3OZOA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with ngt
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of insect beta-N-acetyl-D-hexosaminidase OfHex1 complexed with NGT
rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ozoA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3ozoA01
1OGSA 2VOTA 1WO2A 1M53A 1W3LA 1OINA 2BXYA 1W91A 4DWSB 1Q6DA 1TA3B 1ZU8A 1KGXA 4UQ9A 1UA3A 3RIKA 4MNKA 1US3A 5HNNA 2J7BA 1F4AA 2GJXB 1OT1A 3CH9A 4MNJA 1FFRA 1VBUA 3QR3A 1V0LA 1ZL1A 2ZXDA 5EFFA 2CETA 2GK1A 1B31A 2VX6A 2J25A 1I1WA 3ECQA 5EB8A 1B1YA 1E71M 2CERA 4OIFA 4UFHA 2BY3A 5DMYA 4M82A 3WMBA 3W6LA 5CJ5A 2D0FA 2WVSA 5JIWA 5E0FA 1RH9A 1HT6A 4B16A 3VIMA 1JIBA 5C8BB 3BSHA 1FHDA 1EO5A 1WAWA 2DH3A 2WMHA 3M6DA 2DIEA 2WXDM 1V03A 1E4LA 2O9RA 1K6AA 3CHCA 4AW7A 3NCOA 4IUGA 4ACZB 1PX4A 1N82A 3WEZA 4XZBA 1CXIA 2FH6A 3VD9A 4HA1A 3J7HA 2VQTA 5C70A 3DECA 1JI2A 2DSKA 1PX8A 4A3HA 4GIAA 2B31A 3FW6A 3K8KA 2VRJA 3CO4A 4KRUA 1DTUA 1OD8A 1GJWA 1UWTA 2DSUA 5IFTA 1V3HA 4MAVA 1BYBA 4HU0A 3WIJA 3PZIA 3N15A 1DWHM 1V0KA 3AZTA 4HA4A 1BQCA 2VQUA 4U2YA 4CUCA 4URIA 4CVUA 1E56A 1VFUA 2ZUUA 1EDTA 1J9YA 1H41A 3KE0A 1UHVA 1W9DM 4UFLA 2VCBA 3L2MA 3BCFA 2F8QA 3BAWA 1G01A 1E0VA 1VEPA 3D5HA 1IZJA 4PMXA 4C7GA 1M04A 3TTQA 1H0GA 4W86A 4U3CA 1EXPA 1KBKA 4AIOA 3WQ4A 3VILA 1HL8A 3N9KA 1H11A 5D8ZA 4M8UA 1DHKA 1JXKA 3BAYA 2WM0A 2YA2A 2VCCA 1CECA 5D4YA 5E6ZA 3VDBA 2PF0A 3GNOA 3T09A 5HPCA 2YL5A 5E70A 4M24A 2RGMA 3VIIA 5ABEA 3NDZA 5HDRA 2J78A 3GBDA 2WC4A 4OOUA 1ISVA 4ZEPA 3SCTA 3OGVA 3PZOA 3VD4A 1LLOA 3OLGA 1Q4NX 2D23A 2JEPA 3OZPA 1J0ZA 4KGLA 4D1IA 4JFVA 1GPFA 4GO9A 3W4RA 3LMYA 2CKRA 4UQCA 1ODUA 3NSNA 3WUEA 1UR8A 1H4PA 4AD4A 1JYXA 3NDYA 4TOQA 1HIZA 2A3EA 3IAPA 4P8WA 5HOSA 5A8NA 3BXWA 3FHAA 4L4OA 4UZUA 4DUWA 1V6WA 3EDKA 1XSKA 3OIHA 5CSUA 3OZOA 1BG9A 4BZYA 2BHZA 1CPUA 3N11A 3OLDA 1XH0A 2CIPA 1XCXA 3W24A 3PN8A 3AS3A 3VNZA 1QI4A 3CZEA 1V3KA 1NOUA 1EOMA 3KL3A 1H2JA 4BS0A 2E9LA 1CIUA 1CXFA 4W8AA 4HTYA 3KL0A 5EBAA 4YHGA 3RO8A 3VUPA 2J75A 2YLLA 3GYCA 4E8CA 1GONA 3PTQA 1CDGA 2CHNA 1BGAA 2WWDA 2WSPA 2WHMA 2OWWA 2FGZA 3L4UA 1K9DA 1V6UA 2FH8A 4J3TA 1V0NA 3WH8A 1UD8A 3CUGA 5JIPA 1QNQA 3VVGA 3LPOA 3F5JA 3CHFA 5I23A 1ITXA 3L4TA 4WKFA 3VGHA 3VDHA 2ZOXA 3AHVA 3T0DA 2ZX6A 1GOMA 1FA2A 1WB0A 3EBVA 2XVLA 1AQHA 4LPCA 1W9BM 2VCAA 3AZRA 1Q6CA 4PMOA 3WD3A 1E6RA 3PZ9A 4M80A 1RP9A 3HU7A 4QP0A 4U31A 2C7FA 4XV0A 2XIIA 8A3HA 1GVYA 2CBIA 3AISA 3O2LA 3U57A 2VUYA 4JFSA 1XC6A 1UD5A 1VBRA 3QOMA 3SUUA 1MQPA 3MV11 3ZT7A 1EOKA 5CZKA 3VGBA 4QFUA 1R86A 4U3AA 1MW1A 1DP0A 2D1ZA 4IPLA 2ZUWA 3L2LA 3KEHA 2FGLA 3VGEA 2EPKX 5GNZA 1BGGA 3AMCA 3AIBA 1ITCA 3GNPA 2V38A 4P8VA 4PSPA 3WY1A 4R27A 4HPGA 4FF5A 3ARZA 1JNEA 1E55A 2ZUMA 1XCWA 3B8SA 2VZOA 5A8PA 2J7FA 4Q7NA 1VFMA 3FNDA 4MJ2A 2OLHA 4CVWA 1CGTA 1XRVA 4UQBA 2FHCA 5AYBA 1P6WA 4PMNA 4ZFMA 5A95A 4TX6A 1CLXA 2G3IA 3PTMA 3VGFA 1J11A 2YA1A 4JFUA 1FP8A 1US2A 3WNLA 3UR8A 2W62A 4UCFA 4E4PA 4KRTA 4W7VA 2J79A 2E0PA 1GCYA 3BH4A 1TFVA 3BLKA 4U5IA 4BQ2A 3O9NA 4CD8A 2XIBA 3SEPA 3AS0A 1MFUA 1B3XA 4HU8A 3SUSA 2W5FA 3UR7A 2W61A 3FXYA 2J8FA 3ZR5A 1UQYA 5FIPA 4A3YA 2J77A 4PTWA 1VIWA 3UG3A 5BRQA 1DWJM 5FCZA 4E2OA 2BNJA 4P7QA 1WCGA 2JIEA 2W92A 1XH2A 1D7FA 5A6LA 3WH5A 1WP6A 3BSGA 1NWTA 4RE4A 3WKZA 2A3BA 1GOQA 1FH7A 4AZIA 3GM8A 3EMCA 4AD1A 2Y8KA 4MB1A 3WBEA 3WUGA 1U2YA 2PWHA 2WVUA 3JUGA 1NM9A 4ZENA 4UNIA 4GZIA 3T2PA 4H8HA 4GI9A 3ARTA 3W81A 3PTKA 4B9ZA 4ACYA 1DEDA 3F4VA 2XGBA 3N18A 2WCGA 4D6FA 4FLQA 2FDMA 2XVGA 1SR0A 1I75A 1V3LA 2XM1A 1I1XA 4TUFA 1LG1A 3BAIA 1J0YA 3AMGA 4PMYA 1CYGA 4UTFA 1EHNA 1JYWA 3WH9A 1NOWA 4PUDA 3VGGA 1E5JA 2EBNA 2O92A 2X8RA 4D6JA 2FHFA 2J47A 4WJXA 2WBKA 2V3EA 4Z2HA 4AC1X 2VRKA 3DYPA 3CLWA 3DHPA 1G0CA 1HN1A 5DO8A 3ARYA 4RL3A 1BVZA 2YDQA 1UD4A 1AQMA 1CENA 3WDIA 1H49A 3VTRA 3E1F1 1UWRA 3VX0A 2DQXA 2MANA 1HX0A 2ZUNA 2FHBA 3TTYA 4FK9A 3MMUA 3EDFA 3SCVA 1BVNP 1UD3A 2AMGA 1V6YA 2VURA 4DWSD 5M17A 4P8UA 1GORA 1KGUA 1ISYA 4WF7A 4OBRA 4XZWA 1OWQA 5IHSA 3CMJA 3PBGA 5DT7A 2V3GA 3WUBA 4UOQA 7A3HA 2DH2A 4DUVA 1EQCA 1PPIA 1KCLA 5A3HA 2EPNA 3SCRA 1H5VA 1XHGA 4MTVA 4P7NA 1WDRA 2PWEA 2ZXBA 1E0WA 4HA3A 1E15A 3EDEA 3VIJA 3MSDA 4U2ZA 5A69A 3L4WA 2BY1A 1D2KA 5FKYA 3W0KA 1EQPA 4W5UA 3ARPA 5KZ6A 4GO8A 2BFGA 3QOKA 4GKLA 1K9FA 1K9EA 1HJWA 3HJEA 4BQ4A 4CD7A 3K4AA 2V5DA 5BXPA 1WDPA 3AYRA 1BHGA 4PN2A 1G5AA 3TP4A 3HMCA 1GHRA 4U5KA 1L0PA 4CKQA 5LA2A 2QHAA 3UETA 1RPKA 2D20A 4AD3A 2OSYA 3AYSA 5CGMA 4C91A 1YHTA 3T2OA 6A3HA 1NWSA 5I0DA 4LGXA 2XTKA 3VU2A 2XUCA 4TVDA 3DHUA 4JKKA 1KWKA 4CGTA 2VX7A 4B15A 4Q22A 3GNRA 2JIWA 4PMVA 4X0VA 4DM1A 4HMEA 1OIFA 1OD0A 1CXLA 3WUFA 5BYWA 1BSIA 4V27A 1HP5A 4JHOA 3AROA 2DEPA 2X05A 3WNPA 2PB1A 1J10A 1Q6GA 1JZ2A 1GOWA 4D6CA 3QHMA 4Z2LA 1UYQA 2WHJA 5BCAA 4W7WA 4FLOA 1KR0A 2X1IA 3SCQA 5E6YA 3MUIA 1TVNA 4P7RA 1WZAA 1KBBA 3W29A 5A6BA 1DWAM 4PMRA 7CGTA 4UFMA 1QHOA 2ZX8A 3FAWA 1B0IA 2O9OA 2HISA 4JZ5A 2XGIA 1B3YA 3ARXA 1ZBVA 3BAXA 1CXEA 4LYQA 3W27A 3T0AA 5BXSA 3CPUA 1QVBA 4QDMA 2IXVA 1GQJA 1JD9A 2W66A 2WKGA 3CUHA 3W82A 5A6MA 3BAKA 5D9OA 3TONA 2DIJA 2J8GA 1CGYA 2Y24A 1ZJBA 2WCSA 1MXGA 1DWIM 3ARVA 4OZOA 4H2CA 2E9BA 4PCTA 2VT0A 1ZBKA 3WFZA 4GZEA 1VFFA 1E6SM 2GUYA 3RM4A 2EPLX 5E09A 2GJPA 1BAGA 1ZJAA 3DC0A 1QI2A 2X0YA 4JL1A 5A6KA 2DPEA 2A3AA 2BHYA 4JKMA 2XG9A 5CPQA 3ZJKA 2WCAA 2OYKA 6CGTA 5HBFA 1LF1A 2G41A 1CTNA 1E3ZA 2XHYA 3OGSA 3ARSA 6TAAA 4N0RA 3WNOA 5IFPA 5LYRA 1UZ1A 1NWUA 1DWGM 1TCMA 2VZUA 2VX5A 1UG6A 3CGTA 1OM0A 3BC9A 3WNNA 2J4GA 3PZTA 5A8OA 3AIVA 3NSXA 3ZT6A 2WSKA 2GJRA 2J62A 2GK1B 4ATWA 2UY4A 3WL1A 1MYRA 3MANA 1E3XA 3S6TA 1Z32X 4AZ7A 1TG7A 3UG5A 3FAXA 4W5ZA 2Q8XA 1WPCA 4MNLA 3RMEA 1E43A 2EPOA 3FHQA 2PC8A 1MW0A 1AQ0A 5F7UA 1ODZA 1EDQA 2WMKA 4PBGA 4W93A 1MQQA 3A4AA 1M03A 3ZIZA 4AIUA 1J0IA 4AD2A 2EQDA 2CBUA 3AIRA 1EA9C 3BMVA 3M07A 4J3UA 3SCWA 3POHA 3I3EA 1QNPA 4FMVA 1JD7A 4D6GA 3VIKA 3WD2A 4X9YA 1UR1A 1JDDA 3SURA 2WLYA 5FL0A 1E6XM 1KFWA 2ZICA 1E72M 3U7BA 1EH9A 1JAKA 1ZBWA 2J74A 3T2QA 1G1YA 2ZUSA 3W53A 1PAMA 1C7TA 1D3CA 1R7AA 2E3ZA 4PMZA 2DDXA 4MB3A 4PTXA 4UFKA 1UWSA 2DGAA 2F2HA 1E73M 1FFQA 5I77A 3D3AA 4KGJA 3WEMA 4AXNA 2OYMA 2ZIDA 3L4XA 2ZXQA 1UKTA 3VDCA 1JG9A 1MW2A 1UWQA 1WZLA 3CMGA 4OKDA 5ECUA 3UCQA 2J7EA 4QLLA 1FHLA 3A6OA 3EDDA 2Z1SA 3OBAA 4AD5A 5I78A 1VRXA 1YQ2A 2JEQA 1ZS2A 3HN3A 2YL6A 1J12A 3RM9A 2CKSA 2WZHA 3FN9A 4D71A 1C90A 2ZX7A 4DUXA 1VENA 1QBAA 3KZSA 1UUQA 3G6MA 1GJUA 3B9EA 4MADA 2NSXA 5D8WA 1ISXA 4Y7EA 4JAWA 5I2UA 3OB8A 1ISWA 3WF3A 2A3HA 4H41A 1H09A 2VNCA 1HXJA 5A94A 1SMDA 4R5EA 3VIFA 4BCEA 4UQAA 4B3LA 2WC7A 3OA5A 5CSYA 3QHOA 2W91A 3VIPA 1UA7A 4EKJA 3SCOA 3WDJA 3AI0A 2UY3A 3BLPX 2WNWA 3CUFA 2ESCA 2VO5A 3WF0A 1CNVA 2WC3A 4NRSA 3PZQA 3AFBA 4TTUA 3NYDA 3VKKA 4RE3A 4ML4A 3WBAA 4ZXLA 1A3HA 5JBDA 1W1YA 1E6QM 2JF7A 1CGWA 3UEQA 2J7DA 3WENA 4J27A 1E6NA 2YBTA 3VD3A 4CCEA 2Y4SA 3K46A 5CG0A 5FL1A 1GOKA 1XYZA 5EFDA 2ZXAA 2VZTA 1M01A 1PX3A 2CBJA 3ZJ8A 5AC5A 1WZKA 2XVNA 5FD0A 3AHXA 4CU7A 4HP5A 1OCQA 2JF6A 1BF2A 2V3DA 1F4HA 4U33A 5I24A 3MU7A 3ARRA 4YN5A 1LWHA 1O7AA 1KQYA 4J7RA 3VPLA 4UR9A 2VI0A 5M5DA 3RDKA 3I3DA 1M7XA 4E8DA 1HKKA 4HZ8A 3AXHA 4PUEA 4UZSA 2G3MA 1R87A 4HZ7A 4AEEA 1W1TA 3TOPA 3WNMA 3VM5A 1NARA 3WH7A 1VJSA 1EO7A 1HKIA 3ZJ6A 1TR1A 1ZBCA 3VD7A 1E6ZA 1CGXA 4IM4A 3PHAA 1E40A 4D6HA 3BCDA 2WMIA 2J7CA 4WKHA 2E8ZA 1VAHA 1SFSA 3AHYA 4CN1A 3AIWA 1CGVA 2ZWZA 1XD1A 5E9AA 3EDJA 2G3NA 2AAAA 4FLSA 3IK2A 4AIEA 4Z2IA 3BGAA 5DEZA 1JFXA 3K4DA 1LQ0A 3CBWA 3NUKA 1JZ3A 3NSMA 4GI8A 5CLTA 4FLRA 1SMAA 5GNYA 1JZ8A 1GQIA 4MDPA 4JHZA 4QLKA 1G9HA 2WKLA 3PZNA 3O6AA 5DFAA 1HJUA 3MKKA 3VIGA 2WWCA 4PMDA 3K8LA 3CZJA 1E5NA 2WHKA 2VR5A 1CLVA 1EDGA 2YDSA 1W1PA 1UH2A 2DT2A 2GFTA 3IJ9A 2BV9A 3POCA 2W4XA 4A4AA 3AZSA 3THCA 5LA0A 3VIHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OGS A;  2VOT A;  1WO2 A;  1M53 A;  1W3L A;  1OIN A;  2BXY A;  1W91 A;  4DWS B;  1Q6D A;  1TA3 B;  1ZU8 A;  1KGX A;  4UQ9 A;  1UA3 A;  3RIK A;  4MNK A;  1US3 A;  5HNN A;  2J7B A;  1F4A A;  2GJX B;  1OT1 A;  3CH9 A;  4MNJ A;  1FFR A;  1VBU A;  3QR3 A;  1V0L A;  1ZL1 A;  2ZXD A;  5EFF A;  2CET A;  2GK1 A;  1B31 A;  2VX6 A;  2J25 A;  1I1W A;  3ECQ A;  5EB8 A;  1B1Y A;  1E71 M;  2CER A;  4OIF A;  4UFH A;  2BY3 A;  5DMY A;  4M82 A;  3WMB A;  3W6L A;  5CJ5 A;  2D0F A;  2WVS A;  5JIW A;  5E0F A;  1RH9 A;  1HT6 A;  4B16 A;  3VIM A;  1JIB A;  5C8B B;  3BSH A;  1FHD A;  1EO5 A;  1WAW A;  2DH3 A;  2WMH A;  3M6D A;  2DIE A;  2WXD M;  1V03 A;  1E4L A;  2O9R A;  1K6A A;  3CHC A;  4AW7 A;  3NCO A;  4IUG A;  4ACZ B;  1PX4 A;  1N82 A;  3WEZ A;  4XZB A;  1CXI A;  2FH6 A;  3VD9 A;  4HA1 A;  3J7H A;  2VQT A;  5C70 A;  3DEC A;  1JI2 A;  2DSK A;  1PX8 A;  4A3H A;  4GIA A;  2B31 A;  3FW6 A;  3K8K A;  2VRJ A;  3CO4 A;  4KRU A;  1DTU A;  1OD8 A;  1GJW A;  1UWT A;  2DSU A;  5IFT A;  1V3H A;  4MAV A;  1BYB A;  4HU0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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