3PMWA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA02
3TQLA 3M3FA 3SDFA 1DTZA 3UK4A 3IL1B 1Y3PA 3RNNA 1IQ7A 3FIRA 2UXAA 3KFMA 1M5EA 1AL3A 1B5HA 3THIA 2I4CA 3HHFA 3MAMA 1B05A 4H0WA 5K2YA 2XD2A 1FTJA 2Q9TA 3OOAA 3MZ9A 1D4NA 3EN3A 1H45A 3G3KA 3G7WA 2ZNUA 3PMWA 4BDRA 2DSFA 1P1NA 2Q2AA 2OK2A 5AA2B 3B7DA 1XOCA 4YZZA 3KOSA 4Q0CA 4YAHX 2I49A 3T93B 1AMFA 3W9VA 3K02A 1Y9UA 1EZ9A 3FVGA 4IO5A 3CFLA 3LSFB 3PGFA 4ZE9A 1VSOA 1NNKA 1SBPA 3CSBA 2P1SA 4LONB 2QS4A 1SW5A 5IAIA 4OTEA 1MQDA 1O63A 2X7QA 5DVFA 2F5XA 4PFTA 1WVJA 4O3BA 3CIJA 3FJGA 2FA7A 3VXBA 2DP8A 4EF1A 4G68A 4EDPA 2RKMA 2PVUA 1MPBA 3MVWA 3BKIB 4DCYA 3K01A 4YMAA 1CE2A 2I3WA 1TXFA 1LCTA 5H8FB 3CVGA 5CI5A 3VVDA 2B3FA 1Y1MA 4JXIA 4IB2A 4OFJA 4AB6A 5I57B 5KDTB 1JVXA 1NFTA 4KQPA 1H76A 1PC3A 3O66A 1EH3A 3CG1A 2AYSA 4QFOA 3FV1A 3IB1A 1N0TA 3K1PA 1JW1A 1IEJA 3U94A 1OMPA 4NEDA 4IGRA 4R9GA 3U92A 1JW5A 3TCHA 2QSXA 2DOJA 2QRYA 4DXUA 3KN3A 1N3WA 3HHGA 4K3FA 3TAJA 1WDNA 4FEBA 4PP0A 4GLIA 3Q27A 2I3VA 5ELVA 5TP9B 4G8HA 4LUBA 2NOOA 2XXWA 1GR2A 1F9BA 3KN8A 4F1YA 4OETA 1MY4A 3FVOA 3BFTA 2V93A 3USDA 2GRVA 1IITA 4QRZA 2Z8DA 5M2VA 4O3AA 3MP1A 1FCKA 4YICA 4POWA 4R6HA 2H4IA 2HAVA 1MDP1 4P0GA 2B3BA 1JQFA 4OMBA 2HFBA 1OQGA 3PPQA 1I69A 2XHDA 3PV0E 3O28A 3MVXA 4ZEKA 2YPNA 2DS9A 2ONKE 4GF8A 5JTYA 3FVKA 5I59A 3R7XA 3MQ9A 1RKMA 1SVXB 4QSDA 1A99A 3K6XA 4ELQA 3D4GA 2FYIA 3OELA 4FEDA 2NUVA 5I2KA 4F2QA 4HCWA 2PYYA 4U23A 1WODA 5H8HA 2V3TA 4EXLA 4QFPA 1Q35A 1OLAA 2ZYOA 1NNTA 1MXWA 2HZLA 3KN7A 3UGWA 5CRYA 3OMBA 4I8CA 3L6HA 2H98A 1ZTYA 3AXFA 4R74A 3C34A 1FQDA 4NF5B 2XXYA 4R9FA 4DXBA 1MY1A 3M3LA 3RT8A 1IZ1A 3BBRA 1IXHA 4RA1A 1ATGA 4E0XA 3FVNA 5TPAB 3TTMA 4I9DA 4NF8B 3IO4A 4ZEBA 1FQBA 3MP6A 3FXUA 2X7PA 1PBQA 5KCJA 4GL0A 4LQ2A 3TEPA 4Q8RA 3TMGA 1QUKA 4EQ9A 3JYRA 1MS7A 3IR1A 4ONYA 4X48A 2ABHA 2OWSA 3G3GA 4MH5A 4LA9A 4XIGQ 3SEXA 2RCAA 1IXIA 5DTBA 4G68C 2P2AA 4GFRA 2O7IA 5TU0A 1URSA 2DE4A 4FORA 5L9OA 1FTMA 3MC2A 2VD3A 2Z22A 3TTNA 2ZYKA 2XXTA 1BIYA 1UTHB 5B7DA 4FE8A 2YJPA 3KSJA 4FJPA 4BDNA 3PPRA 2CZLA 3S2VA 2UVHA 3VVEA 5BUUA 1FQAA 2QJEA 5EHMA 5ICQA 1HSEA 2PT1A 2QL3A 1QJMA 3IB2A 4HCYA 4KFQA 3G3IA 1B46A 4YKJA 4JSDA 2REJA 3E13X 2GH9A 3VE1B 5A5XB 1FW0A 1NNPA 3SESA 3OO7A 3CFXA 1T0KA 4NMYA 3LR1A 4FAJA 1YPNA 3PPNA 4YKPA 3MUQA 3CFZA 2UVGA 4LZ5A 3TCGA 2XXIA 2GFEA 3IJXB 1LBCA 4ZZEA 4DCXA 5CM6A 1N7XA 2OJTA 1A54A 1S9TA 5AE4A 3U1OA 1LBBA 4IO7A 4L17A 1B58A 5L8DA 1QUJA 1A55A 2DE2A 1M5CA 3OSRA 3H6VA 1OLCA 2DWHA 1PBPA 3A3UA 1BTJA 1MDQA 4H5FA 2F6GA 4F1VA 4XKNA 4U22A 3OENA 1US5A 1R9QA 3OEMA 5I58B 1MH4A 4EQBA 1Y4CA 1O64A 1KWHA 1S50A 4MBPA 3UP9A 2UVJA 3PMXA 4H6DA 4OXVA 5J1DA 1Y1ZA 1MXYA 4ELPA 2W7YA 1N76A 3ZKLA 1N84A 4EQ7A 3HCQA 2E1SA 2P0SA 3O29A 5H8QB 3O6HA 2RC7A 2UYEA 3T9UA 3RN8A 5CMBA 3U72A 5FTHA 3T22A 3C4MA 3LBSA 3E4RA 1R9LA 4OHNA 3LC8A 1LFIA 1A7LA 3MVZA 5AA2A 1TFAA 3Q25A 1IXGA 3P7IA 3S9LC 3SEYA 5F7VA 1Y3QA 3Q28A 3ODBA 3SEVA 2CMOA 1QULA 4AB5A 1UTBB 3RTFB 4DXCA 3IX1A 5AA4B 1DOTA 4ELOA 2R71A 4NF4B 4DDDA 2NWJA 1JW4A 4OWDA 4RYAA 2O84X 3T9HB 3QYTA 1B7UA 4QHQA 1JEUA 3W15C 1DMBA 3B6WA 3H7MA 3UIFA 3IORA 4IY6A 5HM4B 3Q26A 1NH7A 2REGA 4KI0E 4PQJA 2KLFA 2O7UA 3IK6B 3S9MC 4H8JA 4YKKA 3LSLA 4OZ9A 1Q1KA 2O68A 1MM7A 2DWJA 3DP6A 5EYFA 3RY3A 1JVYA 3K4UA 3N6UA 2O69A 5H8FA 3V5AA 4OQOA 3H6TA 1ANFA 1UIVA 2Y7PA 1D9YA 4GVOA 2Y84A 2R9JA 2OCUA 4THIA 2RC9A 4JB7A 1R6ZA 2VHAA 5I57A 5KDTA 2DYXA 4F31B 4KR5A 3PD8A 3OO9A 4LVQA 4G8MA 4WXJA 1SDXA 2THIA 4KPTA 2FNCA 3FGSA 3H03A 2IA4A 3EHUA 4Z0IA 4F3SA 3G3JA 4JWYA 2ONSA 1EZPA 3SETA 3EQ1A 2Y7WA 1HSJA 3RT6B 3RPWA 2XX9A 3VLUA 4OFOA 3OD7A 4HTGA 1B3HA 3I5OA 3TDJA 5K2XA 2AL5A 4OYVA 2ONRA 5DEXB 1USYH 5DVJA 5I56B 3G3FA 1YAEA 4GRKA 4PE5B 4YKIA 4PETA 3K1MA 4U4SA 4KHZE 2QMXA 2XX7A 5TP9A 4OERA 4IO4A 1AH5A 4Q5TA 3KJ7A 2AL4A 4X1DA 1PB9A 5L9MA 1PB7A 4QF9A 4AQ4A 1QVSA 1B52A 1SI0A 2ZYNA 4MF3A 2F35A 2ZNTA 4IGTA 4U1ZA 4F3BA 4OEVA 1D9VA 2VP1A 3H6WA 1SI1A 3RGYA 3CRBA 5CMKA 3ILUB 4GQOA 4TQUQ 1B0HA 4XKQA 1TWYA 1VE4A 3EHSA 3ONMA 2A5TB 3MPKA 1SW2A 3TTRA 4DE8A 1B32A 4GOTA 1I6QA 1L5TA 2B65A 2I48A 1MXXA 3FZVA 4BDLA 4NF6B 3K1NA 4ZEFA 2XX8A 3E3KA 1SD3A 4ESWA 4EF2A 1FQCA 2I6EA 1B5JA 3R26A 3V83A 2PT2A 4GWOA 3T9XB 1B40A 2DXYA 2XXQA 2XXVA 2XD3A 4QFLA 2DWIA 2UYFA 3VXCA 3OO6A 1TFDA 3U93A 3I6VA 4IY5A 3T66A 4OEUA 3HO7A 1LFGA 4HS7A 4FIMA 1SYHA 2DWAA 2Q2CA 5I2NB 2RCBA 2F97A 4NF5A 1I6AA 3V89B 3W9WA 3T9VA 4XXUA 1MG1A 5TPAA 4NF8A 1NL5A 1B3EA 4C1UA 5H8SA 2OLBA 3PPOA 3FV2A 1Z7NE 3WAFA 4KYDA 4R2FA 4DZ1A 5IKBA 3TQWA 1LSTA 1MQHA 5H8NB 3L6GA 3PUVE 4ELRA 4BDOA 1D3KA 5BWJA 4LQ5A 3TFLA 4M4GA 1DTGA 2RC8A 1DSNA 1OVTA 3PD9A 4NTLA 5HPQA 1FQEA 2ZYMA 2F6PA 1HSLA 5F1QA 2I0BA 2XXXA 1B51A 2Y7IA 2LAOA 2F34A 2ALUA 4NWCA 1MQJA 2O1MA 3PMVA 3QAXA 1B9JA 4YU0A 2V3UA 2R6GE 4ZEIA 1I6BA 1P99A 1XS5A 5HBCA 3S9EA 1A8FA 1QW0A 2M8CA 3O2AA 2A5SA 3V8XB 1LAHE 1XC1A 4F39A 3K6VA 3SEWA 4GL8A 3PUZE 1II5A 2PX1A 3U8QA 1MQGA 1JEVA 2O51A 1PB8A 2HZKA 5AA3A 4OENA 2F7AA 2H99A 1MRPA 1MXVA 1B1HA 3MPLA 3VVFA 1VFEA 2BJJX 3HSTA 1XVYA 3CG3A 1J1NA 1P1WA 4RPNA 4NWDA 4EUOA 4TOZA 5A5XA 4G77A 4IO3A 1GTKA 1LB8A 1NMUA 2VGQA 4JBZA 3HV1A 1MPDA 4RK2A 4P11A 5I84A 3ILTB 2ZXTA 4MFIA 1ZKBA 1O7TA 1LAFE 3TKDA 4H1XA 4I62A 2WKYA 3PPPA 3QK6A 1N7WA 3IOVA 1MY0A 3JV9A 2D5WA 3LSXA 1YTVA 4MLQA 2V25A 3A3CA 3K6UA 3IO6A 3IJOB 4G4PA 4RNSA 2V84A 4RPOA 3B6QA 2XXHA 1OVBA 4KD5A 4BDMA 1OQHA 3A09A 4H5GA 2QS2A 1B0LA 3EHTA 3MJNA 2QS3A 1AIVA 4XTCQ 2V3QA 1XHYA 3C32A 1ELJA 1LGBC 5I58A 1R1NA 1XT8A 3RLFE 4R73A 3ZS6A 4RK9A 2RINA 1IIWA 3IAZA 4QSEA 1RYOA 1RYXA 4YMBA 2DVZA 1P1UA 3FASA 2OWTA 1LCFA 3K6WA 3TYHA 2OBGA 1PEBA 5H8QA 3KG2A 1MY2A 1NNFA 5ISUA 2H5YA 3H3GA 3C33A 3OSQA 1QUIA 2I4BA 4F22A 4U1OA 4RY1A 4F3PA 4HW8A 2H9BA 2Z8FA 2NVUB 2H25A 2XXRA 2ZMBA 1EZOA 5CBRA 3RUMA 3D4CA 3MBPA 3N26A 3KEIA 4ECFA 4R2BA 1Y4TA 1UTBA 4PFWA 3OEKA 2AIXA 1JETA 1B3LA 5AA4A 1N04A 4NF4A 1H44A 3M8UA 1POY1 1ZMGA 4F29A 4GXSB 4ZDMA 4JWXA 5L9SA 3O6GA 4ZECA 2XXUA 4H8IA 3DELB 3C35A 3DM0A 5KZTA 1GGGA 3MP8A 3K00A 4GXAA 1IUDA 1IXCA 4LATA 4N6PA 1LFHA 1FTLA 1FQFA 4G68B 3CI8A 4NE4A 4I1DA 3UA8A 2NXOA 1P1OA 1Y20A 2G93A 1P1QA 4OFLA 3F11A 2RF1A 1B3FA 4XKRA 1S7YA 3R6UA 1M5DA 3MZ1A 3UN6A 3PUXE 3RTWB 4N07A 1H3DA 1UQWA 3KGCA 3QIMA 5EHSA 2XXPA 3SEUA 5DT6A 1USYE 3K0VA 1B5IA 2QPQA 2Y7RA 4P0IA 4ZE8A 4LZ7A 4F1UA 3VFJA 2D3IA 1BP5A 1ZJLA 3O9PA 2VOZA 1Y3NA 1B7ZA 3VDFA 4UA8A 4G2ZA 4POXA 1SYIA 3TTLA 3C9HA 3TODA 4GD5A 1UIUA 4OESA 5CMMA 3MZBA 5DEXA 5ITPA 4C0RA 5AA2D 2ESNA 3O6IA 4R6KA 4XKPA 5I56A 1B6HA 1A8EA 2Q88A 2PMSA 3GZGA 4YB5A 4JDFA 3QSLA 1SW4A 2DE3A 1A40A 4GIZA 4MLVA 1B2HA 1MY3A 3ZSFA 2Z8EA 2VD2A 3PU5A 1LLSA 1SW1A 1B7HA 1B4ZA 3CSGA 5FHMA 4M1VA 4Z7EA 5JEIA 1AOVA 4IO6A 2HCAA 4X1BA 4FATA 3N5LA 1NKXA 3G3HA 1B4HA 3GBAA 2E0SA 1GVCA 1ZLQA 3N94A 3H06B 4DIGA 3VV5A 4ZZAA 3I3VA 1LB9A 2DVCA 2ZNSA 3FUZA 3QXMA 3C36A 3HPIA 3MVYA 5JK4A 3B6TA 2Y7KA 3FXQA 2A5TA 3ECRA 1QKBA 3LUYA 4ND9A 4BLAA 1MXZA 4E0WA 5JTYB 4NF6A 5I59B 2X26A 1B3GA 1URGA 1JNFA 1MXUA 2UVIA 3FJ7A 1H43A 4JWOA 2F78A 3KZGA 5B70A 4F2OA 3DP4A 2HEUA 3TZAA 3TCFA 3FATA 4ZEDA 4QFKA 5I2KB 2QS1A 1MH3A 4C1TA 3KBRA 5H8HB 4YB6A 3PUWE 4TLMB 1TT1A 1YCJA 1MM6A 4ISUA 2DXRA 3WAEA 1LAGE 4UACA 4LP2B 5CBSA 1VR5A 3ZKKA 3IOTA 5I2NA 2YLNA 3H6UA 3Q29A 2Q8JA 3TUSA 4KCDA 1POTA 2HQ0A 2DQVA 3DLNA 1SQYA 4Q30B 4PFUA 4F19A 1DPEA 1M5BA 4U21A 3JZJA 1CB6A 5ITOA 4R72A 1OIBA 2F8DA 5DVIA 5KCJB 1N3XA 4H67A 3TPAA 4TLLB 4U2RA 3H4ZA 3KOTA 4DLDA 2F7BA 5H8NA 4YB7A 3K2DA 1GV8A 3T96B 3S4UA 3S9NC 1FTKA 3TTKA 3EPEA 4WKMA 4LZ8A 2I58A 4JSOA 4KCCA 1NH8A 1LAXA 1Z7ME 3MW0A 4R75A 5DYHA 3UORA 4KYSA 2I0CA 1UTHA 3IOUA 1ZIUA 1ZU0A 3FJMA 3GLBA 4PFYA 1EU8A 2PBWA 3QUFA 5FTIA 5CC2A 3DP8A 3PUYE 2Q89A 4F18A 2G29A 4RJZA 1M5FA 3OXNA 3FD3A 3M3KA 2IEEA 3BFUA 3LSWA 4IO2A 5FHOA 4QFNA 4WEDA 5ICTA 5FHNA 3OO8A 3HN0A 1QKAA 4OVJA 4ESXA 4QSCA 1B1XA 1DPPA 2ANJA 4ZS9A 4G8NA 5CMCA 3E9XA 3GXAA 4X9TA 3RQTA 2GHAA 2O1LA 3MWBA 3IB0A 3C31A 4FECA 3KJTA 4F3GA 4KYEA 3GBBA 2F36A 4U4XA 3N6TA 4BDQA 3CR9A 4N13A 2OZZA 1MPCA 2HXWA 2GHBA 4R6YA 1VFDA 3SERA 5AA1A 1FTOA 4O3CA 3TELA 4H65A 2QMWA 2F7CA 1BKAA 1MQIA 3VLWA 4WEPA 2D21A 2HAUA 1BLFA 3KSXA 1US4A 3VLVA 1XVXA 2Z23A 3FXRA 4RXLA 1PDAA 3QUJA 5LOMA 3EF7A 4EXKA 1URDA 3O97A 1ZBMA 3SKPA 3IOWA 2O6AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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