ISUA 4W6NA 4RXLA 3ZKLA 4KR5A 2G16B 4DE8A 4HTGA 4BDUA 2OWSA 2WSOA 3AI5A 2YPNA 4AB6A 2D5WA 4W6DA 4NF8B 1B05A 4WEPA 3IO4A 3PJ7A 5CC2A 1B52A 3FVGA 1B1HA 4C0RA 2UXAA 2IA4A 2FA7A 2HFBA 3R7XA 1N84A 4N3DA 3VVEA 1PB7A 2XX9A 5EYFA 2HAVA 3UORA 4IO2A 3TDJA 5HW9A 4KFQA 3L6HA 1SQYA 2GW4B 3IB2A 4F2QA 5I2NA 1B32A 4ZEFA 4ZB1A 2O7IA 3TELA 4W6FA 5AA2D 4IK8A 3UGWA 3VLVA 5EB7A 5CI5A 3TCHA 4ZF3A 3IL1B 4OHNA 5F1QA 5BWJA 4G4PA 3HN0A 3S2VA 2OTBA 5DU0A 2HCGA 2P0SA 1LB9A 1HSEA 3BFUA 4R72A 4R73A 4DXIA 4HS7A 3OO8A 3K02A 3SSPA 4ZEBA 5J2OA 4PFYA 3ODBA 5LOMA 3TTLA 4NF8A 4AS8A 2Y84A 1EZPA 5B7DA 1B5HA 2H98A 4YB5A 2M8CA 2Q2CA 1S7YA 1SD3A 3CD1A 2VVHA 2WISA 2QLEA 2NUVA 4PETA 5L9OA 1EH3A 3DQEA 5DTLA 3EVUA 3PPQA 1IXHA 2A5TB 3K00A 2F36A 3TTKA 3JV9A 5TPAB 3G7WA 4W69A 5KTGA 3OO6A 3KSXA 1N0TA 2V4EB 2A54B 2X7QA 4B5YA 4QSDA 4GWOA 3O2AA 5HBDA 4DCYA 2HRSA 2A56B 1IQ7A 1N3XA 1UQWA 3SG3A 2R9JA 1OXFA 3DQIA 1URDA 2I4CA 3BBRA 3KCSA 1ZUXA 4ELOA 1H3DA 1L5TA 2ALUA 1XS5A 3KZGA 1TT1A 5TU0A 3QYTA 1D9VA 1LSTA 2DOJA 4Z7EA 3DQNA 3DQOA 3W1DA 1FQCA 1MS7A 5KCJB 3O6GA 3C9HA 4L1IA 5H8HB 5DPJA 1P1QA 2A5TA 4OETA 3RTFB 3WAEA 5TP9A 1OQHA 2DUFA 3LA1A 1MY3A 3FXUA 3O6HA 3PUYE 3RWTA 3SVEA 3ZS6A 4GVOA 3KN7A 4NMYA 4ZDMA 5DQMA 3LF3A 3VXBA 1LLSA 1MM7A 1XVXA 2V4EA 4JF9A 4OENA 1LBCA 1Y3PA 1VSOA 1YCJA 3K1MA 3KN8A 3NF0A 1PDAA 1JQFA 4OWDA 3U0MA 4BDMA 4KPIA 3MVXA 5H8SA 1QJMA 4XOWA 1JC1A 2VD3A 3EVRA 3ZUFA 3MVWA 4QFOA 3PPRA 4W6UA 4TZAA 4R9FA 1A7LA 5FTHA 1Y4TA 3C32A 1UIVA 4UACA 2DUIA 1VFDA 3E13X 2DXRA 3LBSA 1JEUA 4W7EA 2DYXA 4IO4A 1JC0A 2DE4A 2ZMUA 4RPNA 4KGEA 1YJFA 1MOUA 2F97A 4YKKA 3PUXE 3DM0A 4RYWA 1HSLA 4FJPA 2I48A 3CSBA 1Y1ZA 4Q30B 1P1OA 1SW2A 3SG7A 4U4XA 5DEXB 4PPKA 1B3GA 2ZNUA 5DVIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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