3PDSA

Irreversible agonist-beta2 adrenoceptor complex
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
442
structure length
442
Chain Sequence
DEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAACILMKMWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKFCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and function of an irreversible agonist-beta(2) adrenoceptor complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein Beta-2 adrenergic receptor/Lysozyme
total genus 143
structure length 442
sequence length 442
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3pdsA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3pdsA01
1P7SA 2RAYX 1P2RA 1C6FA 4IAQA 2YDVA 6LZMA 5B6VA 3UZAA 1L27A 1KW7A 1L79A 2RB0X 146LA 1L87A 3PXOA 1L84A 1C67A 196LA 1CX6A 1L52A 2I20A 1C6EA 1G0PA 1C6QA 1L70A 258LA 257LA 3S3CB 4OV0A 2RAZX 1L75A 1C8RA 170LA 1SX7A 109LA 1XJIA 1IXFA 147LA 3NS0A 4GPOA 1KNIA 3QBIA 244LA 3QJRB 1G0QA 3DMXA 151LA 3C81A 3OAXA 1L06A 1L63A 4ARLA 1JQUA 1CWQA 5H2LA 1Q5JA 1PXSA 1LGWA 4I7SA 211LA 3SB6A 1L66A 3QJTB 180LA 1C6PA 234LA 1MGYA 142LA 1C6JA 3ZEVA 1L10A 3COCA 5B6XA 4QRYA 1G0MA 4AMJA 4L35A 1LPYA 1X0K1 4AQNA 1C6IA 1P5CA 237LA 1GZMA 1QT8A 5AHZA 3C80A 1C63A 1HZXA 2QARC 1LN6A 1L56A 1QTDA 3C8SA 1C6DA 2NTWA 3QDCA 4HYJA 1L05A 1I6SA 4EKRA 172LA 4DAJA 1PQOA 3QJVB 137LA 3V2YA 3EH4B 1P64A 1OWYA 1PQIA 1L14A 1L68A 1D3JA 3HASA 4WW3A 150LA 1L55A 1L46A 3DN1A 4UG2A 1H2SA 1UAZA 5AWZA 3CDQA 1P8HA 3P0GA 4JKVA 3C7ZA 5B0WA 2YDOA 3GULA 1SX2A 185LA 183LA 1QTZA 3HUAA 3HTGA 1QSBA 2A4TA 4W56A 165LA 120LA 3QJUB 1KY0A 2Q9DA 108LA 1E12A 3HH3A 123LA 1NHBA 214LA 4J4QA 3ZPQA 1L74A 4EPIA 1C6NA 1BM1A 1L73A 2I21A 5H2MA 3QAPA 1L9HA 3DN2A 1CUQA 1OYUA 3CAPA 2RB2X 3HT7A 1L94A 255LA 4G70B 1QTBA 114LA 1IW6A 1GUEA 2OEAX 1L24A 3GUNA 141LA 1XEPA 2Y02A 3VHZA 3LZMA 1TLAA 1CU0A 1L88A 245LA 2ZZLA 222LA 1C6AA 240LA 1AP9A 166LA 188LA 1L41A 3PWHA 4G7QB 4WAVA 118LA 215LA 1M0MA 3DDLA 3HWLA 2OU8A 4XT3A 1L58A 1QT4A 2G87A 216LA 1T8AA 191LA 4BV0A 4KLYA 3OE8A 140LA 1L11A 230LA 1L39A 4N4WA 1JTMA 5G53A 1QT3A 4GBRB 1L83A 107LA 4BEYA 3CDVA 1C6CA 2YCZA 1L43A 4W58A 111LA 1LW9A 2I1XA 3S8FB 200LA 1LWKA 1L03A 2B70A 2Y04A 3VI0A 1G06A 2OU9A 5DHGA 1Q5IA 1ZURA 1G0KA 4G7SB 5KKHA 1C62A 4KNFA 3RUNA 3C8QA 3HTBA 3C9MA 1L62A 3S3BB 3NY8A 1QT5A 122LA 3FA0A 3PQRA 3X3BA 2ZFEA 1F50A 1DYGA 1L21A 1S52A 3SB5A 1OWZA 3HH6A 3HAPA 1BRXA 2B7XA 3DN8A 1L0JA 1P8UA 3SBBC 2I35A 1L33A 143LA 4I7OA 1F4ZA 4GP8B 3HAOA 160LA 5I14A 1QM8A 1L0KA 213LA 3QJQB 1L90A 174LA 192LA 1L98A 5J7AA 1JFPA 5JJJA 4GRVA 1XIOA 155LA 4A4MA 4I7TA 3DNAA 3S3DB 1PQJA 1L47A 2LC9A 4PJZA 1X0SA 3HU9A 1L81A 4I7RA 1F88A 3AYMA 1C3WA 4JQ6A 4I7LA 1L50A 2KS9A 1ZYTA 2YCWA 1CU5A 1L25A 2Y03A 1L97A 1L44A 1DYAA 5G54A 1JTNA 261LA 103LA 1QTCA 1L57A 3VVKA 2NTGA 2B75A 1L80A 1K28A 1C66A 2HUKA 3SN6R 3ODUA 1C60A 1L30A 4BVNA 128LA 1S53A 5JJEA 1L23A 3HDFA 246LA 3QJSB 3SBAA 3SB9A 220LA 1H68A 1L45A 2RBOA 3NY9A 3RZEA 1QUHA 1L08A 4NC3A 232LA 144LA 2F32A 5AHYA 1QS5A 1L51A 1QKPA 4IARA 5F8UA 1PY6A 4GP5B 4XTNA 1D3NA 249LA 1L07A 3HTDA 162LA 1KGBA 1X0I1 2ZIYA 2OE9X 4EIYA 2KSBA 3ABWA 5ETZA 1JV6A 5H2NA 2X72A 4XTOA 4BUOA 1UCQA 4ZPUA 4XT1A 4OO9A 1CV3A 2RBNA 4BEZA 2VT4A 1KG8A 3L64A 3DKEX 1C6HA 212LA 104LA 223LA 3C7WA 173LA 3D4SA 1P46A 4FAAB 2RB1X 5B6YA 4XXJA 2B6WA 1QSQA 2Y00A 176LA 159LA 4I7KA 2HPYA 1L37A 4I7PA 3WQJA 2KSAA 3BVDB 4LDLA 3HARA 4YXCA 5G2DA 1L77A 3DMVA 4I7QA 3CODA 5LZMA 1DZEA 3OE6A 4ARMB 181LA 2LCBA 5BR2A 4I7NA 1QHJA 1L34A 1LYFA 1T8GA 1O0AA 1EPYA 167LA 3HAQA 1C68A 3MBVA 3DQBA 3REYA 3CDRA 149LA 1QKOA 3UZCA 5ITCA 226LA 2F2QA 1C64A 3QBLA 1DYCA 3X3CA 4ARQB 1DYDA 1L91A 1SWZA 3QAKA 1P6YA 4TL3A 3AM6A 1L32A 2Q9EA 2QPEB 217LA 3K2RA 4LDOA 1C8SA 4LZMA 4QIDA 2EI4A 127LA 1FBKA 163LA 2F47A 1PQKA 184LA 3UONA 5A45A 1C6BA 1L92A 4I7MA 1QUDA 1LYHA 130LA 4ARPA 241LA 186LA 1P3NA 1D2YA 247LA 3T45A 4N4YB 1TN5A 221LA 1KMEA 1XMEB 1PQDA 1BRRA 1CV1A 3HT6A 1CV5A 3V2WA 1QT6A 1SSWA 3AYNA 3QBKA 4MD2A 1S51A 1CVKA 243LA 4XTLA 227LA 5B6WA 1L64A 233LA 4LDEA 2RBQA 260LA 4IB4A 4HYXA 1AT9A 3HT8A 3DN0A 1B6IA 1SSYA 3NYAA 4N6HA 1QTVA 4DKLA 254LA 5BR5A 4GBRA 2B6TA 1G1VA 1L59A 5B6ZA 218LA 3UTYA 197LA 3EH5B 4YXAC 1C6GA 1LYJA 3NSBA 1XJTA 2B6ZA 1ZWNA 2B74A 4MD1A 236LA 1L95A 4X32A 1L96A 1S54A 1C61A 1D9WA 259LA 1L65A 5H2JA 2IGCA 3SB7A 2Z73A 262LA 1L18A 253LA 1LLHA 161LA 1LWGA 1DYFA 1L22A 1L89A 5B2NA 1QS9A 195LA 2LZMA 1L82A 4EA3A 2ANVA 1L76A 250LA 5AZDA 2OE7X 4FBZA 3G3XA 251LA 3HH4A 3C8RA 1L40A 3HDEA 1EHKB 4Y9HA 2B6YA 3VG9A 1C6MA 1L35A 205LA 5C1MA 238LA 1L36A 5H2OA 3F9LA 1G0LA 1JGJA 2OTZX 3UTXA 2RBRA 4HWLA 1LGXA 4I7JA 2YCXA 3DN4A 158LA 1L16A 1KY1A 3OE9A 3GUMA 2WJLA 5G2AA 1CU2A 1LGUA 4IAPA 1L67A 231LA 1TN0A 1P8IA 4EJ4A 1VJMA 5G28A 4EXMA 1L31A 1OVHA 219LA 1BRDA 1LYIA 1L26A 125LA 157LA 3HT9A 1DYEA 2O4WA 1QTHA 2RH1A 5DHHA 2B72A 4L6RA 1PQMA 1L0MA 1G0GA 4E97A 4EKQA 5EN0A 3F8VA 112LA 4EKPA 1C65A 2R4SA 252LA 1OV5A 1CV6A 225LA 2OTYX 3CDTA 3C9LA 1OVJA 1FBBA 2LNLA 3HUKA 4W57A 2ANXA 1M0KA 1CV4A 1L42A 3L2XA 3UG9A 2OE4X 4X31A 3S8GB 5H2HA 1L12A 1GU8A 209LA 4FA7B 1LYDA 199LA 4AMIA 3FADA 3GUKA 3PDSA 1L49A 1G1WA 1L04A 3GUOA 3C82A 110LA 4PXKA 3JR6A 1CUPA 1R2NA 4W59A 1L60A 3HANA 3VW7A 1T97A 115LA 5LWEA 4S0WA 178LA 1L01A 4W52A 239LA 2AT9A 1CX7A 3A7KA 3UTWA 2HUMA 3GUPA 7LZMA 5B35A 1JV7A 229LA 4FPDA 1C6KA 1L28A 4K5YA 1LYEA 4G72B 3UTVA 2BRDA 2L6XA 4QI1A 1L93A 156LA 3C83A 1L71A 1R84A 4X1HA 1S8LA 4W55A 1L02A 4W53A 3HTFA 224LA 3QBGA 5H2PA 1L85A 5ITEA 3PBLA 2RBSA 1VGOA 5TGZA 1L17A 3DN6A 4W54A 1DYBA 1P36A 1L69A 4ARMA 1XJUA 3HH5A 3HU8A 131LA 2QPDB 129LA 1T8FA 1L20A 3G3VA 3HUQA 228LA 210LA 2QB0B 1LYGA 3DN3A 4UHRA 1CU3A 5FJGA 4ARQA 5G36A 2NTUA 3KJ6A 5G2CA 1QT7A 1PXRA 1QUGA 4G71B 113LA 190LA 3RFMA 126LA 1KS3A 5AX0A 2F95A 5JJNA 1L99A 1OVKA 3ZPRA 1L13A 1CTWA 171LA 1L86A 168LA 2Z6BA 2YCYA 3EMLA 242LA 201LA 5A8EA 2L78A 3C7YA 1OV7A 2B6XA 3DMZA 1C69A 1P56A 189LA 2O7AA 5A44A 1CU6A 1L53A 2NTHA 1M0LA 4YX7C 1L72A 1LI2A 1LI3A 4PXFA 4EPFA 1KW5A 3G3WA 4MBSA 4PK0A 198LA 206LA 1L61A 1LI6A 4DJHA 5DYSA 1IW9A 2HULA 5H2IA 1T6HA 177LA 2R4RA 1G0JA 1L00A 235LA 4W51A 4GYCA 3SB8A 2F93A 5AX1A 1L54A 2O79A 1S8JA 1L15A 175LA 2Y01A 1E0PA 148LE 4MQSA 248LA 2JAGA 1C6LA 1QUOA 1C6TA 1P37A 2B73A 4JR8A 139LA 2WJKA 3VGAA 1L48A 187LA 1L09A 1SWYA 3OE0A 4EKSA 1P2LA 4ARJA 164LA 2JAFA 1L38A 2KSYA 2M3GA 2CUUA 3EH3B 3GUIA 1U19A 3CDOA 152LA 1G07A 3FI5A 2PEDA 2RBPA 1D2WA 1CV0A 256LA 3GUJA 2Z55A 2J4YA 4GP4B 4BWBA 1WTHA 4MQTA 182LA 119LA 138LA 2OU0X 1L29A 4G7RB 1KG9A 1D3FA 102LA 5H2KA 145LA 169LA 5B34A 1D3MA 1L19A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MEIA 3UZAA 1L27A 3PXOA 5DM9A 1L87A 1C67A 3QE8A 1L52A 2I20A 1DPWA 3S3CB 2MECA 4OV0A 1QDRA 2RAZX 4QDNA 4R0FA 1SX7A 109LA 2BQLA 3LZTA 3QJRB 4NHQA 3DMXA 2ZNWY 3OAXA 1L06A 1OUFA 1GF6A 4ARLA 1JQUA 1IWTA 1CNSA 1PXSA 4I7SA 3ZEVA 1VDSA 142LA 1C6JA 5B6XA 1IWXA 3W6BA 5I4WA 4L35A 237LA 3C80A 1C63A 1HZXA 1GFVA 1L56A 3QDCA 1DXJA 4WLDA 2D6BA 4XJIA 1H2SA 1LMPA 4LYMA 5B0WA 1SX2A 4NHPA 120LA 1LZBA 2Q9DA 1B7SA 4PJ2C 214LA 4J4QA 3ZPQA 1LJNA 4EPIA 2BQBA 1Z55A 5H2MA 1AZFA 1CUQA 4Z46A 5I4YA 2RB2X 4RLNA 3D3DA 1N4FA 114LA 1IIZA 5C6IA 3A3RX 5KKIA 3VHZA 245LA 3P64A 222LA 188LA 1L41A 4WLXA 3PWHA 2DBTA 1GD6A 2OU8A 4XT3A 1CJ8A 1GF0A 4BV0A 4KLYA 1L11A 230LA 1L39A 4N4WA 1QT3A 4UWUA 4GBRB 1GAYA 1L83A 1GE2A 3CDVA 1RE2A 1C6CA 2YCZA 1L43A 1LW9A 1HC0A 2B70A 1L03A 4BAFA 3VI0A 1B5VA 5KKHA 3C8QA 3A92A 3C9MA 4XADA 3NY8A 3PQRA 3X3BA 1L21A 2XQOA 1J1PY 3SB5A 1OWZA 5B59A 2B7XA 3DN8A 4GCFA 4LYTA 1F4ZA 4GP8B 1G7MC 213LA 1L90A 4GN3A 1YL1X 1LHLA 1XIOA 155LA 5IELA 2LC9A 3HU9A 1XGTC 2KS9A 1ZYTA 2CDSA 1CU5A 2ZWBA 4OWHA 1LZYA 1LZSA 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 164L A;  2JAF A;  1L38 A;  2KSY A;  2M3G A;  2CUU A;  3EH3 B;  3GUI A;  1U19 A;  3CDO A;  152L A;  1G07 A;  3FI5 A;  2PED A;  2RBP A;  1D2W A;  1CV0 A;  256L A;  3GUJ A;  2Z55 A;  2J4Y A;  4GP4 B;  4BWB A;  1WTH A;  4MQT A;  182L A;  119L A;  138L A;  2OU0 X;  1L29 A;  4G7R B;  1KG9 A;  1D3F A;  102L A;  5H2K A;  145L A;  169L A;  5B34 A;  1D3M A;  1L19 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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