3PVGA

Crystal structure of z. mays ck2 alpha subunit in complex with the inhibitor 4,5,6,7-tetrabromo-1-carboxymethylbenzimidazole (k68)
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
327
structure length
326
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Zea mays
publication title ATP site-directed inhibitors of protein kinase CK2: an update.
pubmed rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 113
structure length 326
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pvgA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pvgA02
4NW6A 3RPYA 2UZVA 3BYSA 4BZOA 2NRYA 3A7IA 4I23A 4WRSA 3VUKA 5JN2A 3UO5A 2C6IA 1PY5A 4IX4A 4TKSA 4BDBA 2UW9A 4EOQA 3FI3A 4FKPA 5FWKK 5HKMA 4AFEA 4FOCA 4KD1A 4ANBA 3LFEA 4I94A 2BFYA 4W4VA 3F2AA 3Q4CA 4TPTA 4NW5A 2VWBA 2WQOA 4FA2A 2HENA 3C1XA 3SXRA 4DF3A 1H1SA 3NUUA 3HUCA 5IDPA 1ZZ2A 4TZRA 4G3EA 4KABA 3RWQA 4I92A 2VTIA 3UVPA 2WMBA 4IX3A 4ZTHA 5LVNA 1RDQE 3KY2A 1H8FA 2JKQA 2EB3A 4GK3A 3V6SA 1PKDA 3ATSA 3B2TA 1QCFA 3FC1X 3OWLA 3NEWA 1ZYSA 3TV4A 5K5NA 2UW7A 1PRYA 4BBMA 4CG8A 2E2BA 1H00A 5CEPA 4EK6A 4QMWA 4KKGA 3LMIA 3DFCB 3FKOA 4RFYA 4O96A 3UGCA 2GNJA 3ZTXA 2QO9A 4HCVA 1OZ1A 4TL0A 4EHZA 5CSXA 2J7TA 4JG6A 4U81A 1PJKA 4F9WA 3ZDIA 4E6DA 5HIBA 5IEVA 1UV5A 3FI2A 4NSTA 4GUBA 1IAJA 4U8ZA 4KAOA 5KCVA 3BV2A 3TKHA 4DT8A 2W0JA 3EKKA 2XBAA 3TEIA 3HDNA 2C0IA 3R7IA 3TNWA 3V04A 4PPCA 4R78A 2HY81 3PG3A 4F09A 2OK1A 3Q4TA 4EH2A 2ERZE 3ZU7A 5M44A 5LCJA 4O7LA 1B38A 3HKOA 3GI3A 5B2MA 5I3RA 5AFVA 2JDTA 3LFNA 4FNWA 2W5BA 4DTKA 4O0XA 2H34A 4FV2A 1YXXA 1YKRA 4IJ9A 5GJFA 3TZMA 3AMAA 1Y57A 4ZSJA 2J51A 4UZHA 2J0IA 3PRIA 4I5MA 4BHNA 1IASA 4USEA 5IA4A 2HZ4A 2JKKA 1PMEA 3NSZA 4HGSA 4DFLA 5BYZA 4RX8A 5ICPA 3QGYA 5EQEA 4FKUA 3REPA 3PA3A 2BPMA 3FWQA 3B8QA 5CALA 1Q3WA 4ANMA 1CKJA 2X6EA 4FKVA 3W16A 5J9YA 1YDRE 2YCFA 5KMMA 4DGLC 5FXSA 1G8AA 5ACBC 2PVNA 3BE9A 2C6OA 3UC4A 1FMKA 1P5EA 3EN5A 1BL6A 2I1MA 2CLQA 1URWA 2JLDA 3MVLA 3QQGA 2P2HA 4V0GB 5AP7A 5F95A 5M07A 3CC6A 2W4OA 4K2RA 1YDTE 4GIHA 5JGDA 1YHWA 4YU2A 4O7YA 4EUTA 1CDKA 3VRZA 4GK2A 4YLJA 3ATTA 3U55A 2R3GA 3RP9A 2WGJA 3CPBA 3MJ1A 2GPHA 3MN3A 3RWPA 4O7RA 3AD6A 4QP1A 5HX6A 3FPQA 3BX5A 4BTMA 3FXWA 4PMMA 4U3YA 2C4GA 4YBJA 5DRDA 4NFNA 3VULA 5HE1A 4FVPA 4CZYB 1Z9XA 5DR9A 4D9UA 3NWWA 4FSNA 5F20A 2UZLA 4EKKA 2WD1A 5JKGA 4D5HA 1FPUA 3BLHA 3KFAA 4M12A 4W4YA 3TN8A 2R3KA 3ORKA 4RWIA 3VJOA 3GGFA 2WMXA 3LCTA 5I9XA 4NK9A 2FYSA 2ZVAA 3AMYA 3CQWA 3N51A 5AP0A 4EH6A 3OXZA 1P4FA 1STCE 4FTUA 3B2WA 2CKQA 3NCGA 5L8KA 3ZM4A 2YZAA 5HORA 3U6JA 4I6BA 4FSUA 3WYYA 3EJ1A 4CQEA 4FBXA 2ZDTA 1GIIA 4CTCA 1GIJA 3ULIA 4QP6A 4F1TA 1IAHA 4DE4A 4GSBA 4CYIA 2OBJA 4GEOA 3QC9A 4S33A 4ZS4A 4QTAA 4A9YA 1A06A 4DEGA 3BPRA 3HA6A 3NIEA 5LVPA 1SYKA 4IMYA 3PPJA 4J96A 4BI0A 3IW5A 3M1SA 1H1QA 3ZRMA 2BRBA 2IW9A 2YM4A 3DQWA 2A19B 4DLIA 4RX5A 5HTCA 5DT4A 1Q8UA 5AR2A 2YERA 3U8WA 3FMKA 3EQPA 3P9JA 2X81A 1Q99A 1MRUA 4MQ1A 1OMWA 4PL4A 4E73A 4X3FC 3KXZA 4IJPA 3SKCA 2VWVA 5HCZA 4LM5A 4YTFA 4MXCA 3UP2A 4CCBA 1QPJA 4EQCA 4JL9A 2OH4A 3H4JA 4FUXA 2W5HA 2OXYA 3QYWA 5EM6A 1W8CA 2QKWB 4ZTSA 3SW7A 2BRGA 1SM2A 2VNYA 3Q2MA 4KBKA 4QP4A 4OTGA 3GU6A 3TTIA 4V04A 1PXIA 3O17A 3IOKA 3PPZA 3MV5A 2HAKA 4Q9SA 5J7BA 3CCNA 4FIFA 1M7NA 4UBAA 1AGWA 4TWOA 4MXZA 5KKRC 2Y4IC 3IW6A 5AP1A 4EH8A 5ETAA 4ZSEA 4IB1A 4B8MA 1TVOA 2XH5A 4C4HA 2VX3A 2XK9A 2JDOA 4MYGA 3LFDA 5E91A 2BFXA 3ETAA 3LIJA 2QOFA 4FKWA 3P86A 5E92A 3TNQB 5CF6A 3U54A 4IEBA 5HTBA 4FTCA 4X3JA 4YZCA 3AC2A 3CTHA 4IAFA 4M0YA 2W1EA 2RIOA 4FKIA 2RF9A 1ZLTA 3P5KA 5AP5A 4EWQA 2WMUA 3KQ7A 3F5GA 5I3OA 2A0CX 4IAAA 4FV3A 5CI6A 5DN3A 2VGOA 3V5WA 3BHYA 5BVOA 4LL5A 4RSSA 2R9SA 5HG9A 3WZDA 3BCEA 4JS8A 3EOCA 5HQ0A 2PMNX 2UZBA 5JQ5A 3C50A 4CKIA 2WPAA 2B0QA 1H07A 3F3ZA 3KMUA 3ZUVA 4JG8A 1V1KA 3WARA 1FGKA 2Y6MA 2QU6A 1JWHA 4KINA 4DEAA 4B9DA 2YJRA 3CS9A 3DNEA 3F61A 3GC0A 3C0GA 1J7UA 4FG9A 4NKAA 3QD0A 3D83A 2YWVA 3MH3A 2VN9A 4M15A 4LV8A 5T68A 4QNYA 4NWMA 5C4KA 3OVVA 2DQ7X 4I24A 3VBWA 3NW6A 2EXMA 3LKMA 4YLLA 3GCPA 4U42A 4O86A 4ZSGA 5IU2A 3ORLA 3NIZA 2WTWA 3BU3A 4X3FB 2RKUA 2WOTA 3EB0A 4IAZA 3V8WA 5L2SA 4TWNA 1I09A 3DB8A 4DFXE 1FOTA 4F6WA 2I0EA 3OCGA 2GCDA 1JKTA 4M14A 5FG8A 2C6DA 5HOAA 4APPA 4GG7A 4YO6A 3GOKA 5DNRA 5CF5A 4R77A 4G34A 3UYTA 2ETRA 2Q0BA 3R73A 4EQUA 3EH9A 4LOPA 3R9OA 2XJ0A 4MBIA 5D7VA 1WZYA 3MESA 5KKRB 2Y4IB 5LMKA 5ANKA 4ZY6A 5FD2A 1WBSA 1JBPE 3QQJA 2ESMA 4AZEA 3MFSA 1XR1A 3DQXA 3MIAA 2J4ZA 3UPXA 2BUJA 2UZWE 4CXAA 1NY3A 5L2WA 2B53A 5CAVA 4RX7A 3NRMA 3R00A 2HZIA 4ZLYA 3FMHA 3ODYX 3EYGA 3RGFA 3LFCA 5HLPA 3P7BA 3VQHA 1SNXA 2PWLA 2E9OA 2G01A 4FL3A 1UKHA 4AOJA 5LWNA 3VW6A 4AGDA 4C4IA 4XEYA 2FB8A 4NCTC 2GNIA 1ZYDA 3PIYA 1GIHA 3HNGA 3QRKA 4MWIA 4BTJA 4UN0C 5A9UA 4IBMA 4JI9A 4BDGA 3SA0A 4FV8A 3QRUA 5C01A 3LW0A 1XH6A 3LZBA 5AR5A 1U46A 2OO8X 5F94A 5J95A 4RG0A 1CKIA 5CVGA 3H3CA 5FEQA 3C5IA 5EI2A 5A6OA 2GNHA 3UIUA 2BRNA 2XBJA 4IH8A 2QURA 4EK8A 4BCPA 5AAGA 4FEVA 3DS6A 4C57A 4S30A 4AW0A 3P7AA 2JKMA 2R7IA 4FYNA 2AYPA 2IN6A 4HYSA 2R3HA 2C68A 4GV1A 3LJ2A 3QTZA 5FP6A 1HCLA 3LM0A 3HV5A 1SVEA 2O2UA 3LQ5A 4ZY5A 3SDJA 1OGUA 4B7TA 4EORA 4F9YA 4QT1A 1OBGA 2YJSA 4PQNA 3R8LA 1PXNA 2FO0A 1E1XA 3R7YA 4IWOA 1Y8GA 3ZO3A 2OSCA 5EG3A 5DT3A 4FEQA 3ERKA 5BUIA 4J8NA 5HO7A 5I9ZA 4BY9E 5E4HA 3DLSA 4FGRA 1JLUE 3OEZA 4FV1A 3ZLWA 4BCMA 1AD5A 3DCVA 4Q9ZA 2BHHA 1OPLA 3AC3A 3OWKA 2PZYA 1BX6A 3RINA 3LFAA 3SRVA 2W05A 5LCKA 3SXSA 4U6RA 5CSVA 3UIXA 1KE8A 3Q5IA 2IVUA 1YXTA 1GJOA 4NTSA 3V5LA 3MGYA 5FTQA 4DGOA 3O8PA 4Z55A 2F7EE 2B54A 3R1QA 4L44A 1XBAA 2CGUA 5HBEA 4CFXA 5AUTA 4E93A 4O91A 1ZOGA 3DJ5A 3FE3A 4HVDA 4NM0A 3KULB 4M3QA 2JDVA 3LE6A 4BYIA 2BAQA 4L53A 4GYGA 3RJCA 2WTCA 4UZDA 1GZNA 4ASZA 4CFNA 4D2WA 5CANA 4PDPA 4PWNA 5CTPA 4ASXA 2OF2A 4RPVA 3FY2A 3I5NA 5TT7A 2VNWA 3ID6C 5AUYA 3AMBA 3VHKA 3QRJA 2X7FA 3OZ6A 5HICA 5I9VA 4AA4A 5E7RA 2XEYA 3L8XA 4RIOA 3VC4A 1ZARA 3LFSA 4S32A 4W8EA 3RAWA 2J0KA 2VO6A 4O1PA 3OT3A 4XYFA 1ZMUA 1RQQA 3D4QA 5E1EA 5CXZA 4FSWA 4DINA 2ITWA 2OXXA 4WO5A 4YC6A 3PLAE 2CKEA 1W0XC 3VS2A 3AC1A 3DJ6A 5EQPA 2VTPA 4UMUA 2WQNA 3IDBA 5IUHA 1UNGA 2OICA 4A7CA 4ANSA 3V8TA 2VGPA 4EL9A 3NUPA 5HO6A 4RT7A 3VBTA 3IONA 3MB6A 5DEWA 4ACGA 4FV6A 2WU7A 2XIYA 4FTNA 2WTIA 3ZOSA 4FEXA 1JOWB 2QI8A 3DY7A 3PZEA 4TTHB 3A99A 5GNKA 4QP2A 5IQFA 1FVVA 3PSBA 4A4LA 5A54A 2BZKB 1UWJA 3FLQA 5BPYA 5IQBA 3WBLA 3A8WA 2QOHA 4E8AA 1Y6BA 3BYUA 4E5BA 2OIDA 4J53A 4PUZA 1OL6A 3DKFA 4N57A 1OI9A 3BQCA 2YM8A 3L9LA 3R02A 2GHLA 5IA2A 3TZ8A 1H1RA 2YN8A 2GMXA 4PP9A 2XF0A 1W83A 3QXPA 3WIKA 5KUPA 4IB0A 4BIBA 5J1WA 2C5OA 2QO2A 4WG5A 1YHVA 2OIBA 2IZSA 2X9FA 3NNXA 4EOIA 4Y46A 3IDCA 3ZUUA 3WZEA 2LAVA 3C51A 5E8SA 3RAIA 5HBHA 2GTMA 2WQMA 3CP9A 5CWZA 4ZTMA 4WUNA 1H08A 3LM5A 3LCOA 3OWJA 4QPSA 4WNMA 4AN3A 5CF4A 3Q96A 4RC4A 3SD0A 4Y72A 1RJBA 5ANIA 2PVHA 4PTCA 5H8BA 2XIZA 3HRBA 3N4VA 2XKEA 4HYUA 4N4SA 5M06A 4YZMA 4F1OA 2WFYA 2EWAA 1UU3A 4UMRA 3UOLA 4BZDA 3P0MA 3FJQE 4P7EA 2Y0AA 4OT5A 4D55A 4X3FA 1J7IA 3TKUA 4WRGA 4NJ3A 4IE9A 3VO3A 4RMZA 1U5QA 2CN5A 4DGNA 4CSVA 1SVGA 2ZJWA 4IX5A 4DEIA 5TKDA 3G9LX 3DXPA 4XP2A 5KZ0A 1Y91A 1DI9A 5HESA 3TXOA 1M2QA 3QUEA 4HGTA 4ALUA 1Q97A 3SXFA 4M66A 4HVHA 2DS1A 5D7AA 3RZFA 4X2GA 4X6QC 3VN9A 2UW3A 4AE6A 2CGVA 3NS9A 5AP4A 4FNZA 2BAKA 5A6NA 5IF1A 4L67A 4ONAA 2UV2A 1T45A 5EYCA 4BKYA 2XKFA 2HXLA 2PVFA 3CIKA 4OTIA 2UZEA 4QTBA 4F7LA 4QMMA 4ERKA 2PZIA 4G5PA 1XHAA 2XNNA 5CU2A 3BIZA 4E5AX 4GFGA 3GUBA 5F9EA 4WHZA 3QWKA 4IFGA 1Q62A 3F6XA 1NVRA 3NPCA 4AZWA 2X9EA 4NU1A 3VS7A 1OUYA 3RPRA 3CBLA 4PL5A 4QMZA 4TRLA 4N70A 4F9CA 4G2FA 2IO6A 2YCQA 3DLZA 2VO7A 4CYJA 5CASA 3QZIA 1NA7A 1Q61A 2OWBA 4ZZOA 3RM6A 4F9AA 3DGKA 4IDTA 3ZFYA 2XP2A 3PZHA 2GNLA 5C8NA 5IG1A 3QX2A 2C6TA 5AUVA 4I0SA 5EM5A 1LPUA 3QWJA 3KKVA 4IZ7A 3NLBA 4W4XA 3I7CA 2PMIA 4HPTE 2R3PA 2RFSA 3FEGA 1Z5MA 4MHAA 4C2WA 2QOOA 3R8ZA 4DH3A 3DJ7A 3R7GA 1FQ1B 3OF0A 5GZ8A 4O7WA 4O6LA 3ZRLA 4C7TA 3E63A 3GFEA 4KSPA 5AADA 4I20A 2RG5A 1CM8A 1Z57A 4OTDA 2XK6A 2NNWB 3KB7A 3RBWA 2P55A 3DZOA 4S34A 3ZLSA 3NW5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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