3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
4H8IA 1OQGA 4OY4A 3W1CA 4FEBA 3PUWE 2O2BA 1AOVA 2Q2AA 4KR5A 3MZBA 1PEBA 4XIGQ 2F35A 2HAVA 1MY1A 4ZDMA 3TMRA 3SERA 1MXWA 1KWHA 3EHSA 4KPTA 1OXEA 1OQHA 1YJFA 5J2OA 4TZGA 3TTRA 3ZSFA 4F3PA 4L1IA 4G8MA 1GGGA 3T9XB 3DQ5A 1UTBB 1Q4AA 3EN3A 2B3QA 3C32A 2FZUA 3SV5A 1IZ1A 2PYYA 3L6GA 2CMOA 1B0HA 1EU8A 1HSJA 4PE5B 3ECRA 3MWBA 5TPAA 2GW3A 3SSLA 1IUDA 4GD5A 3DQLA 3PIBA 4KCCA 1MM7A 3OO6A 4HCWA 5DEXA 3WLDA 3O66A 3TDJA 4ZE9A 4GF8A 3GJ2A 5BWJA 4Z4MA 1M5BA 2NXOA 2HCAA 2GH9A 3H1RA 1MPBA 4EXKA 2GW4B 3I5OA 4W6JA 1JEVA 1OVBA 5L8DA 4W7EA 3IOVA 4C0RA 3CGLA 2EMOA 1VE4A 3SVOA 1MY2A 1Q35A 2DUGA 4I8CA 4HQCA 1A7LA 3KG2A 4U2VA 4M1VA 4ZINA 1ZLQA 4HTGA 2DQVA 1RMPA 3SVBA 2F97A 2NWJA 2O69A 3GBAA 4DXNA 4Z0IA 2IOVA 2H9BA 2QS3A 4OXVA 1US5A 2Z8FA 3CFFA 2Q88A 4QFOA 4ND9A 3RWAA 1S9TA 3RY3A 2B3BA 3RLFE 2DXRA 3MPKA 1ZKBA 2I49A 1EMMA 4XKQA 5CMMA 4RK9A 3K6XA 5BQLA 1JW4A 1QW0A 2ZYNA 4HQ8A 3CSGA 5EXUA 1FTKA 3GEXA 3PMVA 1MH4A 5BUUA 3PPQA 1R9QA 3ODBA 4OETA 2XXRA 1B32A 2VOZA 3WCKA 4YKKA 1SW1A 4ESWA 3RQTA 2Q6PA 3TUSA 2WSNA 2X26A 3VK1A 4JB7A 1BKAA 3E13X 4G77A 3AXFA 5AA2A 4RA1A 2QT2A 2Z6XA 2AWLA 1DSNA 4ZS9A 4QFKA 2REJA 1N76A 1A99A 5FHNA 2A5TB 1YJ2A 3KEIA 3WAFA 5H8FB 1B05A 4GF6B 3IB1A 2YFPA 3PMWA 3TTKA 1BFPA 3SG5A 5H8QB 3PPPA 2E1SA 4E0XA 4IO5A 4POWA 2PVUA 3TELA 4W6KA 4J88A 4F2QA 1PB7A 4F2OA 1YTVA 3CFZA 3OO8A 3W9WA 2QJEA 3UGWA 3SRYA 1FTLA 3QAXA 1NH8A 5HW9A 1MXVA 2XXUA 1MS7A 4ZEBA 1RMMA 1C4FA 4WEDA 4F39A 4BDLA 4XVPA 1Y20A 3M3KA 4JWYA 1LSTA 1DPEA 3O6HA 4W6GA 4J89A 4Q9WA 4H3NA 4ZZAA 1HUYA 3GL4A 4KFQA 5EHMA 1IXIA 5KTGA 1SYHA 2ABHA 2VZXA 3JV9A 4KQPA 3MPLA 2P1SA 3A8SA 1B3LA 1OMPA 2FNCA 2PT1A 5F7VA 1LCFA 3OELA 4GESB 4NF6B 4Q8RA 1WODA 3HCQA 1S7YA 2FWQA 5ELVA 3HPIA 3S9MC 3CB9A 1LBBA 3C9HA 5DTZA 4EULA 4RJZA 3TZAA 1QY3A 3PGFA 1SW4A 3QXMA 1GTKA 4LW5A 4BDNA 1B5JA 2ICRA 3DQ4A 3G7WA 2YE0A 4IY5A 3KGCA 4OFLA 4PFWA 4G8NA 3PPOA 4PPLA 3SVUA 1Y3NA 3KBRA 3C35A 4QSCA 1XVXA 2UVGA 2WIQA 3TFLA 5DRFA 3EVUA 3UORA 3CG3A 4ZECA 2ZO7A 3PMXA 2O68A 3K1KA 5I56B 2WHTA 3NF0A 3DQ3A 3Q28A 3IK6B 4YMAA 1G7KA 3EK8A 3SVDA 2OWTA 2ZMWA 2KLFA 3K01A 3M3FA 3UIFA 1FQEA 5I2NA 1MDP1 4ZEFA 5T3IA 3SEUA 1A54A 4U1OA 4PPKA 4GWOA 2F7AA 2O7UA 4EMQA 2QSXA 3OMBA 5H88A 3T22A 3IB0A 3FV1A 5DVFA 4EDPA 1DPPA 1H44A 3SVNA 4OJ0A 1JW5A 4F1YA 3DPXA 4ZEIA 2G6XA 1CB6A 3KN3A 1B46A 4EF1A 3C36A 3KFMA 4W6OA 3EHUA 2G6YA 1Q4EA 4M4GA 4IK1A 4KHZE 5CMCA 3TMTA 1Z1PA 1QJMA 5JK4A 3U1OA 3U0LA 3IX1A 3MVXA 4KYSA 1B51A 4R9FA 1QXTA 5FTIA 3LA1A 1JVYA 4I1DA 1QYFA 5DRGA 3OEMA 2RCAA 2Q2CA 2HXWA 4AB5A 1LGBC 4PFUA 5L9MA 3B6WA 2WHUA 4JFGA 2XX9A 2WSOA 1S50A 3SSTA 4IO7A 1D9VA 2PT2A 1NKXA 1LAXA 1OXDA 1XHYA 3A3CA 1YFPA 1BP5A 4OGSA 2ZYMA 2AHAA 2HQKA 3DQ1A 4MFIA 4W6IA 1N0TA 4IGTA 4W6LA 4F29A 1N7WA 4DCXA 4Z7EA 3KN8A 3EK4A 1URDA 4IK9A 1FQBA 4DXCA 1B9JA 2OTEA 2Y7PA 2R9JA 4KF5C 3TTLA 1NNPA 4LZ7A 2DUFA 4W7CA 4Q9XA 3LUYA 2H25A 3BKIB 3CVGA 4ELQA 5DEXB 5M2VA 3U72A 3SSKA 2F34A 5KCJB 2HFCA 4R74A 4R6KA 5L9SA 4YKIA 4F3BA 3UG0A 4PQJA 3LVCA 4G68C 2RC9A 4H8JA 2RINA 1ZGPA 2P0SA 1BLFA 4W6SA 1ANFA 1MYWA 1MXXA 3DP8A 4DKNA 4KI0E 3VVDA 3KOSA 1MG1A 3DQDA 2O1LA 1Z7NE 3M8UA 4KYEA 3FJGA 1SDXA 3KCSA 5HZSA 3QUJA 4N07A 4W77A 2QLEA 2R6GE 4DXUA 2I0BA 2Q9TA 4F31B 2OWSA 3GJ1A 3NT3A 4NMYA 3TPAA 3E5TA 1Y4TA 4NF5A 4MH5A 2EMDA 4H3MA 2ZYOA 3TEPA 1Y1MA 2XD3A 1WDNA 1JBYA 2LAOA 4QFNA 3VLVA 1MQJA 1XSSA 3S2VA 4JSDA 3K00A 4ESXA 3ZULA 2E0SA 3A3UA 2O24A 1P1NA 5H87A 1A8FA 4EN1A 2A50B 4H1XA 2I0CA 2JADA 4QHQA 3TQWA 1MPCA 3O2AA 3ST3A 4ZZEA 1ZGOA 1PBPA 4AQ4A 3SG2A 1RYXA 2QRYA 4OZ9A 5H8HA 2VD3A 4NWDA 1Z1QA 3VE1B 1M5EA 2A46A 1GV8A 4BDQA 3LSLA 2Y7KA 3H06B 5AA2B 4DCYA 3GB3A 2DE2A 2UVIA 3FVNA 4DXOA 4WEPA 4EQ9A 4LZ8A 1A8EA 4EQ7A 1B0LA 2G29A 4R2BA 1MOUA 4W7RA 3R26A 3NEZA 2G93A 1MXZA 1A40A 3H3GA 3K6VA 1PB9A 4Q7TA 3DP4A 4O3BA 4Q0CA 5EXBA 3RPWA 3DQ9A 4ZEKA 1JBZA 3ILUB 4YAHX 3RN8A 3LF4B 4XOWA 4KCDA 3HN0A 1ATGA 4YZZA 2HGDA 3GBBA 2O29A 1F0BA 4C1UA 2OBGA 3MUQA 1IQ7A 2YJPA 3IJOB 3EVRA 2QLGA 2QS1A 1II5A 2WKYA 3IOTA 3FVGA 5FHOA 2I6EA 3SKPA 4HW8A 1IXHA 3MZ9A 4DXIA 5TP9B 3SSHA 3MZ1A 5KZTA 4W72A 3KSJA 4IK5A 2RC8A 4F1VA 4LJBA 5LK4A 4W75A 1P99A 4X1BA 2GHBA 3SSPA 1B9CA 1JEUA 4W6RA 1OXFA 4K3FA 5FTHA 2X7PA 3LR1A 1B1XA 1PDAA 3BBRA 5I2KA 1ZBMA 2G5ZB 2RCBA 4OWDA 1LFHA 4BDRA 1M5DA 3OGOA 5A5XB 3O6GA 4DE8A 3T9UA 1MH3A 4TZAA 3FXQA 4ECFA 4W6BA 2D5WA 3V3DA 3MP8A 2R71A 1KYPA 1OLCA 3OO7A 2H99A 3P28A 3S05A 2I4CA 3MC2A 1P1WA 3TCFA 1Y1ZA 4OHSA 4OEUA 2VGQA 5AQBB 2GX2A 3K02A 2YLNA 3DQ2A 4JWOA 2Y84A 3SEYA 4XKRA 1TT1A 4QF9A 5I59B 5EHSA 4IO6A 4JF9A 2OK2A 3C31A 2A52B 2AWKA 4QFPA 3BX9A 3O97A 5AA4A 2FL1A 2A5SA 4GRKA 4BDUA 1EMCA 4JWXA 1M5CA 5AA3A 2GX0A 2PBWA 3FXUA 4JBZA 2I3WA 1R6ZA 2XXYA 2V25A 2XXXA 3VHTB 3H6TA 1H45A 1EH3A 1MQHA 5I2NB 3H4ZA 4B5YA 4P0GA 3MQ9A 1Q4BA 3LSAA 4L13A 5EBJA 3ZUJA 3IO6A 3EK7A 4RPNA 1ZTYA 3E9XA 2Q8JA 3VLWA 1IEJA 3G3JA 2GHAA 5KDTA 1B3EA 2XXIA 3PPRA 1Y3PA 2B3FA 3W9VA 1RYOA 4NWSA 1USYE 5ISUA 5BTTA 3G9AA 4H6DA 2HZLA 2QZ0A 3EHTA 1Y4CA 1VFEA 4U22A 2O84X 5H89A 5DYHA 4ELOA 3N6TA 2X7QA 4R6HA 3OEKA 3IOUA 3U0NA 3RGYA 1MXYA 1VSOA 2F6PA 1EMLA 4IK4A 2VVIA 3CFAA 2O7IA 4NF8B 1I6AA 3L6HA 4I9DA 2H5QA 1GL4A 1D9YA 3R6UA 3IR1A 3GZGA 3RT8A 5JTYA 3ZUFA 4OFJA 3IL1B 4OENA 1IXGA 3SVRA 5DTYA 3TTMA 1B5IA 2NUVA 3B6TA 1P1QA 2Q89A 3ZTFA 4HCYA 4W6UA 3Q29A 2P2AA 2DUIA 2UXAA 2V4EA 4NTLA 3OD7A 3W15C 3ST4A 2Z8EA 2DP8A 3RUMA 5H8SA 2REGA 3DQMA 1MQGA 1H43A 1FQDA 4JSOA 3TODA 3ZS6A 2H8QA 3WLCA 4IB2A 5FHMA 4R6BA 1LAHE 4L17A 5I57B 2HEUA 3DQKA 1FQAA 3R7XA 3U8CA 4R73A 3FJMA 1MM6A 3K0VA 5LTRA 4KF5A 2ALUA 3ST0A 4LJDA 3ILTB 4GXAA 1OIBA 1CV7A 1B7UA 5DPJA 4I62A 4F3GA 3KZGA 1KYRA 1ZJLA 1URSA 4YICA 1MY0A 3PU5A 3BXCA 3PJBA 4G68A 1YHGA 3LF3A 5FVIA 4PFTA 5EHUA 3QK6A 4JDFA 4GXSB 1RM9A 4RTCA 1D3KA 1NNKA 3CSBA 4H67A 4G2ZA 2Z6YA 4ELPA 2VVJA 2H5YA 1RMOA 3O6IA 3RWTA 2DWIA 4U4XA 5FVFA 3MP6A 1JVXA 3DQIA 2I58A 1FTOA 4IK3A 3DQUA 1FQCA 4KPIA 2G16B 1O64A 1XA9A 4JGEA 4R75A 1QYQA 4Q7UA 3PJ5A 5EB7A 2ONRA 1QYOA 1N3WA 4X48A 4AR7A 2F5XA 4ZFSA 3DQJA 5J1DA 5DPGA 5F9GA 1MPDA 2YDZA 3C34A 4XGYA 2WHSA 1HSEA 4DXBA 1EMEA 3M3LA 1T0KA 2HCGA 4GOBA 1H4UA 4W6MA 3TCHA 3UA8A 2OTBA 4YB7A 5AA1A 3JYRA 2RF1A 5AA2D 4EUOA 3ST2A 1XVYA 4ISUA 2NOOA 4RYSA 1YCJA 1JQFA 3TKDA 1Y9UA 4YU0A 4UA8A 5ITPA 4B30B 3Q27A 3CI8A 1PBQA 4RPOA 3LVAA 1B6HA 3SEWA 2FYIA 3GXAA 3BXAA 5LOMA 4RYAA 3BFUA 5DQMA 3U0MA 4OFOA 4OEVA 2DD9A 3TCGA 1AIVA 3SG3A 2YPNA 1O63A 2I4BA 3G3IA 3FIRA 4AB6A 1KYSA 1W7UA 2AWJA 4J8AA 2G3DB 3H03A 4X9TA 1US4A 5HZOA 2A48A 5DTLA 1UTHB 1B1HA 2Y7RA 2QLGB 3H1OA 2QLHA 5HZTA 1I69A 2ONKE 3T9VA 1XQMA 3VXBA 4NE4A 4N3DA 4PPJA 5CI5A 1GFLA 4XOVA 1NFTA 3MJNA 1OLAA 4ORNA 1HSLA 4LQ2A 1B3GA 3PPNA 5HBCA 5K2XA 4W7XA 3P8UA 4EDOA 3T96B 3FVOA 2V4EC 3SETA 2XHDA 5I84A 3K1NA 3NT9A 2ZXTA 3RTFB 4YKPA 2Z6ZA 4IK8A 1LB8A 3IR8A 3SSYA 1POTA 3IJXB 1ELJA 2F78A 4LJDC 3ONMA 1YHHA 3K1PA 3PUYE 5TPAB 4P11A 3VDFA 4HE4A 5LTQA 1YAEA 4JXIA 4KD5A 3THIA 2GRVA 2D3IA 2A54B 2OKWA 3FASA 1VFDA 1XC1A 2G6EA 2DD7A 3TMGA 3USDA 3SVSA 2UYEA 3IORA 3CBEA 4H5GA 1D4NA 4PETA 2C9IA 4O3AA 3V5AA 2QMWA 5CRYA 3KSXA 3IP2A 3T9HB 3FGSA 2VP1A 5B7DA 3S9LC 4U2RA 2YE1A 2AWMA 4ZF5A 3DPZA 1LFGA 1M5FA 4UTSA 1KP5A 2ZNUA 4NF4A 1W7TA 4LA9A 1ZU0A 1DOTA 3M22A 4W7AA 4G4PA 1SW5A 5B70A 3CIJA 3FUZA 1O7TA 3PUZE 3O9PA 4LP2B 2P4MA 4LJCA 2DXYA 2ONSA 1B3FA 1N84A 3VLUA 1I6QA 3G3FA 2V3QA 3AI4A 4ZB1A 4DXMA 3SSVA 1AMFA 1R1NA 2DYXA 3O29A 2HGYA 3CR9A 1FQFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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