3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
3C7NB 3UKRA 1NWKA 4M7XA 4NO7A 3H46O 1K8KB 4BRIA 3WXLA 1GLDG 2HOEA 1KAXA 4A61A 1NGIA 4CZHA 3A8YA 1T44A 3IFRA 3D2EA 1EQYA 5FPEA 3EZWA 4FWPA 3BP8A 3MN5A 1QHAA 2Q0RA 2A41A 4MO5A 3FZLA 2YJEA 3A0IX 3M1FA 2PBDA 3H45C 1HPMA 4I6MA 3TU5A 3WXKA 2V7ZA 5E84A 3R9PA 4NB4A 3HM8A 5LY3A 2P9LA 4BC5A 5LJVA 1WUAA 1MWMA 4CZMA 4CZFA 1NM1A 3EKSA 5AQPA 3ZEUB 4CJ7A 2YJFA 2D4WA 2GELA 5EOYA 3UB5A 4FWQA 4QS8A 4BRLA 3GL1A 3H3NO 1Z6RA 3D7EO 4AM6A 4PKIA 1JCFA 1NMDA 1X9JA 2D1KA 3DWLA 4RCHA 2P9PA 3GG4A 4H0YB 4H0XB 3UKUA 3O6WA 3CI5A 4FWOA 4EHTA 4WQ5C 4M63C 3CJCA 5AQFA 2VCPA 5BRFA 2QWOA 1X3NA 3HBTA 3MN7A 3LM2A 2E88A 4PKHA 5AZJA 3FZHA 1QQNA 4FPBA 4B1XB 3CQXA 1T6CA 2D0OA 1XQSC 1Z05A 1NGFA 3FZKA 3L4IA 4JD2B 2QWRA 4H0TB 4DQ8A 1JCGA 1Y64A 2YHXA 1MA9B 2VWBA 4H5WA 5EVZA 3U9DA 3ATUA 4BGAA 4E1JA 3H1VX 3O1BA 2Q1NA 2YI1A 5FPNA 1U6ZA 3ATVA 3LDOA 3W0LA 4Z94A 4ISEA 5KPRA 1ATSA 3MDQA 3VOVA 1TYQB 1LOTB 3VPZA 1HKGA 2GTDA 4IJAA 3FFKB 3EN9A 1GLLO 1KAYA 1R59O 3JXUA 4A2AA 3M3ZA 2BUPA 3CJ9A 5F0XA 1BDGA 2QWPA 2QWNA 1V4SA 4RWTA 2V52B 2Q0UA 5EY4A 5AQOA 4BRQA 5BPNA 3BEXA 1NGJA 4B1YB 1HJOA 3VEZA 4BRCA 3FGUA 3UE5A 2HMPA 2CGJA 3H1QA 2E2NA 1KAZA 1NGHA 5CE3A 4BRFA 3ZETB 4C23A 4CZKA 3D2FB 4ISFA 3RSEA 2FXUA 3VESA 4B1ZA 2A5XA 4H5VA 3LDQA 2ZGYA 4FL9A 4Y0WA 4JN4A 2CH5A 5AQIA 2QWMA 4BVPA 4EFHA 2H3GX 3VEYA 2Q31A 2P9SB 3VETA 1ZC6A 1NBWA 1CZAN 5LJWA 4IWVA 4LC9B 1MDUB 3SMSA 3LDPA 1BA1A 3CERA 5KPZA 5AQZA 3A5MC 4BR2A 1BG3A 1U2VA 4IJNA 3O08A 2EWSA 3CIPA 2P9NA 3A5NC 1GLCG 3WEEB 3I8BA 3LDNA 3KHYA 5AQYA 1E4GT 2V51B 5AQXA 4JNEA 2FSNA 5BRDA 3DXMA 3MN6A 3G25A 2GWJA 3VF2A 4FO0A 1JCEA 3ZX2A 3ID8A 3VENA 2ASOA 4FWKA 3VEOA 3R8EA 2FSKA 2ZWHA 3HZ6A 3ZEUA 4BRNA 5AQLA 3U4LA 4XH4A 4K25A 1XUPO 3EO3A 3ZX3A 3MN9A 5TKYA 3ULEB 5KQDA 2WUSA 4WQ4C 1GLFO 1BOTO 4JAXA 2E2PA 2P9UA 5AQKA 3BUZB 2A3ZA 4IZ9A 2W40A 2E1YA 5BR9A 3LL3A 4BRKA 2P9KB 3LM9A 4J8FA 3FZMA 5AZIA 2NRHA 3VERA 2IVNA 2QM1A 4B9QA 3O4WA 1WOQA 3F9MA 4K43A 4ISGA 4DHYA 1NGDA 4BRAA 4BR4A 2PAVA 2E2OA 2D0PA 2P9LB 4BG8A 4FWLA 3AAQA 1MWKA 2ZF5O 3O80A 4DB3A 2CGLA 4JD2A 4CZGA 1HKBA 3ENOA 3DJCA 4H0VB 2Q36A 3ZX0A 5AQMA 2QWLA 3WUHA 3IDHA 2AA4A 4DCHA 1ATRA 1DGKN 4A2BA 4CD1A 3H6EA 3QFPA 4H0PA 3CHWA 4BVOA 3VEWA 2A42A 1YVNA 3DXKA 1NGEA 1NGCA 2OANA 3GBTA 3HSCA 4M7YA 5AFUA 5BN8A 3CJBA 3QFUA 2I7NA 2E1ZA 3R6MA 4GNIA 3SJHA 3P4IA 4A62A 2E2QA 3QBWA 4RTFD 2VYPA 4XH5A 3U9ZA 1TUYA 4BR5A 4PL8A 5AQQA 2E20A 1ZXOA 2F9WA 3ZETA 3IUCA 3MK6A 4XEIA 1BU6O 3FR0A 3QICA 5FPDA 2P9IB 4EAHD 5I9EB 5BPLA 4BRMA 3ENHA 3KZBA 1RDWX 1GLBG 1XC3A 3HI0A 1KXPA 1NGGA 1NGBA 3W3DA 5B8HA 4YDUC 2HF4A 4CI6A 3EL2A 5AQRA 3CETA 1QZ5A 4O8KA 3O5BA 2ITMA 1YXQA 3C7NA 5F2RA 1SAZA 1QZ6A 2QXLA 4FOEA 1C0FA 4JHDB 1K8KA 3CJ1A 2FF6A 5AFUH 3HTVA 4H5TA 2KHOA 3SK3A 1LCUA 3O1WA 4FPAA 1BA0A 3DAWA 3AAPA 5JLFA 3RSEB 4BC2A 1HX1A 3A5LC 4B1VA 1DKGD 1NLVA 2V7YA 3BF3A 3WXJA 4BQLA 1QQOA 2F9TA 3LDLA 4H0OA 4FWMA 2GUPA 3OHRA 2YHYA 4MLEA 4CZLA 2J4RA 4CBXA 4H5RA 3S41A 2IVPA 2ZGZA 3M6GA 1OKJA 4H03B 3VGMA 3VGKA 3UKRB 4EIAA 1NGAA 1Q18A 1P8ZA 2FLOA 4BRHA 1U2VB 2P9KA 4BC3A 2P9NB 2FF3B 5BRHA 3KVGA 4IXCA 1SQKA 3FLCO 4K42A 1HLUA 1ZBSA 3D2EB 2AP1A 3CJAA 1X3MA 4FWNA 3DXMB 2W41A 1IJJA 2CGKA 3SMPA 4QS7A 1J6ZA 3GDQA 3GOIA 4BG9A 5AQSA 2CH6A 2ASMA 4I6MB 1GLEG 2I7PA 4WQ4A 1DEJA 5JMVA 4CZEA 1T6DA 3GE1A 5AQHA 5JICA 5EX5A 2A40A 5AR0A 1BO5O 1GLJO 4QS9A 3VEXA 5KQ8A 1HUXA 2P9UB 3VEVA 4BC4A 2E8AA 1ESVA 4EHUA 3TPQA 4FSVA 1BUPA 1H1VA 4FWRA 4MLHA 4PKGA 5JLHA 5AQNA 2P9PB 3FZFA 3UKUB 4WQ5A 5AZIB 2FSJA 1YAGA 1TYQA 5E26A 1BWFO 4L3QA 3CJ7A 4FWSA 1QQMA 3SLCA 4BGBA 4HWIA 3VGLA 3WQTA 3L6QA 1RFQA 4BRDA 5AZJB 3CQYA 3U8XA 3VF4A 3WQUA 5ADXA 3MMVA 3VF6A 5AQWA 3AARA 3C0BA 2QW9A 2QWQA 5BPMA 4K41A 5BN9A 4GY2B 3L0QA 1D4XA 3I33A 5EXWA 4BR0A 3JS6A 1G99A 2P9IA 4XH1A 4BR7A 1V4TA 4F9OA 4KBOA 1S22A 1E4FT 2GEMA 4BRPA 3D2FA 2IVOA 2YHWA 3QDKA 1TUUA 4BQZA 3WT0A 1C0GA 3DXKB 1GLAG 3FE1A 2NZTA 4BR9A 4B1WB 4BROA 1SZ2A 2P9SA 3B8AX 4B1UB 4CZJA 2BTFA 5FPMA 3MCPA 4JHDA 4O5FA 2GWKA 4BRGA 3O8MA 4HTLA 1HKCA 4H5NA 4CBUA 2Q97A 1ATNA 1S3XA 5KPTA 3J8AA 1YUWA 4MO4A 4PL7A 4AM7A 4CBWA 4FOIA 2IIRA 4WYBA 2A6AA 5AQGA 5AQUA 4CD3A 5AQJA 5AQVA 2HF3A 2UYTA 2YCHA 3WEEA 3A5OC 5F1XA 5ADXH 3H3OB 4CZIA 3QBXA 4YDUA 3QB0A 3QMLA 2Q2RA 4IO8A 5BREA 3BF1A 4BREA 1RGIA 3IMXA 2DPNA 5AQTA 5ELZA 2ASPA 3WXIA 1IG8A 3EKUA 3AY9A 2NLXA 3ULEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UKRA 3AVHA 5KTQA 2ATQA 3H46O 1C0UA 3CD6N 3BGRA 3AVBA 4CESA 4HCCA 3BP8A 1QHAA 3G10A 1C1CA 1EKEA 3FZLA 1Q81O 4B3RK 1VSKA 2X6NA 4IFEA 3CM5A 4EP4A 4CEOA 3H45C 4DV0K 1HPMA 3TU5A 3WXKA 4M42A 3C94A 4DG1A 4FJGA 2XHBA 3C65A 2VQEK 3HM8A 2P9LA 4DV4K 1WUAA 2HHSA 3NGZA 4G1QA 3L8BA 2P1JA 3KIOA 4CZMA 2W6LA 4CZFA 4AHCA 3SBGA 4DV7K 5EOYA 1N32K 3HSTB 4YOXA 1TL1A 3H3NO 4AM6A 4PKIA 1NMDA 3AVCA 2HHUA 4KHWA 3RMCA 1RBRA 3OYKA 3QINA 3MXIA 4CGHA 5J1EA 4FWOA 3MWPA 3QEIA 2VCPA 3OJUA 4OPJA 3MN7A 3LM2A 3IKMA 3ZSRA 3OYNA 3PO5A 3TAMA 3ZSQA 4CVNE 4JKDA 3D6RA 1NKCA 4Y1DA 1IKXA 3PX6A 3QERA 3QNOA 4CECA 2QWRA 4X64K 4DQ8A 3SCXA 3QO9A 4BGAA 4E1JA 4K8ZA 3ATUA 2F7TA 5C12A 4HUFA 2HHQA 1U6ZA 3ATVA 4W5RA 3CMEN 3LANA 4YY3K 4Z4FA 1YIJN 3OTOK 1HKGA 2GTDA 2RKIA 4CHYA 1T05A 3FFKB 3VQBA 3EN9A 3MX2A 1NK4A 1R59O 3JXUA 1RT3A 2NUBA 1U47A 4RWTA 2V52B 2Q0UA 5EY4A 2Q3SA 1NGJA 4RW6A 1BIUA 3HM9A 3UE5A 3EEQA 3J81O 3RVCA 1J9AA 4BRFA 1JLCA 5GAHP 3THWA 1UA1A 4E19A 3D2FB 1L3TA 2ZGYA 4FXDA 4Y0WA 4JN4A 2X74A 4I9LA 2WC9A 2H3GX 3KLEA 5C25A 2YNGA 1CXUA 3VMFB 1CZAN 3ZT3A 4LC9B 3KLHA 3LDPA 3JYTA 1TK8A 2PFUA 3DLBA 4CEBA 3RWUA 1NK0A 1S9EA 2P5OA 4JV5K 3O08A 3T1AA 2IOCA 3QEVA 3I8BA 3LDNA 1IKWA 1RTDA 2G8KA 3MN6A 1Q9XA 3VF2A 2F96A 4E7HA 5AJ3K 1TKXA 2R7YA 3L2VA 2XY6A 3ID8A 3NGYA 3DLEA 4JK7A 3ZSOA 4CJEA 3LP1A 2XY5A 1NKEA 4BRNA 1EXQA 3DLLL 3NHGA 4DMNA 4OO1J 3ULEB 3M8SA 1L5UA 4OVLA 4WQ4C 3B6PA 1NK6A 3KK1A 1BOTO 4NXMK 5LMNK 2A1SA 3THXB 1WNSA 4B8CA 4OX9K 2ZJQL 4KV8A 4DR2K 3LM9A 1SV5A 1BISA 1VK0A 4MDAA 3K9KA 1LW2A 2NRHA 2FBVA 1TKDA 4FCYA 3ULDA 3O4WA 1WOQA 5M1PA 3VA3A 4C8MA 1Z26A 1XC9A 4FLUA 1WSIA 4BG8A 4YOWA 2DFFA 3AAQA 1MWKA 2ZF5O 4JYAK 1SL1A 5JS1A 2HNYA 3WNHA 4CF0A 3MXMA 3ENOA 3HP6A 1VQPN 3RRHA 2HHTA 4H0VB 3LAMA 3OS0A 5AQMA 4DSJA 2ZQBA 3WUHA 3IDHA 4DS5A 5E41A 1N8RO 3QIPA 3G0ZA 4Z4GA 1VSJA 3V9WA 2D0BA 4I2QA 4H0PA 4A5AA 3PIOL 4M3ZA 3VEWA 3DMJA 2A42A 4CW7B 1NGCA 5AFUA 3HSCA 2O8CA 2QA4N 1HYSA 3E9PA 4CCHA 4XH5A 1YVUA 2NNWA 4FLWA 1TUYA 4MQ3A 4J2EA 4PL8A 4KPYA 1W2BM 1SKWA 4PWDA 3I56N 1QSYA 3K2PA 1J54A 4NLCA 4XEIA 1WAFA 5MLCQ 3FR0A 2YNHA 1JLBA 2XRIA 3V1OA 1SL0A 1HR0K 3ENHA 1C0MA 3L2UA 3V1QA 4DQQA 3K5MA 4YDUC 3BY5A 2HF4A 3SUPA 3EL2A 3OJSA 3PX0A 1RDCA 4ZHRA 4B9VA 3SPZA 3CETA 1QSLA 1M1KO 4O5BA 5F2RA 3CM6A 2QXLA 3SQ4A 4JHDB 1TVRA 4CERA 3J80O 2F8TA 1HNZK 3HTVA 2PYLA 4FK0A 2JWKA 2A1RA 3OY9A 1HQEA 3ZSYA 4FPAA 3OYHA 1S1WA 1BA0A 4KREA 3M8RA 4CGIA 4AHUA 2V7YA 1LAVA 3CPWM 4BE2A 3LDLA 3SYZA 3OHRA 4CZLA 1VSDA 1UOCA 2J4RA 4CBXA 2KFZA 1B9DA 4FLZA 3O9QA 4EIAA 1U2VB 5C2FA 3CPEA 4C8KA 1XI1A 3CC7N 3RTVA 4G9ZA 1HLUA 1ZBSA 4FWNA 3MEEA 3DXMB 4DTOA 4BG9A 5AQSA 4FW2A 4I6MB 2FBYA 3I0SA 3KKRA 3O3FA 1NJYA 5JMVA 3TI0A 1NK9A 5JICA 1T03A 4RW7A 5EX5A 2A40A 1GLJO 1U49A 2P9UB 2E5LK 3VEVA 1A5VA 5FRMA 2ETJA 4FSVA 1BUPA 3TARA 4MLHA 1TV6A 5JLHA 5AQNA 2YKMA 3FZFA 3RMAA 3E9OA 4WQ5A 3EE9A 1YAGA 5E26A 4LFCK 1L3UA 3NCIA 1QQMA 3WQTA 3L6QA 3HOSA 3LZIA 5AZJB 3K57A 1N36K 4AILC 4AQYK 3TSUA 1VSFA 4CEQA 4K41A 3F2KA 3O9UA 1S6QA 2YNFA 5LL6Z 1KD1O 1RT2A 4BR0A 1ZYQA 4B3SK 4HVJA 4BR7A 3CCJN 4KBOA 1BHLA 3NVMA 2YHWA 1TUUA 2Y1JA 1GLAG 4KO0A 5D3GA 3FE1A 3AO2A 4BROA 4DU4A 5FPMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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