3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
molecule tags Fluorescent protein, transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
4R6DA 1B9JA 1SW1A 4BDUA 3U0KA 4HQCA 3LF3A 4KPIA 5HBDA 4RY1A 3C33A 3LUYA 4G4PA 5I59A 1VR5A 1UISA 1XA9A 4WEPA 4H3NA 1S6ZA 4WXJA 4ECFA 4O3AA 3SEUA 2EMOA 3UORA 1NNFA 3EK8A 4ZF3A 3UK4A 1ZIUA 1ZMGA 1IUDA 3U72A 4K3FA 1SQYA 3GLBA 3CBEA 4W6MA 1Y4CA 3S9EA 1EMAA 2XXHA 4FEBA 5L9MA 3KFMA 1G7KA 4JWXA 3H7MA 3SVNA 4H8IA 3K02A 2VVHA 5LOMA 4QFOA 4W6TA 3M8UA 2Z23A 5AA2B 3DQOA 1D9VA 2VD2A 1VFDA 4EXLA 2QJEA 1B58A 2O7UA 3SSKA 1A7LA 1H3DA 4ZFSA 4OETA 5H8FB 1BIYA 3ILUB 4JBZA 3SVCA 3SSVA 3CFXA 2YE0A 2P0SA 5TPAB 4X9TA 5LTPA 3MWBA 4M4GA 4ZEDA 2NVUB 2HFBA 2DDCA 1LFHA 1Z7NE 3MVYA 3KCSA 4R9FA 1L5TA 2ONSA 1DTGA 5I2KB 1OVBA 3I3VA 1YHHA 2ANJA 1RM9A 4LVQA 4IO5A 4HW8A 1YCJA 5AA4B 1FTMA 1ZJLA 3RLFE 5DTYA 1MY4A 4KF4A 3EQ1A 4KD5A 1A40A 4OWDA 4W6PA 3V3DA 4ZE8A 4U1OA 1XVYA 4Z4KA 1AIVA 4O3BA 5TP9B 1P1WA 4NWCA 4RPOA 4TZGA 4OQOA 1VE4A 2PT1A 1XSSA 1GVCA 3KJTA 1JVXA 3SV5A 3SVEA 3U92A 2RH7A 3OEKA 2Z6XA 5CC2A 3SS0A 2QMXA 3ZUFA 4OY4A 3BFUA 3CGLA 2I4BA 1HUYA 3TYHA 4H0WA 1N84A 1SBPA 4U21A 4LQ5A 3EKHA 4ZZAA 5HW9A 1Y1MA 2OWSA 4F3PA 5BT0A 4F39A 1N0TA 3AXFA 5DVFA 2RINA 5I57B 3PPOA 2G93A 3SG6A 4EQ7A 5FTIA 1J1NA 2H98A 3IK6B 1B2HA 1FQAA 4ZEKA 3N5LA 5DQBA 4W6CA 4DKMA 1MPDA 3PPNA 3HPIA 1FQFA 3CFAA 2HQKA 4GD5A 3DQHA 3W9VA 1ZGQA 2I58A 1IXCA 2ZNTA 4OJ0A 3EK7A 3DQLA 4PPLA 3PUYE 1CB6A 2Y0GA 4UACA 4IO3A 2XXPA 3SG2A 2WISA 2FYIA 3EVUA 4W6LA 3MUQA 3UFZA 3QXMA 5H88A 2B3PA 1B1XA 1US5A 4AB6A 4ELRA 4GESB 2C9JA 2ZMBA 1P99A 4RA1A 4NF8B 3H06B 3MZ1A 1KP5A 2QPQA 1EMEA 2AWLA 4DXOA 4N3DA 1ZBMA 1D4NA 1WODA 4NF4B 2ONKE 4GFRA 4R6YA 2NXOA 3CFFA 3ZKKA 2P4MA 3K2DA 4W6BA 3OO8A 2R6GE 3B6QA 5HZUA 3CG1A 1PC3A 2W7YA 3S05A 2HAVA 4H8JA 2Y7WA 1RYXA 2ZYMA 2A50B 4F3SA 4N13A 1LB9A 4B5YA 2GHBA 3V5AA 1DPPA 4NF6A 2IA4A 3TAJA 1NNPA 4IK4A 1JEVA 2H5QA 2IB6A 2XXXA 5IKBA 3ONMA 5FTHA 2OJTA 2H5YA 3KN8A 3SG7A 1UTHB 2F6PA 4XL5A 4OFLA 4MF3A 3SRYA 5BWJA 4QF9A 3LBSA 5J2OA 3USDA 2I3VA 5B70A 2QLGA 2FNCA 3IB1A 3K1MA 1SDXA 4OVJA 4X1DA 3U8AA 2POXA 3K1KA 3L6HA 1MXVA 2DWHA 4KYSA 5I84A 2Q8JA 4FECA 3FJGA 5I58B 2QT2A 1EMGA 4W6GA 1Q1KA 1UTBB 3P7IA 2H4IA 5FHNA 4GWOA 2H9WA 3SKPA 4JSDA 5AE4A 5KDTB 2HXWA 1B40A 3IB0A 2P1SA 3V8XB 4ORNA 2BJJX 1S7YA 2O69A 4BDLA 2O84X 1FTKA 2A5SA 3RN8A 4HQ8A 3VFJA 2G5ZB 2VAEA 3WCKA 3FIRA 4KGFA 2DS9A 4QFKA 4W73A 1MDP1 2I3WA 4HS7A 1TT1A 3FD3A 5DRGA 5DTBA 4DXUA 4JDFA 2F7BA 5FHMA 5BTTA 1B5HA 2ZXTA 5H8NB 3ST0A 3GB3A 1LFIA 2OWTA 1PBPA 3TMTA 4R74A 4XKNA 3U94A 2G29A 3UA8A 3LSWA 3V89B 2PYYA 5H89A 1IQ7A 2FA7A 3DQJA 1URDA 2Z22A 3TTNA 1NMUA 3EF7A 4KI0E 2DD9A 4QRZA 4OESA 1NNTA 3ILTB 4H6DA 3O78A 5LTQA 4GQOA 2X26A 1RMMA 3PGFA 3DQ9A 2HEUA 4IK8A 3M3LA 3SSPA 4I62A 1PEBA 3DPXA 3DPZA 2IE2A 4FATA 3G9AA 3V83A 4PFWA 4Q5TA 2XXWA 3VVFA 3DQ1A 2M8CA 1OIBA 3IAZA 1NNKA 1AL3A 4XKQA 3MVWA 2GX0A 4JWOA 3AKOA 2BTJA 4F2QA 1GTKA 2PMSA 3F11A 4YU0A 2XX8A 2OKYA 5DT6A 1KYSA 3TPAA 4DIGA 3G7WA 3T22A 2RC8A 4G68B 3KCTA 3CI8A 2GHAA 1XT8A 3MGFA 1AH5A 1B3LA 1JW4A 4IK3A 4LZ8A 4EQBA 4QSDA 4JFGA 4KW9A 5CI5A 5FVGA 3MP1A 1URSA 5LK4A 3DQ3A 3DLNA 2Z8EA 3TDJA 2P2AA 3KEIA 3EVRA 1YZWA 1TWYA 1XC1A 4OEVA 4KFQA 2V25A 3Q25A 1WVJA 3Q26A 4DXPA 1QUJA 4ONYA 3T9HB 3I19A 1H43A 1JC1A 2EMDA 4IO7A 3W1CA 4W6UA 1M5BA 4JEOA 1HSJA 1DTZA 3VDFA 4ZIOA 1I6QA 3RNNA 5FHVA 1B5IA 2RC7A 3GXAA 4GVOA 2UVIA 1PB9A 2Q6PA 1PB7A 1LAXA 2YPNA 4C1TA 3DQFA 4PFEA 5H8HB 2I0BA 1FQBA 2ZO7A 1LFGA 4GLIA 1H6RA 3PJ7A 4UA8A 1Y1ZA 3AI5A 1B9CA 2DE2A 3BFTA 3IJXB 3FVOA 3LVDA 3FATA 4GF8A 4YKJA 3LF4B 3CFLA 5AQBB 4THIA 3SG3A 1MYWA 3VHTA 4XIGQ 3GBBA 1ZU0A 1P1UA 1FTLA 5DTXA 2YFPA 1OMPA 4LJDA 3OMBA 4FIMA 5DTZA 4H5GA 4PPJA 1I6AA 4B30B 1KYRA 1P1OA 4W69A 1XOCA 3U0NA 3MAMA 2DUGA 1VFEA 2YDZA 5M2VA 4LW5A 3TFLA 4R75A 2HJOA 4HCYA 2F5XA 5H8QA 2ZNUA 2OKWA 2OJKA 3PJ5A 5K2YA 1PBQA 1O63A 5DU0A 3DQ6A 2H6VA 2HRSA 3K0VA 1SW2A 1F9BA 1UQWA 5DVJA 4J88A 2Q57A 3TZAA 3U0MA 1MPCA 3MPLA 3KZGA 3R26A 4H67A 1GGGA 4ZECA 4RJZA 5EB6A 4OENA 4IB2A 4QFNA 3Q29A 2F35A 5F1QA 3T9VA 1R9QA 2R9JA 3H6UA 5I56B 4GOBA 2YE1A 4TOZA 4PFUA 4W6SA 1JETA 3QUJA 4LONB 1JVYA 4RK2A 3SEWA 4YB7A 5TPAA 1EZOA 1S9TA 4RYSA 3PUXE 4XVPA 3KGCA 1B46A 4F29A 2O24A 1YHGA 1SYIA 3FJ7A 3FJMA 3A8SA 4OFOA 1QJMA 3PD9A 2B3QA 4H3LA 3ED8A 1UIUA 1QYQA 3SVDA 1ZKBA 3W1DA 4EDSA 1Q73A 3IORA 4NF5A 1S50A 5DEXA 1OXEA 2O2BA 4BDNA 3RGYA 3VLVA 1POY1 3DQUA 4PFTA 4Z0IA 4R2BA 4OHSA 5JTYB 4IY6A 4Q7RA 4UTSA 4GL8A 4OERA 3IO6A 3BXCA 5TP9A 4R6BA 1MH4A 3O6GA 2QL3A 2HCAA 4W6NA 5ITOA 4AS8A 3PUZE 4GF6B 4JXIA 3IOWA 4H3MA 5DPIA 3TTMA 3CD9A 3DQ4A 1QY3A 3MC2A 4DKNA 5FVFA 1SI1A 1FTJA 1NL5A 1NH8A 1OXFA 1MM6A 1M5DA 4RYWA 5DYHA 3C32A 3TTKA 1W7SA 4QFPA 4U2RA 3OO9A 2A46A 5DPGA 1MRPA 2OBGA 3DM0A 4W7FA 2ZYOA 4GXSB 2G3DB 2Q89A 3DPWA 1JBYA 2JADA 4DXQA 2DOJA 2UYFA 4W6OA 1FQCA 1Q4BA 2F8DA 2WSNA 1B32A 4EQ9A 5DY6A 3BKIB 3CR9A 4POWA 3G3GA 1Z1PA 3GJ2A 4IO4A 1BKAA 4RPNA 4F3GA 3PIBA 2GW4B 4U4XA 3DQNA 2V4EA 5L9SA 1Q35A 3H6WA 2QMWA 3SETA 3FXUA 4PETA 1JBZA 1A8EA 1N3WA 3SEVA 5H87A 1JEUA 3RTFB 1A54A 1Q4AA 3SEYA 4W6HA 2WIQA 5FHOA 5I2NA 1VSOA 2O6AA 2PT2A 2ICRA 2A5TA 1I6BA 2OTEA 1GFLA 2AWMA 3S9MC 1QXTA 4H47A 3DQ7A 1IEJA 3SSTA 3E3KA 3S2VA 4H48A 2O29A 4J89A 4JB7A 3R7XA 4F1VA 3S4UA 2Q9TA 4ND9A 4W77A 2AWJA 1MXZA 1YPNA 3N6UA 4KCCA 3G3IA 2QS3A 2Z6YA 3T93B 4DCYA 4XOWA 3DQ2A 2Q2AA 4KHZE 3QSLA 4KEXA 5DQMA 2PX1A 4G68C 3PUVE 3TODA 4MBPA 3KOTA 1A8FA 1XAEA 3PJBA 4F18A 2IEEA 4KYDA 1MXUA 4FE8A 2DD7A 4R73A 1SD3A 2OCUA 1EZPA 1B3HA 4W6DA 3FV1A 3DQEA 2OLBA 4FJPA 4YAHX 4EF2A 3GZGA 4Q7TA 2B65A 3T9XB 1SYHA 3WAFA 2XXTA 3QUFA 4GRKA 2DDDA 2HZLA 1OVTA 3UIFA 1MS7A 4KPTA 4EUOA 1UTHA 2QRFA 4P76A 3SVSA 1O7TA 3K00A 3CFHA 5CMCA 4E0WA 1GGXA 3DQKA 2DVCA 4DDDA 4HQ9A 2C9IA 3LVCA 5AA2D 1B7HA 5ICQA 3CFZA 1P1NA 3T66A 4YKIA 4LUBA 4NE4A 5H8SA 4W7XA 1UTBA 4R72A 4BDOA 3U0LA 2DVZA 4KR5A 4XTCQ 2CZLA 2Z8FA 2DUIA 2X7QA 3OD7A 4ZB1A 3THIA 4IK9A 3ZULA 4BLAA 3KSXA 2GRVA 2EMNA 1POTA 5HBCA 4KF5C 4KW4A 3QAXA 4EDPA 5LTRA 3TUSA 1OXDA 4JWYA 3H6VA 4W6AA 4ESXA 3ADFA 5HGEA 1FQEA 4R6KA 3DQ5A 2F97A 1JW5A 3KN3A 3OSRA 4R2FA 4KQPA 1ZLQA 2ALUA 1Y4TA 1MG1A 3SVUA 3RWTA 1US4A 3PD8A 3WLCA 3IO4A 1N3XA 1N7XA 1CV7A 1MY3A 3CVGA 3O9PA 4U22A 5BQLA 4RXLA 1MQDA 4P0GA 1ZGOA 4KGEA 3EVPA 4W7DA 3KSJA 2B3FA 2RCAA 3U1OA 1LAGE 1MPBA 3CB9A 2D3IA 2F7AA 4F31B 3NF0A 4F2OA 3EHTA 3NT9A 3FGSA 3EK4A 3C4MA 3VLUA 3IOUA 3PUWE 4KAGA 2QS4A 3PMVA 4NF6B 2XX7A 3OGOA 3K4UA 1MOUA 4X48A 4H1XA 1R9LA 5FVIA 2HGYA 2WHUA 3SSYA 3UGWA 4H5FA 3G3KA 4DXBA 5EB7A 3OXNA 3E9XA 3EVVA 2ZMUA 4LQUA 3MP8A 3MW0A 4C1UA 1YAEA 2I4CA 4QSCA 2GW3A 3JYRA 3ST4A 3O6IA 4F1UA 3KG2A 2QS2A 4JSOA 2QSXA 5EHMA 3U93A 4DXNA 1OLAA 1JQFA 1QUKA 4Q0CA 4WEDA 4KA9A 4ELOA 1JNFA 1CE2A 2DWJA 4DZ1A 1LAFE 5A5XB 1GV8A 1ELJA 3E4RA 4I2YA 1SW5A 2QLIA 1EMMA 3CSBA 3WAEA 4ZINA 3SVOA 5L9OA 3TQWA 2RKMA 3DP4A 1B7ZA 2E0SA 3SSLA 2O68A 3U8QA 3LA1A 3DQIA 3PMWA 2V3QA 3FZVA 3BXBA 5H8HA 3KBRA 2H9BA 3MQ9A 3D4GA 4IY5A 3HO7A 1B5JA 1LCFA 4IO6A 2FL1A 5BTTB 3VICA 3TTLA 3SERA 3B6TA 3Q27A 3SVRA 4Z7EA 2OGRA 1O64A 4Q8RA 3EN3A 3A09A 1MY2A 3TMRA 1LBBA 3UP9A 3FV2A 2VZXA 4BDQA 1DSNA 4ZEIA 3JV9A 2F36A 4TQUQ 3Q28A 3IL1B 1B0HA 4NMYA 4QSEA 3HN0A 3TCFA 2RC9A 3W15C 1LBCA 4XGYA 2ESNA 1MXWA 1B3GA 1TFDA 3IP2A 4W7CA 2E1SA 1SVXB 1MDQA 1Y3NA 3SESA 2Y7KA 1IXGA 4JRBA 3FASA 2XXVA 3HCQA 4W7EA 4ZBLA 1AOVA 3ECRA 4X1BA 2PXSA 1WDNA 1IITA 4OMBA 4ZF5A 1YHIA 1RMPA 1MQJA 2AL4A 2FWQA 1MXXA 1N76A 4OFJA 4EN1A 4ZEFA 4GIZA 4ELQA 5T3IA 4KCDA 4I9DA 2OK2A 2D21A 1OLCA 3MBPA 1EMKA 1A55A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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