The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
TTLTNPQKAAIRSSWSKFMDNGVSNGQGFYMDLFKAHPETLTPFKSLFGGLTLAQLQDNPKMKAQSLVFCNGMSSFVDHLDDNDMLVVLIQKMAKLHNNRGIRASDLRTAYDILIHYMEDHNHMVGGAKDAWEVFVGFICKTLGDYMKELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
pH-dependence crystallographic studies of the oxygen carrier hemoglobin II from Lucina pectinata
rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin II
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
60
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3IC2 A; 3LB1 A; 1CH9 A; 4MQK A; 1Y85 A; 2H35 A; 1C7B B; 1EBT A; 1HBR A; 1O1K B; 2QMB B; 2Z6N B; 3MJP B; 3AQ7 A; 1GZX B; 2BK9 A; 3QM6 A; 1LH5 A; 1HGB B; 2EVK A; 1Y4P A; 1BIN A; 3WCP A; 3WR1 A; 4ESA A; 2VEE A; 3B75 A; 1NIH B; 1DLW A; 4MAX A; 1Y5K A; 3EU1 B; 2W6X A; 1G08 A; 4UUR A; 1HHO B; 1MBS A; 2R1H A; 2ZSN A; 2QSS B; 3WCU C; 1Y0D A; 3GQP A; 1CQ2 A; 1L2K A; 1Y4Q B; 1UC3 A; 1CP0 A; 3KUN A; 3M3A A; 3NML A; 1MLG A; 1J41 B; 2WY4 A; 4ZVA A; 3WI8 A; 1XYE B; 1MYM A; 2R80 A; 3OZV A; 5CNB A; 4MQJ A; 1OBM A; 2EKU A; 1GLI A; 1U7R A; 1EWA A; 1V75 B; 3PIA A; 2GTL C; 2D2N D; 1YGD B; 3AG0 A; 2VEB A; 1Y8I B; 5CN5 A; 3UHB A; 1EMY A; 1BVC A; 4X0L A; 1YEV A; 1YE2 A; 2LH3 A; 1ITH A; 1Y0C B; 5AZR A; 4FWY A; 4F68 A; 1XCH A; 1RVW B; 3NG6 B; 1A00 B; 1O1L B; 3G4Y A; 2D2M D; 5HBI A; 2LH7 A; 4KMV A; 1M9P B; 1BZP A; 2LHB A; 2JHO A; 2AUQ A; 1XZU A; 5CNC A; 2ZLT B; 2GL3 A; 1BIJ A; 1XZ7 A; 3GQG A; 2D5Z B; 2SPO A; 3S48 C; 4FWZ A; 4HSX A; 1HLM A; 3OZW A; 1YEQ B; 1O1N B; 1DO1 A; 5ILP A; 2XKH A; 3MKB B; 1XY0 A; 1BZZ B; 2ZLV A; 1Y35 B; 2MGL A; 2PGH A; 5EE4 C; 2GDM A; 1J7Y B; 1HAB A; 1QSH B; 1Y7G A; 2W31 A; 4N7O B; 4BJA A; 1THB B; 3MJU A; 1NWI A; 3KMF C; 2ZFB A; 2AUR A; 3A0G B; 1IBE A; 2HBG A; 1VHB A; 1FLP A; 1J3F A; 4TYX A; 2SPM A; 2O5B X; 110M A; 3AQ8 A; 4TWU A; 2QMB A; 1ASH A; 1A01 B; 5ILM A; 1JL7 A; 3MJP A; 4JYQ A; 1GZX A; 5CHR A; 1HCO A; 3CY5 B; 3HYU B; 1N9I A; 2ZT1 A; 2DN1 B; 1KR7 A; 2QSS A; 3R5I A; 2ZLX A; 1RPS B; 2AV3 A; 1PBX A; 4MQG A; 1J41 A; 3G52 A; 2RI4 B; 1HBS B; 1J7S B; 3BJ3 A; 1XYE A; 1V4W B; 2MGE A; 2MYC A; 3BOM A; 3FS4 A; 1YEO A; 1RQ3 A; 4UZV A; 1MLJ A; 2E2Y A; 1UVX A; 1HDB B; 1QSI B; 4N7N B; 1FSL A; 3WFX A; 1NPG A; 1Y4B B; 5D5R A; 2BMM A; 2DXM B; 1G0A B; 3WTG A; 3GDJ A; 4UIQ A; 3UH7 A; 1XZ5 B; 1RVW A; 3NG6 A; 1C40 A; 2HBE B; 4L7Y B; 1MBO A; 2QFK A; 1MZ0 A; 2EB8 A; 3AQ6 A; 1O1O B; 1PMB A; 2ZLT A; 3TM3 A; 2ZSQ A; 1O1J B; 1RQA A; 1Z8U B; 1MNK A; 1RTX A; 1S56 A; 2DN2 A; 1YCB A; 4PQC A; 4G51 B; 5HLX A; 4MXL A; 2PEG A; 3ONZ A; 1BZ6 A; 2W6V B; 1BZZ A; 1Y2Z A; 1Y35 A; 2Z6S A; 3ECX A; 3D4X B; 1IWH B; 1YOI A; 2V1F A; 1CG5 B; 3D1K A; 1J7Y A; 1XQ5 B; 3DHR A; 1MNI A; 1SDL B; 1MYF A; 3ZOL A; 6HBI A; 1NZ4 A; 1RQ4 B; 1FAW B; 3VRG B; 4WJG A; 1A01 A; 4MBA A; 106M A; 1K0Y B; 3CY5 A; 2YRS A; 1S5Y B; 1QI8 B; 1FDH G; 1CIK A; 4XS0 B; 1GCV A; 3UHX A; 3PI8 A; 3UH5 A; 5JOM A; 101M A; 2ZLU A; 1YEU B; 3WCU A; 112M A; 3ZJI A; 1G09 B; 3NL7 A; 3MYN A; 2WTG A; 1X9F B; 4KN3 A; 1J7S A; 2V1I A; 4HRR B; 2HBC B; 3VRE B; 1CO8 A; 1V4W A; 3O7N A; 3UGZ A; 2HHD B; 3LQD A; 2O5S X; 3K8B B; 4M4A A; 2GTL A; 1MYT A; 1MLO A; 1JEB A; 1UIW B; 3ZJS A; 2AUO A; 2DXM A; 1BZR A; 1NS6 A; 2B7H B; 1G0A A; 1YIH B; 3QJC B; 1Y09 A; 1DXU B; 2MGI A; 1YHR B; 2MHB A; 4G1V A; 5ILE A; 2GKN A; 3HEO A; 2HBE A; 4L7Y A; 1B86 B; 2D60 B; 1YVQ A; 2OLP A; 1MNO A; 1YGF A; 1Y46 B; 1HLB A; 1VXD A; 1O1O A; 1SPE A; 2W6Y A; 4H2L B; 1F5O A; 1O1J A; 1MBN A; 3UH6 A; 1J52 A; 1LTW A; 1Y0W A; 3UGY A; 1DWS A; 1A3O B; 1GCW B; 4H07 A; 1MLL A; 1JZK A; 1LJW B; 4DWU A; 1DXV B; 3H58 A; 1MTK A; 2D2M C; 3MN0 A; 1JL6 A; 1Y7C B; 1DXD A; 4O1T A; 1MBD A; 2ZT0 A; 1IWH A; 4MQH B; 3GKV A; 1COH A; 4U8U D; 3UHG A; 3KMF A; 1KD2 B; 1OFJ A; 3G46 A; 1URY A; 1RQ4 A; 1Y22 B; 3WCW B; 1FAW A; 1FHJ B; 1ABS A; 3VRG A; 1LH2 A; 3GYS B; 2MGG A; 1YDZ A; 1JP9 A; 1C7D B; 3PI9 B; 4ROL B; 1G9V A; 3QQQ A; 3HEN A; 1BUW B; 3A9M A; 1S5Y A; 2AA1 A; 3QQR A; 1V9Q A; 5EUI B; 1N9H A; 1V07 A; 1HBB B; 1DXC A; 1YH9 B; 2MYB A; 1H97 A; 2IN4 A; 4H0B A; 2NSS A; 1YEU A; 5EV5 A; 1MTJ A; 1JZM A; 2BLH A; 1WMU A; 3V2V A; 1MBI A; 5JDO F; 1FSX B; 1YE0 B; 2NRL A; 1OUT A; 4HRR A; 1CG8 B; 1YVT A; 3VRE A; 1Y83 A; 1I3E A; 2EF2 A; 2H8D A; 3SZK B; 1DTI A; 4NZI A; 5HAV A; 2VLX A; 1WVP A; 1Y8W B; 3S1J A; 2HBS A; 1QXD B; 3WCV A; 2R50 A; 1VRE A; 2GRF A; 1DKE A; 2ZSZ A; 1Y5F A; 1LH6 A; 1Y7Z A; 1Y4G B; 1GBU A; 2AUP A; 1CBM A; 1QXE B; 2B7H A; 1YIH A; 3QJC A; 3ZH0 A; 4C0N A; 1CH2 A; 2DHB B; 2D60 A; 2NSR A; 3HF4 B; 2GNW A; 2D2N B; 5E6E B; 1MOD A; 1MTI A; 4FWX A; 1Y0A A; 2ZSX A; 4H2L A; 5CN9 A; 1SDK B; 3CIU B; 4N8T A; 3PT7 B; 1JY7 A; 1HAC B; 1IDR A; 1DXV A; 1OUU A; 4AVE A; 1UMO A; 2HBD B; 2D2M B; 1NGK A; 3AT5 A; 1Y7C A; 1B0B A; 3UHD A; 2Z6T A; 4PQ6 A; 1LFT B; 1YEN B; 4F6D A; 2ZFO C; 3BCQ A; 1A0Z A; 1DTM A; 1MYI A; 3QM7 A; 1O1M B; 3U3E A; 1S61 A; 1KD2 A; 2QU0 B; 3K9Z A; 1YIE A; 1Y22 A; 1Y45 B; 1YMC A; 3AT6 B; 2HZ1 A; 1I3D A; 3PI9 A; 5CNF A; 1DWR A; 3UH3 A; 2HHB B; 1IRD B; 1W92 A; 1J40 B; 2GLN A; 2QLS A; 1DM1 A; 3ARJ A; 3HC9 A; 3IC0 B; 5MBN A; 2HZ3 A; 1HBB A; 3WHM B; 1LH7 A; 2O5T X; 5ILR A; 5KDQ A; 2GRZ A; 3G4U A; 1BBB A; 1AZI A; 1S5X B; 2NRM A; 2OH8 A; 3EDA A; 1JPB A; 1YHE B; 1CO9 A; 1DXT B; 1CMY A; 5JGG B; 4B3W A; 2H8F B; 3G4R A; 4F6G A; 1SHR B; 1J7W B; 3SZK A; 1FN3 A; 1Y8K A; 3MVC A; 3MOU A; 4HSW A; 1LFY B; 1NQP B; 3ED9 A; 1HBH A; 1SPG B; 1DUO A; 1A0U B; 3A2G A; 3FH9 B; 1DWT A; 1XXT B; 5IKS A; 1VXG A; 1Y4G A; 3KUO A; 4MXK A; 1QXE A; 1S0H B; 3ASE A; 3UHU A; 3GOU B; 1TES A; 3OVU C; 2R4X A; 5D1V A; 1MKO B; 1UT0 A; 1HSY A; 3UHN A; 1GBV B; 1MOH A; 5F2A A; 2SPN A; 1Y7D A; 2DHB A; 4MU5 A; 1MYZ A; 1MLQ A; 3EOK B; 1QPW A; 3HF4 A; 1HDA B; 2ZWJ A; 1C7B A; 3UHH A; 3E55 A; 1O1K A; 1SDK A; 1MBA A; 1Y0T B; 2Z6N A; 1HGB A; 3EDB A; 4F4O B; 1MDN A; 4F6J A; 1HGA B; 1NIH A; 3OZU A; 3PI4 A; 1NPF A; 2HBD A; 3EU1 A; 4NXC A; 1HHO A; 3E5O A; 1LFT A; 2ZFO B; 1N9F A; 2EB9 A; 1Y4Q A; 1HRM A; 3QJB B; 2MGC A; 4FC3 B; 1X9F C; 2MGB A; 2QU0 A; 4HRT B; 3ZJN A; 4O2G A; 1CQX A; 1OJ6 A; 1Y45 A; 1LHT A; 5SW7 B; 1YHU D; 1A4F B; 2Z8A A; 5HU6 B; 5CMV A; 3HHB B; 2G12 A; 2HHB A; 1YOG A; 1IRD A; 1V75 A; 1U7S A; 2RAO B; 2MGJ A; 2ZS0 C; 1IOP A; 4SDH A; 1YGD A; 1BZ0 B; 4MQC B; 1URV A; 1Y8H B; 3ZHW A; 1Y8I A; 3WHM A; 1DO4 A; 3OO5 B; 3O89 A; 1O1I B; 1HGC B; 3ZJQ A; 3IXF A; 1SI4 B; 1Y0C A; 1YG5 B; 1VWT B; 1CH4 A; 3H57 A; 1RTE A; 1A00 A; 1S5X A; 2OHA A; 1O1L A; 3PT8 B; 1R1X B; 1YHE A; 1NEJ B; 4N7P B; 1M9P A; 1Y4R B; 4WCH D; 1SHR A; 1HBA B; 1J7W A; 3DHT B; 3PI3 A; 4DC8 A; 1VXC A; 1MLU A; 1HBI A; 2ZS1 C; 5KKK A; 2CMM A; 5JDO C; 4VHB A; 1LFY A; 3A5B A; 5EYS A; 1HV4 B; 2D5Z A; 109M A; 1SPG A; 5AZQ A; 4HHB B; 1C7C B; 2HBF B; 1GVH A; 1ECO A; 3FH9 A; 3K3U A; 3WCU D; 1YEQ A; 1O1N A; 1MNJ A; 1MOC A; 3MKB A; 5HY8 B; 5KER B; 4YU3 B; 3HRW B; 1ABY B; 1FDH A; 1QSH A; 4N7O A; 3QJE B; 1THB A; 1YFF B; 1OR4 A; 3NFE B; 3A0G A; 1HDA A; 4F6B A; 3ODQ B; 3WCW C; 1NAZ A; 2GTL D; 2ZSR A; 3ARL A; 3G4W A; 1HDS B; 1LFL B; 3PEL B; 1CLS B; 1CP5 A; 3G53 A; 1CH7 A; 3HYU A; 3WCT C; 3OO4 B; 1HGA A; 4ROM B; 1JZL A; 2MGH A; 2DN1 A; 3D1A B; 2ZFO A; 1SWM A; 5F0B A; 4ILZ A; 2SPL A; 2BW9 M; 4FC3 A; 1RPS A; 3E4N A; 2RI4 A; 4ODC B; 3GLN A; 1HBS A; 3WFU A; 5SW7 A; 1LFV B; 3BJ1 B; 1NZ5 A; 5HU6 A; 3HHB A; 3A5A A; 1AJG A; 5MBA A; 3P5Q B; 3S66 B; 1NS9 B; 1AJ9 B; 1VXB A; 2ZS0 B; 2RAO A; 5CN8 A; 3LR9 A; 1HDB A; 1QSI A; 4U8U B; 4N7N A; 5EE4 D; 2G0S A; 1Y4B A; 1GDK A; 1O1I A; 2O5L X; 5B84 A; 1SI4 A; 1DO7 A; 1YG5 A; 4QAU A; 1XZ5 A; 1VWT A; 1YZI B; 3G4Q A; 3HXN B; 3S1I A; 4YU4 B; 4N7P A; 1CH5 A; 1JF4 A; 1VXE A; 1Y4R A; 3OJ1 A; 2AV0 A; 2D2N C; 1DUK A; 2BNL A; 3A59 B; 1AJH A; 3DHT A; 3D17 B; 2MGM A; 2ZS1 B; 3QJD B; 3S65 B; 2IG3 A; 4B4Y A; 2Z85 A; 1MYH A; 4GZG A; 3TM9 A; 4C44 A; 1HV4 A; 3DUT B; 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1XY0 B; 3D17 A; 2ZLV B; 2ZS1 A; 2PGH B; 2HHE B; 5EYJ A; 1HAB B; 5EQM A; 1IT2 A; 3DUT A; 3M39 A; 1A3O A; 1GCW A; 2ZFB B; 1MLH A; 2R4Y A; 1LJW A; 1IBE B; 3MBA A; 3QM5 A; 1O16 A; 3BJ2 A; 5E83 B; 3LHB A; 2ZST A; 2BLJ M; 3UHV A; 3UI0 A; 4IRO A; 4G1B A; 4NI1 A; 1DLY A; 4MQH A; 1HCO B; 2D5X B; 1JP6 A; 1XZ2 A; 1UFJ A; 3GKT A; 1X3K A; 1MCY A; 1JF3 A; 1S69 A; 3GQR A; 1JP8 A; 3WCW A; 1FHJ A; 3GYS A; 3UHY A; 1A9W A; 2OIF A; 1C7D A; 4ROL A; 2ZT4 A; 3R5I B; 2ZLX B; 1BUW A; 1PBX B; 4MQG B; 1NZ3 A; 3WCT A; 5EUI A; 2EVP A; 1K1K A; 1D8U A; 1MGN A; 3BJ3 B; 1YH9 A; 2VRY A; 5E29 A; 3ZJP A; 4FH7 A; 3BOM B; 3FS4 B; 2O5O X; 1YEO B; 1O1P B; 3ZJL A; 3ZOM A; 1RQ3 B; 2ZSP A; 5EU2 A; 3BA2 A; 4MQI B; 1FSX A; 1YE0 A; 2V1K A; 1A3N B; 4F69 A; 3UHR A; 1CG8 A; 2W6W A; 2FAM A; 2VLZ A; 3WTG B; 3GDJ B; 4NK1 A; 1CH1 A; 5CN4 A; 3SDH A; 1Y8W A; 1QXD A; 1BZ1 B; 1C40 B; 4TWV A; 2BKM A; 1ECA A; 3D7O A; 1Y5J A; 1JWN A; 1UVY A; 6HBW A; 2HCO B; 1F65 A; 1ABW A; 1KFR A; 1LH1 A; 1G0B B; 1YHU B; 1MOA A; 1RQA B; 5EET A; 4M4B B; 4KJT A; 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