3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
3UKUA 3WEEA 2P9LB 3VEZA 3O6WA 3UE5A 1Z6RA 3VF2A 4BREA 2V7ZA 1KAYA 4FWLA 2QW9A 5JICA 5AQQA 2NZTA 2QM1A 3TPQA 1D4XA 1JCFA 5JLFA 3I33A 3ZETB 4B1ZA 3VGMA 2GELA 1DKGD 1HKGA 3SMSA 5ADXH 3VEOA 4CZFA 4CD1A 1NGGA 2V7YA 4WQ4A 3FGUA 3FZLA 3VETA 2YI1A 4HWIA 1OKJA 4CZMA 5JMVA 1NGCA 4IJNA 4M63C 3U4LA 3QMLA 1X9JA 5AQJA 3GL1A 4BQLA 4BR5A 4FWMA 2A6AA 1ATSA 4BG9A 2HF3A 1BA0A 4K41A 3HZ6A 5AQIA 2YCHA 4K43A 2OANA 3WXJA 2E8AA 2V52B 3MN6A 2Q1NA 3CJCA 3EZWA 4CZHA 4HTLA 3VEVA 3EO3A 4BC5A 2QWMA 1U2VA 1V4TA 3ATVA 3L6QA 5E84A 4BR9A 4K42A 5KPRA 1MA9B 1NGFA 2W40A 3DJCA 3ZEUA 4CBWA 3CJ9A 3WUHA 3H3OB 5JLHA 1Z05A 1QQMA 2Q31A 2YHYA 1KXPA 3TU5A 4BGAA 3C0BA 2GTDA 3P4IA 3LDOA 1LOTB 1NGDA 2P9NA 3BUZB 5I9EB 1BDGA 3QFPA 4BR2A 3VGLA 1QZ5A 4B1VA 5BRDA 3M3ZA 4BRKA 5AQUA 4QS7A 2BUPA 3ZX0A 4BG8A 3SMPA 1RGIA 3U9DA 1X3NA 1QQNA 1BO5O 1QHAA 4FWQA 4FWKA 3R9PA 4FWSA 4JHDA 4CZKA 1BU6O 3F9MA 3DAWA 4BRAA 4BRCA 3QFUA 4CI6A 3BF1A 4CBXA 3WXLA 1XUPO 3HI0A 2A3ZA 4YDUA 1HKCA 1BG3A 4A2AA 3FZKA 3CJ1A 1TYQA 4MLEA 3WQTA 5EOYA 2FLOA 3BEXA 3BF3A 2GWKA 3UKRA 3VF4A 2YJFA 3I8BA 2QWPA 4H0PA 3OHRA 4H0XB 3FR0A 5AQTA 3H3NO 2P9PA 4RCHA 3BP8A 4BRPA 1GLFO 2P9UB 3LM9A 3FZHA 4BVOA 4CZLA 5AQPA 3O1BA 4H5RA 3HTVA 5AZJB 1V4SA 4K25A 5TKYA 1Y64A 4B1WB 3U9ZA 1NGBA 3CQYA 2NLXA 3H46O 1G99A 1U6ZA 3EL2A 4BR0A 5ADXA 4BRDA 3FZMA 2E2NA 1BWFO 2Q97A 1LCUA 4BRMA 4EHTA 4WQ5A 3QBWA 1HUXA 4Z94A 3MMVA 1C0GA 4CZGA 2CGJA 4FWPA 3AARA 4I6MA 2W41A 2IIRA 4XEIA 2I7PA 5B8HA 3C7NA 1X3MA 4BRGA 4BVPA 2HMPA 1P8ZA 4BRNA 3VEWA 4BRIA 4XH5A 4CZJA 5FPNA 4JD2B 3A5LC 4DCHA 2ASPA 2WUSA 3WXKA 4B1XB 1NGIA 4EHUA 3R6MA 4GY2B 5BRHA 5F0XA 4PL8A 4QS8A 5AQFA 2D1KA 3WQUA 4DQ8A 5LJWA 4BC4A 4JAXA 4JNEA 4F9OA 2P9KA 4A61A 4B1YB 3CJBA 3HSCA 1T6CA 1KAZA 5CE3A 4FOIA 3H45C 5AFUH 4FSVA 3CQXA 1YUWA 4O5FA 2FF6A 5AQVA 1CZAN 2YHWA 2AP1A 4CJ7A 2BTFA 1NGHA 1T6DA 3FLCO 4M7XA 1JCGA 5BREA 1RDWX 1SAZA 1GLJO 4FWNA 4BRFA 2Q36A 2ITMA 4IXCA 3CHWA 1YAGA 3A8YA 1NMDA 5AZIA 4A62A 3HM8A 3QICA 4AM7A 3VF6A 5F1XA 3AAQA 3D2FA 4MLHA 1RFQA 4CZIA 2E1YA 4H03B 1K8KA 3FE1A 4BRLA 3QDKA 3RSEA 3LDQA 3MK6A 4H0OA 4IO8A 1EQYA 3L4IA 1BUPA 4B9QA 2E2PA 2D0PA 4BQZA 5AR0A 4WQ4C 5E26A 3JS6A 3D7EO 3WT0A 1DEJA 2CGKA 2IVPA 2E88A 2A40A 1NM1A 1WUAA 2V51B 1KAXA 3O4WA 2P9SB 3M6GA 1TUUA 4J8FA 5KQDA 2A41A 3ULEB 1BOTO 5BR9A 4CD3A 1GLAG 5BRFA 3A5NC 5BN9A 4ISGA 2P9LA 4E1JA 4DB3A 4FWOA 3O5BA 3J8AA 4BRQA 2CH5A 4IZ9A 4RTFD 4H5TA 3MN9A 2VWBA 2J4RA 3B8AX 3ZETA 1ZBSA 2EWSA 5AZJA 4JN4A 4C23A 2KHOA 4FOEA 4IWVA 2YJEA 5BPNA 2H3GX 1DGKN 1E4FT 3CERA 3VEXA 3MCPA 2PAVA 2QWOA 4ISFA 4O8KA 2CGLA 1H1VA 1NGEA 2FXUA 3GG4A 5ELZA 5AQWA 3S41A 5BN8A 1S22A 3HBTA 3CI5A 3LDNA 5F2RA 3DXMB 1E4GT 4I6MB 3AAPA 4BR4A 2P9IB 3DXKB 3O08A 5EVZA 2ZGYA 1MWKA 4B1UB 4NO7A 4CZEA 3C7NB 5KPTA 4H5WA 1J6ZA 3H6EA 4JD2A 2P9NB 5AQYA 3ENOA 4BRHA 3CJ7A 4YDUC 4NB4A 3A0IX 5AQNA 4BROA 3IUCA 2I7NA 4FWRA 1U2VB 4PKHA 3ZX3A 3U8XA 3FZFA 3GDQA 3ZEUB 2ZF5O 1TUYA 2P9KB 1S3XA 4FO0A 3W3DA 4L3QA 5FPMA 4AM6A 4IJAA 2QXLA 1JCEA 4JHDB 4DHYA 2IVOA 3A5MC 3JXUA 4H5NA 4RWTA 5EXWA 4ISEA 4EIAA 3QBXA 2HOEA 1WOQA 4PKIA 1HJOA 2GEMA 1YXQA 3D2EB 3SJHA 4WYBA 4XH1A 1IG8A 3VEYA 4KBOA 1ATRA 4H0TB 3MN7A 3L0QA 1XC3A 1ZC6A 4M7YA 3UKUB 3UKRB 5AQOA 3GOIA 3WEEB 4PL7A 5BPLA 2A5XA 4H0VB 4FL9A 3MN5A 3GE1A 4H0YB 2NRHA 1Q18A 3A5OC 5AQMA 3D2FB 1R59O 4BC2A 2CH6A 2UYTA 1ATNA 3FFKB 3VESA 3IFRA 2F9TA 3LL3A 3SLCA 5AQHA 4QS9A 5AQGA 1TYQB 3O1WA 3UB5A 3VERA 4A2BA 1HPMA 3DWLA 2QWLA 5AQRA 4MO5A 1GLBG 4CBUA 2P9SA 3SK3A 2E2QA 2ASMA 2P9PB 3LDPA 2P9UA 3H1VX 3EN9A 5AFUA 2ZGZA 3VOVA 1SQKA 3CJAA 3ULEA 1NLVA 4MO4A 4Y0WA 4H5VA 2ASOA 3VENA 4EAHD 1XQSC 5EY4A 3ATUA 2F9WA 2YHXA 4XH4A 3ZX2A 2D0OA 2FSJA 3G25A 4FPBA 1BA1A 1HLUA 2E1ZA 4BR7A 3ID8A 3KVGA 4LC9B 3VGKA 4BC3A 2PBDA 4FPAA 5LY3A 4PKGA 2FSNA 3LM2A 3W0LA 3CIPA 2QWRA 1QZ6A 1NGJA 4BGBA 3QB0A 3WXIA 4WQ5C 3KHYA 1C0FA 2FF3B 2IVNA 1GLCG 2VCPA 3AY9A 3EKUA 3O8MA 3DXMA 5AQZA 2GWJA 3M1FA 2P9IA 3DXKA 2DPNA 2FSKA 3VPZA 3LDLA 2Q0UA 1HKBA 3ENHA 5AQKA 4EFHA 1T44A 2A42A 5BPMA 1QQOA 5AZIB 1IJJA 1MWMA 3R8EA 5KPZA 2Q0RA 3O80A 1K8KB 3IMXA 2D4WA 2ZWHA 2E2OA 4GNIA 3CETA 5LJVA 3RSEB 2HF4A 5FPEA 3MDQA 5AQXA 1NWKA 1HX1A 2E20A 1GLLO 5EX5A 5KQ8A 1MDUB 2GUPA 1ESVA 3H1QA 1GLEG 1SZ2A 1YVNA 2QWNA 3EKSA 2AA4A 1NBWA 5AQSA 1ZXOA 2QWQA 3GBTA 2VYPA 3D2EA 1GLDG 5FPDA 3KZBA 1NGAA 3IDHA 2Q2RA 5AQLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSWA 4C8OA 3OS2A 1FKOA 1CZBA 2YKNA 3UE5A 2QW9A 3AV9A 1JLBA 3OYGA 1D4XA 1JCFA 2WBNA 2F4VK 4B1ZA 3D0PA 4DWIA 4NCBA 3SNNA 1C0TA 1HKGA 3E9LA 4CF0A 3G71N 4CZFA 2V7YA 5JMVA 3FGUA 2YNFA 1NGCA 3U4LA 3HT3A 2HMIA 2AJQA 4DR5K 3WNHA 1NK5A 3OYMA 1YIJN 4BG9A 2HF3A 3NAEA 3T3FA 1KLNA 4LF7K 1NK4A 4K41A 5LMUK 5GADP 1VHXA 5AQIA 4K43A 1BCOA 5CY4A 1EXQA 2E8AA 2Q1NA 3EZWA 5M1NA 4JI8K 4GW6A 3VEVA 3EO3A 3QESA 1V4TA 4BR9A 4K8XA 5E84A 4K42A 2YX6A 2PY5A 4CFBA 1U47A 1CZ9A 1BIUA 4E7HA 3AA2A 3FFIA 3EY1A 3F73A 2GTDA 4FM0A 1LOTB 4DFPA 4ZTFA 5D3GA 2YNGA 4DLGA 1OVYA 5I9EB 1KFDA 3U3GA 1U49A 1IO2A 4BRKA 3LP3A 1OH8A 1JJ2M 1VQ5N 1VQ7N 3KTQA 1LW2A 4WE1A 1NOYA 1N8RO 3AA5X 4IKFA 1NK9A 4CZKA 2OPPA 3QFUA 4CI6A 3BF1A 4KRFA 3K5OA 3LPUA 4BE2A 2A3ZA 4A2AA 4OPKA 3HVRA 3FZKA 1HQUA 1WSFA 3ZSZA 1TYQA 4KHWA 3WQTA 3UKRA 4F4KA 4HUGA 2QWPA 4CEEA 3C6UA 4GV3A 4A57A 3N4PA 4RCHA 3T1YK 2P9UB 1LW0A 4NCGA 3KKSA 3AA4A 4CZLA 4I9LA 5AJ3K 3I0SA 1Y64A 2NLXA 3H46O 1G99A 1U6ZA 2UXBK 3FZMA 4CJTA 1WNSA 4CJ3A 4ELTA 3ZYYX 4J2BA 1LCUA 1C0GA 1IG9A 4E7KA 1O1WA 2CGJA 1TK5A 4N41A 4Q0BA 3DYAA 4CE9A 4KHNA 5DM7L 2VQEK 3HPGA 4CZJA 4JD2B 4TSXA 2WUSA 3WXKA 2HB5A 4WFNL 1KQSM 2D5RA 2KZZA 1VSFA 4PL8A 3J7AP 4KH4A 2D1KA 3DOKA 4BC4A 4F9OA 3AO4A 2IC3A 4A61A 3VMFB 1Q81O 3NF8A 1T6CA 4FK2A 1S1UA 2IAJA 4M41A 1TGOA 3AVBA 4DV1K 5AQVA 4ILHA 1VQPN 4FJLA 2AP1A 1C1AA 1T6DA 3FLCO 3ZSYA 4DTNA 1JCGA 4CJSA 1SAZA 2OA8A 4IFEA 2Q36A 2ITMA 3LDSA 3CHWA 1TKZA 3VA0A 3KLFA 1UWBA 4UQGA 3QICA 2QTDA 3VF6A 4CF9A 4LSNA 3HXMA 3CFOA 2PYLA 3VQPA 1VRTA 2LSNA 3DRRA 1RCHA 2E1YA 1RTHA 3FE1A 3OS0A 4JI1K 2F8TA 3D45A 1I3AA 3K9JA 1B9DA 3CQ8A 4H0OA 4IO8A 1VSLA 4AHUA 1XNQK 4O0JA 1BI4B 5AR0A 1Q9XA 3K5MA 3O9TA 4RW9A 1DEJA 1YTAA 2ZJQL 2V51B 2P9SB 1X9WA 1TUUA 3R3LA 1JLEA 2NRRA 2RE2A 4CJFA 4HTUA 3DRSA 3NVMA 3AGRA 2O8CB 1JLCA 2Z1IA 2CH5A 4IZ9A 2W42A 1RT2A 4FXDA 3DLLL 2J4RA 5AZJA 3RMCA 4JN4A 4DTXA 1VQON 1EP4A 3SUPA 3OBYA 2PAVA 2QWOA 4LH5A 3CCEN 3KD5E 4CJPA 3LAMA 2O8FA 5ELZA 5K14A 1ILYA 1S22A 1TKDA 3LZJA 4CJKA 1E4GT 3AAPA 3WNGA 5HRSA 2ZGYA 3V1OA 3C7NB 4B9LA 4JRPA 4O4GA 1J6ZA 5H1SQ 1SL1A 4B9SA 4W5NA 3ZSXA 4BRHA 4YDUC 2IS3A 5TKWA 2P5GA 2IDOA 3G10A 3SZ2A 4ILGB 3ZX3A 3U8XA 3RRGA 3ZEUB 3I0RA 4IEEA 3MEDA 1J9AA 4YOVA 3ULDA 1M90O 3THYB 3SAFA 5C42A 4E7JA 2VQFK 1JCEA 4ID1A 3K58A 4BY9C 4G9ZA 3CFRA 1S5JA 5EXWA 2ZJRL 4EIAA 2HOEA 3C94A 1Z25A 2GBZA 1CXQA 4DTOA 5J2PA 1NK6A 4QOZB 1XC3A 3UKUB 4DFJA 4FL9A 4AF1A 4FLVA 4H0YB 4BWMA 2HHTA 1MU2A 2NRHA 4ZTJA 2FBYA 2VGNA 3A5OC 2O4GA 5AQMA 4BC2A 4FK0A 2UYTA 1ATNA 4GMJB 1RILA 3T1AA 5AQHA 1EO1A 4DTUA 4QS9A 4K0KK 5HOOA 4E7IA 1HPMA 4E19A 4FJMA 1FW6A 3IG1A 1XHXA 1UOCA 3VN5A 3SQ1A 4GKKK 1S9GA 1S6PA 3P39A 3PSFA 3V9SA 4E3SA 2HNYA 4FLZA 3CJAA 3S3MA 3ULEA 1NLVA 4MO4A 1LV5A 3M8SA 4Y0WA 3SBTA 4H5VA 4CJ4A 3R1XA 3THWA 4MFBA 1XQSC 2JGUA 4DTPA 2FSJA 4DR6K 3OY9A 4HVJA 5HRRA 1HMVA 5CR4A 2PBDA 3K9KA 1HNZK 5LY3A 4X62K 5KI6A 4PKGA 2NNWA 2IGIA 2Z1JA 1C1BA 3F5TA 1TL1A 5HP1A 3KHYA 3OYFA 4N56A 2B6AA 4UY8O 5M1KA 3KK7A 2GWJA 4A59A 4DUZK 4CFDA 5AQKA 4EFHA 1X1PA 1T44A 3CC7N 1NKCA 3KLEA 1RDCA 1IJJA 3O9UA 4W5RA 3SQ4A 1QVGM 2DFEA 2Q0RA 3HPHA 2QKBA 4N47A 3IMXA 2XHBA 1KVCA 3V1QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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