3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
1IJJA 4MLEA 2Q2RA 5KQ8A 4CI6A 5CE3A 1MA9B 2ZWHA 1LOTB 3CJCA 4EFHA 4FWOA 2FLOA 1T44A 1ATNA 2D1KA 4BGAA 2QXLA 4M7XA 4EHTA 3WEEB 3AY9A 3HTVA 4BRKA 5BRHA 1DKGD 3G25A 4KBOA 1QQMA 2GWJA 3MN9A 3A5OC 4AM6A 3VOVA 2P9PB 4J8FA 3ATUA 4BREA 2YI1A 5AQMA 1YVNA 3EL2A 3S41A 1QHAA 3LDOA 3ZX0A 4QS8A 3VEWA 1ZXOA 4K43A 3ZEUA 4BC5A 1E4FT 3UKUB 4CJ7A 4WYBA 5B8HA 1V4TA 2P9IA 1E4GT 3BP8A 4PKIA 4MLHA 2ITMA 3GDQA 2YCHA 2P9LA 3H46O 4WQ4A 2GUPA 2E2PA 5F2RA 3U9ZA 4CZKA 1SAZA 4H03B 2Q97A 1GLLO 1U2VA 2I7PA 1TUYA 2ASOA 2BUPA 2QWOA 3I8BA 3QMLA 4PKHA 3H3NO 4BG9A 4IWVA 3CIPA 4F9OA 5LY3A 3HI0A 2P9KB 3C7NA 4H5NA 3A0IX 4NB4A 3RSEB 2Q36A 2GELA 4RCHA 3AAQA 3WUHA 5LJVA 5E84A 3WXLA 4BRMA 4WQ5C 2A41A 2P9UA 4H0XB 1HPMA 4JHDA 4H0VB 3ZETA 4QS7A 3VERA 4C23A 5BREA 5JLHA 3VEZA 5AQPA 5AZJA 4BR5A 2HMPA 3H3OB 3LM9A 4BRAA 3L4IA 2ZF5O 4A62A 5ADXA 2ZGYA 4BRDA 5AQTA 2A5XA 2E1ZA 3WXIA 1Y64A 2ASMA 3LDPA 4CD3A 4IZ9A 5AR0A 2CGJA 1OKJA 2AP1A 4XH1A 4BRIA 3O8MA 1TUUA 1WOQA 5AQVA 4A2AA 5KQDA 4K25A 4H0TB 3U8XA 1R59O 3DXMB 3CI5A 4EIAA 3TU5A 1K8KB 1H1VA 1HJOA 3RSEA 5AFUA 3UKRB 3ZX3A 3FE1A 3CQYA 4FSVA 5AQOA 2QWNA 5AQNA 4FL9A 3VGMA 4BRPA 2A42A 4AM7A 4JD2B 1Z6RA 1ZC6A 4FO0A 3W3DA 3VESA 5JMVA 2CH6A 5ELZA 1ATRA 2NLXA 4H5RA 2IVNA 1NGDA 3SJHA 1C0GA 4Z94A 5AZJB 3VETA 1HKCA 3O6WA 3SLCA 5EVZA 1QQNA 3D2EA 4BR9A 4IJAA 2GTDA 2A3ZA 5AQZA 3MCPA 3C0BA 1YUWA 5AQWA 2ASPA 1IG8A 3J8AA 3MN7A 3HBTA 3VENA 3FZMA 4E1JA 4PL8A 4CZGA 5BN8A 2IVOA 2BTFA 3VF2A 1NMDA 3VF6A 4EHUA 2E8AA 3U4LA 5AQXA 4IXCA 2FXUA 1NM1A 4H5TA 2YHXA 3VEOA 2CGLA 3DXKA 3WT0A 3ATVA 4CD1A 3WEEA 3QFUA 1BA1A 4BC4A 1BUPA 2P9SB 4B9QA 2YJEA 3CJ9A 4ISFA 3H6EA 4FWKA 2NZTA 4FPBA 2VCPA 4HWIA 4XEIA 1GLJO 4XH4A 5AQSA 4BR7A 3DWLA 5AQIA 4H5VA 5E26A 3CERA 3M1FA 1JCEA 3ULEB 4H0YB 1NGFA 4FWPA 1NGAA 3ZETB 3HZ6A 2P9KA 1RGIA 4GY2B 2Q1NA 2GEMA 4BROA 3VEVA 3BEXA 2UYTA 3IUCA 5BPMA 3M3ZA 2D0OA 3WQUA 3R8EA 3FGUA 1CZAN 2YJFA 3CJ1A 3A8YA 1X3NA 2FSJA 3OHRA 3FFKB 3KZBA 2A40A 2WUSA 4JN4A 3O08A 4YDUA 2D0PA 3P4IA 2H3GX 2J4RA 4FWNA 1NGEA 1YAGA 1NLVA 1D4XA 3O5BA 3CJBA 2A6AA 3TPQA 3D2FB 3O1WA 3LL3A 5AQHA 1NBWA 1K8KA 3FZFA 5BN9A 3EKUA 3ID8A 1HX1A 1ZBSA 3H1VX 3ENHA 5AQLA 4K42A 5F0XA 1QQOA 1TYQB 1YXQA 3DAWA 2OANA 4Y0WA 4JHDB 3L6QA 4PL7A 1HKGA 2QWRA 2FSKA 4I6MB 4IO8A 3UKRA 3EO3A 3LM2A 4BGBA 1T6DA 2FF3B 1NGCA 1NWKA 2P9LB 2Q31A 3LDLA 3JXUA 2VYPA 5BRFA 2Q0UA 2ZGZA 4H0OA 4BVPA 1J6ZA 4A61A 1BG3A 3GL1A 5AQFA 3VGKA 5BR9A 1RFQA 5EXWA 1Q18A 1P8ZA 1HUXA 1SZ2A 1NGIA 4CZMA 2Q0RA 5AZIA 3MMVA 2QWMA 5KPRA 1GLBG 2E1YA 3QFPA 2V7YA 3SMSA 2IIRA 4GNIA 4L3QA 1BO5O 3FLCO 3HSCA 4CBWA 2HOEA 4CZHA 3SK3A 4B1XB 2NRHA 4QS9A 5KPZA 3ZEUB 5FPNA 4WQ5A 4B1VA 3B8AX 4BQLA 5AQQA 5AQJA 2W40A 3GOIA 1EQYA 3VF4A 2FF6A 5JLFA 5AFUH 2QW9A 1GLAG 1XC3A 3CETA 3H45C 1U2VB 4CZEA 3R9PA 2DPNA 3QDKA 4DQ8A 3KVGA 1Z05A 3FZLA 2FSNA 1DEJA 2EWSA 1HKBA 3C7NB 1KAXA 4O5FA 1BA0A 2E88A 3O1BA 2P9NB 1KAYA 3QB0A 3CHWA 3AAPA 2V7ZA 3R6MA 1V4SA 3EZWA 4IJNA 3DXKB 4M63C 1U6ZA 2V51B 4MO4A 3LDNA 3QBWA 4FWRA 4BG8A 1NGHA 2CH5A 3IMXA 3DXMA 3BF1A 1S3XA 4FOIA 1GLEG 4CZFA 3GBTA 3O4WA 5EX5A 2CGKA 4H0PA 3ZX2A 4CBUA 3D2FA 4XH5A 4K41A 1X3MA 3ENOA 1BDGA 1BOTO 2PBDA 4WQ4C 3ULEA 1NGBA 4JD2A 3QBXA 2IVPA 3WXJA 4CZIA 4A2BA 1C0FA 2AA4A 4BC2A 1LCUA 1NGJA 3MN5A 3BF3A 2D4WA 4JNEA 2QWQA 2GWKA 3IDHA 3UB5A 4BQZA 5BPNA 3QICA 4FPAA 5FPDA 1ESVA 1T6CA 2KHOA 4FWLA 4BR2A 3D2EB 3LDQA 1KXPA 4B1YB 5AQUA 4FOEA 3CJAA 3EKSA 3MDQA 4BR0A 5BPLA 4BRCA 1QZ6A 4B1WB 2YHYA 5ADXH 1SQKA 3W0LA 4BRGA 1RDWX 3JS6A 3UE5A 1TYQA 4BC3A 2E2NA 2F9WA 4M7YA 4FWSA 1KAZA 3MK6A 2HF3A 3BUZB 4B1ZA 3CJ7A 3MN6A 2PAVA 5AQRA 4FWQA 5AQYA 4I6MA 5BRDA 3CQXA 3FZKA 4BRQA 4BVOA 2P9IB 1DGKN 1HLUA 2YHWA 1JCFA 3DJCA 5AQGA 5JICA 5FPMA 4ISGA 1WUAA 1MWMA 4CZLA 3U9DA 4BRNA 4LC9B 1S22A 3HM8A 3D7EO 3L0QA 4B1UB 1GLCG 3A5LC 4RTFD 2P9UB 3A5MC 3IFRA 3AARA 4RWTA 4DCHA 4CZJA 4BRHA 5FPEA 1BU6O 5AZIB 3VEYA 1MDUB 5TKYA 1GLFO 3A5NC 3FZHA 3VEXA 3GG4A 2F9TA 2E2QA 3KHYA 3WQTA 1XUPO 4EAHD 3EN9A 5EY4A 3VGLA 5LJWA 4YDUC 2P9NA 3SMPA 3FR0A 2VWBA 3I33A 2HF4A 2I7NA 4DHYA 2W41A 1ATSA 1JCGA 1QZ5A 4NO7A 4CBXA 4DB3A 1G99A 3VPZA 1MWKA 2P9SA 3O80A 5F1XA 2QWPA 4HTLA 4JAXA 4MO5A 1XQSC 4FWMA 1GLDG 2QWLA 3H1QA 4PKGA 3WXKA 3M6GA 2P9PA 5I9EB 2QM1A 4ISEA 3GE1A 5EOYA 4BR4A 2E2OA 1X9JA 1BWFO 4H5WA 4BRFA 3F9MA 5AQKA 3UKUA 4BRLA 2V52B 1NGGA 4O8KA 5KPTA 2E20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IJJA 4MLEA 5KQ8A 1JL2A 4CI6A 2QKKA 3OYFA 1T44A 3L2UA 2D1KA 4CJFA 3QNNA 5J2MA 3T19A 4DV3K 3CXCM 1KC8O 4JI1K 5BRHA 3G25A 1QQMA 2GWJA 4FZYA 3MN9A 4C8MA 4DR7K 1P90A 3VOVA 3HVRA 1S9EA 3ATUA 4L8RB 1NK9A 1YVNA 3EL2A 3I0SA 3S41A 1MU2A 1WSJA 1NK5A 4N41A 3TAPA 4JLHA 2HVHA 3VEWA 1ZXOA 2Y1IA 1EO1A 2UXDK 1BIUA 1C0MA 4FZXC 3EYZA 3UKUB 4WYBA 3T1AA 2P9IA 1NMNA 2GV9A 3ASMA 3ZT0A 4HUEA 4PKIA 3PO4A 2GUIA 2YCHA 2E2PA 4I2QA 3VQCA 4PA1A 2NRVA 4CJWA 2VG6A 1SAZA 3KLFA 4M42A 1FJGK 1KLNA 2ZQBA 1VQ4N 4JI3K 4V19S 5DM6L 3RRGA 2QWOA 4PKHA 3IS9A 1L5UA 4RW7A 1VSMA 5LY3A 3I56N 3F73A 3C6UA 4DLEA 2QA4N 1A5WA 4NB4A 3AAQA 3WUHA 3HXMA 3L8BA 1C6VA 3WXLA 3THVA 4YY3K 4H0VB 1W97L 3AVMA 2ZJPL 3OBYA 4C23A 3CCRN 5JLHA 5AQPA 3D0PA 3PX6A 3LP0A 5AZJA 4JI6K 5FROA 1WLJA 4BRDA 1NK0A 3JYTA 4LH5A 4XH1A 4YOVA 2W42A 1TUUA 1WOQA 3VQPA 4LF8K 4H0TB 4EIAA 1K8KB 1SS6A 4TSXA 4FLZA 3UKRB 3S3MA 1U45A 5AQOA 2QWNA 4FL9A 4DSKA 2HW3A 3L2RA 4CF0A 3J7AP 4AM7A 3P39A 4E19A 1JLGA 1ZC6A 4JS4A 3VESA 5ELZA 1ATRA 2NLXA 5AZJB 2BE2A 4NLBA 2JLEA 4CFDA 1VQPN 1RTDA 3DRPA 5J2QA 4IJAA 2KZZA 2GTDA 2YNGA 3ITHA 2D0CA 4KH5A 1IG8A 1RDAA 1YF5L 3MN7A 1D9FA 3VENA 3HRGA 1BCMA 1HQUA 3THYB 4LFBK 3CPEA 4CJKA 3C6HA 2IVOA 1VAZA 1J53A 4CHNA 4JI8K 3U4LA 4DR1K 1BGXT 1RT4A 2FXUA 2YHXA 4CGDA 4ILJA 1LW0A 2VWJA 1KVAA 4DWIA 4YOUA 2D0BA 3SYZA 3VQ5A 2YJEA 3LALA 2WOMA 2NZTA 2VCPA 1GLJO 4FJNA 3AA5X 3DWLA 1D9DA 4DV7K 4HCBA 3CERA 1JLFA 3TAGA 1QSLA 1JCEA 5C24A 1NGAA 3NAEA 5KI6A 3HZ6A 5GIOA 4K0KK 4I2PA 1Q8IA 2WONA 4BROA 4LH4A 1KFSA 3IUCA 3MEDA 5BPMA 3M3ZA 3WQUA 5A2QO 2DY4A 4JYAK 1CZAN 2YJFA 3CJ1A 5FRNA 1X3NA 4JI0K 2IC3A 2FSJA 3FFKB 2KFNA 3KZBA 3PSIA 2A40A 1DT9A 2D0PA 2J4RA 3CM5A 1NGEA 3ZT1A 3CJBA 5HRPA 2XY5A 4C8LA 4DMNA 4PY5A 3OYCA 3FZFA 5BN9A 3M8PA 4PQUA 4KRFA 1HX1A 3LAKA 4CEQA 3H1VX 3EZ5A 3E9LA 2G8IA 1TYQB 1YXQA 3EE8A 1HKGA 2HHUA 2FSKA 4OPHA 4I6MB 4IDKA 3HOSA 4FLWA 1QE1A 2FF3B 3NFAA 1RTIA 4FM1A 1JLEA 4O8UA 1TL3A 3OJUA 1R0AA 4BVPA 4OGEA 3TAMA 1Q7YO 3GL1A 1L3SA 5M1FA 3AA4A 4M3RA 1RDUA 3VTIA 4ID5A 2FBTA 4E1MA 4FJMA 4CZMA 2Q0RA 1Q81O 3V4IA 5KPRA 2E1YA 3SMSA 2O8CA 2IIRA 4E7IA 4Z4FA 2KTQA 1BHLA 4GNIA 1QHTA 3J80O 1EWRA 3V81A 1JLAA 3THWA 4B1XB 5IT9O 3ZEUB 1I3AA 3V9UA 3PY8A 3GOIA 4KPYA 2Y1JA 4M3TA 1GLAG 4JKCA 1XC3A 3OVNA 2G8WA 1U2VB 3E66A 4DQ8A 4DQSA 3OYMA 1Z05A 3V9WA 4YNQA 4FCYA 1IBMK 2EWSA 1HKBA 2OPRA 1U4BA 2E88A 2P9NB 3VQEA 1NKBA 3KJVA 3HM9A 4KH6A 1XHZA 3T7ZA 3HO1A 4O4GA 1BISA 1YITN 3CHWA 2V7ZA 3R6MA 1V4SA 3J7ZO 4M63C 1U6ZA 3M8SA 4BG8A 3AVLA 1HR0K 4DSJA 3K0SA 4FOIA 4E7JA 4CZFA 3GBTA 5EX5A 4H0PA 3HP6A 3ZX2A 3EY1A 3LAMA 4GVMA 4CEAA 2F8SA 3T69A 1RBUA 3AO4A 3LP2A 1ZBHA 3DRRA 3NF6A 2HNZA 3ULEA 1Y97A 2IVPA 4IDHA 4CZIA 3PSFA 4BC2A 4FYDA 1LCUA 3LP3A 2PZSA 2OPSA 2DFHA 3UB5A 4DR4K 4AHCA 4A5AA 4CK3A 4C8NA 1T6CA 1JLCA 2YX6A 3QIPA 1TKZA 4CJQA 1ASVA 4CF2A 1RBVA 5K14A 4JKHA 3BGRA 4BRGA 1ASWA 3CCEN 3CMAN 2NNWA 2F9WA 1VQMN 1A5XA 1SKSA 3MN6A 2PAVA 4B3TK 3HPOA 5AQYA 1IO2A 1XNRK 3FZKA 4PWDA 1EETA 1C1AA 5AQGA 3S3NA 4O5BA 1RTJA 4CZLA 3ULDA 4CJTA 2QK9A 3U9DA 4BRNA 3O4QA 3V1OA 3O9TA 1RT1A 1VQ8N 4B1UB 3A5LC 3C95A 4Z4CA 2BDPA 4LFAK 3MX5A 3HP9A 4RWTA 3THXA 3CC2N 5FPEA 3A5NC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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