3OWNA

Potent macrocyclic renin inhibitors
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Design and synthesis of potent macrocyclic renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
total genus 87
structure length 334
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3ownA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3ownA01
1HIVA 3VG1A 4EXGA 1HHPA 3ZLQA 3S45A 3K5DA 4DQBA 2R3WA 5COOA 5FIVA 5KR0A 1FQ6A 4Q1YA 1Z8CA 6UPJA 5P5SA 3OQDA 2QI3A 2R3TA 4MC9A 5P12A 2HM1A 2QNPA 2I0DA 1D4KA 5P04A 4Y4JA 2EWYA 4DJYA 3OOTA 1LF4A 4OBDA 5OYVA 4MC2A 4PHVA 1GVTA 1LYBA 1UPJA 2JJIA 1NPAA 2I4VA 1BDRA 4Y9WA 2AZCA 2WL0A 3Q3TA 3BRAA 4I8ZA 3VF7A 1QRPE 2I4UA 1B11A 1D4JA 3SA7A 3MXDA 4HZTA 1ZP8A 2HS1A 5P5HA 5P2ZA 4QJ8A 2AVOA 3FKTA 4I0ZA 2WF4A 5OZLA 5P5KA 5P6QA 1FFIC 4I10A 1PSOE 3JVYA 5P8FA 5HDZA 5P73A 5P5UA 4Y58A 4Z2ZA 3UDPA 3UQUA 3GGVA 3LZYA 5P0PA 5P1HA 3WSJA 4J1CA 5P6TA 3QVCA 4DQHA 1A9MA 5P1NA 4RCDA 1A94A 1B6MA 1HTEA 3UF3A 3UDNA 5P7XA 2VS2A 3LIYA 4WY1A 5OZXA 1PROA 4LP9A 3UDHA 3R1GB 3QROA 3QP0A 1ZJ7A 5P6ZA 2R43A 4Y3XA 1GKTA 5P6YA 3BC4A 5P4TA 4RCFA 4Y5PA 1OD1A 1SIPA 7UPJA 5P3CA 1G35A 1K6CA 1C70A 4Y5AA 3CKTA 1FQ7A 3L38A 5HE7A 3G6ZA 5P6PA 2WF3A 4ZIPA 4YOBA 3SKGA 3BXSA 3HVGA 3SA8A 1EC3A 5P8HA 4J17A 3EL9A 3GI0A 4A4QA 2IEOA 3PSUA 2RENA 5P50A 5P8OA 1MIQA 3KN0A 1HVSA 5P1QA 5HTZA 4YCYA 5P3AA 5P6OA 5KR8A 1YTHA 5P4JA 4XX3A 1MRWA 1HPVA 3UHLA 1E80E 9HVPA 1ZLFA 1BWAA 3QRSA 3NUOA 4FM6A 3S7MA 3HW1A 3SA4A 5OZVA 2ER6E 3RVIA 2O4PA 4EQ0A 1XL5A 1K2BA 4RZ1A 3QI1A 5P4EA 3BUFA 2V12C 5AHAA 1MSMA 3OGQA 5P5OA 3PRSA 1META 3SA9A 4B00A 5IE1A 4Y56A 4B78A 3NU6A 1RL8A 3R0YA 4NJVA 3MWSA 5P3DA 1HVJA 4HEGA 1QBTA 4XKXA 2F3FA 2P3CA 4Y3LA 4LXMA 1F7AA 3EKQA 5P76A 4J1IA 3OQFA 5HDUA 3PLDA 3O9EA 5P08A 3OTSA 5P6SA 4PEPA 1E81E 2G27A 3QIHA 4CMSA 3EKYA 5P2RA 3NU5A 5OZAA 1HOSA 3APPA 5P4CA 3S85A 4Y4DA 4QLHA 5P8CA 2R9BA 1UH7A 2FGUA 5P3BA 2UXZA 5KQZA 4Y4TA 5OZQA 1MTRA 3KA2A 2FXEA 3PMYA 3ZKNA 4QJ6A 5KOQA 3EL0A 5P7FA 2VNMA 5P3YA 3ER3E 3KF0A 1LEEA 3QN8A 1HVLA 4Q1NA 5P0BA 4EJKA 3CYWA 5P0QA 4PZXA 2P4JA 3PI5A 4F76A 2MIPA 2J9KA 5P2OA 3F9QA 5DR4A 3LIQA 5P3EA 3IVIA 5OYXA 2B60A 3ZKSA 5P2YA 2PYMA 4Q1XA 5P6LA 2G94A 4H3JA 3OU3A 2QAKA 3UQXA 3FNTA 4AA9A 3NUJA 4KE1A 3PCWA 5P4KA 4J1KA 1W51A 3D1YA 3Q70A 5JFUA 2QHZA 5P2BA 5OZIA 5P8DA 4YD7A 3T7XA 5P6VA 1HEFE 5P7JA 3FSMA 3DK1A 4I12A 1HVKA 5P1SA 2XYEA 3S2OA 5P6EA 3UDRA 4DVFA 4I0GA 4DJXA 4OC6A 5P23A 1A30A 5P20A 1IBQA 2ER9E 3IXKA 3NDTA 2CEMA 3QBFA 5OZ0A 3S8IA 2AOFA 5OZCA 5SY2A 4GZFA 4B70A 5I3YA 5ER2E 5P7TA 1LV1A 5TOLA 3N4LA 3OXWA 2AVQA 2VJ9A 5P0XA 4Y53A 4J55A 4HDBA 5P62A 1ZSRA 3UPJA 5OYYA 1PSNA 4HA5A 4DH6A 3VYDA 1SMEA 5P5XA 4Y41A 4Y5CA 3WZ7A 5P01A 4TRYA 4DJRA 5P37A 5P0JA 5P7PA 2IKUA 4EQJA 2O4KA 3L5BA 1G6LA 4LL3A 1FF0C 2WF0A 2XFIA 4PZWA 5P2JA 4R92A 2AOIA 2WHHA 5P3IA 1GVUA 1SGUA 1BAIA 3UDJA 1FQ5A 1ZAPA 2XYFA 5OZGA 4FAFA 5P4UA 1CPIA 5P1TA 5P78A 5P3GA 2OHPA 4YCTA 5CLMA 3D20A 5P0RA 5P51A 5JG1A 1HEGE 5C9BA 3EKVA 1KZKA 4Y5LA 1HIHA 2ZJNA 1APTE 4Y4EA 3PSYA 5P2FA 2FIVA 4QGIA 3ZKQA 4RYCA 4QJAA 4PYVA 2QI6A 4J0TA 5P2QA 2R38A 5P2KA 2G1YA 5P36A 2Z4OA 2UPJA 3S43B 4DQCA 2QZXA 1IZHA 4K8SA 2V00A 2PK6A 5P0VA 5P68A 5P5AA 3U7SA 5P8PA 2WEAA 5DGUA 5P17A 4FRSA 4Q5MA 2AZBA 1BDLA 1BWBA 5OZNA 5P56A 3GW5A 2ZHSA 5P0EA 2G69A 5P4VA 4TRWA 2P3BB 8HVPA 5P34A 5P3QA 1T6GA 3OU1A 4OBHA 3C9XA 4NJTA 3LIXA 2QI4A 3CKRA 2QZWA 3OTYA 5HE5A 4FAEA 3OUCA 3HVPA 4J1FA 2WF1A 5P6GA 2QMPA 4FCOA 4J54A 4CPUA 5P0YA 5P7BA 5DGWA 5P0OA 1C6YA 2QI7A 1ZSFA 2PSVA 1LYAA 3SA3A 4Y4GA 5P6UA 4N00A 1AM5A 2SAMA 4Y3TA 3KMXA 1SGZA 2I4DA 5P29A 3UQPA 3L59A 3CICA 1EPME 4RRSA 4M8XA 1SDTA 4I0EA 4OBZA 3TOHA 2QU2A 3VFBA 4DUSA 2ZJHA 4YBIA 2O4NA 5P41A 3MSLA 2NR6A 3DOXA 2G20A 4FRKA 4BFBA 3D1XA 5P7LA 5OZSA 1RV7A 1YTJA 2ZJJA 2VIYA 4Y4WA 5AH8A 1LF3A 2I4QA 4U8WA 1SH9A 4OD9B 4FL8A 5P5IA 4TRZA 5P4SA 5HD0A 2Q11A 1Z1RA 3U71A 5P66A 5P3MA 4D8CA 4DI2A 5KR1A 4GJBA 3S7LA 5P4HA 1FMUA 5P28A 5P3RA 1AJVA 3K4VC 3QS1A 5P89A 4FS4A 1T7JA 1TSUA 5P5RA 1AZ5A 2ZJIA 4ZSMA 5P7MA 3HDKA 1CMSA 5OZHA 1FGCC 4FRJA 4L7HA 5OZ7A 1APUE 3PHVA 3HAUA 4Y3ZA 1HPXA 2G1SA 2OHLA 5P3JA 5P6MA 1EBZA 5P59A 1FB7A 1J71A 5P71A 3EM4A 3MSJA 4D83A 1BV9A 3NSHA 2PMAA 3DM6A 3FX5A 3G72A 5P25A 5P79A 3TOFA 5P5EA 5OYWA 5P7GA 4LXAA 5P8VA 5P0GA 4DQGA 1IZIA 4YE3A 4CPXA 4TVHA 1KJFA 1W5XA 2PWCA 3ZPTA 4EP2A 4Y5EA 2ZHTA 5P6NA 1HSHA 5P7WA 5P2CA 3SA6A 3S54A 5P2LA 5P7CA 5P55A 2WECA 3PCZA 5P8NA 4EJ8A 3OUBA 1D4HA 5P0LA 1Z1HA 3INDA 2QHYA 3EM3A 5P85A 3O9CA 4GMIA 1HXWA 2HB2A 3KYRA 1XS7D 5IVRA 4HDPA 4YOAA 4DFGA 2ZHUA 3OHFA 1LYWA 2G21A 2V0ZC 1U8GA 5P05A 5OYTA 3D3TA 5P1UA 3LZUA 3UDKA 3L3AA 5P1XA 4RVXA 5P72A 2FDDA 2I4WA 3EC0A 1ZBGA 5P2SA 4DV9A 4Y4XA 3EL5A 3UDQA 4EYRA 5P2AA 4HE9A 4KUPA 5DQCA 1IVQA 2O4SA 1IZEA 2AVVA 2Q5KA 2ER0E 4U7VA 3BGBA 5P0KA 4L1AA 5ER1E 3H5BA 4RYGA 1OEWA 4LXKA 4GYEA 3VCMA 4XX4A 3INFA 4RROA 2WF2A 1CZIE 5P5YA 1HIIA 2FDEA 3NLSA 2J9JA 4FE6A 5OYUA 4L6BA 3GGAA 4R8YA 3DUYA 3B7VA 2PK5A 3OU4B 3O9HA 5P4AA 2ZE1A 2IGYA 4Y47A 3SAAA 1XE6A 1GVWA 4B0QA 4DJVA 1BILA 3VF3A 3SKFA 2OHQA 5P7SA 5P8TA 3OADB 3CIDA 3EM6A 1QBRA 3IA9A 4J1EA 2F3KA 5P5GA 4YA8A 3VLBA 4NPUA 5HCTA 1K6VA 5P3HA 1MTBA 4Y3DA 4R91A 3SO9A 3WZ6A 4Y4ZA 5P74A 3L5CA 2PWRA 4IVSA 5HVPA 4R5NA 3QRMA 3KFRA 1ENTE 1MERA 4WY6A 2V10C 3ZPUA 5P86A 2OHSA 2IRZA 5DR0A 4FGXA 1XDHA 4Y3RA 4K4RA 4ER2E 3SPKA 3VFAA 2VA6A 1IIQA 2Q63A 4J0YA 4CPSA 3D1ZA 2CEJA 4Y3EA 1APWE 1QS8A 5HCOA 2QI5A 5P3OA 5P70A 5P2DA 2AOCA 2NNKA 1A8GA 1YM4A 4Y3JA 4IVTA 3BUGA 4GJ9A 2BB9A 1W5WA 4Y50A 5P6JA 5P60A 1ODWA 4TVGA 5DPZA 5P1YA 1HTGA 5IS4A 1YTIA 3MSKA 2G22A 3TPJA 5P65A 2OHNA 3TKGA 3BXRA 2B42A 2QD8A 3Q4BA 1PPLE 1MVPA 4YD4A 5OZRA 4F73A 1HWRA 2P83A 1NSOA 4FIVA 3OOZA 5P3LA 2FGVA 5P0DA 3OU4A 1T3RA 2PQZA 4FLGA 3VF5A 5P5BA 4M8YA 2PC0A 3LINA 4NPTA 2OAHA 4BELA 2FNSA 3LPJA 5P5FA 1AAQA 5P2GA 3EL4A 3UFLA 5HDVA 2XFJA 4H3IA 5SY3A 3OAGB 3HZCA 3JW2A 4CPWA 2AIDA 4FM7A 5OZTA 1WKRA 5P4NA 2RSPA 3H0BA 1ZPAA 3KT2A 3PWRA 2OHRA 4D89A 1B6JA 5BS4A 4X7IA 4Y3NA 4DPFA 3SFCA 2VJ6A 1BV7A 3T3CA 5P84A 3EL1A 5P6RA 2AQUA 3O9DA 4ACXA 4ZPFA 2VJ7A 1VIKA 1BBSA 1NPVA 4ER4E 5OZ3A 5P4WA 4LBTA 3K5FA 5HE4A 2F81A 3O9LB 3PJ6A 2BQVA 4CPTA 3DV5A 2QMGA 5OZ4A 3DV1A 2QMDA 1EC2A 5P3XA 3OQ7A 1FFFC 3AIDA 1T6EX 3O9BA 2A4FA 3QAAA 4RCEA 5P46A 7HVPA 5KOSA 2IGXA 5P07A 3GI4A 4GJ8A 1ER8E 4JECA 4MC6A 4RRNA 1LF2A 2NMZA 5C9DA 3SA5A 2RKFA 3Q5HA 3EKTA 5ENKA 5P1FA 3URLA 1FG8C 1HTRB 4ZLSA 3OUDB 4Y4UA 4Y35A 2Q54A 5IVSA 3QVIA 5P8QA 5P6FA 4BFDA 5P8UA 1XE5A 5P6WA 1MT8A 5P83A 4NJSA 4LHHA 3TL9A 5OZEA 4UPJA 4Y57A 5OZ1A 5DQ5A 2G1OA 2JE4A 5P1BA 4DQEA 3CKPA 5OYQA 1W50A 1HTFA 5P0ZA 2HPFA 3L5EA 2IDWA 5P30A 1QBUA 5P8RA 5P54A 1C6ZA 5P80A 3VYEA 4LC7A 4FSEA 5P6CA 5P06A 1SBGA 3RTHA 3UCBA 1EC1A 2Q55A 5OZ8A 3RU1A 4B1DA 1HBVA 2NNPA 1G0VA 3LZVA 3QRVA 5P2XA 1KJ7A 1TCXA 1EPPE 2OHMA 5P7QA 2FDPA 5P2WA 5P5WA 1OHRA 4R95A 3PWMA 1DAZC 2O4LA 4DJWA 1IZDA 2P8HA 3L5DA 5AH6A 5P15A 4LAPA 2BPVA 1FKNA 5P2HA 3IGBA 1W5YA 4Y5KA 4I0DA 1BIMA 5P7IA 3EMYA 2QD7A 5P18A 3N3IA 1SDUA 2ANLA 4WTUA 5P7OA 1AVFA 3EKXA 1A8KA 2F3EA 3CIBA 5HDXA 2RMPA 3WB5A 5JODA 1D4SA 5P61A 2VA5A 4EWOA 2F8GA 2AZ8A 5SZ9A 5P7HA 2O40A 4Y5MA 5DQ2A 5P1LA 3OQKA 1NH0A 5P1ZA 2QK5A 3GGXA 4I0HA 3IXOA 3NDUA 2PH8A 2ZHVA 3URIA 4B1CA 4HDFA 2BJUA 5P00A 5P0TA 1PSAA 4QJ7A 4Y3AA 3INHA 1EPLE 3DCRA 2Q64A 1MT9A 4Y37A 3O9IA 5AHCA 5P42A 1F34A 3ZKGA 1ODYA 2JJJA 3PVKA 5P8MA 2BPWA 3BVBA 1JLDA 2QD6A 1T7IA 5P67A 5P4MA 4DPIA 4EPJA 1B6LA 3OHHA 5E5JA 2V16C 1DP5A 2UY0A 3I7EA 2BBBA 1HSIA 3PI0A 5P7AA 2HS2A 1BXOA 3NU9A 4DQFA 1LZQA 2QHCA 2APRA 3UTLA 1ZPKA 5P4IA 4EJLA 5AGZA 4Y5GA 1DPJA 5P7DA 3PSGA 1HSGA 3ZL7A 4RVJA 3O9FA 4CPQA 3VV6A 3RTMA 4CKUA 3FNSA 1FIVA 5BRYA 5P1GA 5P5VA 1HRNA 3S56A 3HLOA 1FQ8A 2R5PA 4YHQA 5KQYA 2WEZA 5P7UA 2P3DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HIV A;  3VG1 A;  4EXG A;  1HHP A;  3ZLQ A;  3S45 A;  3K5D A;  4DQB A;  2R3W A;  5COO A;  5FIV A;  5KR0 A;  1FQ6 A;  4Q1Y A;  1Z8C A;  6UPJ A;  5P5S A;  3OQD A;  2QI3 A;  2R3T A;  4MC9 A;  5P12 A;  2HM1 A;  2QNP A;  2I0D A;  1D4K A;  5P04 A;  4Y4J A;  2EWY A;  4DJY A;  3OOT A;  1LF4 A;  4OBD A;  5OYV A;  4MC2 A;  4PHV A;  1GVT A;  1LYB A;  1UPJ A;  2JJI A;  1NPA A;  2I4V A;  1BDR A;  4Y9W A;  2AZC A;  2WL0 A;  3Q3T A;  3BRA A;  4I8Z A;  3VF7 A;  1QRP E;  2I4U A;  1B11 A;  1D4J A;  3SA7 A;  3MXD A;  4HZT A;  1ZP8 A;  2HS1 A;  5P5H A;  5P2Z A;  4QJ8 A;  2AVO A;  3FKT A;  4I0Z A;  2WF4 A;  5OZL A;  5P5K A;  5P6Q A;  1FFI C;  4I10 A;  1PSO E;  3JVY A;  5P8F A;  5HDZ A;  5P73 A;  5P5U A;  4Y58 A;  4Z2Z A;  3UDP A;  3UQU A;  3GGV A;  3LZY A;  5P0P A;  5P1H A;  3WSJ A;  4J1C A;  5P6T A;  3QVC A;  4DQH A;  1A9M A;  5P1N A;  4RCD A;  1A94 A;  1B6M A;  1HTE A;  3UF3 A;  3UDN A;  5P7X A;  2VS2 A;  3LIY A;  4WY1 A;  5OZX A;  1PRO A;  4LP9 A;  3UDH A;  3R1G B;  3QRO A;  3QP0 A;  1ZJ7 A;  5P6Z A;  2R43 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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