3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
4BRIA 3D2FA 2QWPA 5AR0A 1LOTB 4PL8A 4DB3A 4CZFA 4BGBA 4RWTA 3QDKA 1K8KB 1GLFO 5E84A 2QWRA 3IMXA 1CZAN 4EHTA 1XC3A 3IFRA 3GBTA 2BUPA 1BA1A 2QWLA 5AQIA 1S3XA 1KAZA 3EO3A 4M7YA 4CI6A 3A5OC 3QBXA 3S41A 4CZLA 3MN7A 5BN8A 2W40A 4XH5A 3BUZB 3ID8A 3LM2A 3O08A 3W3DA 1Q18A 4CZIA 2D0OA 1BOTO 5AQXA 4BRGA 4BR9A 4GY2B 3O80A 4FL9A 2A42A 2P9LB 3SMPA 5KPRA 5AQOA 3H1VX 1MWMA 2QWQA 1ESVA 3O1BA 2E1YA 1NGEA 4JHDA 3UE5A 5AZJA 4M7XA 3U4LA 4BRPA 3LDNA 5JICA 3ZX2A 3VGLA 2YHWA 2FF6A 2P9KB 4BRLA 3ZEUB 3I8BA 2CGKA 4JD2B 3VEOA 5B8HA 5FPNA 3LM9A 4A62A 3DXMB 4BR5A 4BVPA 5KQDA 2H3GX 3ZX0A 3CJAA 4FPAA 3CERA 1Z05A 2V52B 3MCPA 2P9PA 4B1ZA 3UKUB 4BROA 4BRMA 2NRHA 3MMVA 3L0QA 2GEMA 4BR4A 4H0TB 2CGJA 3F9MA 2QM1A 4QS7A 5E26A 1KXPA 3C7NB 3H45C 4BGAA 1T6CA 1C0FA 3DXKB 1HX1A 1IJJA 3HTVA 2Q0RA 4FPBA 5FPMA 2AA4A 3O1WA 2E2OA 2F9TA 1ZXOA 5AQHA 3RSEA 1ZC6A 4H0OA 4H5NA 5AQGA 3CJ1A 3H1QA 4WQ4C 1NGCA 4CZEA 5AQSA 2Q97A 2GWJA 1J6ZA 3WQUA 1R59O 3R8EA 3D2EB 1BUPA 3AY9A 4I6MA 4ISGA 5BPMA 4MLHA 3SMSA 1HUXA 1U2VA 3SK3A 3ENHA 2QWOA 2EWSA 3FR0A 1TUUA 3FZMA 1QZ6A 3VETA 2ASOA 3O4WA 2P9NA 3FFKB 1HPMA 1JCFA 1T6DA 3EN9A 3MN6A 3WEEB 3HI0A 3SJHA 3FE1A 4FSVA 5KPTA 3KZBA 3VEWA 3HBTA 3BF1A 4F9OA 4K41A 1MA9B 1IG8A 3MK6A 2HF4A 5AZIA 2ZWHA 4B9QA 3MDQA 1BG3A 5AZIB 3LDQA 5JMVA 1OKJA 4MO5A 3VF2A 2Q31A 3WEEA 4XH1A 1HLUA 2AP1A 1BU6O 4K25A 3LL3A 4BG8A 4WQ4A 2WUSA 5AFUA 4BRAA 3WXLA 4BRQA 1YXQA 2D1KA 3GDQA 1NGAA 5AQWA 4XEIA 3A5NC 1X3MA 3OHRA 3ZETB 2IVNA 1RGIA 5KQ8A 4A2AA 4BRCA 3ZX3A 3D2EA 3TU5A 1QQMA 2YJFA 4B1XB 1U6ZA 3O6WA 1V4SA 3GG4A 3A5MC 4RCHA 4CZHA 3VGMA 4DQ8A 3H46O 5ADXH 4QS9A 3ATVA 3R6MA 2HF3A 4BRKA 4PKIA 1KAYA 3UKRB 2J4RA 1T44A 4H5TA 5TKYA 3VESA 5EOYA 2ZGYA 5EX5A 3VEYA 3H6EA 2PBDA 3EZWA 2Q36A 3CQXA 4RTFD 1X3NA 3HZ6A 1YUWA 5AQRA 3SLCA 4FWPA 1E4GT 3BF3A 4CZMA 4FWLA 2GWKA 4JNEA 4YDUC 5BR9A 3J8AA 4C23A 1LCUA 3UKRA 1YVNA 4BC4A 5LJVA 1SAZA 4BVOA 3TPQA 2IVOA 2Q0UA 5BPLA 2A41A 4QS8A 3EKSA 4FWOA 4BRNA 4B1YB 3AAQA 3VEVA 2P9KA 1E4FT 2YI1A 2ZF5O 3CJCA 2BTFA 4EAHD 2HOEA 1QQNA 1DKGD 4BRHA 3ZETA 2E88A 5AQTA 4NB4A 2P9NB 3VENA 3VPZA 1BO5O 2QXLA 2D4WA 3L4IA 4A61A 1U2VB 2FSJA 3IDHA 4H5RA 2V51B 3H3OB 4BREA 3UKUA 3WUHA 3O5BA 3FZLA 5AQJA 3ATUA 3M1FA 1NGJA 4BC2A 4L3QA 1QHAA 3VEZA 3CETA 4B1WB 3U8XA 1NBWA 2F9WA 4LC9B 3DXMA 3AAPA 3CJBA 1ATSA 3FZFA 3RSEB 1JCEA 2V7ZA 4JD2A 2YCHA 4MLEA 4FWQA 3DXKA 5EVZA 1NGHA 2GUPA 3CJ7A 1ATRA 5BRFA 3QICA 3D2FB 3VERA 5EY4A 4AM6A 5AQLA 5AZJB 5BPNA 2Q2RA 4KBOA 2E20A 1WOQA 4DCHA 4FWNA 4GNIA 2P9PB 1QQOA 3D7EO 3LDOA 1NWKA 3EL2A 3HM8A 5JLFA 2E8AA 1X9JA 4FWMA 4ISFA 4I6MB 3HSCA 3ZEUA 3W0LA 2VYPA 5AQNA 2ZGZA 4CD1A 3LDPA 5JLHA 1QZ5A 1H1VA 2VWBA 1BDGA 2E2PA 4H5WA 4JHDB 4FOEA 2FLOA 2ITMA 1K8KA 4FWKA 4IJNA 1GLJO 4WYBA 3R9PA 2YJEA 4H5VA 2FSKA 3C7NA 3L6QA 1MDUB 2QWNA 3CIPA 2YHXA 3QFUA 1WUAA 1S22A 2GTDA 4WQ5A 3VEXA 4H0PA 4JN4A 4CBWA 4CJ7A 1DGKN 2KHOA 1YAGA 4J8FA 1NGDA 3AARA 2E2QA 4WQ5C 2UYTA 1EQYA 3M3ZA 2HMPA 3WT0A 4K43A 2FF3B 4O5FA 5F2RA 4BQLA 4IXCA 1GLCG 3I33A 3U9DA 2P9IA 5BRHA 2A40A 1NGFA 3GL1A 1C0GA 4IO8A 5FPDA 2V7YA 4FWRA 4IWVA 3VGKA 4B1UB 1SQKA 5AQUA 1BA0A 3M6GA 2I7NA 1P8ZA 2P9LA 4EIAA 4PKGA 5AQQA 5BN9A 4BC5A 2IVPA 4CBUA 4Z94A 4CD3A 5LJWA 2P9SB 4HWIA 2I7PA 3DWLA 4FOIA 3VF6A 2ASPA 3G25A 3O8MA 4IZ9A 1GLEG 5EXWA 1NGGA 3BEXA 5AQFA 2YHYA 1TYQB 3ULEB 4EHUA 3CJ9A 3FZHA 4E1JA 4CBXA 4K42A 2A3ZA 3MN9A 3QBWA 4H0XB 4XH4A 4NO7A 3KVGA 4JAXA 5BRDA 3CI5A 2QWMA 4CZKA 3CHWA 3DJCA 2NZTA 2A6AA 1ZBSA 1G99A 2ASMA 3LDLA 5AFUH 3A5LC 3UB5A 3CQYA 4PKHA 2DPNA 1NMDA 4MO4A 3VF4A 1GLDG 4A2BA 4FO0A 2CGLA 4O8KA 1RFQA 2FSNA 3QB0A 1BWFO 3FGUA 4CZGA 1NGIA 2VCPA 5AQVA 3ENOA 5AQMA 5FPEA 2E1ZA 3GE1A 2D0PA 5ADXA 1KAXA 3FLCO 4DHYA 4BQZA 5LY3A 1GLAG 4BR0A 1TUYA 2A5XA 4H03B 1DEJA 3WXKA 4EFHA 5AQYA 1TYQA 1NGBA 3WQTA 3U9ZA 3JXUA 1RDWX 2P9UB 3B8AX 3BP8A 3DAWA 1MWKA 1SZ2A 3JS6A 5BREA 5KPZA 3H3NO 2CH5A 1GLBG 4BG9A 4M63C 3WXIA 5I9EB 3VOVA 5AQZA 5F1XA 4BRDA 2FXUA 1GLLO 1NLVA 2GELA 2P9UA 3QFPA 4B1VA 4H0YB 3A8YA 5AQKA 5ELZA 1NM1A 4YDUA 1HJOA 5F0XA 2QW9A 3ULEA 2E2NA 4BRFA 5AQPA 4PL7A 2P9IB 4BR2A 5CE3A 2CH6A 3IUCA 3A0IX 3FZKA 4AM7A 2PAVA 3KHYA 4IJAA 1Y64A 2W41A 1D4XA 1Z6RA 4FWSA 4BC3A 2P9SA 1ATNA 4BR7A 1XUPO 4ISEA 3C0BA 4Y0WA 3WXJA 1HKGA 2OANA 1JCGA 4HTLA 1HKBA 2NLXA 3MN5A 3GOIA 3QMLA 4CZJA 1HKCA 4H0VB 3P4IA 2Q1NA 1V4TA 2IIRA 3EKUA 1XQSC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVFA 3D2FA 2QWPA 1YT3A 3VQ4A 3VQ7A 1ZBLA 1LOTB 1YIJN 4JKFA 3QDKA 5E84A 2QWRA 3IMXA 1CZAN 4EHTA 1RBUA 4IDKA 4DSIA 2HHQA 4JI6K 2JWKA 3T19A 3J7AP 2QWLA 3J80O 4CFBA 1YTAA 1N6QA 3QBXA 3ZT3A 4JI8K 3S41A 5BN8A 1WSGA 3AVAA 3O08A 1Q18A 1BOTO 4OLAA 3C65A 4B9VA 5LMNK 3VMFB 1NK9A 3MX2A 1NK6A 2GV9A 3SMPA 2W6LA 4QAGA 3H1VX 4JKBA 4X64K 5C2DA 3TWHA 2QI2A 3KK7A 3EY1A 2Z1GA 3NF9A 4GV3A 3EEQA 3ZX2A 4E89A 3K57A 3NH2A 3RMAA 1TGOA 5B8HA 4DF4A 1W97L 4BVPA 4BR5A 1U47A 3THWB 2H3GX 1WSHA 3ZX0A 2X74A 5KGXA 1RT6A 1K8AO 1QSSA 3L2VA 3RMCA 1VSDA 1KTQA 3L0QA 4OLBA 4BR4A 2CGJA 2QM1A 4QS7A 4C8KA 4EZ6A 3HXMA 3C7NB 3H45C 5HRSA 3M8RA 1R0AA 1VAZA 3DLGA 1HX1A 5FPMA 2AA4A 3KD5E 1ZXOA 3EE9A 1OH5A 3OJUA 3CPWM 2D0BA 4IOCL 3H1QA 3BZCA 4CZEA 3UIQA 4LH5A 1S6PA 4JI2K 5HROA 4O55A 1LAVA 4B9NA 3WQUA 4IOAL 2EHGA 3VQ5A 2OTLN 3QLHA 1L3SA 4B3TK 4LD0A 1HUXA 4IO9L 3NF8A 2ITGA 4C8NA 2Z1HA 1VSKA 3AV9A 3OYAA 1C6VA 3DOKA 5E41A 3LZIA 2UU9K 3OW2M 2DTUA 1IBLK 3R3LA 3K9JA 3L2WA 3DOLA 4NYNA 2QK9A 3SJHA 4KO0A 4HHTA 2XY8A 3HBTA 4K41A 1MA9B 4WFAL 3TAFA 3MK6A 3I56N 3TANA 2ZWHA 1ZBFA 1S1TA 1BG3A 3T7ZA 4DTJA 1REVA 1Q82O 3F5TA 1LW0A 2Q31A 4WFNL 1U48A 3KWIA 3LL3A 4AHSA 4WQ4A 1HNIA 4B8CA 4PQUA 5GADP 4BRAA 4CERA 1YXQA 1UWBA 4MDBA 1NGAA 5AQWA 1X3MA 3CPEA 3OHRA 3K5MA 1B9FA 2ZE2A 2IVNA 4CF1A 4A2AA 4GMJB 3V1OA 2QTDA 1RTHA 1U6ZA 4B1XB 2W6KA 3GG4A 4RCHA 4GVEA 4DQ8A 3VGMA 4CHQA 4NCBA 1T7PA 4PKIA 3UKRB 2E4LA 1U49A 2O8EB 5TKYA 5FLXO 3HOSA 5C24A 1C1AA 3EZWA 1JLCA 2Q36A 3U3GA 3DLKA 4IFVA 2OPRA 2Z1JA 1X3NA 2IDOA 2XRIA 3C6UA 1TK8A 3SAFA 2VG6A 2B5JA 1BQMA 2GWKA 3NH0A 4EZ9A 4FJ9A 2O8EA 3NGIA 3RR8A 4RW8A 3UKRA 1YVNA 4KHQA 1SAZA 2IVOA 2A41A 4J2AA 3SBGA 3EKSA 4YOVA 4DTOA 5HP1A 1E4FT 3CJCA 4LSNA 4EAHD 3K5LA 4BRHA 2E88A 2HMIA 3ZSYA 4JYAK 1FKPA 3VPZA 1BO5O 2WC9A 1OH8A 4FJXA 2LSNA 3L4IA 3CC7N 3WNHA 4FJHA 3O4NA 2G8HA 2FSJA 2V51B 3NVMA 3C6TA 5T7BA 3LWLA 4OX9K 4BREA 3O3HA 5D3GA 4K8XA 3O5BA 4OJRA 3OBYA 4KRFA 4L3QA 3VEZA 3CETA 1EX4A 4B1WB 3U8XA 1NBWA 1JL1A 2F9WA 4BE2A 4DTMA 4ILJA 3DXMA 1YJWN 3AAPA 4IFEA 3QIPA 4JD2A 1UOCA 4MLEA 1C1BA 4C8OA 3AVLA 3CJ7A 1JLQA 3D2FB 3CFRA 4AM6A 5LMUK 5AZJB 5CR4A 4FVUA 4CK1A 3K5OA 3NFAA 3ZT0A 1CZBA 3AO4A 1QQOA 4DUZK 3D7EO 3O3GA 4DMNA 1N32K 1XNQK 3EL2A 2Y1IA 3G10A 1X9JA 2ZD1A 4E3SA 3ZEUA 4JKGB 4J2EA 1HJRA 2PY5A 5AQNA 4E1NA 4E7KA 4CD1A 4PUOA 3LDPA 4RG8A 3KLIA 1H1VA 1VHXA 5C10A 2E2PA 3THVA 1SKWA 4FOEA 1XWLA 2HHTA 1K8KA 3E9PA 4YNQA 3B6OA 4WYBA 2OZMA 1TVRA 3C7NA 4AHCA 4E7IA 3SPZA 2ZQBA 3AA4A 1FXXA 2UXDK 4DTPA 2WOMA 3OS1A 1UA1A 1WUAA 3VA3A 2QA4N 2GTDA 4WQ5A 3VEXA 4H0PA 3N4PA 3CMAN 4CJVA 2QKBA 4FK0A 1YAGA 3AARA 1KC8O 4DSLA 4UQGA 3SPYA 2PZSA 1QE1A 3PIPL 1K6YA 3S3NA 3QEPA 4BQLA 2OZSA 2HBMA 3I33A 5BRHA 3NGYA 1NGFA 3MEEA 4PWDA 2QEXN 4F3TA 4NLCA 4B9MA 3DM2A 1TL3A 3AVIA 1IBMK 5AQUA 1VSEA 1RBSA 1BA0A 3M6GA 4EIAA 4LH4A 3D0PA 3CQ8A 4CF9A 5BN9A 2IVPA 2F7TA 4JKEA 4Z94A 3F73A 3MEGA 4CD3A 3DRRA 2F8SA 2I7PA 3NAEA 4Z4IA 3VF6A 1X1PA 4Z4CA 3DLRA 3VQAA 4CJPA 2IOCA 2YHYA 5JS1A 4IEEA 1RDBA 3MN9A 1YVUA 5GINA 4KHUA 3MX5A 4FJIA 3DJCA 2O8FA 3J81O 5M1PA 2O8DA 3LP2A 3O4QA 4CEDA 4CHPA 4YHHK 3KWGA 4CIGA 4PHTX 1ASUA 3G6EN 3DLHA 4A2BA 2ZJPL 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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