3Q5HA

Clinically useful alkyl amine renin inhibitors
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Discovery of VTP-27999, an Alkyl Amine Renin Inhibitor with Potential for Clinical Utility.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 337
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-12-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q5hA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q5hA01
5P6VA 5P7SA 5SZ9A 3LHGA 2AOJA 3MSJA 1HIIA 5P84A 1BVEA 2I4DA 5P8CA 3GGXA 5IVQA 3TPPA 1BAIA 1IVQA 5P4VA 3OHFA 5P8NA 5P8TA 4I0DA 1PROA 1B5FB 4GJ9A 1SDTA 4PEPA 5P7VA 5P8OA 5KR2A 2VIYA 1BILA 5P6XA 4Y3AA 1ZBGA 1UH8A 2QI7A 7UPJA 3O9FA 4TVGA 2AOEA 5P08A 1QBSA 1EPNE 4IVTA 2IS0A 1YTHA 4Y6MA 3VLAA 1BDQA 3EBZA 5HE4A 4H3GA 3UF3A 5P0XA 5P4WA 5P3IA 2FS4A 2PSGA 4RLDA 4OBHA 4YBFA 2BKTA 4NJVA 2O4NA 5P75A 1K6VA 5UPJA 5P2AA 1MERA 1K1TA 5OZXA 4LXAA 2R8NA 1EPOE 1YTIA 2J9JB 5P0BA 3VG1A 2J9KA 4FRJA 4GJBA 5P0FA 5C9BA 3D1YA 5J25A 3KF0A 2WHHA 4BELA 5P10A 4BFBA 4CPXA 1RPIA 1QS8A 1IBQA 1EEDP 1BDLA 4DH6A 5P2GA 1AJXA 3OUBA 3SFCA 2CENA 5HDUA 1FQXA 4R95A 4J1CA 2ZJKA 4RVIA 5P78A 1GNNA 5P31A 2IQGA 3O9IA 4Y45A 3I2LA 3PSUA 1MT8A 5P47A 4ZLSA 3BUHA 5P1QA 5P8SA 3INHA 3VEUA 5P33A 1YTJA 1ZPKA 1HIHA 1Z1RA 5P7NA 3L5BA 3CICA 1XS7D 1WKRA 1W5VA 4GJ5A 5KAOA 1UH7A 4YCYA 4CMSA 5P4CA 1RL8A 1BV9A 3NYGA 3F9QA 3UFLA 3EC0A 3PWWA 5P8GA 4RROA 3B7VA 5AH9A 3RTHA 5OZUA 4L1AB 1A8KA 1HOSA 5OZJA 4ZSMA 5P5QA 5P1KA 3ZPUA 3BUGA 4HDBA 5JG1A 5P76A 4R91A 3WZ6A 4B70A 3S2OA 1FGCC 3K4VC 1LYBA 2PMAA 4EJDA 4J0YA 5P6YA 2G22A 3NU6A 2QI5A 5P6SA 1F34A 1HEFE 4LL3A 5P53A 2Q55A 2HPFA 1K6TA 3VF5A 1FG8C 5P5GA 3OGPA 4B1DA 5P09A 3Q5HA 3OTSA 1EC0A 3FNSA 3Q4BA 3UDQA 3TOFA 5F00A 2OHNA 3OQAA 3GGVA 3EKQA 3ZKNA 2P4JA 2CEJA 2G20A 3FIVA 4FRIA 5P05A 3NDTA 1K6CA 3OTYA 1T3RA 2BB9A 3Q3TA 3NUJA 5P7TA 5P62A 1XL2A 4QJ9A 5P6ZA 1DMPA 5P1EA 3D20A 3LZSA 4Y3LA 5AH7A 4Y3YA 4YD5A 3S54A 4RYGA 4MC9A 3NSHA 4DJPA 3EM4A 3HAWA 5P6HA 4ZE6A 3NDXA 3TPJA 4AUCA 4QLHA 4ZPFA 1EBWA 3KDBA 2OHSA 5HE5A 3LINA 3KT2A 3U71A 3HLOA 5P5SA 4APRE 4D85A 4JPCA 5P25A 5P0IA 1TCXA 3K5GA 2JYSA 2R3WA 4PZWA 1MVPA 5OZ6A 1KJ4A 5P89A 4B77A 4EJKA 3PLDA 3KMYA 2PSUA 3NU3A 1HVCA 4OBZA 5OZ3A 5P3VA 3EL4A 1IDBA 2JXRA 3VYDA 4GJDA 1HWRA 2FGUA 5P1GA 4QJAA 4Y3QA 4I1CA 5P2LA 5P00A 4Y5GA 5P58A 4Y35A 4HDPA 1LF4A 1E80E 5P59A 2JJJA 2FNTA 2Q5KA 5P2EA 3IAWA 3PGIA 3LIXA 1FLHA 4OBKA 3BGCA 2QZKA 3CKPA 5OZ7A 5P0DA 3A2OA 4GIDA 3GI6A 3D3TA 5P57A 3IXJA 1VIKA 4Y3XA 2G1SA 4OBJA 4Q1NA 3EKTA 4Z4XA 4FLGA 2AODA 3ZMGA 1PPME 3ZL7A 5P7HA 1A8GA 1RV7A 1XN3A 2HIZA 5P5KA 4D8CA 1SIPA 5P4TA 1C70A 2G1RA 3KFNA 3VFBA 5IVTA 5P4YA 2PWRA 1OEWA 3QIHA 4D89A 4TRWA 2Z4OA 5P5JA 5ISJA 2R5QA 4EPJA 1IDAA 4QJ6A 5P6CA 1C6XA 4J17A 4Y57A 5OYUA 5OZ1A 5P0PA 3VV7A 2B7ZA 2O4LA 3SO9A 5OZAA 4GJ7A 3EKVA 6UPJA 3NWQA 2QNQA 2NMYA 4Y4EA 3DUYA 2PYNA 3MXDA 3FKTA 5DQ1A 5AHAA 1SIVA 4I0JA 4DJWA 3L3AA 1EPME 4QJ2A 4DQCA 1SP5A 1GNMA 3ZPTA 5KR8A 2O40A 3O9CA 3GI4A 3T7QA 5P8QA 3MXEA 3LPIA 3TKWA 3UQRA 5P11A 4Y3NA 4KB9A 1G6LA 1RNEA 4B00A 1LYWA 2B42A 2NNPA 3OXCA 3PI0A 5P2WA 1F7AA 2RMPA 1VIJA 2IGYA 5OZEA 3OUCA 2I0DA 4Y4WA 4HLAA 1JLDA 5P3RA 4RVXA 1YG9A 3GI5A 1ODWA 5DR1A 5COPA 4DJYA 2BQVA 5P7LA 5P4DA 1FQ4A 2VS2A 4Y51A 5P6GA 3OAGA 5P1AA 1APWE 5P3FA 1HVJA 3G70A 1LZQA 5BWYA 5ISKA 4B05A 3TH9A 5C9DA 3R0YA 1CPIA 3ZKSA 4LAPA 5P4QA 5P5IA 2JJIA 1LYBB 2ZE1A 3KDCA 2ER0E 5P1RA 1NH0A 2BJUA 2F81A 4U7VA 1T7KA 3LITA 5P3BA 4ACUA 5P3MA 4EP3A 1ZLFA 4D88A 5KQXA 3QBHA 2QD7A 5P17A 3WB4A 1ODYA 1AVFA 1M43A 1BBSA 5P7MA 2V0ZC 2QMPA 5P3SA 2R9BA 4Y3HA 3VSWA 2B8VA 1HVIA 1SGUA 4FIVA 4H3JA 1G0VA 3FX5A 1AM5A 5P42A 5P0WA 2QI3A 4H1EA 1HSGA 2V16C 4NKKA 5P0ZA 6APRE 3S53A 2VNNA 5P2QA 5P1HA 2PWCA 5P50A 5P18A 4HA5A 5P6FA 5P7CA 3S43A 3ZKGA 5P22A 4YD4A 1TCWA 4K8SA 5OYVA 3MWSA 1KJ7A 2PH6A 3OADA 3PEPA 1ZAPA 1EC2A 5DR4A 3D91A 7HVPA 1IIQA 4Z22A 2QCIA 4EQ0A 4L6BA 5P1UA 4Q1WA 4LP9A 3O9HA 2WF0A 3NR6A 4OBZB 1EAGA 3EL1A 1RQ9A 8HVPA 1NSOA 1GVVA 3HVGA 1B11A 3R0WA 4Y4TA 2AOCA 5P5OA 3QRMA 1FMBA 3UDJA 1Z1HA 4OC6A 1FG6C 5P8JA 5HDZA 3MSLA 3BXRA 2Q63A 4R92A 1K2BA 1PSAA 5P4ZA 3O9BA 1FQ8A 3QRSA 2QI0A 5P19A 4JOOA 2JE4A 5P68A 5P64A 5ER1E 4HZTA 3NDUA 1HSHA 4JP9A 5CONA 5P46A 3BXSA 5P0QA 5P6PA 5P88A 3SKFA 1HTGA 2I4VA 1MEUA 4FM6A 1D4JA 3T6IA 1W6HA 5P1FA 3UQUA 5F01A 3UDRA 4MC2A 4D83A 5BRYA 2RKGA 5P29A 5ER2E 2AOHA 4GJCA 4RCEA 5P72A 3EL5A 4GJAA 4TVHA 4Y4XA 4DJQA 5P3XA 2AZBA 3OQDA 5P5DA 4B72A 3HD8A 2H6TA 5OZYA 3K5CA 1GVXA 5P16A 1APVE 3PMYA 4K4QA 5SY3A 3UFNA 1FFFC 2AOFA 3TNEA 2WEAA 5P2BA 5DQ5A 2QHYA 3UQPA 4HVPA 1HVHA 2QP8A 2IRZA 4UPJA 4XXSA 4TRYA 3O9GA 5P4XA 3LNKA 3PM4A 4Y43A 2I4WA 2BBBA 2V13A 3S7MA 5P0UA 1ZSRA 1M4HA 4Y5LA 5P1LA 3L5EA 2R43A 3JVYA 4FRKA 4Y3JA 5P4PA 5SXNA 3HZCA 5I3YA 4YD7A 3Q6YA 4WY6A 3PWRA 3FSMA 5P4SA 5P1XA 3LIYA 5IVSA 2ZJLA 5P4FA 5OZKA 5P5CA 3EKXA 4DQFA 5DGWA 2OHKA 3ZLQA 4CPQA 3N3IA 2VJ6A 2VNMA 5P3OA 3S8IA 5P34A 4Y3DA 2IKUA 3OU1A 2BPVA 1LYAB 5CLMA 5OYTA 5P6TA 3OOTA 5AHBA 2WF2A 5HD0A 5IS4A 4L7GA 5P7JA 4U8WA 1SH9A 1ME6A 4R8YA 5P4IA 3INDA 5JFUA 2I0AA 4B1CA 5EZZA 2WJOA 1FF0C 3OAGB 5OZ8A 2IEOA 5P1DA 3GW5A 3QVIA 5P82A 3AUPA 1D4HA 1TZSA 5P8DA 5TOLA 1HPXA 2VJ7A 5P0OA 5P0GA 3GGAA 3DOXA 5P01A 5P1BA 3EKWA 5P6AA 3S56A 4DQBA 4I0ZA 5P1IA 5P1YA 5P2MA 4DJXA 4ZEAA 5P26A 2ER7E 1KJHA 3BVBA 3OHHA 4LBTA 5P7WA 4ZSQA 1K6PA 4KUPA 5OZLA 2QMGA 4HEGA 3TLHA 2G1NA 4Z2ZA 5P40A 5P44A 5P5UA 3SLZA 4AA9A 5P8AA 4R93A 5P1TA 5HVPA 4Y5AA 1GNOA 5P1OA 5P4GA 3KN0A 5DQ4A 5P20A 3PRSA 3EM6A 4Y36A 1W5WA 5P6WA 1TW7A 5OZQA 1FKNA 5P32A 2H6SA 5P2FA 1ZSFA 5P4UA 2UY0A 3BGBA 5P2YA 4DJUA 2RKFA 3INFA 2RENA 4B1EA 1XN2A 3N4LA 4Y5KA 5OYSA 3NWXA 2WKZA 3NU9A 3S43B 5B18A 3UCBA 3CMSA 4N00A 4Y58A 5P87A 5KQZA 5AGZA 5OZWA 2V11C 4NJTA 3OADB 1A94A 4KE1A 4YDFA 4RYCA 2OF0A 5P0KA 1HPSA 1IZEA 3B80A 3FNTA 1MSMA 4Y5BA 5I3VA 3S45A 2VIJA 5P71A 1FEJC 3D1XA 3LPKA 5P1WA 3DK1A 5P8PA 1EPQE 3OUDA 3VYFA 5AHCA 5HCOA 3TOGA 2OHTA 2QHZA 3FV3A 3QBFA 2PH8A 2A1EA 4FRSA 2FXEA 1BWAA 3IVHA 3OQFA 4WY1A 4WTUA 3I8WA 4OC6B 4DJVA 1QBRA 5P48A 3SM2A 5KQFA 4ER2E 5OZ4A 3OGQA 2EWYA 9HVPA 3NXEA 3URLA 3UTLA 2HS1A 3OU4A 5P3TA 5P54A 4EYRA 3UPJA 1MESA 2HM1A 3PI5A 4L7JA 2F3FA 5P3UA 5P2KA 3O99A 1D4LA 2QZWA 3G72A 2Q3KA 3TKGA 4F74A 4Y5CA 4EXGA 5P6RA 3APPA 4A6CA 2VIEA 4ZSRA 5P4AA 3NU5A 1KJGA 1MTBA 5P7PA 1W5XA 5P8IA 5P80A 3ZPSA 5P60A 1QBUA 5P2RA 1ENTE 4NPTA 1HPOA 4I11A 3R1GB 3UDMA 2B60A 1FIVA 1G2KA 2AVQA 1Q9PA 5P1SA 5P4LA 5P5WA 2P83A 3DM6A 1MT9A 3RSXA 5P4OA 3SQFA 1HVLA 3SA3A 3OOZA 5P2VA 3UDPA 4KE0A 1AAQA 4PYVA 5DQCA 3WB5A 3SPKA 3C9XA 5P43A 5P1VA 4RZ1A 2AVOA 5HTZA 3IN3A 4CKUA 1BXOA 2SAMA 2O4SA 2OHPA 3I25A 5P39A 3SA4A 3TOHA 5OZVA 3RU1A 1WBMA 4AMTA 3KDDA 5DPZA 5P7IA 1APTE 5P1JA 4A4QA 3KYRA 5P6IA 3OU1B 5P3LA 4RCFA 5HE7A 2NPHA 5AH6A 5KOSA 1GKTA 2NTRA 3OY4A 3PSYA 5COKA 5P3NA 5KOQA 1LF3A 4BEKA 2QNPA 3EL0A 5P7QA 5P81A 2A4FA 2RSPA 5P79A 4DUSA 1HVSA 5T4SA 4Q5MA 5P8UA 1TSUA 5P4MA 1BIMA 4YOAA 1LF2A 2PSVA 1KZKA 1AXAA 5HDXA 4B78A 4JPEA 5P38A 1BWBA 2CEMA 1GVTA 1HTEA 2F3KA 3BVAA 4DJRA 1PFZA 3M9FA 3PWMA 4EQJA 4I0EA 2P3CA 4YCKA 3TPRA 4Y3TA 1MTRA 5P61A 1SBGA 5P30A 2AOGA 1IZIA 4GJ8A 5P28A 3HBOA 5OZTA 3D1ZA 5P2XA 4I0FA 5P7YA 5P3AA 1TSQA 1BVGA 5FIVA 4CPRA 1HHPA 4RVJA 4QGIA 3UQWA 6FIVA 4ZPGA 2O4PA 5P3EA 3G6ZA 4Y5NA 1EPLE 1B6LA 2AZCA 4I0HA 5P02A 4Y4UA 5OZZA 1Z8CA 2QMFA 3JVWA 4NJSA 3O9LA 4YDGA 3BUFA 3CKTA 3NXNA 5DGUA 2BKSA 5P6JA 2ASIA 1E5OE 5OZ0A 5P4KA 2R3TA 2ZJMA 5P36A 1HTFA 4ZSPA 3SA6A 2UXZA 5P7DA 4Y56A 2FMBA 1W6IA 2NXMA 4EJLA 3PVKA 4J1IA 2G94A 5P5LA 1PSNA 1MUIA 1UPJA 3O9DA 2QMDA 1K1UA 5HU0A 2OHQA 4DPFA 2BPWA 3PJ6A 5HU1A 1FQ5A 3LZYA 1IZHA 1SDUA 3IN4A 2VKMA 5P0YA 3IXKA 4LC7A 5P51A 4FM7A 1A9MA 5P5HA 2F3EA 1SGZA 4APEA 1OD1A 3VFAA 3OUDB 1KJFA 1HVKA 5P7RA 4TRZA 4OBGA 1FMUA 5P3WA 1PPLE 1NPWA 2VA5A 2AOIA 1ZP8A 2ER6E 3KA2A 2HAHA 4Y4JA 3VLBA 2FLEA 2P3BA 4B0QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P6V A;  5P7S A;  5SZ9 A;  3LHG A;  2AOJ A;  3MSJ A;  1HII A;  5P84 A;  1BVE A;  2I4D A;  5P8C A;  3GGX A;  5IVQ A;  3TPP A;  1BAI A;  1IVQ A;  5P4V A;  3OHF A;  5P8N A;  5P8T A;  4I0D A;  1PRO A;  1B5F B;  4GJ9 A;  1SDT A;  4PEP A;  5P7V A;  5P8O A;  5KR2 A;  2VIY A;  1BIL A;  5P6X A;  4Y3A A;  1ZBG A;  1UH8 A;  2QI7 A;  7UPJ A;  3O9F A;  4TVG A;  2AOE A;  5P08 A;  1QBS A;  1EPN E;  4IVT A;  2IS0 A;  1YTH A;  4Y6M A;  3VLA A;  1BDQ A;  3EBZ A;  5HE4 A;  4H3G A;  3UF3 A;  5P0X A;  5P4W A;  5P3I A;  2FS4 A;  2PSG A;  4RLD A;  4OBH A;  4YBF A;  2BKT A;  4NJV A;  2O4N A;  5P75 A;  1K6V A;  5UPJ A;  5P2A A;  1MER A;  1K1T A;  5OZX A;  4LXA A;  2R8N A;  1EPO E;  1YTI A;  2J9J B;  5P0B A;  3VG1 A;  2J9K A;  4FRJ A;  4GJB A;  5P0F A;  5C9B A;  3D1Y A;  5J25 A;  3KF0 A;  2WHH A;  4BEL A;  5P10 A;  4BFB A;  4CPX A;  1RPI A;  1QS8 A;  1IBQ A;  1EED P;  1BDL A;  4DH6 A;  5P2G A;  1AJX A;  3OUB A;  3SFC A;  2CEN A;  5HDU A;  1FQX A;  4R95 A;  4J1C A;  2ZJK A;  4RVI A;  5P78 A;  1GNN A;  5P31 A;  2IQG A;  3O9I A;  4Y45 A;  3I2L A;  3PSU A;  1MT8 A;  5P47 A;  4ZLS A;  3BUH A;  5P1Q A;  5P8S A;  3INH A;  3VEU A;  5P33 A;  1YTJ A;  1ZPK A;  1HIH A;  1Z1R A;  5P7N A;  3L5B A;  3CIC A;  1XS7 D;  1WKR A;  1W5V A;  4GJ5 A;  5KAO A;  1UH7 A;  4YCY A;  4CMS A;  5P4C A;  1RL8 A;  1BV9 A;  3NYG A;  3F9Q A;  3UFL A;  3EC0 A;  3PWW A;  5P8G A;  4RRO A;  3B7V A;  5AH9 A;  3RTH A;  5OZU A;  4L1A B;  1A8K A;  1HOS A;  5OZJ A;  4ZSM A;  5P5Q A;  5P1K A;  3ZPU A;  3BUG A;  4HDB A;  5JG1 A;  5P76 A;  4R91 A;  3WZ6 A;  4B70 A;  3S2O A;  1FGC C;  3K4V C;  1LYB A;  2PMA A;  4EJD A;  4J0Y A;  5P6Y A;  2G22 A;  3NU6 A;  2QI5 A;  5P6S A;  1F34 A;  1HEF E;  4LL3 A;  5P53 A;  2Q55 A;  2HPF A;  1K6T A;  3VF5 A;  1FG8 C;  5P5G A;  3OGP A;  4B1D A;  5P09 A;  3Q5H A;  3OTS A;  1EC0 A;  3FNS A;  3Q4B A;  3UDQ A;  3TOF A;  5F00 A;  2OHN A;  3OQA A;  3GGV A;  3EKQ A;  3ZKN A;  2P4J A;  2CEJ A;  2G20 A;  3FIV A;  4FRI A;  5P05 A;  3NDT A;  1K6C A;  3OTY A;  1T3R A;  2BB9 A;  3Q3T A;  3NUJ A;  5P7T A;  5P62 A;  1XL2 A;  4QJ9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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