3PSYA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Inhbitors based on the Gewald reaction: multiple Binding modes in Endothiapepsin
rcsb
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2010-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3psyA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3psyA01
3FNTA 5P13A 4D89A 5P0MA 1B6KA 3K4VC 5JG1A 1W50A 1LS5A 3S53A 3SACA 2PSUA 2QZXA 2WL0A 3C9XA 1E81E 3EBZA 2OHRA 5P2DA 5P4WA 3OQ7A 4TRZA 3EKVA 5P6GA 4Y6MA 1F34A 4CPUA 1BXOA 5P6VA 1B6JA 3OADB 5P6QA 2IS0A 3O9FA 1IBQA 5ISJA 5P4JA 5P0XA 4DQFA 3HW1A 5P5GA 3WB5A 4YA8A 2FDEA 4XKXA 5P0NA 3NSHA 4U8WA 5OZCA 3IVIA 1TCXA 4Y3LA 2QI5A 5P30A 3UQPA 5SY3A 5AH7A 3L5DA 5P1RA 5P1XA 1SGUA 1OD1A 1HEGE 1KJFA 2F8GA 3KA2A 4FLGA 5OZUA 3LZYA 5P37A 2AVMA 5P5SA 1XS7D 3MSJA 1AJVA 1SH9A 4I11A 3QS1A 5P2WA 1HTRB 1W5WA 3L5EA 4Y3TA 5DGUA 3M9FA 5P3QA 4U7QA 5P0CA 5P4HA 1QRPE 1TSQA 1Z1HA 3QRVA 5OYYA 2ZHSA 1Z8CA 5OYVA 3UQRA 3OWNA 1MIQA 5P3VA 5P6AA 4H3IA 2XYFA 1AZ5A 5AHCA 1AVFA 1FIVA 3GGVA 3LZUA 4B0QA 4DJUA 3QRMA 3OY4A 2QNPA 4I0GA 5P6DA 5P27A 5P0HA 2SAMA 1RL8A 2I1AA 3HZCA 2IGYA 3OAGA 1IZEA 2BPWA 1XL5A 1FQ6A 4ER1E 1N49A 3OU4B 1AAQA 5HVPA 2ZHUA 3PWRA 5P84A 4EPJA 1LYWA 3CMSA 3BHEA 5P50A 3NLSA 1K1TA 5P4CA 5F00A 3CIDA 5P2OA 3KT5A 1K2BA 5P1FA 3S2OA 3HVPA 4B1EA 5P0LA 3U7SA 3ECGA 5SY2A 5HD0A 3KYRA 2FDDA 1TSUA 2WEZA 3CYXA 3PI5A 2H6SA 4Y4GA 2QZWA 2PK5A 4I12A 3PMUA 5OZFA 3LZVA 1PROA 2FS4A 4MC9A 2QCIA 1MSNA 3LHGA 1HIVA 4Z4XA 5HTZA 4L1AB 3HD8A 5P3BA 2VIJA 4EJ8A 1FEJC 3Q70A 1LF3A 3NDXA 5OYXA 5P1BA 4YE3A 4HE9A 1ZBGA 5P7FA 3VLAA 4DJWA 3IXOA 2P4JA 1M4HA 2PC0A 5P8JA 1LYAA 2QZKA 3O9EA 3PEPA 4YOAA 3NU5A 5P4ZA 4NPUA 5P0PA 3LPIA 4Q1NA 1BDLA 2V0ZC 3O9GA 3PRSA 3I2LA 1A94A 3VEUA 4NPTA 5EZXA 3G6ZA 3NU4A 5P02A 4KE0A 5P7NA 3IN4A 5P11A 4Y3MA 2P3BB 2APRA 5OZPA 1LYBB 3RVIA 4Z50A 2JXRA 5KQFA 4IVTA 4EHCA 4RLDA 3EKWA 4QJ8A 3H0BA 5P07A 3S43A 3TOHA 4EJLA 3VF5A 4DQHA 4DJQA 5P1WA 4YD7A 4Y3SA 4HVPA 5OZ0A 2R5QA 4B78A 5OZBA 5P0JA 3SA4A 5P51A 2V16C 3UFLA 5HE4A 3VYEA 5HDUA 5P3JA 2AVSA 2IKOA 2R8NA 5IVRA 1HPSA 4QGIA 3BVAA 3LPJA 1T7JA 4NJVA 3IA9A 5P1UA 1BIMA 5OZKA 1ZSRA 3L58A 4ZIPA 1EBKC 3K5GA 2I4DA 5P4DA 4DVFA 4FCOA 3ZKIA 5EZZA 4QJ6A 5P3IA 5P05A 1WKRA 4FRJA 3TPPA 2PMAA 3DK1A 3DV1A 3NU3A 1ZPAA 4DQCA 3QP0A 1RNEA 2VKMA 2AODA 1SMEA 3ZKGA 4QJAA 1EPPE 3GI6A 5KOQA 1KJHA 3O9HA 2WF1A 9HVPA 4RYCA 2R5PA 2ZJLA 2ER7E 5OYUA 1HVKA 2FGVA 1YTGA 4DPFA 5KQZA 2NR6A 3BUGA 1FKNA 5P15A 2G69A 1HRNA 5P5HA 4J1CA 5P16A 3LZSA 1EC2A 3UDYA 2QHZA 5OZQA 1CZIE 3L38A 4Q1XA 5DR3A 1ZSFA 3OQAA 2PWCA 5P7DA 2WF0A 1APTE 3LIYA 4RZ1A 3GGXA 4YBIA 4OC6B 1ZJ7A 2ER6E 5P6UA 4B05A 1ODWA 3B80A 3QPJA 4OBJA 3OADA 5P2RA 5P0QA 1D4JA 4J0VA 1B6MA 5ISKA 1TZSA 5OZ6A 5OZJA 3UDNA 1E82E 4QJ2A 4DQEA 1ODYA 5HE7A 3URLA 4LBTA 4Y4DA 1GVUA 5P08A 2OHSA 4JPEA 1VIKA 2OAHA 3FIVA 3JVWA 5HCOA 3D91A 3O9BA 5P5UA 4YOBA 2I0DA 1QBTA 5P2YA 7HVPA 3IVHA 3VCMA 2HPEA 2ZJKA 3R1GB 5P4AA 3VYFA 5P6NA 1HTFA 5P72A 2FNSA 3SPKA 3DUYA 5OZ7A 5I3WA 2VJ7A 3T7QA 4MC6A 4EJDA 1AJXA 5COOA 4Y5NA 5P89A 2QI1A 1ZTZA 5AH9A 3LIXA 3HAWA 5P8TA 2BKTA 3CYWA 2G26A 5P34A 5P7AA 5AH6A 5P8LA 4DPIA 3D3TA 4J0YA 3TNEA 1NPAA 1FQ7A 2ZJMA 5P81A 5P4YA 2PSVA 5OYZA 2O40A 4M8XA 1QBSA 2IL2A 3PLLA 5P6EA 1HTEA 3EM3A 3ER3E 4Y3YA 3INEA 3S7LA 4Y53A 1GVWA 1LZQA 4AUCA 2CEJA 5P01A 1W5YA 4Y48A 3KF0A 1GVXA 2I4QA 6UPJA 5E5KA 4BFDA 2PQZA 5IE1A 3K5DA 5P3KA 4Y5MA 5JFPA 3GI4A 4YBFA 3OU4A 5KR8A 5P1EA 5P3HA 3SA5A 3Q3TA 4I10A 1T7IA 5P2CA 1KJGA 1IIQA 5P1CA 5P8QA 3OXWA 4QLHA 3UFNA 3OUDB 1EPOE 4S1GA 4FSLA 2NPHA 2IENA 1IDAA 2R9BA 3SM1A 1IVPA 2AOEA 4D83A 3OGQA 5P3TA 2AOJA 5P6LA 5P1PA 2ZDZA 1HXBA 1W6HA 3KFPA 5P0VA 4GJAA 5P6CA 1HVLA 5P7EA 5P2EA 1HVHA 1T6GA 2O4LA 1B11A 2HS2A 4OBGA 2QZLA 1QS8A 3SFCA 5P7CA 5P5AA 3PLDA 1HBVA 4GYEA 5P55A 1BDRA 5AHAA 5F01A 5P2KA 3VV6A 4PYVA 5DQ4A 4RCDA 2P83A 5P7SA 2O4PA 5P8MA 3BVBA 2Q54A 4FM7A 1FMXA 1SIPA 5P09A 2QMPA 1PPKE 5OZOA 5P5YA 3D1XA 1K6VA 1HPOA 4D8CA 4Y4JA 4MC2A 2NXMA 3WZ7A 4D85A 2V12C 3OTYA 3NXEA 2P3BA 1FQXA 1LYBA 1Q9PA 4GJ5A 4APRE 5P2BA 3T7XA 3WZ8A 3NWXA 5P2QA 4Y38A 1FLHA 4J1KA 4A6BA 5AH8A 4YCYA 3DV5A 2QMFA 4ZSPA 3INHA 2ZYEA 3OU1B 5P1IA 2QAKA 1TW7A 2O4NA 2ZJIA 5P5FA 2IKUA 2RMPA 1C6XA 2G27A 5OYSA 5P7GA 1EBWA 3SQFA 3GI5A 3QBHA 1MT9A 4Y4TA 2V11C 2ASIA 2G21A 1MVPA 5P8PA 5P3XA 5P8SA 5HE5A 1UH7A 2I4XA 3SO9A 3SA9A 1EPNE 5P4TA 5COKA 3OXVA 4A6CA 2JJIA 1E80E 4MC1A 5P3PA 5P4NA 1YT9A 3OQFA 5OYRA 4Y5PA 3S8IA 4DI2A 3ZL7A 3QAAA 4OBFA 2B60A 1ZP8A 4J17A 5OZNA 5SXNA 4EXGA 2PSGA 3OHFA 2G20A 5P0YA 5P38A 4OBZA 5P80A 2VS2A 1HPXA 2QI4A 1XDHA 5P61A 8HVPA 4Y41A 2AZCA 5P20A 5P23A 4L7JA 5P1NA 4RGHA 5P1QA 5P2JA 2NTRA 5P5CA 1MESA 2EWYA 4B1CA 4LHHA 3PWMA 1WBKA 1ZLFA 4Y3WA 5P63A 5P8KA 4A4QA 4H3JA 4OC6A 3F9QA 3IAWA 3DM6A 4I8WA 3PSUA 2FNTA 5KR1A 4HDFA 2AVVA 3KDDA 5P8VA 3NDTA 3EL1A 3U71A 3APPA 2Q15A 2Z4OA 2QI7A 4LXAA 3ZPTA 4Y5BA 4Y5LA 2IDWA 5P5KA 5P40A 3EL9A 1ENTE 4FL8A 2IQGA 5OZXA 4JP9A 1IVQA 4Y3FA 4NJUA 3VG1A 3VF3A 4J1IA 2P3CA 4XX4A 3OOTA 4H3FA 4J55A 4APEA 2HAHA 4DJOA 2QP8A 1T3RA 2Q64A 5ER2E 5P3OA 3VSXA 5P45A 3EL5A 5DQ2A 2QD8A 5OZHA 3O9AA 3H5BA 2BPZA 5PEPA 4HLAA 3TH9A 2I0AA 5P5XA 1EC1A 4ACXA 3OQDA 1QBUA 4F74A 4H3GA 3RSXA 5P4BA 5E5JA 1FB7A 2VJ6A 1D4SA 5P42A 2G1SA 3BXRA 2BPXA 5KQYA 3QVCA 4FRKA 5P1ZA 1RPIA 5P3WA 4KB9A 5P32A 2HB3A 5DR7A 2AVQA 3I6OA 3TPRA 1AIDA 5KR2A 3LINA 1XN3A 5OZ3A 1OHRA 3D1YA 4GJBA 3IGBA 5OZAA 2IEOA 2BJUA 5P4EA 4I0FA 2WF4A 3RU1A 4ZSQA 5P7LA 1FQ4A 4R95A 5P8UA 3T11A 4JPCA 1FGCC 4I0JA 2PYNA 1META 3KFSA 1PFZA 4Y5AA 2I4WA 3OUDA 5BS4A 1PPME 1GNMA 1W6IA 4EQJA 3O9LB 5C9BA 3UDPA 1ZAPA 4WTUA 5OZRA 3ZKSA 5P64A 2G1RA 5P3CA 1BDQA 1LF2A 2ZHTA 1XL2A 3R4BA 4CP7A 1FFIC 1K6CA 2QHYA 5P4MA 5P2VA 4Y3XA 4ZPFA 4I0EA 4GJ8A 3MWSA 4N00A 3HVGA 5P25A 3BGCA 2AQUA 5P79A 5P2GA 5P86A 1DIFA 5P10A 5P4QA 5P47A 4ZLSA 4FM6A 5P7BA 5P29A 2BPVA 4RYGA 5P65A 4CPXA 3OXXA 5P46A 3BUHA 5P6IA 3OUAA 3SKGA 2J9JB 2QI6A 1DMPA 5OZDA 3NUOA 4KE1A 4GZFA 4DV9A 4CMSA 3URIA 1C70A 1XN2A 5P75A 5P0OA 4I0HA 5ER1E 1HIIA 5P6WA 5KR0A 2IGXA 5P1KA 1TQFA 3UQUA 2F3EA 3TTPA 3MSLA 3ZKMA 2B42A 2AVOA 1EC3A 2NNKA 5OYWA 2G1YA 3QRSA 4B1DA 5P5DA 1BWBA 4R8YA 2G24A 5P56A 2A4FA 5P1AA 2G94A 5OZ9A 1YX9A 2VIYA 2HPFA 3OU1A 4NJTA 5OZEA 2BKSA 3R2FA 5P6RA 4Y4AA 5P5RA 2I4VA 5P4PA 4D88A 4DQBA 4I1CA 3L59A 3I8WA 3SA7A 4LP9A 1DW6C 3EL0A 4Q5MA 4YD4A 1EEDP 5P67A 3NUJA 3RTHA 3FKTA 1HXWA 1MTBA 4ZSRA 4YCTA 1K6PA 5TOLA 4Y47A 5I70A 1BAIA 1EPLE 5C9DA 5DR0A 1XE6A 5KOSA 5P0DA 2Q63A 3VFBA 3MXDA 2QD7A 2H6TA 3KDCA 1G6LA 4HDPA 1VIJA 3IN3A 4DJYA 2P8HA 4F76A 1D4IA 3GGUA 4B77A 4GJ7A 1D4KA 3O9IA 5I3XA 4DQGA 2Q55A 5P48A 4OBKA 4K4PA 4LL3A 5CLMA 5P3AA 5P7VA 1FFFC 2RKGA 3K5FA 3EC0A 4FIVA 3L5CA 1YTIA 1MSMA 3L5FA 5P1JA 2XYEA 2BQVA 5P7KA 3KN0A 2AOGA 1T7KA 5P7XA 4EQ0A 5I3YA 1SP5A 1M0BA 1HTGA 5BRYA 1FG6C 1MT8A 5P2SA 5P2IA 3PJ6A 3N3IA 4Y3PA 5P4LA 1HVSA 1DP5A 3APRE 5OZZA 3S56A 3OUCA 5P6MA 1A9MA 2IRZA 3VV8A 1DPJA 1KJ7A 5P66A 3QIHA 3SAAA 2I4UA 4Y39A 3TL9A 2ZE1A 4X2LA 2UPJA 5AGZA 1C6ZA 4QJ7A 4RCFA 2WJOA 4TRYA 4JOOA 3TKWA 3IXKA 1K2CA 1SIVA 5OZWA 1QBRA 5DQ5A 3JW2A 1LYWB 2VNMA 3ZPUA 3SA8A 1SDTA 3BUFA 4LXMA 5P49A 3LIZA 3HBOA 5P2LA 5P7IA 2HIZA 3EMYA 3ZLQA 4J1EA 3TPJA 5P5LA 5P4KA 3T3CA 5P03A 2JE4A 4TRWA 3ZKNA 3WB4A 1B6PA 5P3SA 3DCRA 3UTLA 1MTRA 4I0ZA 5P3YA 3PI0A 2OF0A 5OZ5A 1IZIA 4Y50A 6APRE 5P3EA 1MT7A 2FGUA 3LIQA 2NMYA 1K1UA 5P0BA 3EKQA 5P69A 1BV7A 2UY0A 4L1AA 5P3UA 3CKRA 5P7JA 3WZ6A 4WY1A 4E43A 2PWRA 3QVIA 3HDKA 5P8IA 2VA6A 1W51A 5P0EA 2FIVA 2V00A 2VA7A 5P2HA 5P04A 3UDMA 1HIHA 1EPRE 4CPWA 3KFNA 3VLBA 5P2AA 5ENKA 1HOSA 4KUPA 2OHMA 2FXEA 5P78A 5P2TA 3O9LA 4HDBA 1YG9A 4J1HA 4ZSMA 3BXSA 4Y4XA 3EL4A 3URJA 1TCWA 1JLDA 1A8KA 4Y3QA 3S43B 4QJ9A 5P76A 3PVKA 5P7HA 3LPKA 4XXSA 5P1SA 5P88A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FNT A;  5P13 A;  4D89 A;  5P0M A;  1B6K A;  3K4V C;  5JG1 A;  1W50 A;  1LS5 A;  3S53 A;  3SAC A;  2PSU A;  2QZX A;  2WL0 A;  3C9X A;  1E81 E;  3EBZ A;  2OHR A;  5P2D A;  5P4W A;  3OQ7 A;  4TRZ A;  3EKV A;  5P6G A;  4Y6M A;  1F34 A;  4CPU A;  1BXO A;  5P6V A;  1B6J A;  3OAD B;  5P6Q A;  2IS0 A;  3O9F A;  1IBQ A;  5ISJ A;  5P4J A;  5P0X A;  4DQF A;  3HW1 A;  5P5G A;  3WB5 A;  4YA8 A;  2FDE A;  4XKX A;  5P0N A;  3NSH A;  4U8W A;  5OZC A;  3IVI A;  1TCX A;  4Y3L A;  2QI5 A;  5P30 A;  3UQP A;  5SY3 A;  5AH7 A;  3L5D A;  5P1R A;  5P1X A;  1SGU A;  1OD1 A;  1HEG E;  1KJF A;  2F8G A;  3KA2 A;  4FLG A;  5OZU A;  3LZY A;  5P37 A;  2AVM A;  5P5S A;  1XS7 D;  3MSJ A;  1AJV A;  1SH9 A;  4I11 A;  3QS1 A;  5P2W A;  1HTR B;  1W5W A;  3L5E A;  4Y3T A;  5DGU A;  3M9F A;  5P3Q A;  4U7Q A;  5P0C A;  5P4H A;  1QRP E;  1TSQ A;  1Z1H A;  3QRV A;  5OYY A;  2ZHS A;  1Z8C A;  5OYV A;  3UQR A;  3OWN A;  1MIQ A;  5P3V A;  5P6A A;  4H3I A;  2XYF A;  1AZ5 A;  5AHC A;  1AVF A;  1FIV A;  3GGV A;  3LZU A;  4B0Q A;  4DJU A;  3QRM A;  3OY4 A;  2QNP A;  4I0G A;  5P6D A;  5P27 A;  5P0H A;  2SAM A;  1RL8 A;  2I1A A;  3HZC A;  2IGY A;  3OAG A;  1IZE A;  2BPW A;  1XL5 A;  1FQ6 A;  4ER1 E;  1N49 A;  3OU4 B;  1AAQ A;  5HVP A;  2ZHU A;  3PWR A;  5P84 A;  4EPJ A;  1LYW A;  3CMS A;  3BHE A;  5P50 A;  3NLS A;  1K1T A;  5P4C A;  5F00 A;  3CID A;  5P2O A;  3KT5 A;  1K2B A;  5P1F A;  3S2O A;  3HVP A;  4B1E A;  5P0L A;  3U7S A;  3ECG A;  5SY2 A;  5HD0 A;  3KYR A;  2FDD A;  1TSU A;  2WEZ A;  3CYX A;  3PI5 A;  2H6S A;  4Y4G A;  2QZW A;  2PK5 A;  4I12 A;  3PMU A;  5OZF A;  3LZV A;  1PRO A;  2FS4 A;  4MC9 A;  2QCI A;  1MSN A;  3LHG A;  1HIV A;  4Z4X A;  5HTZ A;  4L1A B;  3HD8 A;  5P3B A;  2VIJ A;  4EJ8 A;  1FEJ C;  3Q70 A;  1LF3 A;  3NDX A;  5OYX A;  5P1B A;  4YE3 A;  4HE9 A;  1ZBG A;  5P7F A;  3VLA A;  4DJW A;  3IXO A;  2P4J A;  1M4H A;  2PC0 A;  5P8J A;  1LYA A;  2QZK A;  3O9E A;  3PEP A;  4YOA A;  3NU5 A;  5P4Z A;  4NPU A;  5P0P A;  3LPI A;  4Q1N A;  1BDL A;  2V0Z C;  3O9G A;  3PRS A;  3I2L A;  1A94 A;  3VEU A;  4NPT A;  5EZX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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