3QBXA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid kinase (anmk) bound to 1,6-anhydro-n-actetylmuramic acid
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
353
Chain Sequence
b'PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLADEFFAARGPKSTGRERFNLPWLQEHLLPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Molecular Basis of 1,6-Anhydro Bond Cleavage and Phosphoryl Transfer by Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transferase
total genus 118
structure length 353
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2011-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qbxA01
3VESA 4PKGA 3ZEUA 2A5XA 5AQXA 1NGHA 3ENOA 3GG4A 2ITMA 2ASMA 4FOIA 2W40A 2A41A 1XQSC 4BQZA 1ESVA 5B8HA 3HBTA 4FPBA 3GOIA 4EAHD 2ASPA 4B9QA 3B8AX 3C7NA 1V4TA 3LM9A 4HTLA 1BWFO 1IJJA 2F9WA 2Q36A 4PL8A 5AZJA 1NGEA 4CZGA 1YAGA 3KZBA 4K25A 4A61A 2A42A 4MLEA 4FWOA 5F2RA 3D7EO 3ZX0A 3VETA 2NZTA 1RDWX 4C23A 3H1VX 3O4WA 1K8KA 4BR5A 4BR0A 3LDPA 4K42A 4XEIA 3UKRA 4H5NA 2Q0RA 2ZGZA 4DCHA 1SAZA 4PKIA 1KAYA 1T44A 2V51B 4JD2B 1DGKN 1U6ZA 3CJ7A 5AQHA 3R9PA 4A62A 2E8AA 3WXLA 4BRGA 2YHYA 4H0PA 1C0GA 3VENA 3LDQA 3UE5A 5KQ8A 4CJ7A 3H3NO 3VGMA 5KPRA 2FSJA 2VWBA 3LL3A 2HF3A 5AFUH 1BA1A 1EQYA 1LOTB 2YCHA 3VEVA 4BC3A 5JLFA 2D0PA 2VCPA 4B1UB 2YJEA 1KXPA 2EWSA 1XUPO 5BN9A 1U2VB 1HPMA 5EX5A 1QQNA 3W3DA 4WQ5A 4CZHA 2Q0UA 2P9LA 2FSNA 4RWTA 1NGAA 3FLCO 1ATSA 4H03B 3H6EA 1RGIA 1BG3A 2CGLA 4L3QA 3UKUB 4CBUA 3RSEA 2NRHA 3I33A 2QWMA 3D2FA 4JN4A 2Q1NA 4CD3A 5JLHA 2BUPA 3ZX3A 5EXWA 3WXJA 1ATRA 1HX1A 4KBOA 1KAXA 5FPMA 5AQMA 3VGKA 3G25A 2BTFA 4A2BA 5LY3A 1X3MA 4BRKA 3ATUA 3VERA 2YHXA 3BF3A 4WQ5C 5KPZA 1GLJO 4ISEA 3VGLA 2QWRA 1S3XA 5AQZA 1HJOA 3A5OC 4H0OA 4BC5A 1Q18A 5AQUA 5AQOA 3MN7A 5E84A 4BR2A 3CQXA 2P9NA 3QICA 5AQWA 1TYQA 4CZLA 4BVPA 1IG8A 2KHOA 4K43A 2P9KA 3CETA 3EO3A 5EOYA 4PKHA 3R8EA 1NGJA 3AY9A 1Z05A 1BU6O 3ZETA 3U4LA 4IWVA 3J8AA 5AQVA 2P9IB 4DB3A 4BC4A 4EFHA 4F9OA 5AQSA 4BRCA 4BR9A 1GLAG 3L0QA 2GWKA 2P9PA 3DJCA 4ISFA 3RSEB 5F1XA 3MMVA 4BRPA 4BG9A 4BRAA 3DXKA 2HMPA 3FR0A 4H5VA 3IMXA 3GL1A 3O6WA 1NGBA 1V4SA 2P9UB 2QW9A 3MN9A 3WEEA 3FFKB 1QZ5A 3CJAA 1ZXOA 2GEMA 1BOTO 4DQ8A 3LDNA 1GLFO 2CGJA 4H0XB 1JCEA 4H0YB 4NB4A 3CJBA 1WOQA 4MLHA 1MA9B 3AARA 4BRHA 2WUSA 3QFUA 2FXUA 3L6QA 3FZKA 3O08A 1P8ZA 4NO7A 4BR7A 2A6AA 1SZ2A 2D1KA 1J6ZA 2FSKA 3L4IA 3SLCA 5JMVA 3FGUA 2P9NB 4CBXA 2E1YA 1HKCA 1GLDG 4RCHA 3QBWA 4FWPA 1YUWA 5TKYA 5AQFA 2CH5A 3ULEA 5EVZA 1WUAA 4B1WB 4E1JA 1DEJA 3JXUA 5BRFA 5ADXH 3CJ1A 1Z6RA 3HI0A 3W0LA 3CJCA 3UB5A 5FPEA 4FWKA 4H0TB 4H5TA 4MO5A 4FPAA 4BGAA 1NMDA 1KAZA 5AQJA 4QS8A 4BRLA 3M3ZA 3VEOA 1NGDA 4K41A 3O8MA 1MWMA 2OANA 2P9PB 2I7PA 4JAXA 4IXCA 3LDOA 1Y64A 3ZEUB 4CBWA 1YXQA 3DXMA 5AZIA 4RTFD 5FPNA 1HUXA 3GDQA 2Q2RA 1NLVA 2CH6A 5JICA 1BO5O 4WQ4A 4CZIA 2P9SA 3C7NB 4FWSA 4JHDA 1NGIA 3VEWA 4BRDA 5AQGA 3CERA 5AZJB 4I6MA 2W41A 1HLUA 4QS7A 3VPZA 2E2QA 3SK3A 4AM6A 5F0XA 4BREA 4M7YA 3VEYA 1S22A 2E88A 3H46O 2GELA 2ZF5O 3CQYA 2H3GX 1NGFA 2FLOA 1K8KB 3A0IX 4LC9B 5KPTA 3H3OB 5AQPA 3HM8A 4YDUA 3MK6A 4MO4A 3UKRB 2ZWHA 4JD2A 5AFUA 4WQ4C 2IVPA 3QMLA 3MCPA 1NGCA 2PBDA 4DHYA 4AM7A 5BPLA 2IIRA 3FZHA 3FE1A 3AAPA 3VEXA 5I9EB 3EL2A 2QWLA 3WQTA 3H1QA 4H5WA 3GBTA 4ISGA 1QHAA 5BPMA 3FZFA 1E4GT 3VOVA 4GNIA 2D4WA 4BQLA 3I8BA 2A40A 2IVOA 1NBWA 3LM2A 3O5BA 5AQRA 4BVOA 5AQNA 4J8FA 4YDUC 1CZAN 1MWKA 3IUCA 3HTVA 4IJNA 4B1VA 2V7ZA 2P9LB 4JNEA 3WUHA 1JCGA 2E20A 1T6CA 4B1YB 3M6GA 4IZ9A 5LJVA 4CZEA 1ATNA 3A8YA 3BF1A 3D2FB 4BGBA 4FWLA 4M63C 3SMSA 3SJHA 1T6DA 1NM1A 4BRFA 2AP1A 1D4XA 4CZMA 3ZX2A 3BP8A 2IVNA 4BRIA 1XC3A 4H0VB 3EKSA 1HKBA 3CI5A 2F9TA 4H5RA 5BREA 4BG8A 3H45C 3DWLA 4FSVA 4BRNA 1ZBSA 2V7YA 3VF4A 3DAWA 1QQOA 5EY4A 1U2VA 5ELZA 2E2PA 1H1VA 3WQUA 1HKGA 1TYQB 1TUUA 3A5NC 1GLBG 2YI1A 4XH1A 3TPQA 4B1ZA 1NWKA 3KVGA 1R59O 4CI6A 5CE3A 4PL7A 3CIPA 4FL9A 1GLCG 2D0OA 2P9KB 2PAVA 3WT0A 4CZKA 2ZGYA 3BEXA 3UKUA 4Z94A 1C0FA 3MN5A 4BC2A 1ZC6A 3HZ6A 3ZETB 1X3NA 2UYTA 4FWMA 3VF6A 4FO0A 4A2AA 1BDGA 5E26A 5AQIA 2E2OA 3D2EA 2Q97A 3P4IA 3WXKA 1X9JA 3U9ZA 3GE1A 4FWNA 2A3ZA 3WXIA 3DXKB 2E1ZA 1DKGD 4XH4A 4FWQA 1GLEG 1MDUB 2GWJA 1E4FT 3WEEB 3MN6A 5AQQA 3VEZA 2E2NA 2QWNA 1NGGA 3IDHA 5AQLA 4BRMA 1JCFA 4EHUA 2HOEA 3KHYA 2V52B 3M1FA 3U9DA 1SQKA 3O1BA 3O1WA 3AAQA 5ADXA 3QB0A 2GTDA 3O80A 1BA0A 3OHRA 4FOEA 4CZJA 2Q31A 4CZFA 3EKUA 4Y0WA 4O8KA 3FZMA 2P9IA 1QQMA 3ENHA 2HF4A 2QWPA 3FZLA 3ULEB 1LCUA 4IO8A 4B1XB 3BUZB 2QXLA 5AR0A 2AA4A 5BN8A 2ASOA 3VF2A 2QWOA 3R6MA 4BRQA 3MDQA 3JS6A 3EN9A 4EIAA 4EHTA 2I7NA 4HWIA 3LDLA 2P9UA 3D2EB 1QZ6A 5FPDA 3ID8A 5BR9A 3QBXA 2DPNA 3DXMB 4GY2B 5AZIB 4BROA 2CGKA 5AQYA 3ATVA 5BPNA 2FF3B 2P9SB 4CD1A 3EZWA 4XH5A 4JHDB 5AQTA 4O5FA 2YHWA 2J4RA 2QWQA 5LJWA 4QS9A 2GUPA 2QM1A 3F9MA 3U8XA 2VYPA 1TUYA 4I6MB 3TU5A 5BRDA 3A5LC 2NLXA 3HSCA 4M7XA 1G99A 2YJFA 4WYBA 3QFPA 2FF6A 1RFQA 3CJ9A 1GLLO 5BRHA 3S41A 3SMPA 5KQDA 3C0BA 3QDKA 1BUPA 4BR4A 1YVNA 3CHWA 4IJAA 3A5MC 5AQKA 4FWRA 1OKJA 3IFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEUA 5KRSA 2AJQA 3PLAA 3IAYA 2QTDA 3I56N 4ID5A 1NGHA 4CVNE 3B6PA 5CZ2A 3M8RA 1VSLA 4ZHRA 2W40A 1ESVA 4FPBA 3OYKA 4EAHD 4FJGA 3TAMA 3K2PA 4HTLA 4X65K 1IJJA 2F9WA 2Q36A 4PL8A 5AZJA 2OTLN 3LWLA 4FVUA 1JLBA 4MLEA 1QSSA 1X1PA 5F2RA 3VETA 2NZTA 5J2QA 4C23A 2VG5A 5DK5A 4ZTJA 3KD5E 4HUFA 2XY6A 4QAGA 1JKHA 3S9HA 5I42A 1EETA 5LL6Z 1KAYA 4E7KA 2V51B 1Q9XA 3CJ7A 4NXMK 1DTTA 5DM7L 2E8AA 4RW8A 4BRGA 4H0PA 4DTUA 3D45A 2VQEK 4JK9A 1C0UA 3LDQA 3UE5A 5KQ8A 4CJRA 4CK2A 3SI6A 3VGMA 4AH9A 3E1YA 2IDOA 1LOTB 4BC3A 4FJ8A 3N4QA 4KHSA 1Q82O 2NRTA 1KVBA 4J2BA 2E6LA 3W3DA 4WQ5A 1OH5A 2FSNA 4RWTA 3FLCO 3HL8A 1CXUA 4L3QA 3AO3A 1BIUA 4Y1DA 3AO5A 3RSEA 4W5RA 1RBVA 4CD3A 3RRHA 1NJIO 3O4QA 3WXJA 1ATRA 3E9LA 1EO1A 4NXNK 4YORA 4U67L 4JKGB 2PFUA 4HTUA 3KK1A 4BRKA 4I7FA 4O5BA 1S1XA 1WSJA 2RHKA 3BF3A 1L3UA 2PYLA 4ID1A 4OLAA 4ELUA 1S3XA 1HJOA 4H0OA 5AQUA 1XWLA 4HCBA 3HXMA 4W5NA 4CZLA 3LZJA 3DOLA 1IG8A 2KHOA 4K43A 3V4IA 2P9KA 5FRMA 3R8EA 1UAXA 3SAHA 4CHZA 4PUOA 1BU6O 4BWMA 3J8AA 3OYBA 2P9IB 4F9OA 3KLEA 3I8DA 2P9PA 3KWIA 2X6NA 3DJCA 3V1OA 2E5LK 3V81A 5F1XA 3ZSRA 4BG9A 3NCIA 1S5JA 3VQ9A 3FR0A 1NGBA 1LW2A 2P9UB 3WEEA 1QZ5A 2NUBA 1BOTO 2CGJA 3RTVA 1BL3A 2HBKA 3K5OA 1TK0A 1JL2A 5EU7A 1JJ2M 2FXUA 4IG3A 1YITN 4JI6K 4FJJA 3FGUA 3ZSWA 1D8YA 3QBWA 2O4GA 1YUWA 5E41A 5AQFA 1RBUA 4DQQA 1YJNN 3T19A 1DEJA 5BRFA 5ADXH 1A5XA 1SKSA 2DFHA 3CPEA 3UIQA 3W0LA 3CJCA 3UB5A 4FWKA 4H0TB 3K0SA 3IRXA 4NCAA 3AO1A 3TTDA 4BGAA 5AQJA 4CGGA 1HQUA 4DUYK 1YVUA 1JXBA 3O8MA 1MWMA 3O3FA 3LDOA 3G4SN 2VQFK 1YXQA 3NF9A 4M41A 3VA3A 4FZYA 1W2BM 3SAGA 1KSPA 4WQ4A 1RT6A 3I55N 4DSJA 1OH7A 3OYLA 2VG6A 4DV3K 1U45A 4BRDA 4NCGA 1HR0K 1JLAA 4I6MA 2W41A 4YOXA 4QS7A 3K5LA 4B9MA 4CESA 1A5WA 3N4PA 1Q81O 1XHZA 5M1PA 4DTXA 4M3XA 4M7YA 1S22A 3HPHA 2ZJQL 1TAUA 4N76A 4DV6K 4LC9B 4DQPA 2O8FA 4N47A 3HM8A 2X6SA 3UKRB 2ZWHA 3OVNA 5AFUA 4CHYA 3CCVN 4QOZB 2LSNA 3LDSA 1VQON 2IIRA 3AAPA 4CJTA 3Q7BA 4E19A 3EL2A 2QWLA 3H1QA 4A5AA 3NFAA 2YKNA 5BPMA 1S6QA 4DQRA 4NLBA 4E3SA 1N8RO 2NRXA 3HSTB 4CW7B 3TSQA 3VQCA 1IO2A 3I8BA 4ILJA 3O5BA 5AQRA 3HPGA 3NE6A 3O9RA 4YDUC 4BY9C 1T05A 1QTMA 4J2EA 2V7ZA 4V19S 4CERA 1JCGA 4CF1A 4LF5K 4DFMA 4IZ9A 4JI1K 5LJVA 3E01A 4JI4K 3A8YA 2HHHK 1DLOA 5J2PA 4JKDA 4FWLA 1RBSA 1IBMK 4M63C 3SJHA 3CCMN 1B9DA 1TK5A 1XMOK 4IEEA 4KB1A 2AP1A 1D4XA 1OH6A 1QE1A 1GOCA 2UUAK 3T7ZA 2IVNA 2JWKA 1F21A 2G8WA 4BRIA 1OVYA 1XC3A 4DR7K 3H45C 4GV9A 3QESA 3NDKA 3L2WA 4DV5K 2HNDA 1J53A 3ISNC 3T1AA 5KTQA 2IGIA 1WNSA 5EY4A 1U2VA 5ELZA 1Z26A 1HKGA 4XH1A 2YI1A 1IKXA 1C1CA 3HRGA 2PY5A 4B1ZA 5GAHP 3AVGA 1NWKA 3KVGA 1HPZA 1VQ4N 3UKUA 4CEDA 1VQPN 1P90A 2NRZA 1I3AA 1FKPA 3ZETB 3PV8A 3KWGA 1BDGA 1RTDA 4O0IA 1K73O 4CK1A 4IKFA 1X9JA 3QNNA 2F8SA 3GE1A 3TAPA 3MCAB 3LP0A 3ZT3A 3IG1A 1DKGD 3LP2A 4PHTX 4XH4A 5DMRA 5AQQA 1TKXA 2E2NA 2QWNA 4KO0A 3OYDA 4CECA 5AQLA 4BRMA 3ASMA 5C2FA 2HHUA 3KHYA 4DF4A 1NJZA 1SQKA 3O1BA 3HYFA 2HHXA 2E4LA 2GTDA 4DU3A 4ELTA 5KI6A 1VSKA 4WFBL 1T8EA 3F73A 4M45A 5BR8K 4CZFA 1N32K 3SUNA 2P1JA 3CC2N 3FZMA 1QQMA 3ENHA 3PIOL 4C8MA 3CCRN 3ULEB 4H4MA 3QEWA 4B1XB 2QKBA 2KZMA 5HRRA 1NOZA 2AA4A 3VF2A 4CJ5A 4OVLA 4FLVA 2NRRA 3JS6A 4CJUA 1IV0A 3LDLA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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