3PMVA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
total genus 88
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmvA02
1P1OA 5JEIA 1D9YA 1JW5A 1MXWA 3FJ7A 4HCWA 4JB7A 1GTKA 4M1VA 3SEYA 4KQPA 4XKNA 5J1DA 3ONMA 2UVGA 4JWOA 5FHOA 4I8CA 3K0VA 4FE8A 1OMPA 4JWYA 4QRZA 2YPNA 3I6VA 1B46A 3PPOA 3UORA 3TQWA 4U2RA 3SEXA 2XXXA 2I0CA 3H6WA 1JW1A 2HZKA 4N13A 5H8NB 4OTEA 2CZLA 4OETA 1YCJA 4MBPA 2HZLA 3EN3A 3VE1B 4EXKA 3KZGA 4NMYA 3O28A 2DWHA 3B6WA 1B3HA 3KN8A 1IIWA 5ICTA 4RK2A 1ZLQA 4H65A 2B3FA 2F5XA 3EQ1A 4G68C 4MLVA 2RC9A 3FIRA 1IEJA 1NFTA 3OSQA 4NF5B 5H8HB 4F2OA 2Z23A 4HTGA 1HSEA 1JQFA 4KI0E 3RT6B 3MVZA 4R74A 3QIMA 5FTHA 2OLBA 4G2ZA 4Z0IA 3FJMA 2OZZA 3FV1A 3QUFA 1N04A 4OEVA 1UTHA 4QSCA 4YU0A 5H8HA 5H8QB 3RN8A 3VVEA 4ZEBA 4G8NA 3FVGA 5AA2B 4YZZA 4MLQA 1JETA 4OHNA 3TUSA 5CBSA 2DQVA 4YICA 1MQIA 3ILUB 3KOTA 5DT6A 2A5SA 3IX1A 1TFDA 2ZYKA 3CSGA 3KG2A 3PD8A 2XXYA 4DZ1A 3FVNA 5I2KB 4F2QA 3K6XA 5F1QA 1QW0A 3M8UA 1LCFA 1MG1A 1HSJA 2VD2A 4HCYA 3U93A 4AB5A 1IXGA 4DCXA 1USYH 2CMOA 1SD3A 3MZ9A 3IB2A 5JTYA 1LFHA 3QSLA 2ZMBA 1XVYA 3ECRA 3LSFB 4H5GA 4KPTA 4U23A 4F3BA 3I5OA 3O9PA 2F6GA 5H8QA 3HSTA 3TEPA 5I59B 2Q9TA 2QSXA 1S50A 3GBAA 4GRKA 1B0HA 4KCDA 3V8XB 1B5IA 3IB0A 4OQOA 1QUIA 2HAVA 2X26A 4IO5A 4XTCQ 3SESA 1FQBA 2GFEA 2A5TB 2XX8A 3O29A 2VHAA 4H6DA 1M5CA 1DPEA 3IB1A 4NF4B 3S4UA 1LBBA 4XKPA 3DP8A 4ZE9A 2W7YA 3G3HA 1GGGA 2ZNTA 1B2HA 3C32A 4QFLA 1P1WA 1SW1A 3H03A 4ONYA 1CB6A 1Z7NE 4O3BA 5DVIA 4G4PA 2GRVA 2PX1A 3HHGA 3K1NA 5LOMA 3JZJA 1QJMA 5JTYB 1LB9A 2KLFA 4DE8A 2ABHA 2R71A 3LC8A 1GR2A 1NNTA 3EHSA 1SW2A 3E13X 1S9TA 3HCQA 3OSRA 3C31A 4JBZA 5ITPA 4NF6B 1D9VA 2H99A 4LA9A 5I2KA 3PGFA 1B4ZA 3SEWA 4PP0A 1VFEA 1A99A 2QPQA 3IK6B 1WVJA 2XXIA 4P0GA 4ELOA 3IOVA 3AXFA 3LSXA 3THIA 4R72A 2QJEA 1OLAA 1SI1A 5CMBA 1DTZA 4R9GA 1LCTA 2XXRA 3L6GA 2Y84A 1UTHB 1XVXA 3LUYA 2PT2A 2QS3A 3FGSA 3PPRA 4QSDA 3U94A 2OJTA 3FZVA 3K6VA 2NWJA 4X48A 3H06B 5DVFA 4X1BA 3KBRA 1H44A 2OWSA 3A3CA 3B6QA 4R9FA 1IITA 2I4BA 2O7UA 3C9HA 4NF5A 2O69A 1TFAA 1OLCA 5DEXA 5CBRA 3MP6A 4ZEFA 1ZTYA 2UXAA 3N6UA 2Y7PA 3U72A 2OWTA 2Q2CA 4QFKA 2FA7A 3SERA 4C1TA 3FVOA 1B7HA 3I3VA 4KYDA 5H8NA 4AQ4A 3A09A 2PYYA 2Z8FA 4JWXA 2QS4A 4EUOA 3VXCA 4GLIA 1N76A 3FJGA 2RKMA 4PE5B 4RYAA 5BWJA 4PETA 3T9UA 3TYHA 2DSFA 4GXAA 1MY2A 2R6GE 4NE4A 4DIGA 1T0KA 3N5LA 2ONSA 4KCCA 4Z7EA 3K1MA 2YJPA 1QVSA 3PMVA 4H1XA 1H76A 1H45A 1IUDA 3PMXA 4PFYA 1IQ7A 2OBGA 4NTLA 4G68B 3UA8A 4DXUA 1AIVA 2FNCA 4NEDA 3FV2A 1NMUA 4BDNA 4H8JA 1P1NA 4H0WA 5H8FB 1BKAA 2VD3A 2NUVA 3FD3A 4RPOA 1R1NA 3N6TA 3QYTA 3MBPA 5TP9A 2QMXA 3IJXB 2RCAA 4NWCA 5BUUA 2GHBA 4R6YA 3CSBA 3TELA 1QULA 1B3EA 3H6UA 2E1SA 3BKIB 4PFTA 3G3GA 3RUMA 3TCHA 2I48A 4FJPA 4EQBA 5L9MA 2VOZA 1Y3PA 3ZS6A 1DSNA 1JNFA 2I6EA 2IA4A 1B7ZA 2F6PA 3MPKA 4EF2A 3VXBA 4QF9A 4RPNA 4U1OA 5K2XA 2I3WA 4NWDA 2V93A 3HO7A 4QFNA 4ISUA 3MJNA 2XHDA 1GV8A 1B3GA 3LSWA 1MXUA 1N7WA 2R9JA 3Q26A 4WEPA 3CVGA 4ZE8A 2AL4A 3PPPA 3O6HA 3U8QA 4QFOA 1SI0A 5L9SA 1H3DA 2HXWA 1MY0A 5TPAA 1MQJA 4QHQA 3SDFA 1NNPA 1MY4A 1DMBA 3QXMA 4FAJA 5KCJB 1IXHA 3GLBA 4OFOA 3D4CA 4F39A 4GIZA 3OO8A 4L17A 3KSXA 1Y1MA 5KDTA 1B05A 4LQ2A 2O7IA 1Z7ME 1UQWA 2I0BA 3CRBA 3PMWA 1B40A 4YKJA 1SBPA 2O84X 5EYFA 1FQEA 1JEVA 2XXWA 2Y7RA 2ONRA 3M3FA 1LB8A 2XXUA 1QUKA 4IY6A 1Y20A 1Y4CA 1YAEA 1LAGE 2Q89A 4LUBA 4ESWA 2XD3A 3TMGA 3MWBA 3UK4A 2UVIA 2Y7KA 1MH3A 1LBCA 3KN7A 1RYXA 1O63A 2DVZA 2F97A 2GH9A 4KYSA 1MXYA 2DS9A 3N26A 3CFZA 1L5TA 3TCGA 3UGWA 5ICQA 5F7VA 1N7XA 3MC2A 3BFTA 2DXRA 1ZIUA 2RC7A 2DWAA 3KEIA 3OENA 4H8IA 3PV0E 3TTMA 1NH8A 2THIA 3EHTA 4RJZA 3EPEA 1MPDA 3OMBA 1XHYA 5DYHA 1M5FA 4HW8A 1FTKA 5I2NA 1EZPA 3SEVA 5CM6A 3E3KA 1F9BA 2RINA 1VFDA 4G77A 4YB5A 3IL1B 4NF8B 4F31B 4H5FA 3IORA 3T9VA 3FUZA 5CRYA 1H43A 4ELPA 3K2DA 4FATA 1OVTA 3TPAA 4JSOA 1Y3NA 3SKPA 4ZS9A 2QS1A 3PU5A 5CMCA 2WKYA 3RTFB 4BDQA 2PMSA 1GVCA 3D4GA 5H8SA 3MP1A 1VSOA 1FTLA 2NVUB 4EF1A 1D3KA 4N07A 2Y7WA 3PUZE 1B32A 5L9OA 4JXIA 4GOTA 1LSTA 1B6HA 1NNFA 1DPPA 3MZBA 1JEUA 1S7YA 1UTBA 1VR5A 2O1MA 4KR5A 3V5AA 4F19A 5IKBA 1FTJA 1XT8A 1URSA 3H7MA 3OO7A 1EU8A 5I84A 4AB6A 3MUQA 4IGTA 4POXA 4C0RA 3MVWA 1P99A 3G7WA 2PT1A 4ZEDA 4IO6A 3KJ7A 1RKMA 3PPNA 4FORA 2XXHA 3OEKA 2I58A 4QFPA 3VVDA 1USYE 1AMFA 1JW4A 3KFMA 4Q0CA 3F11A 3IAZA 1OQHA 1YPNA 4RNSA 4OWDA 2HAUA 1DOTA 1O7TA 2O6AA 1ZBMA 1XS5A 3MW0A 3IOUA 2P0SA 3TTNA 5B70A 3IO6A 4G8MA 4THIA 4GL0A 4WXJA 3S9NC 3T22A 5CC2A 3FVKA 5I58A 3TQLA 5A5XB 1HSLA 1BIYA 1US4A 5EHMA 4E0XA 1MQDA 1EZOA 1M5DA 2H4IA 4RXLA 1BP5A 1A55A 2NOOA 1MQGA 4GL8A 3VFJA 1UTBB 3S9EA 5I56B 4XKQA 5ISUA 3T96B 1MM7A 2V3QA 3W15C 4TLLB 3L6HA 4IO3A 2HCAA 4X9TA 3S9MC 4OERA 1D4NA 2ZNSA 4BDOA 1B9JA 3E4RA 3Q28A 4POWA 4WEDA 3TKDA 4OYVA 1MPCA 4G8HA 3CIJA 3G3JA 4BDRA 1N84A 4DXCA 2G93A 4R6HA 3G3KA 4ZZAA 4F1UA 2XXQA 1FQFA 2DWIA 2H9BA 4UA8A 2XX9A 2ZYNA 1TXFA 3T9HB 2M8CA 3TODA 4JDFA 3T9XB 5AA4B 4EXLA 1ZU0A 5I2NB 2XXVA 5I58B 3R6UA 2V3UA 4GWOA 1Y3QA 1OQGA 2DE3A 3JV9A 2YLNA 3DP4A 2Y7IA 5HBCA 1A54A 4IO4A 4OXVA 2I4CA 2DE2A 3VLWA 3HV1A 5HPQA 4MF3A 4OESA 3H4ZA 3V89B 1WODA 2AIXA 1UIUA 2IEEA 4H67A 4WKMA 1MRPA 1P1QA 5CI5A 4F1VA 1ZKBA 2X7QA 4ELQA 5I56A 5KZTA 1B1XA 1P1UA 2ANJA 2RCBA 3A3UA 4I9DA 2XXPA 2F7AA 2F35A 3MPLA 2ALUA 1SW5A 3CG3A 3VLVA 1R6ZA 2Q88A 2OCUA 3E9XA 3TZAA 1EZ9A 1PDAA 4U4SA 3O66A 1B3FA 2DYXA 5A5XA 3R7XA 1R9QA 3KOSA 2DE4A 4TOZA 4UACA 2QL3A 4EQ9A 4LP2B 3VLUA 1NNKA 4OZ9A 2FYIA 3C33A 4KFQA 4K3FA 4MFIA 3S2VA 3GXAA 1LAXA 4OENA 1MXVA 3USDA 1M5EA 4YMAA 3IOWA 1Y4TA 2DWJA 3RLFE 1B7UA 3C34A 5I57B 1URDA 4NF8A 4U22A 3BFUA 4U21A 1B3LA 4XIGQ 5ELVA 2P2AA 4FEBA 3SEUA 3Q29A 1A40A 3RNNA 4KHZE 3CFXA 5AA4A 3WAFA 4BDMA 1JVYA 2Q2AA 3VV5A 1LAHE 1I6BA 1US5A 2REJA 3LSLA 1I6AA 4PFWA 2D21A 2NXOA 4ZEIA 4U1ZA 4BLAA 1FQCA 4GFRA 4XKRA 4YKKA 2VP1A 5IAIA 5AA1A 3G3FA 3UIFA 1DTGA 3DLNA 3CG1A 5AA3A 5AA2D 4EQ7A 3FXUA 4ND9A 2F36A 1SQYA 3JYRA 3OOAA 5CMKA 1YTVA 2ONKE 1TWYA 3MQ9A 3EHUA 3FATA 1PEBA 2ZYMA 3OXNA 4PQJA 3W9VA 3MVXA 3CFLA 4GD5A 1B1HA 1N0TA 2F7CA 2Z8DA 1B5JA 1A8FA 1LGBC 3M3LA 1FQAA 3OD7A 4RY1A 5FHMA 3TTLA 1A7LA 3N94A 4IB2A 4RA1A 4YKIA 1B5HA 4Q5TA 3TFLA 4GVOA 3CI8A 1MXZA 1Q35A 5FTIA 3C36A 3VDFA 3FXRA 5L8DA 3V83A 1AL3A 2HQ0A 4GF8A 1KWHA 3Q27A 2PBWA 4KYEA 1MY1A 3TDJA 4F22A 1B4HA 1RYOA 1J1NA 3H3GA 4OEUA 4R6KA 2F34A 5DTBA 1POTA 1SW4A 1PB8A 2H5YA 1NH7A 2UYEA 2PVUA 4FEDA 5ITOA 4JSDA 5K2YA 3PUXE 4R2FA 1NL5A 3S9LC 1ANFA 1N3WA 5TPAB 2XX7A 3QK6A 1MXXA 1Y9UA 1IXIA 1MH4A 3IO4A 3C35A 2H25A 3TTRA 2VGQA 2B65A 2ZNUA 3RGYA 4OFJA 3VVFA 1WDNA 4LATA 3O97A 4LZ7A 3RQTA 1FCKA 4DDDA 3OEMA 1FTOA 1MS7A 2F8DA 5JK4A 1LLSA 4YKPA 1QUJA 3M3KA 3T93B 4LZ5A 1R9LA 1XC1A 2E0SA 3O6GA 3ZSFA 4R73A 1MQHA 4BDLA 4F1YA 3Q25A 1OIBA 1ZJLA 2BJJX 1ATGA 2V84A 3TAJA 1SDXA 3ODBA 3WAEA 4LONB 4OVJA 2DP8A 1SYHA 1Q1KA 1SVXB 2DVCA 1II5A 2F7BA 2F78A 2B3BA 3KN3A 3PUVE 5KCJA 1IZ1A 4F18A 3OELA 1FW0A 4M4GA 1UIVA 2GHAA 1LFGA 3U92A 4XXUA 3HPIA 3RPWA 3GZGA 4GXSB 4P0IA 4YB7A 5DVJA 4IO7A 1B58A 1ELJA 2LAOA 3H6VA 5HM4B 4IY5A 2HEUA 3KJTA 4TLMB 3FASA 3OO9A 1URGA 4ZZEA 3K00A 1MDP1 3K02A 1A8EA 4NF6A 4IGRA 1MY3A 4FECA 4KD5A 4LVQA 2I49A 2UVJA 4ELRA 4O3AA 4ZEKA 2Z22A 2D5WA 4R2BA 3LR1A 2G29A 3O6IA 2I3VA 1MDQA 3MAMA 2QS2A 4O3CA 4YAHX 1FTMA 5TU0A 4ZDMA 1PBQA 2AYSA 4I1DA 3K1PA 1MM6A 2RC8A 3B7DA 1PBPA 4C1UA 3P7IA 1QKBA 3FXQA 1BLFA 4R75A 5FHNA 1NKXA 3K6UA 3ILTB 3LBSA 5TP9B 4GQOA 2DXYA 2D3IA 2UYFA 4E0WA 3BBRA 2HFBA 3TTKA 2O68A 4P11A 1M5BA 3O2AA 3RT8A 3H6TA 2ZYOA 5DEXB 4ECFA 2P1SA 3K6WA 3TCFA 3SETA 4LQ5A 1LAFE 4FIMA 4G68A 3ZKLA 1SYIA 3G3IA 3PUYE 3UN6A 5CMMA 4F3SA 5KDTB 2Q8JA 1PB7A 4F3GA 2V25A 5I59A 3EF7A 2OK2A 3HHFA 4DLDA 2UVHA 3IOTA 2ESNA 2O1LA 1O64A 3QUJA 3K01A 2X7PA 3MP8A 4Q30B 4ESXA 4YMBA 3IR1A 4OMBA 3T66A 3DP6A 3CR9A 4X1DA 3RY3A 4TQUQ 1BTJA 2DOJA 3MVYA 3PUWE 4PFUA 4DCYA 3GBBA 3MZ1A 3PPQA 3R26A 2XXTA 1B52A 1MPBA 1POY1 1JVXA 3IJOB 3B6TA 1VE4A 2XD2A 1B0LA 3KSJA 1Y1ZA 1CE2A 3UP9A 3PD9A 1I6QA 2REGA 3W9WA 1AOVA 4N6PA 4IO2A 4F29A 1ZMGA 1AH5A 4LZ8A 4QSEA 2H98A 1PC3A 2O51A 2RF1A 3K4UA 4OFLA 2QRYA 2ZXTA 3HN0A 4HS7A 4EDPA 5AA2A 4ZECA 5I57A 5EHSA 1TT1A 2AL5A 3DELB 3QAXA 3OO6A 4RK9A 4U4XA 3RTWB 1QKAA 4YB6A 3U1OA 1I69A 1OVBA 5B7DA 1FQDA 1LFIA 1XOCA 4I62A 3DM0A 2QMWA 5AE4A 4Q8RA 4MH5A 1B51A 3C4MA 3ZKKA 4DXBA 2Z8EA 1EH3A 1IXCA 5H8FA 4NF4A 4F3PA 2V3TA 5M2VA 1N3XA 1PB9A 3KGCA 2A5TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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