3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
4FWQA 3I33A 4WYBA 5BPMA 2QM1A 2E20A 1BWFO 1R59O 2ZGZA 3EN9A 2V7YA 4FWSA 1GLCG 5FPDA 3MN9A 3U9ZA 3H1VX 2P9SA 4O5FA 4EHUA 2P9IB 3AY9A 5AFUA 3GOIA 1DGKN 4NB4A 2ZWHA 2W41A 4B1WB 1YXQA 4CBXA 5ADXA 2HMPA 1U2VA 4DHYA 5AQSA 2V51B 4MO5A 4BROA 4BQZA 3VPZA 3U8XA 2Q31A 1ATNA 3IUCA 4WQ5A 3O5BA 2WUSA 5AQGA 1Z05A 3GBTA 2VWBA 2E1ZA 1S22A 1H1VA 4E1JA 5LY3A 2YHYA 5AQOA 4BQLA 5BRDA 2KHOA 4IO8A 4K25A 4EAHD 3HSCA 3VF2A 3SMPA 3DXMB 3A5OC 3HI0A 1YVNA 2QWLA 5AQYA 3FGUA 3VERA 2H3GX 4MLEA 4RWTA 2QW9A 1HKCA 1MWMA 2OANA 3H6EA 3CHWA 2F9TA 2E2OA 1QZ5A 1TYQB 4CZIA 3VEVA 2A40A 3EO3A 1GLBG 5AQVA 1MWKA 3DWLA 3DXKA 4DB3A 5ELZA 3MN5A 3U4LA 4PKIA 3DXKB 4DCHA 2ASOA 3FZMA 1SAZA 4Z94A 1G99A 3CIPA 2FSNA 4CBUA 2CGKA 3QB0A 4CZMA 4JN4A 4BC5A 3MMVA 1HKBA 4BRNA 3A8YA 3EKUA 2Q0RA 4H5NA 3BF3A 2GWJA 3O08A 2CGLA 4B1XB 5AZIA 3SJHA 5AQRA 4CZKA 3U9DA 1CZAN 2AA4A 2GTDA 5AZIB 3B8AX 4BR0A 3FZLA 4XH5A 1V4TA 1GLEG 1KAZA 5KPTA 4AM6A 3M3ZA 2A6AA 3D2EB 3EKSA 2W40A 2QWPA 5BRHA 1ATRA 3M1FA 2FXUA 1K8KB 3OHRA 3KZBA 5FPEA 2V52B 2FLOA 5EVZA 2I7PA 1XUPO 3HTVA 4PKHA 3MCPA 3L4IA 4BVPA 5EOYA 3C7NA 2YJFA 4EIAA 2ITMA 2E2QA 2E8AA 4IZ9A 2FF3B 3I8BA 4ISEA 3MDQA 2EWSA 1RGIA 3R9PA 4BC2A 3WQTA 4BRFA 4J8FA 2E2NA 2P9KA 1WOQA 5AQQA 3KHYA 1X9JA 4H5VA 3TU5A 3HM8A 4A2BA 1NGGA 4BREA 5KPZA 4F9OA 4LC9B 1T44A 1NGIA 4BRPA 3LL3A 4CI6A 3WQUA 2FF6A 2IVNA 2A41A 3D2FA 4Y0WA 4QS7A 1NGHA 1GLFO 2P9IA 5JLHA 1NGFA 3D2FB 3UKRA 1WUAA 3H3OB 4BR5A 1MA9B 1Q18A 2IIRA 3H1QA 3TPQA 3UKRB 3CJCA 2FSJA 4BGAA 1GLJO 3MN7A 3WXLA 3LM9A 1NBWA 3O80A 4FWNA 3ZX0A 3O8MA 2D0OA 4B1ZA 3W0LA 4CD1A 4BVOA 1JCFA 4H5RA 2P9UA 2ZF5O 3HBTA 4M7YA 1LOTB 2P9UB 3JS6A 2QWMA 3VESA 2HOEA 4FWMA 3FE1A 3LDOA 2QWQA 1BDGA 1C0GA 1QQOA 4QS9A 5AQMA 4RTFD 1HLUA 4BC3A 5FPNA 3DXMA 1NM1A 4BRIA 5AQUA 4BR9A 4K41A 5AR0A 4FWLA 4B1VA 2FSKA 2DPNA 5AQLA 5AQFA 5F2RA 5B8HA 3EZWA 1DEJA 4BRKA 3VETA 4BRLA 1RDWX 1QQNA 5BPLA 1TYQA 3O6WA 5LJWA 3LM2A 2Q0UA 4A62A 4XH4A 3CI5A 2E88A 5F0XA 1KAXA 4XEIA 3VGLA 1Z6RA 3L0QA 1HJOA 4BRDA 4H0VB 1X3NA 1XQSC 4B9QA 5E84A 3R6MA 2D0PA 3ZEUB 3CQYA 2F9WA 3RSEB 2HF4A 3MN6A 2ZGYA 2ASPA 1HPMA 2Q97A 1NGBA 3UB5A 3WXIA 5AQNA 2P9PB 5BN9A 4CD3A 1DKGD 4A2AA 1GLLO 4H0OA 4FPBA 3MK6A 1NGCA 1BA0A 1IG8A 3FZKA 3QFPA 1ZBSA 3J8AA 3ZX2A 4EFHA 3S41A 2A3ZA 4FPAA 3SLCA 4L3QA 3QICA 4MO4A 5BRFA 3FFKB 3JXUA 1ATSA 3D2EA 5E26A 4H03B 5EY4A 2P9NA 4FOEA 1K8KA 4CBWA 1SZ2A 4PL7A 4B1UB 2P9NB 3ZETA 1BG3A 1QZ6A 4CZJA 3IMXA 2D4WA 4IXCA 4WQ4C 2BUPA 3ZETB 3UKUA 3A0IX 4BRAA 1JCGA 3KVGA 3QFUA 4M7XA 3UKUB 3H46O 3GL1A 3L6QA 1D4XA 3QMLA 4JAXA 3QDKA 3ENOA 3CETA 3WXKA 1GLDG 3VEZA 1P8ZA 4JNEA 2YHXA 4K42A 5LJVA 2IVOA 4RCHA 3VF6A 3HZ6A 3LDPA 1V4SA 3ZX3A 4KBOA 3GE1A 5F1XA 5I9EB 2E1YA 2CH6A 4JD2B 2YHWA 3CJAA 3CJBA 3C0BA 5AZJA 3O1WA 4GNIA 3AAPA 1NGJA 1KAYA 4DQ8A 5AZJB 4BRGA 2GEMA 2NZTA 4GY2B 3M6GA 4IJNA 3A5LC 3F9MA 2A5XA 2YI1A 4BG8A 4H5WA 2GELA 4HWIA 3DJCA 3VEOA 3VOVA 1SQKA 4WQ4A 1NMDA 1J6ZA 1YUWA 1YAGA 3EL2A 3A5MC 3BP8A 4H0XB 3AARA 4IWVA 4K43A 2YCHA 1ESVA 4BG9A 2PBDA 3ATVA 3CJ7A 3WEEA 2A42A 2QXLA 3GG4A 4FSVA 1NLVA 3AAQA 5AQJA 5AQWA 2NLXA 3WEEB 3BUZB 1KXPA 1T6CA 2AP1A 3SMSA 1BO5O 3ENHA 3CJ1A 3DAWA 3W3DA 3FZFA 2P9SB 2Q36A 4FWKA 4BRQA 3GDQA 1U6ZA 1ZXOA 4NO7A 1BOTO 1U2VB 4FWRA 5BN8A 3CJ9A 4YDUC 3WUHA 4PKGA 3IDHA 2BTFA 4CJ7A 1GLAG 3O1BA 1S3XA 2IVPA 1E4FT 2VYPA 3VENA 4BR2A 1JCEA 5BREA 4JHDA 1T6DA 3VGKA 3VEWA 2E2PA 4BC4A 4JHDB 3ULEA 5FPMA 4CZGA 2V7ZA 4H0TB 3ZEUA 3RSEA 2I7NA 3ULEB 4BRHA 1TUUA 5JLFA 3WT0A 1XC3A 1C0FA 4O8KA 1HX1A 4I6MA 4FO0A 5EXWA 5AQZA 3SK3A 4AM7A 3FZHA 2P9PA 2ASMA 3O4WA 1NGEA 3LDQA 4I6MB 2CGJA 5JICA 3FLCO 3QBXA 5TKYA 1QHAA 5AQKA 1IJJA 3LDLA 4IJAA 2GUPA 5AQTA 1RFQA 4BGBA 5AQPA 2YJEA 4YDUA 3LDNA 1Y64A 2PAVA 4CZEA 3IFRA 1BU6O 4A61A 3P4IA 4EHTA 1TUYA 5AQHA 4BR7A 2CH5A 3VEYA 4BRMA 3CQXA 2GWKA 3H45C 4CZHA 3ATUA 3A5NC 5AQXA 5AFUH 1LCUA 4XH1A 4ISGA 2P9LA 2HF3A 2QWNA 5KQ8A 2NRHA 5ADXH 2P9LB 4MLHA 3BF1A 4FWOA 5BPNA 4H0PA 5KQDA 1OKJA 3VF4A 1NWKA 2QWOA 3QBWA 3CERA 1ZC6A 1HUXA 4FOIA 3BEXA 4C23A 1BA1A 3R8EA 4BRCA 4QS8A 3G25A 5KPRA 2QWRA 1E4GT 4ISFA 4H5TA 3ID8A 3VEXA 1BUPA 1QQMA 4M63C 2Q2RA 3VGMA 1HKGA 1MDUB 4CZFA 4B1YB 4JD2A 3UE5A 1NGDA 5BR9A 1NGAA 2UYTA 4HTLA 5CE3A 2VCPA 4CZLA 3WXJA 2J4RA 5EX5A 3C7NB 4WQ5C 4H0YB 4BR4A 2Q1NA 5JMVA 1EQYA 1X3MA 3FR0A 3H3NO 2D1KA 4PL8A 5AQIA 4FL9A 4FWPA 3D7EO 2P9KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JLAA 4FWQA 3VQ6A 1KLNA 3I33A 4CGGA 4IFYA 4WYBA 2XY7A 4JK8A 2QM1A 5IWAK 4V19S 3EY1A 3EN9A 2RPIA 3TANA 1GLCG 3E1YA 4NYFA 2BE2A 3QEPA 2P9IB 4DG1A 5AFUA 1U48A 3HVRA 4B1WB 1RBUA 3SNNA 2HMPA 4Z4FA 5K14A 3O3FA 4MO5A 4DFPA 1KSPA 3ASMA 4BQZA 4TSXA 1L3SA 1CLQA 3AVBA 2HNZA 4B8AB 1GOBA 3P38A 1S22A 5BR8K 2G8KA 1QQCA 4BQLA 4BE0A 1BI4B 4IO8A 4K25A 4CF9A 2JWKA 3VF2A 4FJLA 1W9HA 1RT4A 4Q5VA 3E9PA 4DSEA 3VERA 4MLEA 4ELUA 2F7TA 4CVNE 4KTWA 3B6OA 2F9TA 1QZ5A 1XWLA 3VEVA 2A40A 3AVKA 1LWCA 3U4LA 4PKIA 4CESA 3HSTB 3C94A 4DCHA 3QEWA 3OJUA 1CXUA 4A5AA 1U47A 2O8DA 3ENBA 2IDOA 4KHWA 4JN4A 4BC5A 3MMVA 1HKBA 1KQSM 4GV3A 3EKUA 4DR6K 1JLEA 1REVA 4B9NA 4NCGA 4CJWA 1SL2A 4B1XB 3OYNA 3CMAN 5AQRA 2OTLN 4F3OA 4CZKA 3U9DA 2GTDA 3B8AX 4XH5A 3NGIA 4FW2A 1Q8IA 4KH5A 4EZ6A 4FZZA 3M3ZA 5M1PA 1RT2A 3VQPA 5HBMA 3MEEA 4YHHK 4JLHA 1XC9A 1K8KB 3CXCM 3VQBA 3ZSWA 1LAWA 5TKWA 2I7PA 4JI2K 4Z4GA 2BANA 3VTIA 1N6QA 3AA5X 5EOYA 4CJUA 3O3GA 2HVHA 2YJFA 5CY4A 4CEFA 4EIAA 4CJRA 3DYAA 3RMBA 3SAFA 3I8BA 5KGWA 1Z26A 4LH5A 4CFBA 4BY9C 2NRRA 3CPWM 3OBYA 1GOAA 4BRFA 5CZ2A 2E2NA 1VRTA 1IG9A 1WOQA 1NOZA 5CZ1A 4BREA 5KPZA 2OZSA 4BRPA 5C12A 3VQ8A 4ICLA 2IVNA 2A41A 3D2FA 2JWLA 1NGHA 3L3UA 5JLHA 3LPUA 1FKPA 3K5NA 1EO1A 1HPZA 1QS4A 3QETA 2A1RA 4DV6K 3H3OB 1Q18A 3CJCA 3TAMA 1NK5A 3SUOA 3CMEN 3W0LA 3M8RA 4BVOA 2P9UA 5GINA 3QLHA 4M7YA 3AA3A 2QWMA 2HOEA 4CJFA 4DR5K 2HNDA 2DTUA 3M8SA 2JGUA 2QTDA 3AVJA 4QS9A 4RTFD 4KTZA 5AQMA 1HLUA 4BC3A 1S1XA 4IDHA 3THYB 4K41A 4CIEA 4JS5A 2FSKA 5B8HA 3HL8A 3EZWA 1RDAA 4BRKA 4DTNA 1QQNA 1RILA 4DTSA 4M45A 4A62A 3CI5A 4JI6K 4DTUA 3KK7A 3CFOA 1RNHA 4DV4K 4AH9A 1HJOA 4K0KK 3ZSZA 1FJGK 1XQSC 2P5GA 1I3AA 1ZBHA 3OYGA 3RSEB 2F9WA 3DLLL 1SKWA 2VQFK 2KQ2A 4CFAA 4M3UA 4A59A 3PIOL 2O8BA 4FLZA 4YORA 1NGCA 3FZKA 3SCXA 3J8AA 2Z1GA 2ZQBA 5JVGL 4FPAA 4DTMA 4FJKA 4CJPA 3KJVA 5BRFA 3FFKB 4FLTA 4CK3A 3AVLA 3QEXA 4E0DA 5CYMA 3HT3A 4FK4A 2KLAA 5E26A 4H03B 5EY4A 2ZJQL 4CBWA 3ZSOA 4B1UB 4DSLA 1X9WA 4IXCA 4WQ4C 2G8WA 4O0JA 3C6AA 1JL2A 3T1HK 2OPQA 1JLBA 1JCGA 3KVGA 4M7XA 3UKUB 4CHOA 3SPZA 4YFUA 5HRSA 3WNEA 3L3VA 3OVNA 1SS6A 4OPJA 3DLHA 3VEZA 4RW6A 4YOYA 3SV4A 4IOXA 4CHZA 5M1QA 3TSPA 3ZT1A 2HNYA 4FYDA 3GE1A 2E1YA 3MXIA 3JAMO 3TR8A 4KI6A 3ZSVA 3I8DA 4I2PA 1KAYA 3CFPA 3NHGA 1SL0A 4W5OA 1VQMN 3PV8A 2NZTA 1NU0A 2A5XA 4H5WA 1Q82O 3D6RA 3C6UA 1EKEA 4DUZK 2Q3SA 3SZ2A 1YUWA 2QI2A 1JLCA 3AARA 3IKMA 2ETJA 4JS4A 2QXLA 5AQJA 5AQWA 2GBZA 2NLXA 3NF8A 3BUZB 2DFHA 1T6CA 2WBNA 3ENHA 3BGRA 3SUPA 2KTQA 4ILHA 4W5TA 4FWKA 4FVUA 4BRQA 2PYJA 4FM2A 1ZXOA 4X64K 1S5JA 4LFAK 4DTOA 1BOTO 3WUHA 3E66A 1L3TA 3IDHA 4ZTFA 1GLAG 3O1BA 1YT3A 2IVPA 1KLMA 4LSNA 5EU7A 4DR3K 2VYPA 1YI2N 3VENA 4BR2A 3OYLA 3AVFA 4M3WA 5BREA 4NXMK 4DFKA 4KHUA 1NNEA 4JHDA 4LF7K 4BC4A 3ULEA 4H0TB 3ZEUA 4FLWA 2OCEA 2B5JA 3OYIA 1BCMA 4BRHA 1XC3A 4O8KA 1RBRA 1JLQA 3N4PA 5CHIA 3SK3A 1VSEA 2VGMA 1A5WA 2ASMA 1HQEA 2CGJA 3Q7BA 3PX4A 3CM6A 5AQPA 3NGYA 4OJRA 3LDNA 3HP9A 3ZT0A 3CCVN 4CZEA 3IFRA 4EHTA 4KFBA 4HVJA 4FJHA 4OGEA 4DF8A 3CCUN 4BR7A 2IOCA 2XRIA 2CH5A 4BRMA 4CZHA 2GWKA 3H45C 3KD5E 3ATUA 2O8DB 2UU9K 4CEZA 4LF8K 4ISGA 3NH0A 3TAGA 5ADXH 2P9LB 3BF1A 3HOSA 3TTFA 3MEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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