3PUZE

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puzE01
4KFQA 1TFDA 1TT1A 2ONRA 1B1XA 5I2KB 4EQBA 2OZZA 4DIGA 4U1OA 4JWOA 1MDQA 1MY3A 1URDA 3IB0A 4NF5A 4M1VA 2R71A 2XXHA 4BDMA 4Z7EA 4MLVA 1AIVA 3C35A 4OXVA 1FTJA 4QF9A 4GOTA 3C34A 1GVCA 3H6WA 4H8IA 4IO3A 4RJZA 3A3UA 1N76A 3A3CA 4FEDA 4OFOA 1P1WA 3N26A 3EHTA 4G8MA 4RPOA 3VLUA 2DE4A 3K4UA 5H8NB 4BDOA 3RY3A 3U72A 1B3LA 1JW5A 2HQ0A 2X7PA 2Z8FA 2H25A 3CFXA 3K2DA 4FJPA 1LFGA 3SERA 2QMWA 1MXYA 2ZNTA 2XXTA 3ONMA 3I5OA 3ZKLA 4FATA 1QULA 3Q27A 3GXAA 1IXGA 5DT6A 3C33A 3MP6A 5J1DA 4G8HA 3MBPA 3IORA 1ZJLA 3RQTA 3IK6B 4FECA 2PMSA 1FQAA 4JXIA 2QS3A 4R72A 4C1TA 3HHGA 1OMPA 3K6WA 4NF5B 3CG1A 3FIRA 2O69A 2FA7A 4R9GA 5KCJA 2H4IA 3C9HA 3ZSFA 5AA2A 2AL5A 3V5AA 3OSRA 2HZLA 1MQJA 2WKYA 3FVKA 4G4PA 3TMGA 1MQIA 4RY1A 3GBAA 3I3VA 2PBWA 3FUZA 5IKBA 4YZZA 3PMVA 4KI0E 4P0IA 3G3JA 4JWXA 1A40A 1MY1A 1MPCA 3IB2A 3MAMA 1FCKA 2OCUA 1S50A 3VXCA 2D21A 2ZYMA 3S9EA 3EQ1A 1DPEA 4QSDA 4WXJA 3FXRA 3MVZA 3MVXA 2AYSA 2UXAA 1EH3A 1QVSA 1PC3A 1MG1A 1FW0A 2DSFA 1NKXA 3FV1A 4KYDA 3CFLA 4LZ7A 3CG3A 3ZKKA 2B65A 2I3VA 4NE4A 3G7WA 3TQWA 4FAJA 1JW4A 5H8HB 5KCJB 3K01A 3LC8A 4YKIA 3S9NC 3CI8A 4IO6A 2I48A 3ILTB 4C1UA 3KBRA 4GVOA 5AA2B 3SEYA 3TTLA 2E0SA 4H65A 3LSLA 3B6TA 4YICA 5CMBA 3L6GA 3MWBA 2OWTA 3H6VA 1EZPA 1O64A 4ZEIA 4NEDA 4U22A 5ICTA 3O6IA 1VR5A 3IOVA 4ELRA 1N04A 1B3GA 5ICQA 1VFEA 3O28A 3E13X 1AMFA 2XXYA 2A5TA 2O7IA 1A8EA 1P1NA 3T9UA 2QJEA 1OLCA 1HSLA 1F9BA 1Y3NA 1OVTA 2V3QA 1JEVA 4E0WA 2AL4A 4GIZA 1B1HA 4F39A 1D9YA 3F11A 2UYEA 4KQPA 3N5LA 4F19A 2Z8DA 5I56A 4YMAA 2Z22A 4GXSB 2UVJA 2AIXA 1IEJA 2H5YA 3TTMA 1MQHA 2RKMA 2BJJX 3OO9A 3G3HA 3PMWA 5CBRA 3IJOB 3KJ7A 4UACA 3PPNA 1POTA 4G77A 5TPAA 1R9LA 4Z0IA 4NWDA 3RTFB 3V83A 3JV9A 3VVEA 5I2NA 3USDA 4GLIA 3LSWA 4FORA 1YAEA 1MPDA 3FXUA 4GL8A 3OEMA 3HSTA 1LFHA 1OQHA 1H3DA 1MM7A 2A5TB 4I1DA 4THIA 2LAOA 1TXFA 1MQGA 2QMXA 1D9VA 2QS2A 3ECRA 1QUJA 3G3IA 3IR1A 4H67A 5M2VA 3N6TA 5KZTA 4HTGA 1PB7A 3PPPA 4ZE9A 3MZ9A 1OIBA 4F31B 4NF8A 2GHBA 5DTBA 1Y9UA 4O3BA 5I56B 3KG2A 4QFLA 4POXA 3M3LA 1ZIUA 4KHZE 1SBPA 5H8SA 3FVOA 3VDFA 3GZGA 2O51A 4IO2A 3VV5A 4DCXA 1B4HA 5TPAB 3RLFE 3S9LC 4QFPA 1FQCA 3OO8A 3QK6A 3H6UA 1VFDA 4PP0A 4IO7A 4KCDA 2X26A 3MPLA 2B3BA 1PEBA 2V93A 4IGRA 1GV8A 2UYFA 5I2NB 1II5A 4I8CA 1O63A 4X1BA 3RUMA 2R9JA 5CBSA 1P1QA 4X1DA 1XHYA 3U92A 2F35A 2IEEA 4IY5A 4U4XA 4OENA 3O6HA 3CFZA 1TFAA 4ELOA 3TCHA 2QRYA 3G3GA 5I84A 3V8XB 3HN0A 4FE8A 1R1NA 4H5FA 3UGWA 2V3UA 3IOTA 3EHUA 3KSXA 4R2FA 1IZ1A 4U21A 2DXYA 3HPIA 4OQOA 3B6WA 4HS7A 4EXKA 4GWOA 2UVHA 4ZEBA 3S9MC 3RTWB 1LAHE 3THIA 3K1NA 3U8QA 3KZGA 4IO5A 1UTHB 4U4SA 3BFUA 1EZOA 2DQVA 1IUDA 3TKDA 3OEKA 1US5A 1US4A 4RYAA 3CVGA 1B5IA 1LAGE 3FATA 3IOWA 3PMXA 1B5HA 4LP2B 5CRYA 2DWHA 3IOUA 3MUQA 4X48A 4JBZA 4ZEFA 4GF8A 1AOVA 4POWA 1ELJA 2I0CA 3Q28A 1ZU0A 4PFUA 2YPNA 4BDLA 4DXBA 2Y7KA 2DVZA 3A09A 3KEIA 3N94A 1M5CA 1QKBA 2QPQA 3FZVA 5ITPA 3HV1A 1Q1KA 2VGQA 3C31A 4PETA 3ILUB 2W7YA 3SKPA 4YKKA 4G68C 1N0TA 1B3FA 4LQ5A 3VFJA 1RYXA 3M3KA 1SW2A 3RT6B 4OVJA 3T22A 4ELPA 3O66A 3W9WA 1SW5A 2RF1A 2XXWA 1NMUA 4YB6A 4EUOA 3K6VA 1XVYA 1Y20A 1URSA 4JWYA 2YLNA 3SDFA 2ZXTA 4WKMA 3FASA 2XXRA 2V3TA 2VP1A 1PB9A 4YAHX 4RXLA 4ECFA 4M4GA 4EDPA 3K00A 1FQFA 4XKPA 1IIWA 1MQDA 5AA4A 4KR5A 1GR2A 4RA1A 3PPRA 1DOTA 2FYIA 3QAXA 1FQBA 1XT8A 4ND9A 3FJMA 2A5SA 3KN3A 3EN3A 3OO7A 4IY6A 1OLAA 3AXFA 1LAXA 5CM6A 4AB5A 4QSCA 4PFTA 3V89B 4JSOA 1QW0A 3SEXA 5EYFA 2F6PA 3T96B 1EU8A 1POY1 4ISUA 2UVIA 4P0GA 1B7ZA 4ONYA 2HZKA 3CSBA 3TCFA 2DE3A 4XIGQ 3QIMA 3H03A 4KD5A 3B7DA 1ZKBA 5K2YA 4N13A 2HEUA 1NNTA 4JSDA 2HFBA 3SEUA 4MBPA 1LB8A 2D3IA 3OXNA 2B3FA 3TTKA 1IXIA 3TQLA 2F97A 3OSQA 2HAVA 5AA4B 1Z7ME 1B5JA 4NF6A 4HCYA 5BUUA 5EHSA 2Y84A 1MY4A 3G3FA 3BKIB 4EF1A 2O1LA 5B70A 3KSJA 2RINA 3IO6A 3KFMA 1Y1MA 1PBPA 5H8FA 3RPWA 3E3KA 4OZ9A 2ALUA 3KN8A 3TELA 3RT8A 3MPKA 4OFJA 1MDP1 1A55A 3H4ZA 3PD8A 3TCGA 4H1XA 3OD7A 4F1YA 1SDXA 4O3CA 4YB7A 1MXWA 2ZNUA 1PB8A 2YJPA 1GTKA 4GQOA 1B40A 1SQYA 3K1MA 1LSTA 4EF2A 3PV0E 1Y1ZA 3DELB 2O68A 4RK2A 3VVFA 4DXUA 1A54A 5FTHA 2PX1A 4ZZEA 4DDDA 2QSXA 4OERA 4NF6B 2ZYKA 5HBCA 1S9TA 4OTEA 1LAFE 2F7AA 1B32A 2F78A 5CMMA 4EQ9A 4NF4A 4BDQA 3OELA 2F7BA 1XS5A 3VLWA 2P1SA 5F1QA 5A5XA 4E0XA 1MRPA 1QKAA 2PT2A 2F8DA 5H8FB 3C36A 1B3EA 1M5FA 4YMBA 1XOCA 3IB1A 4QRZA 1LB9A 1B7UA 4F3GA 1N7WA 2DS9A 4Q5TA 2DP8A 3TPAA 3O29A 3PGFA 2NOOA 2XXPA 1SW1A 1JEUA 4O3AA 1CB6A 1H76A 4JB7A 1UQWA 3TUSA 4KPTA 4R6HA 1NH7A 1Y3QA 3Q25A 2ZYNA 3K6UA 1MY2A 1ZBMA 5AA1A 4OMBA 2O6AA 3PPQA 3SESA 2GRVA 4N6PA 2P2AA 4LQ2A 1ANFA 1B58A 3D4GA 2Y7PA 2QS1A 3K6XA 3PUVE 3UIFA 1USYH 3BBRA 1O7TA 2DOJA 5EHMA 4DE8A 3E4RA 3TAJA 3R26A 4LA9A 5I59A 4F3PA 1FQEA 4NF4B 1DSNA 2ZNSA 3MQ9A 3FVGA 5A5XB 2H9BA 5FHNA 5IAIA 2Y7IA 5TP9A 5LOMA 1ZMGA 2UVGA 3UA8A 1P1OA 1JW1A 4MF3A 4OWDA 3QUJA 1LLSA 4F1VA 2PT1A 1NNPA 5L9SA 2ONKE 2H98A 3M8UA 1B0LA 1URGA 1IXCA 4EQ7A 1HSEA 3L6HA 1MPBA 2NWJA 1D3KA 3LUYA 2Q9TA 3DP4A 3OO6A 1MM6A 1Y3PA 3K1PA 3PD9A 4R73A 2PVUA 1MXXA 4F1UA 4RPNA 2RC9A 4LONB 1MH3A 5CMKA 4NF8B 2XD3A 3ZS6A 5I59B 3TTNA 2H99A 1SW4A 3FJGA 1NH8A 4QSEA 3DP6A 1M5EA 5F7VA 2Q88A 1WDNA 1JVYA 5DYHA 1Z7NE 2O7UA 2I3WA 3CSGA 1A99A 1SD3A 5TP9B 2G93A 3MVWA 2RCBA 3VLVA 1LCFA 4DCYA 1R6ZA 5FHOA 1D4NA 3O6GA 3CRBA 4R9FA 2RC8A 2RC7A 1B7HA 1MS7A 1H44A 2I6EA 3EHSA 3I6VA 3UN6A 3W15C 3VVDA 4IGTA 3T9HB 1B0HA 2QS4A 1LFIA 3FV2A 4BDRA 2ABHA 3DP8A 1N84A 3PPOA 5DVIA 1N3XA 3W9VA 5HPQA 1M5DA 1N7XA 3CIJA 4LZ8A 2DXRA 1OVBA 3WAEA 1T0KA 2ZMBA 4WEDA 3TTRA 4H6DA 4ZE8A 5B7DA 3RGYA 1MXUA 3R7XA 3U94A 4Q0CA 4AB6A 1Y4CA 3GLBA 5CMCA 2OBGA 1Y4TA 3K02A 4P11A 3O9PA 2I58A 2XXIA 4ZEKA 4EXLA 3MP8A 4TLLB 4LUBA 1UIVA 2OJTA 2HCAA 3IAZA 1B51A 1J1NA 4N07A 4TLMB 3MZBA 2VD2A 1CE2A 3MC2A 3H3GA 3KJTA 3FXQA 1B6HA 3DM0A 1DMBA 2Z23A 4QFNA 1N3WA 4GL0A 1NNKA 4R74A 5I58A 2OLBA 4YB5A 3QYTA 4NWCA 4RK9A 2I0BA 2VD3A 1B3HA 3O97A 1FTOA 4L17A 1IITA 3TEPA 5KDTA 1PBQA 1ZLQA 4FIMA 1DPPA 2VHAA 1DTZA 4F22A 1JETA 2D5WA 1XVXA 1LCTA 2DYXA 1P1UA 5JEIA 3G3KA 1MY0A 1ZTYA 5AA3A 4OETA 4GRKA 3UP9A 1B46A 4QFKA 3C32A 1MXZA 3LBSA 1I6AA 4BLAA 3TZAA 5H8HA 5BWJA 4PQJA 2F6GA 4IB2A 3M3FA 2CMOA 3LSXA 3IL1B 5ELVA 1MXVA 5K2XA 2XXVA 4G68A 1BIYA 5I58B 2ESNA 1LGBC 5HM4B 1VE4A 1IQ7A 2IA4A 2P0SA 1LBCA 4XKRA 1B05A 1GGGA 3R6UA 3KN7A 4HW8A 5KDTB 4TOZA 1BP5A 1SVXB 2O84X 3PUZE 3HHFA 3TFLA 1ATGA 4H8JA 4TQUQ 2VOZA 4ELQA 3HO7A 3IO4A 3SETA 2XXXA 2Y7WA 3FJ7A 4MLQA 4OEUA 3OOAA 1BTJA 1LBBA 3VXBA 3TODA 3FVNA 2G29A 4ESWA 1NNFA 3PUYE 3H06B 4XKNA 4I9DA 3QXMA 1YTVA 3OENA 3JZJA 1MH4A 4WEPA 3P7IA 2F36A 3Q29A 2XX7A 1L5TA 4QHQA 3PUWE 5AA2D 2XD2A 4JDFA 1KWHA 2XX8A 5ISUA 4F2QA 2CZLA 4YKPA 3LR1A 2F7CA 4GXAA 4G68B 2DWAA 4QFOA 3K0VA 2V84A 4H5GA 2I49A 3MP1A 3T9VA 2F5XA 3D4CA 4NTLA 1JNFA 4PFWA 3RN8A 3ODBA 3T93B 1AL3A 4XKQA 2ONSA 1HSJA 4F29A 3EF7A 1AH5A 2OWSA 4LZ5A 4G2ZA 2O1MA 1B52A 3TDJA 2X7QA 3OMBA 2Q2CA 4OEVA 1B2HA 3HCQA 4XXUA 3MVYA 1NFTA 3WAFA 1PDAA 5L9MA 3LSFB 3DLNA 4ZDMA 2Y7RA 4U1ZA 3MW0A 1USYE 3B6QA 3CR9A 4U23A 3H6TA 4R75A 3VE1B 4K3FA 4NMYA 5JTYA 4F3BA 4XTCQ 1XC1A 1DTGA 1A7LA 2REGA 2XX9A 2Q2AA 2DE2A 1WVJA 5L8DA 5DEXA 3FD3A 3H7MA 1VSOA 4R6KA 3PU5A 1H45A 1S7YA 2THIA 1RKMA 3QUFA 1WODA 1OQGA 2ANJA 3JYRA 1FTMA 4IO4A 1B4ZA 2KLFA 1YCJA 3C4MA 1SI0A 3KOTA 5DVFA 3UORA 2ZYOA 5CC2A 4ZS9A 4PFYA 1QUKA 1UTBA 4YKJA 3KOSA 3QSLA 3RNNA 2E1SA 2NUVA 1A8FA 5JK4A 4HCWA 3T9XB 5FHMA 4DZ1A 4DXCA 4C0RA 2XHDA 5FTIA 5ITOA 4RNSA 4U2RA 5CI5A 2HAUA 2DWIA 5DVJA 5TU0A 2GFEA 5I57A 5JTYB 3SEVA 2FNCA 5DEXB 4F18A 3S4UA 3Q26A 4F3SA 2Z8EA 5AE4A 2NVUB 1TWYA 2PYYA 2DVCA 4GFRA 3BFTA 1R9QA 2F34A 2XXQA 1QJMA 2QL3A 1UTHA 4YU0A 2V25A 4OESA 4UA8A 1NL5A 2GH9A 1M5BA 3FGSA 1IXHA 2I4BA 3KGCA 4MFIA 4F2OA 2Q8JA 2HXWA 1UTBB 3U1OA 4G8NA 1BLFA 4PE5B 5H8QA 2Q89A 1FTLA 1SI1A 4KCCA 4OFLA 4ZEDA 3IJXB 1JQFA 3O2AA 4MH5A 3S2VA 1UIUA 4AQ4A 1B9JA 2NXOA 5I2KA 5L9OA 2GHAA 4I62A 4H0WA 2OK2A 5I57B 2XXUA 2M8CA 1FTKA 3TYHA 4FEBA 1QUIA 4OHNA 1I69A 1P99A 3E9XA 4LVQA 4ZZAA 3N6UA 1I6QA 1RYOA 3MJNA 4KYEA 3EPEA 4ZECA 2REJA 4KYSA 4OYVA 4DLDA 2R6GE 4GD5A 3UK4A 3GBBA 4Q30B 1SYIA 1EZ9A 5H8NA 3T66A 1I6BA 4X9TA 3MZ1A 1JVXA 2DWJA 4Q8RA 1YPNA 1Q35A 1SYHA 1BKAA 1FQDA 2I4CA 4ESXA 3U93A 4BDNA 1H43A 3PUXE 4R6YA 2RCAA 4LATA 5H8QB 3IX1A 4R2BA 3SEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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