3Q04A

Crystal structure of the apo-form of human ck2 alpha at ph 8.5
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structural and functional analysis of the flexible regions of the catalytic alpha-subunit of protein kinase CK2
rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 111
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3q04A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q04A02
2UW3A 4MYGA 2FSTX 4WO5A 2HZIA 2G9XA 4N6ZA 2WMSA 4XG4A 2WEIA 4ALUA 3I7CA 3V01A 4F9CA 2YHVA 1OECA 1PYEA 1M7NA 2XBAA 3E87A 3OFMA 4IWPA 4L00A 2JDTA 4O2PA 2XNMA 3O50A 3NNWA 3OZ6A 1WVWA 3DK6A 4HPUE 5AUVA 4FV1A 4RPVA 2RFNA 4ZY4A 3U87A 4BF2A 5CEOA 2VX0A 3FV8A 3VUKA 5EI2A 1H1RA 2GS2A 1ZYJA 2OZAB 1ZY4A 4YJPA 4FV6A 5DT3A 4ANQA 4OTIA 3FZ1A 4JRNA 5BMMA 3TKUA 4DLJA 2DWBA 3E8DA 4LGDA 3TV4A 4DGNA 4AN2A 5DMZA 3TACA 3ZDUA 3UNZA 2CKPA 3UZTA 3E93A 4MD8E 2OKRA 2LGCA 3UYSA 3FXXA 4I6FA 5EHYA 4E3CA 4USFA 5E8XA 4U0IA 2OH0E 2QURA 2O2UA 4WG3A 5T68A 4JDJA 4ZLYA 1P4FA 1AGWA 3LZBA 4NUSA 2C3JA 3FSKA 1IA8A 2W1ZA 4JBVA 2X4FA 4Y8DA 3PJ1A 2WQNA 5CSHA 5CF6A 4HW7A 1R0EA 5EYCA 5HVJA 4DG2E 3EKNA 3NAXA 2X7OA 4PNIA 1M17A 2IZUA 4NM7A 4GT3A 4L3JA 2WTDA 4O96A 1FGIA 3FMNA 4GCJA 3RKBA 5I3OA 4XCUA 3EFLA 3EFJA 4JBPA 1R78A 4I4EA 3DJ7A 4QPSA 4QQCA 1KE8A 1MQBA 2WMXA 2P55A 4U41A 3WBLA 4DAWA 3R7UA 4Z7GA 4E93A 1W84A 4XS2A 1MRYA 1DAYA 3DQXA 3QTSA 3BBTB 4KAOA 4YLJA 4ZJIA 4YC8A 5LVNA 1XH7A 1UV5A 3DJ5A 2HZ0A 4GV1A 4A07A 5CSVA 3QTUA 4FKIA 3TKHA 4FE2A 2YIWA 4CNHA 4O0XA 3VBQA 3S4QA 3UIBA 3VW6A 3IW5A 1JWHA 4RIYB 4Z7HA 5JFVA 5LVLA 2W7XA 4IFGA 2C5OA 4Q5HA 2YDKA 4XG3A 4OTWA 5DR6A 2VU3A 4KA3A 5HNBA 5LARA 1YOLA 4BZDA 1ZMVA 4EYMA 1CMKE 2WPAA 2X2LA 3DK3A 3HYHA 3C1XA 4R1VA 2W1GA 3C4ZA 4BCQA 2BIYA 3QQHA 4G5PA 4AW5A 4BB4A 5CXHA 4CFUA 3W2SA 3EB0A 4A4XA 1QPDA 4G2FA 2V62A 4FGBA 4M14A 4M67A 3A7GA 4QYHA 4PRJA 5K0XA 4RJ4A 5AIRA 5K4JA 3IKAA 4W9XA 4NJDA 3NRMA 2VZ6A 3NW6A 1AQ1A 3AC3A 4O7LA 4PDOA 2HXQA 3NZ0A 1SZMA 3BLQA 5TF9A 4WUNA 4D9UA 4O81A 4L44A 3UC4A 2PZIA 1B38A 4X6RA 2ITOA 2UZWE 2XKFA 4L9IA 1SVGA 2G2HA 1PXJA 3E62A 3ETAA 3HA8A 3PWYA 3F3TA 3RJCA 3W2OA 4UN0C 2PE1A 1WBNA 3EIDA 4G3FA 1GIJA 3A8XA 3FAAA 3HA6A 3D5WA 4PNKA 4FEXA 2CDZA 4UXLA 4ZSEA 5GJGA 4WRGA 1P2AA 3BLRA 3A62A 4QTAA 3R8MA 5BUIA 5HG5A 2QONA 5IUHA 4O83A 4EH4A 3BYMA 4P5QA 2WQMA 4NEUA 4FA2A 4X2GA 1J1CA 4Y5QA 1Y91A 4DGLC 3MTLA 2PVMA 4MD7E 4UX9A 2GSFA 3ZBXA 4FSRA 2GCDA 3MPTA 4N4SA 2QR8A 5AP6A 4A9TA 4CRSA 4W9WA 4I23A 2YDIA 4CMTA 4BYJA 2BZKB 2EXCX 2YWPA 3NMUF 4KKEA 3K2LA 5FDXA 1XH9A 3BIZA 4U6RA 4LV8A 3DGKA 1JKKA 5FWKK 2BZJA 3PFQA 3SV0A 3HUBA 3CJGA 3ZUVA 4U9AA 4AT3A 3MFUA 3EWHA 2C30A 5E1SA 3WF8A 1XH5A 5EFQA 2PUNA 2BKZA 1Y8YA 1WBPA 3F7WA 5GINE 5M06A 4FKJA 1PW2A 4ITHA 4DITA 3A4OX 4TNBA 5ANEA 2GS7A 1PXPA 2WTIA 3DAKA 4FI1A 4QTBA 4ZZNA 1JSTA 4FKQA 4K2RA 5ITAA 3Q4UA 4EH2A 3RWPA 4NKSA 5HG9A 4J71A 3Q9YA 4ZSAA 3PXQA 3LFDA 4LRJA 2QHMA 4FTUA 1UNLA 3R9RA 3BYUA 3KXNA 2G1TA 2WIHA 4FV7A 3W2RA 4EK6A 3S1HA 2ETRA 4IQ6A 4Y85A 3QTXA 4XBRA 4BBMA 4IAIA 4CVAA 5CT0A 1PXNA 3TIZA 4D1XA 2R3IA 5CNNA 1OUKA 3MH2A 3FJQE 2OXDA 4PDSA 2XUUA 2YM7A 5IQDA 4X3FB 4CYIA 1OKZA 4X2KA 3QCQA 3QRTA 4EJNA 4HYIA 3SOAA 4O7ZA 3DJ6A 3PVGA 4TNDA 5AUXA 4A7CA 2R7BA 2XM9A 3DLSA 3NUSA 5EG3A 4LV5A 3E88A 4OTHA 3DBQA 5TE0A 1SMHA 3LE6A 3UC3A 3RGFA 2YZLA 3LFEA 1W0XC 4CZYB 4DG0E 3HEGA 5K5NA 2ITYA 5ANIA 2EXEA 4EYJA 5IH6A 4WT6A 4ACCA 3JYAA 3PJ2A 4BIEA 2VO3A 1LUFA 2CLXA 4F65A 2W1FA 3F2RA 1Q97A 3G0EA 5KHWA 2GQGA 4QMVA 2OF4A 3FL4A 3RMFA 4NL0A 3TNIA 4LFIA 2OJFE 2PMIA 4FX3A 3BV3A 3C5UA 3LW0A 2E9OA 2ESMA 2PSQA 2QHNA 3Q04A 4M13A 4OBQA 3VUHA 4EC9A 3HAVA 4OTFA 4UXQA 3UOKA 2HZ4A 2YDJA 1SVEA 3D14A 4C02A 4BDAA 3R8LA 4FT5A 2XM8A 5CF4A 4OBPA 4D2RA 4TY1A 2O64A 4TWPA 4XH6A 3EZVA 3SDJA 5J7BA 4YZCA 2WTKC 5LXMA 2C68A 2HYYA 4E6QA 3BU6A 1BUHA 1Z5MA 3KU2A 5D41A 4U7ZA 3F7ZA 4HYUA 1ZZ2A 3Q6WA 3NNVA 3OWJA 4FTLA 4XG9A 3OCSA 4XOZA 5M55A 4FV3A 3ENMA 5C26A 3V8WA 3WF6A 3JPVA 2YFXA 4ALVA 2WU6A 2QO7A 3RPVA 5HLNA 3S3IA 3UVQA 4L42A 4IWQA 3AD6A 5BVWA 4BI1A 4QYFA 2Y0AA 5GIOE 5BVNA 5KMJA 2PVYA 3H3CA 3IOKA 4GT5A 3QU0A 4UYAA 4IM0A 3KGAA 3PSDA 3UG2A 2EWAA 3TXOA 4UALA 3CXWA 3ZSHA 3ZRMA 5JH6A 4IXPA 3OG7A 3ZDIA 2Z7LA 3LXPA 3ZFMA 2YLEA 4FKPA 2Y4IB 3HV5A 4GH2A 4BDIA 2XEZA 4UWBA 4MWHA 2E9NA 4FSNA 3C9WA 4PPBA 5IQFA 3R6XA 3S95A 2UV2A 4PTGA 4JVGA 4J95A 5LMAA 3DTCA 1OL1A 3O7LD 2W1IA 2CNUA 3MIAA 3R1SA 3TI1A 3LFAA 3AT3A 4S30A 4AN3A 4I5MA 1XWSA 3O96A 5CU4A 3BZ3A 4QO9A 5FGKA 1I09A 3UMXA 3ZBFA 4AGWA 4ZLOA 5J9LA 5AV4A 1YRPA 5IG1A 3WZJA 3UDBA 4AZSA 4YU2A 2A2AA 2BHHA 3BEAA 3ZUTA 4G3GA 4R1YA 2Q0NA 5DHJA 4E6CA 2PVKA 2R3OA 1M14A 3C5IA 3R1QA 4ASDA 5CEIA 2FB8A 1ZLTA 4K9YA 2XKEA 2PZYA 4EBVA 2B54A 3R8UA 3OMVA 1PF8A 3G6HA 1YWVA 4Q9SA 5HZNA 4NCTC 1WMKA 4FYNA 4OTPA 1ATPE 3Q9XA 5E8SA 4ZMFA 4AN9A 1KE7A 3F9NA 3P78A 4IX4A 3PY1A 3HZTA 2ITVA 3KF4A 3I79A 5L2QA 4L8MA 3DFCB 2OLCA 5KBQA 3VS4A 5KKRB 1PJKA 2B9FA 4HVSA 4BZOA 3QTQA 1O6YA 1WZYA 2HAKA 1XBAA 4DFUA 2W1EA 5HCXA 4BDFA 2CKQA 4WNOA 3ZLWA 3CPCA 4RIYA 3R9OA 2XK9A 3H0YA 3DKOA 3JUHA 4XG6A 2VWVA 2GPHA 4GG5A 2CSNA 2IVUA 3LMGA 3PWDA 3FQEA 4X21A 3GQLA 5L6WL 5JGDA 4PV0A 3UPXA 4QQTA 2QLQA 5AP3A 4F08A 1PXIA 2W9FB 2WTCA 1H8FA 1A9UA 3OCGA 4WNMA 4O82A 4L67A 3CQWA 4YJVA 4DINA 4EOMA 1E1VA 1WCCA 2PE2A 4RX5A 3OEFX 3GU8A 3I5NA 3MGYA 3OC1A 2ERKA 3ZS5A 2X8DA 5L2SA 3AMBA 4BTMA 2OBJA 2YIRA 3R8ZA 4QPMA 4MXYA 3O0GA 2NNWB 2IG7A 4PL4A 4TN6A 2PVNA 5AX9A 3RK7A 4BDHA 3NWWA 4L46A 4NU1A 5TKDA 4O6EA 3K5VA 4AG8A 2FH9A 4UMPA 4GVAA 1BYGA 1Y6AA 2Y8OA 3DPKA 1XQZA 4IM2A 3WE4A 4KD1A 3RAHA 1R1WA 4E5BA 4DC2A 1UU7A 3VQHA 5HIEA 4O2ZA 4OT6A 1H4LA 1ZYLA 3QKKA 2BROA 4D0WA 3R71A 5C9CA 5AV1A 2I1MA 1J7LA 2OIQA 4FEQA 3ZO4A 1ZOEA 2XCHA 3F3UA 3FMDA 4QTDA 5A3XA 2XJ1A 4CV8A 3ZRKA 3RPOA 4F6SA 3MWUA 2J50A 1T45A 4IHPA 1GZOA 3VW8A 3LFFA 2VO0A 4D28A 4E7WA 4QP8A 4I41A 3MPMA 1JAMA 4CEGA 1YI6A 4NKAA 4CKIA 4KIQA 2WHBA 2YN8A 3EN4A 3JY0A 4I6BA 3RWQA 2CJMA 3U8WA 3PVBA 3UVPA 5CSPA 3PJ3A 3HAMA 4RJ8A 4BTKA 1FQ1B 3DZOA 5C8KA 3E5AA 4ANSA 5AUTA 4C34A 5IQHA 1DI8A 3Q6UA 5BYLA 3DU8A 5ICPA 2C6EA 2RL5A 4FKVA 5HBJA 4M0ZA 3AGLA 3E3BX 5EQPA 5HHWA 4O86A 2VAGA 3Q32A 1XBBA 1WBWA 3ZTXA 4AGUA 4CFWA 4EH8A 4H3BA 3KMUA 2ITUA 3EQIA 4IAFA 3PLAE 3GCSA 3WE8A 3GCPA 2OXYA 4C62A 5AJQA 3FZPA 4CD0A 5FXSA 3TZ7A 5HESA 3BQCA 3PE1A 4HVGA 4AZFA 3BX5A 4M8TA 4KBKA 3A4PA 3NUNA 3ZXTA 5A54A 3GU6A 4HCUA 5EDQA 3GCQA 4L43A 5IH4A 4YTHA 1YDSE 5L3AA 4XX9A 2BALA 3UIMA 2H8HA 3KFAA 2GNFA 3D7ZA 4NT4A 4V0GB 1U5QA 5AA8A 2WMTA 3FDNA 3TJCA 2PE0A 3E92A 3N51A 4C2WA 2FSMX 2F9GA 3UPZA 4QRCA 2HK5A 2BRNA 4TYIA 3U4WA 3UGCA 4BCNA 2IVVA 2W0JA 3OTVA 3DFAA 5CX9A 3ANRA 3LJ0A 4QQJA 2W1HA 3N4VA 3QC4A 1NY3A 3CLYA 3K5UA 4KB8A 3LCDA 1HOWA 4UMTA 3PY3A 5EHOA 5FUTA 3G33A 3RK9A 3TZ9A 4C58A 3SRVB 4BWKA 3FYJX 4F1TA 4AQCA 3ATSA 4PMTA 3FYKX 4L6QA 2WFYA 3TWJA 3MB6A 3FHRA 4LGGA 4J1RA 4AFJA 4EH5A 3FLSA 3QUPA 2XK6A 4J99A 4EOPA 2OWBA 4JAIA 3CTQA 3WOWA 4F7LA 3HGKA 4QT1A 4ZTQA 5DOSA 4E26A 3IONA 2VO6A 3I6UA 5CZHA 4EQMA 3KN6A 3CBLA 2W96B 4RX9A 2YA9A 2PMNX 4YZBA 4ZSJA 3TV7A 3VBWA 5CEMA 2QNJA 3ALOA 1H0VA 2WOUA 2HZNA 2J0LA 4ZSGA 4XP0A 5T3QA 4AAAA 4AOTA 2BR1A 1JSUA 3B8QA 4F1OA 3JR1A 4FTNA 3A7IA 3BHHA 3MH0A 3RAWA 2XA4A 4GVJA 5CAUA 4QD6A 4G6LA 2R5TA 2XB7A 3NYOA 5FP6A 2BDWA 3UIUA 3WIKA 4YJUA 4V01A 2PHKA 2W5AA 1H27A 4IZAA 2X7GA 3I6WA 2YAKA 4KIKB 3W55A 2ITZA 3E7OA 3LIJA 1LR4A 2OK1A 3O8PA 3C0GA 1MP8A 4XP2A 4LI5A 3LFSA 4G5JA 4IAKA 2WMAA 2YIXA 3DBDA 2C6LA 2HY81 4K1BA 3QLGA 4D2VA 3UQFA 2RKUA 3OROA 3TZMA 3NPCA 4RZWA 1MRUA 4M12A 3AG9A 2ZM1A 3QD2B 2RFSA 3QFVA 5JZNA 2FSOX 4YO4A 4DH8A 5EQEA 4FIJA 4C35A 3P4KA 5I9XA 4TW9A 2UZOA 3COIA 5IQIA 3MPAA 3T3UA 3U9NA 5IUGA 4V04A 4EBWA 4DF3A 3RPSA 3WIGA 2QO2A 5JQ5A 3QKLA 1FINA 2J5FA 4JLCA 4TYEA 4FIIA 3BV2A 2BILB 2C1BA 1GZKA 2GTMA 3HMIA 3PYYA 2XJ2A 4FKUA 4MAOA 1JSVA 4H36A 4U8ZA 5CAPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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