3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
4EUOA 5AA2D 1YJ2A 3FVKA 1MXVA 1BTJA 5I2NA 1QUIA 5LOMA 1NNTA 1AOVA 3S9LC 4F19A 4MF3A 3CFLA 3CI8A 5H8NA 4ANJA 3TTKA 2WHUA 3DQLA 3IJOB 5AA4B 3P7IA 3HHGA 3DQAA 2ZMUA 5I57B 1JW4A 3U94A 1QULA 3SG6A 4W6IA 1IXIA 1S50A 3E5WA 4OHNA 1P99A 3CFXA 3KN7A 3SKPA 4FAJA 2REGA 3CBEA 4P76A 5I2KB 2GX0A 4LQ5A 4L17A 1BFPA 4W77A 3R7XA 1MXYA 4NWDA 4GF8A 4W6NA 3QK6A 3PUZE 1B58A 2HPWA 3ODBA 5EXBA 2X7QA 3H1OA 2NXOA 4XKNA 2AHAA 1M5FA 4Z0IA 3PJBA 1MXXA 3CG1A 2XX7A 2V4EC 1AH5A 1XOCA 1C4FA 1F09A 4W6JA 5DRGA 3EK8A 4RK9A 4H48A 3SVEA 4KGEA 1PDAA 4NWSA 1QW0A 1XT8A 4ZIOA 2D21A 4LUBA 2XXPA 2ZYNA 3LSAA 3SG2A 1YTVA 3EN3A 3H1RA 1SYHA 4H67A 4XKQA 2GHAA 1KYSA 3IO4A 1D9VA 3GBBA 3U8QA 4C1TA 2FNCA 3SETA 3BBRA 4OTEA 4QSDA 2D5WA 4XGYA 1I6QA 1EMGA 4FECA 4GIZA 4ELRA 3DQ4A 1B9JA 1OMPA 1YHHA 3OELA 4R75A 4HQ9A 1PB7A 4QFNA 4OQOA 4P0GA 3MZBA 3PPPA 2GFEA 2Q2CA 3SEUA 4NF4B 1I6AA 4QRZA 4LQUA 3A3CA 3ST2A 1B3EA 3S9EA 4WXJA 1FQDA 5KDTA 3TKDA 4DDDA 4KGFA 3KG2A 3DPZA 1LB8A 4I2YA 1LAHE 3OO6A 5F7VA 5KCJA 5IKBA 4GLIA 2Z6ZA 1UTBB 5DVJA 4G4PA 2DUFA 1Z1PA 2OKYA 1OIBA 4HCYA 4EF2A 3MP8A 4RYSA 1S9TA 4F3BA 1Y4CA 5EBJA 2G16B 2G6YA 4WEDA 3EPEA 2QZ0A 4W6LA 3SSLA 3TMRA 2YPNA 2E1SA 3S2VA 1LAFE 3EHUA 4HTGA 4I62A 5DQBA 4OGSA 4THIA 3U8PA 4W6RA 2VD2A 5EYFA 1MH3A 2XD3A 5LTQA 4F1YA 3OMBA 2UVHA 4PE5B 4YAHX 3RNNA 3T9HB 2ZNUA 3E5VA 3TCGA 4U2VA 1Y3NA 4QFOA 1N84A 2DD7A 2PT1A 2UYFA 3MZ1A 5H87A 3A09A 4OQWA 4BDNA 1B6HA 3PIBA 2NOOA 1LFHA 1IUDA 1J1NA 4NF6A 4NTLA 3PU5A 3UN6A 1XMZA 2Y7PA 5AA2B 4JC2A 4YICA 2ONKE 2GRVA 4RTCA 3ST3A 3B6TA 3SVNA 3LVCA 3SG7A 4ZEIA 1XC1A 3OD7A 3O29A 1ZLQA 3B7DA 1MG1A 3BXBA 2ZMWA 3E9XA 3VDFA 3BFUA 1QYOA 5AA3A 3EK4A 4U21A 4KF4A 2E0SA 3KCSA 4BDUA 1ZUXA 4ZE9A 3O6IA 3IO6A 3V8XB 4I9DA 4AR7A 4KQPA 2Y0GA 3SSTA 1WDNA 2A54B 2O24A 4W6FA 2DUEA 4TLMB 3DQEA 4M4GA 2F36A 1SW2A 3KOSA 3SERA 3K6WA 4G8MA 2ANJA 4YZZA 3OXNA 1Y1ZA 2DUGA 3K0VA 5DVFA 4W6HA 3UFZA 3SG3A 3CG3A 3C4MA 4F2OA 2H9WA 1Z7NE 1MYWA 5AA4A 5EB6A 3FVOA 4X9TA 1B3FA 3DM0A 5FVFA 2P1SA 3VVDA 2REJA 5I57A 1Y20A 3OO8A 1JBYA 1EZ9A 4ZBLA 4QHQA 1Q1KA 3UORA 4KA9A 1B4HA 1USYH 1EMAA 3MP6A 1MRPA 2POXA 4LQ2A 3N94A 4ISUA 3OEMA 2F7AA 1ZU0A 4TZAA 2PBWA 4LA9A 2OK2A 4W75A 1N04A 2GX2A 4PP0A 2V3UA 3WLDA 2DWAA 4W7FA 1B52A 3M8UA 4KEXA 3EHSA 3G3IA 2Y7RA 2V84A 2RCAA 1ANFA 2DE3A 3M22A 3U93A 2PXSA 2C9JA 2R71A 5I56B 1GL4A 3ZKLA 3SVCA 3UGWA 1CB6A 3IP2A 2AWKA 1JBZA 4OENA 2H99A 2HXWA 2DDCA 4W6TA 5CRYA 4ZE8A 3RTWB 4TOZA 1XS5A 2P2AA 2DS9A 3TZAA 1NH7A 2AWJA 2A46A 2B3QA 4X1BA 4YB6A 4U23A 3DP8A 5DPIA 2RKMA 3V83A 3K6XA 3TYHA 1SW5A 3AI4A 2VZXA 3SVOA 1TFAA 4GFRA 4GWOA 4LZ7A 1DSNA 1FW0A 5DEXB 1ELJA 3C32A 4Q8RA 3SVDA 4W6GA 1IZ1A 4PPLA 2B3PA 5J1DA 3Q25A 4JFGA 4NF4A 1A7LA 3K4UA 2ZNSA 3PGFA 5I84A 3CSBA 3G3JA 3PUXE 4YMAA 4K3FA 4TLLB 2O29A 4ELPA 3K6VA 2VVJA 3LSXA 3H4ZA 2H25A 4NWCA 4RA1A 3PJ5A 3Q27A 3RPWA 4JXIA 5H8HA 5EHSA 2IA4A 1P1OA 1RM9A 2V4EA 3RWTA 2OLBA 1BKAA 1SW1A 3GZGA 5EJUA 4GL8A 1N7WA 2Q6PA 3FASA 5HGEA 2VOZA 4PFWA 1N3WA 2OTEA 2I4CA 2QJEA 4W7XA 3SRYA 4C0RA 4UTSA 1T0KA 1QXTA 1GV8A 4G8NA 3W9WA 3S9MC 4W6AA 1Y4TA 5DY6A 1XSSA 3UK4A 3LVAA 1NFTA 5BQLA 3M3FA 3CRBA 1RKMA 1IQ7A 4U1ZA 3HO7A 1EMMA 2QLGB 4L12A 3K1KA 5H8SA 4N13A 1CV7A 1II5A 3LUYA 3Q28A 5K2XA 4Q9WA 1MDP1 3OEKA 3DQ2A 4YKPA 3ED8A 4F3PA 2OZZA 2O1LA 2DE4A 3O6HA 5DQMA 2NVUB 3U0LA 3KGCA 4O3CA 4KCCA 2I0CA 3KCTA 3MZ9A 2EMNA 2GH9A 3UA8A 1Q4DA 1MQDA 1NKXA 5DPGA 4KI0E 3DQ9A 3I3VA 2ICRA 1N0TA 5AA2A 5LTPA 1URGA 5TPAA 3RN8A 3HCQA 2V25A 4J88A 2HEUA 4R2FA 4XTCQ 5TU0A 3IL1B 5BTTB 1EMKA 3OO7A 4DXBA 1POY1 5DRFA 2A5TB 3FXQA 1I69A 2F5XA 5JK4A 4HW8A 4EXKA 3JV9A 1UIUA 4G77A 5HZTA 5DTZA 5I58A 1VR5A 3RTFB 5BWJA 2B65A 4GRKA 5B70A 1A54A 2XXTA 2O69A 4F3SA 3T9XB 4Q7UA 2A56B 4LJBA 3K01A 4GXAA 3IORA 1UIVA 1Y1MA 4N07A 3DP4A 4HQCA 3HPIA 4MLQA 5B7DA 2A5SA 4RY1A 5CM6A 4IO4A 4H8JA 3QYTA 2F6PA 3LSLA 4Z4KA 4R2BA 2RC9A 4OEVA 3ILTB 2PT2A 2DDDA 3BKIB 1YZWA 4ZINA 1G7KA 1H3DA 4MLVA 1ATGA 4DXUA 1B0HA 4I8CA 3SSKA 4QF9A 4X1DA 2R6GE 3GEXA 1MQHA 1URDA 4ELQA 5FHNA 4P1QA 3LS3A 3AXFA 4RPOA 4W6DA 3VXCA 3TDJA 2DOJA 3DQJA 4DCXA 1JEUA 3DLNA 4RK2A 4IK1A 1B40A 1HSLA 2AL4A 4B30B 3MUQA 1P1WA 3S9NC 1PEBA 1UTHB 4JEOA 4H3NA 1SD3A 4W6KA 3G3KA 1DPPA 2I3VA 4W7DA 4J89A 1B51A 1B7ZA 4E0XA 5ICQA 2Z22A 1EMBA 2YFPA 5BUUA 3CFFA 2XXXA 4FIMA 4OERA 1OXEA 1MOVA 4F31B 3H6UA 4KCDA 2A48A 1Y9UA 3CGLA 4UACA 5CMMA 3AKOA 1URSA 1KYRA 3KOTA 2O2BA 2HAVA 1Y3QA 2KLFA 3DQMA 2H5PA 1RYOA 4RNSA 5T3IA 1MM7A 4H65A 4N6PA 5CBRA 3FVNA 2H98A 1GVCA 2AH8A 1DTZA 3PPQA 2OJTA 3OSQA 3UIFA 4XOVA 4KHZE 3GJ2A 3ZUJA 2QL3A 4OFJA 5ISUA 1ZBMA 4YKKA 1JC0A 3F11A 3D4GA 2WIQA 3LA1A 1Z1QA 1KP5A 4JGEA 1QYFA 3PMXA 4ESWA 4KW8A 3LF3A 4LVQA 1MM6A 4OFLA 1Y3PA 2DWIA 1QJMA 3I6VA 4PFUA 2ESNA 1YFPA 1H43A 4GESB 2R9JA 2G93A 4LONB 4DXQA 2I4BA 2ZYOA 5DEXA 4RPNA 4NF5B 1OLAA 2DVCA 3PPNA 4F18A 3VFJA 1ZTYA 4N3DA 3RT6B 4DXOA 4Z7EA 1RMMA 3VHTB 2Q89A 5JTYA 3W1DA 1QUKA 4W6CA 3Q29A 4OFOA 1FTLA 5FTIA 2QS1A 3SEWA 3SEXA 5HZSA 2Z23A 1RMPA 3PD8A 2ZXTA 1SI0A 3IB0A 1JC1A 4YKIA 4POXA 3N5LA 2F35A 1HCJA 1YAEA 4R6DA 2UXAA 1GGXA 3LVDA 3TTMA 4R73A 1ZGPA 3NF0A 1OLCA 3G3HA 3ZUFA 2PX1A 1MXUA 4PFEA 2FL1A 2HGYA 4MH5A 1B5JA 2DVZA 4ZEBA 1MY0A 3KJ7A 3FGSA 2H4IA 1XAEA 1MS7A 1O7TA 3VXBA 2I58A 3QXMA 3UG0A 1LCFA 3FJGA 2RH7A 1GTKA 1MXZA 1JW5A 3DQDA 4OY4A 1ZMGA 2QLGA 2G6XA 2Z8DA 4ECFA 5HBCA 2WKYA 1R9QA 3C36A 2DD9A 3TPAA 2Y7KA 1N3XA 2QS2A 3U0KA 2PVUA 1TXFA 3IOWA 2RCBA 2HGDA 1B3LA 4ONYA 2BTJA 2O7UA 4W6PA 4B5YA 4IO6A 1FQBA 1JETA 2VADA 4R6BA 4IK8A 1M5DA 2HCGA 4R6HA 3O78A 4F22A 2WSOA 1P1UA 3ZTFA 2A53B 3O77A 2O51A 3MVWA 1RMOA 5EXUA 5BTTA 4XIGQ 1GGGA 2A5TA 4DXNA 1JVXA 2EMDA 3A3UA 3O2AA 2X26A 3NEDA 1FTOA 5DPJA 1VSOA 3KJTA 5ELVA 3ST4A 5H8QB 2Q9TA 3MVYA 4W7EA 2DXYA 1XVXA 4GD5A 3SVBA 4C1UA 4DKMA 3EVUA 5DT6A 2EMOA 1LFGA 1FTKA 5I2NB 2THIA 2VP1A 1AL3A 4JSOA 5AE4A 4JSDA 3LR1A 3KN3A 4RYWA 3NEZA 2DYXA 5JEIA 3GJ1A 2PXWA 3R26A 4EDSA 3O28A 5TP9B 4HQ8A 1EZOA 4BDRA 3DQKA 3SG4A 3CR9A 3DPXA 1US5A 4DIGA 2H8QA 4W6SA 5H89A 2YLNA 1ZIUA 4YKJA 3FJMA 4W76A 2Y7IA 3RY3A 4W6MA 3FD3A 3WAEA 3MW0A 3EVVA 4HVFA 3MAMA 3MVXA 2XX8A 2OGRA 2G3OA 1B5IA 1Q4AA 2F6GA 3TFLA 3TTRA 4H5GA 5I2KA 4IK5A 2RC7A 3TMGA 1JQFA 1EZPA 2NUVA 4RJZA 4ZS9A 2DSFA 4P11A 1XHYA 3SVSA 1IITA 4HCWA 2D3IA 3C31A 4ZEDA 1W7TA 5DTLA 5LTRA 1PB8A 1A99A 1R1NA 3I5OA 4B30A 1TWYA 1FTJA 2ZYMA 3K2DA 2QT2A 2QLHA 3SVUA 4KD5A 1MY1A 1SBPA 4OETA 1HSEA 4ZF4A 3C35A 2QS4A 4JWYA 1JNFA 2M8CA 4W69A 1LGBC 5EB7A 4ZFSA 4HS7A 1ZGQA 4U4XA 1H45A 1SYIA 3SDFA 2HAUA 4BDMA 4IZNA 4QFKA 1RRXA 4F1VA 2OJKA 4F39A 1OVTA 4PFTA 1D4NA 2H5QA 3VK1A 3K6UA 2XXQA 3IOUA 1D3KA 2XXYA 4XKPA 5L9OA 4JWXA 2HRSA 5FVGA 2A52B 4IGRA 4EDOA 3SG5A 3C9HA 2HFBA 5KZTA 1TFDA 1F0BA 3O6GA 4OESA 3NT9A 2WHSA 2RF1A 3U0MA 4F2QA 4EDPA 3H03A 4IK4A 1Q35A 3JZJA 3MVZA 4JB7A 1HSJA 1MH4A 5FHVA 1M5EA 3MQ9A 3TTNA 1EMLA 3DQ6A 4ZEFA 1SW4A 3PMVA 1DTGA 2O1MA 4KR5A 4IK3A 2UYEA 3HSTA 3KSJA 3CFAA 1HUYA 5KCJB 4QSEA 3PUWE 1B05A 3EHTA 1UTBA 4ND9A 1B3HA 3EVRA 3KSXA 3VLWA 5HZOA 1NNKA 2LAOA 4O3AA 3CFZA 2OCUA 2YJPA 3TMTA 3FXRA 5CBSA 4KYDA 2QU1A 1EMFA 2DP8A 4ZB1A 2JADA 4AB5A 3FV2A 5FTHA 1MQIA 3CSGA 5L8DA 4QFLA 3QAXA 3MWBA 3G9AA 2XXHA 1UQWA 1Q4CA 2Z8EA 3PUVE 4LJDC 3TUSA 4Q7TA 4U1OA 2O7IA 1OXFA 1IXHA 3G7WA 1H44A 3E5TA 5FVIA 3ADFA 1BP5A 4DXMA 1VE4A 3TODA 3I19A 4IO7A 4I1DA 5K2YA 2RC8A 3FZVA 5HM4B 4R6KA 3IOTA 2H5RA 4H1XA 1S6ZA 2GHBA 4FORA 4G8HA 3RGYA 4KF5C 2VVHA 2DE2A 3TTLA 4ZZEA 2V3QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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