3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
3EK4A 3PPQA 2OCUA 3GLBA 4LATA 4L12A 4IO4A 3PV0E 4JXIA 3PJBA 4U4SA 4JWYA 5KCJA 4GESB 2HAVA 1XVXA 3DPXA 1B3FA 2CMOA 1T0KA 4W69A 3E13X 3K6XA 2O51A 2Z8DA 3ONMA 4LQTA 3RT8A 3CIJA 4G77A 3CFZA 2ESNA 1B4ZA 4OWDA 2XXYA 2GX0A 3V89B 1IZ1A 4LA9A 1EH3A 1FTKA 4W7AA 1US4A 3LSFB 1A55A 4KYSA 2DDCA 3OO6A 2VHAA 1RM9A 3EKHA 2XD3A 2ZO7A 1M5CA 2Y84A 2H8QA 4DXCA 1MQGA 3FXUA 2XHDA 3DQAA 1SW5A 5AE4A 1YJ2A 3HCQA 1NKXA 5EHMA 1MY3A 4IO5A 1EMBA 3AXFA 5EYFA 5H8HB 5I57B 3TEPA 3VVFA 1UISA 3IJOB 4DE8A 1NNFA 2Z1OA 1EMFA 1Z1PA 3WLDA 2P1SA 3BXCA 4Q7UA 2VOZA 4NEDA 1F9BA 5B7DA 1JBZA 3CRBA 3PU5A 4F3BA 1Y20A 3OXNA 3K1KA 4R9GA 3I3VA 1P1QA 3EK7A 5I56A 1S7YA 4PP0A 5L9OA 3EVVA 1RMPA 1P1WA 5BT0A 1YFPA 3MZ9A 4H3NA 1CV7A 2GHAA 4JFGA 5DTBA 2G6EA 1USYH 4QFNA 1MY4A 3O9PA 4H3MA 3GEXA 3K01A 3VV5A 3DQHA 4MLQA 3AKOA 1BTJA 2PYYA 3SSKA 3ODBA 5J1DA 1NH7A 4ESWA 1WVJA 1TWYA 1MYWA 1URDA 1JNFA 2EMDA 3NEZA 1DSNA 1A7LA 1UTHB 4N6PA 1Y1MA 4W6GA 1MY2A 4EUOA 5HZUA 1FTMA 3T9XB 4GWOA 5F7VA 2A50B 3EVRA 3Q28A 4FIMA 1GV8A 1AL3A 4HW8A 4DLDA 3HSTA 3SEVA 1NFTA 1CB6A 2O6AA 5I2NB 4MBPA 1QVSA 3SSVA 5H89A 2QL3A 4OZ9A 3DQ3A 4JC2A 4OMBA 3G3FA 1OXFA 2QJEA 1MY1A 4N13A 3AI4A 1KP5A 5DPJA 3LSAA 5H8FA 2G2SB 1FTJA 2V4EC 3ZUFA 2H99A 2G6YA 3PPOA 3HHGA 4G68B 2ZYMA 1PB8A 2G93A 4G68A 2F7AA 3V5AA 3OO7A 1SQYA 2DUEA 1XSSA 4W6FA 4KFQA 1B7UA 4MH5A 1OLAA 4YKIA 4ZF5A 1NMUA 5AA2D 1JVYA 4GOBA 3OENA 3S05A 3MGFA 4LQ2A 4QRZA 5DVJA 4H8JA 4KQPA 3C32A 2FNCA 3OEKA 3CVGA 5FHOA 3B6WA 1VFEA 4WKMA 3O78A 1LB9A 2VADA 2DWIA 3PD9A 1XQMA 1MM7A 1O7TA 3T93B 4IK1A 1HSJA 4YU0A 4LQ5A 3FASA 4I9DA 4EN1A 3EPEA 3I6VA 2WHTA 3SS0A 5FHVA 2GW4B 3SEWA 1S6ZA 5TPAB 4FEDA 5DRGA 3PUVE 2O24A 1ZU0A 1LAHE 4C1UA 1II5A 3IB2A 3S9MC 5EHSA 4W6SA 4H1XA 1ZBMA 3RUMA 5L9SA 1DTGA 2E1SA 3UP9A 1DMBA 4W7EA 5I58B 2ARLA 1QULA 1JQFA 5DPHA 3PUZE 4H48A 4P0GA 2XXRA 5HPQA 3DELB 1QYFA 2Q8JA 4EF2A 1SYIA 2XX8A 3TTMA 1Q4AA 1UIUA 1POY1 4ZE9A 2AWJA 3TZAA 3K00A 3LBSA 3UK4A 2O2BA 4YB6A 3LSXA 1USYE 4F39A 1BP5A 3PD8A 4GF6B 3M24A 5T3IA 1EMKA 4KI0E 3CG1A 5IAIA 3IB1A 2I6EA 3TODA 1GGXA 4G8HA 1LFGA 5FVFA 3O29A 1AIVA 2DS9A 3KG2A 1Q35A 5J2OA 1QYQA 4EMQA 1FQDA 1SI0A 4DXOA 3H03A 4KD5A 3NEDA 4Z0IA 2XXVA 2FL1A 3TKDA 3FVGA 2RC9A 3U0LA 2H98A 4GXSB 1OVTA 2QS2A 2YLNA 3H1OA 4NF4A 5F1QA 1ZTYA 4ZB1A 2VVHA 2VD3A 4KPIA 4ZFSA 3VLWA 4NWCA 4ZZAA 4YKPA 1YHHA 4DXNA 4YB7A 4KW4A 2DUHA 3DQ8A 1N3WA 3H3GA 3UN6A 1B1XA 3RTFB 3ZULA 2GRVA 3PPRA 2A47A 4RK9A 2H9BA 5CC2A 4IK3A 4OVJA 5ICTA 4IK9A 2F35A 3TTRA 1EMAA 1FQBA 3KEIA 4IGTA 3CG3A 2HCAA 2FA7A 4BDMA 1YHIA 2QRYA 1EZOA 2XXIA 2YE0A 4G2ZA 1MH4A 1B3GA 3QUFA 2AWLA 3BFUA 5DQBA 1QUKA 4PFUA 1IXIA 1N3XA 3SSYA 1Y4CA 3TTLA 4W77A 3ZKKA 1YJFA 4X1DA 4TOZA 5FTIA 5KTGA 2F34A 4OYVA 2XXXA 3RQTA 4RXLA 3PUXE 2DXRA 5JK4A 4DXMA 1OQHA 1YAEA 1HSEA 4GOTA 1BKAA 4PFEA 1IEJA 4ZECA 2ZMBA 4GXAA 3D4CA 1Q1KA 2GFEA 3O6IA 4NWSA 5KDTA 3VHTA 4W73A 2Z8EA 4ISUA 1ZGPA 3E4RA 4GRKA 1RYXA 1EU8A 1JW5A 4H3LA 1JEUA 1Z7NE 1Y4TA 3C35A 1Y3PA 3C34A 3SG7A 1Y1ZA 2O84X 2HQ0A 1I6BA 3FUZA 4ELRA 3WAFA 2ZNTA 3P8UA 5AQBB 4DXUA 2Q2CA 4XKQA 3KGCA 4PPLA 4QFPA 3TTKA 3IK6B 1VR5A 4Z4MA 4KGFA 1IIWA 2WSNA 1ZGQA 4M4GA 4BLAA 5AA4B 1B46A 3LA1A 1MXUA 5EXBA 4QHQA 4L1IA 4Q9WA 3OO8A 5AA3A 2B3FA 4EXLA 4G68C 2POXA 3H4ZA 3K1PA 4FECA 2DUFA 4DCXA 3U0MA 4W7DA 1UTBA 2RCAA 3KFMA 3SERA 2AL5A 4KPTA 4H8IA 4ZEBA 1VFDA 4OJ0A 4XOWA 4R6BA 2W7YA 1RMMA 3IAZA 4NF6A 3DPWA 4P76A 4DXIA 1LCFA 5H8NA 3ILUB 4XIGQ 2WIQA 4OHSA 2DOJA 3CBEA 2PVUA 4W6DA 4X48A 3U72A 2HCGA 3BKIB 3FATA 4I62A 1JW1A 1MPCA 3R26A 2UYFA 3DQLA 3H6WA 5HZSA 2A46A 3GB3A 3FVOA 1Q4DA 2Y7RA 1M5EA 4LJBA 4F3SA 3H1RA 3K6WA 2GHBA 4YMAA 1JVXA 1B5JA 3U0KA 4PQJA 2V4EA 1WODA 4IO2A 3PJ7A 3FD3A 2RINA 4XVPA 3ZUJA 3E9XA 1XVYA 3GZGA 4LJDA 4KF4A 3P28A 1O63A 1HUYA 4XKPA 2FYIA 3UORA 2H5PA 5H8QA 5DQMA 4F31B 3A3UA 3VVDA 1GFLA 4XKRA 1PBQA 3SG6A 3DQUA 2OK2A 4B30B 3T9VA 2QS1A 1XHYA 4Q5TA 1P1NA 2REJA 2V3UA 4IY5A 2X26A 3FZVA 2R9JA 1PB9A 1RRXA 2UVJA 2WKYA 3DQ2A 5I2KB 4OXVA 1Q4CA 2WISA 5FVIA 1KWHA 5H8HA 5I2KA 1I6AA 3FIRA 3SEUA 1B1HA 3SG3A 4ZZEA 3HV1A 1DPPA 3N5LA 4F2OA 3PUYE 4JWXA 4YB5A 4I8CA 5DTYA 2XD2A 1Z1QA 4PPKA 5KZTA 1S9TA 1QY3A 1LBCA 2QLEA 3T22A 3V3DA 2DSFA 3TAJA 3OELA 2QS3A 4JEOA 5TP9A 2A54B 2HGDA 3FJ7A 3GJ2A 4FE8A 3ST0A 1MXXA 1EZ9A 3K6VA 4IO6A 1Y9UA 2P0SA 3SSHA 1MOVA 2VAEA 3O6GA 3EF7A 2RCBA 1W7SA 4RPNA 2FZUA 1D4NA 4ZS9A 2QZ0A 5DVIA 4LJCA 3K6UA 1B3EA 2THIA 5FVGA 2VP1A 4Z7EA 2DE4A 2O29A 1AOVA 4ELPA 2A53B 4Q7TA 3T9UA 3TUSA 1ZKBA 4ZIOA 3EK8A 3LSWA 1B0LA 1JW4A 4IK8A 3T66A 3WAEA 2FWQA 2GH9A 1LCTA 3ECRA 4TLLB 1FQFA 4ND9A 3O66A 4OTEA 2F8DA 3ST2A 2QSXA 1JBYA 4ONYA 1N04A 3EQ1A 3Q25A 2QLGA 4UACA 3PUWE 4LUBA 5EB7A 4LQUA 5JTYB 3GL4A 4RNSA 4J8AA 3MVXA 4DCYA 4IB2A 5F9GA 3RWTA 4HCWA 2H9WA 3ST3A 3CFXA 4UA8A 2Z23A 3SVUA 4F3GA 2Q9TA 1LB8A 4XOVA 4W6JA 1XA9A 2O68A 3FJGA 2I3WA 4DIGA 1B0HA 2WHUA 2V93A 2YPNA 4NF8A 3TYHA 1QJMA 1QUIA 4J88A 2ZXTA 3CFHA 4W6LA 3MVYA 2R71A 5BQLA 4JSOA 4AB6A 2ZMWA 3RWAA 4YAHX 4U1OA 3JYRA 1H4UA 2ZYOA 3KZGA 1MDQA 4U23A 4QFKA 3MP8A 1SVXB 2DDDA 1MRPA 5DRFA 5FHMA 4DKMA 3M22A 4POWA 4W6NA 1Z7ME 3C9HA 2DWJA 1FW0A 2YJPA 4W6MA 1HSLA 4BDUA 4OFJA 2F97A 3U8CA 3CD1A 2DE2A 5H8FB 3T9HB 4RK2A 3RN8A 3LVCA 2ANJA 1SW2A 3CD9A 3DQ1A 3EN3A 3OOAA 4R2BA 5LK4A 5EXCI 3PPPA 5L8DA 1FCKA 2F7CA 4W6OA 1IXHA 3U8AA 4F1VA 2Y0GA 3BXBA 5H88A 1B6HA 5EXUA 4RA1A 2UYEA 3MVWA 5EB6A 2H5OA 2A48A 2F5XA 2PMSA 3C33A 4LZ7A 1F0BA 3PJ5A 3RY3A 1SYHA 4H65A 1US5A 4IZNA 1QUJA 3QYTA 3UA8A 2QS4A 1A54A 1MQDA 4OENA 3V8XB 2HQKA 4H67A 1N76A 2ONRA 5DTZA 3EHTA 5B70A 4W72A 1IITA 2HFCA 4JRBA 1QXTA 3WLCA 1GGGA 1LAXA 4LVQA 4OETA 4DXBA 4W6RA 1N84A 3MVZA 2HJOA 2XXTA 4RYAA 1H43A 4QSEA 3TCHA 4W75A 3HO7A 3IOUA 1M5DA 4KW9A 4PFYA 5H8QB 3SEYA 1EMLA 4ZINA 2HRSA 1B5IA 5H87A 4LZ5A 3AI5A 4X1BA 4ZF4A 3TCFA 4ANJA 4TLMB 4R6KA 1EZPA 3O28A 2H4IA 2O7IA 3MPKA 4O3BA 3MWBA 1QYOA 3K1MA 2HPWA 4Q30B 2DYXA 3GJ1A 1G7KA 1IXCA 2CZLA 2IEEA 4P0IA 3GBAA 4R75A 2VGQA 1IQ7A 1JEVA 3SEXA 2B3QA 2OKWA 1NNKA 4IGRA 4OESA 3CSBA 3MUQA 3DQ9A 1W7UA 1H76A 4YKJA 3DP8A 3QUJA 2PX1A 4MFIA 2V3TA 2OZZA 2XXWA 2XX7A 5CMCA 3V83A 1FQCA 3VFJA 4U21A 2X7QA 1PDAA 3FVNA 4PPJA 5CRYA 2EMOA 4MF3A 1GL4A 2M8CA 1EMGA 2I0CA 2Q6PA 3VE1B 3TMGA 2H25A 3R6UA 3H06B 3CGLA 3TDJA 5I59B 1TT1A 1R9LA 4U2RA 3THIA 3SESA 1GTKA 3N6UA 5DVFA 4W7RA 3VICA 1JC1A 4F19A 3M3LA 4GD5A 4ZDMA 4GFRA 3PMVA 1P1UA 4BDLA 4DDDA 2DVCA 2V3QA 2HZLA 1LAFE 1H45A 2A52B 3MP1A 3O6HA 2GX2A 2Q89A 5LTRA 3FVKA 3SVSA 2I0BA 1D9VA 2DXYA 1MS7A 4H5FA 3LVAA 1N0TA 4W6HA 4KGEA 3CB9A 4M1VA 2DD9A 2O1LA 1UQWA 4N3DA 2RF1A 2VZXA 4RYWA 3I5OA 3R7XA 1M5FA 1PEBA 2G29A 3KJ7A 3KOTA 3P7IA 1YPNA 4P11A 1EMMA 3FGSA 3T96B 1XC1A 3VXCA 4KAGA 1I6QA 2Y7IA 2DD7A 2Q57A 3A09A 5DEXB 4GF8A 4YICA 4THIA 3D4GA 3DP6A 2EMNA 1UTBB 3ZKLA 1BLFA 4W76A 3C4MA 3LUYA 2DUGA 1YHGA 2QLGB 2Y7WA 5CBRA 5EHUA 2NOOA 4YKKA 4ELOA 1B51A 1A99A 1AMFA 3U8PA 3IL1B 3EVUA 3MAMA 2QLHA 1OXDA 1B5HA 4EQBA 2IB5A 5DPIA 3M8UA 5I2NA 4HQ9A 3S2VA 5IKBA 1UTHA 3TMTA 3SVNA 3EVPA 4XKNA 4ZF3A 3M3KA 3SVOA 3FV1A 5ITOA 5HGEA 1LLSA 4DXQA 2PBWA 3OEMA 2YE1A 1NNTA 2OWSA 3RPWA 4FORA 5I57A 3IOWA 2O1MA 1XMZA 3UG0A 3U93A 3PGFA 5DEXA 3DQ5A 5DYHA 3EHSA 3N94A 3GBBA 3IOVA 1OXEA 3NF0A 1MQIA 3K0VA 4HVFA 1MPBA 4DXPA 4JBZA 1SDXA 3SETA 4GLIA 1FQAA 2F78A 2A5TA 3IP2A 1MXZA 4W6IA 3O2AA 4KYEA 3QXMA 4Q8RA 2DWHA 2H5RA 1EMEA 4NF5B 3W9WA 1DPEA 4KCCA 4F29A 2I48A 4KA9A 5ICQA 5BWJA 1P1OA 2R6GE 4AB5A 4PFTA 3W1DA 4OEVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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