3QBWA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to adenosine diphosphate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
347
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFSRAVLNIGGFSNVSLLRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 111
structure length 347
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbwA01
3EL2A 4K42A 4PKIA 2IVOA 3BP8A 3WT0A 5AQMA 1DGKN 2V51B 1BA0A 2WUSA 2ITMA 3RSEA 3CJ7A 2VCPA 3WXIA 4IJAA 5JICA 4BRHA 2A3ZA 3SMSA 1HKBA 3LDQA 4MLHA 3A5MC 5JLHA 1BUPA 2ASPA 4RWTA 1HJOA 2P9UA 3ZX2A 3O8MA 4H5RA 5AQXA 1EQYA 2A5XA 3LM9A 3VETA 3DWLA 5FPMA 4ISFA 5AZIB 5BRHA 1NBWA 4K43A 3MN5A 3HM8A 4BROA 4JHDA 3ZX0A 3ENHA 5AQVA 4BGBA 5ADXA 3R6MA 4NB4A 4JN4A 5AQGA 1E4GT 1NGDA 3BUZB 2E20A 4J8FA 1KAYA 4O8KA 1ZC6A 1U2VB 5E84A 2CGLA 4K25A 3O1WA 1BWFO 1ZXOA 3ZEUA 1BOTO 2GELA 2FSJA 3CQYA 5BPNA 1KXPA 2J4RA 1HUXA 1U6ZA 2FLOA 3DJCA 3O5BA 3EKUA 4A61A 4BR9A 5BRFA 3O08A 3HI0A 2YCHA 3WQUA 3DXKA 3I33A 1IG8A 4B1VA 5KPTA 3FZKA 4BRMA 3MCPA 3HZ6A 3ENOA 3LDOA 4ISGA 1GLLO 4KBOA 1X3MA 5KPZA 4FOIA 2NZTA 3ATUA 4BG9A 3RSEB 1GLDG 4BRPA 1YVNA 3QDKA 5AQZA 4XH4A 2YHYA 1ATSA 2AA4A 4BR4A 4BRFA 3WXKA 2P9SB 4FWNA 4CZEA 1T6DA 3FZHA 5AQQA 4M7YA 4BC4A 5JMVA 3D2EA 3H6EA 4B1UB 3VESA 2P9UB 5F1XA 1NGCA 5AQTA 2FSKA 2GWKA 2Q2RA 3CJBA 3WEEA 2QWQA 3AY9A 2P9IB 2CH6A 1NLVA 4JHDB 5KQDA 4BGAA 3LL3A 4FO0A 4DCHA 4BRAA 3GE1A 4FWOA 4CZGA 5AQIA 4IXCA 5AZIA 1BO5O 1GLFO 2CGJA 2OANA 3G25A 3D2FA 1LOTB 3M1FA 3SMPA 4DQ8A 3ID8A 2FF6A 1MWKA 2VYPA 5BPLA 3L0QA 4FL9A 3ZEUB 3DAWA 3LDLA 2E2PA 2QWLA 1XUPO 2KHOA 1TUUA 1QQNA 5AQWA 1X3NA 3KZBA 2DPNA 3A5NC 5LY3A 4EHUA 4QS9A 4WQ5A 2V7ZA 1Z05A 4WQ5C 4H5NA 5LJVA 2IVNA 3QICA 5JLFA 3WQTA 5AQHA 2E8AA 4QS7A 1TYQB 1RGIA 4CZJA 2I7NA 3D2EB 5EVZA 1CZAN 4DHYA 4CBXA 1QQMA 2F9WA 3AAPA 2ASMA 3EZWA 2Q36A 5ADXH 5CE3A 5F0XA 1BDGA 4BRCA 4CZMA 2D0OA 2NLXA 4MO4A 2P9SA 3WEEB 4M7XA 2A41A 1DKGD 2ZF5O 1S22A 1OKJA 1NGJA 3D2FB 4GY2B 4H5WA 1ESVA 3WXJA 1QZ5A 2P9IA 3CIPA 2Q97A 2FF3B 4E1JA 1C0GA 4CZFA 5KPRA 3IMXA 4BC2A 3QBXA 1RDWX 2YJEA 1JCGA 5KQ8A 2CH5A 2I7PA 2D1KA 1E4FT 3VEVA 1Q18A 5LJWA 5AQYA 3WUHA 2IIRA 1GLEG 2YJFA 4I6MA 3ZX3A 2PBDA 2QWRA 3A0IX 4CZKA 3CHWA 3H3NO 3DXMA 3H3OB 3FFKB 4Z94A 1DEJA 2A6AA 1NGEA 2E2NA 4B1XB 4BRNA 5AQOA 1MDUB 4HTLA 4RTFD 4A2BA 1ATRA 2AP1A 5EY4A 3VEOA 4BRDA 4H5VA 4FWLA 1NMDA 3F9MA 5AQJA 1K8KA 3LDNA 4BVOA 3BEXA 5AQPA 1TYQA 5BN9A 4IWVA 4B1ZA 3H46O 4BC3A 3W0LA 3BF3A 1SQKA 3QB0A 3HTVA 3MK6A 4C23A 3VPZA 3FE1A 3L6QA 4HWIA 1GLCG 4H03B 2P9NA 3H1QA 5EXWA 1HX1A 5AQFA 3VF2A 2HOEA 3GL1A 1SAZA 1NM1A 4CJ7A 2QM1A 3B8AX 3LM2A 1YAGA 2QWMA 3L4IA 3W3DA 3CETA 1NGFA 4H0PA 4A2AA 2GWJA 4B1WB 4I6MB 2W41A 2QW9A 3CJ1A 3EKSA 4YDUA 3DXMB 3HSCA 4FWQA 1T6CA 4YDUC 3CERA 3U8XA 4K41A 4FOEA 3S41A 4FWSA 4M63C 3O80A 1S3XA 3HBTA 1QZ6A 3MMVA 1NGAA 2GEMA 4PKHA 3UKUA 4NO7A 3FZMA 4FPAA 2CGKA 1K8KB 1NGGA 3R8EA 1V4SA 3KHYA 1H1VA 3O1BA 5I9EB 1SZ2A 1WUAA 4BRLA 4XH5A 1NGHA 4BREA 5TKYA 2V7YA 4GNIA 1Z6RA 1JCFA 1HKCA 3O4WA 5FPNA 3FZLA 4PKGA 4WYBA 5BRDA 1V4TA 4CI6A 4BRKA 3ZETB 3OHRA 1HKGA 1J6ZA 4JNEA 1D4XA 4H0OA 1GLJO 4FWMA 1QHAA 3VEZA 3H1VX 3U4LA 4JD2A 5BN8A 2P9NB 4O5FA 4XH1A 2P9KA 4CZHA 4CD3A 3LDPA 4BR2A 2FSNA 2GUPA 2QXLA 1KAXA 1YUWA 3WXLA 4MO5A 1GLAG 1QQOA 5AQSA 3UB5A 4WQ4A 4FWKA 1YXQA 2YHWA 4FWPA 1KAZA 3IDHA 3QMLA 4WQ4C 2EWSA 2IVPA 3JXUA 2VWBA 4AM7A 3U9ZA 2ZWHA 3A5LC 3C7NB 4H0TB 3VGKA 5AFUA 1T44A 4BRQA 4EAHD 4JAXA 5F2RA 2Q0UA 3GDQA 4BRGA 3AARA 3VEXA 3VF6A 4AM6A 4BG8A 3CJCA 2Q0RA 2ASOA 3EN9A 4EHTA 3QFUA 2NRHA 4L3QA 3ULEA 2Q31A 1IJJA 2QWPA 3UKUB 4FWRA 1ZBSA 2E1ZA 1XQSC 3I8BA 3VOVA 2P9LB 3VENA 3FZFA 4BQLA 1NGIA 4CD1A 5FPDA 3VEWA 5AZJB 1BG3A 1JCEA 4ISEA 3EO3A 3UKRA 4CZLA 3VF4A 5BPMA 5BREA 3GG4A 4PL8A 5AQNA 3A8YA 3KVGA 2Q1NA 1R59O 3FLCO 3SK3A 3TPQA 3CJAA 3U9DA 4EFHA 1MA9B 3MN9A 3QBWA 3CJ9A 4QS8A 1TUYA 2QWNA 2P9PA 1LCUA 4JD2B 5FPEA 5E26A 3A5OC 4FPBA 3CI5A 2V52B 4MLEA 1Y64A 2P9KB 3ZETA 5EX5A 4H0VB 3MN6A 4RCHA 4CBUA 4BC5A 4PL7A 3AAQA 3R9PA 3GBTA 4BVPA 5AR0A 3IFRA 2ZGZA 4B9QA 1NGBA 4FSVA 1HPMA 4H5TA 2D4WA 2HF4A 3CQXA 2D0PA 4F9OA 3M3ZA 2GTDA 3C0BA 4BRIA 3P4IA 2F9TA 2E1YA 3VEYA 3ATVA 4BR5A 2BTFA 3MN7A 3VGMA 3IUCA 3SJHA 3UE5A 3GOIA 4XEIA 3ULEB 4DB3A 1G99A 3C7NA 1NWKA 4BQZA 2PAVA 2FXUA 1XC3A 5AQKA 2ZGYA 1X9JA 2A42A 3H45C 1P8ZA 1C0FA 5AQUA 5AQRA 3M6GA 5AQLA 2W40A 3UKRB 2E2OA 1HLUA 1MWMA 3QFPA 3TU5A 2P9LA 3VERA 2H3GX 2YI1A 1RFQA 2UYTA 4IZ9A 5ELZA 5EOYA 1GLBG 4CBWA 4LC9B 5BR9A 4B1YB 4A62A 5AZJA 5B8HA 2P9PB 4CZIA 3O6WA 3BF1A 2E88A 2A40A 3JS6A 1U2VA 3D7EO 1WOQA 3DXKB 3MDQA 2QWOA 3FGUA 2HMPA 3VGLA 3FR0A 4IO8A 1BA1A 4H0YB 3SLCA 5AFUH 2BUPA 4EIAA 1ATNA 4Y0WA 2YHXA 1BU6O 4IJNA 2HF3A 4BR7A 4BR0A 3J8AA 2E2QA 4H0XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ITGA 5AQMA 1L3TA 3KK2A 2AJQA 1W7AA 2VCPA 5JICA 4DR1K 4NCGA 4DR4K 2A3ZA 3L8BA 1NKCA 1NOYA 3A5MC 4JKHA 4U7BA 2P51A 3E9PA 4FLZA 4A5BA 4DTOA 2ASPA 3ZX2A 3LM9A 3VETA 3DWLA 5J2QA 3QEWA 4ISFA 5AZIB 2YNFA 3MN5A 4C1NI 4M3YA 4KTQA 3SJJA 4BGBA 3R6MA 4KH6A 3ZSRA 4LSNA 4J8FA 3SZ2A 5E84A 1U2VB 4M41A 2CGLA 3KLGA 4K25A 1KCFA 3VQ7A 1QE1A 1SKSA 2D0CA 1ZXOA 1VQON 4FM0A 4LF7K 4O0IA 2QEXN 2FLOA 1VSLA 4BR9A 1NJXA 3RRGA 2E6MA 3NH0A 3HI0A 4MFBA 2YCHA 1KFSA 3I33A 1JXBA 1IG8A 2O8DB 3PIPL 1VSHA 3AGKA 2HBMA 1NKBA 3V4IA 3MX2A 4KBOA 1X3MA 3D6RA 1LWCA 3ATUA 4KPYA 4E3SA 1VQ5N 1T3VA 4NCAA 1HJRA 1Q9YA 5CYQA 4CZEA 4BC4A 3FZHA 3TTFA 3NGIA 4B1UB 2A1RA 1YVUA 4JKAA 4KKOA 4DR3K 2LSNA 1NGCA 5AQTA 2Q2RA 2W6LA 3CC4N 4IDKA 3DLGA 2D0AA 2O8BB 4O8UA 1OH7A 4KTZA 4E7LA 1HQEA 3OVNA 4IXCA 1GLFO 2QK9A 2CGJA 2OANA 3SMPA 3OYFA 3HOTA 2YHBA 3S3NA 4B8CA 3SBGA 3ZEUB 2NRZA 4ID1A 1YHQN 3BY5A 3L2RA 3SUQA 4BWMA 1TUUA 3U3YA 1LWFA 3KZBA 2DPNA 1EO1A 4GV6A 3MECA 4DMNA 1C1BA 3LAKA 4DTRA 4H5NA 4B3TK 2IVNA 3P39A 2YKNA 5JLFA 1Q81O 3WQTA 4QS7A 1TYQB 1RGIA 4DQPA 4M3XA 2OZSA 1RDDA 3DRSA 4CE9A 3PIOL 2I7NA 3D2EB 4ELTA 3P5JA 1VSEA 4WFAL 2F9WA 3EZWA 1K6YA 2Q36A 5CE3A 4R5PA 4BRCA 4B9VA 4WFNL 2NLXA 4RW8A 4MO4A 2HHWA 3NGYA 4M3TA 1VSFA 1OVYA 4M7XA 4LSLA 2ZF5O 3THWA 3LWLA 4CJSA 4B3SK 2XY5A 1QZ5A 3CIPA 2Q97A 4K8ZA 5KPRA 3G4SN 2BH1A 5KQ8A 4JI7K 2HBKA 1XC9A 1E4FT 3VEVA 2HMIA 5AQYA 3HT3A 1N36K 4GV9A 3QESA 3T7ZA 3O3FA 3ZX3A 4JI8K 3HPOA 3DXMA 1D9FA 2HNZA 2IGIA 4Z94A 1N8RO 1QVGM 2E2NA 4BRNA 3AO3A 4DS5A 4HTLA 1EX4A 1VQ6N 4LF5K 3AVFA 2EHGA 3LZIA 5FDLA 3F9MA 3CC2N 4BVOA 3NFAA 4CJEA 4BE1A 4CIGA 4DQSA 3ITHA 3BEXA 2O4IA 4Z0UA 1WAFA 5BN9A 1QHTA 4B1ZA 3MXMA 4CF2A 4E19A 3CM5A 1J53A 4Z4IA 3ZSZA 2G8UA 4I9QA 1JLFA 5DK5A 5EU7A 4C23A 2OPQA 4E0DA 1ZBUA 3NVKA 3PSFA 3EE9A 3RWUA 1KLNA 3F9KA 3AO2A 1OH8A 4DLGA 3MWTA 5AQFA 2HOEA 4CHOA 4ICLA 1RT1A 4W5TA 1SKRA 1Z25A 3L2UA 1WSEA 2O8CA 1NGFA 4MDBA 2GWJA 4CJVA 1GOAA 2QW9A 3KJVA 1VQNN 2UXDK 3I56N 4CIEA 4DV0K 1C0TA 4JKEA 4FW1A 5HLFA 4M63C 4M3ZA 3E9LA 3OW2M 1QZ6A 4FLVA 4Q5VA 2GEMA 3WNHA 2IS3A 3KK7A 1H1VA 4BRLA 4PWDA 2WFBA 5JS1A 5TKYA 2V7YA 4GNIA 1JCFA 1JL1A 4IFVA 4W5QA 3FZLA 5BRDA 3L2QA 3VA3A 5JVGL 4CERA 4KRFA 4YY3K 3ZETB 1SL2A 1EP4A 4JNEA 3V1QA 1D4XA 2KTQA 4UY8O 3H1VX 4DV5K 3HOSA 1N5YA 3ISNC 1UA1A 5BN8A 1JKHA 4GMJB 4FJLA 1S9GA 1TL1A 3UIQA 3NMUA 4CZHA 4CGFA 3T3FA 2FSNA 2QXLA 1KAXA 4DSLA 5D3GA 1IH7A 3UB5A 1S6QA 2YHWA 4FWPA 4RW4A 4RW9A 3C65A 4CJ5A 4CJKA 3KKSA 3ZYYX 1KC8O 2EWSA 3KWIA 3JXUA 2VWBA 4AM7A 3CF5L 1YF5L 3C7NB 2NRTA 4H0TB 3P38A 1FXXA 4EAHD 4CF8A 1EKEA 2PFUA 1JL2A 3U6FA 5HP1A 3DLKA 4CF9A 1XMOK 2HW3A 3G6EN 3CCQN 1X1PA 3NBPA 4ID5A 4E1NA 4FLWA 1IJJA 4HUEA 1C0UA 4FJNA 3THXB 4FW2A 2G8HA 4N41A 1WSJA 3VEWA 3K59A 4WF9L 4N76A 4ISEA 3EO3A 3UKRA 4KV8A 3GG4A 4PL8A 3TAMA 3KVGA 4PQUA 3VTHA 3U9DA 1MA9B 4ZTFA 3HVTA 2NRRA 2X6SA 2OTJN 3M8PA 4DU4A 3K9KA 4FPBA 3CI5A 4FCYA 1NJIO 2NNWA 4EZ9A 4MLEA 1Y64A 2P9KB 4IEIA 3MN6A 4CGGA 4KHNA 3NF7A 5JVHL 5A2QO 3D45A 3K5OA 4JKGA 2Z1IA 4OPJA 4YOUA 3IFRA 4B9QA 4H5TA 1S1UA 2HF4A 4KI4A 4IFEA 1L3VA 3M3ZA 2GTDA 3C0BA 3E9OA 1TK0A 3VGMA 4KHSA 1W0HA 1KQSM 4H8KA 3DRPA 3OTOK 3K9JA 4Y1DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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