3PMWA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmwA02
2O51A 1QKBA 4M1VA 4THIA 4U2RA 3OELA 1D9VA 1IEJA 3MQ9A 1P1UA 3UN6A 2PT1A 2XD2A 4JWOA 3L6HA 3PD8A 1SYIA 4G2ZA 1LAHE 4EQ9A 3K6XA 3HV1A 2H25A 4Q0CA 4DIGA 4EXKA 4ZEDA 4RJZA 5H8QB 2ONSA 1RYOA 3OXNA 4LVQA 4O3BA 3ZSFA 5KCJA 1PB9A 4ZEFA 1B0LA 4NF8B 1EZOA 2W7YA 4OYVA 4PETA 4OFJA 1PB7A 3ZKLA 5H8FA 1B3LA 3B6QA 1OIBA 1US5A 4BDOA 3EHSA 2P1SA 4FECA 2PT2A 2O68A 4FATA 4MLQA 1Y9UA 1LSTA 5EYFA 3W15C 4TQUQ 1LB8A 3IOWA 1MH4A 4HCWA 3MP6A 3IOUA 2OZZA 4JSDA 1L5TA 4WKMA 1UQWA 4POWA 2HFBA 3ECRA 4KYEA 1LFGA 1FQBA 2O7UA 5AA4A 3JYRA 4P11A 3S4UA 1PB8A 4KI0E 1LAXA 4F3BA 4ZDMA 1EH3A 3MWBA 1OQGA 1DOTA 5AA3A 4G8HA 3TDJA 3N26A 2RCBA 3WAFA 1NKXA 5I56A 5I59B 1ZKBA 1N7XA 2XXTA 1AL3A 4DXCA 3VXCA 2GHBA 3G3IA 1B1HA 4XKRA 4FAJA 1H44A 4MLVA 4DZ1A 5CM6A 4F22A 3PD9A 2I4BA 1OVTA 4F29A 4DXUA 1OMPA 2A5SA 4PFWA 1B3HA 1MY4A 3FXQA 4RA1A 2DQVA 4C1UA 1MXVA 3CFZA 5ICTA 3DP6A 2Q89A 2O1MA 1Y1MA 2R71A 3SEWA 2F7CA 4F3GA 1AOVA 1EZ9A 4KHZE 1B0HA 5DEXA 3A3UA 3FV2A 1MQDA 4N07A 4QFOA 4IGTA 4WEDA 1SW2A 1IITA 4XKPA 2HEUA 5L8DA 1MQJA 1MQGA 2ZNUA 3IL1B 3TKDA 2HXWA 1YCJA 2A5TA 1J1NA 1WODA 4KYSA 4NF4A 4H5FA 3CI8A 3O6HA 4ZE8A 3N6TA 1YAEA 4JDFA 2HAVA 4H0WA 2DOJA 4H8IA 1NNFA 2QS3A 1JNFA 2FA7A 3ZS6A 5FTHA 1IIWA 4AQ4A 3HPIA 1BP5A 4MH5A 4P0GA 1USYE 3VE1B 2XXHA 3FD3A 3IORA 1DTZA 1MS7A 3T66A 3P7IA 3T9VA 3VDFA 4UA8A 2ZYKA 3MAMA 1MY3A 3HHFA 1MPDA 4F39A 3C31A 3MZ9A 2RC8A 3MVYA 5FTIA 3IB2A 1FQFA 1DSNA 3TTLA 4RY1A 2FNCA 3QSLA 4G4PA 5BWJA 5B70A 1HSEA 1XVYA 2REJA 4H5GA 3RGYA 3H6VA 4AB6A 3TUSA 3S2VA 1LGBC 4YKIA 4GQOA 1OQHA 3UP9A 4YKKA 4XIGQ 5F1QA 3IJXB 1UTBB 4YAHX 4YU0A 1ZMGA 5H8NB 3TPAA 1GVCA 2FYIA 4DDDA 4TLMB 1SDXA 3CSBA 4GVOA 5FHNA 1NNTA 1NNKA 4G8MA 4NF5B 1IQ7A 1QULA 2I0CA 2NWJA 4KCDA 2Y7PA 1JEVA 4OETA 3IO6A 3EHUA 3H3GA 2O69A 3MPKA 2VHAA 1SVXB 1SD3A 5A5XA 4C0RA 1PC3A 1SI1A 4DCXA 1MQHA 4YMBA 2F5XA 3G3HA 1R9QA 4F18A 2DVZA 4H65A 4EQBA 1XT8A 3HHGA 4F1VA 3FIRA 4IO4A 4ELPA 4I62A 4PE5B 1LAFE 3PUYE 3EQ1A 4LP2B 3FVGA 2DE4A 3G3GA 1B7HA 3MBPA 2O7IA 3GBAA 4M4GA 3O28A 2D5WA 3O2AA 2V25A 3FJGA 3KOTA 4OFOA 4G68B 2X7PA 3G3JA 1B1XA 1R6ZA 2I0BA 4BDQA 2QL3A 1LBBA 3UIFA 4F19A 2AL4A 3PUWE 2PX1A 4PFYA 5DVIA 2NXOA 2QS2A 4DCYA 3QUFA 3VV5A 4HTGA 4KCCA 3RPWA 5K2YA 3K1MA 3PMXA 1ANFA 4IO5A 3K2DA 4X9TA 4PFUA 2I4CA 3M8UA 3BKIB 4GF8A 5CBSA 3O6GA 3RQTA 1LCTA 1QUIA 1A99A 4PFTA 2XXYA 3T22A 5L9MA 3PPRA 1CB6A 1FTLA 4KPTA 2V84A 4GXSB 4P0IA 4FEDA 4TLLB 4F2OA 3EPEA 2F35A 4NWDA 4IY5A 1XVXA 4IO2A 1MXUA 2Q88A 4IO7A 3FASA 5I57A 4NTLA 1BIYA 4X48A 2QPQA 1GTKA 4GL8A 3I3VA 3T9UA 5JTYA 3RY3A 5EHMA 2Q2AA 1WVJA 2F6PA 4ZEBA 1XHYA 3MC2A 3THIA 4YKJA 1M5FA 4GRKA 3RUMA 1M5EA 1P1NA 2Y7RA 2AL5A 2Q2CA 4QHQA 4MFIA 3FJMA 1DPEA 4Z0IA 3BBRA 1AH5A 2ZYMA 1ELJA 4GOTA 1OLAA 3IOVA 3IOTA 3JV9A 5I58B 1R9LA 5DVJA 4IGRA 3KN7A 1B9JA 5AA2A 3A09A 4ZEKA 3IB0A 3CFLA 2B65A 3T93B 3MP8A 5H8HB 1N3WA 3U92A 4OWDA 3DELB 1LBCA 1LAGE 1PDAA 3R7XA 3MVWA 2LAOA 2D3IA 1H3DA 4I9DA 4ZS9A 3W9WA 3N5LA 2XHDA 1S9TA 3PMVA 2HAUA 4R72A 1B5HA 1UIUA 1B40A 1IUDA 4F2QA 1N7WA 1Q1KA 4JB7A 1A8FA 1MY0A 4X1BA 1BTJA 2VOZA 5ELVA 1MXXA 3TCHA 2XXQA 4EF1A 1MXWA 4ELOA 4NF8A 3ODBA 4WEPA 1F9BA 1N04A 2F78A 1I6QA 3KN8A 4XTCQ 5BUUA 5KCJB 5JK4A 1QVSA 1URSA 3FV1A 2ALUA 1FQEA 4QFKA 5H8FB 4E0XA 1A7LA 3LSWA 2OLBA 3MVZA 1FTKA 3D4GA 3Q27A 4OFLA 3HCQA 1SQYA 1URDA 2IEEA 3VVEA 1O64A 2O6AA 3TEPA 1NH8A 4FJPA 4UACA 2PBWA 2H98A 3JZJA 2F97A 1NH7A 3KBRA 2XXPA 4KFQA 4ELRA 3CG3A 3OEMA 4PP0A 2DWIA 3R26A 3B6WA 2QMXA 5AA4B 1PBQA 2F36A 3E3KA 2G29A 1QUKA 4ND9A 4FE8A 2UVGA 2Y7WA 3E13X 4QFNA 4NEDA 1FQDA 5I56B 1FCKA 1HSJA 1DTGA 3Q28A 2RCAA 1B4HA 1IXCA 1M5BA 1UTHA 3U72A 3AXFA 3H06B 2BJJX 2ONKE 2ESNA 2XXUA 4U1OA 5EHSA 2YLNA 1KWHA 3HN0A 3SEVA 2ZMBA 2I48A 2O1LA 3O66A 2PYYA 2RKMA 4H8JA 3RTWB 2Y7KA 1N0TA 1MPBA 4NMYA 3IB1A 4YZZA 3TELA 4R73A 2AYSA 1SW4A 5B7DA 3TCGA 2F6GA 2DE2A 5CC2A 4FORA 2HCAA 3PGFA 4N13A 1Y3PA 2ZNSA 3IR1A 4DE8A 1UIVA 5DEXB 4R2FA 1D9YA 3VXBA 4HS7A 1YTVA 3T9XB 3SEXA 4ECFA 4OESA 3SERA 2P2AA 3M3FA 2F7AA 3K1PA 4Q5TA 2ONRA 5I2NA 2H4IA 4ZZAA 2E1SA 1B7ZA 1B3FA 4NF4B 3TQWA 3RT6B 5DYHA 5FHMA 3QK6A 1B46A 1D3KA 2R9JA 3MJNA 4ESWA 1B2HA 4F3PA 2V93A 1SI0A 1O63A 3LBSA 3H6UA 2AIXA 4NF6A 3EHTA 3KN3A 4HW8A 3USDA 3SESA 4YKPA 5KZTA 3HSTA 4U4XA 2OK2A 5CMMA 5TPAA 4KQPA 4N6PA 4LQ5A 4EDPA 5KDTA 2D21A 1Y20A 3SETA 1H76A 2DE3A 4O3AA 4F31B 3CG1A 4H67A 1ZTYA 4RXLA 4ELQA 3CRBA 3TAJA 3TTMA 4OEVA 1P1QA 4U21A 4JSOA 4KYDA 3OO8A 3V89B 4GLIA 4BDLA 3MZ1A 2OBGA 2DSFA 3O29A 4KR5A 4O3CA 3K01A 1Q35A 4NWCA 3VLVA 3TTKA 3OEKA 2UVIA 1GV8A 1EZPA 1LFHA 1HSLA 4R9GA 2OWTA 1N84A 2H99A 2XXVA 1IXIA 5TP9A 4EF2A 2Z8FA 1BKAA 4F3SA 1B52A 4ZEIA 4R2BA 1II5A 3TMGA 1I6BA 1FQAA 1MY1A 1QUJA 3CIJA 2Z8EA 3FXUA 1MM7A 1QW0A 4OTEA 1M5DA 3L6GA 1Y4TA 1FTOA 4QF9A 5IAIA 4R75A 3C32A 4I8CA 1H45A 3KG2A 3RN8A 5A5XB 3RT8A 5I2KB 1QJMA 2GRVA 3OSQA 1NFTA 3H6WA 1AMFA 3S9EA 3H4ZA 3C34A 2GFEA 3U8QA 2XXIA 3PUZE 1JW5A 1Y3QA 5M2VA 5ICQA 3EN3A 5H8SA 2QJEA 2UYEA 4G8NA 4Q30B 4ZZEA 5CMCA 2VD2A 3H6TA 2V3QA 4RK9A 1B5JA 5K2XA 1ZLQA 3Q26A 4LUBA 1S50A 3E4RA 3IAZA 2DWJA 2H5YA 1BLFA 1ZU0A 3MZBA 1A40A 1JW4A 3K6UA 5CI5A 3OO7A 2I3VA 1N76A 2Q9TA 4ESXA 5DT6A 3KJ7A 4ZECA 3LSXA 1O7TA 3FVOA 1IXGA 2QMWA 2E0SA 3B7DA 5HPQA 1IXHA 3B6TA 3KFMA 2PMSA 5CMBA 2RC9A 3O6IA 1NL5A 2DVCA 4R6YA 5HBCA 3VVDA 1PBPA 5I57B 3MVXA 4JWXA 1B32A 4RNSA 2VGQA 4PQJA 4EXLA 5JTYB 4LQ2A 1FTJA 3FVNA 3ZKKA 4RPOA 2I3WA 3N94A 3M3KA 3MPLA 1URGA 5CRYA 5J1DA 3S9MC 2NUVA 1Y4CA 2CMOA 4FEBA 2ANJA 4GXAA 1MG1A 2ZYNA 1POY1 4NE4A 3I6VA 2DXYA 2IA4A 5TU0A 1TWYA 1SW1A 4LZ7A 5HM4B 3MUQA 5AA2B 3PPPA 1D4NA 4QSCA 1RYXA 5ITPA 2DWHA 3G3FA 4DXBA 2UVHA 5H8QA 3TZAA 3LSFB 2ZYOA 5DTBA 2QS1A 3QUJA 3KOSA 3LR1A 2OJTA 2GHAA 4RPNA 2GH9A 1ZIUA 1PEBA 3K4UA 2RF1A 4E0WA 1T0KA 1VSOA 1A54A 1B4ZA 1YPNA 1SYHA 4R6HA 3CVGA 3PPQA 1B6HA 3N6UA 4XKNA 3DM0A 4GFRA 3OOAA 4L17A 4U22A 3DP8A 1NMUA 4ONYA 3VVFA 3OO6A 2Z22A 3OO9A 4U1ZA 1FTMA 1WDNA 3H7MA 3E9XA 3U94A 3WAEA 1VR5A 1USYH 1B05A 2X26A 4YICA 1M5CA 1JETA 1MDP1 2F8DA 2UXAA 5JEIA 3IJOB 4YB7A 3UA8A 3MW0A 3FJ7A 3GZGA 2Y84A 1Y1ZA 4H6DA 1MH3A 4OZ9A 3UORA 2F34A 5I59A 2P0SA 3TODA 4QFPA 1LFIA 3F11A 3KSJA 4YB5A 3G3KA 1QKAA 2ZNTA 1B5IA 3QIMA 1P1OA 4EQ7A 3SEUA 1POTA 1B58A 4MBPA 4IY6A 1N3XA 3T96B 4H1XA 2M8CA 4BDNA 2OWSA 2ZXTA 3MP1A 2KLFA 5AA1A 4LZ5A 3VFJA 3TTNA 3KZGA 3RNNA 4K3FA 4R9FA 2ABHA 2HZLA 4U4SA 1VE4A 3D4CA 3O97A 3K1NA 2XXXA 3KGCA 3DLNA 1Z7ME 4QRZA 1UTHB 3FXRA 3LC8A 3TTRA 1TFDA 5AE4A 2YJPA 4TOZA 4X1DA 1B3EA 2DXRA 2XX8A 4R6KA 3TQLA 4EUOA 3RTFB 2H9BA 2CZLA 3ILTB 3PPOA 4XXUA 2RC7A 4Z7EA 4LA9A 1US4A 2V3UA 3FGSA 2XX7A 3PV0E 3KSXA 3IX1A 1TXFA 2I49A 5ITOA 3KJTA 4BDMA 3HO7A 3PPNA 2B3BA 1TFAA 3PUVE 2A5TB 4G68C 1MXZA 4GD5A 3IK6B 1DPPA 3G7WA 4YMAA 2PVUA 1H43A 4OXVA 2R6GE 2YPNA 1VFDA 3C35A 5I2NB 4R74A 5I84A 1VFEA 1NNPA 2THIA 3EF7A 1I69A 4POXA 3S9LC 1GR2A 3FATA 3UGWA 2VD3A 5IKBA 3PUXE 4IB2A 3A3CA 5FHOA 2V3TA 1LCFA 3OSRA 3K00A 3FVKA 3ILUB 4NF6B 3RLFE 4ISUA 5DVFA 2NVUB 1TT1A 1JVXA 1AIVA 3V5AA 1UTBA 2UVJA 5TPAB 3S9NC 4GWOA 5KDTB 4JBZA 4U23A 1SBPA 3UK4A 3K6VA 2DWAA 5H8NA 4YB6A 4Q8RA 4LATA 3DP4A 1I6AA 1B7UA 2Q8JA 1ATGA 4QFLA 2HZKA 1FQCA 1MXYA 1JVYA 2VP1A 4NF5A 2OCUA 1EU8A 3SKPA 5F7VA 2DP8A 4MF3A 3PU5A 3SEYA 3CFXA 3I5OA 3TCFA 3C4MA 2G93A 3LSLA 3U1OA 2QS4A 4LONB 3Q29A 2HQ0A 1MY2A 3H03A 4OENA 1XS5A 2I58A 1Y3NA 1IZ1A 4F1UA 5TP9B 4ZE9A 4HCYA 1XC1A 3K6WA 3QYTA 5L9OA 5LOMA 1DMBA 3OENA 2Z8DA 5CBRA 2O84X 1LB9A 3QXMA 3W9VA 3SDFA 3GXAA 2I6EA 5I2KA 3KEIA 5AA2D 3FZVA 4RK2A 1ZJLA 2X7QA 2UYFA 4OERA 1JQFA 4G68A 2XXWA 1R1NA 3CR9A 3GBBA 3GLBA 2Y7IA 3V8XB 3BFUA 4OMBA 4RYAA 2Z23A 4IO6A 2WKYA 1MDQA 1A55A 1GGGA 4F1YA 1CE2A 4LZ8A 3QAXA 4GIZA 4G77A 3LUYA 1XOCA 5ISUA 4QSDA 3CSGA 1ZBMA 3U93A 2B3FA 3V83A 4JXIA 3PMWA 1OLCA 3FUZA 4KD5A 4BLAA 5L9SA 4C1TA 3T9HB 3R6UA 2QSXA 3K02A 3K0VA 1SW5A 3O9PA 3M3LA 4AB5A 1LLSA 4OHNA 5CMKA 2DS9A 1P1WA 3C33A 2NOOA 1P99A 3TFLA 4DLDA 2XD3A 1S7YA 3TYHA 2REGA 3C36A 3C9HA 1FW0A 2F7BA 1MM6A 2QRYA 1MRPA 4WXJA 1Z7NE 4JWYA 4FIMA 2XX9A 5I58A 3BFTA 4IO3A 4OEUA 1JW1A 3VLWA 1OVBA 3IO4A 3VLUA 1JEUA 3ONMA 3OD7A 4GL0A 3Q25A 4OVJA 1MPCA 4QSEA 1RKMA 5H8HA 3OMBA 4I1DA 4BDRA 1A8EA 2RINA 1B3GA 1MQIA 4OQOA 1B51A 2DYXA 2XXRA 4XKQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O51A 1QKBA 4M1VA 5LDZA 4THIA 1YZ0A 4U2RA 3OELA 1D9VA 1IEJA 3MQ9A 1FPDA 1P1UA 3UN6A 1FRPA 4IR8A 2PT1A 2XD2A 4JWOA 4MIJA 5IZ3B 3L6HA 3PD8A 1SYIA 4G2ZA 1LAHE 4EQ9A 3K6XA 3HV1A 2H25A 2FBPA 4Q0CA 4DIGA 4I3YA 4EXKA 4G61A 4ZEDA 2P3NA 4RJZA 5H8QB 4PF8A 2ONSA 1RYOA 3OXNA 4LVQA 4O3BA 3ZSFA 5KCJA 1PB9A 4ZEFA 1B0LA 4NF8B 5T3JA 1EZOA 2W7YA 4OYVA 4PETA 4OFJA 1PB7A 3ZKLA 5H8FA 1B3LA 2QFLA 3B6QA 1OIBA 3IFCA 1US5A 4BDOA 3EKIA 3EHSA 2P1SA 1VDWA 4FECA 2PT2A 2O68A 4FATA 4MLQA 1LSTA 1Y9UA 1KA0A 5EYFA 3W15C 4TQUQ 1LB8A 5EQAA 3IOWA 5EYHA 1MH4A 4HCWA 2HHMA 3MP6A 3IOUA 2OZZA 4JSDA 1L5TA 4WKMA 1UQWA 4POWA 2HFBA 3ECRA 4KYEA 1LFGA 1FQBA 2ZZWA 3MYUA 2O7UA 5AA4A 2V4CA 3JYRA 4P11A 3S4UA 1PB8A 4KI0E 1LAXA 4F3BA 4ZDMA 1EH3A 3MWBA 1EYKA 1OQGA 1DOTA 5AA3A 4G8HA 3TDJA 3N26A 2RCBA 3WAFA 1NKXA 5I56A 5I59B 1ZKBA 1N7XA 4N4UA 2XXTA 1AL3A 4DXCA 3VXCA 2GHBA 3G3IA 1B1HA 1FPJA 4XKRA 4FAJA 1H44A 4MLVA 4DZ1A 5CM6A 4F22A 3PD9A 1FTAA 2I4BA 4N8GA 1OVTA 4F29A 4DXUA 2R8TA 1OMPA 4XEQA 2A5SA 4PFWA 1B3HA 1FBFA 4P1EA 1MY4A 3LV0A 3FXQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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