3PBLA

Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with eticlopride
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
432
structure length
432
Chain Sequence
YALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASIWNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the human dopamine d3 receptor in complex with a d2/d3 selective antagonist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords D(3) dopamine receptor, Lysozyme chimera
total genus 163
structure length 432
sequence length 432
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pblA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pblA01
2Q9DA 5A44A 1OV5A 3SB7A 1L45A 1G0QA 1L37A 5BR5A 3L64A 1SX7A 1C69A 3GUOA 3RUNA 1C6HA 4XTLA 2F32A 1L79A 3QJQB 3HAQA 3DN0A 1L85A 3V2WA 1JQUA 2X72A 2A4TA 115LA 1PXSA 1L89A 1C6BA 1XJTA 2WJKA 1HZXA 3HWLA 1JFPA 1SWZA 125LA 2M3GA 1DYBA 4GBRB 2Z73A 3QBLA 1L27A 1L61A 1X0I1 4BV0A 227LA 1I6SA 1L22A 5KKHA 1L16A 5C1MA 3DN3A 1L55A 247LA 1P8IA 5H2HA 3F9LA 3T45A 1C6NA 1LYHA 123LA 2B6ZA 2RB1X 7LZMA 1L53A 1F4ZA 2JAFA 1QM8A 3AM6A 1NHBA 1LI3A 1L03A 186LA 188LA 1KS3A 4W57A 231LA 1AT9A 260LA 3ZPQA 5I14A 3HTBA 4EPIA 3JR6A 5AWZA 241LA 1L19A 3CDVA 1SWYA 1C6AA 250LA 1CV4A 1ZWNA 3DMXA 3S3DB 4K5YA 1G0LA 4W58A 1LI6A 2KS9A 3QJUB 3CDTA 4ARQB 262LA 2F47A 2F95A 1XJIA 4L6RA 1GU8A 1L26A 3KJ6A 102LA 131LA 1L82A 237LA 235LA 1C63A 160LA 4ARMB 4X1HA 5A8EA 5G2DA 3S3CB 1L04A 2L78A 3GUJA 4AMJA 1T6HA 2RBRA 3DN4A 3QAKA 3HDFA 1C6JA 1C6QA 5JJNA 200LA 3SB8A 1KY1A 3FA0A 174LA 163LA 1L39A 122LA 4W55A 1LN6A 1L48A 206LA 1CV1A 5AHZA 1QUGA 111LA 166LA 1DYCA 1Q5JA 1C6IA 1XEPA 4IAPA 1GZMA 4E97A 3QJSB 152LA 219LA 4WW3A 1C6GA 126LA 3EH3B 1PQMA 2G87A 232LA 1KG8A 1X0SA 4MD2A 1D9WA 3DMZA 2WJLA 3UONA 5G54A 3HUQA 1L63A 1FBKA 1OWZA 209LA 1L21A 1L38A 2ZIYA 3ZEVA 2YCYA 1CV3A 3OE0A 3GUPA 3PDSA 2YDOA 1L58A 2AT9A 3F8VA 2L6XA 1L10A 4BEYA 3QBIA 3GUKA 2OU8A 2PEDA 114LA 169LA 3D4SA 4IAQA 1L64A 1LGWA 3AYMA 1G0PA 1QT3A 4HYXA 1E12A 1L08A 2IGCA 4PJZA 1IXFA 120LA 4W51A 4Y9HA 190LA 2B72A 4LDEA 4I7NA 1CU3A 119LA 223LA 2Y01A 3RZEA 2RBSA 3P0GA 1OVJA 1C6EA 1L09A 4GYCA 175LA 4I7TA 3ABWA 1L77A 1C61A 3SBBC 3PWHA 1XIOA 1P7SA 1R2NA 1L47A 2F93A 1DZEA 2RBPA 148LE 1L81A 4OO9A 211LA 2NTUA 3C9MA 1C6MA 3C7ZA 3SB9A 1P8HA 2B70A 129LA 1DYGA 1QHJA 2Y03A 1QT5A 3COCA 1QSQA 5B6ZA 1CV5A 1S53A 1L43A 221LA 1L91A 1L56A 4EKPA 3ODUA 3A7KA 1IW9A 5H2JA 1QTHA 107LA 1L29A 118LA 2NTGA 1KGBA 3MBVA 3UZAA 3QBGA 141LA 1QS5A 1R84A 4UG2A 1G1VA 1QUDA 1TLAA 5H2MA 4G7RB 1D2WA 2NTHA 2OU0X 1GUEA 3DN6A 2EI4A 4XXJA 4XT1A 5DYSA 4XT3A 1L59A 1L94A 5G2CA 1S8JA 248LA 5G53A 3VG9A 2OU9A 1QKOA 4EKRA 1L49A 113LA 2B73A 1LWGA 1CTWA 1L02A 1P2RA 1C6LA 2LZMA 3K2RA 3HH3A 1SSWA 2ANVA 1C68A 3DDLA 1C64A 1L90A 1D2YA 1L28A 1L88A 1UAZA 4MQSA 4BUOA 5B6WA 4LZMA 2YDVA 4IB4A 1SSYA 3EH5B 191LA 3QJVB 1C60A 1H2SA 4QIDA 3GUMA 1L73A 1L9HA 1L72A 1LW9A 173LA 3CDOA 2RAYX 1P8UA 145LA 2BRDA 1M0KA 1P56A 108LA 1G0MA 2RH1A 1L87A 5AZDA 1S52A 1LLHA 195LA 3BVDB 2I1XA 220LA 158LA 1L62A 4EA3A 1G0KA 1L76A 228LA 217LA 5H2NA 2J4YA 2Y02A 5H2PA 3VHZA 5JJJA 1L11A 1CUQA 4I7RA 4YXCA 2KSBA 3DQBA 4X31A 4EKQA 1L68A 3S8GB 4GPOA 2ZZLA 4ARPA 2OE4X 3X3BA 3DN1A 1C6DA 261LA 4G7SB 212LA 1LPYA 1TN0A 2OTZX 4W52A 1G07A 3CDQA 2HULA 1QUHA 3OE6A 4TL3A 1L0KA 1LYDA 1QTCA 246LA 3C7WA 5ITCA 110LA 3S8FB 185LA 1VGOA 4GBRA 2HUKA 3FADA 1LI2A 4G72B 1CU6A 2O4WA 1C6PA 3DKEX 1LYGA 149LA 5ETZA 137LA 4JR8A 210LA 1L07A 1L33A 4W59A 1VJMA 2ANXA 3C8SA 3G3WA 1L69A 1QT6A 1S51A 2B7XA 5B2NA 1EHKB 239LA 2LC9A 1JV7A 3SBAA 5H2KA 229LA 2I20A 109LA 1PQDA 3ZPRA 1OVKA 1L60A 1L75A 4BVNA 3HAOA 4I7KA 1P2LA 3DMVA 2R4RA 146LA 181LA 1C66A 3HASA 1M0MA 4PXFA 5DHHA 1LYIA 1QTBA 1L52A 3OAXA 5EN0A 1D3FA 3HU9A 4ARQA 1LYEA 2KSAA 216LA 3HT7A 3HT9A 3HTGA 2B74A 2YCWA 4YXAC 3REYA 1L34A 4BEZA 5B6VA 4ARMA 1KMEA 2HUMA 3HTFA 3RFMA 3CDRA 3WQJA 2OE7X 1CV6A 1L42A 4FA7B 240LA 2QPEB 253LA 1XJUA 4XTNA 1LGUA 1CV0A 4L35A 3FI5A 4I7QA 1L0JA 2YCXA 4GP5B 1L80A 1T8GA 1JTMA 1KNIA 112LA 4PK0A 2R4SA 4FAAB 1L46A 4X32A 1IW6A 3UTVA 176LA 103LA 242LA 3S3BB 214LA 3DN2A 4HWLA 1L44A 3DN8A 2QARC 1CWQA 1PQKA 1OVHA 5B34A 3QAPA 1L05A 164LA 258LA 1AP9A 3C80A 1OWYA 4GP8B 4J4QA 1L40A 4MD1A 1L0MA 5AX0A 233LA 4GP4B 1T97A 1CU2A 1EPYA 1C6FA 1PQIA 2OE9X 3NS0A 3SB5A 5G36A 150LA 3HU8A 1PQOA 171LA 4OV0A 2Y00A 226LA 245LA 2B6WA 3UTWA 1C67A 1P64A 151LA 3GULA 1BRRA 1JV6A 1L71A 2B6XA 3L2XA 1FBBA 4FPDA 3X3CA 1XMEB 4JQ6A 4KLYA 3G3XA 1L54A 3HT6A 172LA 1S54A 3C8QA 144LA 1C3WA 5B0WA 1L15A 3EH4B 5FJGA 4FBZA 1DYEA 1WTHA 4PXKA 3VGAA 1OV7A 2O79A 4LDOA 251LA 256LA 1L00A 5A45A 1L20A 1QSBA 1T8AA 1C62A 3UTXA 3HANA 1U19A 4JKVA 1P37A 1KY0A 4BWBA 1PXRA 104LA 177LA 1DYDA 1L01A 3QDCA 2CUUA 2QB0B 1BM1A 1L12A 1L74A 4I7OA 4DJHA 1L86A 1H68A 1TN5A 215LA 3HH5A 1S8LA 1E0PA 1L30A 2OTYX 2B75A 2KSYA 5LZMA 4EXMA 167LA 4I7PA 1L32A 182LA 1L51A 5AX1A 1KG9A 1L70A 2Q9EA 1CVKA 1L41A 1ZURA 5JJEA 1C8RA 1P46A 1L23A 199LA 1L35A 1LWKA 2RBQA 3QJRB 1L24A 3HT8A 4EKSA 3HDEA 1C8SA 3CAPA 127LA 5G28A 1G1WA 5H2OA 234LA 1SX2A 2RAZX 3GUIA 1QTZA 1L50A 3EMLA 2Y04A 183LA 2JAGA 5DHGA 1O0AA 4IARA 1CX6A 1LGXA 1K28A 1CUPA 4N4YB 1L95A 161LA 1L31A 165LA 257LA 2B6TA 3GUNA 198LA 1L66A 159LA 3HUKA 3SN6R 3PQRA 3UTYA 5J7AA 1QS9A 1BRXA 1X0K1 5B35A 143LA 3C82A 2ZFEA 3NY9A 1L92A 205LA 2I35A 3C81A 5AHYA 3HUAA 1L17A 4ZPUA 2YCZA 157LA 142LA 140LA 3AYNA 213LA 168LA 1PQJA 1QT4A 1L99A 243LA 1L67A 2F2QA 1L14A 4G71B 5BR2A 236LA 1D3MA 2I21A 3PXOA 4I7MA 196LA 1QTVA 2RB0X 180LA 4LDLA 3VVKA 4AMIA 1C6TA 1KW7A 4G7QB 3UZCA 1BRDA 1P3NA 255LA 2RBOA 3C8RA 2B6YA 2HPYA 4A4MA 224LA 218LA 3NYAA 4EIYA 1LYJA 238LA 3QJTB 4GRVA 139LA 1L13A 1L96A 254LA 4MBSA 2RBNA 1QUOA 1LYFA 4NC3A 5ITEA 5TGZA 1OYUA 1B6IA 2QPDB 4MQTA 1L25A 138LA 4ARJA 3C9LA 1L98A 130LA 4G70B 5B6XA 230LA 4WAVA 5F8UA 1QKPA 2Z6BA 1MGYA 3CODA 1KW5A 259LA 2LCBA 4N4WA 5H2LA 4QRYA 1QTDA 3HH4A 189LA 1L06A 4I7LA 3C83A 4N6HA 3NSBA 4S0WA 1P36A 1CX7A 1G06A 1L97A 201LA 178LA 1C6KA 1G0GA 170LA 3G3VA 4QI1A 162LA 1DYFA 2O7AA 3QBKA 5LWEA 1L18A 1M0LA 1C6CA 2VT4A 1QT8A 225LA 252LA 2Z55A 5H2IA 4I7JA 1D3JA 2OEAX 1JGJA 3SB6A 197LA 1P5CA 3V2YA 3VW7A 4W54A 6LZMA 1JTNA 1CU0A 1L65A 4XTOA 156LA 1C65A 3PBLA 2RB2X 147LA 3DNAA 4I7SA 1L57A 4UHRA 4DAJA 3HTDA 1L84A 4W56A 1D3NA 1L36A 1L93A 222LA 4ARLA 4EJ4A 5B6YA 4KNFA 244LA 1F88A 3HAPA 249LA 1ZYTA 2NTWA 4EPFA 3OE9A 1DYAA 1UCQA 4HYJA 1G0JA 3VI0A 4AQNA 4W53A 5G2AA 2LNLA 3UG9A 1PY6A 192LA 1Q5IA 1T8FA 4YX7C 1CU5A 1QT7A 1P6YA 3HH6A 128LA 4DKLA 3C7YA 3NY8A 1F50A 3OE8A 1L83A 184LA 155LA 3LZMA 3HARA 187LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TX7A 1A2YC 4NGVA 1L37A 4QGZA 4AXTA 1W08A 2HEFA 4U3XB 2F32A 5FDJA 1L79A 1W6ZA 4LT1A 3HAQA 3QJQB 3DN0A 1LPIA 1WTNA 4DD9A 1L27A 1GPQC 1L16A 5C1MA 4OW1A 1P8IA 247LA 1PZYA 1CKCA 2EPEA 1FLYA 1F4ZA 1LI3A 1L03A 3W6EA 3A96A 4W57A 1AT9A 1HEMA 5AWZA 1L19A 4H1PA 1ZWNA 2PC2A 1IWXA 1LI6A 4WL6A 2F95A 1XJIA 1L26A 102LA 1D6QA 235LA 2W1YA 1GB7A 5A8EA 2L78A 4AMJA 4NGZA 1A4VA 1L39A 3LN2A 4G9SA 5AHZA 1IP5A 4KPMA 1GF4A 3VWOA 4E97A 3QJSB 4WW3A 1C6GA 3TMXA 1GBOA 2G87A 1X0SA 1G7IC 3TXJA 5G54A 3HUQA 1L63A 1T6VL 1YQVY 3LHMA 1CJ9A 3ZEVA 2VB1A 1CV3A 1DI3A 1UIBA 1L10A 1N4FA 3GUKA 4IAQA 2I26L 4XJDA 3AYMA 4WO9A 5B59A 1E12A 4PJZA 2ZQ3A 1B5UA 4W94A 1QQYA 1ZV5L 4LDEA 2BQDA 2HECA 4H9AA 3CSZA 5LVKA 2Y01A 175LA 4I7TA 2FYDA 5B06A 3PWHA 1L47A 2RBPA 5F81A 4LT0A 4WLXA 3AYQA 1HSWA 1P8HA 129LA 3COCA 1LSFA 1QSQA 5B6ZA 1CV5A 1IW9A 1QTHA 1UUZC 5I4XA 2MEIA 1GFKA 4G7RB 1D2WA 1GUEA 4PGJB 4X3BA 1HFZA 5DYSA 3AZ5A 4M6DA 1L94A 1S8JA 1LZNA 1LJ3A 4EKRA 1LWGA 1CTWA 1P2RA 4NSHA 1LSDA 1L28A 2Z12A 208LA 1XGRC 1SSYA 1YL1X 2HU1A 3QJVB 1C60A 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 218L A;  3NYA A;  4EIY A;  1LYJ A;  238L A;  3QJT B;  4GRV A;  139L A;  1L13 A;  1L96 A;  254L A;  4MBS A;  2RBN A;  1QUO A;  1LYF A;  4NC3 A;  5ITE A;  5TGZ A;  1OYU A;  1B6I A;  2QPD B;  4MQT A;  1L25 A;  138L A;  4ARJ A;  3C9L A;  1L98 A;  130L A;  4G70 B;  5B6X A;  230L A;  4WAV A;  5F8U A;  1QKP A;  2Z6B A;  1MGY A;  3COD A;  1KW5 A;  259L A;  2LCB A;  4N4W A;  5H2L A;  4QRY A;  1QTD A;  3HH4 A;  189L A;  1L06 A;  4I7L A;  3C83 A;  4N6H A;  3NSB A;  4S0W A;  1P36 A;  1CX7 A;  1G06 A;  1L97 A;  201L A;  178L A;  1C6K A;  1G0G A;  170L A;  3G3V A;  4QI1 A;  162L A;  1DYF A;  2O7A A;  3QBK A;  5LWE A;  1L18 A;  1M0L A;  1C6C A;  2VT4 A;  1QT8 A;  225L A;  252L A;  2Z55 A;  5H2I A;  4I7J A;  1D3J A;  2OEA X;  1JGJ A;  3SB6 A;  197L A;  1P5C A;  3V2Y A;  3VW7 A;  4W54 A;  6LZM A;  1JTN A;  1CU0 A;  1L65 A;  4XTO A;  156L A;  1C65 A;  3PBL A;  2RB2 X;  147L A;  3DNA A;  4I7S A;  1L57 A;  4UHR A;  4DAJ A;  3HTD A;  1L84 A;  4W56 A;  1D3N A;  1L36 A;  1L93 A;  222L A;  4ARL A;  4EJ4 A;  5B6Y A;  4KNF A;  244L A;  1F88 A;  3HAP A;  249L A;  1ZYT A;  2NTW A;  4EPF A;  3OE9 A;  1DYA A;  1UCQ A;  4HYJ A;  1G0J A;  3VI0 A;  4AQN A;  4W53 A;  5G2A A;  2LNL A;  3UG9 A;  1PY6 A;  192L A;  1Q5I A;  1T8F A;  4YX7 C;  1CU5 A;  1QT7 A;  1P6Y A;  3HH6 A;  128L A;  4DKL A;  3C7Y A;  3NY8 A;  1F50 A;  3OE8 A;  1L83 A;  184L A;  155L A;  3LZM A;  3HAR A;  187L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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