3OSRA

Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into e. coli maltose binding protein at position 311
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
621
structure length
603
Chain Sequence
RWGSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELGGSHNVYIMADKQRNGIKANFKIRHNIEDGGVQLAYHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYIQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNNPAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEDLKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Fluorescent protein, transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Green fluorescent protei
publication title A genetically encoded, high-signal-to-noise maltose sensor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 191
structure length 603
sequence length 621
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.155.10 Mainly Beta Beta Barrel Green Fluorescent Protein Green fluorescent protein 3osrA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3osrA01
3IB1A 5FVGA 5I58A 4KF5C 1LLSA 4W6LA 3KOTA 3OXNA 3RTFB 3ZKLA 3PUVE 1MY1A 5AA2B 1YHIA 1DPEA 2RCBA 4AB6A 3KCSA 5HBCA 3DQMA 3SVNA 3GBAA 3P7IA 2WSOA 1JBYA 3EPEA 4X1DA 5CMBA 2O2BA 4KA9A 3PUWE 4OETA 1H76A 5AE4A 4XGYA 1VFEA 2PX1A 2F34A 4FAJA 4KW9A 1DTGA 2HQ0A 3HHGA 3DQCA 2OWSA 4NF4A 3G3JA 4R2FA 4YAHX 4F1VA 1HSLA 1A40A 1OLAA 1MOUA 5I2NB 4JBZA 2FL1A 4MFIA 1B2HA 4N07A 2IB6A 2PYYA 1NH8A 3U8CA 3UK4A 4W7AA 2V3UA 4MLVA 2DD9A 2G5ZB 1XMZA 3PPNA 2ONKE 2C9IA 4W6RA 1FW0A 1ZUXA 3DPXA 3VLWA 1SBPA 3BFTA 4FE8A 4I1DA 2QPQA 4ECFA 3H6UA 4OGSA 3DP8A 2Q89A 3PD9A 4JC2A 1AIVA 1Y20A 3CG1A 4W6KA 2DOJA 1DTZA 4EF1A 1EZPA 4KPTA 5H8SA 5L9OA 4NF5A 4W7RA 2GHAA 2YDZA 1US4A 3SG7A 5J2OA 2ZYMA 3FVKA 4RNSA 4NMYA 2A53B 4U1OA 1MY4A 2P0SA 3E13X 3TTNA 4IO2A 3DQKA 1M5CA 1LBBA 3CIJA 2A50B 2JADA 1F9BA 2NUVA 4LP2B 1ZU0A 4JSDA 3MZBA 1FQCA 2O1LA 2DE3A 4NF4B 4J89A 3OO8A 3CFXA 1FQFA 4IK4A 3SVBA 5H8QB 1NL5A 3JYRA 1Y3PA 1XA9A 1O63A 3W1DA 1LSTA 2F35A 4NWCA 3RN8A 3EKHA 3C9HA 1KYSA 2THIA 4H48A 2I48A 2DD7A 2H9BA 4Q30B 1Q4AA 3GLBA 1YAEA 2GW3A 3LA1A 5M2VA 2QLIA 4LQ5A 2I4CA 4YMBA 5H8NB 5DYHA 4JFGA 3EVPA 2HAVA 2X7QA 4F39A 3E3KA 1NNPA 2YJPA 3S9NC 2Z6ZA 1Y1ZA 2XXRA 4OXVA 4H5FA 1EMFA 5DPHA 1I69A 3C33A 1B9CA 4W6JA 2RINA 2QSXA 3NEDA 2QS3A 1RKMA 2UVJA 2Z8DA 1T0KA 4W6SA 1UISA 2G6XA 4R9GA 2DUHA 4DXNA 2XXXA 3N26A 1LAHE 2WKYA 1Z7NE 1ATGA 4JSOA 2RC8A 3K1PA 4YMAA 1LCTA 3B6WA 4F18A 3IX1A 2ZYNA 3MC2A 1B5IA 3MVZA 3RTWB 2A52B 3PUZE 2OZZA 4WXJA 3PUYE 4GOTA 1EU8A 2V3QA 2A48A 3SSPA 1I6BA 3BXAA 4ELOA 5I2KA 3Q29A 1NH7A 3UIFA 2IE2A 3A3CA 3SESA 3Q28A 2AWJA 2G3DB 2YLNA 3OO7A 1MDP1 3A8SA 4IK5A 4QHQA 2OTEA 4JWXA 1HUYA 1QXTA 4PFYA 1LFGA 2Q8JA 1WDNA 5H8FA 2I3VA 4C0RA 5T3IA 2Z8FA 2UYEA 1MDQA 1B0LA 4KF4A 4IGTA 1B6HA 1XVYA 3W1CA 4E0WA 5IKBA 1B4ZA 1B52A 2VZXA 3HV1A 4FEBA 4ZZEA 4NWDA 1Q73A 2Y0GA 1Z1PA 4OWDA 3V5AA 4DXMA 1W7SA 3G7WA 1HSEA 4BDRA 1POTA 3OSRA 5CBRA 1QULA 1DOTA 3MPLA 5I84A 5LTRA 3PMWA 1NNKA 2XXIA 4ZEKA 2O1MA 2ZO6A 1D9YA 3I5OA 2Q57A 3D4GA 2ESNA 3FVOA 4TLMB 1RRXA 5AA2D 3LF3A 3DQ9A 3HCQA 4JB7A 4F22A 1MXZA 3UORA 3M22A 4QFKA 5DPGA 3MVWA 2DWHA 2GRVA 2B3QA 2DUFA 2AL5A 1JVYA 4KF5A 1IXCA 3GJ2A 5KDTA 2POXA 2ZMWA 3ZUFA 3QK6A 5JTYB 3VV5A 4Z4MA 3KJ7A 1QW0A 4KYSA 4LW5A 4W7XA 2XXUA 3IJOB 3MVXA 4W6NA 4ELQA 3TMGA 2XXVA 4R2BA 1SVXB 3E4RA 3DQDA 2I58A 3VDFA 4KW8A 2HXWA 2XXQA 4Q7RA 1QUJA 5EHUA 5ISUA 1FQAA 5DVJA 1QJMA 1PEBA 3MUQA 4OENA 3QYTA 5CMKA 3K6UA 4R73A 3ZSFA 3DLNA 3IOUA 3H1OA 1AL3A 4QFNA 4IK3A 3PJ5A 4LQUA 1GL4A 2WSNA 3LVAA 1IITA 4EULA 3R6UA 1YPNA 1OVTA 2PT2A 4GLIA 1J1NA 4L1IA 2XHDA 3EK7A 1PBQA 4W6CA 3DQEA 1MXUA 3L6HA 3VVDA 1FQEA 5HBDA 5KCJA 4G68C 1H3DA 1S7YA 1R9LA 5BWJA 5K2XA 2H5QA 2OGRA 2XX9A 3DM0A 4R75A 2H4IA 1MM6A 2QZ0A 4IZNA 4M4GA 1YCJA 3W9WA 4ZF3A 2VVJA 5DEXA 2D5WA 4LVQA 2ZXTA 3OGOA 1B5JA 1GGXA 2P4MA 5DQBA 2FA7A 4LA9A 4HQ9A 4XOWA 3SSYA 2ZYOA 2IB5A 4G77A 1L5TA 4TZGA 3UG0A 2QJEA 2F8DA 2DQVA 5A5XB 1KYRA 3KBRA 5B7DA 1QUIA 3OD7A 3EHUA 3SSVA 1NNTA 3FJMA 5ICTA 4QFOA 1JETA 2KLFA 1JEUA 3PMVA 4F19A 2IOVA 1SW5A 2YE1A 4JWYA 2F7CA 3WAFA 4RPNA 4I8CA 3OO9A 3FIRA 4DXOA 4H8JA 2DVCA 3RNNA 1N7WA 5CMMA 1DSNA 5BUUA 3CG3A 2V25A 2OKYA 3B6TA 3SSLA 2DWAA 1Q1KA 4G8HA 4U1ZA 3DQ8A 4JDFA 2ICRA 4ZE8A 4KI0E 3WAEA 3U0MA 3RWAA 1CB6A 1MXXA 3ECRA 2QMXA 4P1QA 4IK9A 3Q26A 2DWJA 2WHUA 4R6KA 3KFMA 5EYFA 4EDPA 4IO6A 2X26A 3FVGA 1H44A 3TUSA 3T22A 3VHTB 3EHTA 3TELA 3FUZA 4HVFA 1N76A 1MY3A 2DVZA 1URGA 1GV8A 1YHGA 4GWOA 2A56B 4N13A 3LR1A 4W75A 3CSGA 5DTXA 1A54A 4C1TA 5ITPA 4IK1A 1YZWA 2Y7IA 1B3EA 4H47A 1B32A 4DXUA 3IP2A 3VXCA 4R6BA 5J1DA 3OMBA 1UIVA 2DS9A 1MXVA 1TFAA 1LFHA 2R9JA 2IA4A 2Z22A 3U8QA 4W74A 3Q27A 3QSLA 4QRZA 3DQ2A 3H6TA 4I62A 1EZOA 2X7PA 5FVIA 3K0VA 3U93A 5DU0A 4U4XA 1S9TA 4Q7TA 4H3MA 4OVJA 3ZTFA 3DQ7A 5IAIA 1XOCA 3RY3A 4P11A 4EQ7A 4Q5TA 1JEVA 3TQWA 3MP6A 5DPJA 1S6ZA 1SI0A 1OXFA 1B46A 1ZLQA 2AH8A 1FTMA 5H8HA 2O69A 4LONB 4KGEA 2XXYA 3FVNA 1B7HA 2ONRA 4YKJA 4J88A 3IK6B 5CMCA 5DPIA 1PC3A 4XKRA 4Q8RA 4GQOA 3I19A 2HCAA 4FIMA 3C31A 1OIBA 1OMPA 2QS2A 3EHSA 2ABHA 3ADFA 3FV2A 2ZNSA 5EB7A 4DCYA 3TFLA 1FQBA 4DKNA 3MBPA 5TPAA 1SW4A 1ZGPA 2RC9A 3F11A 3LSWA 1MXWA 4LUBA 3VICA 4ND9A 2HZLA 4I9DA 4KCDA 4RK9A 1N84A 1RMPA 1CV7A 4DXIA 5CBSA 3CGLA 5DVFA 4GL0A 1N3XA 5ICQA 2OWTA 4AQ4A 5BT0A 3SSTA 3EK4A 3Q25A 3UGWA 3LS3A 2YE0A 1SYHA 1O64A 2XD3A 4DKMA 3K1MA 3VVFA 3FATA 4R6HA 2EMNA 4RYWA 2OCUA 4LZ8A 3SDFA 3MW0A 1AMFA 2V93A 4LJCA 3CR9A 5HZOA 3TMTA 5CRYA 4DXBA 1A99A 2F36A 3DP4A 3SEXA 5I58B 3OEMA 1RM9A 2DUGA 4NE4A 2HCGA 4GXAA 4H5GA 3SG4A 3SS0A 1KYPA 1FCKA 1EMLA 4M1VA 4W6GA 3N6TA 1YFPA 3UFZA 3G9AA 1MY0A 5KTGA 4F2OA 2OBGA 4OFLA 1QKAA 3AI5A 2Y7WA 4TZAA 2DXYA 4RXLA 4G68A 3VVEA 1LAXA 4YZZA 4GD5A 4ANJA 5I57A 3U92A 4U23A 3SETA 3SG3A 3LBSA 1BFPA 4QF9A 1XS5A 2R71A 1D9VA 5EHMA 1YJFA 3KG2A 2OK2A 2H98A 5BTTA 3IJXB 3T96B 1WODA 1ZBMA 1FTKA 4DDDA 3U72A 3A3UA 1D3KA 3EVRA 4Q9WA 5EJUA 1OVBA 1YTVA 1RMMA 3BXCA 4ESWA 1QUKA 3RGYA 4JXIA 4EQBA 4N6PA 3QXMA 5FHVA 2PBWA 3G3KA 2LAOA 4IK8A 4QSDA 3P28A 3ZKKA 1ZGOA 5DT6A 1PB8A 1XAEA 1UQWA 1Q4EA 1NFTA 4XXUA 3VLUA 2FZUA 1CE2A 1EMAA 1TXFA 4PFUA 4NF5B 2FYIA 1PB7A 2GFEA 2D21A 4HE4A 4W76A 1NKXA 4HS7A 3FJ7A 1JQFA 3GJ1A 3ONMA 2QT2A 3I3VA 1UIUA 4LATA 1B4HA 2QLGA 4ESXA 2AWLA 4G68B 3TDJA 2F6PA 3KOSA 4GVOA 2Q9TA 4F29A 3FV1A 3CSBA 3BBRA 3SG6A 4ZF4A 1EMMA 4RYSA 1N04A 3PJBA 2O84X 3TEPA 4W7FA 3WLCA 1MG1A 2VVIA 5AA3A 3TTKA 1URDA 2ZMBA 1IUDA 3FZVA 1EH3A 5B70A 1XVXA 4RA1A 4WEPA 4Z4KA 3SEVA 3SVUA 2QMWA 1OXEA 5KZTA 4GFRA 2GW4B 3N5LA 5FHMA 1S50A 3K6XA 3ST3A 1TFDA 3EQ1A 2REJA 1P1NA 5HM4B 4ZFSA 2QRFA 1MPDA 3DQUA 3HN0A 3M3FA 1QY3A 4OHSA 1IQ7A 4QSEA 4KFQA 5DRFA 4ZS9A 3S9EA 4R6DA 1Z1QA 1B3HA 2XXHA 2BTJA 3IB2A 2H5OA 1ELJA 3PD8A 4ZF5A 2UVGA 4LZ7A 5AA4A 3SVSA 2F6GA 3K1NA 1VFDA 2M8CA 3SVCA 1II5A 3O28A 1R1NA 3K00A 3DQOA 2F7BA 4U4SA 4HCWA 3N94A 2G2SB 4C1UA 1RMOA 2QLGB 4OY4A 3H03A 5LK4A 2HRSA 1EMGA 4YKIA 3DPZA 5DRGA 1JNFA 4PFWA 2DXRA 4PFTA 3DQNA 4LJBA 1BIYA 4G8MA 3FXUA 1LB8A 1VSOA 4W6IA 1R6ZA 2OJTA 3CBEA 4ZINA 3TCFA 2H25A 3G3HA 1BKAA 4NF6A 5I2KB 2B3PA 1PBPA 3O6HA 3P8UA 1ZMGA 3TPAA 4F3SA 1VR5A 4GF6B 3T9UA 1ZTYA 2NVUB 1MYWA 3PPQA 3QIMA 5BQLA 2V4EA 3OENA 3CFLA 2W7YA 3FXRA 4F3PA 5H8FB 2DE4A 1M5EA 1RYXA 3GBBA 3FGSA 4W77A 2H5YA 3PJ7A 3IO4A 1EMEA 1ZGQA 2BJJX 2DSFA 3MPKA 2Y7RA 4H3NA 5I59A 1LCFA 4OZ9A 3SV5A 1MPBA 1AH5A 1SW1A 3IORA 2VD2A 4ELPA 3ST0A 3SSKA 5HZTA 1LGBC 4PPKA 2A47A 2YFPA 3OOAA 4FECA 3VE1B 1QYQA 4YB7A 3DQJA 4OFOA 4ZE9A 4ZEBA 3K6WA 4OESA 3O2AA 4E0XA 4JGEA 2AWKA 4BDOA 2A54B 3V83A 2QS1A 4ZEIA 2HGYA 4H65A 2IEEA 3T9XB 2VD3A 3K6VA 3GEXA 4JEOA 1XHYA 3S2VA 4YB5A 4NF8A 4Q0CA 3TTMA 2E1SA 3IR1A 2HQKA 1B05A 3RUMA 4OHNA 2DP8A 4F3GA 3JZJA 5KDTB 1HSJA 5ITOA 4F1YA 2HQZA 3U8PA 2QLEA 1GTKA 2DE2A 1FQDA 3ILUB 4NWSA 5FVFA 3IB0A 2WISA 3OEKA 3OO6A 4KCCA 3MVYA 2O24A 4X48A 4IO5A 2Z8EA 1DMBA 3MQ9A 3ZS6A 1POY1 4THIA 1VE4A 4O3CA 1Q4BA 2AWMA 2H5RA 3KN3A 4PE5B 1Y3NA 5H87A 3MP1A 1LAGE 1USYE 1UTBA 1XT8A 1F0BA 2I0CA 3SKPA 3W9VA 2PVUA 5EXUA 1Y3QA 1ZJLA 5I56A 4JRBA 4PETA 1KWHA 1G7KA 1MPCA 2D3IA 4YICA 2PXSA 1UTHA 4KHZE 1TWYA 3PPPA 2F78A 3AXFA 3O77A 4GL8A 3SVEA 4GIZA 3H6WA 5KCJB 4B30A 4NF8B 1Z7ME 2HPWA 3MZ1A 4OMBA 2XXPA 3HHFA 3DQLA 4ZEDA 5DQMA 1YJ2A 4KD5A 3TCHA 4MLQA 3TMRA 2O29A 3DELB 3ST4A 5DEXB 3QUFA 4L13A 3SEUA 3M3KA 3CRBA 3IR8A 1LFIA 1IZ1A 3MAMA 4WKMA 2G6EA 1SQYA 5DVIA 1M5BA 4KYDA 1B51A 2ARLA 4PPJA 1MS7A 4XKPA 4EF2A 4XL5A 5EXCI 3JV9A 3OELA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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