The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
38
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sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
DAHIPQLIASEANFGAKAALMRSTIAQAEQAAMSSQAFHMGEASAAFQAAHARFVEVSAKVNALLDIAQLNIGDAASSYVAQDAAAASTY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal transport
|
| source organism |
Mycobacterium smegmatis
|
| publication title |
Heterologous expression of mycobacterial Esx complexes in Escherichia coli for structural studies is facilitated by the use of maltose binding protein fusions.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pe family protein
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| total genus |
38
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| structure length |
90
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| sequence length |
90
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | ESAT-6-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GZR B; 2KG7 A; 2AZ0 A; 3OGI B; 4ABM A; 3Q4H B; 3O9O A; 2KG7 B; 4I0X A; 3TXQ A; 3GWK C; 3FAV A; 4I0X B; 3FAV B; 2B9Z A; 4LWS A; 2VS0 A; 3GVM A; 2AZ2 A; 3HR0 A; 4LWS B; 2DE0 X; 3FD9 A; 1WA8 A; 3ZBH A; 2VRZ A; 3TXS A; 3G80 A; 3Q4H A; 1WA8 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1EFR G; 1H38 A; 2Q69 A; 3QO8 A; 2D3O W; 4DRX A; 3QVN A; 2WPD G; 3ZRW B; 2IJK A; 3CRQ A; 4X64 O; 2XOK G; 1CP9 A; 5LYJ B; 3ZRX A; 3AG4 C; 2ZDI A; 5EBM C; 4K0K O; 2BE3 A; 4XDJ A; 2UUB B; 2HKO A; 3L75 H; 1VMG A; 4H13 B; 2ARH A; 5B1A B; 1SQQ H; 3MAQ A; 2JVD A; 1J95 A; 1GO3 F; 3G67 A; 1W59 A; 4IYI A; 4UCR A; 4DV2 O; 4MVO A; 4I9Q A; 3SJC C; 2UXX A; 3JD3 A; 1RFY A; 5H9C A; 4JYA O; 4PI2 A; 1JJO A; 3E89 A; 1DF4 A; 4O2A A; 1SQP H; 5FNV A; 3ZHV A; 1FYJ A; 3K9S A; 4Z1V A; 3BA8 A; 4CC6 A; 2NLJ C; 1Q82 W; 1V9P A; 3ZJZ A; 3IFX A; 1D2D A; 2VWK A; 3CWB H; 1CEZ A; 2EZO A; 5JVD B; 4XBF A; 3K3W A; 1Y74 B; 2QGN A; 4K8X A; 1WJZ A; 4UB6 Z; 4JI3 B; 2NN4 A; 1BS3 A; 3JAL A; 2EZP A; 5LMU B; 1GH6 A; 1FFX A; 4N21 A; 4TOI A; 3K04 A; 3FYI B; 4YHH B; 1S5H C; 4JTD B; 4HNA B; 1GM8 A; 3ZN0 A; 4GKK B; 5IYZ A; 1VQO V; 1X4T A; 2F95 B; 1B04 A; 1HWY A; 3LDE A; 3HKC B; 1MSW D; 3CC7 V; 5A9G A; 2EIN B; 1QLN A; 4YIO A; 4LBE C; 2YIB A; 5H5N A; 5B1A C; 3SPC A; 3AG1 C; 1ARO P; 2DQ3 A; 2F4V B; 4DV4 B; 1F51 A; 2H94 A; 2FTK A; 3ML0 A; 1WPX A; 2WLI A; 5J2T A; 4RQE A; 4DR1 B; 5IT9 N; 4AQY O; 4QGP A; 1HNX B; 3W7S A; 1K4D C; 1MZF A; 1P7G A; 3H01 A; 2UUB O; 2JGU A; 1L8D A; 1JQ0 A; 3L9D A; 1L1F A; 1BE3 H; 1NH2 D; 1H2S B; 1XNR B; 4GKJ B; 3K06 A; 5CBF A; 4O4L B; 2UXD B; 3AEI A; 1W2B U; 5B3S C; 3CCR V; 2B1I A; 4TV8 B; 3OEH G; 3G6B A; 2AHY A; 4LC1 A; 3AG7 A; 5ITZ B; 4CS3 A; 5F2V O; 2QA4 V; 1HNW B; 1ZL8 B; 2WLL A; 5EC1 C; 3CME V; 4NTX A; 1T5E A; 1Q90 D; 3I5D A; 4K8Z A; 3TXS A; 5EIB C; 3JAK B; 1NQT A; 5K1P A; 2WLN A; 4LR3 A; 2PUS A; 3EHB B; 3RW0 A; 2XND G; 3E22 A; 4DR5 O; 2BTQ B; 1BL8 A; 2Y69 C; 4JV5 B; 1XIL A; 1QVG U; 1K73 W; 4I7Z B; 1FXK B; 4JI3 O; 3BEH A; 2IJH A; 2AZ0 A; 1OJH A; 3FX7 A; 5LMU O; 3EFF K; 3OMN B; 4HZ3 A; 3OE7 G; 5IE9 A; 1VQ6 V; 4E4E A; 2DYR C; 3E2E A; 1N4C A; 3P3N A; 4CC5 A; 4UCV A; 1XHX A; 5IDJ A; 2E5L O; 4I5S A; 2CUG A; 2JDI G; 1OCR C; 1SES A; 3D36 C; 3JD1 A; 4ICG A; 4DV4 O; 3OMA B; 4LFA B; 4JYC A; 4JI2 B; 1MNG A; 2JJ1 G; 1OCO C; 4TQF A; 4I9W A; 1J5E O; 4TT3 G; 5CB4 A; 2WSS G; 3B77 A; 4X62 O; 3H1H H; 2IU0 A; 1Y66 A; 1Y76 A; 3D3Q A; 4LF7 O; 3SYO A; 4LFB O; 4DR6 B; 3K79 A; 2X7R B; 1F4M A; 5KHK A; 1WPB A; 1H8E G; 2Q7H A; 1XNR O; 3I55 V; 1IBL O; 2H8P C; 3APQ A; 1YTF D; 4GKJ O; 1HW7 A; 3QO5 A; 3CX5 F; 3VQY A; 4IHJ A; 4JZ2 A; 2UUA B; 2BSK A; 3GWK C; 4UCO A; 1F7Y A; 5EIB D; 4MTF A; 3E86 A; 5BY1 A; 4D6T H; 1HNW O; 4YY3 B; 1N0J A; 1K97 A; 3E8H A; 3J81 N; 1AP6 A; 2ITC C; 2CK3 G; 2GUZ B; 4B3T B; 3G6E V; 4RAI A; 3CJH A; 2UXC B; 2KKW A; 4UV8 A; 3TXQ A; 1D5A A; 4JV5 O; 3WG7 B; 5IY5 B; 3F7Y C; 1GN2 A; 1VF7 A; 5LA6 A; 3CPW U; 4FLX A; 3UCS C; 4DR2 B; 1AI5 A; 3CYO A; 2A7W A; 4YJ2 A; 4JI1 O; 2KG7 B; 4J9Y B; 1M57 B; 1VF5 B; 1WP7 A; 2P4K A; 3DC5 A; 2EIK B; 1MMM A; 5JJE B; 2GTA A; 4BWA A; 3BAA A; 3UO3 A; 2WWW A; 1IBK B; 5C8Y A; 4CS2 A; 2ZDI C; 3SPG A; 2IH3 C; 4GT1 A; 2Y0I A; 3VQV A; 4BIU A; 2AHZ A; 4HYO A; 2E75 B; 2B1G A; 2HG5 C; 3JD2 A; 1NT2 B; 5JCO A; 2LJ2 A; 1BZK A; 4PDM A; 2Q9L A; 3JAT A; 1B6Q A; 3ETQ A; 1JPX A; 4MS2 A; 3E8B A; 3AK3 A; 3ASN C; 3C3S A; 4DR6 O; 2A9H A; 2IU3 A; 4DR4 B; 3FD9 A; 4CH6 A; 3RYC A; 3T1Y B; 1YZB A; 2EBO A; 5KLV H; 4DV1 B; 1FXH A; 3Q4H B; 1V54 B; 1R6N A; 4LP8 A; 2XUM A; 4ASU G; 2YEV A; 3RT3 C; 4LF8 B; 5IY5 C; 4ZKI A; 1XHZ A; 3OTF A; 4LFC B; 5LGN A; 3K59 A; 3JAM N; 1BSM A; 2F1M A; 4DUY B; 1N32 B; 1O9H A; 4KHP O; 3UO2 A; 3AG2 C; 3FB7 C; 4PHZ A; 2UXC O; 1TUB A; 4UV9 A; 4FLV A; 1TUE B; 4MVR A; 4O2B A; 1I5X A; 1K92 A; 4LNU A; 3UT5 A; 5IJ0 A; 4GX1 A; 4UXN A; 1GM9 A; 5DEC A; 4G2K A; 1VQK V; 1KKD A; 1NR7 A; 1XMO B; 5LHI A; 5KA5 A; 4DR2 O; 1KUQ A; 4TQD A; 5B1N A; 4IYH A; 4DYL A; 1TA8 A; 4X1I B; 4UVC A; 1PL0 A; 4NKG B; 3DC6 A; 3TCU A; 1K7D A; 3KZI Z; 3MHH C; 4PDL A; 1XUQ A; 4DV7 B; 1IDS A; 3RYF B; 1MA1 A; 1V55 C; 4QNH B; 4BR6 A; 1AP5 A; 1YEW A; 3CRA A; 1G8M A; 3TK1 A; 2ADQ B; 4X65 B; 4EEQ A; 4UVA A; 2Q7G A; 4R7C A; 1DF5 A; 2Y48 A; 1N34 B; 1KU9 A; 1N8R W; 2RDC A; 4DR3 B; 1BGY H; 3J7A U; 1QR8 A; 4DR4 O; 2L6L A; 1DLB A; 3RYI B; 4ZOL B; 2P67 A; 3D8C A; 4BAY A; 1NR1 A; 3UM7 A; 2IJI A; 3VQW A; 2HVJ C; 1ZSP A; 3WB2 A; 3BPZ A; 2PF4 E; 4X64 B; 4TUY A; 2EIL B; 1OCC C; 4LCU C; 2VQF O; 5IJ9 A; 3N2G A; 4CBC A; 3ZX6 A; 3HKC A; 1SET A; 1K3E A; 3N2K A; 4K0K B; 3H9V A; 4DK1 A; 1XQ8 A; 2JEX A; 1R3K C; 1IUR A; 4GZR B; 5D5Q A; 2N74 A; 3ZMV A; 5D5P A; 4DV2 B; 1W0J G; 2UU9 B; 5K1X A; 3ZCC A; 1SA0 A; 2YIB D; 3AG4 B; 3OR6 C; 1JMK C; 3EXA A; 1XMO O; 2EIJ B; 2ZR3 A; 2ATK C; 4TWK A; 1F23 A; 2AW9 A; 4FFB B; 2JGD B; 3HPL C; 2H3O A; 1NZ6 A; 2R9I A; 4N23 A; 1R3J C; 1SER A; 3B8M A; 1MSD A; 4WFB V; 4PV1 B; 5JJJ B; 2ZIN A; 4X1Y B; 2R9A A; 4G28 B; 4DV0 B; 3FB5 C; 3IAY A; 4OPH A; 3MDS A; 4O4H B; 1VAR A; 1NH2 B; 1ZL8 A; 2Q73 A; 4OX9 O; 2FL4 A; 1JJ2 U; 3ZHQ A; 1RPR A; 2A0L A; 4FM2 A; 5FLX N; 1BQ0 A; 1SRY A; 5E79 Z; 1KEC A; 2Q4P A; 2F93 B; 3N27 A; 5H6Q A; 1N34 O; 4I0X A; 2ETN A; 5EZY B; 5C93 A; 1SQB H; 2CH7 A; 1VQL V; 4UCS A; 1PKX A; 5DM6 V; 2JS5 A; 1FXK A; 1VF6 A; 4Z2W A; 4NB5 A; 1K9M W; 3JSN A; 2EIM C; 4IT5 A; 3ZMS A; 3H1K H; 1S76 D; 2DYS C; 2X0L A; 2XAF A; 2X6C A; 1CXZ B; 5EBW C; 5B5E Z; 4FM1 A; 2KB1 A; 4J7Z A; 5CA3 A; 3OGI B; 4EB6 A; 2BCC H; 3CCE V; 1YCI A; 3K08 A; 1HP8 A; 3MD0 A; 1H2K A; 2JEU A; 2VWJ A; 3SYP A; 4X8A A; 1PNM A; 3CCJ V; 2WA4 A; 5KA6 A; 4DW0 A; 5KHJ A; 2N05 A; 4AQY B; 4JI4 O; 1QCE A; 4U7N A; 1SKV A; 2ZNI A; 1E1R G; 2EIJ C; 4UCT A; 1JCH A; 4B3S B; 5B66 Z; 4JI7 O; 4MW3 A; 5LMN O; 3OUF A; 3HKB A; 4GLX A; 4JAV A; 1PD3 A; 5KUK A; 2P4V A; 3AG1 B; 3APO A; 3CB2 A; 1M56 C; 1WN7 A; 2UU9 O; 4DO2 A; 3W7U A; 3OGC C; 3SR2 C; 1IZ3 A; 3W7X A; 1P7B A; 1SZX A; 2AGA A; 4JAA A; 3ZN1 A; 1TGO A; 1B3Q A; 3L71 H; 1GK9 A; 4PA3 A; 2ZE7 A; 2V1D A; 5JCO C; 1S5J A; 3ZIA G; 4DV0 O; 3B2E E; 3HKE B; 5B3S B; 4LF9 B; 5CA0 A; 3DXR B; 1PNL A; 1NJI W; 4NR1 A; 3H1I H; 2XTA A; 5KX5 B; 4P9P A; 4DR5 B; 4NVP A; 2ZQM A; 1YTF B; 3ZRV A; 3ETG A; 1R73 A; 4JI6 O; 1XI1 A; 1XL6 A; 3OAA G; 4JAU A; 2RNB A; 3UKM A; 4ZHQ A; 3K9A A; 1VQ5 V; 5LP6 A; 3M99 B; 3RYH A; 3O65 A; 3TET A; 4I4T A; 1XL4 A; 1EM1 A; 1IX9 A; 3U11 A; 2Y69 B; 5L3G A; 2WLM A; 2QWO B; 3FYE B; 5B1B C; 2PZS A; 1SC5 B; 2LFR A; 1WP8 A; 2CDY A; 5H2F Z; 2OWO A; 2DMX A; 2E5L B; 1JFF B; 3THO A; 2WA3 A; 1RSO B; 1K5S A; 2QWN B; 5EBL C; 3A0B Z; 1CPY A; 2Q0O C; 5KMG B; 1AIL A; 3CMA V; 3OR7 C; 1TAE A; 3JAR A; 1J5E B; 2DYR B; 4Q6G A; 5JH7 B; 4R8C A; 4X62 B; 4B3S O; 3CCQ V; 1BHB A; 3BRC A; 2OTL V; 4LF7 B; 4LFB B; 3P32 A; 1QU7 A; 3CD6 V; 3T1H O; 1OCR B; 2EUL A; 2NR5 A; 1YI2 V; 3F5T A; 5GW7 A; 3T4Z A; 1IBL B; 1OCO B; 2A79 B; 1IBM B; 4MTX A; 1QR9 A; 5GON B; 2W0F C; 2WLK A; 3K5M A; 3K03 A; 1THZ A; 4PEL A; 1H2L A; 2HJD A; 1KBH A; 1G4Y B; 1RM1 B; 2Q67 A; 1TVK B; 2XAJ A; 3Q4H A; 5EYP B; 3WB1 A; 1URF A; 2QDO A; 1K33 A; 3ASO C; 1N36 O; 1XBL A; 4LF9 O; 1FPO A; 1Q43 A; 3ZMZ A; 2F43 G; 4DV5 O; 4O4J B; 1MZE A; 4J7J A; 3JYC A; 2KSD A; 1GAX A; 1FFT B; 2ADP A; 5CBG A; 4QE7 A; 2WLH A; 3LSS A; 4MT8 A; 2XAH A; 4BIZ A; 1K8A W; 2E76 B; 2K1E A; 1XNQ O; 1QQC A; 4H33 A; 4X1K A; 1R1B A; 3HB3 B; 4JI1 B; 3FAV A; 4B3R O; 2QM8 A; 3ZHT A; 1GKF A; 3IJ4 A; 4FLT A; 1ENV A; 1WB7 A; 4W4K A; 2LFS A; 4E2L A; 1W0K G; 4O4I B; 4AI8 A; 3T2M A; 4X1I A; 3ZMU A; 1X59 A; 1Y67 A; 2EJR A; 3ZRS A; 4JYY A; 3HKD B; 4DV6 B; 1L0N H; 4ZBM A; 4DRX B; 1EBO A; 1Q6U A; 4QIW F; 5BZB A; 1Q5O A; 3MHS C; 1DTO A; 4LWS A; 3SYC A; 2YXY A; 4X66 B; 2YXL A; 1AR5 A; 1RM1 C; 1Q81 W; 1E1Q G; 4TV9 A; 5IYD O; 5CA1 A; 3CC2 V; 2CTP A; 4OGQ B; 5BMV B; 2HVK C; 4LF4 O; 2UXN A; 1IBM O; 5HFL A; 4FK5 C; 3W7T A; 5J2U A; 2A06 H; 1WAZ A; 4I50 A; 2PYJ A; 2HP8 A; 3QTC A; 3ASN B; 5FL7 G; 3RYI A; 2WLJ A; 4NXN O; 4ZOL A; 2RQ6 A; 4IGG A; 3OM3 B; 5FNV B; 5KHI A; 4KHP B; 3EVK A; 2ZIM A; 1I7F A; 2G38 A; 2EJ7 A; 3B09 A; 2GBO A; 4A5U B; 2Q0A A; 2NNU A; 3LDD A; 3X2Q C; 3P3P A; 3TJT A; 1KB9 F; 5KAF Z; 4U3J A; 4OXS A; 4B3M B; 5AG2 A; 4X20 A; 3AG2 B; 4JI8 O; 3QG5 A; 2PI4 A; 1H2G A; 2QKS A; 4X88 A; 2LW7 A; 4LF5 O; 3OTO O; 3AG3 B; 3SPI A; 1U96 A; 5KHG A; 1FFX B; 3A0R A; 3IC7 A; 1Z5W A; 3OUS A; 4FFB A; 2IM9 A; 1SQX H; 3A0H Z; 3AK2 A; 2P22 C; 1M9N A; 1EZJ A; 1NU1 H; 5IYZ B; 4FPP A; 2BTO A; 3OEE G; 1SF9 A; 1VQ4 V; 4DV6 O; 2LO1 A; 4FLW A; 1Y6X A; 2OCC C; 5LOV A; 4DXW A; 5BXZ A; 4ZI7 A; 1GM7 A; 1S0V A; 2WLI B; 5J2T B; 1AI6 A; 2P7T C; 4FLU A; 4X66 O; 1H8H G; 4C7U A; 2QKA A; 5B1O A; 1V55 B; 2RN9 A; 4YJ3 A; 3WU2 Z; 5IWA O; 1UFI A; 3ZS8 C; 3JD0 A; 2ITD C; 3KCX A; 4PJ0 Z; 5EZY A; 1YVW A; 3CCV V; 3JAW A; 3RFR A; 3F7V C; 1KC8 W; 1I5Y A; 4RUE A; 2Y4T A; 4MVZ A; 4FZ0 A; 2VQF B; 2VQE O; 2D2C B; 1JX9 A; 3KKY A; 1PP9 H; 2WLL B; 5L3B A; 1M5I A; 2VRZ A; 1NKD A; 1WA8 B; 1Y4M A; 2XAS A; 3ZRW A; 3OT7 A; 2V4D A; 4K35 A; 2DOS A; 5LYJ A; 5LP6 C; 2FKX A; 4FMT A; 3E22 B; 4J80 A; 3AG3 C; 1H2N A; 1RP3 B; 1OCC B; 1XDC A; 4DW1 A; 2AZ2 A; 4W4L A; 2F66 C; 4B3M O; 4H37 A; 1MAB G; 4FZ1 A; 5L3E A; 2ZCE A; 3CCS V; 4JPR A; 4LH7 A; 4QPJ A; 3WFV A; 4PDR A; 3RVZ A; 2M7W A; 2C2A A; 2QTO A; 4OX9 B; 1Z5V A; 3VOU A; 3BCC H; 3R65 A; 5KHH A; 2OTJ V; 2JIZ G; 3E35 A; 1AI4 A; 1NTK H; 5JVD A; 3SGI A; 4KXR A; 5CB4 B; 2EX3 A; 1Y74 A; 3VBB A; 4CS4 A; 1M4U A; 3ZHR A; 4NTW A; 1Y76 B; 2QM7 A; 2Q8V A; 2ZIO A; 3JAS B; 4P9O A; 2XT9 A; 4RQF A; 1VQ9 V; 4IIJ B; 4BIO A; 1BQZ A; 4FJC C; 3SDL A; 1KQS U; 2ZE8 A; 4F6R B; 4U3F H; 2OCH A; 4IHJ B; 2ZE5 A; 4UVB A; 1NTZ H; 4Z1M G; 1DK1 A; 2BSK B; 4HNA A; 3OMI B; 3L74 H; 3GVM A; 2EIM B; 3KG2 A; 3CRC A; 4JI4 B; 3K5N A; 1COW G; 2DYS B; 4JI7 B; 3ABL C; 1R3L C; 4YIP A; 5LMN B; 2W0X A; 2GV9 A; 4LF6 O; 2ZE6 A; 2PY5 A; 2PGG A; 3CJH B; 1GRJ A; 1S3J A; 1P4R A; 4NXM O; 3UQ8 A; 4B7K A; 4GUN A; 5LL6 Y; 4JTA B; 2HHH O; 5LA6 B; 2ODM A; 3U10 A; 4UUJ C; 4MVS A; 1AJP A; 2CE4 A; 4O4L A; 1M56 B; 3FFQ A; 1M1K W; 2OIE A; 1JA8 A; 1NBM G; 4TV8 A; 3FB8 C; 4HAM A; 3OD4 A; 4WFE A; 1EN4 A; 2JK5 C; 5ITZ A; 2HR3 A; 2XHB A; 4I55 B; 2LQT A; 4EFB A; 2LP7 A; 2QSA A; 1S72 V; 3SPH A; 3ZHS A; 1YJ9 V; 3C3T A; 3JAK A; 4JI6 B; 4EFE A; 4O4J A; 4CZZ A; 2YC0 A; 2BTQ A; 2L35 A; 1HR0 O; 3JAT B; 1NS1 A; 1B06 A; 2FML A; 4ZIB A; 1HNZ B; 4DUZ B; 1AR1 B; 2DN9 A; 4RUF A; 1N0N A; 3JCU Z; 1I94 O; 1FJG O; 1YSC A; 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