3QB0A

Crystal structure of actin-related protein arp4 from s. cerevisiae complexed with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
480
structure length
427
Chain Sequence
b'GGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLVIDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDIGHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYVPLKRTKNELIGLADLVYSSIMSSDVDLRATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGVERLLNDRFR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-related protein 4
publication title Structural biochemistry of nuclear actin-related proteins 4 and 8 reveals their interaction with actin.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Structural protein
total genus 117
structure length 427
sequence length 480
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qb0A03
5E84A 2PAVA 3DWLA 3CHWA 4BRMA 1ATNA 1HKBA 5BRHA 3IUCA 4CZKA 3DXKB 2OANA 5AQKA 4Y0WA 4MLHA 4RTFD 3ULEA 1QZ6A 2KHOA 1T6DA 4JD2A 3VESA 2FXUA 2WUSA 3ENHA 1H1VA 2YCHA 4CJ7A 1NGEA 3UKRA 4CD3A 1HUXA 3SMPA 5E26A 1GLDG 3C0BA 1HJOA 2VYPA 3QMLA 4ISFA 4IWVA 4MO4A 4BVOA 4BRAA 3EZWA 2P9PB 5AQNA 2BUPA 3LDOA 1DKGD 3OHRA 1NGCA 3VERA 3O5BA 3H3NO 2GELA 4CBXA 5F2RA 3O1BA 3MN7A 3LM9A 5BN9A 3EL2A 2A6AA 2ZGYA 3CJAA 4IJAA 4B1WB 5BREA 4RCHA 3RSEB 3F9MA 2QWRA 3CQXA 2QWMA 2Q36A 4A2BA 5BPLA 5F1XA 2IVNA 3VGLA 5FPDA 2P9PA 3BP8A 1JCEA 4HTLA 2E8AA 4BRDA 1BA0A 2V52B 3CJ9A 5AQMA 1MWMA 3VGMA 4FL9A 2GWKA 5AQVA 2J4RA 2FF3B 3U9ZA 1CZAN 3VETA 1R59O 1HLUA 2GTDA 4M7XA 1XC3A 3RSEA 3L0QA 4H03B 5KQDA 2E1YA 3ATVA 2E2PA 4XH1A 4WQ5C 1KXPA 5AQGA 3WQTA 1NGFA 4WQ4A 4WYBA 2QW9A 4HWIA 5AQRA 1OKJA 4BVPA 2W41A 1ESVA 3MDQA 1S3XA 3AARA 3VEYA 2HMPA 3CIPA 1TUYA 3UE5A 2Q1NA 4MLEA 3MN5A 2QWPA 2NRHA 4BRLA 3R9PA 4B1XB 4B1ZA 5AR0A 5AZIB 3IFRA 4AM7A 2Q97A 5KPTA 4BRGA 3WQUA 3O8MA 4IJNA 5ADXH 3VEWA 1V4SA 1V4TA 2HF3A 2E1ZA 2P9LB 3ZETA 2HOEA 5EOYA 1X3NA 4FWKA 1RGIA 3MCPA 4DHYA 1D4XA 2IVOA 5TKYA 3O80A 4ISGA 3A5OC 4JN4A 3U4LA 3VGKA 4JD2B 2P9IA 5AZIA 4CZGA 2QXLA 4H0YB 4BRFA 1DEJA 4BGAA 4BROA 3MN6A 1TUUA 1K8KA 4CZEA 4A62A 3UKRB 1BOTO 5AZJA 3B8AX 3CJ1A 3QB0A 4GNIA 3L4IA 2P9LA 1GLEG 4A61A 1E4FT 1GLBG 4KBOA 2ASOA 2GUPA 4BC4A 1YUWA 3BEXA 3CI5A 5AQOA 2E2NA 2Q0RA 4H0OA 4CZFA 1T6CA 1IJJA 1NGGA 3FZFA 3P4IA 4BR9A 3HSCA 4H5WA 4NO7A 4O8KA 3CETA 4DB3A 4K42A 2FSKA 2A41A 3U9DA 1HPMA 2D1KA 4BC5A 4BC2A 4ISEA 2Q2RA 3O1WA 4JHDB 3VEZA 2EWSA 2ZF5O 1P8ZA 5ADXA 5AQSA 3CJCA 1NLVA 1KAZA 3EKUA 3TU5A 3QBXA 1NGHA 1BG3A 5AFUH 2VCPA 1X9JA 2CGJA 4CZJA 5F0XA 4LC9B 2D0OA 2VWBA 1LCUA 5AQFA 2DPNA 4B1UB 4B1VA 3GE1A 2NZTA 5JLHA 4FWPA 1NBWA 1Q18A 4BQZA 1LOTB 4JHDA 1J6ZA 5EY4A 2E2QA 2V7YA 1YAGA 1MA9B 3GBTA 4FWLA 1YVNA 1RFQA 4IO8A 1ZC6A 4CBWA 1NGJA 2FSNA 1EQYA 1NGDA 3WXKA 3WXIA 4B1YB 2FLOA 4Z94A 4DQ8A 3KZBA 2GEMA 4QS7A 2QWOA 3R8EA 2AA4A 1JCFA 4AM6A 1BWFO 4FWOA 4H5RA 1GLJO 2E88A 1QZ5A 5AQTA 4H5VA 3CJ7A 3CERA 1NGIA 4CD1A 3D2EB 2FF6A 1QQNA 4FOIA 3ENOA 3ZEUB 5BRDA 4MO5A 5LY3A 2CH6A 2I7NA 5AFUA 3FE1A 3A5NC 4FWNA 5B8HA 1DGKN 3W0LA 3ZETB 4L3QA 4H0VB 3SJHA 3VEOA 3LDQA 5AQZA 1SQKA 2P9NB 3EKSA 3VEVA 3D2FA 3MK6A 5AQQA 2YHXA 5JMVA 4FPAA 4JAXA 3LDPA 4BR2A 3GL1A 4IZ9A 2P9IB 3I8BA 4BRNA 2E20A 3R6MA 3D2EA 5BRFA 4XH5A 1KAXA 4YDUA 3ZEUA 2AP1A 2ZWHA 1K8KB 3AAQA 3CQYA 5AZJB 2YHYA 3ZX0A 1HX1A 2YJEA 3A0IX 2CH5A 4H0PA 3U8XA 1KAYA 1HKGA 2Q31A 1Z05A 3MMVA 3VOVA 3HI0A 4JNEA 1BA1A 3DAWA 2P9NA 2F9WA 3CJBA 3JXUA 2FSJA 5EXWA 4BR0A 4EHUA 4BRHA 4FSVA 2A3ZA 2YJFA 2IVPA 4BRQA 3LM2A 4PL7A 4PKHA 1QQOA 4IXCA 4M63C 3DJCA 5AQLA 4EFHA 1BU6O 2HF4A 3AY9A 4QS8A 5KPRA 4BREA 3SLCA 3FFKB 2QWNA 5AQWA 4FWRA 3QFPA 3WXJA 1G99A 5BR9A 3QDKA 3GG4A 3FZHA 4CBUA 1RDWX 3AAPA 3WT0A 4NB4A 4CZHA 4EIAA 4CI6A 3H3OB 2BTFA 3O4WA 3FGUA 2Q0UA 3DXMB 1NMDA 2P9SA 1QQMA 2A42A 3I33A 3G25A 3SMSA 2ITMA 1U6ZA 3VF6A 2V51B 3HZ6A 3J8AA 3KVGA 3BF3A 5FPEA 5BPNA 4E1JA 3MN9A 3BUZB 3LL3A 3FZLA 4B9QA 2P9UB 1NGBA 3HTVA 1BDGA 4FWMA 4BC3A 5LJVA 5JLFA 3GDQA 1U2VB 3DXMA 4GY2B 5LJWA 3WEEA 3TPQA 1JCGA 3LDNA 2D0PA 3ZX2A 5EVZA 1NM1A 4XEIA 5AQYA 3M6GA 4RWTA 1Y64A 3GOIA 4I6MB 3IMXA 1GLAG 4CZIA 1YXQA 3VEXA 3ZX3A 4CZMA 4F9OA 4H5NA 4WQ5A 1NWKA 2IIRA 3DXKA 4J8FA 2CGKA 2P9UA 1QHAA 5KPZA 5CE3A 3FZMA 3O6WA 4K25A 4M7YA 1ATSA 1U2VA 5FPNA 5BPMA 4FO0A 5EX5A 2NLXA 2ZGZA 3FR0A 5JICA 3D2FB 3VF4A 5AQHA 1E4GT 1T44A 3H46O 3VENA 2P9KB 5AQUA 3JS6A 1XUPO 1MWKA 3UB5A 4I6MA 3C7NB 4BRCA 3FZKA 2GWJA 3EN9A 2UYTA 1GLLO 2I7PA 4BGBA 3SK3A 1WOQA 2QWLA 5I9EB 3H1QA 2QWQA 2YI1A 3A8YA 3O08A 3UKUB 2E2OA 1XQSC 3EO3A 3HM8A 4FPBA 4PKIA 4BQLA 4BRKA 5KQ8A 4BG8A 2A5XA 2ASMA 1S22A 4BR7A 4BRPA 3QBWA 2P9KA 5AQJA 4PKGA 1TYQB 3C7NA 4PL8A 4DCHA 4O5FA 3QICA 1X3MA 1MDUB 3D7EO 1WUAA 3A5LC 1C0FA 3LDLA 1ZBSA 3HBTA 1ATRA 4FWSA 4C23A 3A5MC 4CZLA 1SZ2A 1HKCA 4H5TA 5ELZA 3L6QA 2F9TA 3M3ZA 3UKUA 3ID8A 3BF1A 3H6EA 4QS9A 4BG9A 3ATUA 4A2AA 1NGAA 3M1FA 5AQXA 3IDHA 4H0TB 1ZXOA 2H3GX 2W40A 2P9SB 1TYQA 5FPMA 4EAHD 3W3DA 4XH4A 1BUPA 2PBDA 3QFUA 2CGLA 3VF2A 4WQ4C 4FWQA 3H1VX 4BR5A 4K41A 3H45C 2QM1A 2ASPA 1GLFO 4K43A 2D4WA 4BR4A 1GLCG 1BO5O 3FLCO 3VPZA 3WUHA 5BN8A 1Z6RA 2V7ZA 5AQPA 3ULEB 1C0GA 1IG8A 3KHYA 2A40A 4H0XB 3S41A 5AQIA 3WEEB 4BRIA 1SAZA 3WXLA 4YDUC 2YHWA 4FOEA 4EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FK9A 4M3RA 1WN7A 4KHYA 1OH7A 3CHWA 3HK2A 1LW0A 3O9UA 1HKBA 3IUCA 4N76A 4Y0WA 4DTOA 1XC9A 1T6DA 3O3HA 4E7JA 1EXQA 1OVQA 5T7BA 3LAMA 3MX2A 4DQSA 4IG0A 5E26A 5M1FA 4MO4A 1VQ4N 5AQNA 4C8LA 4JS5A 1BGXT 4Z4EA 2AJQA 3OHRA 4FVMA 1DTQA 2GELA 4JKGA 1JLGA 3O1BA 1NU0A 4DR7K 3QEIA 1NKCA 5M1PA 3D0PA 3EL2A 4IDHA 3CC7N 3RSEB 3AA2A 3CQXA 4A2BA 5H1SQ 2UXDK 4QOZB 3C6AA 1JLBA 4Z0UA 3AO1A 1BA0A 3CJ9A 5AQMA 3VGMA 5AQVA 4B8AB 4O0IA 4OX9K 4YY3K 3CCEN 4KREA 2HB5A 1C1CA 4CK1A 1A5XA 2ZQBA 1KCFA 2F8SA 4M7XA 2WFBA 1KD1O 4H03B 1IKWA 1Q86O 3LWMA 3HOTA 2E2PA 4XH1A 3O3FA 2ZJRL 4CGIA 4EP4A 4ELTA 1QSLA 1NGFA 3CCVN 2QW9A 3AV9A 3OYNA 1VQ6N 1S1WA 2W41A 4DFJA 3MDQA 4RW7A 3HXMA 3SYZA 2D0BA 5M1QA 3DLKA 3HM9A 4U67L 2XHBA 3TTFA 3V4IA 1JLQA 2NRHA 4O55A 3IFRA 4AM7A 2Q97A 4BRGA 4JK9A 1ZBHA 3WQUA 4KHQA 3VEWA 3LPTA 3TAFA 4J2DA 3R1XA 3NH0A 2HOEA 5EU7A 3MAQA 3PV8A 2IVOA 2D0AA 3RTVA 2F8TA 1RDAA 4ZTFA 3J7ZO 3C65A 3RR7A 2B6AA 1RT1A 3VN5A 2P9IA 3S9HA 1TV6A 5AZIA 4OPKA 3WNEA 4BGAA 3CCLN 4BROA 4E89A 2ZJPL 1K8KA 4ID5A 2P5OA 3QERA 5CHIA 1ASVA 4J2EA 1YTUA 4JI4K 1RDUA 4KBOA 2UUCK 3Q7BA 1TL3A 4DR1K 1G15A 3BEXA 4DSJA 3K58A 3R3LA 3LP3A 1T6CA 3E66A 1OVYA 3FZFA 4NO7A 4K42A 1HPMA 5GAGP 4BC5A 2Q2RA 3VEZA 1IO2A 1Y97A 2ZF5O 1I94K 1P8ZA 1HJRA 5AQSA 3CJCA 1NLVA 2XO7A 1KAZA 3EKUA 3TU5A 3WNGA 1BG3A 3AGRA 4JI0K 4DR6K 4CZJA 5F0XA 4LC9B 3THWA 1L5UA 4OKJA 2VWBA 3JSMA 3ZYYX 3I0SA 4CIEA 4FWPA 5JVGL 1CXUA 4JHDA 4OLAA 1J53A 4W5QA 1K9MO 3J7YP 4CJRA 3PX4A 1VSMA 4DQ8A 3E1YA 2QXFA 4M3YA 2RE2A 4F3OA 3G0ZA 1JCFA 4FWOA 1QZ5A 5AQTA 3SPZA 3D2EB 1QQNA 4FOIA 1S1UA 3OYAA 1D9FA 3ENOA 1TKZA 4CGJA 4MO5A 3LZIA 5I42A 4RW9A 3DLLL 1BCMA 4FWNA 3W0LA 4L3QA 3VEOA 4BECA 1QE1A 2P9NB 1WNSA 4DFMA 1I39A 2W6KA 2YHXA 5AQQA 1XHZA 4JAXA 3C6UA 4GMJB 1TKXA 4IZ9A 3L2WA 4DSLA 1D5AA 4O8UA 1EX4A 3N4QA 3I8BA 4BRNA 1R0AA 3R6MA 4XH5A 3LP0A 4QAGA 1KAXA 4YDUA 3ZEUA 4RW6A 2QKBA 3L2RA 4DLGA 3SQ1A 2YJEA 3THYB 4FM1A 2Q31A 1HKGA 3HI0A 1S9GA 3JXUA 1IKYA 4FLYA 4BR0A 4EHUA 4LH5A 3KD5E 4IOCL 2YJFA 3E9OA 1UOCA 2IVPA 4KH4A 3SQ2A 1QQOA 4M63C 3SJJA 3ZT2A 5GADP 4CIFA 1QVGM 4PY5A 3WXJA 1G99A 4E3SA 3OA9A 2ZD1A 3WT0A 3ALYA 3O4WA 2WC9A 4CGFA 1NK7A 1NMDA 4I9LA 3NHGA 3G25A 3DOKA 3CFOA 5HRNA 2ITMA 5I3UA 2O8BB 3KVGA 3K5OA 3TSQA 2HSTA 3BUZB 3ZT4A 4CEQA 1YJNN 4NCAA 3HTVA 4FJNA 2BANA 5LJVA 3AVCA 4MDBA 3DXMA 4GY2B 4FJMA 4BWJA 3EY1A 1KFDA 4DQRA 3M6GA 5C2DA 1Y64A 3HT3A 1KVBA 4I6MB 2LSNA 1YXQA 1RDCA 3IRXA 5LMUK 4GW6A 4H5NA 4DF8A 3DXKA 1JLAA 4LF6K 2CGKA 2P9UA 4DS5A 5JS1A 1VK0A 4WFBL 3FZMA 1NK8A 4B3RK 4KO0A 3AVGA 3O6WA 5CYMA 5M1NA 1U2VA 4FJIA 5DM6L 2O8DA 4CK3A 2ZGZA 4CE9A 3FR0A 4O0JA 5JICA 1S72N 4B9TA 1HYZA 3VF4A 2IC3A 5HRSA 1KSPA 4ICLA 3LALA 1BQMA 1MWKA 3AA5X 3C7NB 3DLHA 3OBYA 4BRCA 4DSKA 1ASUA 3I56N 1X9SA 2OYQA 3EN9A 2YX6A 4LF4K 4DQPA 4K8XA 2I7PA 4X64K 3T3FA 1WOQA 3VTIA 3H1QA 1XI1A 2QWQA 2YI1A 3A8YA 2VQFK 2YHBA 4FW1A 3HM8A 4FPBA 1I3AA 3HPHA 3CYGA 2ITGA 3KTQA 2ASMA 1GOBA 1J54A 1S22A 5AQJA 4FJXA 1NMNA 2P1JA 3G4SN 4PKGA 3OYEA 3CQ8A 4KHUA 4HVJA 2F96A 1YTAA 3A5LC 3VQ4A 3G71N 5HLFA 3SPYA 3HBTA 2HNYA 3DLEA 2G8KA 3J7AP 2PYJA 1BHLA 3O9QA 4BACA 3M3ZA 4ILHA 4A5AA 3SBTA 4CJ5A 3BF1A 1IV0A 1HNXK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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