3PJQA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase-like inactive isoform (including the natural mutation tyr342his) in complex with lactose
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAHSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of an enzymatically inactive trans-sialidase-like lectin from Trypanosoma cruzi: the carbohydrate binding mechanism involves residual sialidase activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Trans-sialidase
molecule tags Sugar binding protein
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 171
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2010-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3pjqA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3pjqA01
2D6NA 2BQPA 1IOAA 4YZ2A 3CKZA 1DILA 1WW7A 4ISRA 1SCRA 1LHUA 4YZ4A 3T1EA 4KS2A 3SNMA 1R1ZA 2YROA 4KBBA 2ZMKA 4B7NA 2VVZA 2AH2A 1S0BA 2AREA 3FFZA 4JF7A 2AUYA 4KS3A 3WG1A 2GMPA 3BOPA 3ATGA 1A3KA 1WLDA 4YW5A 1LU1A 2V73A 5HCAA 2W08A 3PVOA 4Q6KA 4MWRA 3SILA 1W8OA 4GXLA 4B7RA 3PVNA 1LGBA 3D6EA 2E7TA 4M01A 1LOBA 1AJKA 2A5ZA 5IK7A 4YM2A 3HMYA 3LCPA 1F8DA 3AJZA 3ASIA 5KXBA 1W6QB 1C1LA 1PZ9A 2ZHNA 4FPYA 2YDPA 1E8VA 1NMAN 1OKQA 2GN3A 4LBJA 3SALA 3TICA 2WLQA 4AVTA 1QNYA 3WDYA 1NSDA 1HKDA 5DG1A 4ATEA 4OZXA 1V0EA 3O0WA 1UAIA 2EALA 2C4LA 2EXIA 7NN9A 3RMXA 3SANA 2QWAA 1LHOA 2ZMNA 1ULDA 4Y1XA 5KXCA 1W21A 3H73A 2XB6C 2ZKNA 4XJZA 5HUGA 3BODA 2JECA 5JOXA 1KJLA 3A71A 4AVVA 4FPOB 4C1XA 1CONA 1BZWA 3WDWA 1B9VA 4GDIA 1DHKB 3N35A 1NCCN 3SH3A 1W6OB 1Z4XA 1LEMA 1USRA 1IKQA 1LECA 2ZB5A 4CTEA 2HU0A 1GNZA 4H53A 3TAYA 1JYIA 1LHWA 2PHXA 4GZOA 1LESA 1YO8A 1Q8SA 4GALA 5SV8A 1LOFA 2DUOA 4M4VA 1INHA 3BTAA 4CRQA 4AGVA 2VUAA 2ZGUA 2HT8A 4AGRA 3WV6A 1IS6A 4UF7A 1V6KA 3FLTA 4GWMA 1Z4ZA 4HIZA 1A14N 4PCRA 4FZHA 4WEFA 2HT7A 1YYNA 2WSVA 4DFSA 3OBTA 1W0PA 1F8EA 1W20A 2NM1A 1BJIA 2ZGMA 1DQ4A 1GKBA 1H9WA 1KDMA 4BMEA 5CAZA 2P2KA 1W6PA 5H9PA 4FPKA 3SITA 4HZZA 1JHNA 1WUVA 1DLLA 1INWA 1N1SA 1JW6A 2JKBA 3FBYA 2YDTA 3AYAA 3OY8B 4QN6A 4XXPA 1GZWA 4FPGA 2KM2A 4M3CB 4AVSA 1AF9A 5KXEA 2TEPA 1Z4VA 1NSCA 1V6NA 2GNMA 3AK0A 3ZYRA 3JU4A 1Q8QA 1MACA 1N1TA 3PVEA 4HZYA 2F12A 4X4AA 2B8HA 1F5FA 3B00A 3ZVXA 5F9TA 1QOSA 3AYCA 1DFQA 4K21A 4M3MA 2BATA 4XIKA 2ARBA 1Z4WA 1MWEA 5E88A 4YLZA 1L7FA 1VLNA 4FPJA 1C1FA 3M3CA 4MWYA 3ZXLA 4RL7A 3PJQA 2CL2A 3GVJA 5EWSA 1SLBA 1WD4A 1Q8VA 3NV1A 1Z4YA 3M3QA 5EYXA 2DVAA 2ZAAA 2ZGKA 5DUUA 4YGDA 1BJQA 1V3DA 1JBCA 2D3RA 4QN5A 5JOYA 1VAMA 1Q8PA 3W58A 2GDFA 1SLTA 1AXKA 4NCSA 3R4UA 2DYCA 4F83A 4GZSA 2DUQA 3M1HA 1LTEA 2D3PA 3T1MA 1G9DA 4XJWA 3MW4A 2DTYA 1PZ7A 1USXA 4XMAA 2ZGNA 2JJ6A 5EXOA 3AXDA 3WZ1A 2DTWA 1SLLA 3GNEA 3IN9A 1MS3A 1LGNA 2PELA 1CR7A 2SLIA 5DUVA 3K39A 3CL2A 4XILA 2D43A 4JCKA 1EUUA 1D0HA 3WHUA 3USUB 2JE7A 4HZWA 5JYYA 4DPNA 1WBFA 4YW3A 1QOTA 2D6LX 2ZGSA 3B3QE 2FMDA 5DUXA 4CPNA 4NOTA 4XJUA 4FOYA 2SILA 3AP6A 3WDVA 1ULCA 2GNBA 1MS4A 1QGLA 1C57A 2I2SA 4XJAA 1UZZA 4X49A 1V6IA 2A71A 3AX4A 5T50A 4YZ5A 5EYYA 1GYKA 1LODA 2F26A 2ZGTA 5GLVA 2YXSA 1ENQA 4PQ9A 3MW3A 4DRRA 3TIAA 3M2MA 3ZXJA 2R0HA 1W8NA 4U36A 3O9JA 1MR5A 1VIWB 5T54A 1N3QA 1LOEA 3KM5A 2SIMA 4Q8LA 3O12A 1S0IA 4WA5A 1EPWA 1IVCA 4M4UA 1BYHA 1FAYA 1DQ1A 4GZPA 1LU2A 3CL0A 1ZA4A 1IKPA 1KITA 1MVEA 1B9TA 4GDJA 4H55A 1LOGA 2EXJA 1WCQA 1G9FA 2WT1A 1S0FA 4FVVA 4LBQD 5DZGA 1QKQA 5B2DA 1YI7A 1UKGA 3FUOA 2F24A 1I1EA 1ULEA 3RRDA 1N1YA 2GN7A 4FPEA 5JOWA 1ULGA 1G7YA 2ZMLA 4CZSA 1LCLA 1AVBA 1C4RA 4Q26A 2E51A 5CNAA 1DYKA 4ASMB 2V5YA 2AYHA 2GMMA 2ARXA 3U4XA 1W6QA 5FRAA 5T5OA 1AJOA 2ZHLA 3UJOA 4B7JA 5HCBA 4MWLA 1EUSA 2ZHKA 4YG3A 3N3HA 2D6OX 3RQ0A 1NCBN 1F9KA 1WCSA 1WLCA 1IVBA 1W6MA 4K1ZA 3WUDA 2QWCA 2CNAA 2UU8A 2A6VA 3I8TA 2E53A 1INXA 3UK9A 4LBOA 4MWQA 4GZWA 4XTMA 4Y20B 3TI3A 1N47A 4GKYA 2VSKA 1DGLA 5NN9A 4RA0A 4GB1A 1DQ2A 4J9TA 4LBQB 1IVGA 1MZ6A 3ZSLA 4XBQA 1GV9A 1W6OA 2YA5A 2VK7A 1GNHA 4PBOA 4YM0A 3POWA 3DUIA 2ZACA 2GMEA 1GLHA 3BIWE 2F11A 3WOGA 2A3WA 4GZTA 2JE9A 1APNA 2W5NA 3AZZA 1NXD1 2E6VA 3INBA 3N36A 2ZGQA 2VXRA 2W39A 2P3KA 1V00A 3WDUA 1S0JA 4UW6A 2WKKA 5GLZA 3LSEA 5B2CA 2UURA 2W38A 3R05A 3N7MA 4WVWA 3TI6A 4YG6A 4K1YA 3I4IA 5IK4A 4XHXA 3NV3A 2VWDA 3B9CA 5T5JA 3D5OA 4MZAA 3SH4A 1QOOA 1JUIA 3APBA 3V64A 4YW4A 5E89A 2C4AA 1SBDA 3OY8A 1ZM1A 3RS6A 3QLQA 1X50A 3D4KA 2OW4A 4M3CA 5DG2A 1FX5A 3WG2A 2P3IA 2DVFA 2XG3A 3NSSA 1NMBN 1A4QA 4WVVA 2A75A 2HTYA 2CMLA 3TIBA 2HTQA 4L8QA 1W6NB 2B7YA 2DU0A 3D12A 5KXDA 2F29A 2YA4A 1NCAN 4B7MA 5JDBA 1E8UA 4NN9A 5E8AA 2NMOA 1Q8OA 4Y22A 1SFYA 4FVKA 1LGCA 4YZ3A 2SBAA 3V0BB 2CY6A 4XMIA 1UX6A 2YV8A 2ZGOA 2D3SA 2ES3A 4M4NA 3AZWA 2DWRA 4XDQA 1EUTA 4NO4A 1BQPA 2QWKA 1Q56A 1NNBA 1SACA 5M1ZA 4XBLA 1G9CA 4HZVA 2AEQA 1OQ1A 4PF5A 5T5LA 5IUQA 1AXZA 1I3HA 4KS4A 1L7GA 4KS5A 1N3PA 2HU4A 1SLCA 2A7AA 1MS9A 3A0KA 3CNAA 4MX0A 1QDCA 1KRIA 4GKXA 3C2UA 2ZGLA 2RKCA 3WCSA 3N7JA 3H71A 3V0AB 1KQRA 4K1IA 4LBLA 3NV4A 4QNPA 4UW4A 1NNCA 2UWCA 4MZEA 1S0GA 4FPHA 4D8SA 4CPYA 1IS4A 4TYSA 4BM8A 2AENA 1QMJA 5IK5A 3TI8A 2RHPA 2VY0A 3WLUA 3MEPA 3WHTA 3AFKA 1L7HA 4P9XA 1SNTA 1INFA 3VKOA 3O0VA 4XJ9A 4FQZA 3JU9A 1IS5A 2E7QA 3USUA 2AEPA 1Z78A 2HYKA 4BQ1A 1SLAA 3IPVB 4ISQA 1BXHA 4KS1A 4FPCA 5HUNA 3N7KA 1GZWB 5DZEA 5HUKA 1F8CA 4TZDA 3TI4A 1H30A 2EXHA 4FOWA 1DIWA 4YFWA 1UMZA 3MW2A 2ZA9A 1WW6A 2CTVA 1W0OA 3ZYPA 4K1KA 5JMCA 3IM0A 4XJRA 2ZABA 3SLIA 1QU0A 1DQ5A 3H0OA 5CB7A 1F31A 1WW4A 2VW1A 3KQRA 2F25A 2ZB6A 3ZXEA 5T52A 5T55A 4Y26A 2ZHMA 5JLVA 3AJYA 1BKZA 2A6XA 1LHVA 4B7QA 4M3CF 2EAKA 3WDXA 2F13A 4HL0A 5H9QA 4P9WA 5JVVA 4MWXA 3A72A 5GZFA 3AP4A 5GJ6A 1CPNA 1V3BA 3OYWB 1IS3A 6NN9A 1NMCA 1LJ7A 1V0ZA 2R0FA 1N3OA 2QWBA 4C1WA 5GM0A 2WSUA 3T1LA 2JDZA 4MWUA 3K37A 4NC5A 3RG0A 2XZIA 4LBKA 3ILNA 1MZ5A 1DBNA 2PHRA 4DGRA 2GNDA 1QF3A 2YZ4A 2ZBJA 2ERFA 3R4SA 1HQLA 2P37A 2R16A 2PHUA 1RIRA 2OUJA 2D7FA 3BEQA 1JN2P 2YMZA 3AP9A 4PBPA 4FPFA 3VKMA 1O4YA 5GZDA 1LOCA 3ENRA 3ZPYA 4M00A 2WT2A 3W59A 4XHBA 4GEZA 2DURA 5GZCA 3GVKA 3NN9A 1MS0A 4YGEA 4WA3A 3ALXA 4Y1YA 4QN3A 3K36A 3INAA 1G9AA 1A4GA 2WT0A 3POYA 3LSDA 3K38A 4YFZA 2R1DA 4K20A 4Y20A 1AX2A 2BERA 1V3CA 4XIOA 5HUMA 2UWBA 1PZ8A 4W65A 4FOQA 3O9KA 4Y1VA 4CPZA 2OVUA 3NWKA 1CESA 3GALA 2A6WA 1SBFA 3Q9OA 4YM3A 5HCFA 3O0XA 4XTPA 2DV9A 4MWVA 2A6YA 1CQ9A 2QWHA 1AZDA 3B7EA 4HANA 2C5DA 1KJRA 4MYEA 4MWWA 4XOGA 1GSLA 2D44A 3M3EA 4H52A 3B69A 4GA9A 2ZZJA 2A3XA 3UL2A 2NP0A 2AGSA 3JUUA 1VALA 2ZGRA 2NN8A 4BMBA 1W1XA 4FPLA 4MJUA 3WG4A 1ENSA 5DUWA 1NSBA 4QN4A 2H0BA 4XYXA 1S0CA 2W52A 1Z50A 2EIGA 2F10A 1B9SA 4D69A 2YA8A 1LEDA 3NV2A 4Y1ZA 2A3YA 4YW1A 1LOFC 4U2AA 1INVA 2ENRA 1VCJA 2A70A 3WG3A 4I30A 1O4ZA 4YZ1A 1CPMA 5F5QA 1CIWA 1H9PA 1HDKA 5GLUA 2DVBA 4XXAA 4LBNA 3VUOA 4R9CA 1INGA 2HTRA 3AP7A 1URXA 1WLWA 4WZFA 5IK8A 1SO7A 1W6NA 4BPZA 1V2IA 4XJQA 1NN2A 2DUPA 1YXWA 3VKFC 4CPOA 1FATA 2QWDA 1GZCA 3FUQA 2JD4A 1OFSA 1CN1A 2R1BA 2DU1A 1D2SA 1W6MB 1FNZA 2WQZC 2VK5A 1MS8A 3V0BA 3AZXA 4DQAA 4K1HA 1TEIA 1VCUA 1N1VA 3AYDA 1KDKA 5LK5A 2W68A 2F27A 2UWAA 4ITCA 2R49A 4YG0A 2LTNA 2FHRA 1G9BA 4BBWA 5L73A 4XE9A 5BYNA 1U0AA 2WNEA 3AZYA 1YRZA 3AXEA 3AZVA 3H6JA 1IVFA 4XBNA 3ZXFA 1ULFA 2HTWA 4FJ6A 2P3JA 3SH5A 2NMNA 3HN1A 1AX0A 3V0AA 1S0EA 2W20A 2VH9A 1DYPA 1V6MA 1XQNA 4LBMA 1NCDN 5CBLA 2D6PA 4P14A 4YGCA 3IMNA 5HX0A 2D6KA 1V3EA 2G4IA 2D6MA 4XJ8A 2F28A 1HLCA 1DIMA 1UZYA 3IKWA 4I00A 4FQ4A 1YIFA 3WVJA 3M3OA 1FV2A 4ATFA 2VK6A 1S1AA 5T5PA 3IPVA 4ZKTB 3A4UA 1Y7BA 4R9DA 3HR9A 4JRAA 1A8DA 1MS5A 4SLIA 3ZSMA 3UJQA 5GALA 3QCWA 2DVDA 2W5OA 4FP3A 3RMYA 4YM1A 1AXYA 3ZSKA 1GICA 2LALA 5H9RA 2VU9A 1JOJA 4X47A 1LULA 2GNTA 2GALA 4GZQA 2XCYA 1E8TA 4GZXA 1RITA 4YW2A 2F0ZA 4Q27A 4R9AA 1NLSA 1SCSA 3DGTA 3N7LA 4Y22B 4MC7A 5AVAA 4X6KA 4AGGA 3TB0A 2VW2A 3OPZA 5H9SA 3W09A 3MPPG 1W6PB 2BF6A 1SBEA 4Q1RA 2CWSA 3ILRA 3OGGA 3O5SA 3AYEA 2QWGA 1ENRA 1DZQA 4WA4A 3OYWA 2WJSA 3VV1A 1GBGA 5IT6A 1INYA 1IVDA 4Z8BA 1MVQA 1G8WA 1Z0HA 2ZGPA 1QDOA 3H72A 4K3YA 4YGBA 1V0FA 2P34A 3OBRA 5GZEA 2PHWA 1FYUA 4R9BA 4Q8KA 4HZXA 1FV3A 4DS0A 4Q2FA 1CVNA 2PHFA 1GZ9A 4MWJA 2PHTA 2Q5TA 3FLPA 4WV8A 2X9MA 1VAVA 4MJVA 3ALWA 4QN7A 1MS1A 4BLIA 2NZ9A 3WUCA 2BZDA 1V6JA 1QNWA 3ZXKA 5CA6A 1UN1A 1V6OA 3TI5A 1HQWA 4AYUA 2QWEA 4FOVA 1FNYA 3VKNA 3SISA 3RSJA 4XZPA 1F8BA 4IQPA 2CYFA 3V65A 4CPLA 4DRVA 1UPSA 3AP5A 1S0DA 3CYEA 5GLWA 2EXKA 4Y1UA 5GLTA 4UW3A 4K1JA 1CJPA 5JOZA 1WBLA 3L2YA 4AWDA 4Q1PA 2NYYA 1WW5A 3GVLA 1WD3A 2VW0A 3B01A 1V6LA 5FREA 4BOWA 1J1TA 1A78A 1EURA 3OJBA 1XOEA 2XZKA 1G86A 3VKLA 2Z42A 4CPMA 5GZGA 2YA6A 1LENA 3T2TA 1GANA 2DVGA 2XZJA 1ONAA 1IVEA 2YY1A 2YA7A 1NNAA 1SLIA 2HTVA 1DQ0A 1UL9A 2A6ZA 3WCRA 3A0NA 1RINA 5DXDA 3WDTA 2HTUA 2OUHA 3FLRA 2AR6A 3ILFA 2QWJA 4BLJA 1B09A 1JXNA 2EF6A 2QWFA 4GJTA 4FP2A 2C9AA 2CWMA 1AX1A 4WEGA 4UW5A 3ZSJA 3WNXA 1LOAA 2QWIA 3PMEA 2VSMA 4P9YA 1XOGA 4LBQA 3D11A 4ZXKA 5DZFA 1DQ6A 4JC1A 4Y24A 2HT5A 1JYCA 3K3AA 3POSA 1LHNA 4M3CE 4GWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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