3QB0A

Crystal structure of actin-related protein arp4 from s. cerevisiae complexed with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
480
structure length
427
Chain Sequence
GGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLVIDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDIGHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYVPLKRTKNELIGLADLVYSSIMSSDVDLRATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGVERLLNDRFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural biochemistry of nuclear actin-related proteins 4 and 8 reveals their interaction with actin.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 4
total genus 117
structure length 427
sequence length 480
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qb0A03
2YHXA 1GLBG 1BOTO 3LDLA 2FLOA 4CI6A 3O4WA 3H1VX 1XQSC 5FPMA 3VGKA 2Q97A 1HKCA 5EX5A 5AQWA 3EKUA 1T44A 3VOVA 3MMVA 3MN6A 5BREA 4EFHA 1IJJA 3FFKB 2ASPA 5AQTA 3B8AX 1NGGA 4MLEA 4B1UB 2P9LB 3KHYA 4GY2B 3BP8A 4MO5A 4FL9A 4B1YB 2CH6A 3H6EA 1XUPO 5BN9A 2H3GX 4JHDA 3MK6A 1NMDA 3HTVA 1NLVA 1HKGA 2HMPA 4GNIA 3HZ6A 2E2PA 3QBXA 3LL3A 1QQNA 1MDUB 2FSKA 4FWRA 4L3QA 4QS9A 3RSEB 1S22A 2QWPA 3HI0A 4NB4A 2D4WA 1RFQA 4BR7A 1HJOA 5AFUA 2CH5A 3IUCA 1YXQA 1HPMA 3FLCO 1C0FA 3H3NO 4ISGA 3BUZB 4FWMA 4O5FA 3UB5A 1X9JA 5AQFA 1LCUA 2F9WA 4MO4A 3SJHA 3O8MA 4B1XB 3GOIA 3FR0A 4M63C 4M7XA 3VGLA 2FSJA 4YDUC 3R9PA 4BRIA 5KPRA 1GLAG 1YVNA 1X3NA 1Z05A 3MN7A 1QQOA 3U4LA 4BG9A 3VEOA 1JCFA 3J8AA 2P9PA 1KAZA 2W41A 4CBXA 2E88A 1HUXA 1XC3A 4H5TA 3S41A 3MN9A 3CQYA 4BRLA 5LJVA 1CZAN 3EL2A 2D0OA 4WYBA 1EQYA 3FZFA 4CBUA 2V51B 1GLFO 2ZWHA 4BRAA 3WQUA 2VYPA 3LDNA 1T6CA 3U8XA 2V7ZA 5EXWA 2E1YA 3JS6A 3O5BA 3QDKA 4KBOA 4PKHA 1ATRA 1C0GA 1HX1A 3GBTA 2P9IB 3C0BA 2YI1A 4BC4A 1BA0A 3BF3A 3O1BA 3A0IX 4FPAA 4I6MA 2PBDA 1BDGA 3CERA 4XH1A 1YUWA 3CJAA 3SK3A 1KXPA 5CE3A 3LM9A 2IVOA 2P9KA 3L6QA 1ZBSA 4CD3A 3DXKA 1X3MA 1HLUA 3ATUA 3EZWA 4JN4A 4IXCA 2V7YA 3GL1A 3IFRA 4FOIA 3EN9A 3D2EB 5AQYA 3MCPA 3IMXA 3ID8A 4BQLA 4CZIA 4DB3A 5LJWA 5AQVA 3AAPA 2IVPA 4K42A 3VPZA 3CJ9A 3CIPA 5EOYA 2QXLA 1DGKN 1T6DA 2V52B 3QFPA 3VF2A 3A5OC 1NBWA 5EVZA 2GELA 4HWIA 2QWNA 4RTFD 3SMSA 2A40A 5ADXH 2P9IA 2A41A 4H0YB 3MN5A 4A61A 3HM8A 3WT0A 1MA9B 1E4FT 3ATVA 3QMLA 3ENHA 2Q1NA 4BRKA 3ULEB 2D1KA 4BC3A 3AARA 3VGMA 5AQXA 1BU6O 2ZGZA 2QW9A 3D7EO 3FZKA 3VEVA 5B8HA 4H0TB 4CZLA 3L0QA 2P9SA 2NRHA 3H3OB 2A3ZA 3CHWA 3WQTA 1DKGD 4CZJA 3GDQA 1TUYA 5AZJB 2CGLA 2Q2RA 2I7NA 3M1FA 3JXUA 2Q36A 2YHWA 4PKIA 4H5NA 3DXMB 2A6AA 3GG4A 1QHAA 3WUHA 2QWOA 3HBTA 4BC2A 5F0XA 5EY4A 5BPNA 1BG3A 4FPBA 4CZMA 3ZX0A 3ZEUA 3CI5A 2W40A 2A42A 3CJCA 4FSVA 5ELZA 4H0VB 4Z94A 2GWJA 4EIAA 1JCEA 2E8AA 4H5VA 5AQKA 3IDHA 1NGAA 3QBWA 5AQSA 3VESA 4BRMA 5AQRA 4BRNA 1KAXA 4JAXA 4K43A 4BROA 1NGIA 3D2FA 4BREA 3FZHA 3VF6A 3VEWA 3RSEA 4YDUA 2P9NA 2UYTA 4Y0WA 2HF4A 4DQ8A 2BUPA 4NO7A 5E26A 3D2EA 1SAZA 3DJCA 4BRFA 5AQLA 3FGUA 3CETA 4FOEA 1ATNA 4FWNA 2GEMA 4BR0A 3FE1A 1Y64A 1BA1A 2QWQA 4FWPA 2AA4A 4JD2A 5AZIA 2ZGYA 2YCHA 5BPMA 1NGHA 2FSNA 5AQMA 1P8ZA 5JMVA 4WQ5C 2YJFA 4WQ4C 3ZX2A 4BVOA 1E4GT 3A5LC 1ZXOA 2P9UB 4CBWA 3WXJA 4WQ4A 2EWSA 4JD2B 5AZIB 4K25A 3WEEA 1V4SA 5LY3A 2FXUA 4CZHA 3QFUA 4IJNA 1NGJA 2F9TA 3VETA 4IJAA 5AQQA 4HTLA 3ZETA 4B9QA 2E1ZA 3A8YA 4XH4A 1U2VA 4O8KA 3WXLA 2J4RA 4C23A 4CZFA 2BTFA 3ZEUB 3A5MC 2ASMA 2VCPA 2FF3B 1TYQB 5F2RA 4CD1A 5FPDA 3R8EA 1WOQA 1BUPA 3U9ZA 1GLDG 3WEEB 4EHTA 3QICA 1MWMA 2D0PA 4BRGA 2P9KB 2CGKA 3M3ZA 4QS8A 5BPLA 2P9LA 3HSCA 3W0LA 4BR9A 5FPEA 1QZ6A 2E2OA 3D2FB 1K8KA 4LC9B 2P9PB 4RCHA 3UKRB 4A62A 1R59O 5JLFA 4M7YA 3FZMA 3OHRA 1GLCG 2P9UA 2QWRA 1MWKA 2I7PA 5AQPA 3I8BA 2QM1A 1GLJO 3WXKA 4A2BA 5BRDA 4BG8A 2VWBA 5AQIA 5KQDA 3DWLA 3WXIA 3AAQA 3CJ7A 1GLEG 3C7NB 5KPZA 4BRDA 4PL8A 3DXKB 1QZ5A 1J6ZA 3AY9A 1U2VB 2DPNA 4CZEA 4H0PA 3UKUB 2HOEA 4BRCA 2OANA 2Q31A 1ZC6A 4FWQA 3U9DA 1ESVA 1DEJA 3MDQA 2QWMA 3VEYA 2AP1A 4RWTA 4ISFA 3SLCA 4FWLA 4K41A 1TUUA 3UKUA 3H46O 4IWVA 5AQUA 1NGCA 4B1WB 4IZ9A 5KPTA 1JCGA 1NWKA 2PAVA 1NGEA 3QB0A 4XEIA 4A2AA 4H5WA 2QWLA 3LM2A 4EHUA 5AZJA 3L4IA 3M6GA 4DHYA 2E2NA 3H1QA 2GWKA 2NZTA 3LDOA 4BR5A 5AQNA 4B1VA 5AR0A 3VENA 5BR9A 1H1VA 1NGBA 1KAYA 2A5XA 1BWFO 3R6MA 3UKRA 4BRQA 1NGDA 4H5RA 4ISEA 5I9EB 4BGBA 4BVPA 4FWKA 1GLLO 3O6WA 4JNEA 3DAWA 3FZLA 2IVNA 4AM7A 3LDPA 5TKYA 1NM1A 2KHOA 3C7NA 2YHYA 3G25A 1NGFA 1QQMA 4PKGA 3P4IA 3DXMA 5AQGA 5JLHA 1WUAA 1LOTB 3W3DA 4E1JA 1ATSA 2P9NB 4PL7A 2ASOA 4CZKA 5ADXA 3VERA 1HKBA 2E2QA 1RGIA 4FO0A 5FPNA 3KVGA 4I6MB 4XH5A 5AQOA 4BC5A 4IO8A 3EO3A 4BR4A 4BQZA 4CZGA 5BRFA 2P9SB 4H0OA 4QS7A 1D4XA 4FWOA 4WQ5A 4F9OA 1BO5O 1OKJA 3VEXA 3EKSA 2ITMA 4B1ZA 3A5NC 3F9MA 1Z6RA 4FWSA 3SMPA 1RDWX 5AQJA 2WUSA 1Q18A 3O80A 4JHDB 3UE5A 2NLXA 3KZBA 2HF3A 1S3XA 1U6ZA 2Q0RA 5KQ8A 4J8FA 1G99A 3GE1A 3LDQA 1YAGA 1K8KB 2CGJA 1SQKA 3BEXA 5E84A 2GUPA 3ENOA 2E20A 4BRHA 4AM6A 3TU5A 3VF4A 4H03B 4BR2A 5AQHA 4H0XB 1TYQA 2FF6A 3H45C 2YJEA 3ULEA 2Q0UA 3TPQA 5AFUH 2ZF5O 4CJ7A 4MLHA 3BF1A 3CJ1A 2IIRA 4BGAA 1IG8A 3O1WA 4BRPA 3ZX3A 3O08A 5JICA 5BRHA 4DCHA 1SZ2A 2GTDA 5AQZA 3VEZA 3ZETB 5F1XA 5BN8A 3CJBA 1V4TA 4EAHD 3CQXA 3I33A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASVA 3LDLA 3LPUA 3KKSA 4DTSA 1IG9A 5DK5A 1S1XA 1HKCA 5AQWA 3SAHA 3EKUA 1C6VA 3NGIA 3B8AX 2AJQA 1K9MO 5HRPA 4GY2B 3BP8A 4JI3K 3BZCA 3MEGA 4WFBL 2IDOA 3SUPA 5C0YA 2P1JA 4FK0A 4JHDA 1TAUA 4DU1A 3PO4A 1TL3A 2OZMA 2DY4A 2HMPA 4M3ZA 1S22A 3PX0A 2D4WA 5I3UA 4BR7A 3CMAN 4M3RA 5AFUA 3G10A 1S9GA 3MX5A 3VQDA 3IUCA 4DTRA 4IO9L 1HPMA 4FM0A 2ZM6K 2OCEA 3SI6A 3VQ4A 2RF2A 2FBTA 3PUFA 2PZSA 3UB5A 3T3FA 1X9JA 3OBWA 1UA0A 4KB1A 1TKZA 3B6OA 4E7IA 4M63C 1Q9XA 3VGLA 3TTFA 1EXQA 3SQ1A 4I2PA 3K5NA 2YHBA 1X3NA 1Z05A 3MN7A 3U4LA 4BG9A 1NU0A 4MDBA 5HROA 3ALYA 3O4QA 1UWBA 4H5TA 3RRHA 4B3OA 3HRGA 3CM6A 4DR1K 1M1KO 5LJVA 4DTXA 3THVA 1CZAN 3I0RA 4CEAA 4CERA 1WSEA 1S1VA 2FC0A 1WAJA 4BRAA 3K5MA 2DFFA 4FJNA 1T6CA 2E1YA 3KLEA 2KLAA 1C0GA 1YHQN 3C0BA 2UXCK 4BC4A 3OA9A 1BA0A 3OJUA 2BANA 3VA3A 3CERA 1IKXA 1O1WA 3CJAA 3J7ZO 3SK3A 2G8FA 1IBKK 1VSJA 4CD3A 2O4IA 1X3MA 3MWPA 4CGJA 2YKNA 4JN4A 1IKYA 1VSHA 4OKJA 4Y1CA 3IFRA 3D2EB 1XMOK 3ID8A 3V1QA 3K0SA 4CVNE 1I39A 3CMEN 3LPTA 4NLCA 3DMJA 2NRVA 3WNGA 1DGKN 4DQRA 3VQEA 1T6DA 1NBWA 4CGGA 4RTFD 4HWIA 3M8QA 4AHUA 1UAXA 2VGMA 2GBZA 4R79A 3WT0A 1MA9B 3QEWA 4B9TA 4JI8K 2Q1NA 4CIGA 3ULEB 2D1KA 4BC3A 4B3RK 3AARA 2YKMA 4I7FA 5AQXA 1N32K 3U6FA 1ASUA 5FRNA 2P5OA 2KW4A 4MFBA 4MQ3A 4CEOA 3MXMA 2BGGA 4KKOA 2P5GA 1TK5A 3HP9A 4LF9K 3C6AA 4M3TA 1TK0A 2A3ZA 3DM2A 3WQTA 4Z4EA 2VQEK 4YOUA 4WFNL 2HHWA 4KI4A 5M1OA 2Z1HA 3TARA 3MWTA 5FRMA 3JXUA 5M1NA 3E9OA 1GOAA 5D3GA 3DXMB 4BC2A 4M42A 5EY4A 5BPNA 1BG3A 4CEDA 4CZMA 1K8AO 3NGYA 3E01A 2B5JA 4KTZA 1ZBFA 3CJCA 1JLFA 1BI4B 3PSFA 4BRMA 5AQSA 1N6QA 2OPPA 4LSLA 1KTQA 2HNDA 1WSJA 3D2FA 4G9ZA 3FZHA 4PUOA 4YDUA 2B4JA 2D0BA 3SYZA 3HSTB 1TK8A 3CM5A 1NKEA 4IG0A 3D2EA 4YORA 1SAZA 3QESA 1QE1A 3ZYYX 3I8DA 3AO4A 4FOEA 2ETJA 3G0ZA 4BR0A 1Y64A 1SL0A 4CJQA 2YNFA 3LALA 1RTHA 2G8IA 1BA1A 2AA4A 5BPMA 3RTVA 4GW6A 1T03A 3JYTA 5SWMA 3V1OA 4WQ5C 2VGNA 5LMUK 2BH1A 1E4GT 4CW7B 4BDYA 3A5LC 2P9UB 4JKDA 3J81O 3O3GA 3TTCA 4JD2B 5AZIB 1V4SA 4CZHA 3QFUA 4IJNA 2BE2A 2F9TA 5CY4A 3VETA 3MEDA 4IJAA 3QETA 1KSPA 4N5SA 3QNOA 2O8FB 3AA5X 4O8KA 3WXLA 2BTFA 1BISA 4C8MA 1TAQA 2ASMA 3J7AP 3NF7A 5FPDA 4DUYK 1BUPA 1GLDG 1MWMA 3HM9A 3EYZA 4FK2A 3M3ZA 2P9LA 3HSCA 4BR9A 3K5LA 5FPEA 1QZ6A 2E2OA 3K5OA 1ZBIA 3CFOA 3DRSA 5JLFA 3OHRA 3ITHA 4W5RA 4CGDA 1GLJO 4JKHA 3CCVN 1U48A 4BG8A 5AQIA 1BQMA 3OYHA 3DWLA 3ZLJA 1GLEG 3C7NB 2WFBA 5H1SQ 4JK9A 1KQSM 1SL1A 1S6PA 4FJ8A 3AY9A 3AA4A 2HOEA 2DFEA 1RTIA 1S72N 1ZC6A 4O44A 4ZTJA 2QWMA 4JEPA 4KB0A 4C8LA 4E1NA 4CHOA 3AVAA 3ZT4A 2HBMA 4PWDA 3ZSQA 1J5OA 3QLHA 3LP2A 3TR8A 3V9WA 1TUUA 1OVQA 5C12A 4CE9A 3QO9A 5AQUA 1NGCA 4B1WB 4IZ9A 5FLXO 3KLGA 5KPTA 4NXNK 4DTJA 3AA2A 2C1GA 1OVYA 4J2EA 4EHUA 3DRPA 3L4IA 1YIJN 3H1QA 2WOMA 4CK3A 4DSEA 4EZ9A 4JI7K 4DS5A 3UKRA 1BWFO 4LFCK 4ISEA 1YJ9N 2XRIA 1J5EK 1XHZA 3K2PA 1NM1A 4DKWA 3THWA 4BACA 2HBKA 3OYIA 1RT5A 3DXMA 4AILC 4C8OA 3E9PA 1WUAA 4QAGA 3W3DA 4CFCA 4PL7A 2HNZA 5ADXA 3KVGA 4CF8A 3L2WA 2BDPA 1KFSA 3VQ9A 3KD5E 2NRTA 3NDKA 4DTUA 1RDDA 3O9UA 4B1ZA 3VEXA 3EKSA 4GVEA 1WB9A 3A5NC 3LZJA 1Z6RA 1RDWX 4DR2K 3NH2A 3LWLA 3VQPA 4DR3K 4X64K 3BGRA 4FW2A 3NF8A 5KQ8A 1Z26A 4AF1A 1YAGA 5HLFA 2F4VK 3CD6N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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