3PG8A

Truncated form of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from thermotoga maritima
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
264
Chain Sequence
GSFTLVSREFHPEDTVIDLGDVKIGNGYFTIIAGPSVEGREMLMETAHFLSELGVKVLRGGAYKPRGLGEKGLEYLREAADKYGMYVVTEALGEDDLPKVAEYADIIQIGARNAQNFRLLSKAGSYNKPVLLKRGFMNTIEEFLLSAEYIANSGNTKIILCERGIRTFEKATRNTLDISAVPIIRKESHLPILVDPSHSGGRRDLVIPLSRAAIAVGAHGIIVEVHPEPEKALSDGKQSLDFELFKELVQEMKKLADALGVKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase
publication title Tyrosine latching of a regulatory gate affords allosteric control of aromatic amino acid biosynthesis
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 98
structure length 264
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2010-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pg8A00
5AHIA 1RQEA 3FLUA 5K4ZA 1QPNA 2XN1A 1VS1A 5HJLA 2AQWA 3FJLA 3P5ZA 2P0OA 4R53A 3IIZA 5AFDA 3WK2A 3LRMA 2FLIA 3M5VA 2DZTA 3EWYA 4NXSA 4OU1A 3TV8A 2J9XA 3MW7A 5KZDA 3UWQA 4CQ9A 4JTKA 5CSSA 1SQ7A 4MZYA 1FDZA 2CLLA 3M6YA 4WY0B 2C16A 1VLIA 4GE8A 5FF0A 5CSRA 4FNQA 1YTKA 3LI1A 2B7OA 2BSLA 3FA5A 3LXBA 4M5PA 3TSDA 3DI0A 3HO8A 2VFEA 3E49A 5KINA 4FHAA 1TYGA 3LGEA 3W75A 2B4GA 2C19A 2YYUA 3HGRA 1VC4A 2Y6ZA 4JTUA 3LRLA 1ONRA 4Y9AA 1P0NA 4LVGA 4O1DA 1XM3A 3L5LA 4NX0A 4K6AA 4WQ6A 5AHNA 3KOFA 3TUUA 4Y90A 3TR2A 3LHZA 1VRDA 1X1ZA 3INPA 1H7PA 5H2ZA 4X2RA 5LHEA 4WJEA 3IRDA 3HMJG 2CLKA 2XN0A 4IMEA 2QF7A 1L6SA 4UTTA 3NQ8A 2ZYFA 1ICPA 1BWKA 3N34A 3DBPA 3GXNA 5AOUA 3VI2A 2YX0A 1S3HA 3NQDA 3DZ1A 1JCJA 5K9CA 1M7OA 2ZRZA 3PULA 1GYLA 5HUPA 3B0UX 1V5XA 3W72A 3TU9A 4MZ1A 3CQ0A 4UFMA 4CCCA 1GQNA 4QM1A 3OVQA 4O16A 3LCGA 3LXAA 1SZEA 3BVJA 4WY0A 3E96A 2PRHA 2GOUA 4A2RA 2WO5A 4TU1A 2YPIA 2B7QA 1OF6A 3LV5A 3LCHA 1EWDA 4QISA 2TPSA 1WQ5A 2GJLA 1H7RA 3QZEA 3UXAA 1FX6A 4A2SA 1L9WA 3PBYA 3K30A 3LBCA 3DFOA 5LNVA 5MHBA 3NEVA 2H8XA 2E68A 1OFEA 1OFDA 4O1CA 3NPWA 4AXKA 2VEMA 2PC4A 3B06A 1BKSA 2ZRUA 3LTPA 1VYPX 3LXCA 1KM4A 5J5RA 1FCBA 1D9EA 3TC6A 3KRUA 2V81A 3HPSA 1FUYA 4NQ1A 4UFLA 1S5WA 1R46A 2ATSA 1RZMA 1K02A 3A22A 1FWTA 4N4PA 2CLOA 4K38A 3G1HA 3DH7A 5F4WA 3R13A 2EGZA 1OFRA 1VCVA 2C1HA 4JIQA 1KM3A 3W1AA 3W2JA 3QMSA 2Q8LA 1W3NA 3O8AA 1QPOA 5T26A 3QW4B 1ZENA 3DFPA 4DF2A 4DELA 2JKPA 4O0KA 4ZL1A 2CU0A 3N2MA 5A8GA 3P62A 1SO3A 2I14A 1X6UA 2CLHA 4M7TA 3A5VA 2PE4A 2QEZA 4D2JA 1WOBA 3A23A 5G5IA 3C0JA 5D02A 3A5FA 3QW3A 1ADOA 1RD5A 4RK8A 3NR0A 2CLEA 4K39A 1VCGA 4IMGA 1B57A 5KMYA 1O5KA 3W07A 5DCDA 3M5ZA 4IMDA 5FEWA 1Q6QA 2CWNA 3M9YA 3GDMA 4YCOA 3G0UA 5EMUA 2ABAA 1XI3A 3S5OA 1TPEA 3E9AA 3G8RA 3L0GA 3HF3A 4AAJA 2X16A 2RDTA 3HGOA 5AYZA 1JR1A 1LBFA 1F7BA 1K3UA 1SZFA 3AO0A 4N9CA 1B9BA 2O7QA 4E0CA 5FF3A 4O1AA 3CT7A 4TR9A 3H54A 4M6QA 2H3DA 3EXRA 4O57A 4QAIA 1F5ZA 1LBLA 4M6PA 4UMBA 4PA8A 4WOQA 4LUIA 2V9DA 3L0NA 3SJ3A 5DY3A 5D33A 2E77A 3LRKA 1X7FA 1UBSA 2BXVA 1K8YA 1QOPA 5DELA 4MFDA 1ZFJA 1ZJIA 4YWIA 3NQCA 1JULA 4FNPA 4O18A 5AHLA 1TPDA 1EA0A 4JX5A 1PHWA 3IIXA 1H7OA 4R34A 5HR7A 3G1YA 2DJLA 2ZTKA 3BG5A 3OEXA 3H53A 1KA9F 1TQXA 1NVMA 5LNUA 4EF9A 2XN2A 2FPVA 1WX0A 3H55A 3I7RA 1JUBA 2NX1A 2WV8A 3ANYA 3MO7A 1W5QA 3R8RA 3RFAA 4S1FA 3B04A 3R89A 4LNYA 3DFSA 4NNCA 1TTPA 3W7EA 2Y7FA 2FQIA 2VFGA 2E1DA 2Z1BA 3ABSA 1Q3NA 1XC4A 3SGZA 2JGYA 3CHVA 1O4UA 2VOMA 2GJNA 1W5MA 1K7FA 3QPYA 5C5YA 4N9BA 1TO3A 2C14A 4E2BA 2CZDA 3W6YA 4LV9A 3A9IA 2NLIA 2V2CA 4UTHA 1QDSA 1H62A 1W1ZA 4K7YA 1R30A 2J24A 3GLCA 2Y61A 3CWNA 3PBWA 3TH6A 4JDYA 2Y7EA 1E51A 1MEWA 1XKYA 3JS3A 3T44A 4AWTA 3MUXA 4LOCA 1JRCA 5CZSA 4FIQA 4QITA 3B0VC 1LCOA 4Y8FA 5G4WA 3CIWA 1ME9A 4LW7A 4M7SA 1ICQA 3DENA 4O13A 4ZQMA 3TAOA 5DXYA 3GR8A 3PSVA 3CPRA 3SGUA 3EWXA 1K7EA 3GAKA 3HBLA 3IIVA 3WK0A 1QO2A 3P7YA 1OX6A 3W2UA 1OVDA 5F1VA 2H8ZA 1YDOA 2W0UA 3UY7A 3EWZA 2G97A 3KVLA 4BI5A 3S9YA 3CLMA 5FI8A 1A53A 5FF4A 2DZUA 3C4UA 2BX7A 2FPTA 3L9CA 3BW3A 5D38A 5LNRA 1G7UA 4CNPA 3L5AA 2Q3RA 4LT9A 1FCUA 2NUWA 1H60A 4UUIA 5CZJA 3QSTA 3CB8A 2RH9A 1G6CA 1RQBA 1GOXA 1VQTA 3U2OA 2NWRA 1YTDA 5SWUA 3N9SA 2JKAA 3WJYA 4DBEA 3T78A 3PC0A 3TNOA 3GZ3A 2VELA 4AHPA 1DHPA 2ZZ3A 3HG2A 3PF3A 5HWNA 2NXHA 1VGAA 4Y6GA 2QCGA 3LERA 3TIMA 3IIOA 4GJ1A 5CZ0A 5IM51 1W37A 2V0TA 3MHGA 1JCLA 1FXPA 1Q6OA 1DKWA 4PL2A 1HO4A 3T40A 3ZWTA 3NM1A 3UWZA 1TPC1 3O6CA 2QCEA 1H51A 4FF7A 1NSJA 4L4MA 2YFOA 4HNNA 5AYYA 4GRSA 4OHQA 4IPJA 3O1NA 4XBKA 4L4LA 3S1VA 3TFXA 2F84A 1K7XA 1XFBA 3S1WA 3G18A 1G67A 1BEUA 3NDOA 4JR5A 4JTJA 1DV7A 1TB3A 3KRZA 4P61A 1FWRA 5I3FA 4TMCA 2A2IA 4FX7A 3TAKA 3BGJA 1G7VA 1ZNNA 3QRHA 5DCEA 1KLZA 1SSGA 4AWUA 3N73A 3LHWA 3LCFA 2YW4A 3PUOA 2NXGA 2VEIA 3TQVA 3HIJA 5CG7A 1HTIA 2JK2A 1KM5A 2E6YA 3W1PA 4XKYB 3V1PA 2V5BA 3MMTA 3QF0A 4DPPA 4BFAA 3W84A 1SR9A 3W7CA 1WDWA 3MI3A 1F76A 4JDBA 4CCDA 5G4EA 3LM7A 4NJIA 4Z0SA 4JTSA 1XBVA 3W76A 2ZZ5A 3LX9A 4C1LA 3QJAA 3NQGA 2ZZ7A 4IWWA 1Z48A 1DQWA 4OV4A 3S6DA 4A29A 3B03A 3NQ7A 3QFEA 2NZLA 1FXQA 4JIPA 5D2TA 3BV4A 3CTLA 3TROA 1G4SA 3CEUA 3MHUA 4Z08A 1TMHA 2FPYA 4GFSA 2A21A 2PRLA 3RF9A 1QAPA 1QOQA 3C2RA 2W79A 3W7LA 1ZY9A 3G1VA 2VFDA 1JQXA 1YTEA 3TQKA 3BARA 5C6MA 4MPQA 4E2DA 4UFIA 1O95A 1VJIA 3TSBA 1WOAA 6ALDA 4EF8A 4IXXA 2G96A 1G4PA 2ZZ6A 4POCA 1XUZA 5TBOA 3HG3A 2Z6JA 3THAA 3GR7A 5FF2A 4XKYA 3C3NA 4XTIA 4O4VA 4HN4A 1KM0A 5E0KA 1OK4A 1LM1A 4UFJA 2QUTA 2R14A 1UCWA 4MLRA 3L5MA 4BK9A 3KVMA 2CLFA 3PM6A 4FX8A 2R8WA 5K3VA 3LB0A 4DPQA 2E5BA 1W8SA 3HOJA 5DY2A 3E12A 1SUXA 1VYSX 1JVNA 4UIOA 1AW5A 1VH7A 4KFPA 3B05A 2DZXA 3TKFA 3N14A 2HMCA 1O94A 3M5XA 4LWWA 4UMCA 3W1UA 3GX9A 3G1XA 4NVTA 3NGJA 4RZ6A 4WD0A 4GUJA 3W7DA 2X1SA 3W7PA 3UPBA 5LSMA 1IXOA 2RHGA 2BLEA 2ZZ2A 4ML9A 2PCQA 5AB3A 1T0OA 4N4QA 1HL2A 4NXKA 3M0ZA 1QFEA 2VFIA 2OT0A 1Q6LA 3ZS4A 4A21A 1XDLA 3SR7A 1Z44A 4CNNA 3NAVA 2JGQA 3O05A 2EKCA 1B4KA 5AHMA 3IVUA 1OG0A 3NQVA 3Q58A 3FOKA 1P4CA 5H91A 5AC7A 4GNJA 2V8ZA 3NZRA 1AW1A 3BW4A 3W71A 2FIQA 4UTJA 5CPOA 1QNVA 3TQ0A 2V5LA 4NNAA 3YPIA 3LTSA 1IXNA 1SFLA 3VE9A 3N2XA 2NX9A 3LHUA 1I2NA 4O15A 2R94A 1QPRA 1DBTA 4ADTA 3LHTA 3QMTA 4JTTA 1C9DA 1WAUA 2FB3A 3G1AA 3Q37A 1IGSA 1QPQA 3ABQA 3TK7A 5LGXA 4WXZA 2TYSA 1TTIA 2OZ0A 4PTNA 2VENA 1SO4A 4HNVA 3JR2A 4TO8A 3TW7A 1EP3A 4LS0A 5F2MA 3W85A 4YXGA 3BLFA 2QUUA 3NL5A 4HSOA 5DN1A 1OFPA 4O10A 1W56A 2C3ZA 1AG1O 2GVGA 3N9RA 1QO5A 1TV7A 4H4IA 5J5DA 2DP3A 3S42A 2J6XA 4Q32A 4Y96A 4XTDA 3P5YA 4E38A 4TX9A 3DFQA 4JS3A 1QWGA 1VZWA 1EIXA 3QPZA 4R7JA 4MYAA 4N2YA 3O6DA 3TMLA 3MI6A 4PL1A 4RZ4A 1TV8A 4NJJA 4FB7A 2VFFA 4JGDA 4OQVA 4JNMA 1H7NA 5L6UA 1SO6A 2QCFA 1QCWA 1TCDA 4KKXA 2A5HA 1LOLA 4NJKA 4GUGA 4JN6A 4EVZA 2ZTJA 4AMAA 3VKJA 1GTEA 4JYFA 3P8IA 4FNRA 3P82A 1GWJA 2ZRXA 4RCXA 2ALDA 3TXVA 3LI0A 3STGA 5HULA 3W2MA 1I2OA 1I2QA 5HUOA 5BRBA 2YR1A 4BF9A 4DO5A 1HG3A 2ZRVA 1W5NA 1LROA 3DHFA 1K8XA 4WOZA 1T96A 3O15A 1PCWA 2WNQA 2EAWA 4NX5A 2QCNA 1GVQA 4ZQOA 1R2SA 4HHPA 1MZHA 1FQ0A 3WJSA 4UTLA 4UC5A 5HMSA 5DBUA 2HTMA 1KM2A 1RQHA 1LZOA 4IOTA 5HWMA 1HFBA 3KVKA 4JXCA 1FWSA 3W83A 2YCEA 2EHHA 3ZWSA 3C52A 3TFCA 4UFHA 4O12A 1ZALA 5KZMA 2GQ8A 2YW3A 1TQJA 4WZHA 1WV2A 1FDYA 2J88A 3W3OA 3NVTA 2DU2A 4IMCA 3EXSA 3PUEA 3W2LA 2A7PA 1OFAA 3C2EA 1KFLA 4OBTA 1KFKA 3CU2A 4AWSA 3HG4A 5CPMA 5HINA 2UV8G 4ZQNA 2WOQA 4C1KA 1I8JA 1O5XA 3GKFA 1KFEA 1G4EA 3GDRA 1SSDA 2W6RA 3HQ1A 4LV4A 1JCXA 1K8ZA 1AMKA 4YLWA 1GVRA 3EWUA 4S2BA 1H7WA 1MSSA 3B0PA 4FEZA 2DORA 1WXJA 1ZAJA 3LBMA 3MBDA 1B3OA 1GJPA 3ZFHA 4UTMA 1PV8A 1VCFA 3W86A 3S1UA 1M6JA 4O52A 3UYCA 3KAOA 2Y88A 1S5VA 3NPVA 4RKAA 4Z0JA 4UTKA 3PBUA 2ABBA 4LVBA 1J2WA 3FS2A 3M7WA 1L2UA 2WSYA 3KHJA 3FEMA 4R33A 5HNRA 4LVAA 4X9SA 2C15A 2A7NA 3N3MA 4QQ3A 1KW1A 5LZLA 4DO4A 5FF7A 2VKZG 8TIMA 2YSWA 1T8XA 2G5WA 5D2XA 3LTYA 2QAFA 2ATMA 4Q33A 3WJZA 4UTUA 1OYBA 2FDSA 3G3MA 4N02A 5K4XA 5D03A 4DF1A 1KTBA 5G2HA 5D2YA 2YFNA 3GVGA 5U7SA 2HSAA 2ISWA 4ALDA 5K2ZA 4K36A 1CX9A 5EL1A 2E6AA 2ISVA 5KZEA 1CW2A 4IMFA 5F4XA 3G1FA 4JTHA 3NM3A 4H6KA 3NQ2A 3PS7A 4LS2A 1IXQA 1KM6A 4ONVA 1LOQA 4MKNA 3F1QA 5DLCA 1VLWA 5D30A 3S1XA 1AK5A 1GG1A 3BG3A 3C61A 3W7MA 4UTWC 1B4EA 4K7VA 3G24A 4OWGA 3QH2A 5FEXA 4UR8A 1JUEA 1JCMP 3M16A 1O60A 5U4NA 2JKEA 2QDHA 1JCYA 1NAL1 1OX5A 2VC6A 1XXXA 3BK0A 5F2IA 3TMQA 3UPWA 4O11A 4EWND 1TPH1 1F2JA 5DXXA 2H3BA 5C54A 4HPJA 4AH7A 1TREA 2PURA 3S0CA 3UZ5A 2NUYA 2YDAA 4GWEA 4HIBA 1EWEA 2Z2UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3B0Y A;  1E56 A;  1VS1 A;  4R53 A;  4S3D A;  2HPM A;  1VIW A;  2GL5 A;  5AFD A;  3WK2 A;  4D6J A;  2VEF A;  3ZIZ A;  2J9X A;  1OC7 A;  3DG7 A;  3MW7 A;  1I0B A;  3UWQ A;  4JTK A;  4RUB A;  1NH6 A;  3AYV A;  3OGR A;  1FDZ A;  1JZ2 A;  4RV3 A;  5FF0 A;  1JYX A;  4DJD C;  3IJL A;  1E9I A;  5I7G A;  4E3T A;  4M5P A;  3TSD A;  2VUY A;  1J01 A;  3P14 A;  3R1Z A;  4CNU A;  1X38 A;  4FHA A;  5KIN A;  3LGE A;  4TX6 A;  3W75 A;  2OB3 A;  4E8G A;  2C19 A;  3NSN A;  2YYU A;  5CCZ A;  2P8C A;  3K1G A;  4CD4 A;  1P0N A;  1NDV A;  1XM3 A;  3VAV A;  2DUA A;  4PUJ A;  1MYR A;  3H2F A;  4Y90 A;  1DWI M;  2QHA A;  3INP A;  4WKH A;  3ONB A;  2VZT A;  4X2R A;  5LHE A;  4WJE A;  1ISY A;  3WUG A;  4ZSU A;  7REQ A;  1T6M A;  1P7T A;  1VBR A;  3GE7 A;  3HFT A;  4Z2L A;  2QYG A;  5JBF A;  3W27 A;  2FHF A;  3WDJ A;  1UYQ A;  4L9Y A;  1RCO B;  3NQ8 A;  4HMC A;  1X1N A;  3GG8 A;  4ZO9 A;  1ICP A;  1BWK A;  1FA2 A;  3GXN A;  2VT0 A;  3VI2 A;  2YX0 A;  3M0V A;  1M7O A;  2ZRZ A;  3WBE A;  1GUV A;  3W72 A;  1PTG A;  5LXX A; 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