3QD9A

C72s/c353s mutant of trypanosoma brucei qsox containing an interdomain disulfide
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
402
structure length
388
Chain Sequence
PGLFHLDSSVVDLSGDDFSRVHRVAPLCPWIVLFYNDGCGASRRYASTFSKFAGGLKVEHGKDALQIATAAAVNCASEVDLCRKYDINFVPRLFFFYPRDSSLEHVAFENSHLEVDELESEVRRLVNKHMVVDDSLKERCIDMHFKLYTSKEELVSSTDESGRFVETTELYATDIAGAFFSAMHYDVSLVGTEPRERLTALEDFVLLVKDSLPSIGADGVVSALESITAERPFTVASWQDAVVKSGIPFDGSPRNVRWRTCRGSSPQYRGFPCGMWLLLHALTVNTPADRNVLEVIQNYIRYFFSCKESRDHFIQFNFSPNEDPVLQLWRAHNNVNARLANVKDGADPLVPKRQFPTLEACTECYDGAGNFIEAHVTGFLKQRYLWDP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The dynamic disulphide relay of quiescin sulphydryl oxidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords QSOX from Trypanosoma brucei (TbQSOX)
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
total genus 108
structure length 388
sequence length 402
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2011-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF04777 Evr1_Alr Erv1 / Alr family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qd9A01
1ZYEA 3VWWA 2PWJA 1K3OA 2J23A 3M1GA 2F8FA 4ZBBA 1SJ6A 4ML1A 2E7PA 3EMXA 1GTIA 3ED3A 4DVCA 2X8GA 3KJYA 3GSTA 2G2QA 1XBSA 4GCIA 4WR4A 5HR3A 1SENA 2YWIA 2JSYA 4Z7XA 2OADA 4WF4A 5DCGA 4EDYA 4MP4A 2RM6A 2CZ3A 2LQQA 4J57E 2LRTA 3ZREA 2FA8A 3F0IA 4ULXA 5G30A 4LMVA 11GSA 1BJXA 1AQXA 3C1RA 1PX6A 2N5FA 5ECNB 4FYUA 3UOMA 2K8SA 3BCKA 3P90A 3RHCA 2JU5A 1TRUA 4BWQA 1PSQA 2A2RA 4N30A 1OKDA 3EVIA 2LUSA 3CRTA 5IM9A 1BG5A 1ERTA 2L4CA 4Q5QA 1H4OA 1GH2A 4MLYA 4MF5A 3KP8A 1GSDA 5DAKA 5A4VA 2DMMA 1K3YA 2YCDA 2RUEA 3IE3A 2CVBA 4MZBA 2YOIA 4ECCA 4MF6A 1TJDA 4XS4B 20GSA 3ZIVA 2KP2A 2WJUA 2QC7A 1Q4JA 2BJXA 16GSA 1M2DA 2I4AA 3TDGA 5JWOB 3L4NA 1Y25A 1R5AA 2DJ3A 4MJAA 5GSSA 5E59A 4K7OA 2YP6A 4ILFA 2JL4A 4PXOA 5L71A 3SBCA 3DMLA 1E6BA 3IOSA 3BD2A 3GIXA 3F9UA 1GULA 5G5FA 2VM2A 5IPGA 3I69A 3ZITA 3IHQA 4HZ2A 2K6VA 2RUFA 12GSA 1HNBA 6GSWA 2GZPA 2H1GA 4RI7A 1J08A 1XZOA 1SD9A 3G7JA 3C73A 5ECLB 2R2JA 3FZ5A 1ZGNA 3APOA 3ZL5A 3ZMKA 5IQYA 2EIQA 5ECPB 1B9YC 1TRVA 1EEMA 3ZVJD 4L8EA 5A5KA 5B7CA 4OO4A 4Q5NA 3A2WA 2GLRA 4KAEA 2M80A 3APQA 1G6YA 4ZL8A 4XCSA 5HR1A 2H8LA 2B5YA 3BBYA 3WGEA 1GSEA 4YH2A 3GKNA 4D73B 2NTOA 2VCTA 3VWXA 4NV2A 4KDYA 1TI1A 1ZZYA 2GDRA 5ID2B 2IIYA 4XS4A 3IXRA 1PQNA 1N8JA 3UVHA 4DSQA 5JCUA 3BOAA 3D0ZA 3WGXA 4EL1A 3O3TA 4GRFA 4TRXA 3G7YA 4ZIJA 1B4PA 2A4VA 1M9BA 4G10A 2CA8A 2HNLA 2PN8A 3MSZA 4KNDA 1ZOFA 4ZILA 5CNWA 1JZDA 1HQOA 1ON4A 2O7KA 2I3YA 4I2UA 1CQGA 2GVPA 1NW2A 2DJ0A 2JZRA 2GQKA 2MMNA 4KH7A 3KMOA 2E0QA 2E2MA 2DLXA 2PGTA 4RQXA 2C0DA 3GL5A 1O8WA 4WXTA 5JWRB 3KD0A 4ML6A 4GTUA 1TKDB 3GH6A 1GTAA 1VRSD 2O85A 2LRCA 2P5RA 1FVKA 5ECHB 1YQ1A 3GX0A 4K6XA 1VGLA 1ERUA 1V57A 3UBLA 4Q5RA 4AJ8A 4BPYA 2IMKA 2R6KA 1NM3A 4KB3A 1O73A 2YZHA 3C8EA 2H71A 3A2XA 3F4TA 4D73A 3WGDA 2VCXA 2VL2A 4MZCA 3GH9A 1B9XC 5J4UA 5JWQB 2I1UA 2C3TA 3M8NA 2GZYA 1M7TA 2XBQA 3GHAA 2LS5A 1FB0A 3HA9A 4TR1B 3KM6A 1G7EA 6GSXA 4KCEA 1GNWA 1XWCA 1OKTA 2VIMA 3AY8A 5DQSA 1GLQA 1ACVA 5ECKB 2C4JA 3DGQA 4K9ZA 4IGJA 2L59A 1FG4A 2XBIA 1TI3A 4NPBA 5CRDA 1NSWA 3TKSA 1VF1A 5HFGA 5HR0A 4OCFA 5KN2A 4POLA 3GKXA 3VWVA 6GSYA 3TJGA 3LYPA 2P0GA 3ERWA 3RBTA 1NHYA 3FK8A 2OJLA 2L6DA 4FO5A 3MWHA 2CQ9A 5J41A 2HLSA 2R4VA 2FUG2 2O8VB 4L0WA 4ACSA 5AISA 3VWUA 3ZZXA 2WZ9A 1C72A 3KGKA 4WETA 3F4RA 3GNJA 3D4TA 1EWXA 2GGTA 3GTUB 3FRCA 2JADA 2C3NA 2H74A 4E8EA 3LJRA 4FIWA 2VD1A 3FW2A 1QQ2A 1QGVA 1GNEA 1Z6NA 10GSA 2V6KA 3RDWA 2G0FA 1GSFA 4HJ2A 3CYNA 4FH8A 3GFKA 5IMAA 1PD21 4TR1A 2HYXA 4AJ7A 4MJBA 1Z3EA 9GSSA 3DVXA 4HI7A 5AGYA 1W89A 2FNOA 2FGXA 4KCAA 4TXOA 5A4UA 1A2MA 3SWLA 3HYPA 1PL2A 4POMA 5HFIA 2I81A 2H0GA 3F8UA 4F82A 5ELGA 4HOJA 1XVQA 2IMEA 3L9UA 3Q6OA 1QFNA 5IIZA 4V2MA 1GP1A 2LNTA 3HJOA 1U87A 1X9WB 1LU4A 2OBKA 2E2GA 3EC3A 1ZYQB 1OC9A 2HFDA 2LKUA 2VD0A 4KDXA 4DEJA 4ECJA 1WOUA 2V41A 5DCHA 1ML6A 7GSSA 1UA5A 2EC4A 4NMUA 5G5EA 2C8UA 5CAXA 5EVOA 1A8YA 3OR5A 2TIRA 5IOXA 1PMTA 2C0GA 2MZCA 3M0FA 4PNGA 3APSA 1BYEA 1F9MA 3CMIA 2JACA 1AW9A 1THXA 4FYBA 5D93A 1TK0B 1U6TA 19GSA 2GZZA 3HJMA 2X64A 1G0TA 4LL1B 3F4SA 4JBBA 3QFAC 6GSSA 1MD3A 2GSRA 5F06A 4ZBAA 3L0HA 4EUYA 2GT6A 1XIYA 5C04A 5E4WA 2H1AA 5INYA 2H76A 4LA1A 4BL7A 2R3XA 2VLUA 2FWHA 1SKWB 3H4KA 2VAFA 3D22A 1J9BA 3KP9A 3H8QA 4HEA2 4TVEA 1K0CA 1AAZA 1AIUA 3EE2A 5IMVA 2J9HA 1PRXA 2IL3A 3TOUA 4MPFA 2IMDA 4PQIA 2IPAA 5B8BA 1M0UA 1V58A 2AV4A 4J56E 2EIOA 4WBJA 1HNCA 3G9BA 4OMVA 2HE3A 2VUPA 3F63A 4GWRA 4QL9A 2DBCA 2CVKA 1U88A 5HFKA 2HRNA 4ZB6A 2H6XA 5D8IA 1S3CA 4PUFC 1MDIA 2KOKA 4GQCA 4ECBA 1YEXA 3Q19A 1EGRA 3F3QA 3GX8A 4DSSB 3DD3A 4DSRA 3IK9A 2VCVA 3EURA 3FZ4A 1CQHA 1YEPA 1Z9HA 1FOVA 4OFNA 3VPTA 4PUAA 3F6DA 1GUKA 4BVXA 1FVJA 3TUEA 1XXUA 2IJYA 1XFLA 4ECIA 1O7UA 3RPPA 3CSIA 2WDUA 1TU7A 2OBIA 2CV4A 2HZEB 1KEBA 3RAZA 5ABRA 3C71A 2OA7A 22GSA 3D4MA 3ERGA 3U5RE 1B8XA 1JZOA 3IDVA 1JHBA 1SL0B 4JRRA 2IWTA 1SL2B 2VLTA 5KN3A 2OACA 2XPDA 1PGTA 1KNGA 3TKSE 4KW6A 2QGVA 1TU8A 3LQ7A 1YJ6A 5HR2A 5HQPA 1ZCPA 1JZWA 3R2QA 3I43A 4NAXA 1DE2A 1O81A 1DSBA 1HYUA 4ISDA 1K0NA 5ECSA 2LJKA 1X9SB 1TRWA 1EGOA 2IMFA 1TTZA 1FW1A 4JZQA 2VO4A 1VF4A 1JFUA 1BAYA 3KH9A 2GSSA 1AQVA 3GSSA 1EOHA 4IJIA 4ZL9A 3WYWA 3MNGA 3GA4A 2WCIA 1OC3A 2B1LA 1USBA 3IRAA 3W8SA 4GSNA 5CREA 4OFTA 5F0GA 3W6GA 1TW9A 3P8WA 1T4YA 5D73A 2I9HA 2FLSA 1G7OA 2HSHA 3NZNA 1ABAA 1YF1A 2YPMA 4IHUA 2X8CA 1SL1B 3CRUA 1PA3A 4PQHA 1W4VA 2HZEA 2ES7A 3A3TA 5DVBA 3F3RA 2OKAA 4YQUA 1QXHA 3EWLA 1EEJA 5DDLA 3H79A 2REMA 4HQZA 2IMIA 1DE1A 4K0NA 14GSA 3D6IA 5EL8A 1B4QA 3QAWA 2GS3A 4TW5A 1JLVA 2AAWA 4I8BA 2H70A 2N5AA 5DALB 1TP9A 1V2AA 4KE3A 4JU5A 3TKPA 3HY2A 1LJRA 3QPMA 2PMTA 4V2NA 4WR5A 4GSSA 4OWYA 3ZFLA 4TR3A 4MF7A 1GLPA 2VM1A 1IYHA 3TOTA 2YN1A 4K8MA 3VPQA 4MJEA 3KMNA 3DEXA 1T8EB 3CXGA 4ZBDA 3PR8A 1T3BA 3UARA 2HXKA 4K1FA 1SYRA 2GSTA 2JSZA 4X1UA 4XS6A 3L78A 3HJPA 2WFCA 3FR9A 1V40A 1XW5A 4AF2A 3KEBA 1A8LA 1XCCA 1BQ7A 4GSTA 4K7IA 2MMZA 4MJCA 1I9DA 3HHVA 3RHBA 1HNAA 3ZFBA 8GSSA 2L6CA 5ECOB 3Q74A 4ZB8A 5ID2A 1Q98A 4IJ3A 4IP1A 4L5OA 4JEDA 3KCMA 3KIJA 2LQOA 4WEYA 3GYKA 1U3AA 3EU4A 2QSIA 1WP0A 4N11A 2KHPA 1GUHA 1V98A 1F3AA 4G9HA 2YWNA 2A2SA 4K2DA 5KEJA 1XWBA 1Z6MA 2AB6A 5G1KA 3ZTLA 2CAIA 5JCGA 1BEDA 4OD7A 2DJJA 4G19A 4I2TA 4IELA 3IV4A 3GV1A 3LXZA 1SK2A 5DBQA 5IOWA 2CX4A 4O5RA 4HZ4A 4JR4A 3ZIJA 1ERVA 1PL1A 1SJZA 5GAND 1SKRB 4TXVA 2PVQA 2PERA 2VCQA 4KDUA 2FHEA 5ECMB 2OE1A 2AHEA 4IS0A 3C1SA 2C0FA 5DJLA 4NWYA 4KUNA 4JE1A 1WIKA 1RQMA 1A2JA 2LRNA 1EOGA 2H73A 4PNFA 2YWMA 1SK0A 3QMXA 2EIRA 1GSSA 3HVSA 3J7Yb 3TKRA 4KGIA 4I6XA 2YNXA 2DSAA 1URMA 2MBSA 2NPBA 17GSA 5GSTA 3EINA 3EU3A 1YZXA 3L9SA 2AJQB 2WULA 4MMMA 4O7HA 5GZZB 3CTFA 4EDZA 5CRWA 1PN9A 1WRYA 1S3AA 2R5GA 4F2IA 4G2EA 1XOAA 2DJKA 5D9VA 3Q18A 5B6NA 2CAQA 2N5BA 1J0FA 2B1KA 2RM5A 2BMXA 2P5QA 1GRXA 4YAVA 1SU9A 2K8VA 1KTEA 4IKHA 1MEKA 2WB9A 2GT5A 3N9JA 1F3BA 3MDKA 2AUVA 1SKSB 3KXOA 2PBJA 4ID0A 2LJAA 5ELAA 3TJJA 2NBSA 2KUCA 2MBTA 2VCWA 4IW9A 4WF5A 4OO5A 4TR4A 2JZTA 3QR6A 3TJFA 1LBKA 1MDJA 3TGZA 2AYTA 2ZCTA 2C80A 3ERFA 1K0DA 4WBRD 2PPTA 1YF0A 4HS1A 3HXSA 5KN1A 3KZQA 4CDOA 1QMVA 4MPGA 3VI7A 2MMAA 1VF3A 3DYRA 3LEFA 2LTKA 1XWGA 1GUMA 2LSTA 3E0UA 2RLIA 5D9WA 3HKRA 5AIVA 1RW1A 2NDOA 3U6VA 4QL7A 1X5CA 2FWGA 4KA0A 1WPIA 4IP6A 4TR0A 3QD9A 1OAZA 3GTUA 2F9SA 2F51A 4KX4A 2ON5A 2VL2C 1A0RP 5ECQB 3HDCA 3D5JA 4HJMA 3GRXA 3HZ4A 1EV4A 4IBPA 3DRNA 3CSJA 1B48A 3VI5A 3M9JA 3UMAA 4V1Ap 5IPHA 3UAPA 3TKQA 2GQLA 2YV7A 2C3QA 2WS2A 4POBA 2XPEA 2YWOA 1M2BA 5LD0A 3CBUA 2P31A 3UBKA 1XOBA 1UVZA 4L0UA 3FHKA 2DJ1A 3GKMA 2CZ2A 4E8HA 5DAKB 4AJ6A 3TKSC 3MAKA 2TRCP 2L5LA 2X99A 3A2VA 2LEGA 3PINA 4I97A 2R37A 2B7JA 1GTBA 3L9VA 5JCWA 4HU9A 2V6OA 1F6MC 5DJMA 5FT3A 1PKZA 1A23A 3I6AA 2D2ZA 4YAPA 3O6TA 1DBYA 3VLNA 4O32A 2YJHA 2VL3A 3LYKA 2H0IA 2MYGA 4TOPA 5GAPD 2CX3A 1WJKA 3I9V2 3NOFA 4YQMA 3ZVJA 1SYXA 3FR6A 5CO3A 1UC7A 4NV5A 2NVLA 3DXBA 2H6YA 2GSQA 3ME8A 4K7NA 1K0BA 4RI6A 1GSUA 2K9FA 2C1YA 1OC8A 3WT1A 3QAVA 3IA1A 2X8HA 1RK4A 1JZRA 1I5GA 5H5RA 3A5WA 3KTBA 2JZSA 2OE0A 4QQ7A 1T7PB 4XTSA 3FZ9A 5F07A 4NHWA 1ZMAA 4MCUA 4XS1A 5D96A 4NHZA 5G31A 1EP7A 5CP1A 5C00A 1HD2A 4XIHA 2H30A 1T1VA 3IAM2 4IQ1A 2B7KA 2VL9A 5D9TA 1M9AA 2LJRA 5F8BA 2H72A 4ZL7A 4ZB9A 2FA4A 1O8XA 1A0FA 1XW9A 3QDNA 5G1LA 4KSOA 2H1DA 3WD6A 3S9FA 5F05A 4F0BA 2C0EA 1X0RA 5ENUA 1KBNA 4BVYA 3BJ5A 2GQMA 4XHMA 3GMFA 1O6JA 4BWSA 2HI7A 1MD4A 1H75A 2CT6A 1GL8A 1K3LA 3IBHA 2OE3A 4X0XA 1UN2A 1G6WA 2H19A 1FB6A 1ST9A 3VK9A 18GSA 2GTUA 3W8JA 2FCHA 1OYJA 4TN8A 4MA9A 1DUGA 1R4WA 2H6ZA 2RIIA 1XVWA 5IO0A 4Q5FA 4EKZA 3HVXA 5A4WA 4DSSA 1GTUA 3NIVA 4GXZA 2BTOT 5J9BA 4EF0A 3M9KA 3FYGA 2B5EA 3D21A 1QUWA 1Z7PA 4EE0A 5CRHA 4N0ZA 1F2EA 4PURA 1XW6A 3TB2A 5ECIB 1WWJA 2LV3A 2KLXA 3LWAA 1M99A 1WMJA 3FY7A 3TRQA 5DQYA 4NXIA 2VOCA 1K0MA 3QAGA 1XPVA 5ECRB 6GSVA 1K0OA 3TRXA 3IK7A 3PH9A 3GURA 1X9MB 3TJKA 2FY6A 2XHFA 3P7XA 4XRDA 3QFBC 3WT2A 3HVVA 2B5XA 4P3YB 3G7IA 4KSMA 3HZ8A 3KH7A 1SJIA 3UIWA 3P2AA 2VLVA 4CW9A 2V2GA 1S3DA 2WGRA 2CVDA 4GF0A 4HUAA 3J7Yk 4L5LA 3KTLA 1GWCA 3H1NA 4V1Ag 1PX7A 3TJBA 4O92A 3UEMA 4MDCA 2V32A 2M46A 2DMLA 2PUKC 3TCOA 4HU7A 2ALBA 1MTCA 4X43A 1V9WA 2L57A 1OE8A 4F0CA 3LSZA 2F3MA 1SK1A 4MH2A 4RQRA 6GSUA 1E2YA 4OCEA 4IN0A 1FAAA 2H0HA 3GN3A 3EMPA 4MK3A 2HT9A 2KP1A 3DWVA 1OE7A 2PVOC 4XRAA 5AN1A 3LGCA 2DIYA 5IO2A 4MABA 2ZUPA 1Z5YE 1X5DA 5IMDA 2O89A 5B6MA 4H86A 1ILOA 5G2ZA 3IC4A 4N10A 1VF2A 1BX9A 2M72A 1N2AA 4PGTA 5J9CA 3HCZA 5DALA 3CTGA 1FO5A 3HD5A 3E3EA 4HQSA 3GKKA 3PGTA 2FWFA 1R26A 2Z9SA 4F03A 4EXJA 3RPNA 1A24A 3JCML 4TXOB 5LNKe 3K8NA 4PX1A 2FD3A 5CRGA 4OFMA 5IMCA 3GUSA 1EV9A 4HDEA 1THOA 1MDKA 2V1MA 4PQ1A 2O87A 4JR6A 4LLRA 1XWAA 5D9XA 1WE0A 5H5QA 5B8AA 1TDIA 1M2AA 3FR3A 1OC9B 3ISOA 2L4QA 2HRFA 2F8AA 5J3RA 1O85A 2LNSA 1Z7RA 2FWEA 1JLWA 2DJ2A 2YZUA 1A2LA 5FWGA 3O76A 4BA7A 3E9JB 2HSYA 3GL3A 4TKYA 5IMFA 5IMZA 5COHA 2YANA 2B3SA 1OVNA 1X5EA 3C7MA 5H5SA 4IQAA 4MZWA 2IFQB 3DKSA 3US3A 2B6MA 3F6FA 3DIEA 1R5PA 1EZKA 3LORA 2MMOA 6GSTA 3DVWA 5EY6A 3LFLA 5FHIA 3ZMLA 3TRPA 1NHOA 4J2FA 4FYCA 3ZYWA 3FZAA 3IPZA 2DC5A 2H75A 4YQVA 5CYYA 3V1WA 3ZLPA 4LMWA 4MH3A 1Y6EA 2H66A 3ME7A 1GSYA 1K0AA 1AC1A 1XWKA 1TK5B 3H93A 4CHSA 3N5OA 1EP8A 3UVTA 1IYIA 1PKWA 4EC0A 3M3MA 3IAS2 4EVMA 4POKA 3ZRDA 4V2LA 5LCZA 1U3IA 3LXTA 3UL3A 2H01A 2XC2A 1R7HA 1SD8A 3VURA 2PU9C 4I5QA 2TRXA 4RUVA 1F37A 5J5NA 3VFIA 3CSHA 1YDKA 1QK8A 2L5OA 1YY7A 1TOFA 1AUCA 2YV9A 4AGSA 1TRSA 3QCPA 4WKWA 1TK8B 3FEUA 2WRTA 1T00A 2IN3A 4F9ZA 1AXDA 2IFQA 4ZXGA 4IVFA 2DIZA 3FKFA 2QKEA 1GSQA 1FHEA 2K18A 2ON7A 3IR4A 4K0GA 2VCZA 4GLTA 2ZNMA 3LG6A 1ZL9A 4LL4B 1YKCA 5AIXA 3EYTA 1T4ZA 4EO3A 2HZFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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