3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
1XA9A 4Z4MA 3K1PA 4PFWA 1QY3A 2FNCA 3LA1A 3U0LA 5DT6A 5LK4A 3AI5A 4BDQA 3IR1A 5H8SA 1LB9A 4HQ8A 4RYWA 2NXOA 3EKJA 4WKMA 2ZO7A 2REJA 1F9BA 1RMPA 3S9LC 3LUYA 1MYWA 4OMBA 3DPWA 5HM4B 4JRBA 3KOSA 2CZLA 2VVJA 3O2AA 5DY6A 1B3LA 1EZPA 2HGDA 5F7VA 3O6GA 3DQCA 3OEKA 4H48A 3OOAA 4DE8A 3ADFA 4OWDA 4G77A 2B3BA 1B3HA 4EXLA 4F2OA 1R9LA 3THIA 4FAJA 5CRYA 3PU5A 2DSFA 2O51A 1B2HA 4Q30B 5KCJA 3SG5A 3U72A 2QRYA 3TQWA 2OZZA 2QS2A 2ZYOA 4L17A 4AR7A 4JWOA 4HCWA 3SG6A 1SBPA 4G68C 2GHBA 4XTCQ 3SEXA 3IO4A 3FIRA 1OMPA 5HPQA 3IB2A 2A53B 1B1HA 3IL1B 5I2KA 2VOZA 4EDSA 3B6TA 3DQ2A 1P1UA 3K6WA 5DPHA 1QYOA 3E5WA 4R74A 1POY1 2OTBA 3BXAA 2DUHA 1LSTA 3DPZA 1LCTA 2HAVA 2O68A 3M3FA 2XD2A 3ST4A 1GVCA 3VVEA 2NOOA 4IK8A 5FTHA 3W15C 4W6HA 4F3PA 1B0LA 4BDOA 5EHUA 2AIXA 4ZDMA 4KPTA 1H4UA 2G93A 2ZYMA 2AWMA 4F3SA 1QUIA 3BFTA 3G3GA 3H06B 4JXIA 2HQ0A 3S05A 3K6UA 4HW8A 1AH5A 3I3VA 5LTQA 3PJ7A 2M8CA 3ZTFA 4NWSA 4KA9A 1ZLQA 3DPXA 3M22A 1XVYA 1XOCA 5I56A 4NMYA 3OO7A 3GLBA 3EK8A 3ST3A 2NUVA 4YU0A 3U0MA 5DTXA 1FTKA 3T9VA 4ZEKA 1OVBA 5DU0A 1YJ2A 4JEOA 5AE4A 1B4HA 1POTA 3TELA 1B4ZA 3OSRA 3JZJA 1NNFA 1A8FA 2ZNSA 3U1OA 2Z1OA 4W74A 3DQHA 2DUFA 2QT2A 3A3UA 4JB7A 1OXDA 4KW8A 1P1WA 3MC2A 4LQ5A 4U23A 1UTHB 5I2NB 4KF5C 1IXGA 4J88A 3V5AA 1XVXA 3L6HA 4GOBA 1O63A 3MAMA 1II5A 2X26A 4JDFA 1OLCA 4TLMB 4JFGA 5DPIA 4IO2A 2PXWA 3SEWA 1ZUXA 3IJXB 1B32A 3EN3A 4OFOA 1GGXA 4W6TA 4H8IA 3Q27A 1F09A 5LOMA 4HQ9A 1URDA 3PPRA 2Y7KA 1YHIA 2P1SA 3EHTA 3G3IA 3EK7A 1MH4A 2H9BA 3K6VA 3MVYA 4OQOA 4R6HA 3TYHA 1Z1PA 4H3NA 1I6QA 2HZKA 4LZ8A 2OWTA 1O64A 3KN7A 1D9YA 2HJOA 4EMQA 4L13A 3U0NA 3IK6B 2WKYA 1S9TA 3CSGA 3EVRA 4R9FA 5EXCI 3PUVE 2H25A 3H7MA 5L8DA 5TPAA 2Y7PA 2HAUA 3UFZA 1SW5A 1P1OA 3RTFB 1NNKA 3K1KA 3ZKLA 1B7ZA 1FQDA 3CFXA 1MQGA 1TT1A 3PPPA 1HSLA 4X48A 3CVGA 2VHAA 1Z7NE 4F22A 1MXYA 2A5TA 2UVJA 4W7AA 2Q88A 2GW3A 1I69A 3K02A 5KCJB 1W7TA 4DZ1A 3DQDA 3BBRA 5EXBA 3LR1A 2NVUB 1I6AA 3MP1A 4EQ9A 2OCUA 3TPAA 3SVEA 3CIJA 1M5BA 2V4EC 4KFQA 1RRXA 3PPQA 1B5IA 4GL8A 4TZGA 2ZNUA 1B9CA 1N0TA 4W6JA 4R73A 1DSNA 2F6PA 1UTHA 2QLGA 1OIBA 2DP8A 4KYEA 4RY1A 5FHNA 1YTVA 5H8FB 1FTLA 3SG7A 3IX1A 4B30B 1S50A 4J8AA 4LZ7A 3NEDA 2Q2CA 4PE5B 3SVCA 1MG1A 4EN1A 5K2XA 4W6AA 5HZUA 5CMKA 3E13X 3ODBA 5ICTA 4F18A 3KEIA 3EPEA 2RC7A 3FVOA 3PMWA 4R6KA 4OHNA 1XMZA 1ZTYA 4ELRA 2AH8A 1NNPA 1R9QA 5FTIA 3TUSA 1D9VA 3MBPA 1B3GA 3HV1A 4N6PA 4THIA 3C34A 3KOTA 5EBJA 3TAJA 1NFTA 2RF1A 1SYHA 3T66A 3TCHA 2RH7A 2IE2A 4U22A 3FUZA 3S9MC 3H6VA 4W6UA 4KD5A 3U8QA 1EMAA 4IK4A 4KEXA 3O77A 2I49A 4RA1A 2QPQA 4W6BA 1JC1A 3EVPA 2F35A 4ECFA 4W69A 2A50B 4PPKA 3T93B 3TQLA 1PB8A 4C1UA 5A5XB 4Z4KA 4ZF3A 1LFIA 2QS3A 1A7LA 1A40A 4I9DA 1MQHA 1FCKA 4ZEDA 4ANJA 4GOTA 3SERA 1N76A 2OK2A 3LSFB 3T96B 3IOTA 3TTNA 2Q2AA 4R75A 4AB5A 1NH7A 4NF4A 3DQNA 2AL5A 4KAGA 4TOZA 3NF0A 2XXVA 5DQBA 3MWBA 3DQMA 4DXCA 4PPLA 2DVZA 4OXVA 3E5TA 2RINA 1O7TA 2ONRA 1B7UA 2BJJX 5HBCA 4KW9A 1MS7A 2DD9A 4OERA 3O66A 4ZE9A 5JEIA 4OYVA 4RYSA 1VFDA 3CFZA 2YFPA 2H8QA 2F7BA 3SSKA 3U8AA 2AWJA 4H6DA 4G4PA 5BTTA 1TXFA 1RMMA 3JV9A 3TZAA 5DTBA 4YMBA 5AA4A 5HZTA 5DEXA 4JC2A 4W75A 1N7XA 1ZJLA 2Z6ZA 1IITA 4YZZA 2V3QA 3KG2A 3I6VA 1IIWA 2DQVA 3H6UA 4EF1A 4RPNA 1VSOA 3E9XA 3TCFA 1PDAA 1M5FA 4O3AA 3PUYE 5I84A 4W73A 4F3BA 3O29A 1MH3A 2GFEA 3MVZA 4W76A 3P28A 3CD9A 1UIUA 1MY2A 4WXJA 4R6BA 2Q8JA 2VD3A 1Q35A 1CV7A 4ORNA 1QXTA 3HPIA 1B3EA 3G9AA 4W6IA 1Q4EA 1SW1A 3SSTA 1BKAA 2DYXA 4W6LA 5I57A 2ESNA 2G2SB 1WDNA 2G6XA 3PUZE 4F3GA 2ZXTA 3IORA 5BQLA 4FJPA 3FVNA 5I57B 4OVJA 5DYHA 3G3HA 3KZGA 2DDDA 3N6TA 4AB6A 3HSTA 1OXEA 3R26A 2I6EA 4EQBA 1KYSA 4YMAA 4Q8RA 1Y3QA 3CGLA 5IAIA 3LSLA 2PT2A 2XX8A 5CC2A 3PUXE 3ZSFA 5TU0A 2I48A 1OXFA 4U4SA 4XGYA 4W7XA 3D4CA 3AXFA 3AKOA 2OBGA 5CI5A 2WSNA 4ZBLA 4G8MA 1PEBA 3LS3A 4ESXA 4NF5A 5JTYB 4BLAA 3K01A 2I0CA 3TCGA 5L9OA 2F8DA 3SG4A 3DQ7A 3CD1A 3C32A 1EMEA 1USYE 1MM6A 1QW0A 2UVGA 4WEPA 5HW9A 2O2BA 2HRSA 3VFJA 3QUJA 2XXIA 1MQIA 1JEVA 2DUGA 2I3VA 4LATA 3M24A 5CMMA 4BDRA 4I62A 1DOTA 1YFPA 5CMCA 3QAXA 3PMVA 1QJMA 4HCYA 4W6DA 1UIVA 1VE4A 4OFJA 1WODA 2Z23A 3Q25A 4JSDA 4DXPA 4XL5A 4ZE8A 3IJOB 4Q7TA 2B3FA 3FXUA 4PFYA 4R72A 3K00A 4W7CA 5KDTB 4P11A 3TMRA 2ZMBA 3Q26A 2EMOA 1Q4BA 2ZYKA 4IGRA 5DVJA 2HQZA 3TFLA 1OLAA 3CR9A 3KSJA 4ZS9A 4OEVA 1ZGPA 1B40A 4PFEA 1VFEA 2F6GA 4FATA 3U94A 5IKBA 4DXUA 2F78A 4YKIA 4LP2B 2AYSA 2EMDA 3T22A 4F19A 4NF8A 1SI0A 4IK1A 1ANFA 4ZZAA 2RKMA 4Q5TA 3TKDA 2DVCA 3QXMA 3LVCA 2Y7WA 2G16B 3OO8A 2UYEA 2IA4A 2Y84A 2DWAA 4Q9WA 3QUFA 3LF4B 2XXYA 1US5A 2AWLA 3IOUA 3SRYA 1BIYA 2ABHA 5ITOA 2WHUA 3K1NA 4GXAA 3EF7A 4C0RA 1QUJA 4UACA 3PD8A 4KYDA 3SSYA 2Z22A 5HZSA 3ST2A 3ZUFA 4DIGA 1UTBA 5H8NA 2YLNA 5I59A 1Q1KA 4G8HA 4O3CA 4Q7RA 4KW4A 5EYFA 2O1LA 3LF3A 3DQAA 1KYRA 4LONB 3PIBA 3PJ5A 1Q4DA 5ITPA 4ND9A 1YHGA 1DTGA 2WHTA 4JF9A 3TTKA 4E0WA 1H44A 4ZZEA 4F31B 1JBZA 4L1IA 1W7SA 4GLIA 3MZ1A 2P2AA 2VD2A 1Y20A 3JYRA 2ZO6A 2YJPA 1EU8A 1ELJA 4NF6B 4DKMA 4W6PA 2KLFA 4I1DA 3SG3A 3KFMA 4ZINA 2V25A 3FD3A 3WAEA 5DRGA 1AMFA 2QLEA 2PVUA 2XXUA 2V3TA 4R6DA 1URGA 2OGRA 1NNTA 4W6GA 1A55A 3FJ7A 5DQMA 4YKJA 2XXPA 4W6NA 2OTEA 2B65A 4W7DA 3W1DA 2H5PA 1MY1A 3RQTA 1SI1A 4IO7A 2V4EB 4MBPA 4RYAA 1UTBB 3S9EA 4XXUA 1D4NA 4FEDA 2RCAA 3R7XA 3IOWA 5JK4A 4JWXA 2OJKA 1FTMA 1EMKA 4GL0A 3OGOA 1MXXA 3CFFA 3FZVA 4YKPA 3G3KA 4O3BA 1Y3NA 1T0KA 4KPIA 1IZ1A 4ZEBA 1EMBA 3EK4A 4K3FA 3TMGA 4U2VA 5BT0A 1ZMGA 4NF6A 2QMWA 5BTTB 3R6UA 4YB5A 3CB9A 3B6WA 4NEDA 3MVWA 3O28A 2DDCA 1MXZA 3C36A 3V83A 5EB7A 1B46A 4P0GA 2WURA 1PB7A 3IR8A 4BDMA 5K2YA 1Y1MA 2OLBA 4KQPA 3DP8A 1KWHA 2G5ZB 2WHSA 2XXWA 1FQBA 1GR2A 2HPWA 2V4EA 4Q9XA 4EQ7A 1IXHA 1H6RA 1JW1A 1H3DA 5F9GA 1M5EA 3V8XB 3MP8A 3BXBA 1LGBC 2HXWA 3PPOA 1BP5A 1KP5A 2Y7RA 4OY4A 5H8HA 4LJBA 1P1QA 1CE2A 5BUUA 4H47A 1D3KA 2Q57A 4PPJA 4IO3A 5F1QA 3VHTA 2G3DB 2F97A 2R6GE 3QIMA 5TP9A 3RN8A 3HHGA 4ONYA 3M3LA 3ZULA 2H5QA 3CBEA 2F36A 4G8NA 4LZ5A 5DTZA 2Z8DA 4DXMA 1BLFA 2DOJA 1ZU0A 1BTJA 2GX2A 2O29A 2AWKA 2G29A 1MPBA 1QULA 2FYIA 2F5XA 2HCAA 4RTCA 3FGSA 4OEUA 1EH3A 4ZEIA 2DUIA 5AA1A 1Y4CA 1GV8A 4GD5A 4G2ZA 1QVSA 2YDZA 3OD7A 3DQKA 3HHFA 1B05A 1LAHE 1PBPA 3EQ1A 2P0SA 4X9TA 3QSLA 1EMLA 3W1CA 3FJGA 3UGWA 1C4FA 1FQAA 3GZGA 3U0KA 3KN3A 1TFDA 4H1XA 2DWJA 3OSQA 2XX9A 4LQUA 1R6ZA 2THIA 2EMNA 1XQMA 4W6MA 3QYTA 3H4ZA 1GFLA 2X7QA 5DPJA 2POXA 2YPNA 3KJ7A 4E0XA 3I5OA 3U93A 4X1BA 4W77A 2AL4A 3GB3A 2WSOA 4H65A 4IK9A 2HEUA 4KGEA 1B9JA 1L5TA 3M8UA 2OKYA 1MY0A 4GQOA 1US4A 1MOVA 3BX9A 5DTYA 4TLLB 5M2VA 1QUKA 3U8PA 4W6FA 3HO7A 1MOUA 2IEEA 4B5YA 3TDJA 4OENA 3S4UA 1JETA 1LCFA 3ZUJA 4YB6A 3DQ9A 4F1VA 2IB5A 5AA4B 3KCTA 4XKQA 4RPOA 1DTZA 3C35A 4POXA 1EMGA 3MPLA 3SSPA 1QYFA 3EHSA 4YAHX 3GXAA 2W7YA 1A8EA 1YHHA 1UISA 4ELPA 2XXHA 3FJMA 3K2DA 5TPAB 5AA3A 2GRVA 2Z8EA 3WLCA 3FASA 1XT8A 3DLNA 4U21A 3DQ1A 4KF5A 2A54B 5I58B 3RWAA 3P7IA 3DQLA 2Y7IA 1I6BA 3O9PA 4R2FA 3UK4A 3MUQA 4ELQA 3SETA 4R6YA 4IK3A 3OO9A 5FVFA 3U8CA 2G3OA 4QHQA 3EHUA 2QLHA 2I58A 2Y0GA 3GJ1A 2HGYA 3SESA 2O1MA 4DKNA 2DE4A 3KN8A 3FV2A 3O6IA 3OMBA 4F2QA 5EXUA 4KGFA 5H88A 1Q4CA 2Z6XA 3SDFA 3PJBA 2IOVA 1W7UA 1KYPA 1HUYA 4QFPA 3G3FA 4GESB 5EB6A 3BKIB 3SSVA 4G68B 4IZNA 3FATA 4QFOA 2QZ0A 1NH8A 3C4MA 3VV5A 4W6SA 2FWQA 1P99A 4NTLA 4EDPA 2H9WA 3VDFA 5HBDA 1B58A 1N3XA 2DS9A 1CB6A 3UP9A 5AA2A 4HS7A 1B6HA 5FVIA 2O7UA 2R9JA 4ZECA 3EKHA 4W6CA 5B7DA 4ISUA 4P76A 2FZUA 3SVDA 2ONSA 2HFBA 3O6HA 1SYIA 2D21A 2XHDA 4KYSA 4I2YA 1H43A 4QF9A 3USDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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