The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
38
|
sequence length |
90
|
structure length |
90
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Chain Sequence |
DAHIPQLIASEANFGAKAALMRSTIAQAEQAAMSSQAFHMGEASAAFQAAHARFVEVSAKVNALLDIAQLNIGDAASSYVAQDAAAASTY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pe family protein
|
| publication title |
Heterologous expression of mycobacterial Esx complexes in Escherichia coli for structural studies is facilitated by the use of maltose binding protein fusions.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mycobacterium smegmatis
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| molecule tags |
Metal transport
|
| total genus |
38
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| structure length |
90
|
| sequence length |
90
|
| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-12-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | ESAT-6-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DE0 X; 4ABM A; 3O9O A; 3GWK C; 4LWS B; 3TXQ A; 1WA8 A; 3FAV B; 3ZBH A; 4I0X B; 2B9Z A; 2KG7 B; 4LWS A; 2AZ2 A; 3G80 A; 3FAV A; 2AZ0 A; 2VRZ A; 4I0X A; 3Q4H B; 2KG7 A; 4GZR B; 3OGI B; 3TXS A; 2VS0 A; 3FD9 A; 3HR0 A; 3Q4H A; 3GVM A; 1WA8 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1IBL B; 3R65 A; 4NXN B; 3RYH A; 1H2S B; 4UCO A; 2PTM A; 1HW7 A; 1M57 B; 2Z3Y A; 1I94 B; 1YHQ V; 2XND G; 4CH3 A; 2IU3 A; 2JJ1 G; 4I9Q A; 3X2Q C; 2EIL C; 4UCU A; 4ASU G; 3OR6 C; 4HYO A; 2A79 B; 3B09 A; 2HG5 C; 1A32 A; 2QA4 V; 4PV1 B; 3RVZ A; 3A8T A; 3ZRW A; 4JF3 A; 1V55 C; 1BL8 A; 3ABL C; 2PUS A; 3DC5 A; 4GUN A; 2Q9L A; 1DF5 A; 4O2A B; 4CS3 A; 4K8X A; 2UXN A; 4NKG B; 2ZE8 A; 3R66 A; 3LSQ A; 4GKJ O; 2JGD B; 4IIJ A; 3WG7 C; 1NR1 A; 2AW9 A; 3KG2 A; 5ITZ B; 1VQN V; 2O57 A; 1LUV A; 3JAS A; 3VQX A; 1Q3E A; 3DSQ A; 3OMN B; 5CA1 B; 4JI4 O; 3ZMS A; 1US6 A; 3WFV A; 5KHJ A; 5IYD O; 1UFI A; 4RO2 A; 5JH7 A; 4PA7 A; 5LHG A; 4HNA A; 2IJK A; 3FB6 C; 4DV1 B; 2Y4T A; 1XDC A; 2QKS A; 3FB7 C; 5H2F Z; 3K9S A; 3F5W C; 1MNG A; 3AG4 B; 5D5P A; 4FLU A; 1MAB G; 2ZM6 B; 3L9D A; 3OTO B; 3BRC A; 4O4I B; 1NJI W; 2QM8 A; 3SPC A; 4DV0 O; 1GN3 A; 2NNU A; 2ZIN A; 3E35 A; 3GWK C; 1Q8I A; 1IX9 A; 4DRX A; 4JI2 B; 2ZD9 A; 1Q7Y W; 2DMX A; 1RPR A; 1RPO A; 3CYO A; 3CMA V; 1GKF A; 4TWK A; 4JYA O; 1MZE A; 2GUZ B; 5FL7 G; 2C2A A; 3C3T A; 4UV8 A; 1ZTE A; 2YI8 A; 1BGY H; 1J5E O; 2LP7 A; 3GVM A; 4LNU A; 4UFZ A; 3LDE A; 3ZHS A; 2NN4 A; 4QPJ A; 4I4T A; 2GSM B; 4YXW G; 5LOV A; 3EHB B; 4DV3 O; 4X62 O; 4FZ0 A; 4MVO A; 5GON B; 4BWA A; 2GHY A; 4YY3 O; 1Q5O A; 1SQV H; 4FLW A; 2WLL A; 3ABK B; 2Q68 A; 4J9Z B; 1QHT A; 4R50 A; 1KD1 W; 1PD3 A; 4DO2 A; 2HJF C; 2Q0A A; 1M5I A; 4GKJ B; 2HEP A; 1TVK B; 1NR7 A; 5J2T B; 3AEI A; 4P30 A; 3SJB C; 4UVA A; 2EIJ B; 2Y4U A; 1VQK V; 2ZR3 A; 4MTG A; 4TUY A; 2OIG A; 4IYH A; 4YJ3 B; 4XDL A; 4D6T H; 4LF5 O; 3AG2 B; 3BHP A; 3JAT A; 4JAV A; 4QPK A; 2EJ7 A; 4TQF A; 5L3B A; 1Q82 W; 3QTC A; 3JSL A; 5LBQ A; 3N2G A; 3ZBH A; 3B77 A; 4I0X B; 4DR1 B; 1K3E A; 4R6Z A; 2IW5 A; 2ZR2 A; 2RMK B; 1H2K A; 4OXS A; 2XHB A; 3A0H Z; 1FD9 A; 4DV0 B; 3N2K B; 4PDM A; 5CA0 A; 3SGI A; 4JI1 O; 3E22 A; 3G67 A; 1AR4 A; 2RCV A; 4MVZ A; 3JAM N; 2W6J G; 2OT5 A; 3ETE A; 2ZCE A; 2EIN B; 1NT2 B; 4YJ2 A; 4OX9 B; 2Q69 A; 1VQP V; 1CPY A; 1XOU A; 4DK0 A; 4GKK O; 3OT7 A; 1R3L C; 4GX5 A; 5HFM A; 5JVD B; 1KMI Z; 1XL4 A; 1J5E B; 2P67 A; 3HKE A; 1THZ A; 3FFQ A; 1KP3 A; 1N33 O; 1K4C C; 1WP8 A; 3W7T A; 4ZI7 B; 2Y69 B; 3O9O A; 4DUZ O; 4JI6 O; 4DV3 B; 4DK1 A; 1NVP B; 1IXM A; 2ZXW B; 2AZ2 A; 2W0X A; 1NH2 D; 3SPJ A; 1PL4 A; 3RYH B; 2K1E A; 4PI2 A; 1K73 W; 1K92 A; 2YI9 A; 2CTW A; 1JOY A; 3K06 A; 2OTJ V; 4TV8 A; 3ASN B; 3WB2 A; 3W7W A; 4DR7 B; 4DV5 O; 4JI0 B; 1Y67 A; 3ML0 A; 1IUR A; 2BCC H; 1V54 B; 4MTX A; 3VQW A; 2XAQ A; 2QEX V; 2ATK C; 3I56 V; 3ZRW B; 2PZS A; 4KP4 A; 5KHG A; 3SYP A; 2HP8 A; 3E8G A; 5J2U A; 2EIM B; 1Q6I A; 1D5N A; 1WP7 A; 3OMI B; 4IIJ B; 2X7R B; 4NTY A; 3K5M A; 3JAS B; 2ADQ B; 1R6T A; 2WA3 A; 2DYR B; 3BAB A; 2WPD G; 1NQT A; 3SR2 C; 5JH7 B; 4HNA B; 2IJJ A; 3CB2 A; 3E8B A; 4B7E A; 2DJV A; 1FKA O; 3RW0 A; 3CPW U; 1YTF D; 2VWJ A; 1NH2 B; 4O2B A; 1SKV A; 4H0L B; 4I7Z B; 1I5X A; 5EYP A; 1Q43 A; 2UXC O; 5KHK A; 3VOU A; 2R72 A; 1N33 B; 4JI6 B; 4K8Z A; 4DRX B; 5H9C A; 1ZX3 A; 2L6L A; 4F6R A; 3T4D A; 1GM9 A; 4DUY O; 2YIB A; 4J7K A; 3STL C; 1OCR C; 3K57 A; 1R3J C; 4JZ2 A; 1QNM A; 1QU7 A; 2Q73 A; 4NYK A; 2YSU B; 3ZHQ A; 4B3M O; 3ZMT A; 1Z5V A; 2G38 A; 4BR6 A; 4AI8 A; 1AJQ A; 2JS3 A; 3H1H H; 4LNU B; 1XNR O; 3H9V A; 4DR5 B; 3OGI B; 4WFH A; 2XOK G; 4U7N A; 4I4T B; 5IYB O; 2ZNJ A; 4LBE C; 5LOV B; 1AI5 A; 1QLE B; 4DV5 B; 4MSW C; 4GX2 A; 1BSM A; 1ZUQ A; 4KXR A; 3CCU V; 3APO A; 1YI2 V; 2WLL B; 4JTC B; 4DW0 A; 2LFR A; 2M6Y A; 1YJ9 V; 3K58 A; 5B1B B; 2ILM A; 3CCL V; 1YTF B; 4LF6 B; 1BMF G; 4LF9 O; 3TXQ A; 4PI0 A; 3U0Z A; 3T1Y O; 2GDS A; 3B8M A; 4PDL A; 3SJA C; 4TUY B; 4YHH O; 2DYS B; 1GAX A; 1KBH A; 3JAT B; 3IC9 A; 4RAI A; 2VQE O; 3OGC C; 4IL6 Z; 3N2G B; 2DE0 X; 2ZKO A; 2H3O A; 2Z0A A; 2QM4 A; 2V7Q G; 1SET A; 2HHH B; 1ZAU A; 5CA0 B; 2DWD C; 3ABM B; 2Y0I A; 3E22 B; 2CTR A; 1N8R W; 4PDR A; 5KA5 A; 5BXZ A; 4NR1 A; 4PDV A; 3CCM V; 3JSN A; 4X66 B; 4YJ2 B; 1VQO V; 4LF7 O; 5EBW C; 1XI1 A; 3VQV A; 2H8P C; 2X6C A; 3DXR A; 1XUQ A; 5KHI A; 3ZMV A; 5JCO C; 1XNR B; 3CRQ A; 3HKE B; 1DTO A; 2PI4 A; 2OYQ A; 4LC1 A; 3RVY A; 1H2N A; 3UQ8 A; 5B1A B; 3SYO A; 2ZE7 A; 5H5N A; 3AG1 B; 5EZY A; 4EFE A; 2XT9 A; 2IJH A; 3UKM A; 3HPL C; 3WU2 Z; 2P4V A; 2ZDI C; 3ICX A; 2XAG A; 1NI8 A; 1GTO A; 4WFF A; 1Q6H A; 3ETD A; 5JQG A; 4O4H A; 2EBO A; 4FM1 A; 3FAV A; 4X65 O; 2Z5U A; 4WFA V; 1K5S A; 1E79 G; 3E2E A; 2OIE A; 2X0L A; 2WAM A; 3CWB H; 3THO A; 2ZE5 A; 3E86 A; 5KUK A; 1XMQ B; 4TV8 B; 5LXT A; 1MA1 A; 4O4J A; 3X2Q B; 2EIL B; 3L72 H; 4YHH B; 4LF4 O; 1VEW A; 1YF2 A; 2ADP A; 4MVR A; 4BW9 A; 1JJO A; 3UT5 A; 4MVU A; 1JVM A; 4BW5 A; 4CH4 A; 4DV6 O; 2VQE B; 3OFN G; 4UB8 Z; 4GT1 A; 4B7K A; 4FK5 C; 2ZQM A; 1V55 B; 3ABL B; 3OUF A; 2Q4P A; 4K35 A; 4AHC A; 3T1H O; 5J2U B; 1AIL A; 4W4L A; 4FLV A; 1K97 A; 2WSS G; 5LGU A; 5CBH A; 2QTO A; 1PL0 A; 3WG7 B; 4CZZ A; 3ZMZ A; 1T5E A; 1AP5 A; 2E5L O; 2WLH A; 2FKX A; 3IJ4 A; 4J11 A; 2UXD O; 3RYF A; 2PGG A; 4D7T A; 4LF7 B; 3D36 C; 2PYJ A; 2ETN A; 3MAQ A; 4UV9 A; 3W7S A; 4O2B B; 4WFE A; 1R73 A; 4ZKI A; 5CN0 A; 3AK1 A; 5EYP B; 2YXL A; 4I5S A; 3ASO B; 2XAH A; 4UCT A; 1GN4 A; 4ZOL A; 1K8A W; 2OWO A; 2CAZ C; 1CXZ B; 4FLT A; 1P7B A; 1VQ4 V; 2UU9 O; 1N36 B; 1SES A; 2Q7H A; 2LJ2 A; 4Q20 A; 3RYI A; 4F6R B; 1Q86 W; 3IAY A; 2A3Q A; 1R3K C; 1G8M A; 5KMG A; 1ZSP A; 3QNE A; 3W7X A; 1AVM A; 4J80 A; 4DR3 O; 2HLD G; 4X65 B; 1HNX O; 2Q7E A; 1HNW B; 4EFB A; 1BQ0 A; 1FPO A; 3WB1 A; 3FB8 C; 3ZX6 A; 2EIK C; 4PEL A; 4LFC O; 4FZ1 A; 2QJ1 A; 4O4L A; 1DGS A; 1FYJ A; 4OPH A; 4LF4 B; 5A2Q N; 1SC5 B; 1N32 B; 5GW7 A; 3IGA C; 4KFM A; 1N34 O; 1ZL8 A; 2NR5 A; 4UB6 Z; 3CCS V; 4TSF G; 2HVJ C; 3T1H B; 1SA0 A; 2A06 H; 3P3N A; 4EEQ A; 2IH3 C; 1K4D C; 3A0R A; 5B1O A; 4LH7 A; 4H13 B; 1DLB A; 1QLN A; 1P7G A; 4CH5 A; 4JV5 O; 4IGG A; 1VF7 A; 3H1J H; 1B3Q A; 1XQ8 A; 1JA8 A; 3ZED A; 2UXD B; 3GB7 C; 2BTQ A; 1QR8 A; 4FMT A; 4XBF A; 3HKB A; 2Q67 A; 5CA3 A; 1K5Q A; 1EN4 A; 1GK9 A; 3ETG A; 4DV2 O; 5LHH A; 5IDJ A; 1S5L Z; 4IYI A; 1JCH A; 1PKX A; 3HKD A; 3KCX A; 1NTM H; 5E79 Z; 1IBM O; 3E89 A; 4DR4 B; 4Z1V A; 4MW8 A; 1G4Y B; 1RM1 C; 3C90 A; 4ICG A; 1SQG A; 3OW2 U; 2WLN A; 3HKC A; 4FLX A; 3OD4 A; 4CH6 A; 4LF8 O; 2B1G A; 3MHS C; 2UUB O; 4X88 A; 3DXR B; 3P32 A; 1VQ9 V; 2VQF O; 2P90 A; 4J10 A; 1BS3 A; 5B5E Z; 4WFG A; 1VIB A; 4JI5 O; 1DK1 A; 2A9H A; 5LA6 A; 3ZHT A; 2FL4 A; 4LFC B; 3CXC U; 5L3C A; 4BIO A; 1PNM A; 2VRZ A; 5EZY B; 2ZT9 B; 4MVS A; 4RWU A; 1UPG A; 1EN6 A; 1XMO O; 1WPB A; 3M99 B; 1GRJ A; 5JQG B; 2ZDI A; 4O4H B; 4J7J A; 2PI5 A; 3K0G A; 3FAV B; 4PA9 A; 5KX5 A; 2YS8 A; 2LFS A; 2WLI A; 3AG3 C; 4FFB A; 5EBM C; 1NS1 A; 3BA9 A; 3BPZ A; 4HBN A; 3G80 A; 2QKA A; 3PJS K; 3J81 N; 4MVM A; 5EIB C; 1NVP D; 4WFB V; 4JI4 B; 5LXT B; 4JV5 B; 4O4J B; 1YJW V; 3H01 A; 2QWN B; 3VBB A; 4NXM O; 1KU9 A; 2OCH A; 1BT8 A; 4P9P A; 3UT5 B; 3ZHU A; 1R1B A; 1PNL A; 1R6N A; 2JIZ G; 4UVB A; 3T4Z A; 5B3S C; 2QKC A; 3RGB A; 1FFX A; 4K3A A; 1E1R G; 4BAY A; 1U97 A; 4D7S A; 3SYQ A; 1H2L A; 4WBN A; 5FPO A; 2CGO A; 1YCI A; 1MZF A; 1VMG A; 1I7F A; 4C7U A; 1WB7 A; 1F51 A; 4ZIB A; 3EXA A; 4LFA O; 5TIS Z; 4E4E A; 5FLX N; 3A2F A; 4JYA B; 1V9P A; 4X1K A; 1Y74 A; 3RYF B; 1H2G A; 4LF8 B; 1K7D A; 3CRM A; 1QBZ A; 5CBF A; 3LDD A; 3ZN1 A; 3D36 A; 4JI3 O; 4JI8 O; 1X59 A; 1M4U A; 5KUM A; 2VQF B; 1NU1 H; 4YIP A; 2F23 A; 2CH7 A; 1XNQ O; 4JI5 B; 4QGP A; 2UUA O; 2EJR A; 4ZOL B; 4X64 O; 4F4L A; 4X62 B; 4DR2 O; 5BZB A; 4YY3 B; 2QR4 A; 3RYI B; 1GO3 F; 1S3J A; 1FXV A; 1OV9 A; 5F2V O; 5KMG B; 3JAL A; 4AQY O; 1SZX A; 1R3I C; 2KSD A; 1ORQ C; 3CXH F; 1OCR B; 3CC7 V; 1VQL V; 2F4V O; 1VF6 C; 3SDL A; 4J7Z A; 3RBZ A; 1R6K A; 4MTF A; 2EUL A; 1PP9 H; 1OCO B; 1WPX A; 3OR7 C; 4O4L B; 4UCV A; 1HNZ O; 1VQM V; 4B3R O; 2BTO A; 1I08 A; 4LF5 B; 3IC7 A; 2F1M A; 3ZHR A; 1EZJ A; 1ZL8 B; 3QO5 A; 3S3X A; 4FM0 A; 1NTZ H; 2LGW A; 4GX0 A; 3CCQ V; 4IHJ A; 1SA0 B; 3AG2 C; 1SQQ H; 4CS2 A; 4JTA B; 4Z2W A; 4KL1 A; 2A7W A; 4JI1 B; 2HJD A; 1OCC C; 3DGE A; 1XEQ A; 2QM7 A; 1GMG A; 1EFR G; 1WLE A; 1ZLZ A; 3TK1 A; 1BZK A; 3EFF K; 3K04 A; 2BTQ B; 1MMM A; 2LO1 A; 1OCZ C; 3LSS A; 5CB4 A; 5JJE B; 3HKB B; 2XUM A; 4GKK B; 2HKO A; 2Q8V A; 4KHP O; 3K08 A; 3FX7 A; 3B8N A; 2RDC A; 3U10 A; 3D3Q A; 5CBG A; 4ZBM A; 3ZRX A; 3KCY A; 1XHX A; 5LP6 C; 1KP2 A; 3HKD B; 2UUA B; 3L74 H; 4DUZ B; 5IJ9 A; 1ARO P; 1OJH A; 4OPA A; 5IT9 N; 4DR2 B; 3CCV V; 5IY5 C; 1AB3 A; 3QG5 A; 1O9H A; 5GTH Z; 3CME V; 1WA8 A; 2JJ2 G; 4HAM A; 3HKC B; 4AQY B; 3K59 A; 2OCC C; 2F4V B; 1IBK O; 4NTX A; 3K3W A; 2DWE C; 4TOI A; 2HFE C; 1AR5 A; 2V1D A; 1DF4 A; 5BMV A; 2P4K A; 5LA6 B; 3T2M A; 3SPI A; 3CRR A; 3EVK A; 3QF7 A; 4JI7 O; 1D5A A; 4RQF A; 2FYU H; 2LW1 A; 4UCS A; 3ZRV A; 2ITD C; 3JD3 A; 4PJ0 Z; 3ASN C; 1Z5W A; 1YZB A; 4JPR A; 1N0N A; 1PNK A; 1V54 C; 3FKS G; 5KX5 B; 4FJC C; 4FFB B; 2WLI B; 4EB6 A; 1XIL A; 1SQF A; 3CS5 A; 3JCZ A; 3RN4 A; 3BAA A; 4R7C A; 3ZMU A; 2JRI A; 4JTD B; 4X20 A; 4UVC A; 3K9A A; 4U3F H; 1VF5 B; 3CCE V; 2UUC O; 2D3O W; 4DV7 O; 3LNM B; 1TA8 A; 4BIZ A; 5AG2 A; 2UXB O; 3JD2 A; 3ZRS A; 4CS4 A; 1JR9 A; 1FFX B; 1Q90 D; 1I5Y A; 5H6Q A; 1SER A; 4J9Y B; 3L70 H; 4WBN B; 2UXC B; 1QVG U; 4PHZ A; 1CEZ A; 2KQX A; 3JD4 A; 2EX3 A; 1L8D A; 1B06 A; 1NTK H; 3FB5 C; 4UCR A; 1KUQ A; 2AZ0 A; 4I50 A; 1GN6 A; 2E76 B; 3UO2 A; 4DUY B; 4X1K B; 5L3D A; 1Y74 B; 1S72 V; 5A9G A; 2BSK A; 4JYC A; 3ZHV A; 2P22 C; 4B3M B; 3G71 V; 1VQ8 V; 1K33 A; 2DW4 A; 1L1F A; 1SF9 A; 1PM9 A; 1YJN V; 1W0K G; 5LYJ A; 1AJP A; 2CH7 B; 1RSO A; 2NLJ C; 5C8Y A; 4JI7 B; 2B5U A; 4H44 B; 3AG7 A; 2JS5 A; 1AJN A; 3I55 V; 3JAL B; 2UXX A; 4H33 A; 2EZO A; 2BOC C; 3SPG A; 4FM2 A; 1LUW A; 3E83 A; 4QIW F; 1VF6 A; 3JAR A; 1VP7 A; 3ZN0 A; 3Q4H A; 3VQY A; 4XDJ A; 4TV9 A; 2N04 A; 4QE9 A; 1M90 W; 4LF9 B; 1FJG O; 3E8F A; 3I5D A; 3T1Y B; 4CC6 A; 2YIB D; 5IYC O; 3JD1 A; 2Y48 A; 2EIK B; 1IBL O; 1FXH A; 4HZ3 A; 3A0B Z; 1COW G; 5LL6 Y; 1W59 A; 3P30 A; 1FXK C; 2DOS A; 2FB5 A; 3K5L A; 4A5U B; 1JQ0 A; 4B08 A; 1FFT B; 1AI6 A; 1IVS A; 5DN6 G; 3CX5 F; 2JK5 C; 1M56 C; 2E75 B; 2P6J A; 2Q0O C; 1SQB H; 4IHJ B; 3JAK A; 4K0K O; 4IT5 A; 1JPX A; 1H38 A; 4FVM A; 3SJC C; 5DM6 V; 2Y0P A; 3RT3 C; 2VWK A; 5CB4 B; 3L71 H; 4DV4 O; 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