The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
38
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sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
b'DAHIPQLIASEANFGAKAALMRSTIAQAEQAAMSSQAFHMGEASAAFQAAHARFVEVSAKVNALLDIAQLNIGDAASSYVAQDAAAASTY'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pe family protein
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| molecule tags |
Metal transport
|
| source organism |
Mycobacterium smegmatis
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| publication title |
Heterologous expression of mycobacterial Esx complexes in Escherichia coli for structural studies is facilitated by the use of maltose binding protein fusions.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
38
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| structure length |
90
|
| sequence length |
90
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | ESAT-6-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3O9O A; 1WA8 A; 4I0X A; 3Q4H B; 3G80 A; 2B9Z A; 4GZR B; 3FAV A; 2AZ0 A; 4LWS A; 3HR0 A; 2VS0 A; 3TXS A; 4I0X B; 3TXQ A; 3OGI B; 3Q4H A; 4ABM A; 3GVM A; 3FD9 A; 2VRZ A; 2KG7 B; 3ZBH A; 2DE0 X; 3GWK C; 2KG7 A; 1WA8 B; 3FAV B; 4LWS B; 2AZ2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GKK B; 1W2B U; 5KMG A; 3CCU V; 3M99 B; 2E76 B; 4J11 A; 3TJT A; 1K34 A; 5L3F A; 3FB8 C; 2YIC A; 3ZHR A; 4GX1 A; 2IJJ A; 2DJV A; 1GM9 A; 3BAB A; 4PA4 A; 4TQF A; 3EFF K; 3U0Z A; 1G1X B; 1IXB A; 2P67 A; 2DE0 X; 1YIJ V; 3B40 A; 4LFA B; 2Q9L A; 4JI1 B; 1WA8 B; 1YVW A; 2M7W A; 4Z1V A; 1N36 B; 1V55 B; 3CP1 A; 4YIO A; 1KB9 F; 5FPR A; 1HNW B; 2ITC C; 2Y69 C; 1N32 O; 3LDE A; 2WA3 A; 3RGB A; 3RN4 A; 4J10 A; 4J41 A; 2CGO A; 4JI3 B; 1VQK V; 2Q6A A; 4UCS A; 3ABK B; 4PDL A; 1XUQ A; 2PTM A; 3OMN B; 1ENV A; 2QWR B; 5LA6 B; 4NXN B; 2HVK C; 5EZY B; 2RMK B; 4KHP O; 2JGU A; 1Z5W A; 3RWR D; 4LF7 O; 3E2E A; 4O4H A; 1JVM A; 3DXR B; 2LFR A; 5KUK A; 1LNQ A; 5A9G A; 4JI7 B; 1MZE A; 3JAS B; 1AR5 A; 4FLU A; 4YHH B; 4UCT A; 2JS5 A; 4RWU A; 1NTZ H; 3C90 A; 5CBF A; 1H2S B; 4MVM A; 1D2D A; 2AZ2 A; 2UXC O; 3P30 A; 4Z1M G; 2FB5 A; 1BHA A; 1K92 A; 3JAK B; 4UCV A; 2F23 A; 2HJD A; 2ADQ B; 4FPP A; 3CEI A; 2UXX A; 3B2E E; 3X2Q B; 4LNU B; 4JYA B; 2ZE6 A; 4YY3 O; 2RJZ A; 3SYA A; 1SQP H; 1FXK C; 1X4T A; 4LF4 O; 4MTG A; 3G71 V; 2A06 H; 1QVF U; 1XNQ O; 3ASN B; 2QTS A; 2V7Q G; 2ZDI C; 5EYP A; 1KP2 A; 1WJZ A; 5JVD B; 2ZQM A; 3F5W C; 1VQ6 V; 2BSK A; 2BTQ A; 3HR0 A; 1JFF B; 2ADP A; 1F4M A; 2HFE C; 3NR7 A; 4I55 A; 3OTF A; 2F93 B; 2X0L A; 1TVK A; 3L75 H; 1VQ8 V; 2B1I A; 3OMA B; 2R9I A; 1VQL V; 3T4D A; 2QA4 V; 4FFB B; 4R50 A; 3O9O A; 1WPB A; 4QPK A; 3JSN A; 4U7O A; 1R3I C; 4PI2 A; 4X1K A; 3ZMZ A; 2EBO A; 4LR3 A; 2LW1 A; 4RUE A; 1QNM A; 3EVK A; 3RYC B; 1VQ4 V; 1GN6 A; 3E86 A; 3ZN1 A; 1THZ A; 3CC2 V; 3LDD A; 5KAF Z; 3FYI B; 2DWE C; 2DW4 A; 2UU9 O; 2CTW A; 5IY5 B; 1E1R G; 4DR5 O; 3APQ A; 2VQF B; 1V54 B; 3QF7 A; 1D5A A; 2GUZ B; 1P7G A; 2LJ2 A; 1KQS U; 2UXB O; 1NKD A; 2H3O A; 4RUF A; 1MZF A; 5IJ9 A; 2EJ7 A; 1H38 A; 1JR9 A; 4J7J A; 4X65 B; 3ETG A; 1SS3 A; 1VF6 A; 1NTM H; 1VQP V; 3C3T A; 2K9P A; 4GT1 A; 1FD9 A; 2QSA A; 4IHJ B; 2YC0 A; 3T1H O; 4FLX A; 2CDY A; 3ZHT A; 4LF7 B; 1CEZ A; 1TUB A; 2QEX V; 3QO5 A; 4LF8 B; 4DXW A; 4FZ1 A; 2LO1 A; 1BQZ A; 2YI9 A; 2O57 A; 1OCR B; 2IJH A; 5JVD A; 4WFE A; 2Y4T A; 3CCV V; 3P32 A; 1PP9 H; 1W0J G; 1VAR A; 4IGG A; 5GON A; 4X1Y A; 2CUG A; 1OZ0 A; 1Q5O A; 3ASO B; 2Y48 A; 3L9D A; 3JSL A; 2KG7 A; 3E83 A; 3ZHQ A; 4IL6 Z; 2JJ1 G; 5L3E A; 3CCR V; 2IU3 A; 4LF6 O; 1R6K A; 4JI7 O; 2K1E A; 2ZR2 A; 1FXK A; 3F7Y C; 1BL8 A; 3QO8 A; 3AEI A; 2KSD A; 4WBN B; 4IIJ A; 1KEC A; 1LR1 A; 1BCC H; 1YDX A; 1VF7 A; 1Y4M A; 3D3I A; 1AP6 A; 4I5S A; 1KD1 W; 5DEC A; 1BQ0 A; 2IJK A; 4FM0 A; 4PDV A; 1DF4 A; 4X65 O; 2YXY A; 4JV5 B; 4DR4 B; 3ZRW B; 3VQW A; 3CRQ A; 4X1Y B; 3TK1 A; 2YDE A; 4D6T H; 2F95 B; 5H6R A; 1M9N A; 2DN9 A; 2B1G A; 4JI3 O; 4JYA O; 3IGA C; 3ZBH A; 1YF2 A; 4X20 B; 4X20 A; 3UQ8 A; 3VOU A; 3ZJZ A; 3ZHU A; 3RYI A; 3K9A A; 2IU0 A; 2P4K A; 2YIA A; 1B6Q A; 2AGA A; 1YCI A; 2PYL A; 4I0X B; 3JAW B; 3RFR A; 3RW0 A; 4LC1 A; 3WU2 Z; 4ZHQ B; 4KUM A; 3KKY A; 5EC2 C; 1ZAU A; 3KZI Z; 3S3X A; 4H13 B; 5CB4 B; 3FAV B; 3JAR B; 2UUA O; 3HKC A; 4QNH B; 2PYJ A; 2OCH A; 2LQT A; 4F4L A; 4TV9 A; 3RYF A; 5D5P A; 4JI8 B; 2YSU B; 1H2G A; 4TSF G; 4O2A A; 1BMF G; 3E8F A; 2WLL A; 1PNK A; 2ILM A; 3OFN G; 4U3J B; 5KHI A; 3N2K A; 2YUA A; 4MTO A; 4DR7 O; 1L1F A; 1ZWI C; 5H9C A; 5LHG A; 3K5M A; 4FM1 A; 3HKD A; 4UCR A; 1Q6H A; 2UU9 B; 3TET A; 2B9Z A; 3JAM N; 4DV0 B; 4F6E A; 3ZMU A; 1TUB B; 3ZN0 A; 5B1B C; 4D7S A; 1NJI W; 4RQE A; 1B04 A; 3OT7 A; 5LYJ A; 1NTK H; 3G6E V; 2OIG A; 3K03 A; 4EEQ A; 1XL4 A; 2HLD G; 3GWK C; 2ZE5 A; 2QM8 A; 4IT5 A; 1MMM A; 1E1Q G; 4JI0 B; 4B3R B; 5DN6 G; 4NXN O; 4N21 A; 2Z3Y A; 3ZMS A; 5D5Q A; 2ARH A; 4PEL A; 1TGO A; 4QGP A; 1F51 A; 2H94 A; 3TCU A; 4ZKI A; 4LF4 B; 1SQV H; 3W7X A; 2N04 A; 3K08 A; 3OUS A; 1XNR B; 5K1P A; 3E8H A; 3OGI B; 3AG3 C; 4ZOL A; 4MSW C; 4EB6 B; 1NU1 H; 1ZL8 A; 4X89 A; 5GTI Z; 2QKC A; 1F4N A; 4JGS A; 2UXC B; 1IX9 A; 1AI7 A; 1PM9 A; 3SPI A; 4HAM A; 3AK2 A; 1H2L A; 4HYO A; 4PD4 F; 2BCC H; 2IJI A; 3DSQ A; 3FD9 A; 2ZIN A; 2Q5Z A; 1GN2 A; 3CSX A; 5JH7 A; 3M7M X; 1EN6 A; 4F6R A; 4JI5 O; 1XI1 A; 1R3L C; 3A0H Z; 1HW7 A; 1CP9 A; 2YI8 A; 1G4Y B; 3ABL B; 2UXD O; 3BHP A; 1AR1 B; 4O4I A; 5KHK A; 1J5E B; 5CB4 A; 3UO3 A; 1M57 C; 3T2M A; 3ZHV A; 4BWA A; 2GSM B; 2N74 A; 3SJC C; 4I0X A; 4YXW G; 5KHG A; 1GK9 A; 3P3P A; 3W7T A; 1Q7Y W; 1OCO C; 1RSO B; 1S5J A; 5LMU O; 3E8B A; 1XHZ A; 2EIN C; 2JK5 C; 4GX0 A; 1XNR O; 4FLY A; 2JS3 A; 4LP8 A; 4MVQ A; 4MVS A; 3FB6 C; 3ETD A; 1RPR A; 4O4I B; 1ZUQ A; 1EZJ A; 4G27 B; 1VQM V; 3RYH A; 2RCV A; 3L70 H; 1SQX H; 5HFM A; 4JV5 O; 4P9O A; 5CMU A; 4J9Y B; 2YEV A; 4K8X A; 2ZNI A; 4BIU A; 4B3S B; 2GBO A; 3ZMV A; 1K4D C; 4WBN A; 1XDC A; 3UCS C; 5L3G A; 5J2T A; 4MW8 A; 4BR6 A; 1BT8 A; 3CRA A; 3HKB A; 3SPJ A; 4JI5 B; 1FXV A; 2NLJ C; 5FLX N; 1NQT A; 3DGE A; 2FL4 A; 4X64 B; 2AXT Z; 2WA4 A; 3RYI B; 1Q8I A; 2W0F C; 3CCL V; 4P9P A; 2QM4 A; 1L0L H; 2YIB D; 1J5E O; 2KG7 B; 1COW G; 3BY6 A; 2EZO A; 4A5U B; 2OIE A; 1P49 A; 3ETE A; 1QHT A; 3ABT A; 4X1I A; 5JJJ B; 4JYC A; 4DRX B; 4KP4 A; 5IT9 N; 1YXB A; 1JA8 A; 2P6J A; 4CS3 A; 2A3Q A; 1M56 B; 3E89 A; 1QLE B; 4WCE V; 1V9P A; 4CH6 A; 1VQ7 V; 3ZX6 A; 3ETQ A; 3CRC A; 5C8Y A; 2OTJ V; 5K1X A; 2A79 B; 3JD2 A; 4TV9 B; 2XUM A; 1VF6 C; 5BR8 O; 4X9Q A; 4UVB A; 3N27 A; 4RAI A; 1DGS A; 4FJC C; 4U3F H; 1T5E A; 2MK3 A; 4XDJ A; 1HNW O; 1N32 B; 5AG2 A; 2DYS C; 2EIK B; 2E74 B; 1US6 A; 2EIM C; 1GMG A; 1AB3 A; 1IBM O; 1K7D A; 4O4L A; 4GZR B; 3W7U A; 1M57 B; 5FPO A; 4LNU A; 3IC7 A; 3SDL A; 5E1A C; 4JI2 B; 3AG2 B; 2FYU H; 1GO3 F; 3LSS A; 1JOY A; 1HNZ B; 1ZL8 B; 4CC5 A; 3SPH A; 2GTS A; 3WB2 A; 4K0K B; 3L73 H; 2KKW A; 4OPH A; 1VF5 B; 4NYK A; 4JI0 O; 4B3R O; 4GKJ O; 5H6Q A; 1OCC B; 3FKS G; 5IJ0 A; 1I94 O; 1R1B A; 4LCU C; 4PV1 B; 2BOC C; 4DW0 A; 4DR7 B; 4JI4 O; 5LXT A; 4DYL A; 2YXH A; 5JJN B; 3DXR A; 3P3N A; 1W59 A; 4QIW F; 5J2U A; 3H1K H; 1FKA O; 5B5E Z; 5IE9 A; 5J9P C; 1SES A; 4UCO A; 3K5L A; 5KA5 A; 4DUY B; 4G28 B; 2JGD B; 2XHB A; 2NNU A; 4XDL A; 4TWK A; 1R3K C; 1EBO A; 2FTK A; 3H1L H; 2WLM A; 2N05 A; 1NT2 B; 1R6T A; 1I5X A; 3B8M A; 5KA6 A; 3MHH C; 1MSW D; 5FL7 G; 3PJS K; 2QWN B; 2IBZ H; 3Q4H B; 3OUF A; 3H1H H; 1ZLZ A; 4DR3 O; 5KLV H; 4J7Z A; 1RPO A; 3FB7 C; 3BPZ A; 4O4H B; 4UVA A; 3T1Y O; 4UUJ C; 3H1J H; 2Q0A A; 3RVY A; 3CPW U; 4MTX A; 3HKE A; 2Q7E A; 4E4E A; 4K0K O; 2LGQ A; 2F1M A; 3QTC A; 2ZE7 A; 4P30 A; 2V4D A; 3CCJ V; 3AG4 C; 4TV8 A; 1FS0 G; 1KKD A; 5CN0 A; 4DV5 O; 5C8Y B; 4I9W A; 1SQG A; 1PKX A; 3QNE A; 3HKC B; 2UUB B; 5BZB A; 4CS4 A; 3K04 A; 2HKO A; 4X66 O; 5LMN B; 1KC8 W; 1RSO A; 4DR5 B; 1SER A; 2WLI A; 4LH6 A; 4O4L B; 5BY1 A; 1NR7 A; 3SPC A; 4DUZ B; 2PY5 A; 2IH3 C; 1NZ6 A; 4CH3 A; 5A2Q N; 3MAQ A; 4KXR A; 2CE4 A; 3CCM V; 4DUY O; 2Q0O C; 3CD6 V; 1RP3 B; 2XAH A; 1H8E G; 3TXQ A; 1P7B A; 3ASN C; 1QCE A; 5LHI A; 4NTY A; 3J81 N; 2E3C A; 3DC6 A; 4H37 A; 4LF5 O; 1YJN V; 2DQ3 A; 3TGU H; 1SQF A; 2HVJ C; 3FX7 A; 2RNB A; 1K5S A; 4JAS A; 5JH7 B; 1YHQ V; 1Q81 W; 2OCC B; 3I55 V; 4DV4 O; 2KB1 A; 2VWK A; 1ROP A; 3UT5 A; 5IJ9 B; 4J80 A; 3R65 A; 4GCZ A; 1RFY A; 2VQE B; 5B1N A; 2QGN A; 1QLN A; 1W0K G; 3QG5 A; 4OXS A; 1RM1 B; 5EBW C; 4PA6 A; 4UCU A; 3S3W A; 2VS0 A; 4GX2 A; 4JI6 B; 2P22 C; 1JCH A; 3F5T A; 5B1B B; 5JCO A; 1PD3 A; 2JVD A; 2ATK C; 1SQQ H; 1G6U A; 4IYI A; 2QTO A; 1V54 C; 1UPG A; 4CH5 A; 1EZV H; 1HR0 O; 3EHB B; 5B1O A; 1Y74 B; 2YS8 A; 4LF9 O; 1XRE A; 5IYC O; 4MVU A; 5BXZ A; 1Y67 A; 2WSS G; 4X62 O; 1OCR C; 2G38 A; 1EFR G; 2QWP B; 2XND G; 2QE7 G; 3UO2 A; 4D7T A; 4DR4 O; 5B1A B; 5CBH A; 4MVR A; 4TOI A; 2VWJ A; 1PNM A; 2A7W A; 3ZHS A; 5IDJ A; 2P06 A; 1IXM A; 1KYO F; 1QU7 A; 1SA0 B; 2EUL A; 1YEW A; 5BMV A; 3FYE B; 2ZIM A; 2R9R B; 5CBG A; 1DTO A; 3ABM C; 4MS2 A; 2E5L B; 2QKA A; 1Y74 A; 4ABM A; 1YI2 V; 1Y66 A; 4DV1 O; 4HZ3 A; 3AG1 C; 4FMT A; 4B7E A; 1VQ5 V; 1U96 A; 4LBE C; 2UUB O; 5ITZ A; 1KUQ A; 3L74 H; 3JAK A; 3A8T A; 3JAT A; 1VQO V; 1F23 A; 4ASU G; 5IYZ A; 3MHS C; 3ZED A; 1KP3 A; 3AG7 A; 2Q73 A; 5LOV B; 4IHJ A; 1DLB A; 1NS1 A; 5BR8 B; 5LP6 A; 3K0G A; 4MVZ A; 4PDR A; 1VMG A; 2LFS A; 3SYP A; 1CXZ B; 3JAR A; 3OEE G; 2UXB B; 4FLW A; 3W7W A; 3UT5 B; 3CRR A; 4DV5 B; 3CJH A; 3GB7 C; 4DV2 B; 4MTF A; 3OGC C; 2NN4 A; 5LP6 B; 2WLH A; 5F2V O; 4X62 B; 3BA8 A; 1H2K A; 3JD4 A; 2DWD C; 1OCO B; 4LFB B; 4DV4 B; 2QJ1 A; 4PA7 A; 4ZI7 A; 2DYR B; 4AHC A; 1O9H A; 1VP7 A; 2CAZ C; 1M93 A; 4TUY B; 3CMA V; 1BSM A; 5IYZ B; 4LFC O; 2QKS A; 2OTL V; 3DTU B; 3SYQ A; 3LNM B; 4DR2 O; 1FAF A; 3VQX A; 3NXS A; 4WF9 V; 1ZX3 A; 4CH4 A; 4NTX A; 3A2F A; 3STL C; 1LUV A; 4L87 A; 1NR1 A; 4FM2 A; 2XAS A; 5IYD O; 3AK3 A; 1S5L Z; 1IBM B; 1N34 B; 4BAY A; 3BFR A; 4O2A B; 1MNG A; 1VQN V; 1K9M W; 1G8M A; 4DR1 B; 1N33 O; 4AQY B; 4X66 B; 4LF9 B; 3J7A U; 1XL6 A; 2ZXW B; 5LGT A; 1S3J A; 4WFA V; 4LF6 B; 3U11 A; 3G6B A; 4TT3 G; 2R70 A; 1I94 B; 3SGI A; 2R9A A; 2C2A A; 4CC6 A; 4JI4 B; 3FAV A; 4JI1 O; 1YTF D; 1H2M A; 2IW5 A; 1FFX B; 3JYC A; 2R72 A; 1D5N A; 4LF5 B; 4I50 A; 4P2Z A; 3ABM B; 1HR0 B; 2BOB C; 1NH2 D; 2F66 C; 1GH6 A; 1PPJ H; 2EIL B; 1EM1 A; 2HJF C; 4DV1 B; 1ZTE A; 3RYC A; 5LL6 Y; 5KUM A; 5JWP A; 2WPD G; 3T1C A; 4TQD A; 2X6B A; 4NXM O; 2WLL B; 4FK5 C; 2GDS A; 1DK1 A; 3LSU A; 1AP5 A; 2XOK G; 4DO2 A; 5GTH Z; 1K73 W; 5IWA O; 3RYF B; 2VQE O; 1HNX O; 4NR1 A; 2WLK A; 4B7K A; 3E22 B; 5LMN O; 2ZNJ A; 2AW9 A; 2JEU A; 3CWB H; 2PI5 A; 1AJQ A; 1BE3 H; 3D36 A; 1NBM G; 5CA0 A; 3BVO A; 3T1Y B; 1OJH A; 1HP8 A; 2DQ0 A; 2BTQ B; 3K59 A; 1VQ9 V; 3EXA A; 3AG2 C; 3G67 A; 3OE7 G; 4DR6 O; 1S72 V; 1IVS A; 3OD4 A; 1B06 A; 1M56 C; 1Q3E A; 4ZOL B; 1PL0 A; 3KG2 A; 4JAV A; 5DED A; 1M1K W; 2DYR C; 4I50 B; 3OTO O; 2XTA A; 1QBZ A; 2B5U A; 2PGG A; 2PUS A; 4LFC B; 1RM1 C; 3ZMT A; 2CH7 A; 2JJ2 G; 4J9Z B; 2CTQ A; 2Y69 B; 3CCQ V; 2EX3 A; 3ABL C; 3JCU Z; 4ICG A; 4DUZ O; 4W4K A; 1XMQ B; 3M8A A; 4FFK A; 2Q7G A; 2P4V A; 2W6J G; 2UUC O; 2JGD A; 4JTD B; 2LW7 A; 3I5D A; 2EIK C; 3B8N A; 3GWO A; 4UFZ A; 5C93 A; 4DV2 O; 1Q82 W; 2E5L O; 1NVP B; 1TUE B; 5H5N A; 2KQX A; 3L72 H; 5CA0 B; 4W4L A; 4PHZ A; 5E79 Z; 3IJ4 A; 4LH7 A; 1KU9 A; 1HDJ A; 1JX9 A; 4J7K A; 4DV6 B; 3CE2 A; 5EYP B; 4LWS B; 1KBH A; 1Q43 A; 2Q67 A; 1K8A W; 1X59 A; 3SJA C; 4JTC B; 4JZG A; 2CH7 B; 4UV9 A; 5LXT B; 1ZSP A; 2ZXW C; 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