3OSQA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 175
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
614
structure length
607
Chain Sequence
b'IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENHLSHNVYIMADKQKNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNGGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRIT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
total genus 187
structure length 607
sequence length 614
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osqA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osqA01
1B1HA 1Q4BA 2O51A 2NXOA 4KGFA 1B2HA 4W6AA 1JBYA 2OKWA 4W7CA 3H6TA 4IK4A 1PC3A 1EZPA 3N5LA 3DQMA 4XXUA 4YMAA 3K0VA 4W6GA 3PJBA 1QYFA 3KN7A 4KF5A 1S6ZA 4GL8A 2WHTA 3M3KA 3PPRA 2VHAA 2PYYA 4W72A 1Y20A 1Y1MA 3IAZA 3K1KA 4BDLA 1KYPA 3I3VA 2AH8A 4GXAA 2ABHA 2XXPA 3CD1A 1FTLA 3OELA 1M5DA 4OTEA 4GXSB 4BDUA 4OZ9A 2Y7IA 2A53B 3PUXE 4W6TA 3SVBA 2DDCA 3LF4B 4HS7A 1QYQA 4H0WA 1B3FA 1ZKBA 2UYFA 5KDTA 4FEDA 2OZZA 4HCWA 2VD2A 4NF4A 4RK9A 2QMXA 1B0LA 3G3IA 1QW0A 4B30B 5I56A 3ST2A 3QK6A 3O66A 2WHSA 4ZF5A 2C9JA 2HAUA 3UP9A 5FTIA 1F0BA 2A50B 2AWKA 4EDOA 1GVCA 4I2YA 2D3IA 4NEDA 3TQWA 3KJTA 2ZYOA 1EZOA 2OK2A 3ZSFA 4RK2A 5KCJA 4QRZA 3K2DA 3K6VA 2GHBA 4XGYA 4GWOA 5FHNA 3H6VA 2QZ0A 3MUQA 3KFMA 1PDAA 1ZMGA 2QS1A 3D4GA 3O6IA 3V3DA 3EF7A 2RKMA 1GGGA 4ECFA 1RMPA 4MH5A 3RTWB 2O29A 3VHTB 2OLBA 1ZGOA 4ZZAA 3O6HA 3CFZA 1LFGA 1R6ZA 1MY2A 4NTLA 2HCGA 3TTMA 1XA9A 3MZ9A 2IEEA 5TP9A 1ZGPA 3S4UA 4ZFSA 1SQYA 4ORNA 4F39A 2ZYKA 4F22A 4X48A 1NH8A 3NT3A 5JEIA 2XXRA 3RWAA 1ZTYA 3EN3A 3B6WA 2P4MA 2H8QA 1M5CA 2FL1A 3GB3A 3H03A 3H06B 3U0NA 3KJ7A 5JTYA 1MPBA 4BDOA 1EMGA 1VFDA 3KG2A 4KW4A 1FTOA 5CMKA 3UK4A 3MVWA 4IGTA 2A56B 2QU1A 1USYE 4TZAA 4LZ8A 4W7EA 2HPWA 3UG0A 3ZUJA 2OTBA 2OTEA 1P1OA 1RMMA 1USYH 3ILTB 1MPCA 4RXLA 2DE2A 3RNNA 3N6UA 4PPLA 1H6RA 4ND9A 3PUZE 4YB7A 4XVPA 3FVNA 2IB6A 3MVXA 3DELB 4N6PA 3U92A 2ZMUA 4PFTA 2O6AA 3T22A 4KGEA 1ZGQA 3FZVA 4JEOA 4Q7TA 4NF5B 2A48A 4JWYA 4OQOA 3A09A 2QLIA 2FYIA 3CFLA 3FJ7A 5DU0A 4U1ZA 1BIYA 4IK8A 1VE4A 5HBDA 3LBSA 1YPNA 4X9TA 2GH9A 4ISUA 4NF4B 5DVFA 4EDSA 1XHYA 4DXNA 3A3UA 5I56B 4IO5A 3DQ9A 4J88A 2F78A 5H8FA 4KFQA 5F7VA 4Q30B 1BKAA 5DTBA 3ADFA 2DXRA 2YLNA 4ZEFA 1JQFA 3JYRA 3DQCA 3H6WA 2GHAA 2OGRA 4PE5B 1PBPA 1IQ7A 2B3BA 4RA1A 1LGBC 3PV0E 1MY3A 4XKPA 3U8PA 5DTLA 1S7YA 4YU0A 1MH4A 3MC2A 3L6HA 5KCJB 3QXMA 1Q1KA 3DQ7A 3PJ5A 3CG3A 4AS8A 3PPQA 1O63A 3IJXB 3MPKA 3W1DA 2QPQA 2Z6XA 3IO4A 1M5EA 3SVOA 1IXGA 1N7WA 1SI0A 3DQ5A 5HZSA 3TCFA 5KZTA 3TTRA 5HW9A 4GESB 1OXEA 2Z6ZA 4Z4MA 5EXBA 4RYWA 3TCHA 4W75A 5L9OA 2HEUA 3I19A 4Z0IA 3EVPA 2Z22A 5I2NA 1FQAA 4GF6B 5TP9B 4W6NA 4ZIOA 1NMUA 2I3WA 3VVDA 4NF8A 5A5XA 1DTZA 4YZZA 4MFIA 2HZLA 1LCTA 2GW4B 4W76A 3G3FA 5FHMA 1MS7A 3TMTA 4W6UA 3F11A 4QFOA 1XQMA 4EXLA 4HW8A 1HSLA 5TU0A 4AR7A 2O84X 5K2YA 3CFHA 5JTYB 2PX1A 3ZKLA 4LVQA 3PPOA 3M3LA 1II5A 2VD3A 1POY1 1B40A 3G3JA 1W7SA 4ZECA 2XXVA 4MF3A 2V25A 3UORA 3RLFE 4C0RA 3G7WA 2HQZA 1Z7ME 4RTCA 2OBGA 1F09A 1WVJA 5EB6A 1Y3QA 5ICQA 3FJMA 1S9TA 2I4CA 3CFAA 5J1DA 1KYRA 4N3DA 4KF5C 4LQ5A 3PMXA 2V3TA 2H9WA 3OGOA 3ST0A 5CBSA 3AI5A 3PUYE 2EMDA 3O2AA 3FV1A 5LOMA 4Q5TA 4YKPA 2R9JA 1JBZA 2CMOA 2Z1OA 3IR8A 4ZZEA 3U1OA 2F7BA 4M4GA 1MDP1 2DWHA 3R7XA 4NMYA 3SVRA 4IK9A 3EK4A 3MZBA 3SEUA 5H8FB 4O3AA 3TKDA 4N07A 1LBBA 2DYXA 1MXYA 1OLCA 2Q2AA 3LC8A 3U0LA 4PFYA 4H8IA 5HZTA 1B4ZA 4BDQA 4ESXA 2E0SA 3S9EA 2REGA 1FTJA 4XKRA 1PB9A 3EPEA 4U21A 3V83A 4EXKA 1S50A 2ZXTA 1B5IA 4QFNA 2G5ZB 1H76A 4DKNA 3IL1B 5H8HA 1OIBA 2OKYA 3EK7A 1GFLA 3LSAA 1LAGE 1OXDA 4XOWA 2ONRA 3G3HA 4KHZE 2HJOA 2UYEA 2VZXA 2YJPA 1A7LA 3G3GA 3SVCA 5AA4B 4DLDA 1MM6A 2DP8A 3P28A 1LB9A 4ESWA 3E3KA 3E9XA 3IJOB 4THIA 4Q7UA 1A8EA 1OMPA 3W1CA 3FIRA 1LCFA 5I2NB 2HCAA 2F6PA 3BXCA 2DSFA 3ILUB 4X1BA 3HV1A 5KTGA 4NF8B 2AIXA 4ZS9A 4IY6A 4H67A 1EU8A 2H5RA 5FTHA 3R26A 4WEPA 2XHDA 5ITPA 2O68A 1HSEA 4H65A 4OXVA 4XL5A 3AKOA 3I6VA 3O97A 3SG6A 3IX1A 4KCDA 1BP5A 1B7HA 4ANJA 3PD8A 2RC7A 4W6DA 3O9PA 2XD3A 3NT9A 3SVSA 1URSA 1GL4A 1NNPA 3DQOA 2F7AA 1SBPA 4JFGA 3FV2A 2O69A 5DT6A 4Z4KA 1FQDA 3O29A 1HCJA 4ZEKA 4ELRA 2XXTA 4H1XA 2UVHA 4KA9A 3HO7A 1B9CA 1MQJA 4PFWA 1IXCA 1Q4AA 1EMAA 3DQ4A 3U8QA 4Q7RA 4R6DA 4XKQA 2ZNTA 2V4EA 1N84A 1FW0A 4OENA 4EN1A 4OMBA 5EYFA 3RQTA 1GTKA 4LQ2A 3MWBA 1Z1QA 2XX9A 4ZE8A 2ARLA 1A55A 2E1SA 4KQPA 1P99A 4Q0CA 3TTKA 2X7PA 4EULA 4DXCA 2THIA 3LA1A 1NNFA 2QS2A 2O24A 3CGLA 1VR5A 4OYVA 3EKHA 4W7XA 4GQOA 3DQHA 4W6CA 5FVIA 4NF6A 5L9MA 2Z8FA 2Q89A 3UA8A 1DPPA 3DQ6A 3OD7A 1SW2A 3TDJA 4LATA 4QFKA 2REJA 1JW4A 4H5GA 4FATA 1MXVA 1LAXA 5AE4A 2HFBA 4NWSA 2DQVA 3MZ1A 3TZAA 4KW8A 3SG3A 2XXIA 3HSTA 3W9WA 1P1QA 1QVSA 5H8HB 1C4FA 1Q35A 2QLHA 5I2KA 2WURA 2H5QA 3G3KA 4NF5A 5LTPA 1OQGA 1SYIA 4OETA 4BDNA 5CRYA 4F1UA 3HHFA 3GJ1A 3E13X 3VVEA 2ZNUA 3TMRA 1PEBA 4Q9XA 2YFPA 1RM9A 3WLCA 2F7CA 3TCGA 3VE1B 2PMSA 2KLFA 4H47A 2PXSA 1EMCA 3E4RA 1DMBA 2UVGA 5DPJA 3M8UA 4OFOA 2QS3A 1KWHA 4H3NA 3THIA 2QRYA 4ZB1A 1NNKA 3DQKA 4O3CA 2H5OA 1LAFE 4KPTA 1ZU0A 1QYOA 4WEDA 4R75A 1R9LA 4YICA 1PB7A 5AA2D 3CFFA 3PMVA 1XAEA 3MQ9A 1R1NA 3EHTA 2Q2CA 3K6XA 4W6KA 4DXMA 4GD5A 4U1OA 1QXTA 1O7TA 4W7DA 3SSTA 5ITOA 2VVHA 2XXWA 5EHUA 5DVJA 1SW5A 4LZ7A 2O1LA 4HVFA 3C4MA 4MLQA 3VLVA 2BTJA 2DVCA 1W7UA 1SYHA 3KEIA 3B6QA 4UTSA 4ONYA 4IB2A 4WXJA 1JVXA 1POTA 3EVRA 4R74A 4OHNA 1EMFA 1YTVA 4H8JA 4RJZA 4YB5A 4RPNA 3U93A 2OWSA 1LBCA 1SW4A 3FATA 4G2ZA 1BFPA 3EQ1A 1US5A 4RYSA 3NEDA 4U2VA 3BBRA 3P7IA 1WODA 2H5PA 1FQEA 5DPIA 4IO2A 3Q28A 3S9NC 3S9LC 2V4EB 2RC9A 3UN6A 3ZS6A 1A8FA 2DE4A 2A46A 2Y7PA 1P1UA 1B6HA 1VSOA 3ODBA 3UIFA 3K6WA 1GR2A 3ST3A 5HZUA 2PT1A 4ZE9A 2OJTA 4OEUA 2VVJA 4KYSA 2QSXA 4H5FA 3RUMA 1Y4TA 4HQ8A 2BJJX 1JC1A 1FCKA 5IKBA 2Q9TA 4NF6B 4F3PA 4I9DA 4GL0A 2OJKA 3ZUFA 2I0BA 1QUKA 5H8SA 1YHIA 4DIGA 5EXCI 2OCUA 1H45A 2AYSA 3OO9A 2HRSA 4G68B 4GLIA 5ELVA 1PB8A 2UVJA 3EKJA 4U4XA 1D9YA 3NF0A 3C9HA 3PGFA 4W7AA 2G16B 1D4NA 2ZYNA 2I58A 2ZMWA 3OO6A 5I2KB 2NUVA 4B5YA 1WDNA 1B32A 3VK1A 4KW9A 4N13A 4TZGA 2PVUA 1GV8A 1BLFA 3K6UA 4TLMB 2ESNA 3IOTA 4LQUA 3VLWA 4LW5A 2Q57A 2GW3A 3S05A 3C33A 1LSTA 3IR1A 5DY6A 2LAOA 4GF8A 2DXYA 1DOTA 5DPHA 2F35A 3AI4A 1FQBA 3GXAA 4PFUA 4H6DA 3BFTA 3CRBA 2F36A 2Y7WA 4Q9WA 4GOBA 3K1PA 5CC2A 2HXWA 3MP1A 4IK1A 1QJMA 2VAEA 2RCBA 1P1NA 4R73A 1P1WA 1JEUA 3FXUA 3MP8A 4QFLA 1B3HA 4JSDA 2CZLA 1CB6A 4QSDA 5AA3A 1T0KA 2DD9A 3VDFA 1B1XA 4GRKA 3HPIA 2G6EA 1Y4CA 4JWOA 4IO6A 4IO4A 4ZINA 5AQBB 1DSNA 3E5TA 3QUFA 2QLEA 4E0XA 5DPGA 1UIUA 2I0CA 4OGSA 1URGA 3SG2A 1TXFA 2XD2A 2DE3A 5AA4A 4EQ9A 3LSFB 3TMGA 4W6JA 3BXAA 3E5WA 2P2AA 3KN3A 4FIMA 1B7UA 2QL3A 1MOUA 3P8UA 3TFLA 1I69A 1ELJA 1QUJA 5I58B 5EXUA 4G8NA 3RGYA 2D21A 4Q8RA 3H1RA 1MXWA 4R2BA 3MJNA 1MQIA 1NFTA 3H1OA 5DQMA 1O64A 5CI5A 4W6HA 4GOTA 2HGDA 2A52B 1MM7A 3GZGA 3KCSA 2XXHA 1FTMA 3OEKA 5EB7A 5IAIA 3RPWA 4DXBA 3RT8A 5TPAB 3SETA 3DPZA 3Q29A 4DXPA 4L1IA 4OWDA 3OENA 3OO7A 1US4A 3T9XB 5T3IA 1Q4CA 4W69A 1XMZA 3C35A 2V4EC 4KD5A 4U23A 2WHUA 4W6SA 5DYHA 4DXIA 4H48A 1TFAA 5I57B 4KAGA 2IA4A 1MY1A 1YCJA 4POXA 1XOCA 5HBCA 2DVZA 4JDFA 2O2BA 3G9AA 2FNCA 5J2OA 3RY3A 3PUVE 1B4HA 1EMKA 3SG5A 3EVVA 4OERA 3DP8A 2A5SA 2DUGA 1B0HA 1N76A 2JADA 3ZTFA 5CMBA 2XXXA 1XSSA 2HFCA 3M22A 4KR5A 1JVYA 2F6GA 4POWA 3ECRA 2IB5A 3EK8A 4FJPA 4KEXA 4F2QA 1QULA 5DQBA 1B3EA 3SVDA 1SD3A 3EVUA 3QSLA 5LK4A 2V84A 4ZBLA 2ALUA 1N04A 4FEBA 2YDZA 2DS9A 3GLBA 3LSWA 3H6UA 4JB7A 1ZIUA 3N94A 3CD9A 5DTXA 2Y84A 3HCQA 3GJ2A 3S9MC 4PFEA 1RMOA 3MGFA 5H8NB 5BTTB 3DQAA 5DRFA 3KSJA 1D9VA 5F1QA 4EMQA 2NOOA 3DM0A 4IO7A 2DWIA 3IOUA 4JRBA 4F31B 4MLVA 3RTFB 3E5VA 1RKMA 2H5YA 4XIGQ 2DD7A 4R6KA 3SV5A 2Y7RA 3SVNA 3O28A 3SEWA 3U72A 1G7KA 1OXFA 4F2OA 4IY5A 5ISUA 1B3LA 3OMBA 4C1TA 4XTCQ 3TTLA 3K02A 2XXQA 3HN0A 4PP0A 3PUWE 2VADA 1JEVA 1A99A 2ANJA 1MQHA 4TQUQ 1QUIA 1AIVA 4ZF4A 4OY4A 3B6TA 3IO6A 2G29A 3O78A 3BFUA 4TLLB 1Z1PA 1AOVA 2F8DA 3QYTA 1UIVA 4JF9A 4YKIA 3CSGA 4KPIA 3PJ7A 1MY0A 3T9UA 3U8AA 2F5XA 3C32A 3DQUA 3CR9A 3O6GA 1EMBA 2G93A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2AL5 A;  5K2X A;  5HGE A;  2ICR A;  1Y9U A;  5F9G A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 1B1H A;  1Q4B A;  2O51 A;  2NXO A;  4KGF A;  1B2H A;  4W6A A;  1JBY A;  2OKW A;  4W7C A;  3H6T A;  4IK4 A;  1PC3 A;  1EZP A;  3N5L A;  3DQM A;  4XXU A;  4YMA A;  3K0V A;  4W6G A;  3PJB A;  1QYF A;  3KN7 A;  4KF5 A;  1S6Z A;  4GL8 A;  2WHT A;  3M3K A;  3PPR A;  2VHA A;  2PYY A;  4W72 A;  1Y20 A;  1Y1M A;  3IAZ A;  3K1K A;  4BDL A;  1KYP A;  3I3V A;  2AH8 A;  4GXA A;  2ABH A;  2XXP A;  3CD1 A;  1FTL A;  3OEL A;  1M5D A;  4OTE A;  4GXS B;  4BDU A;  4OZ9 A;  2Y7I A;  2A53 B;  3PUX E;  4W6T A;  3SVB A;  2DDC A;  3LF4 B;  4HS7 A;  1QYQ A;  4H0W A;  1B3F A;  1ZKB A;  2UYF A;  5KDT A;  4FED A;  2OZZ A;  4HCW A;  2VD2 A;  4NF4 A;  4RK9 A;  2QMX A;  1B0L A;  3G3I A;  1QW0 A;  4B30 B;  5I56 A;  3ST2 A;  3QK6 A;  3O66 A;  2WHS A;  4ZF5 A;  2C9J A;  2HAU A;  3UP9 A;  5FTI A;  1F0B A;  2A50 B;  2AWK A;  4EDO A;  1GVC A;  4I2Y A;  2D3I A;  4NED A;  3TQW A;  3KJT A;  2ZYO A;  1EZO A;  2OK2 A;  3ZSF A;  4RK2 A;  5KCJ A;  4QRZ A;  3K2D A;  3K6V A;  2GHB A;  4XGY A;  4GWO A;  5FHN A;  3H6V A;  2QZ0 A;  3MUQ A; 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