3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
2HF3A 5BR9A 3I33A 3VF4A 5AQSA 4B1UB 5AQHA 3WQUA 3FFKB 5TKYA 4QS8A 1NBWA 2YHYA 3C7NB 4EAHD 3LDPA 4EFHA 5AZIB 4CZIA 4FWKA 4IWVA 4BRHA 2P9IA 3UKUB 5E26A 3OHRA 5LY3A 5AQJA 3VF6A 4DHYA 3ZEUA 2KHOA 1GLCG 4FSVA 5AFUA 5FPDA 3ATUA 3LDNA 2A42A 2QWLA 3FZHA 4HWIA 1GLBG 3CQYA 2A5XA 4ISFA 5KPZA 2I7NA 3W3DA 1GLDG 1GLAG 4M63C 5AQYA 1TUYA 5AQMA 2E2PA 2GWJA 3VEXA 4H0OA 3VEOA 5AQWA 1NMDA 4BRLA 1TYQA 3RSEB 4BR0A 5AQOA 1HX1A 4BR5A 3SK3A 1IJJA 4FWMA 2VCPA 3TPQA 1DKGD 2Q0UA 3CJ1A 4BRCA 5F1XA 3JS6A 1NGCA 3F9MA 1LOTB 1K8KB 4IZ9A 4CBXA 4B1VA 4CD3A 4Z94A 4AM6A 2F9WA 1J6ZA 4K41A 4H5TA 1V4SA 3LM9A 4FPAA 3KHYA 3O4WA 4XH5A 4QS7A 3DXKA 1E4GT 2QM1A 5AQKA 2ZGZA 4FWOA 4BR4A 4QS9A 1S3XA 4EIAA 4I6MB 4BRGA 2GELA 3FE1A 1IG8A 1T44A 5EOYA 1HLUA 4K43A 3VGMA 1ATNA 1U6ZA 4EHTA 4IXCA 2GTDA 4WQ5A 5BRFA 3W0LA 4AM7A 3TU5A 2E2QA 2GWKA 1KAZA 3DXMA 2E20A 4BVOA 5BPLA 2UYTA 4ISEA 1BWFO 4DB3A 1X3MA 3HM8A 3M3ZA 4PKIA 4C23A 2E2OA 3HI0A 4ISGA 5F2RA 3BF1A 2FSNA 2P9NB 4FL9A 4CZKA 1BU6O 3G25A 2E1ZA 2FSKA 4BREA 2E88A 3UKRB 4FPBA 1KXPA 2Q0RA 4XH4A 4CI6A 2E8AA 3ID8A 1GLEG 4BRDA 1QHAA 5BPNA 5AFUH 3I8BA 3UB5A 3QFPA 5AQZA 3SMPA 3H3NO 4BC3A 3CJ7A 1MA9B 4CJ7A 2FF6A 4RWTA 3A5MC 1JCGA 2QW9A 3A5NC 2PAVA 4BRKA 2D0PA 5AQTA 3ZETA 3A5LC 1NGIA 3D2FB 3GDQA 3D2FA 1BDGA 3J8AA 3VGKA 2FLOA 4JNEA 2GUPA 4K42A 3MN9A 4BG8A 3R9PA 1LCUA 3BP8A 1BOTO 3BUZB 4M7YA 5F0XA 2NLXA 3LDQA 2ASPA 5ADXH 3L4IA 4KBOA 2HOEA 3FZMA 4IJNA 3O08A 3M6GA 3MDQA 3H1VX 3CERA 5AQXA 2P9NA 3WXJA 3VEVA 3QB0A 3QICA 3KZBA 3O1BA 5AQNA 5KPRA 2Q2RA 1C0GA 3ENOA 3MN7A 1GLJO 5ADXA 2QWQA 3ULEA 3WEEB 2FF3B 4BC2A 2VWBA 1MWKA 4FWNA 3FZFA 3VENA 2CH6A 3DAWA 3GE1A 3WQTA 2HMPA 4JHDA 1QQMA 1U2VB 3CQXA 1Q18A 3H46O 1BUPA 1XQSC 2CH5A 3M1FA 3O1WA 2F9TA 4I6MA 4L3QA 2ITMA 1X3NA 5BRHA 1CZAN 3DXKB 2OANA 3VEZA 3CJ9A 5LJWA 4JAXA 3EZWA 2QWPA 4DCHA 1SQKA 5I9EB 1HKGA 2E1YA 4H5RA 4DQ8A 4XH1A 5AQIA 1U2VA 2P9UA 3CJAA 1V4TA 4JHDB 3QDKA 3CETA 5BN9A 2I7PA 4BR7A 4CZFA 1ESVA 3HTVA 2CGJA 3ZX2A 3CIPA 2YHWA 1NGHA 4A2AA 2H3GX 4MLHA 3QBWA 5LJVA 2V7YA 3MK6A 3DWLA 4WYBA 5AQFA 4A61A 3BEXA 3CHWA 1TYQB 1NGAA 1R59O 3RSEA 4BG9A 5JLHA 1KAXA 1Z6RA 2BUPA 3ZX0A 1YAGA 3IMXA 1X9JA 1QQNA 4FOIA 4WQ4A 5BREA 1HKCA 2A3ZA 3H3OB 3CJCA 5AQRA 1NGGA 4RTFD 5KQDA 2ZF5O 3VETA 1YUWA 3FZLA 4B1YB 2D0OA 1QZ6A 2FSJA 2QWNA 2Q31A 3ZX3A 3ZEUB 1QZ5A 2QWMA 4CZMA 5JMVA 5FPNA 3WXIA 5AQVA 1MDUB 3ZETB 3D7EO 1E4FT 4BRNA 1HUXA 1QQOA 2P9UB 4BRMA 2PBDA 3VERA 4CZGA 1BA0A 1NWKA 2W41A 3IFRA 3AARA 1XUPO 3GL1A 4BVPA 1YVNA 1P8ZA 4PL7A 2V52B 2QWRA 2ASOA 3JXUA 2IVPA 3VGLA 1YXQA 2QXLA 2AP1A 3EL2A 3HZ6A 4WQ4C 4PKHA 4H5NA 3FZKA 3EKSA 4CZLA 1RGIA 3D2EA 4FWQA 3WEEA 3ULEB 3R6MA 3H45C 1T6CA 4RCHA 4BC5A 3HBTA 2P9KB 2YJFA 3ATVA 4H5VA 4IJAA 4H0PA 2VYPA 4K25A 3H6EA 1Y64A 2P9PA 4H0YB 2AA4A 1JCEA 3R8EA 3VEWA 2D4WA 1G99A 4YDUA 1XC3A 2BTFA 2V7ZA 4B9QA 3A8YA 3VPZA 2J4RA 3A5OC 5ELZA 4MO4A 1Z05A 5BRDA 1WOQA 3HSCA 1ATRA 2HF4A 2Q1NA 4PKGA 5EY4A 4H0VB 2A6AA 2A41A 2A40A 4CZEA 3QFUA 1SZ2A 4A62A 5AQGA 3H1QA 4H03B 3O80A 3U9ZA 1ZC6A 4BQZA 4H0TB 2P9LA 2ZGYA 4M7XA 1S22A 5AZJA 1TUUA 1NLVA 4FWSA 3U9DA 1BA1A 3UKRA 1DGKN 2YI1A 2P9SB 3BF3A 2ASMA 5KPTA 2QWOA 5JICA 5AZJB 4YDUC 1C0FA 1T6DA 3MMVA 2P9LB 3WXKA 5JLFA 5AQQA 4FWRA 5BPMA 1ATSA 3FR0A 3DXMB 3LM2A 2FXUA 3CJBA 4O5FA 1H1VA 1HPMA 1HJOA 2EWSA 2W40A 4A2BA 5AQLA 3WXLA 3LDLA 4BR2A 4O8KA 5CE3A 4BRAA 5AR0A 4CD1A 3S41A 2YJEA 2E2NA 5AQPA 3IUCA 5AZIA 4E1JA 1RFQA 4GY2B 1NGDA 3ENHA 1BO5O 3P4IA 5FPEA 3IDHA 3EO3A 4NO7A 4BRPA 3MN6A 1KAYA 4B1WB 4BGAA 4FWPA 2IVOA 1K8KA 5FPMA 2WUSA 4LC9B 3SMSA 2P9KA 3WUHA 5EXWA 4FWLA 3QMLA 3D2EB 4EHUA 2CGKA 3QBXA 4BRIA 3L0QA 3C0BA 4CBWA 3KVGA 3MCPA 4B1XB 1NGFA 4FOEA 3UE5A 3U4LA 3CI5A 4J8FA 4BGBA 4NB4A 1OKJA 1NGBA 3FLCO 1D4XA 2YHXA 2IIRA 2P9SA 2ZWHA 3LL3A 5KQ8A 4BRFA 4CZJA 5B8HA 3AAQA 3DJCA 4BQLA 4CZHA 4H0XB 1BG3A 4B1ZA 3B8AX 4BC4A 4FO0A 4JD2A 1GLFO 1RDWX 1ZXOA 2IVNA 3O8MA 3EN9A 4HTLA 4XEIA 3AY9A 4WQ5C 2DPNA 1JCFA 4JD2B 5BN8A 3UKUA 2P9IB 4BROA 1EQYA 1ZBSA 4PL8A 5EX5A 3VOVA 2D1KA 1HKBA 5EVZA 3C7NA 2NZTA 1DEJA 3AAPA 3GBTA 1NM1A 3A0IX 3VESA 2V51B 3O6WA 3U8XA 2P9PB 1GLLO 4Y0WA 2YCHA 2NRHA 1WUAA 2CGLA 2Q36A 4MO5A 1NGJA 4BRQA 1SAZA 1NGEA 3GOIA 4H5WA 4F9OA 4JN4A 3GG4A 2Q97A 3LDOA 3SLCA 2GEMA 5AQUA 4BR9A 3O5BA 3FGUA 4GNIA 3EKUA 1MWMA 4CBUA 4MLEA 3VF2A 5E84A 3VEYA 3WT0A 3SJHA 3MN5A 3L6QA 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF3A 4GMJB 3QERA 4B1UB 2FC0A 5AQSA 3CCQN 3ULDA 3K2PA 3FFKB 1NBWA 4EAHD 1F21A 1O13A 2QA4N 4CZIA 4BRHA 4PUOA 3OYEA 2P9IA 2P5GA 5LY3A 5AQJA 3ITHA 3VF6A 2KHOA 4FSVA 4CERA 2KTQA 3SV4A 3AVNA 4DV1K 1HNWK 3SV3A 3CQYA 4DSJA 2E4LA 3W3DA 5AQYA 2E2PA 2GWJA 1N8RO 1VQMN 5AQWA 3NH0A 4BRLA 1TYQA 1VRTA 3RSEB 4CEAA 4JS5A 3MXIA 5AQOA 4DMNA 3AVJA 1XI1A 4BR5A 1EKEA 1VQ4N 1VK0A 1IJJA 3S3MA 4FXDA 3TPQA 2YNHA 1S1VA 2WFBA 4FW1A 5A2QO 5M1QA 3T1YK 4LD0A 5FRMA 3M8PA 3L2QA 3C65A 1RTDA 1IKWA 4N5SA 4CBXA 3MAQA 5BR8K 1NJYA 4K41A 4FPAA 3OYNA 1YJWN 4H4OA 5GADP 4J2DA 1E4GT 3J81O 4EIAA 4BRGA 4BWMA 1HYZA 5CYMA 3AVIA 4DSFA 1YT3A 3KLGA 1KLMA 4EHTA 2I5JA 2GTDA 5K14A 4CF9A 1HNIA 3TU5A 1WSGA 4DQIA 2D5RA 5FRNA 2UYTA 3OYDA 3HO1A 2HHXA 3M3ZA 4PKIA 3ZYYX 2E2OA 2PFUA 2FSNA 1BU6O 1W2BM 2FSKA 3CF5L 2E88A 3UKRB 4FPBA 4FJ7A 2Q0RA 4WE1A 3ID8A 5BPNA 1REVA 1VSIA 3SMPA 4BE0A 4CJ7A 2HVHA 4CHNA 5AQTA 4ZTJA 3NF7A 2AJQA 2XY7A 3D2FB 3J8AA 1BDGA 3VGKA 1ASWA 5DM7L 4JNEA 1KSPA 3TARA 2RKIA 3L8BA 3LDQA 2ASPA 1I39A 2HOEA 3FZMA 1E3MA 4G1QA 3O08A 3OYKA 5MLCQ 2O4IA 1RDCA 1KRPA 2KQ2A 3I8DA 2P9NA 3G6EN 5KPRA 1KVCA 3SQ2A 1KFSA 1TKXA 1BISA 3TR8A 2FF3B 4JKDA 2VWBA 4LSNA 2CH6A 4YOYA 2W42A 4F2RA 3D0PA 1Q7YO 3WQTA 2HMPA 2ZJPL 5KRSA 3T1HK 1IBKK 1XQSC 3M1FA 4F8RA 3VEZA 4DTXA 3CJ9A 5LJWA 2W6LA 1SQKA 3E9PA 1HKGA 2O8BA 1U2VA 3ZSRA 3CJAA 1V4TA 1ZBLA 4X62K 2YHBA 4IEEA 3CMAN 4O0JA 2UXBK 4JI3K 3ZLJA 1ESVA 5JS1A 3CPWM 2VQEK 4KH4A 3AA2A 2UUAK 2HVIA 4FLTA 3KKRA 1RILA 1XNRK 3QBWA 4RW7A 3VQDA 2V7YA 1JJ2M 3QEIA 5AQFA 4YOVA 3OJUA 2O8EB 4BG9A 1K9MO 1Z6RA 2BUPA 3ZX0A 1YAGA 3IMXA 1QQNA 4I2QA 1LWFA 1HKCA 2ZQBA 3H3OB 3MX2A 3VETA 2Q3SA 3AVBA 4KHSA 4BDZA 4B1YB 5TKWA 3TSQA 4IKFA 3TAQA 5C15A 3OYAA 4NCBA 3WXIA 2X6NA 1MDUB 3ZETB 1BIZA 3D7EO 3AVGA 3DLKA 4BRNA 4CFBA 2RF2A 1NK7A 3TAPA 4OVLA 4OKJA 3SQ0A 1T05A 1YF5L 2PBDA 1Q81O 2W41A 3QEPA 4BVPA 2V52B 3LAKA 2QWRA 3JXUA 4B9MA 4N76A 2HHVA 2XHBA 3DRRA 4H5NA 1UAXA 4FM0A 3EKSA 2IDOA 4CZLA 1ZBUA 3NE6A 4C1NK 3R6MA 4HUEA 4BC5A 3ZT0A 4H5VA 2QXFA 4IJAA 4H0PA 1A5WA 3QNOA 2HMIA 5CYQA 4K25A 4NLBA 4OPKA 2P9PA 2OPRA 4K8ZA 3R8EA 2O8DA 4Z0UA 1XC3A 4ZTFA 2V7ZA 5CY4A 1RDDA 3F9KA 1FW6A 4KH5A 3SYZA 4Y1CA 2J4RA 1RT4A 3A5OC 4MO4A 1Z05A 3UIQA 4Y1DA 2Q1NA 4DQRA 3M5RA 3QFUA 2XY5A 1ASVA 1TK0A 1UWBA 4FLWA 4M3UA 1EETA 2ZGYA 1TUUA 5HOOA 1JLAA 3I56N 3CC2N 3EEQA 4CJSA 3U9DA 3V9WA 3UKRA 1DGKN 2B5JA 2D0BA 1YI2N 4NXMK 3TABA 3LP3A 2YKMA 3KD5E 5KPTA 4RG8A 1O1WA 3R1XA 2FBVA 5AZJB 4YDUC 5C12A 1EWRA 3CM6A 2ZD1A 1BQMA 3O9TA 2UU9K 5JLFA 3THYA 5AQQA 1C1CA 1Q9YA 3FR0A 3OJSA 1UA0A 1HPMA 3ZT3A 2EWSA 3SUOA 3CCMN 3ZT1A 3LDLA 4X65K 3DLEA 4I2PA 4CD1A 2RN2A 3WXMB 4FM1A 3P4IA 3EO3A 3L2RA 2WC9A 4NO7A 5KGWA 4BGAA 4R79A 1RBUA 1WBDA 3KK3A 4ID1A 1W9HA 4LC9B 3WUHA 4M3XA 1B9DA 4FWLA 1L3VA 1IO2A 5J2QA 4B3MK 4CJVA 3O9UA 3DLHA 4W5NA 1RBVA 4IFEA 4J8FA 4NB4A 1D9FA 4BE2A 1NGBA 3LP0A 1D4XA 2IIRA 3AVMA 1U4BA 3LL3A 5KQ8A 2KZZA 1ZBIA 1G15A 3VA3A 1RT6A 3AAQA 4CHZA 2ATQA 3IS9A 2JWKA 4GV6A 1RT2A 3B8AX 4KHUA 3M8QA 1LWCA 1RTHA 5M1OA 1GLFO 3CXCM 2Z1JA 3O8MA 3OYJA 5M1FA 1SL1A 5LMUK 1KQSM 2KW4A 2DTUA 3M8SA 3AVAA 1JCFA 1J54A 3SAGA 2P9IB 1EQYA 4JKBA 2KKZA 1SUQA 2D1KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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