3QAKA

Agonist bound structure of the human adenosine a2a receptor
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
453
structure length
444
Chain Sequence
IMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYRSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein, hydrolase
source organism Homo sapien
publication title Structure of an agonist-bound human A2A adenosine receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Adenosine receptor A2a,lysozyme chimera
total genus 167
structure length 444
sequence length 453
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3qakA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3qakA01
1C6TA 2JAFA 3UTWA 3SB5A 5G53A 1C65A 223LA 169LA 4J4QA 5B6VA 1ZYTA 5EN0A 1UCQA 230LA 3HDEA 3LZMA 1QKPA 1L87A 1C66A 1OWZA 5AWZA 3FA0A 1L97A 255LA 1L23A 4G70B 4KLYA 3DMXA 2B6WA 3CDOA 198LA 254LA 2PEDA 143LA 1KS3A 245LA 4ARQA 2RB2X 1LN6A 158LA 1QSQA 4LDLA 2HUMA 1JV7A 3QBGA 3CODA 1C67A 1C3WA 2BRDA 2KSBA 5AX0A 1QS5A 108LA 4GYCA 1S54A 2OE7X 4HYXA 3S3DB 1QTHA 1CV6A 112LA 4EKQA 187LA 4IAPA 3DN6A 3EH4B 1QT5A 1SSYA 1L17A 1L95A 4I7OA 4ZPUA 1S53A 1U19A 2KS9A 1L76A 2X72A 4YX7C 4MBSA 4XTOA 2B73A 1XMEB 1C6IA 232LA 4IB4A 1QM8A 1L0JA 1L9HA 4XTLA 1L73A 5H2JA 2L6XA 1L42A 1VJMA 4HYJA 3HH6A 3T45A 1L68A 1IW6A 1CX7A 1BRRA 4MQTA 2RAYX 1XJIA 1L55A 4XTNA 3FADA 123LA 1C64A 261LA 2RBNA 3DKEX 173LA 1P2RA 2QPDB 3UONA 3GUKA 1TLAA 2AT9A 1OVJA 1E12A 3UG9A 1CV0A 1G0MA 1LGWA 128LA 1C6CA 4EXMA 1LYEA 138LA 1L83A 5H2PA 1L94A 2OTZX 3EMLA 257LA 4ARJA 4ARPA 168LA 1DYBA 229LA 3QBLA 2I21A 5G2AA 1CV1A 4IARA 165LA 4W51A 4GBRB 2B6XA 3C7YA 3OE6A 1C69A 4QIDA 5A8EA 228LA 1P8HA 1LYDA 2Y02A 2B72A 161LA 1PQIA 3F9LA 4LDOA 1UAZA 5AX1A 216LA 2HULA 5LZMA 1LPYA 4GPOA 4MD1A 2NTGA 3G3WA 1XIOA 109LA 2QARC 3UTYA 4I7JA 4W57A 4G71B 5B6ZA 259LA 1L96A 2RBPA 4OO9A 220LA 1OVHA 2J4YA 1DYFA 1Q5IA 3HT6A 1GZMA 1CU3A 1E0PA 4X32A 258LA 3C9LA 3ODUA 1CTWA 226LA 3HT9A 4X1HA 3PDSA 4BWBA 5AZDA 1DYEA 4EIYA 2LNLA 2YCYA 3HUAA 247LA 2B6YA 3WQJA 1F50A 2I1XA 3DQBA 3NS0A 1L99A 1L10A 1C6HA 2B75A 1C6NA 1G0KA 126LA 4EPFA 4G72B 1VGOA 2M3GA 2LCBA 1L45A 3NY9A 236LA 3OE8A 4PK0A 1JQUA 1P37A 3OAXA 231LA 249LA 1L77A 119LA 2B6TA 4DAJA 115LA 3QAPA 1JFPA 4QRYA 3C83A 1L36A 189LA 4BUOA 183LA 5B34A 1L52A 3HU9A 2RBQA 5G28A 225LA 3K2RA 6LZMA 2O4WA 2YCZA 1QT7A 2OEAX 1C6LA 2VT4A 129LA 1T8GA 163LA 1L50A 3C82A 1SX2A 1LW9A 3CDRA 1L32A 4FA7B 3SBAA 3VVKA 3D4SA 2F95A 2JAGA 250LA 252LA 1WTHA 1C6QA 2LZMA 1C68A 238LA 1G1VA 253LA 150LA 1GU8A 3ZEVA 4EKPA 3HWLA 1BRDA 1L31A 1QT8A 1ZURA 3GUPA 3L2XA 1L75A 1L85A 3C7ZA 1M0MA 2Z55A 1L34A 152LA 3BVDB 1DYAA 2KSAA 5TGZA 1AT9A 196LA 1T8AA 4QI1A 3GUNA 1L19A 157LA 3QJVB 3NY8A 1L21A 184LA 2OU9A 4DKLA 3HTDA 2Z6BA 3GULA 1KGBA 141LA 107LA 1C8SA 5A45A 4GBRA 1Q5JA 1L25A 4WAVA 1PXSA 122LA 234LA 4JR8A 1XEPA 2ANXA 2B74A 1L22A 1L47A 2OTYX 1P46A 1F88A 1QUDA 1D9WA 5G36A 1L0MA 103LA 4I7LA 3C81A 2OE4X 1OYUA 219LA 1BRXA 5BR5A 159LA 3RFMA 246LA 1OV7A 1D3MA 1C6FA 2F2QA 1D2YA 4I7QA 2QPEB 4Y9HA 5H2IA 3UTXA 2RB1X 210LA 3UTVA 5H2LA 5H2HA 2OU0X 1X0K1 1C6GA 156LA 3ZPRA 4IAQA 1QTZA 2B6ZA 1QUOA 1XJUA 3HTFA 3SB9A 2I20A 1C6KA 1C6EA 243LA 1C6DA 3OE0A 4W55A 2Y04A 5AHZA 4W58A 1L91A 1L67A 3P0GA 1D3FA 4EKRA 4OV0A 1X0SA 3UZAA 4TL3A 1H2SA 4EJ4A 164LA 2ZIYA 4I7SA 4I7KA 1G0JA 1L49A 1X0I1 1P64A 2KSYA 4X31A 4BEYA 162LA 212LA 1L20A 3QJTB 1K28A 1CUPA 1L06A 206LA 1S52A 4I7PA 1L58A 2F32A 3HAQA 4G7QB 3SB7A 200LA 256LA 1LYGA 5FJGA 1LGUA 1JGJA 1G0GA 4YXAC 1P8IA 1MGYA 5ETZA 3X3CA 2YDVA 5B6XA 1CX6A 1S8LA 3S3CB 1PXRA 3REYA 1L11A 4AMIA 3C9MA 2G87A 1QUHA 118LA 1LWGA 5ITEA 3C7WA 209LA 1LI2A 195LA 3V2WA 155LA 1L12A 197LA 1QHJA 1DYGA 1T6HA 3VGAA 1L33A 1L14A 2ZZLA 3COCA 3NSBA 1DZEA 1L08A 185LA 2RB0X 1R84A 140LA 4I7TA 3MBVA 1L59A 3HT8A 3HANA 4FPDA 4PXFA 1L44A 205LA 3HH5A 4W59A 1C6BA 1M0LA 3DN4A 1XJTA 3HARA 1L03A 1L15A 1D3JA 1M0KA 1L53A 251LA 3HTGA 4YXCA 5LWEA 1G0LA 4DJHA 1P5CA 3RUNA 1G07A 3DN8A 1IW9A 3PWHA 1KW5A 1LYJA 1SX7A 5DYSA 5DHGA 1L26A 1L79A 2I35A 5JJNA 1EHKB 2A4TA 5G2DA 1C6PA 1L02A 4EKSA 5JJJA 3PQRA 1L74A 1CV3A 3SB8A 1L57A 239LA 2RBSA 3AYMA 188LA 186LA 1L98A 213LA 3QBKA 3EH5B 1QTVA 5DHHA 3AM6A 1F4ZA 4N4WA 4EA3A 1QKOA 3GUOA 1L62A 1L89A 4I7NA 1L80A 2YDOA 4ARLA 142LA 1PQKA 3F8VA 1KW7A 3DNAA 4I7MA 127LA 1OV5A 4JKVA 3QBIA 1ZWNA 1QT4A 5B2NA 144LA 5B35A 4AQNA 3GUMA 1LWKA 5B6YA 170LA 2Y00A 4XT3A 1L84A 1DYCA 248LA 1QUGA 2RBRA 2L78A 3V2YA 1JV6A 1L51A 211LA 215LA 1G0QA 3HT7A 1C8RA 1L0KA 2NTWA 3UZCA 3DN0A 145LA 1L09A 1L39A 3C80A 3HAPA 227LA 3DN2A 2Y01A 1JTMA 1L35A 111LA 3HDFA 1C6MA 4W54A 1HZXA 5H2NA 3JR6A 2OE9X 125LA 1CV4A 1L41A 1P7SA 1CUQA 1SWZA 1LYHA 2WJKA 4UHRA 1L88A 4MD2A 1L07A 2QB0B 2LC9A 242LA 1L40A 2Q9EA 2WJLA 1QSBA 1B6IA 2F47A 4BV0A 1CU2A 149LA 1L04A 1CVKA 4K5YA 4ARMB 1KG8A 1KMEA 4BEZA 2NTHA 175LA 1PQJA 3HTBA 3S8GB 2Q9DA 5A44A 224LA 4L6RA 4S0WA 2CUUA 1SWYA 1KNIA 1L24A 110LA 172LA 4GP8B 1L86A 4I7RA 2B7XA 1QTBA 2EI4A 1LYFA 3DN3A 1L16A 3SBBC 1PQMA 4W53A 3VW7A 2O79A 3QJRB 3VG9A 4W56A 1P2LA 1AP9A 3SB6A 3HU8A 1OVKA 3RZEA 2Y03A 214LA 1CU0A 2RAZX 1L28A 1S8JA 1LLHA 3HASA 3AYNA 4W52A 192LA 1L38A 3CDTA 199LA 1C63A 3HH3A 5AHYA 1P56A 178LA 2O7AA 1L27A 167LA 1L71A 1C61A 1L18A 1T97A 1L60A 3DDLA 4N4YB 3NYAA 5B6WA 5JJEA 240LA 3PXOA 5ITCA 4NC3A 222LA 3G3VA 2ZFEA 2OU8A 3C8RA 1P8UA 1FBBA 1PQDA 4LDEA 2B70A 3C8SA 1TN5A 190LA 1CV5A 3X3BA 1L90A 4ARQB 1KY0A 2R4SA 1QT3A 2NTUA 4FBZA 4FAAB 4AMJA 4PJZA 1L01A 5H2KA 137LA 1L92A 1P3NA 3GUJA 4XXJA 1NHBA 3CDVA 120LA 3CAPA 244LA 5KKHA 1DYDA 114LA 4N6HA 1L64A 147LA 1L70A 3DMZA 113LA 1L63A 4XT1A 180LA 3EH3B 1L29A 1GUEA 3DN1A 1CU6A 1L66A 1CWQA 1G0PA 104LA 4LZMA 1PQOA 1L82A 3PBLA 1D2WA 1FBKA 3HH4A 1QS9A 2Z73A 1L05A 1L46A 1C60A 2IGCA 130LA 3SN6R 4GP4B 171LA 2YCWA 148LE 3FI5A 4MQSA 5G54A 3C8QA 182LA 1S51A 160LA 221LA 2HPYA 1P6YA 1L48A 1C6AA 1L61A 3G3XA 1H68A 1C62A 2ANVA 1KG9A 3ABWA 3QJUB 5F8UA 1L81A 3HUKA 3S3BB 1KY1A 1O0AA 3CDQA 174LA 1L00A 1PY6A 233LA 237LA 3KJ6A 4HWLA 1QTCA 3VHZA 241LA 1OWYA 1QTDA 5G2CA 260LA 1IXFA 1G1WA 1LGXA 151LA 4ARMA 3HUQA 4JQ6A 4E97A 191LA 1P36A 5J7AA 3DMVA 7LZMA 5I14A 3L64A 3QJQB 1R2NA 235LA 1C6JA 4GRVA 3A7KA 5H2MA 1LYIA 139LA 131LA 1LI3A 4EPIA 1EPYA 4PXKA 5C1MA 1L37A 2YCXA 4UG2A 201LA 2R4RA 1L93A 1I6SA 146LA 166LA 262LA 3HAOA 1LI6A 4WW3A 3ZPQA 3OE9A 2HUKA 3GUIA 1QT6A 1BM1A 102LA 181LA 1JTNA 1L43A 218LA 2RH1A 1CU5A 3QAKA 2F93A 3S8FB 4G7SB 1SSWA 5H2OA 1L65A 1L54A 176LA 217LA 1G06A 3QJSB 177LA 5B0WA 1D3NA 4L35A 3VI0A 5BR2A 2RBOA 4KNFA 1T8FA 4GP5B 1L30A 1L69A 3QDCA 1L56A 1L72A 1L13A 4BVNA 4G7RB 1TN0A 4A4MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WM5A 1ZYTA 1UCQA 1QKPA 3AGIA 5AWZA 255LA 1L23A 4G70B 3P66A 245LA 1KS3A 2D4IA 2RB2X 158LA 2HUMA 1WQRA 1C3WA 1N4FA 4QDNA 2LYOA 2BQIA 1LHHA 1CV6A 112LA 4N5RA 1U19A 1L95A 4ZPUA 1JITA 4XTOA 2B73A 1QM8A 1HSXA 3WU7A 2I26L 5H2JA 1DI4A 4CJ2A 1L42A 3WL2A 1HELA 4N1EI 1L55A 3WVYA 261LA 2DQJY 1TLAA 1OVJA 1CV0A 5C6JA 4M6DA 1LOZA 1LGWA 2Z19A 1C6CA 4A7DA 2YDGA 1LYEA 1L83A 5H2PA 3EMLA 5F9XA 4O34A 168LA 1DYBA 4I8SA 3AJNA 3AZ4A 1WQQA 5HQ1A 4IARA 165LA 4BAPA 4QIDA 228LA 3CT5A 1P8HA 1LZNA 4LDOA 1LPYA 4UWVA 4MD1A 1UC0A 1GBXA 1CNSA 4G71B 5B6ZA 259LA 2IHLA 2J4YA 3HT6A 4G4HA 1DKJA 5FDJA 3HT9A 1DKKA 4X1HA 4BWBA 2LNLA 3WQJA 1F50A 1ALCA 1BB3A 2BQGA 1C6NA 1G0KA 3CQLA 4EPFA 3TXKA 1W08A 4LZTA 1L45A 1F10A 1P37A 4DAJA 1GDXA 3QAPA 4QRYA 3A34A 5LAFA 4BUOA 183LA 3GXRA 2F2NA 4LT0A 2OEAX 3C82A 2MEFA 1B7MA 2JAGA 1C68A 238LA 2DQIY 7LYZA 2D4KA 1GU8A 5M1YA 3HWLA 1BRDA 1L31A 3GUPA 3L2XA 1L75A 3C7ZA 3B0OA 152LA 1DYAA 4LYCA 3A92A 3GUNA 1L19A 3NY8A 1L21A 2OU9A 2ZYPA 3IWRA 2Z6BA 1UBZA 107LA 4H9AA 1HFYA 1IVMA 4NY5A 3B0IA 4I7LA 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 1L62 A;  1L89 A;  4I7N A;  1L80 A;  2YDO A;  4ARL A;  142L A;  1PQK A;  3F8V A;  1KW7 A;  3DNA A;  4I7M A;  127L A;  1OV5 A;  4JKV A;  3QBI A;  1ZWN A;  1QT4 A;  5B2N A;  144L A;  5B35 A;  4AQN A;  3GUM A;  1LWK A;  5B6Y A;  170L A;  2Y00 A;  4XT3 A;  1L84 A;  1DYC A;  248L A;  1QUG A;  2RBR A;  2L78 A;  3V2Y A;  1JV6 A;  1L51 A;  211L A;  215L A;  1G0Q A;  3HT7 A;  1C8R A;  1L0K A;  2NTW A;  3UZC A;  3DN0 A;  145L A;  1L09 A;  1L39 A;  3C80 A;  3HAP A;  227L A;  3DN2 A;  2Y01 A;  1JTM A;  1L35 A;  111L A;  3HDF A;  1C6M A;  4W54 A;  1HZX A;  5H2N A;  3JR6 A;  2OE9 X;  125L A;  1CV4 A;  1L41 A;  1P7S A;  1CUQ A;  1SWZ A;  1LYH A;  2WJK A;  4UHR A;  1L88 A;  4MD2 A;  1L07 A;  2QB0 B;  2LC9 A;  242L A;  1L40 A;  2Q9E A;  2WJL A;  1QSB A;  1B6I A;  2F47 A;  4BV0 A;  1CU2 A;  149L A;  1L04 A;  1CVK A;  4K5Y A;  4ARM B;  1KG8 A;  1KME A;  4BEZ A;  2NTH A;  175L A;  1PQJ A;  3HTB A;  3S8G B;  2Q9D A;  5A44 A;  224L A;  4L6R A;  4S0W A;  2CUU A;  1SWY A;  1KNI A;  1L24 A;  110L A;  172L A;  4GP8 B; 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 1L66 A;  1CWQ A;  1G0P A;  104L A;  4LZM A;  1PQO A;  1L82 A;  3PBL A;  1D2W A;  1FBK A;  3HH4 A;  1QS9 A;  2Z73 A;  1L05 A;  1L46 A;  1C60 A;  2IGC A;  130L A;  3SN6 R;  4GP4 B;  171L A;  2YCW A;  148L E;  3FI5 A;  4MQS A;  5G54 A;  3C8Q A;  182L A;  1S51 A;  160L A;  221L A;  2HPY A;  1P6Y A;  1L48 A;  1C6A A;  1L61 A;  3G3X A;  1H68 A;  1C62 A;  2ANV A;  1KG9 A;  3ABW A;  3QJU B;  5F8U A;  1L81 A;  3HUK A;  3S3B B;  1KY1 A;  1O0A A;  3CDQ A;  174L A;  1L00 A;  1PY6 A;  233L A;  237L A;  3KJ6 A;  4HWL A;  1QTC A;  3VHZ A;  241L A;  1OWY A;  1QTD A;  5G2C A;  260L A;  1IXF A;  1G1W A;  1LGX A;  151L A;  4ARM A;  3HUQ A;  4JQ6 A;  4E97 A;  191L A;  1P36 A;  5J7A A;  3DMV A;  7LZM A;  5I14 A;  3L64 A;  3QJQ B;  1R2N A;  235L A;  1C6J A;  4GRV A;  3A7K A;  5H2M A;  1LYI A;  139L A;  131L A;  1LI3 A;  4EPI A;  1EPY A;  4PXK A;  5C1M A;  1L37 A;  2YCX A;  4UG2 A;  201L A;  2R4R A;  1L93 A;  1I6S A;  146L A;  166L A;  262L A;  3HAO A;  1LI6 A;  4WW3 A;  3ZPQ A;  3OE9 A;  2HUK A;  3GUI A;  1QT6 A;  1BM1 A;  102L A;  181L A;  1JTN A;  1L43 A;  218L A;  2RH1 A;  1CU5 A;  3QAK A;  2F93 A;  3S8F B;  4G7S B;  1SSW A;  5H2O A;  1L65 A;  1L54 A;  176L A;  217L A;  1G06 A;  3QJS B;  177L A;  5B0W A;  1D3N A;  4L35 A;  3VI0 A;  5BR2 A;  2RBO A;  4KNF A;  1T8F A;  4GP5 B;  1L30 A;  1L69 A;  3QDC A;  1L56 A;  1L72 A;  1L13 A;  4BVN A;  4G7R B;  1TN0 A;  4A4M A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1L45 A;  1F10 A;  1P37 A;  4DAJ A;  1GDX A;  3QAP A;  4QRY A;  3A34 A;  5LAF A;  4BUO A;  183L A;  3GXR A;  2F2N A;  4LT0 A;  2OEA X;  3C82 A;  2MEF A;  1B7M A;  2JAG A;  1C68 A;  238L A;  2DQI Y;  7LYZ A;  2D4K A;  1GU8 A;  5M1Y A;  3HWL A;  1BRD A;  1L31 A;  3GUP A;  3L2X A;  1L75 A;  3C7Z A;  3B0O A;  152L A;  1DYA A;  4LYC A;  3A92 A;  3GUN A;  1L19 A;  3NY8 A;  1L21 A;  2OU9 A;  2ZYP A;  3IWR A;  2Z6B A;  1UBZ A;  107L A;  4H9A A;  1HFY A;  1IVM A;  4NY5 A;  3B0I A;  4I7L A;  5B06 A;  2YBJ A;  2OE4 X;  1IP4 A;  3GXK A;  1HER A;  4Y9H A;  3UTX A;  1LZA A;  1XSF A;  210L A;  1FLW A;  2D91 A;  2VB1 A;  4PRU A;  5H2L A;  1YAQ A;  4TSC A;  2OU0 X;  3K3T A;  1C6K A;  4W55 A;  1C6D A;  2DQC Y;  5KXW A;  1D3F A;  4TL3 A;  1GB9 A;  2ZIY A;  4I7S A;  1GHL A;  4I7K A;  1GF0 A;  4EOF A;  1IOR A;  2LZT A;  2KSY A;  1IY4 A;  3QJT B;  1G7J C;  1HMK A;  1S52 A;  2FYD A;  1L58 A;  1OUJ A;  1B2K A;  4NWE A;  1TAY A;  1LZD A;  1P8I A;  3LYM A;  3MGW A;  5KXT A;  2Z39 A;  1IOT A;  4NG8 A;  3C7W A;  1LI2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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