The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
84
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sequence length |
211
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structure length |
211
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Chain Sequence |
GSSLSRTQIVNWLTRCGDIFSTESEYLTGLDREIGDADHGLNMNRGFSKVVEKLPAIADKDIGFILKNTGMTLLSSVGGASGPLFGTFFIRAAQATQARQSLTLEELYQMFRDGADGVISRGKAEPGDKTMCDVWVPVVESLRQSSEQNLSVPVALEAASSIAESAAQSTITMQARKGRASYLGERSIGHQDPGATSVMFMMQMLALAAKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and mechanistic insight into covalent substrate binding by Escherichia coli dihydroxyacetone kinase.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PTS-dependent dihydroxyacetone kinase, dihydroxyacetone-bind
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
84
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| structure length |
211
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| sequence length |
211
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| ec nomenclature |
ec
2.7.1.121: Phosphoenolpyruvate--glycerone phosphotransferase. |
| pdb deposition date | 2010-11-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF02734 | Dak2 | DAK2 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3PNL B; 1UN8 A; 3CR3 A; 2BTD A; 1UN9 A; 4LRZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3S7B A; 4YDE A; 2FO7 A; 4JW1 A; 2NYJ A; 3QKY A; 1N52 A; 1QZ2 A; 3AG1 E; 4ILH B; 1N4S A; 4LEU A; 4UQX A; 4BEP A; 4FLH A; 2YNQ A; 3ZNG A; 4AP2 A; 4BTA A; 4U0Z A; 3ASF A; 3NF1 A; 4DUI A; 4GZD A; 4U8H A; 3KD7 A; 4GZC A; 4UI9 J; 1UN8 A; 3TWT A; 2WMN A; 4UWG A; 1V55 E; 4E85 A; 5CEC B; 3HIZ A; 3R9M A; 1SA5 A; 1ZBP A; 2BTD A; 2X3M A; 2GRN B; 4BET A; 2Y69 E; 3U9W A; 4GB9 A; 3D9O A; 3CHP A; 3HXC A; 5FIN A; 3O4Z A; 3SNX A; 2IOS A; 4ATG A; 2GRM A; 2VJ8 A; 3APC A; 5FQ6 A; 4J6I A; 4RSY A; 1TNU A; 5BXO A; 4YDO A; 1RW2 A; 5BXU A; 4DJA A; 4YDY A; 3D9L A; 4JXT A; 4F1P A; 4DX2 A; 3QAQ A; 4EHM A; 3LKU A; 2WVI A; 3MZL B; 3X2Q E; 3LY9 A; 2CG3 A; 1MZC A; 4B89 A; 5ITZ F; 4CDR A; 4BY6 A; 3AU4 A; 1HE8 A; 3UM2 A; 4HVB A; 3GW4 A; 2AJA A; 3D9H A; 3AJI A; 4GCO A; 1EF1 C; 4I1A A; 1P5Q A; 3QJZ A; 3NQP A; 4GU5 A; 5B3S E; 2VGE A; 3IV0 A; 4GTQ A; 4LCT A; 2AWI A; 3DST A; 3VTY A; 1VDY A; 5LX8 A; 3TWV A; 5KJK A; 2UY1 B; 3OTN A; 3UKU G; 4BTB A; 4K03 A; 3QWP A; 2HR2 A; 2XEH A; 3FEY A; 1XNF A; 1O1T A; 3HHM A; 3UIO C; 4QQI A; 3SBS A; 5G04 J; 4Y6W A; 4ANX A; 5JHB A; 4BX8 A; 4G25 A; 4CRW A; 2WMO A; 3LYA A; 5EDS A; 1MQS A; 3ESL A; 2XS8 A; 2OVB A; 5CMW A; 4N39 A; 5AJD A; 2GW1 A; 2PQR A; 4ANW A; 3FUN A; 1HXI A; 4DI3 A; 1JUQ A; 3ENE A; 1KT1 A; 2AXZ A; 2LAH A; 3VLD A; 3LJN A; 3GZ2 A; 4AEZ C; 3T8M A; 2XZT G; 2H6F A; 3DEO A; 4GZ6 A; 3SI5 A; 4U07 A; 3EHM A; 4CYM D; 2PM6 A; 2YHE A; 2OND A; 2J4D A; 4P29 A; 3UMV A; 1N4Q A; 2XRY A; 4EZK A; 1ELW A; 5AAO A; 4WWN A; 4FJZ A; 2VTB B; 1PC2 A; 5CEA A; 1SVX A; 4LER A; 3CHR A; 4GTP A; 4TXR A; 2DYS E; 4APF A; 3KEA A; 1HF8 A; 3EHN A; 5AJL A; 5KWD A; 2VGX B; 1IYG A; 2ION A; 3L17 A; 3R7Q A; 2VYI A; 4I6J A; 1BU9 A; 5AEN A; 4HOT A; 5C1D A; 5CRU A; 3LEW A; 3DPY A; 2V4H C; 3Q47 B; 3B7S A; 1N94 A; 4BFR A; 1JWG A; 1ZB1 A; 1YYH A; 1N0Q A; 2YHC A; 1UJK A; 1TN7 A; 4XKC A; 3NZU A; 1K8K G; 4FLB A; 2EIL E; 2LUH A; 5AIJ A; 2JAB A; 2NXP A; 4U7E B; 3ASO E; 3CKB A; 3S7J A; 3IKO B; 4HNA D; 4I17 A; 2OVF A; 2P2C P; 3D3M A; 4PDX A; 4CZ2 D; 1FCH A; 1XGW A; 4WNG A; 3DWL G; 3FWV A; 3RU0 A; 3V2O A; 1E96 B; 1HX8 A; 2OEV A; 1NI1 A; 3FH5 A; 2WXR A; 2YQ8 A; 3CQG B; 5FQ7 A; 4BT9 A; 5LOZ A; 2UWJ G; 3UM1 A; 2I1K A; 2WPV A; 5CER B; 4KYO B; 4DK5 A; 4Q94 A; 5ENQ D; 3Q7F A; 2WXK A; 3ZVV A; 4GAA A; 3FU6 A; 4OAU C; 4GTV A; 3CVW A; 1H0A A; 3OXL A; 5FWQ A; 1UW4 B; 3CIA A; 5AQ9 A; 3CHQ A; 4HXI A; 1N4P A; 3I4G A; 5EKQ D; 2ZIR A; 3CK8 A; 5FJY A; 2EIN E; 3RAU A; 4I43 A; 2LXL A; 1X5B A; 3NB2 A; 4EQF A; 3EDT B; 2IU1 A; 1ELK A; 4WNF A; 1Q2Z A; 4J8D A; 2LAI A; 5CBO A; 4GPM A; 3N71 A; 1SQM A; 3MKQ A; 1IHG A; 4C9B B; 3DXK G; 3LPZ A; 3B13 A; 1WAO 1; 2XGM A; 1H6K A; 3GYZ A; 3FTX A; 3MX3 A; 2ZU6 B; 1SZ9 A; 4ME2 A; 4G23 A; 3RRU A; 3FFL A; 2HE0 A; 2ETC A; 3FUJ A; 4HFG A; 4AXH A; 4GTM A; 2GRO B; 4I1O B; 3TJP A; 1H6P A; 1H2V C; 3ZN3 A; 4BT8 A; 4PUC A; 1INZ A; 3F6Q A; 3ZXS A; 1N95 A; 1O1S A; 1U3C A; 1OWN A; 1WM5 A; 1E8Y A; 4CEM A; 3E37 A; 3EHQ A; 3TG5 A; 2WXN A; 2R2L A; 3D9N A; 4DX7 D; 3LXU X; 5ENR D; 3Q9N C; 4MKT A; 1OY3 D; 3MV2 B; 2LSU A; 2LNI A; 2XCC A; 5CRV A; 2MHK A; 1E90 A; 2QFC A; 2B6C A; 3CVP A; 2P9N G; 2IO3 C; 3ZW3 A; 1N4R A; 2WXM A; 3ZUV B; 2WXI A; 5LFA A; 2L6B A; 4B8C B; 2DBA A; 1QBQ A; 3JXJ A; 4KXK B; 4FU3 A; 3L82 A; 3Q5M A; 3NBN B; 2KBX A; 3CK9 A; 5FIO A; 3ONK A; 4J7W A; 3JCK C; 3PVL A; 4CGV A; 1HZ4 A; 5E76 A; 5B1A E; 2VSY A; 1N54 A; 3NAW A; 4XX5 A; 4KBQ A; 2I9C A; 3FUH A; 2MRI A; 1K3Z D; 4AJW A; 4F53 A; 2X6J A; 1NP7 A; 5EX0 A; 3JQ0 A; 3RKV A; 1MX2 A; 4C48 B; 1TNZ A; 2R05 A; 1KZO A; 1FT1 A; 3MEK A; 1SW6 A; 3PS6 A; 4UWL A; 4ILI A; 3QNK A; 2XCB A; 3HXD A; 1TYQ G; 3SF4 A; 2QYJ A; 4HRN A; 4F6R D; 3RSE G; 4U8Y D; 2XZD G; 3NZS A; 3ZPJ A; 3EIJ A; 1K1A A; 3FDH A; 3FUD A; 4XE0 A; 1S0P A; 3ZU7 B; 1HU3 A; 1B89 A; 2P9U G; 3MKR A; 3ABM E; 3MKQ B; 3LVR E; 5G05 J; 2KAT A; 3IXE A; 4CCA A; 3ZXP A; 4KZC A; 2WXP A; 1HFA A; 3MV3 B; 4HOR A; 1TJC A; 1X81 A; 3Q4A B; 4EZL A; 3AG2 E; 3IBE A; 4LRZ A; 2C2L A; 5BNW A; 4FAD A; 5CHE E; 4UWH A; 3EHR A; 4V3I A; 2CHZ A; 3ISM C; 3ULY A; 4L2Y A; 4G26 A; 4YVO A; 2VTB A; 1JPL A; 5EX3 A; 2OV8 A; 1H2T C; 3U4T A; 3IEG A; 3MA5 A; 2BED A; 3CV0 A; 4EBA G; 4JL0 A; 2VGX A; 4U0U A; 3UQ3 A; 3FTY A; 3G2V A; 3BG1 B; 3CSF A; 2RG8 A; 2P9K G; 4DX1 A; 1A5E A; 2WXG A; 4I6E A; 5G2N A; 2P9S G; 3FTU A; 4IUL A; 3UI2 A; 5KNG A; 2H6G A; 4DPR A; 5ANR A; 2F8Y A; 2DCP A; 4GMJ A; 3UKR G; 2R5S A; 5CBN A; 5KJN A; 1OWL A; 3SQV A; 3HVE B; 2ILR A; 4I9E A; 4IRU A; 4ANU A; 3PNL B; 3PE4 A; 3LDZ A; 3JYS A; 4C0E A; 1QNF A; 4MBG A; 3P2B A; 4XZ4 A; 2MYO A; 2J9Q A; 2V5F A; 3ABL E; 1O5M A; 3FUL A; 4JD2 G; 1NFI E; 4U04 A; 4ZFH A; 3L13 A; 5D66 A; 5ENO D; 4MRU A; 3SFY A; 3ZYL A; 3OAW A; 3SO8 A; 1EPU A; 3QB2 A; 4GZ5 A; 4MLP A; 2WM9 A; 1OCR E; 3DPD A; 4HRM B; 4AIF A; 3QK0 A; 3URZ A; 4I9C A; 4N3C A; 1UJJ A; 4XI0 A; 2Y4T A; 2PZI A; 5EIL A; 3UPV A; 4UI9 C; 2HO1 A; 3PUJ A; 2RKK A; 2P9L G; 3Q79 A; 3O48 A; 1UOH A; 3Q49 B; 4E6H A; 3PH0 C; 4WUY A; 4PS7 A; 3QWV A; 4KMO A; 4A1G A; 3JXI A; 3ML8 A; 1RZ4 A; 4L23 A; 5EN5 D; 2BF0 X; 3D9J A; 3IHV A; 4L9P A; 4BWR A; 4UWK A; 3LY8 A; 3FEX A; 2CFZ A; 4EEC A; 3B7B A; 2WQ6 A; 3S7D A; 3KAE A; 3SHF A; 2DZN A; 1WG0 A; 3KS2 A; 2EIJ E; 4GMR A; 4J0U A; 4CT4 A; 1MJ0 A; 3LS8 A; 2FI7 A; 2QY7 A; 4FHK A; 4GA2 A; 2H6H A; 3V79 K; 4XI9 A; 4J8F A; 3KEZ A; 5LCW J; 2IEJ A; 5BW8 C; 3QC1 A; 2LSV A; 3UT7 A; 2I1J A; 3TL5 A; 2VQ2 A; 4C0M A; 1K1B A; 2X6F A; 4F7A A; 3L6A A; 4JA7 A; 5ENN A; 1IQU A; 3S7F A; 1PAQ A; 3FH8 A; 2Y4U A; 4O1O A; 2AXV A; 1DNP A; 3FU0 A; 3CST A; 2BUG A; 2IOL A; 1QQE A; 5HKP A; 3MJW A; 4F3V A; 1OT8 A; 2F8X K; 2WQH A; 2XPI A; 3TWW A; 5T8I A; 3PRE A; 4YVQ C; 4HI8 A; 2IQC A; 2WXF A; 4A63 B; 2Y3A A; 4U95 D; 2OCC E; 4TXP A; 1OWO A; 4TV3 A; 3HXE A; 3ZGQ A; 3RO3 A; 2CFU A; 5G04 C; 3DBS A; 3U66 A; 3LY7 A; 3CQC B; 1NA3 A; 3PZ4 A; 1Z6T A; 5ARF A; 2ZGG A; 3FH7 A; 4EBA A; 5BUZ A; 3K9I A; 3CHM A; 1A17 A; 4N2S A; 3FU3 A; 4B8A A; 3I4R B; 3Q9U C; 1LTX A; 4FP7 A; 3FUM A; 1HO8 A; 2F0Y A; 5D0Q D; 2I2O A; 4M3O A; 4RLY A; 4G11 A; 4HQD A; 4I2Z A; 1H19 A; 3L08 A; 2VSO E; 3OXF A; 5ENS D; 4DRX E; 5KCM A; 4KVO A; 1U3D A; 1U2V G; 4ILG A; 1OCO E; 3CHO A; 3U3W A; 3UT8 A; 3PE3 A; 2DIW A; 1UG3 A; 2QYU A; 2GRQ B; 4XIF A; 2LO6 A; 4ACK A; 3V2X A; 4Z68 A; 1AWC B; 3E4B A; 3UUX A; 1WDY A; 3DSW A; 5M72 A; 5ENT D; 1N0R A; 5FQ8 A; 4NIK A; 1H2U A; 1YMP A; 2XPY A; 3BEE A; 3ULE G; 3HRA A; 3PNT B; 5JHA A; 4I2W A; 3FHE A; 4ANV A; 2Q7F A; 2WXH A; 3ZKJ A; 4K0R A; 5C2Y A; 5BV1 A; 4A3V A; 3R9A B; 2FUL A; 5BPP A; 1TJF A; 3B7U X; 4FJY A; 3CVV A; 3PZD A; 4AY5 A; 4OAV B; 2V4L A; 3G2S A; 5A6C A; 1MYO A; 2C0M A; 2J09 A; 4IYP A; 5EIB E; 4FHJ A; 2RD0 A; 3TWR A; 1L5J A; 3PZ3 A; 3CEQ A; 4GTS A; 3PRZ A; 4KT6 B; 1OXJ A; 1H6O A; 2PL2 A; 4LUN U; 4UQY A; 1AP7 A; 1MX4 A; 2R03 A; 1G3N B; 3QAR A; 4GCN A; 4WNE A; 3FUK A; 3ASD A; 3DRA A; 3CVY A; 4JB8 P; 4TXQ A; 3FUF A; 5AQA A; 2XGS A; 1D9S A; 3AS8 A; 3MCX A; 4HB5 A; 4JC8 A; 4GYW A; 1TR4 A; 3IHY A; 5CCM A; 3ZYQ A; 1DCE A; 3G2T A; 3TXM A; 3I5P A; 5H7P A; 4L7T A; 4FUL A; 3T9K A; 2ETB A; 3D9M A; 4JHR A; 3HVE A; 1SA4 A; 2YIN A; 3PDN A; 4H7X A; 1KLX A; 1LF8 A; 5ANL A; 3WXX A; 3SZ7 A; 3V31 A; 2X6I A; 4LNB A; 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