3QB0A

Crystal structure of actin-related protein arp4 from s. cerevisiae complexed with atp
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
480
structure length
427
Chain Sequence
GGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLVIDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDIGHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYVPLKRTKNELIGLADLVYSSIMSSDVDLRATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGVERLLNDRFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural biochemistry of nuclear actin-related proteins 4 and 8 reveals their interaction with actin.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 4
total genus 117
structure length 427
sequence length 480
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qb0A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qb0A03
4KBOA 3I8BA 4NB4A 3FR0A 2GWJA 3CHWA 1ZBSA 2E1YA 1NGFA 2P9KA 4M7XA 3RSEA 3AY9A 3ZX0A 1ATRA 1NGBA 4PL8A 3O6WA 2I7NA 3TPQA 2A3ZA 3MN5A 4BVOA 3I33A 4A2BA 3EKUA 3DAWA 4A2AA 1Z6RA 1P8ZA 4BRCA 4FO0A 4FOEA 4CZKA 5LJVA 3CJ9A 2YCHA 4WQ5C 3VGMA 3ZX2A 2BTFA 5AQPA 4BG9A 1E4FT 4CZIA 4BR0A 1TYQA 2P9IB 3F9MA 3O08A 4EHUA 2P9KB 1NGDA 1T6DA 4ISFA 3QBXA 5AQWA 4BC5A 4BRIA 3BUZB 2F9WA 3H3OB 1BOTO 4FL9A 1XC3A 3EZWA 2YJEA 4JD2A 3VOVA 3ENOA 1BA0A 1T6CA 1LCUA 1HLUA 3HZ6A 2Q36A 4LC9B 4CZJA 4QS9A 3FFKB 5JICA 3U4LA 5AQGA 1K8KB 2YHXA 3UKUA 1JCEA 5AQUA 2E2QA 2IVOA 5AQJA 3DXKB 1BDGA 1BUPA 3ZETA 5AQOA 3MCPA 3FZKA 3MDQA 5AQXA 4YDUC 1QZ5A 5EY4A 1NGIA 2V52B 3QDKA 5AQRA 3QMLA 4H0OA 2EWSA 4CZHA 3B8AX 4H03B 2NLXA 3D2FA 2AP1A 1NBWA 4M63C 5E84A 2W40A 4FPBA 4FWQA 5I9EB 2P9PB 3LM9A 3VETA 2YHYA 1GLCG 3D2EB 1HUXA 1TYQB 2IVPA 2A40A 3VEOA 5KPZA 4BREA 4J8FA 3UE5A 3SK3A 4MLHA 4K41A 3C0BA 3LDNA 1SZ2A 2P9SA 4CZEA 2ITMA 1GLBG 4I6MA 1NGCA 1XUPO 3FE1A 4JN4A 1H1VA 4RTFD 2V7ZA 4CD1A 5EVZA 1U2VB 1Q18A 4QS7A 5JLHA 1ATSA 3KVGA 4IO8A 4B9QA 1D4XA 4B1XB 2ZWHA 2P9SB 5AQKA 3ID8A 4AM7A 3CJ1A 2A42A 4EIAA 3BF1A 4BRLA 3A8YA 1QZ6A 4GNIA 2FSJA 1YAGA 3D2EA 3HBTA 3W3DA 1DKGD 1QHAA 3LDPA 3QB0A 4MO4A 4DQ8A 3HTVA 3AAPA 1HKGA 5AQQA 1TUYA 1NGJA 2CGLA 4BR4A 4A61A 5TKYA 3VERA 1K8KA 2QWRA 3VEYA 1MA9B 5BRHA 3KHYA 1Z05A 1S22A 2P9NA 2VWBA 1G99A 4XEIA 2FF6A 2QXLA 2PBDA 2FF3B 2Q1NA 4DB3A 5BPLA 2KHOA 3CJ7A 2E2OA 3QBWA 4FWLA 4GY2B 3DXMA 4PKHA 2E20A 2HMPA 3C7NB 1XQSC 2ZGYA 4CZMA 2E88A 3WQUA 3VEWA 3TU5A 1GLDG 2QM1A 5AQNA 1ATNA 2BUPA 2DPNA 4H5VA 1ZC6A 2NZTA 3VGKA 4XH5A 3U8XA 4NO7A 3M1FA 4A62A 5KQDA 3VEVA 4IJAA 2ASPA 1BA1A 2CGKA 5KPTA 5B8HA 5BREA 4FPAA 5FPNA 2P9UB 1QQOA 4BRGA 2GTDA 3WUHA 4E1JA 4WQ5A 2F9TA 4L3QA 2CH5A 2GWKA 2D0OA 5AQIA 3A5MC 1SQKA 4H5NA 2FXUA 3DWLA 2Q31A 3IDHA 3JXUA 3ULEA 2NRHA 5FPDA 4JAXA 4K25A 4CZFA 3AARA 2FLOA 1BO5O 3HI0A 4CBXA 1OKJA 3IUCA 1CZAN 4WYBA 1WUAA 4BR7A 4XH1A 2UYTA 3LDOA 3VF2A 4H0TB 3R6MA 4FWRA 2YI1A 5AQTA 5BRFA 3SLCA 3FZMA 1QQMA 1R59O 3DJCA 4FWKA 1HX1A 2A41A 2Q0RA 1NGHA 5AFUH 5JLFA 1RDWX 4JHDA 4BC3A 3FZFA 4BRDA 5BN8A 2AA4A 2YJFA 3GOIA 3CERA 4DHYA 5AZJB 3UKRA 4CBWA 1MWMA 3EN9A 3KZBA 4EFHA 1U6ZA 2VYPA 1BU6O 5CE3A 2E2PA 3VPZA 3CJCA 2IIRA 3LL3A 3DXMB 4RCHA 1LOTB 3H1QA 4JD2B 4HTLA 5JMVA 3WXLA 3ZEUB 4JHDB 3LDQA 3SMPA 4IXCA 1JCFA 3H1VX 5ELZA 3U9DA 1V4SA 3D7EO 2HF4A 4H0XB 3G25A 3QFUA 3ZEUA 2Q97A 3CJBA 5AFUA 1X3NA 5BPMA 4CJ7A 4O8KA 4BC4A 1NWKA 4K42A 4BRAA 4B1VA 4MLEA 2HF3A 4QS8A 3CQYA 4BRKA 1NLVA 3EO3A 1GLEG 1X9JA 4B1YB 4ISEA 5BRDA 3M6GA 4K43A 2D0PA 3ATUA 2Q2RA 3BP8A 3LDLA 5ADXA 1T44A 3L4IA 1YVNA 2P9IA 3O1BA 3CJAA 3IMXA 4FSVA 4BQZA 4FWSA 3WQTA 4BRMA 5FPEA 1C0GA 3QICA 3WT0A 2ZF5O 5AQVA 1S3XA 1ZXOA 1WOQA 1U2VA 4H5TA 3HSCA 2QWQA 3VESA 3O80A 2I7PA 4ISGA 3GBTA 3JS6A 3U9ZA 5BPNA 5E26A 2VCPA 3RSEB 4CBUA 3A5NC 4FWOA 1EQYA 1KXPA 5F2RA 4RWTA 3O8MA 4BGAA 4B1WB 3BF3A 3ULEB 4BQLA 3S41A 2P9LA 2ASMA 3EL2A 2GELA 1GLFO 4CZLA 4H5RA 3OHRA 3D2FB 2QWLA 3O1WA 3O4WA 3ZX3A 4O5FA 2CH6A 2V7YA 4M7YA 1GLAG 1HJOA 3FLCO 5KPRA 4BRQA 2GEMA 2ASOA 3ENHA 4FWNA 4BGBA 3VGLA 2QWNA 1IG8A 5EXWA 3UKRB 5AZJA 1BWFO 1E4GT 3WEEB 3H3NO 2P9NB 4PL7A 3MN6A 1YXQA 3GL1A 5FPMA 4CZGA 2A5XA 2P9LB 1YUWA 3WXJA 3W0LA 3QFPA 4JNEA 3CIPA 2J4RA 3MK6A 4WQ4C 3WXKA 4BC2A 4B1ZA 3H45C 1JCGA 5AQMA 1RFQA 1DEJA 5F0XA 1SAZA 3VEXA 2FSNA 4EHTA 3H6EA 1DGKN 4H0PA 3O5BA 3IFRA 4YDUA 1TUUA 1HKCA 4H0VB 5AQZA 3MN9A 4MO5A 3UB5A 1ESVA 4Y0WA 1C0FA 2QW9A 1NGAA 1NMDA 2QWPA 3SJHA 4BRFA 1KAYA 4XH4A 3H46O 1NGGA 4BG8A 4H5WA 4BRHA 2V51B 5AQLA 2ZGZA 3ATVA 5AQHA 1X3MA 3A5LC 1HPMA 2CGJA 3FZLA 4F9OA 1NGEA 2Q0UA 1MWKA 5LY3A 4FOIA 3R8EA 5BR9A 3SMSA 4PKGA 4BR2A 3A0IX 3C7NA 3VF6A 4IZ9A 3VENA 4CD3A 4IJNA 2FSKA 5BN9A 4BVPA 4BR9A 3FGUA 3MMVA 2WUSA 3HM8A 2QWOA 5EX5A 1V4TA 3A5OC 4Z94A 1IJJA 4WQ4A 2E8AA 1NM1A 5KQ8A 1GLLO 4FWPA 5F1XA 3GDQA 3BEXA 5AQYA 4I6MB 3WXIA 4IWVA 2P9PA 3MN7A 5AQFA 2GUPA 1BG3A 2IVNA 5AZIA 2P9UA 1QQNA 1Y64A 3J8AA 5EOYA 3GG4A 3VF4A 1KAXA 4H0YB 5ADXH 3M3ZA 4BRNA 2YHWA 3FZHA 3WEEA 2OANA 3LM2A 4C23A 4CI6A 4BR5A 1J6ZA 4EAHD 2PAVA 2H3GX 3P4IA 4FWMA 4PKIA 4BROA 4DCHA 4AM6A 4BRPA 3CETA 1GLJO 3GE1A 3L0QA 3VEZA 2E1ZA 1RGIA 2E2NA 5LJWA 2HOEA 3R9PA 2D4WA 2QWMA 3UKUB 3EKSA 5AQSA 4HWIA 1MDUB 2A6AA 4B1UB 5AR0A 3L6QA 2W41A 3AAQA 1KAZA 2D1KA 3DXKA 3CQXA 3ZETB 5AZIB 3CI5A 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KBOA 4YOUA 1NGFA 2LSNA 4M7XA 3VQ7A 1VQKN 1OH5A 3F2KA 3O9TA 3RTVA 1HYZA 3V9XA 4PL8A 3O6WA 2A3ZA 3E9OA 1N5YA 3AGKA 3DAWA 1Z6RA 5HOOA 1XC9A 1UA0A 2YCHA 3ZSVA 3ALYA 1E4FT 4BR0A 1FW6A 3K58A 4OPHA 4DU1A 4CEFA 2OPQA 4FLWA 5AQWA 4BC5A 1TK5A 4NLBA 3CYMA 4ICLA 3H3OB 2RN2A 1C1AA 4CK3A 1A5VA 3VA3A 3EZWA 4LF5K 1XNRK 3ZLJA 3O9SA 3THWA 4OGEA 3OYLA 1HLUA 3HZ6A 2Q36A 5M1PA 3SUNA 4CZJA 2A1RA 1TKXA 3BY5A 1X9MA 4W5NA 5JICA 3TSPA 5TKWA 3EE8A 4DTMA 4DTUA 1VQNN 3VA0A 3UKUA 1JCEA 3DOLA 1BISA 4E1NA 5AQJA 3ZETA 3DXKB 2VQFK 5AQOA 4CJSA 3AVBA 3FZKA 3MDQA 1N6QA 5HRSA 2E6LA 3SI6A 2HNDA 1NGIA 3QMLA 4FW1A 4IEIA 4KH5A 4H0OA 3WXMB 5LMNK 1LWCA 3OYKA 1RDUA 2W00A 4N41A 4M63C 4Q0BA 1VQPN 1TV6A 5IWAK 1BL3A 3K9KA 4PWDA 1YI2N 4MQ3A 3CC7N 3SYZA 1IV0A 2RHKA 3VETA 2YHAA 1TL1A 3L2VA 2IVPA 3NGYA 5KPZA 4WCEL 1T05A 4J2DA 4J8FA 4CK2A 1HYSA 1J53A 1SL1A 1S5JA 1RTJA 4DTNA 4EZ6A 4A5BA 3MWPA 1NKBA 3LPTA 3ULDA 2QK9A 3P5JA 3ZT0A 4FVUA 1ATSA 3HP9A 1N8RO 4CJPA 1C1CA 1YIJN 3AVAA 1QQCA 1NKEA 2G8WA 4OGCA 1WSGA 4B9QA 4KHPK 4B1XB 1HPZA 4JKGA 2XY7A 2P9SB 5CR4A 4F8RA 3ID8A 4YOWA 1RT7A 3T7ZA 3AVNA 4M3TA 4GNIA 4LF4K 4ILJA 4JKAA 4DWIA 1Q9YA 1QHAA 3LDPA 3AVFA 2ZE2A 2YKMA 2FBTA 3F5TA 3QB0A 4CEZA 4GVEA 4DQ8A 5AQQA 4ID1A 2CGLA 2GV9A 4A61A 5TKYA 1RT6A 3VERA 2WTUA 4DU3A 3I56N 1VRUA 3KK1A 3LP2A 1S22A 4B9LA 4RW9A 3KIOA 2O8CB 3DLEA 4WE1A 3ZSWA 1JL1A 1W7AA 3CJ7A 1XMQK 1SL0A 4PKHA 4RW7A 5D3GA 1XQSC 2BGGA 1VQMN 1TKTA 3VTHA 3VEWA 1ITGA 5FRMA 4AILC 4KI4A 4B9SA 1ATNA 2NZTA 3VGKA 3O9RA 1EKEA 3U8XA 4NO7A 3L2WA 3EY1A 4O8UA 3SZ2A 1QVFM 4KTWA 3PUFA 3OS1A 1TAQA 4LY7A 4M3WA 2CGKA 5B8HA 5BREA 4R79A 1L3UA 2CH5A 2GWKA 4BDPA 2D0OA 2OYQA 5AQIA 4IEEA 3RMDA 4X65K 3DWLA 4NXNK 3IDHA 4JI0K 4DSIA 4K25A 2BH1A 2XY6A 4FK2A 1S1XA 3L2UA 1RT4A 4AHUA 5MLCQ 3NVMA 3J7YP 3LWLA 1CZAN 3G0ZA 3P1GA 4BR7A 4FLXA 2UYTA 3CCRN 4H0TB 4ELVA 3LP0A 2HVIA 1J5EK 1HX1A 1SV5A 1KD1O 4BECA 2A41A 2O8CA 1NGHA 4BE0A 4JHDA 1VQ6N 1IBKK 2ZD1A 1Z26A 5EU7A 3CERA 5AZJB 4KHYA 4CBWA 4KB1A 3KZBA 1SS6A 3NE6A 4HUEA 4EFHA 1JLCA 2VWKA 3L3VA 4CGFA 2Z1JA 1KVCA 4FJNA 3SQ1A 3CM5A 1QSLA 4KAZA 2VG6A 4HTLA 1NNEA 1B92A 3K2PA 2D0CA 3SMPA 4NYNA 1JCFA 1L3VA 3HOTA 3PV8A 3CJBA 3EYZA 4O8KA 4BC4A 1KTQA 3WNEA 4M3UA 2IOCA 4QS8A 3E66A 4JRQA 3CQYA 1GLEG 1X9JA 2Q2RA 4EP5A 2P9IA 4CHYA 3QIPA 2OZSA 5M1QA 3IMXA 3V1QA 1RBTA 3J7ZO 4JI3K 1U48A 4FWSA 4BRMA 4JI6K 4PA1A 3RMBA 3TTCA 3WT0A 5AQVA 1WOQA 1U2VA 4DSKA 3O80A 3MXMA 3DM2A 4EP4A 3TANA 1W2BM 1WBDA 1TKDA 2F7TA 5E26A 3CG7A 4WF9L 1M1KO 4CHQA 3S41A 3MEGA 4EZ9A 2GELA 3J81O 4M3RA 4H5RA 3OHRA 4DR3K 3O1WA 4B3RK 4M7YA 1Z25A 4CJVA 3FLCO 4YORA 5KPRA 2OTJN 2GEMA 2ASOA 4DTJA 3VQEA 2IGIA 3L2QA 2HW3A 2JWLA 5AZJA 2VG5A 3H3NO 3M8PA 4PL7A 1D9DA 1SKWA 3WXJA 2P9LB 1YUWA 3L2RA 3TAGA 1TVRA 1I39A 3WXKA 2J4RA 4KRFA 4B1ZA 4PY5A 4KB0A 4KTZA 1RFQA 1DEJA 4FVMA 1SAZA 1S6PA 5F0XA 2KZZA 1CLQA 1EO1A 1GOCA 1DGKN 3O5BA 4FJHA 1EETA 4CJKA 3UB5A 2HHVA 4DSJA 1YTAA 1NGAA 4DFKA 3SJHA 5LL6Z 4M41A 4BG8A 4BRHA 4H5WA 2V51B 3OVNA 4CGIA 1RTDA 3NF8A 2I5JA 4F9OA 4CJ5A 4KTQA 2O8EB 3IRXA 1MWKA 4B8CA 3PIOL 2HMIA 4CHPA 5BR9A 4U7BA 2VGNA 1KVAA 4F4KA 3A0IX 1WN7A 5CZ2A 5J2NA 4IZ9A 1OH7A 3VENA 5JS2A 1K6YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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