3P8WA

Crystal structure analysis of r29m/e81m double mutant of human clic1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
236
structure length
236
Chain Sequence
PQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQMLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIMEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure Analysis of R29M/E81M double mutant of human CLIC1
rcsb
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 236
sequence length 236
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3p8wA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3p8wA01
4KA0A 3TJJA 2HZEA 2CX4A 3TRXA 2O87A 2GS3A 3I9V2 3APSA 4WETA 3QR6A 3DGQA 3HA9A 3J7Yk 2CVBA 4X43A 3TJKA 2VCQA 2C3NA 3IC8A 3F3RA 1BEDA 2L4QA 5C04A 1FAAA 3ZVJA 1V2AA 2RM5A 1A8YA 1K0NA 3UVHA 2AJQB 5HFKA 4G0IA 4HI7A 2VCZA 4KF9A 1E6BA 2IPAA 5KN0A 2YV9A 4YQMA 4XS4A 3IDVA 1PGTA 3QOUA 5ECSA 3Q19A 1VF2A 1TTZA 4ECCA 1ERWA 4V1Ap 2YV7A 4IELA 3DIEA 2X99A 5H5SA 3UBKA 2QSIA 2DJ3A 5H5RA 4FIWA 2YWIA 5CRWA 3LORA 5E59A 2IMEA 2GGTA 3ME8A 4OFTA 5J4UA 5B6MA 5JCUA 1SJZA 2P31A 1R5PA 3CMIA 2OE3A 1DE1A 1DE2A 3PR8A 3S9FA 3HD5A 2M72A 4O7HA 2YP6A 4KB3A 4CDOA 3EYTA 1JZOA 2E7PA 3LXTA 1ZGNA 3CBUA 1SK1A 3ISOA 3RHCA 2WCIA 1JLVA 2RUEA 1B48A 4MF7A 2H1DA 5J9CA 3GSSA 1QK8A 5J3RA 3KIJA 1G7EA 2EIQA 5A5KA 3DWVA 1PA3A 4F82A 1RK4A 3RBTA 1EP7A 1I9DA 3GKNA 3LGCA 1KNGA 3EMPA 2GSSA 5ECIB 3HXSA 2LUSA 2YWNA 3APQA 4ZBBA 3DD3A 1SK2A 3GTUB 4IS0A 1TXXA 2GT6A 4TRXA 5CRDA 3ZRDA 3UVTA 1BX9A 1EEMA 1A2LA 4ZL8A 5HQPA 1XZOA 3EWLA 4G19A 4MZWA 2HRNA 3IAM2 2IN3A 3F4RA 1Q98A 2B7JA 2TRXA 3E9JB 3K8NA 10GSA 4X1UA 2CAQA 3HJPA 2QKEA 4DSSA 2WGRA 2FLSA 1SJIA 4KW6A 2E0QA 1O8WA 4K7IA 5ECQB 3VK9A 1J9BA 2HFDA 3US3A 5ECKB 4PQHA 4IVFA 3VWXA 4ISDA 1OKTA 5D8IA 5G1LA 2VAFA 1THXA 3D6IA 5CRGA 4EKZA 3VLNA 4HQZA 4RI7A 2DC5A 4POBA 1TKDB 4IHUA 1XWAA 5CO3A 1UVZA 1A23A 3M8NA 7GSSA 2IMIA 5FHIA 1GSYA 2HYXA 1YF0A 3DVXA 3Q74A 1TK8B 3A3TA 3W8JA 4LMVA 5GSTA 2H71A 3ERFA 1CQHA 5A4WA 4BVYB 2WJUA 5CNWA 5HR3A 1O73A 2K18A 1QXHA 3C1SA 5LCZA 1ZMAA 4NPBA 1GTUA 3QPMA 4YQUA 5JCWA 4WF5A 2H72A 2JADA 2YZHA 1FB6A 1YEPA 1U3IA 1PKWA 2H30A 3L4NA 4KE3A 1AIUA 4E8EA 1Q4JA 1F6MC 3NIVA 4GSTA 2DIZA 2MZCA 4ZL9A 3LJRA 1V57A 3TRPA 3WYWA 5ECOB 3VWWA 2IFQA 1YDKA 5EL8A 1FOVA 2GSQA 3IC4A 4RQXA 1OVNA 2OJLA 3HKRA 1XIYA 1WMJA 1PKZA 1K0AA 2ZUPA 2AV4A 4MP4A 1SL2B 3ZZXA 5DALB 1F37A 1M2AA 2O7KA 1BYEA 2QGVA 1EZKA 2EC4A 3GNJA 5ECNB 4N0ZA 3GRXA 3MDKA 4ML6A 3ZLPA 4L5OA 4TR1A 1TP9A 2H8LA 2H6XA 3F3QA 2X8GA 3QCPA 1B4QA 3FR3A 4MABA 3ZTLA 4I5QA 2JSZA 5DAKB 3U6VA 2FGXA 5C00A 2CVDA 3M3MA 4ZB8A 1TOFA 1NHOA 4GSSA 1ST9A 4RI6A 2LSTA 4F03A 4IGJA 1ERVA 1NW2A 1OAZA 3M9KA 2YJ7A 2VLTA 1WPIA 2NTOA 3APOA 3GL5A 2XC2A 3WT1A 4I2TA 2K8SA 3AY8A 3CTGA 1GL8A 3D22A 5IIZA 1XPVA 5INYA 1EV9A 2FCHA 2PN8A 4I2UA 3FR9A 2OA7A 3BD2A 2CVKA 2F51A 3IPZA 3SWLA 3IRAA 3UEMA 2H6ZA 3V1WA 4MJBA 4QQ7A 2Z9SA 1AAZA 1BAYA 3DVWA 1AQXA 1EGOA 1C72A 3H4KA 1T00A 3MNGA 2VD1A 1FW1A 3TKPA 4MA9A 2V41A 1UN2A 4PNFA 4ECBA 2E2MA 3RDWA 2REMA 3HZ4A 5E4WA 3UBLA 4O92A 2WDUA 2DJ1A 1TU8A 2C4JA 1FB0A 2V2GA 2MYGA 3IR4A 2VCXA 2KP1A 3N9JA 3E0UA 3IK9A 4FH8A 2NPBA 2D2ZA 1N2AA 2YWMA 3HJOA 4GQFA 1FG4A 9GSSA 5ABRA 2M46A 2X8HA 4KCEA 1MTCA 2VIMA 3FKFA 2O89A 3O76A 1PX7A 4K8MA 1GSFA 4XCSA 3FW2A 4Z7XA 4BWSA 1X9WB 5ID2A 2F3MA 1A24A 4OFNA 2DJ0A 2FWFA 3UL3A 2A2RA 5DQYA 1WJKA 2O85A 1MDIA 4K0NA 2GQKA 4NXIA 2BJXA 1IYIA 3HVSA 2H66A 5CP1A 4JR4A 1M2BA 3L78A 4JU5A 3H93A 3H8QA 2CAIA 2L59A 2VM2A 4ZILA 1F3AA 3HYPA 1U3AA 3DMLA 1X0RA 2C0DA 3UARA 4E8HA 5GAPD 5IOWA 3L9SA 4FYUA 3TUEA 4EUYA 2EIRA 2VCWA 3EMXA 3VI7A 2I4AA 3EVIA 2HI7A 3PH9A 1JLWA 4L0UA 4EC0A 2R2JA 5IMFA 3FEUA 1OKDA 5DCHA 4ZBAA 4KH7A 2LRTA 1GWCA 3GYKA 3L9UA 1XVWA 1YF1A 4D73A 1N8JA 5KN3A 1TW9A 3TB2A 3GX8A 5IO0A 3KTBA 3ZFLA 3ED3A 2CZ3A 4LA1A 3HY2A 1K0BA 3GUSA 4G0KA 2HSMB 4MLYA 1U87A 2VL2A 4Q5QA 1TRUA 2IMKA 2GT5A 3J7Yb 5B7CA 1XW9A 3VURA 1XVQA 1OE8A 2YZUA 1YKCA 4XTSA 22GSA 4WKWA 3F9UA 4MJEA 4IP6A 2NBSA 4TXVA 4ZB9A 4HJMA 2FA4A 2WZ9A 3O6TA 1ML6A 1GTAA 1B4PA 2R5GA 1PX6A 2ALBA 3TGZA 2HT9A 2B7KA 2FA8A 1GULA 1SK0A 2DJJA 3A2WA 1ABAA 5IMZA 14GSA 3GKXA 3ME7A 5EVOA 3G9BA 1OE7A 4KX4A 6GSXA 3TKRA 3IOSA 2VUPA 3KJYA 1HQOA 2CA8A 1PN9A 1M9AA 4MMMA 2OADA 3JCML 4GCIA 3EINA 5HR0A 2DIYA 4RUVA 4BL7B 2HRFA 3PPUA 1F2EA 3ZITA 4TKYA 1V9WA 2HZFA 3G7JA 1MD4A 1ZCPA 4IQAA 1JFUA 4IKHA 3GH6A 4LMWA 2J9HA 3IV4A 1TDIA 3FZ5A 4NWYA 4V1Ag 4EVMA 3F4TA 4WF4A 4L8EA 1AC1A 4K1FA 1EOHA 3RAZA 5BMUA 2XBQA 3CXGA 2CX3A 1A2JA 5LD0A 4GLTA 1K3OA 6GSUA 2KLXA 3RPNA 3M1GA 1TI3A 3P2AA 1YZXA 3HVXA 3ZIJA 3N5OA 4PXOA 1SENA 3I6AA 3L0HA 3D0ZA 2YWOA 3G7YA 3TKSA 3GSTA 3ZFBA 5ECRB 2H1GA 1I5GA 3QAWA 2LTKA 4AJ7A 2OACA 1VGLA 5HR1A 4HJ2A 3GMFA 1F3BA 1ZYQB 5D93A 4OO5A 2IL3A 5F8BA 1TK5B 4XS6A 1EOGA 2LEGA 2VM1A 2XPDA 5DCGA 2XPEA 1AQWA 4JZQA 3GTUA 1EWXA 5JCGA 1FHEA 5G5FA 1GSQA 1MEKA 2MMNA 4QL7A 4MH2A 3TJFA 2AB6A 2PMTA 3M0FA 1VF1A 1AW9A 1Z6MA 3ZL5A 5ELGA 3LQ7A 2IIYA 3VI5A 5IM9A 1X5DA 1O81A 3GKKA 4PNGA 1O7UA 3QMXA 3VPTA 1TRSA 2P5QA 3KGKA 2V1MA 2C3TA 1G6WA 1G0TA 1B8XA 3O3TA 3KH7A 3KCMA 2PVQA 3GL3A 3UIWA 4MK3A 2YJHA 3C7MA 1A0FA 2C8UA 4GSNA 2LJAA 2F8AA 3HHVA 1DSBA 2FWHA 1XBSA 4ML1A 4OFMA 2CQ9A 1SKWB 4K0GA 4NMUA 3TDGA 1YKAA 4IP1A 4GTUA 3IBHA 5KEJA 3TCOA 2TRCP 2B3SA 1S3DA 2GDRA 6GSWA 1YEXA 3KH9A 2H0HA 1X9MB 2G0FA 2A4VA 2MMAA 3FRCA 2V6KA 5J41A 3E3EA 1Z5YE 5ELAA 4BVYA 3IK7A 1WE0A 18GSA 5JWOB 2B1LA 1H4OA 4AJ6A 2H01A 1GLQA 6GSSA 4LLRA 4USSA 2LQOA 5D9WA 4G2EA 2HRAA 1GLPA 1FVJA 3EU3A 2R3XA 2WULA 3BCKA 1B9YC 4EL1A 3TOTA 4MF5A 1PMTA 1V98A 3A2XA 3FYGA 4AF2A 4GQCA 1M99A 4HU9A 1OC3A 3GIXA 1MDJA 1SKRB 1R26A 5AISA 2L57A 1Y6EA 4MJCA 5HFGA 4HQSA 4WEYA 1XXUA 2VLVA 1LU4A 3UJ1A 2K8VA 4F0BA 3CYNA 2C0GA 5L71A 3I69A 5AN1A 3UOMA 1TI1A 3D4MA 4MZBA 4TXOB 2H70A 4OO4A 1BQ7A 3KXOA 4IW9A 2L6DA 1M2DA 1JZRA 1OC9B 1EV4A 3CSJA 1XWBA 1JZWA 2X8CA 3A5WA 1T8EB 1K3LA 2H0IA 4LL4B 1QMVA 5AIXA 5AGYA 1V40A 3GHAA 2JL4A 3NZNA 5CREA 2KOKA 5DAKA 5ECPB 4PTSA 1WP0A 4TR0A 2ON7A 4MPGA 4NAXA 3Q6OA 1X5CA 2F8FA 4ZB6A 1SU9A 3LYPA 1ZZYA 4MH3A 3CSHA 4AJ8A 3TOUA 3ZREA 5IOXA 3G7IA 5DDLA 2B5YA 5ECLB 1X9SB 2LQQA 2C0FA 3BCIA 5G2ZA 4KNDA 4BVXB 3LXZA 2HQTA 4PUFC 2FHEA 4OCEA 4G0LA 5GAND 3F63A 4TR4A 4GXZA 1SD8A 1NM3A 4F0CA 2FD3A 1CQGA 2GSRA 2XHFA 4ECJA 3BJ5A 1TRWA 2AHEA 4BPYA 2FY6A 1GH2A 5EY6A 3QFBC 2FWGA 2IMDA 2HNLA 1A2MA 1Z7RA 1WIKA 2I81A 2C0EA 2DMLA 1TRVA 5COHA 1AXDA 2AAWA 3TJGA 3CTFA 1SKSB 4H86A 4QL9A 5IMAA 1EEJA 2IMFA 4BA7A 4NHWA 3F8UA 4N11A 3FY7A 2N5BA 2M80A 1G7OA 1GNWA 1AUCA 4Q5NA 4PX1A 4ACSA 3ZYWA 1QUWA 2HXKA 3HJMA 1IYHA 5IMDA 3WGXA 1O85A 4XIHA 2DJ2A 3LEFA 4V2NA 4PQIA 4EDYA 1XWCA 1WOUA 1ZYEA 5DJLA 5JWRB 3HVVA 2LKUA 3UAPA 1XOBA 5F05A 2B5EA 3LYKA 3LG6A 3GV1A 2GQLA 4XRDA 1GRXA 2OE1A 4HS1A 2OKAA 4K7NA 1GUMA 3WT2A 5ID2B 3EC3A 1TU7A 2L5LA 3HDCA 2HRKB 1DUGA 1EP8A 1VF3A 2GVPA 3GA4A 4KGIA 3U5RE 17GSA 3H1NA 1SYRA 4ZBDA 2VL2C 3KM6A 1FVKA 5F06A 5IPGA 4NHZA 3VPQA 3KEBA 1GSSA 2VLUA 5HR2A 5GSSA 2LRCA 4GWRA 2BTOT 1W4VA 5G1KA 4NV5A 4DVCA 4PGTA 2GZZA 4XRAA 4ZXGA 2RUFA 1XW6A 2ES7A 2JZRA 8GSSA 2ZNMA 3QAVA 4KDXA 1GSUA 3QAGA 1XCCA 20GSA 2FUG2 2TIRA 1J08A 1OYJA 5IO2A 1LJRA 5F0GA 3SBCA 4K9ZA 3IXRA 2A2SA 1K0OA 3CRTA 3LFLA 4YH2A 2I9HA 3ZMLA 4NV2A 1F9MA 2HSMA 2RLIA 1ON4A 1GSEA 3W8SA 4MJAA 3QFAC 5D9VA 5EPFA 2CT6A 1M9BA 2E2GA 3HCZA 4X0XA 2H75A 3D5JA 1W89A 4IBPA 2HZEB 4YAPA 3FZ4A 1GUHA 2VO4A 4IQ1A 1K0DA 1K0MA 3MAKA 6GSTA 5IMVA 1T1VA 5IQYA 2V32A 3FZ9A 4KSMA 2EIOA 3TRQA 3TKQA 3IAS2 2AYTA 2VL9A 12GSA 1V58A 3F6FA 2PWJA 2VL3A 6GSYA 4MCUA 3TKSC 4XS4B 1QGVA 2H73A 4I97A 4BL7A 4MF6A 1UC7A 5H5QA 3C1RA 2VOCA 1O8XA 3C71A 2DMMA 4KDYA 2X64A 3R3EA 4WXTA 3KTLA 1KTEA 5D9TA 2P0GA 3FHKA 1GP1A 1ILOA 3F0IA 4JE1A 2YCDA 3CSIA 4WR4A 5AIVA 5A4UA 2R6KA 5DQSA 1R7HA 1YJ6A 5IPHA 2DJKA 2KUCA 2GTUA 1DBYA 1Z9HA 4KAEA 3TJBA 4OMVA 2F9SA 4K6XA 3VWUA 4EF0A 2V6OA 3QDNA 2R4VA 4F2IA 1TK0B 2UZ8A 2H1AA 1LBKA 4HUAA 2HSNB 4DEJA 3P7XA 3OR5A 4K2DA 3W6GA 2K9FA 2KP2A 5G5EA 1GUKA 4PUAA 3EU4A 3R2QA 13GSA 4ULXA 4G9HA 4POMA 4WBJA 4POKA 5DVBA 1WWJA 2LJKA 1XWKA 3A2VA 5G31A 1URMA 2ON5A 5F07A 2GLRA 2I1UA 2C1YA 4AGSA 2AUVA 1H75A 1ZL9A 3WD6A 4TVEA 2O8VB 4ZL7A 2LS5A 2B6MA 3IA1A 4HZ4A 2GZYA 4O32A 2GZPA 4FYBA 2LV3A 1QQ2A 4EE0A 1ERUA 2C3QA 1E2YA 1U6TA 2PU9C 1SL1B 2RM6A 2MMOA 1T4YA 4DSSB 4J2FA 2YOIA 3EE2A 3LWAA 2PGTA 4Q5FA 2H1BA 1Z7PA 3RPPA 1GTIA 1YY7A 2JZTA 2VCVA 4I6XA 2NDOA 2HSHA 3F4SA 1PSQA 3HZ8A 1O6JA 2IJYA 1HD2A 2QC7A 4KCAA 4HOJA 5KN2A 2H0GA 16GSA 4TR3A 2YNXA 2YN1A 3DRNA 2RIIA 1TJDA 2B1KA 3KMNA 3I43A 2LNTA 1HNBA 1J0FA 3DEXA 5B8BA 3KP9A 2JSYA 3FR6A 1PRXA 4K7OA 1QFNA 4PURA 2ZCTA 3GH9A 3KZQA 4HEA2 5CRHA 3F6DA 3UMAA 4BWQA 5B8AA 5B6NA 2WRTA 3DKSA 1YQ1A 3VWVA 1R5AA 2JU5A 4JEDA 3H79A 5J9BA 3BBYA 1K3YA 3CRUA 2FNOA 5FWGA 1RQMA 5G30A 5ECHB 3DXBA 2OBKA 4TOPA 4F9ZA 1M7TA 4ECIA 1MDKA 3VFIA 3M9JA 4TN8A 1RW1A 1X5EA 5DALA 3WGDA 4TXOA 4I8BA 3EURA 2IFQB 1OC8A 4J57E 1BG5A 2OBIA 5CYYA 1OC9A 2DBCA 4V2LA 1XFLA 2HLSA 5GZZB 1Y25A 1S3CA 2H6YA 4FO5A 2PBJA 3D4TA 4WBRD 5DBQA 1A0RP 4TR1B 2PPTA 1UA5A 1S3AA 1XWGA 2BMXA 5D9XA 2CV4A 4Q5RA 1T7PB 2WFCA 3C73A 1USBA 2DSAA 4YQVA 2HSYA 1XW5A 1AQVA 3ZIVA 5HFIA 1JHBA 2WB9A 3PINA 3GN3A 4IJ3A 4KSOA 3GURA 1U88A 2KHPA 1HYUA 5ECMB 4BVXA 1ACVA 3C8EA 1KBNA 3MWHA 2R37A 4XS1A 1PL1A 4WR5A 2PUKC 3GKMA 3IHQA 3PGTA 4POLA 4KUNA 5FT3A 11GSA 1G6YA 5KN1A 5DJMA 2CZ2A 4IJIA 1PL2A 1WRYA 4FQUA 4O5RA 3GX0A 3BOAA 5IMCA 2MMZA 2YPMA 2G2QA 1M0UA 4KDUA 3ERGA 2B5XA 3IE3A 2JZSA 2K6VA 4OWYA 2GSTA 3TKSE 6GSVA 2HE3A 2PVOC 19GSA 2H76A 1JZDA 4V2MA 4N30A 2VCTA 4JBBA 1HNAA 4JRRA 3ZVJD 3P8WA 4IN0A 2N5FA 2OE0A 2DLXA 2VD0A 1FO5A 3NOFA 5CAXA 5LNKe 3D21A 3LSZA 2MBSA 2H74A 2XBIA 1GTBA 4MDCA 2WS2A 1R4WA 1PQNA 1SJ6A 3Q18A 4L0WA 4DSQA 1NHYA 2YANA 5ENUA 3DYRA 4CHSA 3P90A 2J23A 2H19A 5JWQB 3KMOA 4YAVA 1GNEA 1GSDA 2PERA 4PQ1A 1BJXA 4EXJA 2FWEA 2IWTA 4GF0A 1MD3A 4N10A 3FK8A 1KEBA 4DSRA 3RHBA 4G10A 4P3YB 4GRFA 2HRKA 2JACA 4J56E 1XOAA 4OCFA 3ERWA 2C80A 4FYCA 1ZOFA 1B9XC 1THOA 3ZMKA 1SL0B 5J5NA 1SYXA 2LRNA 1Z3EA 1Z6NA 3L9VA 4ZIJA 2LJRA 2L4CA 3MSZA 1T4ZA 2I3YA 1ERTA 1T3BA 4L5LA 4HDEA 3GFKA 4N0VA 1A8LA 4EO3A 2MBTA 2L6CA 4RQRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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