3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
b'PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
4BREA 4B1YB 4MLEA 4BG8A 3MCPA 2P9NA 5TKYA 2P9IB 3VEVA 2HF4A 5AZIA 1E4FT 4QS7A 1U2VB 2BTFA 5AQQA 3GBTA 4DCHA 2P9KB 3D2FB 4FWOA 4CZIA 3CJ7A 3U8XA 3ZEUB 3HI0A 3DWLA 5BRHA 1WUAA 2ZF5O 2E8AA 5KPTA 1QZ5A 1YXQA 1BA1A 3MN9A 2D0OA 3IDHA 2J4RA 2QWMA 2E2QA 1ATNA 2UYTA 1GLJO 5CE3A 4BROA 4YDUC 3S41A 4C23A 5AQOA 2A5XA 2CGKA 3CJAA 1NGGA 4H5VA 4BRIA 3GDQA 2P9KA 1SAZA 2FF3B 3LL3A 3SMSA 2IVOA 3ZEUA 3EL2A 1RGIA 3H46O 4BQLA 4O8KA 1ATSA 4H03B 5BPNA 2YHXA 3VGMA 2VCPA 3M6GA 3HBTA 4WQ5C 4EIAA 3WQUA 5LJVA 3M3ZA 2VWBA 2ASOA 2P9UB 3D2EA 2BUPA 1V4SA 3IFRA 3KHYA 4NB4A 4BR9A 1IG8A 2QWOA 2DPNA 3ENOA 5ELZA 3RSEB 5FPMA 3IUCA 1SQKA 3BP8A 4YDUA 3WEEB 5AQLA 2OANA 3W3DA 1KXPA 3ATVA 5JLFA 2ITMA 4H5TA 4CZMA 4DB3A 1EQYA 3GG4A 5AQXA 2P9SA 3MN5A 3UB5A 4Y0WA 1C0FA 3RSEA 4FPBA 2GELA 3U9ZA 2QW9A 4HTLA 4XEIA 3DAWA 4FL9A 5AQSA 2V7ZA 3WEEA 4M7XA 5JMVA 5KPRA 3HM8A 1WOQA 3VGLA 3EO3A 2IIRA 2V52B 1JCEA 1CZAN 2NRHA 3A0IX 1BG3A 4MO4A 3WT0A 4CZLA 3MDQA 3QB0A 4BRQA 2V7YA 4FOEA 3BUZB 4CZJA 4BC5A 1MWMA 5AZJA 5BPMA 5BPLA 1NGBA 3F9MA 3QFUA 3ENHA 5AQIA 5BN9A 3ZETA 1DKGD 4MO5A 5AQFA 2EWSA 4BR4A 4K42A 1GLAG 4E1JA 1NGJA 4H0YB 4H5WA 4IO8A 3VOVA 4BR5A 3MK6A 1ESVA 1IJJA 4ISEA 1NGDA 2P9NB 5AQUA 5AZIB 4L3QA 2GUPA 3QMLA 2GEMA 3O1WA 2E2NA 2QM1A 5BRDA 1JCGA 3O8MA 3FE1A 3CI5A 5KQDA 1MWKA 3M1FA 3A5MC 3U4LA 1XQSC 1ATRA 3H1VX 2HF3A 3H1QA 2YHYA 4IJNA 3LM9A 5EY4A 5JICA 5FPNA 4K41A 2W41A 2H3GX 1KAZA 3QDKA 3VEWA 4CZGA 5JLHA 4MLHA 1TYQB 1S22A 3H45C 1NGHA 5BN8A 1X3NA 4PKIA 5EXWA 1HJOA 3EKSA 1RDWX 4GNIA 5AFUA 4BR7A 3CJCA 4AM7A 3VENA 3QFPA 3WXIA 2V51B 1C0GA 3D2EB 1BUPA 4IZ9A 4IXCA 4WQ4C 3FZHA 5BREA 1J6ZA 2NZTA 3SK3A 1TYQA 3CQXA 3VPZA 1GLCG 2D0PA 3QBWA 1NMDA 1RFQA 4B1UB 2E2OA 5BR9A 1Z6RA 3D7EO 4FO0A 1BDGA 1DEJA 3HSCA 5KQ8A 4A2AA 5FPEA 3VESA 2P9SB 3JS6A 3ULEA 2Q2RA 4J8FA 1H1VA 1BA0A 5AQHA 4PKHA 2VYPA 1JCFA 4O5FA 5AQRA 1QQOA 4I6MA 2P9LA 1GLEG 3CERA 1TUYA 3O5BA 4NO7A 3O4WA 2Q97A 2QWNA 1DGKN 5LY3A 1HX1A 3ZX0A 5AQPA 5F2RA 1Y64A 1QQMA 3ZX2A 2AP1A 3MMVA 2IVPA 3QICA 2HMPA 4WQ4A 3WQTA 4AM6A 3ID8A 4FWQA 2FF6A 3UE5A 4BRGA 3CJ9A 5AR0A 1ZBSA 3L6QA 4B1WB 3H3OB 3TU5A 1BO5O 4B9QA 5I9EB 5BRFA 5AQGA 5AZJB 5AQWA 5EX5A 4ISFA 5EVZA 3ZETB 4XH1A 3VETA 2CGJA 2QWPA 4JHDA 3DXKA 4BRFA 1HKGA 4EAHD 3JXUA 3A8YA 2FSJA 2FXUA 2GTDA 3VEXA 2Q1NA 4CBXA 2FSKA 3U9DA 5LJWA 4FWLA 3KVGA 3BF3A 4B1VA 4HWIA 2D4WA 3VF2A 1YAGA 4CJ7A 2E20A 1KAYA 1U6ZA 4CBUA 2QWRA 2YHWA 5AFUH 3CJ1A 4H0VB 5EOYA 4BC4A 3AARA 4BVPA 3DJCA 3VF6A 1SZ2A 3DXMA 3UKRB 4QS8A 3WUHA 3C7NB 4IJAA 4BG9A 3LDLA 1LCUA 3GL1A 2ZWHA 4PKGA 1QQNA 4QS9A 4RWTA 3O08A 4EHTA 1V4TA 1BU6O 2ZGZA 3A5LC 1HPMA 2YI1A 1NWKA 2AA4A 2IVNA 3EZWA 3R8EA 2NLXA 1HKCA 1NM1A 1TUUA 3UKRA 4JD2A 5AQNA 4BRPA 3C7NA 1NGAA 4CBWA 2QWLA 3FZMA 3SMPA 3W0LA 3SJHA 4BRMA 3SLCA 2Q0UA 4M63C 1GLLO 3FGUA 3H6EA 2P9PB 3CETA 5KPZA 2Q31A 2I7NA 2QXLA 3VEOA 4FWPA 1K8KA 3CQYA 3CJBA 4A61A 3CHWA 3AY9A 2QWQA 3BEXA 4H5RA 5AQJA 3WXJA 4BRCA 1MA9B 4LC9B 4BGBA 1OKJA 4H0OA 4F9OA 3ULEB 2YJEA 4GY2B 4CZEA 2W40A 1BOTO 2Q36A 1QHAA 4I6MB 2P9LB 2P9PA 4JN4A 4B1ZA 1GLDG 1NGIA 3LDOA 5FPDA 4CZKA 5ADXA 4BR0A 3UKUA 3LDPA 3H3NO 1NGCA 1ZXOA 3EN9A 2E2PA 4WYBA 4ISGA 4CD1A 5AQMA 4JNEA 3MN7A 1NBWA 1T6CA 3FZLA 3LDQA 3VERA 5AQZA 1XC3A 2P9IA 1U2VA 2GWKA 1GLBG 4FWSA 3WXLA 4A62A 3D2FA 2A41A 4RCHA 2PAVA 4FSVA 3O6WA 4H0TB 4JHDB 3DXKB 3IMXA 2FLOA 4DQ8A 4FPAA 2I7PA 2ASMA 4JAXA 4CI6A 3J8AA 1HLUA 3R6MA 4A2BA 4BRHA 4FWRA 5F0XA 3VGKA 2A6AA 4Z94A 4BVOA 2ASPA 4H0XB 3KZBA 3P4IA 4CZFA 4CD3A 1Z05A 2A42A 4EFHA 3L4IA 4PL8A 4BRLA 4PL7A 2A3ZA 1QZ6A 1R59O 2A40A 3VEZA 4BRKA 3DXMB 1X9JA 5AQYA 4FWKA 3OHRA 5AQKA 4BRNA 1MDUB 2P9UA 2CH5A 3CIPA 1YVNA 3B8AX 3GOIA 4BRAA 2CGLA 3LM2A 3HTVA 4FWNA 3G25A 4K43A 2E88A 1GLFO 1NGEA 4WQ5A 5F1XA 4B1XB 3FZKA 1G99A 5AQVA 3ZX3A 4XH5A 2D1KA 3GE1A 4K25A 2PBDA 4BGAA 4BC2A 4IWVA 4JD2B 3MN6A 3HZ6A 4BR2A 4BQZA 2E1ZA 5AQTA 3L0QA 1E4GT 1S3XA 2GWJA 5E84A 3VEYA 3I33A 4XH4A 3A5NC 1Q18A 2ZGYA 2E1YA 1HKBA 4M7YA 1LOTB 1KAXA 1T6DA 4H0PA 2F9WA 2YCHA 4RTFD 1XUPO 1K8KB 5ADXH 4H5NA 3QBXA 2HOEA 3FLCO 2F9TA 3FFKB 1BWFO 2Q0RA 4DHYA 3EKUA 4KBOA 3BF1A 2YJFA 1X3MA 4CZHA 3WXKA 1ZC6A 3ATUA 4BC3A 5B8HA 1T44A 1HUXA 1YUWA 3C0BA 3I8BA 4FOIA 3TPQA 1NGFA 1NLVA 3FZFA 3O1BA 3O80A 4FWMA 3FR0A 1D4XA 3LDNA 3UKUB 3A5OC 1P8ZA 5E26A 2CH6A 3AAQA 3VF4A 4BRDA 2WUSA 3AAPA 3R9PA 2FSNA 2KHOA 4EHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z4EA 3WNGA 1LW0A 2P9IB 4I9LA 4CGDA 4O55A 4JI1K 2OA8A 1RDDA 4DCHA 4JKAA 4FWOA 3KJVA 3CJ7A 3ZEUB 5HROA 1BA1A 3MN9A 5HBMA 2J4RA 2FBYA 3PIPL 1VSJA 1GLJO 4BROA 4YDUC 4C23A 4FJ9A 4M3RA 4LF7K 1JLGA 3EE8A 3CJAA 4DKWA 4AF1A 3SV3A 3JAMO 1SAZA 2BANA 1VHXA 2KKZA 4IOCL 1RGIA 3THVA 4MFBA 2YHXA 5C15A 3D0PA 1M90O 1C1BA 3HBTA 4FJHA 5D3GA 2BGGA 2ASOA 2P9UB 4LFAK 1HQEA 3I8DA 1YIJN 4FZYA 3KHYA 1M1KO 4NB4A 2HVIA 2QWOA 2NRWA 3IS9A 3CXCM 3RSEB 5H1SQ 5FPMA 2KZZA 2E5LK 5HL7L 1CXQA 3HXMA 3NMUA 1VQ8N 2ITMA 1QE1A 3TSQA 1N6QA 4LF9K 1WBBA 4DB3A 1EQYA 2ZJQL 3HM9A 2P9SA 2G8WA 3SQ2A 4B9MA 4LSNA 1RNHA 3K59A 2BE2A 3ITHA 1S1VA 4CFAA 2HHSA 3HP9A 3M8QA 3KLEA 5AQSA 3DAWA 4FL9A 2V7ZA 5KPRA 1QVFM 1XHZA 3NBPA 3ZSRA 3S3MA 1X9SA 4B9TA 1NK6A 1S6PA 5C10A 3CC4N 1BG3A 2PY5A 3U3YA 1RTDA 3S3OA 3MDQA 3QB0A 3DLKA 4FW2A 4CECA 4CZJA 4RW4A 4BC5A 5AZJA 1KQSM 5A2QO 4IEIA 1VSFA 4CF8A 3ENHA 1IBMK 3ZETA 1DKGD 3VTIA 3DLHA 1GLAG 2GV9A 3CYMA 3MK6A 1ESVA 4ID5A 4RW8A 3HOSA 1YITN 4DR6K 2GUPA 4C8OA 2O8CB 2FBTA 4DTUA 4DUYK 2QM1A 5BRDA 4DSFA 2HHWA 2O8EB 3LP1A 1IKYA 3U4LA 3OW2M 1XQSC 1XWLA 2VWKA 1RT2A 3OYFA 2YHYA 2XY7A 5EY4A 4OX9K 5FPNA 1N34K 3QO9A 2W41A 1KTQA 1OVYA 1HNIA 2OPPA 4M3YA 2HBKA 4MLHA 1TK5A 1IKXA 1TYQB 5IT9O 1S22A 3H45C 5E41A 1KLNA 5BN8A 3O9UA 2UUCK 1EX4A 2F8TA 3E1YA 4KTWA 1HYZA 4BR7A 3OYBA 4AM7A 3WXIA 1GOBA 4BDZA 1C0GA 2VGNA 3QEPA 3D2EB 1Q86O 2D0CA 4IZ9A 3HSTB 1KVCA 2VQEK 5M1KA 5M1OA 1LWCA 3AVFA 5HRRA 4A57A 1U04A 4QAGA 3SK3A 1XNQK 4X65K 1D8YA 1GLCG 4E1MA 3NH1A 1NMDA 3CCJN 3MEDA 3SBTA 2E2OA 4J2AA 2OZMA 4NCAA 3D7EO 5FLXO 3SAHA 1BDGA 3HSCA 2VG6A 5FPEA 2R7YA 3T1YK 3LP3A 3JS6A 4CJUA 2Q2RA 1BA0A 3VQPA 2VYPA 3CMEN 1JCFA 5CZ1A 3RR7A 2GX9A 5C0YA 3MWTA 3O5BA 3O4WA 4DLEA 5LY3A 1HX1A 2D0BA 4IG0A 3ZX0A 1D9DA 3MMVA 3QICA 1F21A 2QXFA 5SZTA 4DQRA 2HHHK 2PYLA 5DMRA 2YHAA 4HTUA 4K8ZA 3UE5A 2O8DA 4B1WB 3H3OB 5KGWA 5I9EB 3AVJA 3TARA 5AQWA 3CC7N 5CHIA 3G6EN 4XH1A 3VETA 2CGJA 4CJFA 4U7BA 3DXKA 4CEEA 3CD6N 2HNZA 1VSEA 1HKGA 3A8YA 2YX6A 4Z0UA 1NKEA 3OYMA 3HRGA 3E01A 1DT9A 2NRRA 4B1VA 2NRXA 2D4WA 1HPZA 1BIUA 2KLAA 4LSLA 5C12A 1VQ6N 2E20A 3THYA 2QWRA 1R0AA 3C6UA 3VF6A 1L3SA 2W6LA 4QCLA 3C7NB 1HNWK 4CW7B 1JLFA 1LCUA 1CXUA 1QQNA 1GOCA 4H8KA 1VQON 2HVHA 4C8MA 2YNIA 2RKIA 4EHTA 1V4TA 2ZGZA 3A5LC 1HPMA 4KHPK 3O9RA 2IVNA 1SUQA 3EZWA 1ZBLA 3CCRN 3B6OA 1GOAA 4CK3A 1EXQA 1WSJA 1J54A 3FZMA 3W0LA 4CEQA 2NRTA 4GW6A 4OKEA 4Y1CA 1XMQK 1NK5A 3ZSXA 4ZHRA 3ZYYX 3PX4A 2I7NA 3C6TA 4FJ8A 4YY3K 4A61A 1QTMA 4H5RA 3BEXA 3PX6A 1QSLA 1QSSA 2P1JA 5JVHL 1OKJA 1IV0A 2O4GA 1WB9A 3JYTA 1QHAA 2P9LB 2P9PA 3LDOA 4KPYA 1X1PA 4CZKA 3AA4A 3KIOA 3LDPA 4GKKK 1ZBFA 3VA3A 3EN9A 1NG9A 3TAGA 4FVMA 2UXCK 1FK9A 4CD1A 4RW7A 1EWRA 1NBWA 3FZLA 1RBUA 4BE1A 1XC3A 2QTDA 2P9IA 4FJMA 3NVMA 1KVAA 4JK9A 4FWSA 3HJFA 4A62A 2A41A 2PAVA 3O6WA 3P5JA 3Q7CA 4JHDB 4FW1A 3PO5A 3IMXA 1IKVA 4FZXC 2FLOA 3OYDA 2I7PA 2ASMA 3QESA 3SNNA 1SKSA 4CI6A 4IO9L 1RDCA 1HLUA 2XY5A 1QS4A 4KFBA 4M45A 4JLHA 4Z94A 3AO4A 2G8VA 5K14A 3V9SA 4NXNK 1RDAA 4CD3A 2A42A 3L4IA 2I5JA 3SZ2A 4PL7A 2A3ZA 1R59O 2A40A 4DR4K 1UWBA 2Z1GA 4OVLA 3THXB 3CPWM 2P9UA 4BDPA 2CH5A 4OPHA 4KRFA 3B8AX 4BRAA 2CGLA 3QINA 4FWNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2D5R A;  1RT5 A;  3SUQ A;  1RT4 A;  3SV4 A;  2YI1 A;  4WCE L;  1T3V A;  3MEC A;  1J5O A;  3UKR A;  1VSI A;  4BRP A;  1I39 A;  4CBW A;  4LF4 K;  1UA0 A;  3IAY A;  4M63 C;  1GLL O;  1VSL A;  3FGU A;  3NDK A;  3V81 A;  3O3F A;  2ATQ A;  3KLG A;  4M3Z A;  3P1G A;  5KRT A;  3CJB A;  1Y97 A;  3CHW A;  3I0R A;  2QWQ A;  3B6P A;  4DFP A;  1BCO A;  4FLT A;  3RVC A;  4BGB A;  2VG5 A;  2HHV A;  1RT3 A;  4KO0 A;  2YJE A;  3I55 N;  3NF9 A;  2Q36 A;  3R3L A;  4B1Z A;  2KQ2 A;  3AVH A;  1GLD G;  1NGI A;  5FPD A;  1WSG A;  4EZ6 A;  4FJL A;  2YNF A;  3VQ4 A;  4J2D A;  1NGC A;  4WYB A;  4ISG A;  5GIN A;  3LAM A;  1K8A O;  4E7K A;  4JNE A;  4FLZ A;  3LDQ A;  1T6C A;  3MXJ A;  5AQZ A;  1SV5 A;  4MQ3 A;  1VSM A;  3FFI A;  3L3U A;  1JL2 A;  3SI6 A;  2QKK A;  5M1P A;  3VQA A;  1DLO A;  3DXK B;  3OYL A;  2F8S A;  1TGO A;  2FC0 A;  2KTQ A;  1P90 A;  4JAX A;  4CFC A;  3K5M A;  4KB0 A;  2D0A A;  3J8A A;  4C8N A;  1SKW A;  3NF6 A;  1Q9X A;  4A2B A;  3HP6 A;  4FWR A;  2HHQ A;  2GBZ A;  4WFN L;  1IBK K;  1RIL A;  2A6A A;  3ZT4 A;  4BVO A;  2DFF A;  2ASP A;  3O9Q A;  4B9V A;  3THY B;  3CMA N;  4H0X B;  3KZB A;  3O3H A;  3P4I A;  3KK7 A;  4DSI A;  5M1N A;  3VEZ A;  2NNW A;  4BRK A;  4O4G A;  4E7H A;  1X9J A;  5AQY A;  4FWK A;  5FRM A;  1MDU B;  3RMD A;  4Z4H A;  1SS6 A;  3CIP A;  3RWU A;  1YVN A;  4NLC A;  3F73 A;  4JKC A;  1X9M A;  5C42 A;  3T1H K;  4CEA A;  3EYZ A;  3OYE A;  2D1K A;  4K25 A;  4BQZ A;  3HZ6 A;  2QEX N;  2E1Z A;  1S3X A;  2G8H A;  1HYV A;  5E84 A;  1NOY A;  4JI5 K;  2XY6 A;  4XH4 A;  4Z4I A;  4GVE A;  1ZBI A;  2ZGY A;  1LWF A;  2F9W A;  1XUP O;  3VQ7 A;  3PV8 A;  3FFK B;  4C1N K;  3SPZ A;  1BWF O;  3HOT A;  1WAJ A;  5J1E A;  4F2R A;  1L3V A;  4KBO A;  3BF1 A;  1KFD A;  1XHX A;  4A5B A;  1HUX A;  3L4Q A;  2KFZ A;  1YUW A;  4YNQ A;  3OVN A;  3FZF A;  4GKJ K;  3O80 A;  2Y1I A;  3FR0 A;  3PUF A;  4K0K K;  1NNE A;  3A2F A;  1P8Z A;  1NOZ A;  2RHK A;  4BRD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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