3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
1W7UA 3CIJA 5DEXB 3K6WA 5BQLA 5DTZA 2O84X 5I57A 4AB6A 4IO2A 4O3CA 1FQEA 4RPOA 3GJ2A 4EDSA 2I58A 4BDOA 1NNPA 5M2VA 2P0SA 1Z1QA 2F97A 4IK1A 1Z7ME 1Y1MA 3DQIA 1SD3A 1ZBMA 3EKJA 1B32A 3FVOA 4LQTA 4DXCA 3SG2A 3BFTA 2DS9A 3TAJA 4HTGA 1XA9A 1HSLA 2RF1A 2HGDA 4UA8A 2X7PA 3HCQA 3DQ4A 3FJ7A 4RYSA 5T3IA 1B7HA 3S4UA 2ONRA 1L5TA 4FATA 2DD7A 4BDRA 3W1CA 3EVUA 1IXHA 4KR5A 3EK8A 2ZNSA 1EMEA 2O24A 4MFIA 1IQ7A 1S9TA 3MUQA 3SVBA 3DQMA 5I58A 1M5CA 1UISA 3FVKA 3QSLA 5I84A 4JBZA 2ZYMA 4ZE8A 2O68A 4GXSB 3SVOA 1O64A 2G6YA 3OSRA 2RH7A 1ZU0A 4I2YA 3M24A 4H5GA 1DTZA 3CG3A 4LQ5A 3M22A 2HZKA 2VD2A 1MXYA 1NH7A 5KTGA 1AH5A 4HCYA 1G7KA 3SV5A 1MM7A 5EXCI 3GL4A 3P28A 3P7IA 3CSGA 2QS1A 4NWDA 1RYXA 1PB9A 4MBPA 3TPAA 2VD3A 2CMOA 2Y7IA 2VHAA 5H89A 4YMAA 1D9VA 5ICQA 2OLBA 2DXYA 4O3AA 3H3GA 3ED8A 1F0BA 4Z4MA 1ZIUA 4R6YA 4GOBA 4IK9A 2YFPA 2A54B 1FTKA 2XXTA 4IY6A 4W73A 3ADFA 3CR9A 2FWQA 3MVYA 1MPCA 5DYHA 2ABHA 4RYWA 1Z7NE 4R9GA 2DDCA 1IITA 1SW5A 1JC0A 4W74A 1Q4CA 1EZOA 4ORNA 2B3PA 3FGSA 3MAMA 4LZ5A 3O78A 3FXQA 3ZKLA 5DQMA 3PPQA 1OIBA 2YJPA 2FL1A 5HZOA 3H4ZA 4RPNA 3QAXA 2Z6YA 1S50A 1SYIA 4H8JA 4EUOA 1R9LA 4QFNA 5DPGA 4ZINA 3KBRA 4ISUA 2ZYKA 3DELB 2QS4A 2Z22A 4F3GA 5HW9A 5CRYA 1IZ1A 3M3FA 5H87A 5AA1A 2IE2A 1H43A 2HPWA 1YZWA 3I5OA 1IXIA 3DQDA 1EMBA 4W6AA 4OESA 3VXBA 5FHNA 2QJEA 4HE4A 4K3FA 3O77A 5FHOA 2EMOA 4EQBA 1P1OA 1HSJA 5B70A 3BXAA 4R2BA 3PUYE 2Z8FA 2A5TA 4PPLA 3QIMA 4PP0A 1QYOA 4MF3A 4W6KA 3UIFA 4NE4A 3VHTB 4LP2B 1OLCA 5LOMA 1USYE 4RNSA 2F7BA 3DQ2A 4H0WA 4OERA 3UN6A 2G3DB 3SSHA 4H65A 2VZXA 2RC7A 3UK4A 2B3QA 2DP8A 2ALUA 4DXOA 1EH3A 1MY4A 4HS7A 4N3DA 2XHDA 5KZTA 4E0WA 4QSDA 4G4PA 1FQAA 2OCUA 4PPKA 2H5YA 3TCHA 3M3LA 5K2XA 1FW0A 4R75A 2V4EA 3NT9A 1A55A 3U8CA 4DLDA 2DUHA 2OKWA 3DPZA 1RMPA 1YJFA 2F5XA 1RKMA 3LSFB 4EDOA 5TP9B 3O6HA 1AL3A 3E5TA 1KYRA 4H67A 4H3NA 3GBBA 3C33A 4B30B 4GXAA 4NMYA 3E4RA 4DXNA 4FAJA 5CBRA 4R6HA 1S7YA 4YICA 4RY1A 1H4UA 2WURA 1N04A 3CFZA 4LATA 4F1YA 2RC9A 1A40A 3G3IA 1B40A 3PV0E 2ZXTA 1Y3NA 3JYRA 3KJ7A 5I56A 2HQKA 3SG6A 3GBAA 4R74A 3NT3A 1TWYA 1JBYA 3PUXE 1LGBC 4QFKA 1EMCA 1OLAA 3L6HA 3VICA 3PJ7A 2V4EC 1PB8A 3TUSA 4GL8A 3GZGA 4BDLA 4ZBLA 4KHZE 4NWSA 2AWKA 3GB3A 2ZO6A 2O69A 4Z0IA 4DCXA 3AXFA 3IR8A 1LLSA 4M4GA 3TMTA 2HRSA 5ITOA 3RY3A 2ONSA 4QFLA 3LUYA 3QXMA 2R9JA 3SEXA 2UXAA 3ZS6A 2C9JA 4FORA 3C32A 4I8CA 2PYYA 5EXUA 5KCJA 4U2RA 4JWYA 5I2KB 4FJPA 1Q4AA 3VV5A 3K6XA 1B5JA 4U4SA 3VLVA 4IK5A 3O6GA 5BUUA 1M5EA 1B5HA 5H8HB 5ICTA 4W72A 2VVHA 2OJTA 4NTLA 4EQ9A 1A7LA 3K1KA 2UYFA 3R6UA 3U8QA 3DPXA 2YE0A 1MG1A 3B6QA 4W6MA 4F2OA 4G8HA 2OBGA 1MXZA 5LTQA 5L9SA 3ODBA 2CZLA 1MQIA 4ELRA 5JEIA 4TLLB 1FTJA 2POXA 4KGFA 4M1VA 4F3BA 3L6GA 3VVEA 2B65A 3S05A 2Z8EA 1MYWA 4EMQA 4PQJA 1MXWA 3D4CA 3IJOB 4ZS9A 3VLWA 5DPJA 3USDA 3Q28A 3TMGA 1P1UA 4DXQA 3DQJA 1JVXA 2VAEA 3VVFA 4RK2A 1N0TA 3TELA 4IO5A 2P4MA 5L9MA 3MWBA 2QLGA 1MXVA 4LQUA 1B4ZA 3MVXA 4Q7TA 3IOWA 2H5PA 2BTJA 1NNKA 1NKXA 4YKJA 4DXIA 4NF6A 2D5WA 4YB5A 1B05A 4IGTA 1A54A 4N6PA 1JEVA 2QT2A 1NL5A 3VVDA 1H45A 1SW4A 4GD5A 4GRKA 3KSXA 1OVBA 1GGXA 3N6UA 2WSNA 3MQ9A 4R9FA 5EHSA 5LTPA 3KJTA 1QKBA 2DWIA 3TDJA 2PVUA 3ST4A 2UVGA 1UTHB 2R6GE 2ZNTA 3JZJA 4E0XA 1XAEA 3A3UA 4W6NA 1XSSA 5DEXA 2A5SA 2G16B 2O7IA 3U93A 1UQWA 4IGRA 3QUFA 4GWOA 4XKQA 1XHYA 5FHVA 2WHSA 4YAHX 2QS2A 3U0KA 1OXEA 4OJ0A 5KDTB 4EN1A 3FJMA 1Z1PA 3E3KA 4OVJA 1QULA 4DXMA 1M5DA 2FA7A 4X9TA 3O29A 1EZ9A 1QUIA 1B58A 3VE1B 4ESWA 4KA9A 2UVIA 1OXFA 3LF3A 1DPEA 4H6DA 3H6UA 2QLGB 5FHMA 3C35A 1LBBA 2OTBA 2DD9A 4ESXA 5EYFA 1YHGA 2RCAA 2XXUA 4ZFSA 3PUWE 2PBWA 1Y3PA 5DPIA 4PE5B 4XKNA 4F19A 3HSTA 2H5OA 1I6QA 5DTLA 4PFTA 3QYTA 3SESA 1KYSA 3NF0A 4F3SA 1NNTA 1LCFA 3TMRA 1Q73A 1DSNA 2F6GA 4HQ9A 2UYEA 1XC1A 3A8SA 1MRPA 1PBPA 3QUJA 3TQWA 1LB8A 5DVIA 4KD5A 3EPEA 3VLUA 1HSEA 2DE3A 3PD9A 3CB9A 3OO6A 3KN3A 1AIVA 2AHAA 1FTOA 4TZGA 1QY3A 3K01A 1H44A 2REJA 3N94A 2QPQA 3Q26A 1O63A 4F22A 3SSKA 1O7TA 3FZVA 3EKHA 4GL0A 2DE4A 3O28A 2I4BA 2ZYNA 3IOTA 4Q7RA 5AQBB 3U72A 3VXCA 2G2SB 2UVHA 4KPTA 1PDAA 3SVEA 3SVRA 3FVGA 4JSOA 3U0LA 4QFPA 2Q2CA 4DZ1A 3OENA 3OOAA 4HW8A 2YE1A 4P0IA 4I9DA 2IEEA 2Y7WA 2NWJA 3MPLA 5ISUA 2Y7RA 3DP8A 3O6IA 1B4HA 1GL4A 4U4XA 2DOJA 1FQCA 3SVUA 2DDDA 1CB6A 1I6AA 2O1MA 5AA2B 2C9IA 4YKIA 2LAOA 1BTJA 1FQDA 3LSWA 2QSXA 4XVPA 1GFLA 3PPRA 2D21A 1B9JA 1XOCA 2PXWA 3DQ3A 1NNFA 2Q9TA 4JC2A 2DVZA 3IAZA 2Z1OA 1JW5A 1I69A 3LSXA 3HPIA 5HZSA 4MLQA 3T66A 2XD2A 2AL5A 3G9AA 2QMXA 1OXDA 3IO6A 1F09A 2GX2A 2VGQA 4KCCA 3S2VA 4KF5A 1POY1 4H3MA 3VFJA 2HAVA 5HPQA 3PD8A 3TTRA 4C0RA 3G7WA 3RGYA 2HCAA 3KCSA 3GEXA 3TQLA 3TTKA 5AA4B 1M5BA 3K1NA 1W7SA 5FTIA 3EK7A 2IA4A 1YCJA 2ANJA 3SKPA 1URDA 4ZDMA 2GRVA 3T22A 1LAXA 1ZUXA 1N3WA 2AL4A 3CI8A 4POXA 4G8NA 3DQ9A 3PIBA 3CFHA 3H03A 4RK9A 4W7CA 3DQ5A 3IK6B 1MXUA 3HN0A 1N3XA 3FATA 3K4UA 4U21A 3W9WA 3SS0A 1KWHA 1D9YA 3AI5A 1EMMA 4JDFA 4ELPA 3U0NA 4F2QA 3RT6B 3FXUA 3DQNA 4IK4A 3VHTA 5HBDA 3EK4A 3MBPA 1J1NA 4KF5C 4F3PA 4F1VA 4KW9A 1DOTA 1ELJA 4KW4A 3OO7A 3SG3A 3TCFA 1H76A 1FTLA 2RINA 3MGFA 1Y9UA 4W6BA 3BKIB 2RC8A 1MOVA 2Q8JA 3RNNA 3SVDA 3IL1B 1MPDA 2NUVA 3CSBA 5CMMA 3V83A 1FCKA 4W6PA 3K6UA 2QLHA 3K6VA 3T9HB 3LF4B 4LJBA 2ONKE 4H1XA 2VOZA 5TP9A 4HQ8A 3UGWA 2H5RA 3EVPA 3ST0A 1EMGA 2G29A 4ANJA 5L8DA 4ECFA 1QYQA 2X7QA 1N76A 4B30A 3HV1A 1JEUA 4EF1A 4UACA 1MH3A 3S9LC 1QYFA 5J1DA 1KP5A 4JRBA 4U1ZA 3KN7A 3EHUA 1PB7A 2M8CA 2XD3A 4W6HA 1TXFA 3HO7A 5DY6A 4ZB1A 3K00A 4W75A 4OZ9A 3IJXB 1PEBA 2HZLA 1QKAA 5I2NB 3C36A 1Y3QA 2DUGA 3SSPA 3DQHA 2O7UA 1SVXB 4G2ZA 1ZKBA 5BTTB 1FTMA 3K2DA 1YJ2A 2XXRA 2D3IA 4Q7UA 3DLNA 1OQGA 4OYVA 4U22A 2OK2A 5JTYB 3CFLA 1Q35A 2HFCA 4TOZA 4R2FA 4TZAA 3CRBA 3H06B 3SG5A 1II5A 3AI4A 2XXPA 2XX9A 1VR5A 4R6KA 4THIA 4W6LA 3H7MA 1NFTA 2I3VA 4U1OA 5H8QB 3CVGA 1S6ZA 1YHIA 2YLNA 1BLFA 5I2KA 1A99A 2V3QA 2AWLA 3QK6A 3H1OA 4W6JA 3EVRA 2Q89A 5H8HA 2WKYA 4W6RA 1YTVA 5CM6A 1AOVA 4W7XA 4LUBA 2UVJA 3O2AA 5EJUA 2PT2A 3T93B 5HM4B 3PPPA 3CD1A 5ITPA 3CFAA 3W1DA 1B3LA 5EHMA 4ND9A 4J89A 3G3HA 1URSA 3T96B 3RWTA 1B7ZA 1N7XA 1URGA 3THIA 3I6VA 1XS5A 3O97A 4XKPA 3IP2A 2PMSA 4DXPA 4ZF5A 1QVSA 3SSYA 1MH4A 2X26A 3PMXA 3DQOA 4W6GA 5FVIA 2B3BA 2F7AA 2GW3A 2G3OA 2O2BA 2ZMBA 4F39A 2G6XA 2GFEA 1PBQA 3GJ1A 3ZULA 2HFBA 2H98A 3TYHA 1N84A 4ZE9A 1R6ZA 2Y7PA 2DWAA 1B52A 4U2VA 3OSQA 1JNFA 3K1PA 1B7UA 1UIVA 1ZJLA 4LW5A 1Y1ZA 4YKKA 5H8NB 3A3CA 2QZ0A 1B2HA 4H5FA 1N7WA 2FYIA 4ZZEA 4P1QA 4DXBA 4FEBA 1VFDA 1ATGA 1B0HA 3I3VA 4FECA 1JBZA 4BLAA 3K02A 2WHTA 2O51A 4ZEBA 5DTYA 1B1XA 3IR1A 1USYH 4ZEKA 3V3DA 5DTBA 4G77A 1LFIA 3DQEA 5DT6A 1EMFA 4W7RA 5EBJA 1UTHA 4W6UA 4DXUA 2V3UA 3PJ5A 3WLDA 3S9MC 4AQ4A 1MPBA 4OHSA 4GF8A 4YB6A 3MPKA 4ELOA 3LC8A 1DTGA 1EMLA 3RUMA 3MP6A 3C9HA 4OFLA 3R7XA 4L1IA 1LAFE 4IO6A 3S9NC 5KDTA 3WAFA 2AYSA 4ZF4A 4H3LA 4L13A 3AKOA 4DIGA 3E9XA 2I4CA 3E13X 3FJGA 5I59B 3G3JA 4OQOA 1B0LA 2G93A 5F1QA 4EF2A 4C1TA 2IB5A 4OWDA 3S9EA 1LAGE 1QJMA 2QRFA 2OWTA 4UTSA 1A8FA 5CI5A 2AH8A 5IKBA 4N13A 2Q88A 2O6AA 2H8QA 2HXWA 1EMKA 4X48A 3KN8A 3RPWA 1ZGPA 3H6WA 4IO7A 2HEUA 3MZ9A 3OELA 4TLMB 4ELQA 3PUZE 4X1DA 3EF7A 3O9PA 1P1QA 2QRYA 1B3HA 3SETA 2B3FA 4XOVA 2ZO7A 3SSVA 4IB2A 4WEPA 3DQ1A 2AWJA 3LR1A 3O66A 4DKNA 3HHFA 4P0GA 4RJZA 3FV1A 3WLCA 4IK8A 4NF4B 2HJOA 4KQPA 3SVCA 4YKPA 4X1BA 3WCKA 2W7YA 1XT8A 1DPPA 2NVUB 3KG2A 3FD3A 1JW4A 2A52B 4JB7A 2I0BA 2Z6XA 1ZMGA 1B1HA 2PX1A 1US4A 3PPNA 2OZZA 4QF9A 3PPOA 5BWJA 5EB7A 1MY1A 2FNCA 4Z4KA 4XIGQ 4MLVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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