3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
2P9IA 1YVNA 3CIPA 3UKUB 3VETA 4QS7A 2GTDA 2GWKA 3WQUA 4PKIA 2YI1A 5CE3A 3QBXA 4B1XB 5B8HA 1HUXA 3O08A 5AQJA 4FOEA 1HJOA 4BREA 3GDQA 3MK6A 5AZIA 3DXKB 2P9KA 3FE1A 3DWLA 5BPLA 1E4FT 2YCHA 4QS9A 3I8BA 3H3OB 2ZGYA 4O8KA 2V7ZA 4WQ5C 5AZJB 4BRLA 1GLLO 4CZFA 4PL8A 5BPNA 5AQKA 2OANA 1C0GA 3KZBA 4FSVA 5EOYA 2GELA 3VGMA 3U9ZA 2QWNA 4CD3A 1QZ6A 2W41A 2QWOA 4RTFD 3ZEUB 1GLEG 3SMSA 3J8AA 3HBTA 1RDWX 3QBWA 5AQWA 2BTFA 3VGLA 4RCHA 1HLUA 4ISFA 4JHDA 2CH6A 5FPDA 3CHWA 3M1FA 3EZWA 2FSJA 3MN9A 1QQOA 2GEMA 5AR0A 3UB5A 2D0OA 3BF1A 4BVPA 4BR2A 4A61A 5FPEA 4FWQA 5AQVA 3WXLA 4YDUA 4AM6A 3FGUA 4H0YB 3WXIA 5TKYA 1RGIA 3BP8A 4FWSA 3C7NB 4BGBA 1HKCA 2ZWHA 2QM1A 5KPTA 1MWKA 4CZGA 3JXUA 4RWTA 1BU6O 3HM8A 4BG9A 4H5TA 4IJNA 4BRFA 4B1ZA 4CZKA 4BC2A 2GWJA 3P4IA 3FZKA 4FOIA 3KHYA 4CBUA 2VYPA 3UE5A 2CGLA 3EL2A 3L0QA 3MN5A 3VEVA 3VOVA 2BUPA 1X3MA 3CJ7A 1KAYA 3MN7A 1NM1A 3WQTA 3WEEB 1SAZA 2E20A 3D2EB 1TYQB 3VEXA 3VF4A 5KQDA 5ELZA 4H0VB 4LC9B 5BN8A 2P9UB 4H5RA 1ATNA 3GG4A 1YUWA 3UKUA 1BO5O 1U6ZA 3ZETB 3VPZA 4BVOA 4CZJA 5JLHA 5F1XA 4DB3A 4FWNA 4BRDA 4FO0A 4CZHA 3O1BA 4WQ4A 5AQNA 1J6ZA 3GBTA 4JD2B 3VEYA 5ADXA 2KHOA 2V52B 3GE1A 4GNIA 1MDUB 1S22A 1CZAN 3LDPA 3QICA 1V4SA 3H6EA 3O1WA 3DXMB 1HX1A 3ENHA 1ZXOA 3KVGA 1S3XA 4MLHA 1ATRA 3D7EO 4KBOA 1HKBA 3A5LC 1NGHA 1QQNA 3OHRA 2QW9A 3IUCA 2IVNA 3LDLA 4CZIA 1LCUA 2Q0RA 3A5NC 3MMVA 3H45C 1KXPA 4B9QA 4B1WB 2E1YA 2QWRA 3FZMA 1NWKA 3FZLA 3VERA 2P9NA 2ZF5O 3HSCA 3A5OC 3HTVA 2D4WA 5AQPA 2A5XA 3QFPA 2FF3B 1NGEA 4J8FA 1TUYA 4O5FA 2Q31A 4BG8A 4CJ7A 1G99A 3M6GA 1BUPA 5AQLA 1TUUA 2E2OA 2QWQA 1T6CA 2VCPA 4M63C 1NGDA 3H1VX 4GY2B 4Y0WA 1GLFO 3C7NA 2AA4A 2P9LA 2A3ZA 3ATVA 5AQOA 4YDUC 2FF6A 2H3GX 4K41A 2HOEA 2AP1A 4BRCA 4DCHA 4JAXA 3UKRB 1GLDG 2EWSA 3QB0A 2NRHA 5AQIA 1GLCG 3AAPA 4JN4A 4M7XA 3EKUA 3H1QA 4CBWA 2QXLA 4H5WA 3H3NO 4DQ8A 2A42A 1HKGA 1BDGA 4I6MA 2WUSA 1D4XA 4MLEA 3LM2A 1NLVA 5LY3A 3FR0A 1QHAA 3A5MC 1LOTB 3CJBA 1TYQA 3FZFA 3ATUA 3ULEA 3LL3A 5BR9A 2I7PA 5AQQA 1BWFO 5E26A 1T44A 4MO4A 4E1JA 2P9SB 3VEWA 4BRIA 1T6DA 1OKJA 5EVZA 4BC4A 1U2VB 4BRMA 2P9IB 4BGAA 3S41A 3BF3A 2P9PA 1BA1A 5EX5A 3SJHA 1V4TA 4BRKA 2CGJA 4HTLA 4WQ4C 2HF4A 2E2PA 1H1VA 4F9OA 4BRPA 4EHTA 3TPQA 1K8KA 4BRGA 4JNEA 3U4LA 1X9JA 2E8AA 4K42A 3DJCA 3VEZA 1WUAA 2E1ZA 4FWRA 2V7YA 3EO3A 3SMPA 1NMDA 1Q18A 1QZ5A 4EAHD 4BROA 2YJEA 2E2QA 5KQ8A 3ZX0A 2Q2RA 5AQFA 3MDQA 3FFKB 2FSKA 1BA0A 3FLCO 2CH5A 4PKGA 1HPMA 1SQKA 3SK3A 1YAGA 3CQYA 3WUHA 4B1UB 3DXKA 5KPZA 4JHDB 2ASMA 1ZC6A 4HWIA 4NB4A 2A40A 5FPNA 3H46O 5LJVA 1GLBG 1JCFA 1KAXA 3I33A 1NBWA 1NGGA 5JICA 3VESA 4IO8A 5AZJA 1JCEA 3WXKA 3CQXA 2I7NA 4K43A 5F2RA 3GOIA 5F0XA 3VF6A 5JLFA 4FWLA 4BR0A 3L6QA 3O4WA 2V51B 3ZEUA 1WOQA 2NLXA 3TU5A 1DEJA 4XH5A 1JCGA 1XQSC 4AM7A 1RFQA 3RSEB 1NGAA 4EHUA 2FXUA 4FWPA 4FWKA 1SZ2A 3R8EA 4BQZA 3QFUA 5EXWA 5AQXA 3AY9A 2F9TA 5AQYA 4PL7A 2FLOA 2QWMA 3AARA 3FZHA 4BC3A 1MA9B 3O5BA 4K25A 5BREA 5BRFA 4IJAA 4BR5A 3O6WA 3LDQA 4H0PA 4IZ9A 1DKGD 3SLCA 5AQZA 5BPMA 3D2FB 4BR7A 4DHYA 3WT0A 1R59O 5KPRA 3ZX3A 3JS6A 3CJ1A 5BN9A 2Q97A 3R6MA 4Z94A 2W40A 1X3NA 4BRNA 3M3ZA 4QS8A 4C23A 3LDOA 3O8MA 1ZBSA 2ITMA 4CZEA 4BR9A 2E2NA 1NGJA 2E88A 2YJFA 1IG8A 4NO7A 3R9PA 1E4GT 3ZX2A 2GUPA 3WEEA 1NGBA 4H0TB 3VF2A 3D2EA 3C0BA 4B1YB 5BRHA 3B8AX 4H0OA 2DPNA 1DGKN 2Q0UA 2UYTA 2YHYA 2P9UA 5AQHA 5AQGA 3DAWA 3VENA 3VEOA 3CJCA 4CZMA 2PAVA 4H5NA 3ZETA 1GLJO 2IVPA 5I9EB 4A62A 2P9NB 3BEXA 2QWPA 3MCPA 4BC5A 2D0PA 4JD2A 3QMLA 3AAQA 5AQMA 4XH4A 4L3QA 4BRAA 3DXMA 5AZIB 2Q36A 4H03B 2ASOA 3EKSA 1P8ZA 4CZLA 2P9KB 5LJWA 4H5VA 2IIRA 4BR4A 4WQ5A 4WYBA 4PKHA 4M7YA 2F9WA 4ISGA 3HZ6A 2P9LB 2ZGZA 1ESVA 1ATSA 5AQTA 1XUPO 3G25A 5AQRA 3W3DA 1MWMA 5ADXH 4MO5A 1BG3A 2QWLA 5E84A 5AQUA 3IDHA 3QDKA 3CETA 4FPBA 3U8XA 4CBXA 3WXJA 2ASPA 1QQMA 3RSEA 2YHXA 4B1VA 2HF3A 3CJ9A 3L4IA 1NGCA 3CI5A 4I6MB 4EFHA 4ISEA 3EN9A 3MN6A 3ENOA 5AFUH 3BUZB 1C0FA 1Z05A 2VWBA 4XEIA 4XH1A 3D2FA 3ULEB 4EIAA 3HI0A 3A8YA 4FL9A 4A2BA 3F9MA 3GL1A 1YXQA 3CERA 2A41A 3O80A 1KAZA 3UKRA 3VGKA 4BRHA 5FPMA 4CD1A 3IMXA 2P9PB 2YHWA 1GLAG 4FWOA 1BOTO 4A2AA 3LDNA 4IXCA 2CGKA 4BQLA 5BRDA 2A6AA 2FSNA 5AQSA 3IFRA 3LM9A 3CJAA 4FWMA 1K8KB 1NGFA 1Y64A 2HMPA 4IWVA 3U9DA 3A0IX 4CI6A 4H0XB 2NZTA 2Q1NA 3ID8A 4FPAA 2IVOA 1EQYA 4BRQA 1XC3A 5EY4A 5JMVA 5AFUA 2PBDA 1NGIA 1Z6RA 2P9SA 2D1KA 1IJJA 2J4RA 3W0LA 1U2VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P9IA 2QK9A 5CZ2A 2Z1GA 4N56A 4B9VA 4CJLA 2GTDA 4YOUA 4IBNA 3BDPA 5B8HA 1HUXA 1HQUA 2OA8A 5AZIA 4CGJA 3K5OA 3HO1A 4O5BA 3EE8A 3FE1A 5BPLA 1TKZA 5JS2A 4QS9A 3I8BA 4IDKA 4YORA 4MFBA 4K8XA 3AO5A 1RT4A 5FDLA 3OTOK 1LAVA 3RMDA 1WSJA 5CYMA 3U9ZA 2A1RA 3EYZA 1N33K 4CEQA 1TK5A 3ZEUB 3HBTA 3MXMA 2P5GA 1RT6A 3LALA 4JEPA 3U6FA 5AQWA 2BTFA 4O55A 3VGLA 3K5MA 5J2PA 4JHDA 3F5TA 5FPDA 3M1FA 3EZWA 3O3GA 4W5QA 5DM6L 4FLXA 3UB5A 3OYAA 4FCYA 4BVPA 3SUPA 3SAFA 2YNHA 4JI1K 3QINA 3NMUA 3BP8A 4FWSA 1CZ9A 2ZWHA 4CECA 1MWKA 3P39A 3DRPA 1BIZA 2XO7A 4IJNA 2HHSA 3TSUA 4RW8A 1E3MA 4O8UA 3KIOA 4CEZA 5H1SQ 1D9FA 3P4IA 4LSNA 3VN5A 4M3RA 4CBUA 3S3OA 3QESA 5JVGL 2O8BA 4NCBA 2D0CA 3CCSN 3WEEB 2E20A 4KH4A 4DMNA 1VQ5N 1OH7A 1KVAA 1RDUA 1ZBIA 5MLCQ 3LWMA 3SQ2A 1NK4A 2HBLA 2P9UB 1UA0A 2NRWA 4FZXC 1ATNA 3GG4A 4RW7A 4JRQA 1YHQN 1BO5O 3VPZA 5KGXA 4DV3K 4KHQA 4BVOA 1K73O 3VQDA 5F1XA 4WQ4A 1J6ZA 2HB5A 5ADXA 2KHOA 3ZSQA 2FBYA 1MDUB 3LDPA 3M8RA 4DTPA 2HBJA 3KVGA 4F3TA 4OLBA 1NGHA 1DTTA 3IUCA 2UUCK 3LDLA 2QKBA 4B9SA 2Q0RA 3M8PA 1KXPA 4B9QA 4GKJK 4ZTFA 5M1FA 1NWKA 3TTCA 2ZF5O 3ZT0A 1WNSA 3HTVA 3TTDA 5AQPA 3QFPA 2HNDA 2G8WA 4DF4A 3SJJA 2Q31A 3CFOA 4CJ7A 3HVRA 1KSPA 3M6GA 2G8IA 2E2OA 2QWQA 3C6TA 2ZJRL 4IFEA 2VCPA 4M63C 1NGDA 4Y0WA 1GLFO 4F3OA 4FZZA 2OPQA 1CZBA 4DCHA 3THVA 3UKRB 3V9ZA 2NRHA 1IG9A 1LW0A 4R79A 3CPEA 3H3NO 1HKGA 3JSMA 1L3TA 2F4VK 1RTHA 4AILC 2WC9A 4JKBA 3LM2A 1NLVA 4CESA 3FR0A 1RILA 3KWGA 1VSKA 5AQQA 4O0JA 3EY1A 3AVNA 4I9QA 1T44A 4E1JA 2X6SA 2P9SB 3CC4N 1UOCA 4FK2A 4YOXA 1Z26A 4H8KA 5EVZA 4KTQA 1U2VB 4BGAA 3E9LA 3S41A 4ZTJA 2O8CB 1V4TA 2XY6A 3AO2A 3DYAA 5CZ1A 5GIPA 1H1VA 4BRPA 4Z0UA 3OYDA 2VG7A 5CY4A 4C8NA 1YT3A 3QETA 4JNEA 2UUAK 2E8AA 4X65K 4BDYA 1ASWA 3THYA 1RTJA 3VEZA 4FJ9A 4IFVA 3G4SN 4JRPA 2Z1JA 1NMDA 1C1AA 2YNGA 1L3UA 3S3MA 1NKEA 2YJEA 2E2QA 5M1PA 4DTNA 2YHAA 5AQFA 4Z4GA 3LP2A 5FLXO 4J2BA 2Y1IA 2CH5A 1Q9XA 1HPMA 2BH1A 1SQKA 1VSJA 4JKAA 3O9RA 3AGRA 4M42A 4OKEA 3NHGA 4FYDA 4NB4A 5FPNA 1T05A 4UY8O 3VQ9A 4JLHA 1GLBG 3P83D 2D0AA 1KAXA 3I33A 1M90O 1NGGA 4IO8A 1W2BM 5AZJA 3SAHA 4EP4A 3DRRA 2X6NA 3GOIA 1Y97A 5F0XA 5HOOA 2Q3SA 4YOVA 5JLFA 4FWLA 1R0AA 1RTDA 3O4WA 2V51B 4M45A 3VQQA 2WBNA 4CEEA 3TU5A 3HYFA 1DEJA 3MCAB 4E7HA 3T19A 4PA1A 4FWPA 3RMCA 5EXWA 4PL7A 5AQYA 2FLOA 3AARA 4HTUA 4WFBL 3VA0A 1S1TA 4CEDA 2HSTA 4H0PA 4N76A 5AQZA 3OYJA 1JJ2M 2P1JA 2O8FB 4L8RB 4NXNK 3DLRA 3ZX3A 3ZT2A 3RRGA 3NGZA 1NJZA 2YNIA 2HW3A 3R6MA 2W40A 3QEXA 1NKCA 3PX0A 3M3ZA 4C23A 4AH9A 3AVHA 4N47A 3TAMA 2YJFA 3R9PA 3CCJN 3ZSWA 5BRHA 1Z25A 3B8AX 1M1KO 1IV0A 3VTHA 1NJXA 2IDOA 4GMJB 4BDZA 3DAWA 3RMAA 1TK8A 4CF8A 3NH2A 4FK4A 3VQ4A 3ZETA 4YOYA 3I0RA 3NF6A 4DFKA 4M3UA 4Y1CA 1JLCA 3MECA 2P9NB 3AA4A 4IFYA 1NG9A 2D0PA 3R1XA 1ASUA 4CJFA 4BRAA 2NUBA 4E7LA 4AHTA 3EKSA 1NK6A 1P8ZA 5DM7L 1HNIA 4XIUA 4BR4A 3MXJA 1S6QA 4PKHA 4M7YA 4ISGA 4G9ZA 4QAGA 2P9LB 1WAJA 4DQRA 1U04A 3NVMA 2OPRA 1JLGA 1XUPO 3P38A 1NNEA 5HL7L 3W3DA 1MWMA 5AQUA 4OPJA 2HHUA 3QDKA 3CETA 4FPBA 4EZ9A 4LF6K 4LF8K 4DR5K 4B1VA 1XMQK 3LDSA 3L4IA 1NGCA 5M1KA 4ISEA 3EN9A 4WFAL 2O8DB 2YX6A 3DRSA 4XEIA 4MDAA 3E9OA 4MQ3A 3OYLA 1XWLA 4JKGA 1QVGM 4A2BA 2XRIA 2QKKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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