3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
1I6SA 130LA 4ARMB 3P0GA 3NYAA 5ETZA 5H2IA 146LA 1C6GA 1OVHA 1C6IA 3COCA 5EN0A 5B6VA 251LA 2F93A 2B6TA 4GP4B 1L84A 5B6XA 1XJTA 1L28A 2IGCA 2YCZA 1KY0A 3FI5A 3NY8A 3VW7A 2JAFA 4L35A 1L19A 2OU8A 3HAPA 1E0PA 1L90A 1QTBA 4XXJA 197LA 5H2PA 3QBGA 3HTFA 217LA 189LA 1L51A 5G28A 1L72A 4PJZA 183LA 2RH1A 181LA 1CV1A 3PDSA 1S8JA 5G2DA 5H2MA 4G7RB 4I7JA 4I7PA 2PEDA 166LA 1KG9A 1L36A 3DN4A 3C81A 3C7YA 1C6MA 1XJUA 1QT6A 3OE0A 1C6LA 151LA 3DMXA 1VJMA 1T8GA 215LA 1G0KA 177LA 131LA 3SB8A 1L95A 4W53A 4LDEA 4PXKA 3DMZA 120LA 1C6AA 4GRVA 4LDOA 3QAPA 1SX7A 3RZEA 3AM6A 103LA 3SB7A 262LA 3VI0A 4W58A 1C6KA 229LA 4JQ6A 114LA 233LA 1LI6A 3DMVA 4WAVA 157LA 239LA 3CDVA 1S8LA 1L49A 1C67A 1OVKA 3GUNA 4MD1A 3C9MA 1IW6A 3HT8A 3QDCA 1MGYA 5B35A 3HASA 3QBIA 1KNIA 1PXRA 1QT3A 1QTVA 2B7XA 1CV6A 2F95A 254LA 1JV7A 191LA 1L47A 2RBOA 2RB2X 4W51A 3HAOA 1L38A 2YCXA 152LA 4ARMA 1BRRA 1SSYA 1C65A 3ABWA 3OE9A 4IARA 1PQIA 3PXOA 3X3CA 1ZURA 2ANVA 2RB0X 4EKRA 4LDLA 128LA 1L83A 2AT9A 1L60A 1L09A 1M0LA 148LE 1G1WA 137LA 247LA 1E12A 199LA 1QTHA 1C6JA 4OO9A 3AYMA 1S53A 4EKQA 1G0MA 2O79A 1L99A 3SBBC 4EPFA 3A7KA 4XT3A 102LA 1QUDA 4ARPA 3SN6R 1P8UA 1WTHA 3C8RA 1L53A 1L77A 1G0PA 138LA 2OU9A 3HUAA 1OV7A 171LA 3D4SA 1X0I1 3QAKA 2Y04A 2OU0X 4BV0A 4S0WA 3HDEA 1L02A 2NTWA 5A45A 258LA 1O0AA 110LA 1UCQA 5TGZA 3GULA 170LA 3HTDA 180LA 1KS3A 1L82A 173LA 235LA 3HT6A 1GUEA 1L86A 2QARC 2EI4A 3AYNA 1C66A 176LA 4FBZA 174LA 1L03A 1L52A 2B70A 5DHHA 185LA 1QS5A 255LA 1QKPA 1EPYA 195LA 220LA 3F8VA 1L94A 2RBNA 4GBRB 158LA 1FBBA 3HANA 5J7AA 3S3DB 2F32A 1C6HA 160LA 223LA 228LA 1XEPA 227LA 4PXFA 259LA 4I7SA 222LA 1L61A 1K28A 3EH3B 1L11A 4UG2A 1LLHA 164LA 182LA 1L54A 3F9LA 3GUIA 3CODA 3ZPRA 3HTGA 2Y01A 4Y9HA 3HT9A 5B6WA 2I20A 3HU9A 224LA 1L97A 4BWBA 4I7OA 3C8QA 1TN5A 2O7AA 3VHZA 3KJ6A 1P7SA 1D3NA 206LA 4W55A 1L33A 3GUMA 1L45A 1L04A 2I21A 118LA 129LA 4W59A 1QT5A 3HU8A 5A8EA 169LA 4JR8A 4J4QA 1M0MA 3JR6A 1L58A 4ARQB 1LWKA 1C6PA 2F2QA 5AWZA 3SB6A 4ARJA 3GUJA 1CV4A 4KNFA 108LA 1L17A 2L6XA 2Y00A 2B73A 7LZMA 2J4YA 3ZEVA 260LA 3UTVA 1IXFA 4DJHA 1L20A 3GUPA 5H2NA 1JTMA 1L26A 2F47A 4W56A 2YDVA 1XJIA 1L69A 4X32A 1C62A 1P64A 144LA 2B75A 1TN0A 4GBRA 2A4TA 1CWQA 2M3GA 1LYHA 4IAQA 1C8RA 5ITEA 214LA 2ZFEA 221LA 3HH4A 5ITCA 1C63A 1CU5A 1C6DA 1P2RA 1QTCA 4AMIA 5G53A 5AX0A 5B2NA 1CV3A 122LA 188LA 1G1VA 4I7KA 143LA 5G36A 2LNLA 4I7RA 1LYFA 1EHKB 1VGOA 172LA 1L0KA 237LA 1L27A 2L78A 4PK0A 2KSAA 3QBLA 4XTNA 4HYXA 3V2WA 252LA 1L12A 196LA 201LA 4I7QA 257LA 1CVKA 2RAYX 3QJSB 4MBSA 1G0LA 2RB1X 3HAQA 2NTGA 1L73A 1D3FA 5LZMA 1AP9A 1LGWA 3DN6A 1CU6A 3ZPQA 107LA 5H2HA 109LA 2O4WA 212LA 150LA 1JTNA 1L00A 4YXAC 1BM1A 1LI3A 1QT7A 2B6WA 4FA7B 3C7ZA 3NY9A 2RBRA 1L75A 3CAPA 3DN3A 112LA 1KG8A 119LA 2ZZLA 1QUOA 1AT9A 2KSYA 1L59A 4ARQA 1PQJA 1QUHA 3WQJA 147LA 184LA 1C6BA 3QJUB 4G71B 1L46A 4MQSA 5BR5A 1LW9A 2OEAX 2QB0B 1CX6A 1OV5A 2ANXA 187LA 2CUUA 1D2YA 1P37A 104LA 1LGXA 1IW9A 3OAXA 1L65A 1L31A 4G70B 1LYDA 1L92A 1L85A 5JJJA 1L29A 1L81A 1L87A 1H2SA 1OWYA 1L76A 1L42A 1G06A 1L66A 232LA 1QM8A 3BVDB 3CDOA 3UONA 1L50A 200LA 3C80A 3GUOA 4EXMA 3QJVB 4X1HA 1L93A 149LA 1L18A 1L74A 242LA 5H2KA 249LA 5B6YA 1L01A 5I14A 213LA 1JV6A 2NTHA 3G3XA 3MBVA 3C83A 1QS9A 1T8AA 4EJ4A 2LC9A 4BUOA 1L91A 1LWGA 1PQMA 1R84A 3DN0A 2B74A 1L68A 126LA 1L22A 1FBKA 5DYSA 5G54A 253LA 4AQNA 1JGJA 4FAAB 1G0JA 4UHRA 4LZMA 4KLYA 3HTBA 1L39A 5G2CA 3OE8A 1M0KA 1L89A 1DYFA 3VVKA 4MQTA 1L67A 139LA 1DYGA 1S52A 1L44A 1LPYA 2QPEB 2JAGA 256LA 2YCWA 3SB5A 3DN1A 1OVJA 1L15A 3SB9A 1CX7A 1Q5IA 1SWZA 3CDTA 1QT8A 2RBPA 4GP8B 4XTOA 4A4MA 238LA 3RUNA 1ZYTA 1SSWA 2OTZX 156LA 2Q9DA 4I7LA 1L32A 1SWYA 123LA 5B34A 3X3BA 1T8FA 2Z6BA 1C6FA 5A44A 1BRXA 1L13A 1L10A 1P2LA 3C82A 261LA 4NC3A 3T45A 2R4SA 1LI2A 2R4RA 1D3JA 243LA 1C68A 2WJKA 4EPIA 5F8UA 3S3BB 4XTLA 4IB4A 1L05A 3HDFA 2VT4A 2ZIYA 1C3WA 2LCBA 4W57A 1L96A 245LA 1L14A 1L48A 2KSBA 4TL3A 3S8FB 4G72B 205LA 1CUQA 1PY6A 236LA 1L37A 241LA 1PQDA 234LA 1H68A 2RBQA 1L06A 1R2NA 2B6XA 1CU3A 1Q5JA 3EH4B 1L23A 4W52A 127LA 1F4ZA 5B6ZA 1XMEB 1L79A 1L88A 1CV5A 3DN2A 4EIYA 1C6TA 4XT1A 4ARLA 4GP5B 142LA 3PQRA 2HUKA 1P8IA 1SX2A 1F50A 2YCYA 5H2JA 1P56A 2LZMA 211LA 5FJGA 1L70A 1CU0A 1UAZA 2BRDA 5C1MA 1CUPA 1P6YA 3UZAA 155LA 2OE7X 3UTWA 2Q9EA 5DHGA 231LA 5JJNA 3CDRA 4GPOA 4BEYA 248LA 3DDLA 250LA 3DN8A 1KGBA 1L62A 2OE9X 1X0K1 1QSQA 1L56A 3QBKA 3V2YA 2Z73A 3EH5B 3HUKA 175LA 1LYJA 1KW5A 3SBAA 163LA 2Y02A 5AZDA 4HYJA 162LA 1DYBA 165LA 3NSBA 3UG9A 1DYDA 4N6HA 1JFPA 1BRDA 3DKEX 4W54A 141LA 1L40A 5AX1A 2KS9A 3CDQA 1L55A 3HUQA 1P36A 1C6NA 3QJRB 4DAJA 1LYEA 1C8SA 1S51A 3RFMA 190LA 167LA 2OE4X 1C61A 1CTWA 2I35A 1F88A 4BEZA 3EMLA 1D3MA 2Y03A 3C7WA 1L08A 1QHJA 2NTUA 4BVNA 5KKHA 1LN6A 3C9LA 1PQKA 1D2WA 3PBLA 4WW3A 1OYUA 1QTZA 1JQUA 3OE6A 1L34A 5H2OA 2B6ZA 2RBSA 1NHBA 4K5YA 1B6IA 1L30A 218LA 3S3CB 3G3WA 1C6CA 5LWEA 4YXCA 1L25A 1L35A 1P5CA 2QPDB 5G2AA 1C64A 225LA 5JJEA 3HT7A 4ZPUA 1L9HA 1L0JA 168LA 1L63A 2HUMA 5H2LA 3VG9A 1HZXA 1G0GA 1T6HA 1PQOA 1L0MA 4I7TA 125LA 198LA 4L6RA 2B6YA 1ZWNA 3HH6A 216LA 3NS0A 1DZEA 3ODUA 5BR2A 1GU8A 2Z55A 1DYAA 1L80A 1LYGA 3K2RA 161LA 111LA 2I1XA 3HWLA 1L16A 1C60A 1GZMA 1L98A 3DNAA 145LA 186LA 4JKVA 2YDOA 4HWLA 1C6EA 4I7MA 4AMJA 3HH3A 219LA 4E97A 1CV0A 209LA 1D9WA 1C69A 3S8GB 3GUKA 1L64A 2B72A 4N4YB 1L07A 1P3NA 4QI1A 240LA 1QKOA 1XIOA 1C6QA 1G07A 2OTYX 3L64A 4IAPA 3L2XA 1OWZA 4EKSA 1U19A 159LA 3QJTB 4OV0A 115LA 1L71A 4I7NA 3UTXA 2WJLA 178LA 1L57A 4YX7C 2HPYA 4QRYA 2G87A 1DYCA 4EKPA 2HULA 1X0SA 3G3VA 1QT4A 1TLAA 1L21A 3HH5A 4G7QB 230LA 5AHYA 4QIDA 3C8SA 1DYEA 4EA3A 1QUGA 1P46A 3PWHA 1P8HA 1KY1A 1PXSA 210LA 1S54A 3DQBA 3REYA 3HARA 192LA 3UZCA 3FADA 4FPDA 113LA 3LZMA 1L24A 1CU2A 3VGAA 5B0WA 4X31A 1KW7A 5AHZA 1L43A 1QTDA 1KMEA 1LYIA 2RAZX 246LA 1QSBA 4DKLA 4G7SB 244LA 4MD2A 1G0QA 1T97A 6LZMA 140LA 226LA 4GYCA 3FA0A 1LGUA 1L41A 2X72A 3QJQB 4N4WA 3UTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6GA 1C6IA 2HEDA 1AT5A 2Z38A 2F93A 5B6XA 4CFOA 1L28A 3NY8A 1GF6A 1GFAA 1L19A 1OUAA 1E0PA 1BB5A 3W3EA 2D4JA 3CT5A 217LA 1L51A 5G28A 4Z41A 5KXYA 4I7PA 1VDTA 1L36A 1HNLA 3DN4A 1IWUA 1XJUA 1QT6A 1VJMA 1T8GA 215LA 177LA 131LA 4DD9A 1LOZA 1WQOA 2CGIA 3AM6A 4HJVA 4ETCA 3A67Y 3VI0A 2MEDA 229LA 1YAPA 114LA 1JSEA 3DMVA 5D5FA 1VDQA 4WAVA 3CDVA 3GUNA 1NKHA 2D4KA 3HT8A 3QDCA 5B35A 1QUTA 1KNIA 1LZ9A 1PXRA 1C10A 1YL0X 1GB8A 2RBOA 2RB2X 1GF4A 4W51A 1L38A 2YCXA 1BRRA 3ABWA 3G3BB 4DQ7A 1BWJA 2ANVA 4KT3A 1L83A 2I6ZA 5FCPA 5LINA 1GB0A 1M0LA 1NBZC 247LA 4NGKA 199LA 1QTHA 1C6JA 2YBLA 4EPFA 102LA 1QUDA 2Q0MX 4ARPA 4WMGA 1LJJA 1L53A 1L77A 1NQIA 1OV7A 3D4SA 1HMLA 1LMCA 3QAKA 2OU0X 258LA 1O0AA 3A3QA 1UCQA 4Z46A 3QBGA 2B70A 255LA 1AT6A 1EPYA 1FBBA 4GLAA 1L94A 4GBRB 4H8XA 1FBIX 4GCBA 4NHPA 2EKSC 3A95A 227LA 228LA 2MEFA 3M3UA 222LA 1L61A 1K28A 1AKIA 164LA 1L54A 3F9LA 4H8ZA 3ZPRA 4B4EA 5LYTA 2I20A 4BWBA 1LZYA 4I7OA 2O7AA 3KJ6A 206LA 3CQLA 2Y8PA 1L33A 135LA 1L04A 2I21A 4DT3A 1LZEA 3W6EA 1QT5A 1SLYA 1LZ1A 1GBYA 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 1L15 A;  3SB9 A;  1CX7 A;  1Q5I A;  1SWZ A;  3CDT A;  1QT8 A;  2RBP A;  4GP8 B;  4XTO A;  4A4M A;  238L A;  3RUN A;  1ZYT A;  1SSW A;  2OTZ X;  156L A;  2Q9D A;  4I7L A;  1L32 A;  1SWY A;  123L A;  5B34 A;  3X3B A;  1T8F A;  2Z6B A;  1C6F A;  5A44 A;  1BRX A;  1L13 A;  1L10 A;  1P2L A;  3C82 A;  261L A;  4NC3 A;  3T45 A;  2R4S A;  1LI2 A;  2R4R A;  1D3J A;  243L A;  1C68 A;  2WJK A;  4EPI A;  5F8U A;  3S3B B;  4XTL A;  4IB4 A;  1L05 A;  3HDF A;  2VT4 A;  2ZIY A;  1C3W A;  2LCB A;  4W57 A;  1L96 A;  245L A;  1L14 A;  1L48 A;  2KSB A;  4TL3 A;  3S8F B;  4G72 B;  205L A;  1CUQ A;  1PY6 A;  236L A;  1L37 A;  241L A;  1PQD A;  234L A;  1H68 A;  2RBQ A;  1L06 A;  1R2N A;  2B6X A;  1CU3 A;  1Q5J A;  3EH4 B;  1L23 A;  4W52 A;  127L A;  1F4Z A;  5B6Z A;  1XME B;  1L79 A;  1L88 A;  1CV5 A;  3DN2 A;  4EIY A;  1C6T A;  4XT1 A;  4ARL A;  4GP5 B;  142L A;  3PQR A;  2HUK A;  1P8I A;  1SX2 A;  1F50 A;  2YCY A;  5H2J A;  1P56 A;  2LZM A;  211L A;  5FJG A;  1L70 A;  1CU0 A;  1UAZ A;  2BRD A;  5C1M A;  1CUP A; 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 1L9H A;  1L0J A;  168L A;  1L63 A;  2HUM A;  5H2L A;  3VG9 A;  1HZX A;  1G0G A;  1T6H A;  1PQO A;  1L0M A;  4I7T A;  125L A;  198L A;  4L6R A;  2B6Y A;  1ZWN A;  3HH6 A;  216L A;  3NS0 A;  1DZE A;  3ODU A;  5BR2 A;  1GU8 A;  2Z55 A;  1DYA A;  1L80 A;  1LYG A;  3K2R A;  161L A;  111L A;  2I1X A;  3HWL A;  1L16 A;  1C60 A;  1GZM A;  1L98 A;  3DNA A;  145L A;  186L A;  4JKV A;  2YDO A;  4HWL A;  1C6E A;  4I7M A;  4AMJ A;  3HH3 A;  219L A;  4E97 A;  1CV0 A;  209L A;  1D9W A;  1C69 A;  3S8G B;  3GUK A;  1L64 A;  2B72 A;  4N4Y B;  1L07 A;  1P3N A;  4QI1 A;  240L A;  1QKO A;  1XIO A;  1C6Q A;  1G07 A;  2OTY X;  3L64 A;  4IAP A;  3L2X A;  1OWZ A;  4EKS A;  1U19 A;  159L A;  3QJT B;  4OV0 A;  115L A;  1L71 A;  4I7N A;  3UTX A;  2WJL A;  178L A;  1L57 A;  4YX7 C;  2HPY A;  4QRY A;  2G87 A;  1DYC A;  4EKP A;  2HUL A;  1X0S A;  3G3V A;  1QT4 A;  1TLA A;  1L21 A;  3HH5 A;  4G7Q B;  230L A;  5AHY A;  4QID A;  3C8S A;  1DYE A;  4EA3 A;  1QUG A;  1P46 A;  3PWH A;  1P8H A;  1KY1 A;  1PXS A;  210L A;  1S54 A;  3DQB A;  3REY A;  3HAR A;  192L A;  3UZC A;  3FAD A;  4FPD A;  113L A;  3LZM A;  1L24 A;  1CU2 A;  3VGA A;  5B0W A;  4X31 A;  1KW7 A;  5AHZ A;  1L43 A;  1QTD A;  1KME A;  1LYI A;  2RAZ X;  246L A;  1QSB A;  4DKL A;  4G7S B;  244L A;  4MD2 A;  1G0Q A;  1T97 A;  6LZM A;  140L A;  226L A;  4GYC A;  3FA0 A;  1LGU A;  1L41 A;  2X72 A;  3QJQ B;  4N4W A;  3UTY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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