3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
2E1YA 1X3NA 4CZEA 1NWKA 4BVOA 1E4GT 2PBDA 4CD1A 3TU5A 4JHDA 1GLDG 5AQOA 4ISGA 1NGFA 3ATVA 4BRDA 1NGIA 4BVPA 3HSCA 2ASOA 3EO3A 2GWJA 3VGKA 2YI1A 1DEJA 2VYPA 4H0XB 3GBTA 4B1VA 3VERA 4RCHA 1V4SA 5AQHA 5AQWA 3D2EB 3C7NB 4FWMA 4BROA 4FL9A 4C23A 4DCHA 5KPRA 3O6WA 5AR0A 2W41A 1YXQA 5AZJA 3QICA 3DXKB 5BN9A 3QFPA 3VPZA 4BQZA 1MA9B 4PKGA 3SLCA 4JHDB 3GL1A 5CE3A 2YJEA 5KQDA 3UKRA 2I7NA 2D4WA 4KBOA 3D7EO 4BGBA 3UKUA 4NO7A 3SMSA 4LC9B 1CZAN 3B8AX 4JN4A 1QHAA 5JLFA 3I8BA 1SZ2A 1SQKA 3LDLA 1BU6O 2E2QA 2HMPA 3EKUA 3H46O 4WQ5A 3AARA 5AQRA 2GELA 4CBXA 3DJCA 4WQ4A 3KVGA 1NGDA 2QWMA 5AZJB 4H0YB 2BUPA 3QB0A 1DKGD 1MDUB 3F9MA 3H3NO 2E8AA 1HKBA 3UKRB 3GOIA 5F2RA 5KPZA 3ULEB 2QWNA 3W3DA 3MN5A 4RTFD 3UKUB 5BRDA 4CZMA 1T6CA 5LY3A 2YHXA 5I9EB 3WXLA 4BRAA 4IXCA 2GUPA 4MLHA 2NRHA 2IVNA 2Q36A 2NZTA 3P4IA 1E4FT 4CZKA 1HKGA 2D1KA 3IFRA 3ID8A 1NGGA 4B1YB 4H5WA 3AAQA 3H1VX 2FSJA 1YAGA 5BPLA 2FSKA 3ENOA 2D0PA 2QWRA 1H1VA 4BR5A 3ENHA 3ZEUA 4CZJA 1NMDA 2YHWA 3ZX3A 3WXJA 2E1ZA 2FLOA 1JCGA 4IJAA 4Z94A 4CJ7A 1QQNA 5EOYA 5AFUH 5BRFA 3A5OC 3D2FA 4QS9A 3U9DA 5AQXA 3WQUA 1QQMA 3CJAA 4I6MB 2E20A 3LDNA 4A2AA 4BRLA 2EWSA 2HF4A 3DAWA 3HI0A 1Z05A 3U8XA 3CJ7A 3H1QA 3L0QA 4CZGA 1NGHA 3CETA 5JMVA 3FGUA 2YCHA 1NGEA 4GNIA 2VWBA 4FWKA 3ATUA 2P9NA 4BRPA 4M7YA 3FE1A 2A6AA 2ZWHA 3QBXA 2OANA 3MK6A 2F9WA 1Q18A 1KAXA 1GLBG 2P9SA 4BR0A 5BPMA 1GLFO 3D2FB 4F9OA 5KPTA 2HOEA 3GG4A 1DGKN 2UYTA 3VEOA 1KAYA 1KAZA 1R59O 4BRHA 3A5MC 4EHTA 3EN9A 1BG3A 4FWQA 1U6ZA 2GEMA 1K8KB 1S3XA 2A40A 5EX5A 4MLEA 2PAVA 5AQVA 2Q0UA 1HUXA 1S22A 1ATRA 2P9UA 2E2OA 2A41A 2FF3B 2QW9A 4MO4A 5EVZA 2NLXA 4FOIA 4B1XB 3H3OB 3ZX2A 2P9SB 4FWPA 4FPAA 5EY4A 1LOTB 5AQZA 4CZIA 5B8HA 3VGMA 5AZIA 1U2VA 1WUAA 4BREA 5AQTA 1TUUA 3BF1A 3MDQA 2YHYA 4BC3A 1GLLO 4O5FA 4O8KA 5FPEA 1SAZA 3CJ1A 1TYQA 2GWKA 3DXMA 4ISFA 4IWVA 4MO5A 5FPNA 4JD2A 3SJHA 2E2PA 2A5XA 2V52B 2W40A 2H3GX 4FSVA 3WQTA 5ELZA 2P9IA 2A3ZA 4BR7A 3CHWA 3VEVA 3WXKA 3CQYA 5AQYA 4A61A 3VF4A 3W0LA 3O80A 3R6MA 3O4WA 4YDUC 3VGLA 1ATNA 5ADXH 3O8MA 1IJJA 5FPMA 4XH1A 5FPDA 1NGAA 1BUPA 1V4TA 4QS7A 1NGJA 5AZIB 2CH5A 4BRNA 1U2VB 3WEEA 3A0IX 3A5LC 4A62A 2CH6A 3WXIA 4BRFA 1J6ZA 4HTLA 4XH5A 1ZBSA 4CD3A 2QM1A 3LDPA 1GLCG 1TYQB 3DXMB 3LDOA 3VF6A 1BO5O 3OHRA 2QWLA 4FWOA 4AM6A 4K42A 2ZGZA 3WT0A 1IG8A 2Q1NA 2P9IB 1HJOA 3LM9A 4IZ9A 1X3MA 5AFUA 2F9TA 3RSEA 5E84A 4B1UB 1P8ZA 4M63C 3VETA 1NLVA 4E1JA 4H5VA 1BDGA 4WQ5C 4BRKA 4AM7A 4FWNA 3CJBA 3M6GA 4WQ4C 5AQIA 4BRQA 2IVOA 5F0XA 1BA1A 3R8EA 2AA4A 3U4LA 2IIRA 3EZWA 3VF2A 5JICA 3CQXA 1BWFO 2ZGYA 1EQYA 5EXWA 2YJFA 3O08A 2ASMA 1GLJO 2QXLA 3LM2A 2CGKA 3KZBA 4CZFA 4BG9A 4H5TA 3TPQA 3QDKA 3QBWA 2CGJA 4WYBA 5AQJA 3U9ZA 5BR9A 4NB4A 4BR2A 3FR0A 4Y0WA 1HPMA 5AQPA 3MCPA 3SK3A 3R9PA 3UE5A 3ZEUB 4H03B 3A5NC 3LL3A 4B1WB 4L3QA 4BRCA 3O1BA 4PKHA 1XQSC 1OKJA 4BR4A 4CBWA 2Q31A 3DWLA 3AAPA 2D0OA 3L6QA 3VOVA 3CIPA 4PL8A 3ZETA 3D2EA 1ZXOA 2P9LA 3MN7A 4JAXA 1LCUA 1GLEG 4EHUA 1NGCA 3FLCO 4CBUA 4CZLA 3DXKA 2P9PA 2IVPA 3KHYA 1D4XA 1NM1A 3GE1A 5AQMA 2QWQA 4H0TB 4H5NA 3VEXA 3MMVA 3JS6A 1XUPO 2P9NB 3I33A 1WOQA 4FOEA 3IUCA 4FPBA 1RGIA 4FWLA 4FWRA 3HTVA 3QFUA 4YDUA 2HF3A 1QZ5A 4BRMA 5F1XA 2CGLA 3ZETB 1QQOA 4H0VB 4H5RA 2WUSA 2P9LB 5E26A 4BG8A 2BTFA 4JNEA 1RDWX 3H6EA 3VEYA 1JCFA 3VEWA 2FXUA 4HWIA 5AQSA 4B9QA 1ESVA 5AQLA 1NBWA 1C0FA 2P9PB 3J8AA 2ASPA 4DB3A 4BC2A 4H0PA 1GLAG 2Q2RA 3FZHA 2V51B 4BRGA 5ADXA 3FZFA 3ULEA 1TUYA 4CZHA 2Q97A 2P9UB 2ZF5O 3VEZA 3L4IA 4PKIA 3WUHA 3MN9A 1MWKA 1G99A 1HX1A 3HBTA 3G25A 5AQQA 5AQUA 2FSNA 5BN8A 3CERA 3HM8A 2P9KA 1BOTO 5AQGA 1YVNA 1YUWA 3BEXA 2E2NA 4XH4A 4H0OA 5BRHA 2FF6A 2V7ZA 3AY9A 5JLHA 2GTDA 3VESA 4A2BA 3O5BA 1KXPA 3M1FA 2QWOA 4BRIA 5BREA 1T6DA 2V7YA 3ZX0A 4RWTA 2AP1A 4BQLA 4BGAA 4K41A 4K43A 2J4RA 4BR9A 3A8YA 3HZ6A 3QMLA 1Z6RA 4JD2B 5BPNA 4IO8A 1ZC6A 3CJ9A 4ISEA 3FZLA 5TKYA 3FZKA 3BP8A 1BA0A 4GY2B 4EIAA 2P9KB 2Q0RA 2DPNA 1C0GA 3CI5A 1T44A 3JXUA 4I6MA 4DHYA 5LJWA 3VENA 3WEEB 4EFHA 2QWPA 4BC4A 5AQNA 1X9JA 5LJVA 5KQ8A 2A42A 3IMXA 1ATSA 1HLUA 3FZMA 3BF3A 4XEIA 3C0BA 4M7XA 4IJNA 2I7PA 4CI6A 4K25A 3SMPA 4BC5A 3O1WA 2KHOA 3M3ZA 3S41A 1Y64A 5AQFA 4J8FA 4QS8A 1MWMA 1NGBA 1XC3A 3RSEB 3CJCA 3IDHA 5AQKA 4B1ZA 4DQ8A 2E88A 3FFKB 4PL7A 4FWSA 1JCEA 3BUZB 3H45C 3MN6A 2VCPA 4FO0A 1RFQA 3UB5A 1HKCA 4EAHD 2ITMA 1QZ6A 3C7NA 3EKSA 1K8KA 3GDQA 3EL2A 3LDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NAEA 4CJEA 3OYCA 1X3NA 4CZEA 4FJMA 3WNHA 4BVOA 2KQ2A 3KWIA 2HBJA 1E4GT 4CEFA 3M8QA 1K8AO 3PO5A 1GLDG 4DTJA 4ISGA 2UXBK 1NGFA 4FLZA 3BZCA 1NGIA 3MEEA 4BVPA 3HSCA 4I2QA 3EO3A 3VGKA 4N76A 4B1VA 3VERA 4DTRA 4RCHA 3NH2A 4FWMA 4DCHA 1VRUA 1IBKK 3O6WA 5AR0A 4CESA 3VQPA 5AZJA 4FW2A 3TSUA 4AHVA 1WB9A 3DXKB 3E9LA 1RBUA 1MA9B 3SUQA 4PKGA 2YJEA 4KHSA 4KH5A 4YOUA 4KBOA 1NOYA 4A5BA 4BGBA 4GV9A 4NO7A 1D9FA 1WNSA 2RE2A 4Q5VA 4BY9C 1GOAA 4O55A 2E4LA 4RW8A 5KI6A 3MWPA 5H1SQ 3LDLA 4PUOA 3EKUA 3H46O 3B6PA 3TSPA 1Q81O 1KLNA 1WSEA 5E41A 4PHTX 1NGDA 3LAMA 2QWMA 4DQQA 4H0YB 4ZHRA 3V4IA 4AQYK 3QB0A 4LSNA 1XHZA 4FCYA 1DKGD 3H3NO 4M3TA 1U04A 5FRNA 2E8AA 1BCMA 1HKBA 5DK5A 3J81O 5F2RA 1C6VA 3ULEB 3M8PA 3VQBA 4CZMA 1W0HA 2YHXA 3V1QA 4E7KA 3O4QA 2QA4N 5FLXO 1JLFA 1LWFA 2NRHA 3PIPL 1A5WA 4JI2K 4B08A 3OYMA 4FLUA 1E4FT 2ETJA 5CY4A 3CPWM 1U48A 3TAEA 1JL1A 1I3AA 3AAQA 3H1VX 1L3VA 3NMUA 2YV0X 4JI7K 2QWRA 3O3FA 1B9FA 3TI0A 3ENHA 2YHWA 4JKBA 4Z4IA 3ZX3A 1T03A 4FW1A 2ZD1A 3S9HA 4FVUA 3L2UA 4IJAA 3K2PA 1QQNA 4IEEA 5AFUH 4QS9A 3MECA 3U9DA 2X78A 4LH5A 3TAQA 4FJ8A 2E20A 1S1TA 3U8XA 1XMOK 4OO1J 2F96A 1NGHA 3CETA 4DSIA 3F5TA 3FGUA 2VG6A 5HP1A 1NGEA 4DR1K 4DR5K 4M7YA 3FE1A 2QKKA 4B3TK 3RWUA 3MK6A 4LF9K 1U49A 3KD5E 1Q18A 1SKRA 2DFHA 3ZSYA 5FDLA 4CEDA 4V19S 2E6LA 4DTUA 4KHNA 3LPUA 4I9QA 3VEOA 4E7LA 4B9NA 1KAYA 3VA3A 3LALA 3D0PA 1R59O 3A2FA 2OTLN 4EHTA 3EN9A 4CFDA 1JLBA 5M1PA 1BHLA 1S3XA 4N47A 2X74A 5GINA 3K5NA 4OPAA 4QAGA 1T8EA 4MLEA 4FJXA 3QNOA 4LF8K 3SI6A 5AQVA 3J80O 1HUXA 1ATRA 3V1OA 4KTWA 3RR7A 1WSHA 2P9SB 2P51A 1WLJA 3R3LA 4FPAA 1LOTB 2HSTA 1KTQA 5J2MA 1S1UA 4LH4A 1Q9XA 1GLLO 3I0SA 3KLFA 1NK8A 4O8KA 4DU1A 3SPYA 2O8DB 3V1RA 4IBNA 4NYFA 3TAPA 4DV7K 3HPHA 3AA5X 2E2PA 4B9LA 5JVGL 3I56N 4BR7A 1FKOA 3CQYA 3RTVA 3VQCA 1NNEA 4JV5K 3W0LA 3ZT0A 3O4WA 3VGLA 1TAQA 4DR3K 1DTQA 1NGAA 4QS7A 3THVA 5AZIB 2CH5A 1U2VB 1TGOA 4NCGA 4ZTJA 2HVHA 3HRGA 4B3RK 2GUIA 3A5LC 1W7AA 4FJGA 1Q82O 4C8NA 3WXIA 5M1QA 4HTLA 1ZBSA 1HR0K 3T1YK 3LDPA 1YJNN 1GLCG 2HHQA 4M3WA 4PQUA 4E7IA 2Q1NA 1VQKN 1LW2A 1N33K 4OX9K 3SQ4A 1G15A 3CCVN 1MU2A 3C6HA 1DTTA 1P8ZA 4DTSA 1WAJA 1YF5L 3VETA 1NLVA 4NLBA 3OJUA 4AM7A 5KGWA 4FWNA 4CHPA 4EZ6A 3U4LA 5JICA 1ZBHA 4OGEA 4JI4K 4FK0A 3SQ0A 1BWFO 3PSIA 3ZSVA 5EXWA 2ASMA 2HHVA 2QXLA 4DSJA 1YJ9N 3CYMA 3TPQA 3PSFA 3L2QA 3U9ZA 4YOTA 2HNZA 3HM9A 4E0DA 4NB4A 3P39A 4BR2A 4Y0WA 1HPMA 4KH6A 2HHHK 4RW4A 3A5NC 5CZ1A 3E1YA 3AVCA 1HNWK 4BRCA 3P1GA 4HCCA 1TKZA 1OKJA 1VQ7N 3EEQA 1FKPA 2D0OA 4JYAK 1JXEA 1KVBA 4FJ7A 3MN7A 1GLEG 4EHUA 3THXA 4CBUA 3DRPA 3KD1E 4KB1A 3DXKA 3V81A 4FJIA 2P9PA 3M8RA 3NVKA 1QSLA 4KRFA 3VEXA 1S6QA 1EWRA 3I33A 3IUCA 4IKFA 4FWLA 4FWRA 1YT3A 1WSJA 4YDUA 3NE6A 4CEZA 4O0JA 5F1XA 3KIOA 1S1XA 3M8SA 1CXQA 3ZSOA 3ZETB 3PO4A 2EHGA 3OYNA 2BTFA 4Z4FA 4OKEA 1RDWX 4CEEA 4N5SA 4WE1A 4B9QA 4CFBA 1ESVA 3DLHA 1NBWA 1HYZA 3DLRA 1ASVA 5HROA 2O8FA 3RVCA 5ADXA 3FZFA 3ULEA 3CCMN 1IKWA 3CCSN 3RR8A 1QVFM 1TUYA 2FC0A 1RILA 2W6KA 3U3GA 5I42A 1JLGA 5AQQA 4JK9A 2P9KA 4DV3K 4CGIA 3AVFA 1KFSA 5BRHA 2V7ZA 1KXPA 3M1FA 2QWOA 1YTAA 4BRIA 4DV2K 3AA3A 2UXDK 1W97L 3ZX0A 4A59A 1VSMA 4K41A 4K43A 3HZ6A 4DU3A 3SUOA 1BIUA 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1M1KO 3CCJN 4RTFD 3UKUB 1HJRA 4HVJA 3QEVA 4DS5A 2D0BA 2FBVA 4DQSA 5I9EB 4H4OA 1BI4B 4BRAA 4IXCA 4F3TA 3KWGA 4MLHA 2NUBA 2Q36A 2D1KA 1NGGA 3TAMA 4JI3K 1K73O 1X1PA 1N36K 1WAFA 4KFBA 3ENOA 1H1VA 4BR5A 3VTIA 4CZJA 4ZTFA 3WXJA 1NJWA 1SKWA 1JLCA 4CF0A 4XIUA 2FLOA 1Z25A 4CJ7A 4M41A 3A5OC 3D2FA 4DLEA 1S5JA 4F8RA 1HNXK 4KI4A 3QEWA 1FJGK 2D5RA 5BR8K 3CJAA 2EWSA 3CJ7A 3H1QA 4CZGA 2WTUA 5M1NA 5MLCQ 4BRPA 3WXMB 2A6AA 1BQNA 3G71N 3VQ6A 4CF8A 3QBXA 1UOCA 2HBMA 4KHWA 1HYVA 5BPMA 5C42A 4Y1CA 3JAMO 2HOEA 2QXFA 1DGKN 1JLQA 4AH9A 4BE0A 1OVQA 4DFPA 1WSFA 5JVHL 3A5MC 1BG3A 4FWQA 2GEMA 4CJFA 2WFBA 2P1JA 1SKSA 3HVTA 2QTDA 2KZMA 2PAVA 5KRSA 1S22A 3CMAN 2QW9A 5EVZA 1L3TA 3H3OB 3G10A 1BL3A 4E7HA 5AQZA 4CZIA 5C15A 2GBZA 2JWKA 3EE9A 3KKRA 4DV1K 3L3VA 2JWLA 1TUUA 3BF1A 4BACA 2YHYA 4BC3A 2G8VA 2OA8A 1VQ8N 4CHNA 3DRSA 4A57A 2V52B 4RW7A 3WNEA 3K5OA 5ELZA 2P9IA 5GADP 4B3MK 3VEVA 1SS6A 5AQYA 1QVGM 4G9ZA 1IO2A 4HUFA 1KFDA 3K9JA 1IJJA 4CJVA 1KSPA 1V4TA 4YHHK 4BRNA 3HO1A 3SV4A 3A0IX 2CH6A 5SZTA 4BRFA 4CD3A 2QM1A 3BGRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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