3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
b'PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
1MWMA 3LDNA 1YAGA 1JCFA 5BN9A 1RFQA 2WUSA 2ITMA 3VEXA 2P9UA 3BUZB 3MN6A 4BQLA 3M3ZA 2V52B 3DXMB 1V4SA 4KBOA 3D2EB 3QB0A 4FL9A 4IWVA 3WXIA 3H3OB 4BRIA 4DHYA 2FSJA 3FZFA 1HJOA 3I8BA 4BRGA 3D7EO 4BVOA 3VESA 1MDUB 4M7YA 4BG8A 2I7NA 3GBTA 3QICA 5EVZA 4M7XA 4H5TA 1Y64A 4WQ4C 1HX1A 4CI6A 3KZBA 2P9UB 3WT0A 2IIRA 1QQMA 4H0VB 4H03B 4CBXA 1NM1A 1SZ2A 3VETA 3H3NO 2VWBA 3J8AA 1NBWA 2D0PA 4BROA 1D4XA 3DJCA 1QQOA 3HI0A 1BUPA 1YUWA 1NGBA 2E20A 4IJNA 3CJ7A 4BR2A 3O1BA 4FWNA 1XQSC 3LDQA 1K8KA 3L0QA 3GE1A 3U9ZA 4CZIA 3DAWA 4PKHA 3VF6A 5FPDA 2Q97A 3D2FA 3EL2A 1CZAN 3HM8A 4WQ5C 2QXLA 4JAXA 5AQOA 1GLLO 5AFUH 5BREA 4CZMA 2FSKA 4RTFD 3WXJA 1GLJO 4MO5A 3L6QA 2A41A 4RWTA 4IJAA 3QDKA 3LL3A 4E1JA 2IVPA 4O8KA 2ASOA 3ULEB 1ZBSA 4FPBA 3WQUA 5JLHA 5BPMA 1BO5O 4B1VA 4BGBA 3O6WA 4CD3A 3D2FB 3MCPA 3QBWA 3R6MA 3W0LA 4Z94A 1GLBG 4CJ7A 5AQVA 1NGJA 2HMPA 4XH5A 3M6GA 3EKSA 5AQWA 3O5BA 3DXKB 5AQUA 5FPMA 5BPLA 2V7YA 3EZWA 1NGCA 1P8ZA 1NMDA 3ZX2A 2I7PA 3CJCA 2E2OA 1G99A 3H1QA 2PBDA 2D1KA 4AM6A 2UYTA 1HPMA 5I9EB 1KAYA 2Q36A 3W3DA 5AQJA 3QFUA 4NB4A 2GEMA 1X3MA 3H46O 3S41A 4FWRA 1DEJA 1X9JA 5AFUA 3A5NC 3R9PA 5KQ8A 1QQNA 4HWIA 1ATNA 3VGLA 3CQXA 1Z6RA 4BC4A 5BN8A 3VEZA 1ZXOA 2A40A 2E2PA 3DWLA 2ZWHA 3SJHA 4BRAA 4YDUC 2DPNA 1ZC6A 3BP8A 4H0XB 2V51B 3HBTA 3L4IA 3P4IA 5BRFA 3HSCA 4BVPA 5KPZA 2VCPA 1BOTO 3H1VX 1X3NA 3CERA 3CIPA 1YVNA 1BG3A 2E2QA 3BF3A 3C7NA 2GUPA 5FPNA 2P9KB 5AQIA 2CGLA 3CQYA 4C23A 2YHYA 2QWRA 3A0IX 3WXKA 3LDOA 1S22A 1E4GT 4H0YB 3WQTA 4BRQA 5ADXH 4K25A 4BRNA 3O1WA 3FR0A 2CGKA 3GDQA 3M1FA 1BWFO 2P9NA 4ISGA 1EQYA 2YI1A 2A42A 2A6AA 3U9DA 2BTFA 1HKGA 4IXCA 1T6DA 3FZKA 3ID8A 3A8YA 3F9MA 2ZGZA 3C7NB 2D4WA 2VYPA 2E2NA 3FZLA 3ULEA 2ASMA 3FGUA 3QFPA 3IMXA 2Q31A 3IDHA 5E84A 1TUYA 4B1YB 1MWKA 3MN5A 2H3GX 4FWMA 1JCGA 3KVGA 4H0OA 1ESVA 4CZLA 1NGEA 3LDLA 1QZ6A 3MN9A 4H0PA 2P9NB 3EO3A 1WUAA 4BC2A 3HZ6A 4PL8A 4B1UB 3DXKA 5KPRA 2J4RA 3JS6A 4FWSA 4A62A 3GL1A 2QWPA 5AQMA 1IG8A 4BG9A 4LC9B 2NRHA 4YDUA 1DGKN 5AR0A 3FLCO 5JICA 2QWOA 3TPQA 4PKIA 3TU5A 2QM1A 2Q0UA 4IO8A 5BRDA 5AQLA 4FSVA 3RSEA 2W40A 4B1XB 4BC3A 5ADXA 5E26A 1U2VB 2ZF5O 4CZKA 2FSNA 4GY2B 5F1XA 3CETA 1LOTB 4WQ4A 1NGAA 4MLEA 1V4TA 2CGJA 4K41A 4ISFA 4I6MB 4B9QA 3A5OC 4BRLA 4DB3A 3FZMA 3I33A 5AQSA 4H5WA 2YJFA 3CHWA 4B1WB 5EY4A 3U8XA 3WUHA 3RSEB 2W41A 4CZEA 2A5XA 2P9LA 1OKJA 4XH4A 3UKRA 4FWOA 4DQ8A 5AQZA 3BF1A 3A5LC 1WOQA 1NLVA 3ATUA 3CJAA 2A3ZA 4BR7A 3VEVA 3ATVA 2E1YA 1YXQA 3O8MA 2HF4A 2ZGYA 1C0GA 2NZTA 2Q2RA 4BR9A 5LJWA 5B8HA 3FFKB 2P9KA 5AQQA 4WQ5A 5AQGA 2P9SA 4B1ZA 2YHXA 2E8AA 2P9LB 3UKRB 5EX5A 3ZX3A 2QWQA 3C0BA 3H45C 5LJVA 4FOIA 1TUUA 2Q1NA 1QZ5A 5FPEA 2HOEA 1NWKA 4FWLA 2FXUA 5EOYA 4XH1A 1TYQA 1BDGA 2OANA 1Z05A 2YJEA 3LM9A 3CJ1A 4WYBA 4EIAA 3VPZA 1SQKA 3VF4A 2QWLA 4GNIA 2P9SB 1IJJA 3CI5A 5AQHA 2GELA 3VENA 1JCEA 4FO0A 4A2BA 3QMLA 3IUCA 3JXUA 5AZIB 5KPTA 3WEEA 4A61A 2AP1A 3KHYA 1T44A 4BREA 1BA1A 2GTDA 5KQDA 1KXPA 2CH6A 2AA4A 5AQXA 1H1VA 4BR0A 5TKYA 1S3XA 3A5MC 4H0TB 3ZETA 4PKGA 2GWKA 1TYQB 3H6EA 4CZGA 1HKCA 2NLXA 4JHDA 4XEIA 3AAPA 5BR9A 1T6CA 2GWJA 4HTLA 4DCHA 2BUPA 5AQRA 3OHRA 4BC5A 4M63C 4FWPA 1QHAA 2D0OA 1SAZA 2EWSA 3ZX0A 4CD1A 3HTVA 4PL7A 3VERA 2E1ZA 1NGDA 3SMPA 3WEEB 4JN4A 4QS8A 3IFRA 4CBWA 1ATSA 2P9PA 4L3QA 2ASPA 3MMVA 3VGMA 1U2VA 3VEYA 4O5FA 4BGAA 3ZETB 3VGKA 3G25A 5AQPA 3AARA 2FF3B 3LDPA 4JHDB 2P9IA 4EHTA 5AQFA 1HUXA 4Y0WA 5LY3A 3O08A 4JD2A 3UB5A 5AQYA 2Q0RA 4BRHA 1XC3A 2V7ZA 3EKUA 2YHWA 4I6MA 4EHUA 5AQNA 1E4FT 1KAZA 3ENHA 3FE1A 4FWQA 1R59O 2F9WA 1RGIA 3B8AX 4BQZA 3BEXA 3EN9A 3CJBA 4IZ9A 4QS9A 2PAVA 2P9PB 4FPAA 4CZHA 1HLUA 3UKUA 2F9TA 4A2AA 1NGIA 3ZEUA 5AQKA 4BR5A 1NGHA 2P9IB 2HF3A 4FWKA 2QW9A 1KAXA 4JD2B 5AQTA 4BRMA 1ATRA 3MN7A 4H5RA 3AY9A 1K8KB 1HKBA 1GLFO 3QBXA 5F2RA 4BR4A 3VF2A 1LCUA 4CBUA 2QWMA 4EAHD 1DKGD 4J8FA 3O80A 3VEOA 1GLAG 5F0XA 4ISEA 3CJ9A 5ELZA 3O4WA 3SK3A 1MA9B 5BPNA 1RDWX 4H5VA 2CH5A 3UKUB 1XUPO 2QWNA 3VOVA 3FZHA 3LM2A 3WXLA 2KHOA 3ZEUB 5AZJA 1BU6O 3GOIA 4CZJA 4RCHA 5EXWA 3SLCA 5JLFA 4AM7A 4BRPA 4BRKA 4BRFA 4K43A 1C0FA 1J6ZA 4F9OA 3U4LA 2IVOA 1U6ZA 1NGFA 1GLDG 2FLOA 1GLEG 3DXMA 4JNEA 4BRDA 3ENOA 5AZIA 3UE5A 2IVNA 5CE3A 3D2EA 3R8EA 3AAQA 3MK6A 1Q18A 4K42A 4FOEA 5AZJB 4NO7A 2FF6A 3VEWA 3SMSA 4MO4A 3GG4A 3MDQA 1GLCG 2YCHA 4MLHA 4EFHA 1BA0A 4H5NA 4QS7A 2E88A 1NGGA 5JMVA 4CZFA 4BRCA 5BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MWMA 2IDOA 2P51A 1TAUA 1WNSA 2P9UA 4BQLA 3C6TA 3DXMB 4K0KK 4KBOA 2UUBK 4FLXA 1TVRA 4NCBA 1JXEA 1WAJA 3CPEA 4DHYA 3FZFA 2IAJA 3B6PA 3LPTA 1MDUB 4KB0A 1KD1O 4RW9A 1TKXA 3CM6A 4B9TA 3QICA 4WCEL 3VQAA 4KRFA 1B9DA 1X9MA 4E19A 1QQMA 2HHSA 2HNZA 1NM1A 1FJGK 2XRIA 2KTQA 4CJRA 2HHTA 3I0RA 4DQIA 3MAQA 4KHSA 2ETJA 3G6EN 1YITN 3OTOK 3CJ7A 1ZBUA 1J53A 4FWNA 4DTXA 1O13A 4GVEA 3T19A 2WONA 3U9ZA 3VF6A 2FC0A 2Q97A 1K6YA 3CC4N 2VG7A 3QEPA 4NCGA 2QXLA 1GLLO 1ZBFA 3QIOA 5CYQA 3KLFA 3O4NA 4MO5A 5M1FA 4RWTA 5IT9O 3LL3A 4IEIA 3ULEB 1N8RO 3HL8A 5M1PA 3LZJA 2UUAK 1BO5O 1BL3A 4B1VA 1WLJA 3EY1A 1EWQA 2HSTA 3LPUA 3R6MA 4H8KA 5CY4A 3EEQA 3NF8A 1RDAA 4I2PA 2GV9A 5FRMA 4CHYA 1K9MO 5M1QA 2WC9A 3CG7A 5AQUA 3EZ5A 5BPLA 2B6AA 4EP5A 2UUCK 4CF8A 3KLHA 4B9MA 1TKZA 1NMDA 2I7PA 3O9UA 4YNQA 1D8YA 3CJCA 4Z4IA 3LP3A 4I9LA 3VA3A 3QNNA 4FJNA 4ILJA 2UU9K 1DTQA 4WE1A 4FK2A 1QQCA 3P38A 1KAYA 2GEMA 4FWRA 3WNFA 3R9PA 3FFIA 3LZIA 3RVCA 3CQXA 1QVFM 5BN8A 3V9XA 4X64K 1ZXOA 3MEDA 4Z0UA 4DLEA 2ZWHA 4CK1A 4BRAA 4E3SA 3SAGA 1OH7A 3BP8A 1IO2A 3V81A 4CFBA 4DWIA 1SL2A 3L4IA 4CF2A 2GX9A 3VTHA 3HSCA 4CEZA 3H1VX 1MU2A 4Z4CA 3CERA 3CIPA 3BF3A 3VA0A 4YOTA 1VSJA 2CGLA 4DSJA 1WSEA 3A0IX 3VMFB 2NUBA 3I0SA 1S22A 1E4GT 3WQTA 3G10A 3K9KA 1BQNA 4CF0A 1YF5L 3O1WA 4DV2K 3FR0A 2YKNA 1BWFO 2P9NA 4JS4A 1IG9A 1FW6A 4GV6A 3C65A 2KFNA 2YI1A 3DYAA 1TK8A 3TSQA 3T1HK 1SUQA 3FZKA 4IDKA 2ZGZA 2ASMA 3FGUA 3IMXA 5J2QA 3ID6A 3Q7CA 4FWMA 3ZSQA 3DLBA 1CZBA 2QEXN 4CZLA 1ESVA 2OPQA 3NVMA 4L8RB 2F8TA 4FZYA 3EO3A 1WUAA 1T03A 1RT5A 4BC2A 5H1SQ 4B1UB 3JS6A 4IFVA 5AQMA 2YNIA 3L2UA 2NRHA 3E01A 5AR0A 5JICA 4FXDA 3E9LA 4PKIA 1RT1A 2KZZA 2QM1A 4CJWA 4PQUA 4IO8A 4DTUA 3RSEA 3HVRA 4AH9A 4JI1K 2NRVA 4BC3A 5ADXA 3AVLA 2EHGA 4NLCA 4MDBA 2NRRA 3KJVA 4OLAA 3MECA 4LH4A 2FSNA 1ZBIA 3OYJA 3CETA 2HHVA 3THXB 2IC3A 1HYVA 1UAXA 1VQKN 1V4TA 5GAEP 1QSSA 1GOAA 4K41A 4I6MB 3PSFA 4B9QA 5C42A 4BRLA 4DB3A 4DV3K 3FZMA 1M90O 2YJFA 4RW7A 1JLGA 4JKGA 4CZEA 3OS1A 4YORA 1VRUA 3UKRA 1HYZA 3V9SA 1RBRA 3A5LC 3KD1E 3CJAA 4AHVA 2A3ZA 3AA2A 1YXQA 1C0GA 1S1VA 1Z26A 4BE2A 5B8HA 4IO9L 4BE0A 4WQ5A 4NLBA 1NK9A 2R7YA 4HHTA 4FLZA 5EX5A 2Q1NA 3IS9A 4LF4K 5A2QO 4BDZA 3TR8A 2FXUA 5EOYA 1TYQA 1D9DA 4DR1K 4X65K 3LDSA 3LM9A 4WYBA 4NYFA 5HL7L 4FJ5A 2P5OA 2P9SB 1VSDA 1UA0A 4YOYA 3OYGA 4R5PA 1JCEA 4DQQA 3JXUA 3DI6A 4G1QA 3WEEA 4A61A 3KHYA 4E7IA 1FKPA 1T44A 3QINA 5KQDA 3CFPA 3DLEA 4E7HA 1EWRA 1KXPA 3OYLA 2CH6A 4BR0A 3PIPL 4PKGA 4WFNL 3CXCM 3QEWA 4V19S 4BDPA 4DKWA 4FYDA 1RILA 3SV3A 4BC5A 3AGRA 5C25A 5I42A 4M42A 3SZ2A 4DTOA 4DF8A 1T3VA 3K9JA 4O4GA 3K5NA 3C6HA 4F4KA 4JN4A 4CIEA 3IFRA 3AVHA 1C0UA 4L3QA 2G8HA 4BE1A 2FF3B 3HO1A 2F8SA 4CEDA 4ID1A 3O08A 4DMNA 1NG9A 1WSGA 3NMUA 4EHUA 5HRSA 1E4FT 3CCMN 1KAZA 3FE1A 1NMNA 2F9WA 3B8AX 4JRQA 3T3FA 4DTSA 4KHPK 2PAVA 2P9PB 1LAWA 3SV4A 3UKUA 2F9TA 1NGIA 1J9AA 4CVNE 4FLVA 3OYMA 4CEFA 2P9IB 1DLOA 4CCHA 2HF3A 4FWKA 3I8DA 4GV9A 1KAXA 2I5JA 4JD2B 4DTMA 5AQTA 4ZTJA 1NJXA 4OX9K 4DV5K 4W5OA 4QOZB 4CJFA 5D3GA 4AHTA 2OPPA 3THWA 4BR4A 3VF2A 3S3OA 2WTUA 4W5RA 4BWJA 1DKGD 4B9LA 4J8FA 5LL6Z 1GLAG 3IAYA 4CK2A 3O4WA 1MA9B 3VQ8A 2JWLA 2QA4N 4YFUA 4FM2A 3LM2A 3EE8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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