3PMWA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA02
2PYYA 3OENA 3I5OA 4U23A 3IB2A 1FQDA 1SYIA 2CZLA 2QS1A 1LAGE 3KG2A 4BDRA 3JV9A 4H6DA 4YB6A 4LA9A 1B40A 1ZTYA 3TFLA 2ANJA 1LBCA 5I2KA 3CRBA 5I57B 5CBRA 1EH3A 3QAXA 4LATA 3RGYA 1YCJA 3T66A 4DXUA 2I49A 2ZYNA 4LONB 1ZU0A 2P0SA 1LFGA 2XD3A 1Z7NE 2Z8DA 1DPEA 3K2DA 4LZ8A 4N13A 4YKIA 2RC7A 4R6YA 2V3TA 1TFDA 3FV1A 4C0RA 4ZEIA 3BBRA 3OMBA 1FQAA 3OEKA 2DVCA 2H99A 4XTCQ 3FJMA 2DOJA 5CMKA 4IO6A 1VFEA 3W9VA 4GQOA 4NF5A 4R2BA 4OETA 4R6KA 2D5WA 3PUXE 2I3WA 4DXBA 4YKJA 2UYEA 3RT6B 2Q2CA 2F78A 4G8MA 5L8DA 5B7DA 4QF9A 4F3GA 2ONKE 2DWIA 2GH9A 2ZMBA 4YB5A 4X48A 3RQTA 1DSNA 5H8HB 3TCHA 5HM4B 4JBZA 4UACA 3C9HA 4ZS9A 3KFMA 3O9PA 5I59B 4NF8B 3THIA 3H03A 3SERA 2HAVA 5K2YA 1OLAA 2ESNA 4QRZA 1IQ7A 3FJGA 1S7YA 1FTKA 2PT2A 2UXAA 3TAJA 2XXPA 1B1XA 4F18A 3ZKLA 4G8HA 3AXFA 1LSTA 2ZNUA 1PB8A 3WAEA 2Y7PA 3KOSA 4LUBA 4U21A 3N5LA 3O29A 1I6QA 1H44A 3FIRA 3MQ9A 4DE8A 2F34A 1JETA 2OLBA 4FIMA 2Y7WA 4H8JA 2FYIA 4NEDA 5H8SA 3TDJA 2P1SA 4QFKA 5LOMA 4R74A 4R75A 1B4HA 5AA2D 1B46A 2XXQA 2X7QA 3PPNA 4EF1A 3KN3A 1N76A 3KBRA 4ZZEA 5I84A 5DVIA 3RUMA 4IO4A 5DVFA 2RCAA 2REGA 3K00A 4F22A 4M1VA 1JEUA 4RYAA 4P0IA 1B7HA 1CB6A 3GLBA 1MQGA 3OEMA 4R73A 3Q26A 3VXBA 2DE2A 3QUJA 1M5BA 2AIXA 3KOTA 3S2VA 3SESA 4MH5A 1JVXA 4KD5A 3TTKA 3T9VA 3U8QA 2CMOA 1NNTA 3RN8A 1LBBA 4I1DA 1T0KA 2XXHA 4ZEKA 1R6ZA 2R71A 2Q89A 3MBPA 1MRPA 1DTGA 4G77A 1Q35A 1GV8A 2O1MA 3I3VA 1UQWA 3MZ1A 3O6HA 4QFPA 4KYEA 3H3GA 2NOOA 2Q2AA 4NMYA 3VLWA 4RK2A 2ONSA 3N94A 4I9DA 2XXWA 4ELQA 4O3CA 1USYH 3DP6A 1QUIA 3PPPA 2YPNA 3PUVE 1ZLQA 1LCTA 3O28A 3K02A 5IKBA 3B7DA 2XHDA 4Q0CA 4G68B 1JW4A 3TMGA 3ZKKA 2H4IA 2ZYMA 3PMWA 2DP8A 2XXRA 3RY3A 1ZKBA 3PUZE 5CMMA 3K4UA 4I8CA 4ZDMA 5HPQA 5K2XA 2PT1A 4LQ5A 2F8DA 5ICTA 1OIBA 3EQ1A 1I6BA 1SW4A 1A40A 2AYSA 1Y3QA 1FTJA 4OFLA 3OOAA 4H8IA 4YMAA 1NNKA 5ISUA 4H5GA 4NWCA 4F29A 1Z7ME 4LP2B 1N7XA 1JEVA 3RTWB 1B5HA 1LLSA 3GBAA 5F1QA 4ZE8A 5KCJA 3TCGA 3KSJA 5J1DA 5ELVA 5KDTB 3RPWA 3MVYA 4PQJA 3TQWA 2Y7IA 3C33A 3OSRA 4EUOA 4M4GA 1XC1A 1MXYA 4YMBA 4YB7A 2DWAA 4JDFA 1OQGA 2QPQA 3ILUB 1B0HA 1EU8A 4G4PA 3M3FA 1OVTA 1DOTA 4F3BA 2P2AA 4IGRA 2GRVA 1GTKA 5H8NB 1N7WA 4NF6A 4ISUA 4IY6A 3PPRA 3E3KA 3TELA 2VP1A 3O66A 1B3LA 4MFIA 4OEUA 4Z7EA 1LFHA 3V5AA 5KCJB 1EZPA 3VE1B 4JWYA 1LGBC 4DZ1A 2V93A 1MPDA 4QSDA 2ONRA 1BIYA 5I56B 4E0WA 3CVGA 1B3EA 2F6PA 3A09A 1H43A 1H3DA 4ZEDA 1NL5A 5JTYA 3MVXA 3TTNA 4OERA 3B6TA 2XXYA 3MPLA 2GHBA 3KJ7A 5KZTA 5M2VA 4EQ9A 4DIGA 1UTHB 1S9TA 4HS7A 3BFUA 4BLAA 4FE8A 1MY0A 3Q25A 2I6EA 4R2FA 4NF4B 1LFIA 4LVQA 5CRYA 1XT8A 3SEVA 5FTIA 5CBSA 2Q8JA 2RF1A 5TP9A 2NXOA 3MAMA 3OSQA 1QULA 1II5A 3TQLA 3IO4A 4F1UA 3SETA 3OD7A 4ELPA 1XVYA 1F9BA 1BP5A 1QVSA 4IGTA 3HPIA 2QSXA 3ODBA 3C31A 1M5CA 3VFJA 3QIMA 3DM0A 2THIA 1FQBA 1IITA 1XS5A 4KHZE 3PMXA 1P1NA 1PBQA 4C1TA 5DYHA 2HXWA 5CC2A 5DEXB 1D3KA 1AH5A 2YJPA 2Z8EA 1PEBA 2PVUA 1SDXA 3A3CA 4G8NA 5AA2B 1M5FA 4PFYA 5H8QB 1UIVA 5I58B 2X7PA 4U4XA 1A99A 5TU0A 1O64A 3MWBA 4WKMA 1VFDA 4R9GA 2OBGA 2F35A 3K01A 3S9MC 1MH3A 4WEPA 1N04A 4JXIA 4HW8A 1YAEA 5L9SA 1P1WA 1H45A 1WODA 1NNPA 3H6WA 4OYVA 1RKMA 3ZSFA 4F2QA 4GL8A 1EZOA 3MVZA 1A7LA 4GOTA 5I2KB 4Q30B 4H0WA 5JEIA 3IOTA 3FVOA 3MP8A 4BDLA 3T9XB 4PP0A 2KLFA 2QMWA 4YU0A 2VHAA 4GXAA 3MJNA 2I4BA 4HCWA 2I48A 2B3FA 1FCKA 2O7IA 3KN8A 3KGCA 4FEBA 2DYXA 3G3IA 4UA8A 2OCUA 1MM6A 5IAIA 3VLUA 3RT8A 3K6WA 3FJ7A 3K1MA 1P99A 3T96B 1IEJA 5H8FA 1Y1MA 1XHYA 2OWSA 1OMPA 4NF5B 4OQOA 3G7WA 3UP9A 1MQIA 2HFBA 1Y1ZA 5A5XA 4HCYA 3IOVA 1XVXA 4P11A 5EHSA 4GLIA 2IEEA 3EN3A 4PE5B 2QRYA 3A3UA 4GWOA 3HN0A 1IXGA 1Y3PA 3MPKA 1VR5A 1YPNA 1B3FA 3U94A 4AB5A 3RNNA 4OWDA 4JWOA 3D4CA 4YAHX 3OO7A 2AL4A 1JQFA 1QKBA 2GFEA 4YZZA 3IOUA 2G93A 3UN6A 4KPTA 2V25A 4PFUA 3H4ZA 1URGA 1Y20A 1RYOA 1B4ZA 4ZECA 1PBPA 5AA3A 3E13X 5L9MA 4XKRA 3LSFB 1RYXA 2RINA 3RLFE 2RCBA 5EHMA 2O6AA 3MUQA 3G3GA 3N6UA 4OFJA 3FVGA 5AA1A 2HCAA 1POTA 1MG1A 4QFOA 1N3WA 2RC8A 3P7IA 1GVCA 3CFZA 2F6GA 3G3KA 1B58A 1Y4TA 3KEIA 5HBCA 3S9LC 2XXXA 2PX1A 4Q8RA 4DXCA 1SW5A 4BDOA 4TQUQ 1NFTA 3S9EA 4WXJA 4N07A 4DDDA 4OENA 3UORA 4XKQA 1LAHE 3O6GA 3JZJA 1B51A 1PB7A 4BDQA 4OZ9A 5CMCA 3TTMA 5ITOA 1B7UA 4KFQA 3M3KA 5FHMA 4F3SA 2QS3A 1R9LA 2O69A 3R26A 1B7ZA 3VLVA 3SKPA 3QSLA 2FA7A 4IO3A 3WAFA 1P1QA 2DWJA 2G29A 4PFTA 4P0GA 2I3VA 3HSTA 1NNFA 2DE4A 1WDNA 2V3UA 4R9FA 3S9NC 1MXWA 5CI5A 4K3FA 3PMVA 4LZ5A 2Z23A 3FVKA 1NH7A 1D9VA 1B1HA 4GVOA 3GBBA 2NUVA 4EXLA 2HZKA 1I6AA 1US4A 3T93B 3EPEA 2DXRA 3LSXA 2Z8FA 4X9TA 1SI1A 1IXHA 3FVNA 3T22A 1NKXA 4ZE9A 3DP8A 1NMUA 2XD2A 3VVEA 1MY2A 1HSJA 3IO6A 3DLNA 3IOWA 2F97A 4KCDA 1JW5A 2R6GE 2X26A 4U2RA 1Y3NA 4PETA 4YKPA 1EZ9A 1ANFA 3MP1A 1R9QA 4RK9A 2YLNA 3U72A 1JVYA 5BUUA 2DQVA 4JB7A 2UVJA 3LBSA 1JNFA 4E0XA 4EQBA 4R6HA 3T9UA 3G3JA 3PPQA 1A8FA 3KSXA 1FQEA 4IO7A 4IB2A 4TLMB 1FTLA 2OWTA 4ONYA 1FTMA 2A5TA 2O51A 2GHAA 4U22A 2I4CA 2ZNSA 1B05A 4F31B 3B6QA 1AL3A 3IR1A 3C4MA 4OESA 3OELA 2DS9A 4EQ7A 1IXIA 5DTBA 3FASA 1KWHA 3SEYA 2ZYOA 3IORA 4KCCA 1P1OA 1LB8A 4DCXA 3TCFA 4GL0A 1UTBA 4ELRA 3DP4A 1B5JA 4F1VA 4JWXA 1ELJA 5CMBA 3SEXA 4FJPA 4F39A 3UA8A 4NF6B 3R7XA 2F5XA 1ZIUA 3PU5A 2DXYA 1B5IA 2DE3A 4OMBA 4KYSA 1B3HA 3FD3A 1B0LA 3IAZA 1MQDA 3IB1A 3LUYA 2Y7KA 2NVUB 1MH4A 1FQFA 3CG3A 3N26A 1MPBA 1B2HA 1QKAA 3CR9A 1D9YA 2H25A 3D4GA 1SI0A 1BKAA 3MZ9A 3HO7A 3H6TA 3U92A 1QJMA 3BKIB 2XXVA 4EDPA 5JTYB 4RPNA 1XOCA 3BFTA 4ZEFA 4LQ2A 4GFRA 4AB6A 4O3BA 3ZS6A 4HTGA 1UTBB 2PBWA 2R9JA 2VD3A 1OLCA 4F19A 3HCQA 3TTRA 1MQHA 1B9JA 3H06B 3VVDA 3C35A 3L6GA 1AIVA 1L5TA 4F2OA 3W9WA 3PV0E 1DMBA 2HAUA 2QS2A 5TP9B 1TXFA 1Y4CA 2NWJA 3R6UA 1M5DA 2RKMA 2O7UA 1MY3A 1VSOA 3FV2A 5H8HA 1A8EA 2D3IA 1FQCA 2I0CA 4JSOA 1OVBA 5I59A 1IUDA 1S50A 4NF8A 4IO2A 4H65A 5I2NA 2BJJX 3UIFA 3FXUA 1US5A 3TODA 1M5EA 1R1NA 4FATA 2XX7A 3M3LA 3C36A 3I6VA 4YKKA 1GR2A 1MDQA 3K6XA 5EYFA 1D4NA 3N6TA 4TOZA 1TWYA 1I69A 4ND9A 2XXIA 2B3BA 1URSA 4MLQA 1TT1A 3FATA 4BDMA 5TPAA 1ZMGA 4NE4A 1TFAA 3UK4A 1VE4A 4ECFA 2ZYKA 1URDA 3JYRA 3Q29A 3L6HA 2XX9A 2LAOA 4L17A 3K0VA 3EF7A 2W7YA 2DWHA 4GF8A 3RTFB 5I2NB 4I62A 3HHFA 2H9BA 2V3QA 1QW0A 4XIGQ 1PC3A 1A54A 1B6HA 4ESWA 1MPCA 2OK2A 3LSLA 2ZXTA 2VOZA 2HZLA 4MF3A 3OO6A 4H1XA 3M8UA 2QS4A 3TPAA 2E0SA 4AQ4A 3PUWE 3HV1A 2OZZA 3O97A 1QUJA 1SW1A 2XX8A 4OHNA 2H98A 5CM6A 5TPAB 1N0TA 2F36A 2I58A 3VXCA 5AE4A 3TEPA 4RPOA 3HHGA 4BDNA 3FXRA 2Q9TA 3PUYE 1B32A 4MBPA 3T9HB 4DLDA 3IJXB 2ALUA 1UIUA 2Q88A 4OFOA 4QFLA 3TTLA 3V83A 4OVJA 1GGGA 5H8FB 2E1SA 4XXUA 4OEVA 3LSWA 3CFXA 1SW2A 3EHSA 1P1UA 3H6UA 4RNSA 3LC8A 1B52A 3TZAA 3FXQA 3KZGA 2OJTA 2I0BA 3PGFA 3EHUA 4QSCA 3USDA 5A5XB 3QYTA 4F3PA 1OQHA 4YICA 1AMFA 3K1PA 4FECA 2ABHA 3KJTA 2ZNTA 5B70A 2HQ0A 3MC2A 1MY1A 1MM7A 1LAXA 4XKPA 4ESXA 4GD5A 1N84A 3UGWA 3V89B 2PMSA 1USYE 4G68A 3TYHA 3VDFA 3OO9A 3MVWA 2B65A 1AOVA 1MS7A 1HSLA 3MP6A 4G2ZA 5DVJA 3LR1A 1IXCA 1BLFA 4TLLB 3G3FA 3G3HA 1PB9A 3C34A 4QSEA 1MXXA 2AL5A 2FNCA 2M8CA 3F11A 3IX1A 4POWA 4EF2A 3TUSA 3TKDA 4OXVA 5JK4A 3PPOA 1QUKA 2DVZA 2H5YA 3DELB 2F7AA 4KI0E 4JSDA 1IIWA 4F1YA 2HEUA 2UVGA 3QXMA 4G68C 3FZVA 3H6VA 3FGSA 4NTLA 5KDTA 2A5SA 3E9XA 3MZBA 3VVFA 3V8XB 1J1NA 4MLVA 1POY1 5F7VA 2Z22A 1ZBMA 4QFNA 4Q5TA 2WKYA 4WEDA 3B6WA 1SYHA 3SEWA 2VGQA 4ELOA 4POXA 1ATGA 1FW0A 2UVHA 2XXTA 3FUZA 4IO5A 1LCFA 3CSBA 5FHOA 1FTOA 4X1DA 5H8NA 5BWJA 4R72A 3K6VA 3CSGA 3IL1B 4GRKA 1LAFE 3SEUA 3CI8A 4THIA 4KR5A 2UVIA 2D21A 3OXNA 3EHTA 5FTHA 3ILTB 1Q1KA 1BTJA 3U1OA 4KYDA 3QK6A 5AA4A 1JW1A 1IZ1A 4FORA 5I56A 5L9OA 3Q28A 3O6IA 2REJA 3GXAA 3OO8A 4H67A 3ECRA 1SQYA 3VV5A 4U1OA 1MQJA 1NH8A 4KQPA 1PDAA 1SD3A 5ICQA 1SVXB 2F7CA 5DT6A 1YTVA 1A55A 1UTHA 4XKNA 1DTZA 4NF4A 1DPPA 4NWDA 4QHQA 3IK6B 2O84X 3W15C 4EXKA 4FEDA 1N3XA 4PFWA 4OTEA 3CFLA 4H5FA 1Y9UA 4IY5A 4U4SA 1MXVA 4GIZA 2UYFA 4Z0IA 3PD9A 3GZGA 1MXUA 2RC9A 3SDFA 2V84A 4ZEBA 5AA4B 2DSFA 3CIJA 1O7TA 3QUFA 3CG1A 1CE2A 3IB0A 4FAJA 1MY4A 2O1LA 3Q27A 3E4RA 2IA4A 4RXLA 4DCYA 3H7MA 2XXUA 1O63A 1MDP1 3KN7A 3K1NA 2VD2A 4RJZA 1B3GA 5DEXA 3O2AA 4RY1A 2O68A 4LZ7A 5I57A 1HSEA 4GXSB 3IJOB 1SBPA 4O3AA 1MXZA 4N6PA 1ZJLA 4RA1A 2A5TB 3ONMA 5AA2A 3U93A 5ITPA 4X1BA 5H8QA 2QL3A 5I58A 3C32A 1H76A 3MW0A 2QJEA 2QMXA 2Y7RA 3K6UA 3S4UA 4C1UA 4U1ZA 2Y84A 5FHNA 4ZZAA 1LB9A 1WVJA 2F7BA 3PD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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