3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
b'RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
1YJ2A 2BJJX 4GLIA 3RUMA 4GRKA 3E13X 5TP9A 4YMBA 4Z4KA 1IXHA 1XAEA 2OJKA 3IORA 3VVEA 4AS8A 1B40A 2DS9A 3MZ9A 2H9BA 3SSTA 2I0CA 4ZIOA 4PE5B 1MQDA 3HHGA 2Q2CA 4WKMA 1GGXA 2H6VA 3MVZA 3K00A 2POXA 2OKWA 2Z22A 4XKQA 3H03A 3AI4A 4F1YA 1USYE 3SVNA 3QK6A 4KW4A 3LSAA 2DVCA 5EHSA 3G3IA 4GXAA 2H98A 1AL3A 1QULA 4W69A 1EU8A 1Q1KA 3K1KA 2DD7A 2XXQA 4ELOA 2D21A 2AHAA 3UK4A 2H5RA 4RK2A 4GL8A 2IB5A 2HJOA 1IITA 3FVOA 3SVUA 1GVCA 3T9UA 4LQUA 4RYSA 4NF8B 5F7VA 2FA7A 5J1DA 4ZF4A 3A3UA 5H8NA 3O77A 2F7BA 3VDFA 1MOVA 1MM7A 3TQLA 4KF5C 4F3SA 1EMLA 4B30B 1OXEA 5H87A 5LTRA 1LAFE 4OQOA 4GWOA 2EMNA 4YU0A 1IEJA 3EK8A 4HQ8A 5FVFA 2ZXTA 4ORNA 3SG4A 1EMEA 4BDRA 4Q5TA 2XX7A 2I49A 3T66A 2I0BA 4DZ1A 2OCUA 4U1OA 2H25A 4DIGA 3FZVA 5AA4B 4ONYA 3SVRA 2QRYA 3P7IA 3NF0A 3I6VA 1JEVA 1LAGE 3C32A 2O7UA 2WHTA 1WVJA 2Q9TA 5KDTA 5BT0A 4THIA 4RYAA 3W15C 3ZSFA 4U23A 1JBZA 2G93A 5L9SA 4NF6B 4Q0CA 4Z4MA 3THIA 3SEXA 1B7HA 2GHBA 1B0HA 5DPIA 4KF5A 4G8HA 1BFPA 3C36A 2YLNA 3N6TA 3OGOA 3CB9A 4ZF5A 2A56B 4HTGA 4RYWA 3DLNA 3DQ8A 1DOTA 1AMFA 4ECFA 4W6NA 2DXRA 3PUWE 1KYRA 5HZUA 4X48A 1O64A 2M8CA 3KSXA 4KW8A 3MP1A 4DLDA 1UTBB 4DCXA 4TZGA 2F97A 1NH7A 1OVBA 3I3VA 3OOAA 2R9JA 2QT2A 3DPZA 4IK8A 3V89B 4ZZAA 4N13A 3O9PA 1DPEA 1PDAA 3LVAA 2CZLA 1GV8A 4M1VA 1N7XA 1ZLQA 2YPNA 2A53B 4YB7A 5AA1A 5DRGA 3FJMA 1Q35A 1SBPA 2HQKA 3CFHA 3GLBA 1MM6A 4BLAA 3LSLA 2Z1OA 4XTCQ 3FXRA 3H1RA 4Q9XA 3C4MA 2V4EB 2ZYMA 1AIVA 4PFEA 1SW1A 3LBSA 3EVUA 1B2HA 3UIFA 3DQLA 2PXSA 4Q7UA 2Q6PA 2YE0A 1FTJA 2DWHA 2O7IA 2VHAA 5H8QA 3USDA 4YKIA 2O69A 3OENA 2NXOA 4N6PA 5HBCA 3TQWA 4OGSA 5H89A 4OFOA 4W6FA 1B32A 1P1WA 3MPLA 2WURA 3KCTA 2NOOA 3NEZA 2PVUA 1POTA 3MZBA 3SSLA 1Y20A 4R2BA 1Q4BA 2DQVA 3UG0A 3GJ1A 3BKIB 2AL5A 1URGA 3FASA 3TYHA 3FJ7A 2F36A 1LCFA 3RT6B 3QXMA 3EK4A 2DUIA 4W6SA 2HFBA 1WODA 4ND9A 3H6VA 2Y7WA 2ZMBA 4FEBA 2XXYA 3K1NA 5M2VA 3K1MA 2B65A 1PB9A 4DXPA 4JSDA 4PQJA 1YPNA 4PFTA 3TODA 5DTZA 1Y3PA 4EF2A 1A55A 3RTFB 4QSDA 5KCJA 3M3KA 2OGRA 3L6GA 1D9VA 1MY3A 3KN7A 4F18A 3CR9A 1XS5A 4ESWA 3U93A 1H45A 3IOVA 2GX0A 1XOCA 2H5PA 3S2VA 3EF7A 5HZOA 1YFPA 5LTPA 2DUFA 4NF8A 2IEEA 4YKPA 4MLVA 1B9JA 2V84A 4IGRA 4ZDMA 3R6UA 1Q4DA 1ZU0A 1MS7A 1II5A 3ZTFA 4RPNA 2XXIA 4Z7EA 3LSXA 2ZYNA 1YHIA 1B5JA 4H47A 3SG2A 4QFOA 4W74A 2W7YA 2OLBA 4NWCA 5K2YA 1QUIA 3WLDA 5H8HA 4YZZA 5K2XA 4J89A 4LONB 1XT8A 3O6GA 3S9MC 2IE2A 1M5CA 3VICA 2XXVA 5BQLA 2PMSA 4OETA 3C35A 1L5TA 4EXLA 4OERA 2I48A 3BXCA 1B5IA 2P2AA 3FGSA 2UVIA 3B6WA 1EZ9A 2RC9A 4OWDA 4YKKA 2GHAA 2GX2A 1OXDA 3FVNA 2QLGA 1MQHA 4F19A 2H5QA 2WSNA 5CMMA 3VVFA 2ZO7A 5I2NA 4L12A 1KYSA 1JBYA 1PEBA 2QS2A 3PPRA 5HPQA 2Y7PA 2Z6XA 3P8UA 4EUOA 5F9GA 1SI0A 1Q73A 3ADFA 4OY4A 5FTIA 4M4GA 2HCAA 1OMPA 3OEMA 4OZ9A 3MGFA 1EMCA 2QRFA 1Y3NA 1ANFA 1YHGA 1KWHA 4XVPA 3KFMA 4QFNA 2I4BA 2G6YA 3ZUFA 1RMPA 1NH8A 2QSXA 1B7ZA 3MZ1A 4U22A 3S05A 4ELQA 4IK9A 3OO8A 2VZXA 4W6BA 3PUZE 1IIWA 1MXYA 1EMMA 3K6UA 2I6EA 5AA2B 4JXIA 5ITOA 5EJUA 4R6YA 4C0RA 5I58A 4KD5A 2Q2AA 4EN1A 3O28A 4RA1A 4EQBA 3TFLA 2RC8A 2QLEA 3GZGA 5CRYA 3DQ7A 5DVJA 4ZEFA 2UYFA 4DXBA 1MPCA 3D4CA 1EH3A 2KLFA 1B3FA 3SSVA 4MH5A 1SI1A 3CFXA 1HCJA 2QS4A 1S9TA 4H48A 3IP2A 4PP0A 3WCKA 1NL5A 5I59B 3IOUA 3SETA 5CM6A 3U8QA 1R9QA 1QKAA 2G16B 1TFAA 3SS0A 3KJ7A 3BBRA 4P0GA 4W6PA 4UACA 5IKBA 1N76A 5DT6A 4ZE9A 4ZINA 4ZFSA 2Q88A 3CD1A 1Z7ME 1GFLA 1QW0A 2HAUA 5FTHA 4JEOA 4GIZA 3HSTA 3VLUA 1YZWA 2VVJA 4BDQA 4W6AA 4H8JA 5L9MA 2AIXA 3BXAA 2QS3A 1AOVA 1HSLA 4F2QA 4TQUQ 5BTTB 3RY3A 3MW0A 4OXVA 4C1UA 2XX9A 3DQCA 2O29A 3FXQA 5EYFA 3MJNA 2F6PA 1MG1A 2OTEA 1OLCA 3IB2A 3SEWA 3H4ZA 1FQEA 5H8FB 2A52B 4P76A 2AWLA 1F0BA 3TUSA 4HS7A 3ECRA 4NF5B 2XHDA 2QS1A 4W73A 3RNNA 2THIA 3O6HA 4HQCA 1XVYA 4PFYA 2GW3A 3T96B 3CRBA 3DQJA 4QSEA 1GTKA 3U8CA 2QMWA 4UA8A 5JTYA 3CFLA 3PMVA 3HO7A 2WISA 2IB6A 3FATA 1QYFA 4N07A 1R9LA 4OTEA 2DE2A 3HV1A 4NF4B 4P11A 1SYHA 5I56B 3FVGA 2DDDA 1JQFA 2EMDA 2IOVA 2Z8FA 4U2VA 4ELRA 3IR1A 5ICTA 2VP1A 1FQAA 3TEPA 3U72A 1P1OA 3K6VA 2RF1A 2G29A 1UIUA 4QSCA 1LSTA 3SEYA 3UN6A 4G4PA 4RK9A 4GF6B 4G68C 3V5AA 2GH9A 3TTLA 3C34A 2HGDA 4W6CA 3S9EA 4L17A 4H8IA 1Y9UA 3FUZA 1QUKA 4K3FA 1FTKA 2DOJA 3IB0A 1UTHB 2R6GE 2HXWA 4RPOA 2V3QA 3VHTA 3RTWB 1URDA 2G3DB 3SESA 4MF3A 2ZNTA 5A5XA 1LCTA 4YICA 2VD2A 4O3CA 3PV0E 5TPAB 1MPBA 3NT9A 3B6QA 4RXLA 4EDSA 2X26A 2B3PA 1EZOA 2C9IA 2UVHA 4G68A 1MH3A 3TTKA 1W7UA 4KGFA 5EB7A 5HM4B 4LZ8A 1Y4CA 1UISA 4PPJA 1URSA 3HN0A 2R71A 3T93B 4XKRA 3UFZA 3GL4A 4N3DA 4KCCA 3PUYE 4OENA 3PUXE 3SSPA 1LBBA 1MXWA 5AA2D 2QZ0A 4EXKA 3ED8A 4J88A 4G8NA 2ZMWA 3PJ5A 3TTMA 5L8DA 2VVIA 2A5TA 2RCBA 1D9YA 4WEDA 4EF1A 3OSQA 1VE4A 4P1QA 1B58A 4W6JA 1TWYA 3CBEA 3OO6A 3KGCA 4ZEIA 4ELPA 3SVOA 2WSOA 4HCYA 3SV5A 3LSWA 4KYDA 3VXCA 1RYOA 3O2AA 3OEKA 2V25A 3GB3A 1NNTA 4FATA 3UGWA 1NNFA 2Y7IA 1LAHE 4W6GA 4LJCA 3TMRA 1JC1A 5DTLA 3SG5A 3FV2A 1QYQA 3V8XB 3TMTA 3TKDA 1MY1A 3G3GA 5EBJA 4LZ7A 5EXUA 1CB6A 1NKXA 3CVGA 3N94A 3N26A 2GRVA 3OSRA 3OXNA 2PT2A 3ILUB 4R6DA 1S6ZA 2XX8A 3EHTA 3ZUJA 5AE4A 4LP2B 4JB7A 3OMBA 2H9WA 4GXSB 5CI5A 5H88A 2BTJA 1MOUA 5DVIA 4R6HA 3PPNA 1Y3QA 2G2SB 1POY1 3C9HA 4KR5A 1I6AA 4EQ7A 3SEUA 3DQUA 1YHHA 5LOMA 1FTLA 3O97A 5I2KB 1JVXA 1DSNA 4DCYA 4W72A 2XXWA 4LZ5A 1MH4A 4W6RA 4GF8A 4I2YA 3EKJA 4IY6A 2Z8EA 1B3GA 1B7UA 2QU1A 1H3DA 3KG2A 4BDOA 1RKMA 1B3EA 1SD3A 3KOSA 2OBGA 4YAHX 2E1SA 4IO7A 4Q7RA 4LQ2A 1H44A 2DE3A 1IXGA 5DEXB 4HQ9A 3TTNA 4G2ZA 3W1CA 4KF4A 1H43A 1XC1A 3H6UA 5I57A 2HRSA 3PJBA 5EXBA 3ONMA 4KYEA 1JETA 3ST4A 3DQKA 3C33A 4AB6A 4Q8RA 1JW4A 1XA9A 1VSOA 3EVPA 4ZEDA 1A99A 3K1PA 2EMOA 4DKMA 3A09A 3MPKA 2JADA 2ZMUA 3LF4B 2F35A 5LK4A 3RLFE 2HQZA 1JW5A 5DPGA 4H3MA 1ZJLA 1N0TA 2YJPA 1EMBA 5ISUA 2A48A 4EULA 4NWDA 4X9TA 2Y7KA 5DYHA 2QLHA 1FTOA 3K01A 3CG3A 3DQ3A 1S7YA 3MVXA 2O2BA 1O63A 4ZB1A 1SW5A 4MBPA 1RMMA 2H4IA 1QXTA 3GBBA 4W7EA 4W6DA 3SVBA 3ODBA 4LJDC 4GESB 3H6WA 4R9FA 3MUQA 3QYTA 2DXYA 5EHMA 4U21A 4R9GA 2GW4B 4OVJA 3E5VA 3B6TA 3E5WA 2F78A 5CC2A 1US5A 1JEUA 5EB6A 5CMKA 3DQDA 3G3KA 4IY5A 1VFDA 5FHOA 3DQ9A 3SVSA 2X7QA 3BXBA 4IK5A 4PPLA 1P99A 2LAOA 3SVCA 3MBPA 4W7RA 4FAJA 3JYRA 2A54B 2RINA 4R73A 1B4HA 2X7PA 2O68A 4W6MA 3FV1A 4JGEA 2D3IA 5CMCA 2QLIA 2B3FA 1N3WA 3TZAA 4AQ4A 4B30A 2F7CA 2WHUA 2IA4A 4QF9A 5FVIA 4ESXA 4XKPA 4LVQA 2XXUA 2G6EA 3PUVE 3Q25A 3H06B 1A54A 1D4NA 1N3XA 4HVFA 2H5OA 2REGA 1F9BA 4H0WA 1LFHA 5EHUA 3F11A 1IQ7A 5AA4A 2FNCA 2Q57A 2UVGA 1FQCA 2DWJA 5B7DA 3S9LC 4YB6A 3OELA 2VD3A 4I62A 2RH7A 5ELVA 1NFTA 1S50A 4XKNA 2DD9A 1PB7A 4F1UA 4DXCA 3EVRA 2O1MA 3DP6A 4W6OA 1JW1A 4NF6A 3U0MA 4KEXA 5DY6A 2OWSA 4BDLA 4DXOA 2Y0GA 2V3TA 2AL4A 4L1IA 3IOTA 1R1NA 2VAEA 2V3UA 4OMBA 3SG6A 4OFLA 4FEDA 3B7DA 1D3KA 3M22A 5TP9B 3PMXA 2VGQA 3EHUA 2F7AA 1RM9A 3M24A 3MWBA 1IXCA 1ZGQA 2XXXA 2V4EC 1RYXA 4IO6A 4Q30B 4OJ0A 2UYEA 3OD7A 1UTBA 1SW2A 4XGYA 4ZE8A 4W6IA 4GOTA 1HSJA 2YFPA 3H3GA 4F3PA 3OO7A 1UQWA 1LGBC 2NUVA 1Y1ZA 2XXHA 3ILTB 5LTQA 4IO2A 3BFTA 3MP8A 3G7WA 2A5SA 4RNSA 3TTRA 1FW0A 5EXCI 2I3VA 3CFZA 3SG7A 4OEVA 1OIBA 1OXFA 5KTGA 3U92A 1W7TA 4KW9A 1B3HA 4F2OA 4OESA 1LB9A 4F39A 5HZTA 4F3GA 2V4EA 5H8NB 3Q28A 1Q4AA 3L6HA 2ANJA 2ZO6A 3V83A 3O78A 2QJEA 5DPJA 4POWA 2F8DA 4F1VA 4QFKA 2VVHA 2H99A 1OLAA 1QVSA 3ST2A 2Z6YA 1MXVA 2WIQA 4DXNA 1CE2A 4OFJA 2ESNA 1BKAA 3T9HB 3E4RA 3EK7A 4OEUA 3PU5A 3FIRA 3ST3A 1J1NA 3DQNA 1Z1PA 3DQEA 3DELB 4KCDA 4R72A 5KDTB 4MLQA 3W9VA 2PYYA 3HHFA 1F09A 3TELA 2ONSA 4H1XA 4R6KA 4KQPA 1LFIA 1KYPA 1MXUA 2O1LA 4WEPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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