3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
5AQLA 3CQYA 1LCUA 2VCPA 4Y0WA 3J8AA 3MN9A 3VGMA 3LDOA 4EIAA 3A0IX 1ZBSA 1KAXA 3IUCA 5AQGA 2P9KB 3DWLA 3GBTA 1Y64A 3VGKA 4JAXA 2W41A 2HMPA 4H0OA 2P9UB 4DB3A 3C0BA 4A2AA 4BRAA 1NGJA 3ZX3A 4H03B 2QWMA 3VF4A 1NM1A 4WQ4A 2QM1A 3WXKA 4CZFA 2IVPA 4BRKA 5AQKA 1MA9B 3GOIA 3H3NO 1HLUA 3QFUA 1BG3A 4BRMA 3FZFA 4CZMA 3GE1A 3TU5A 4YDUC 3SK3A 1U2VA 3U9DA 5AQJA 2YHWA 3A5LC 1SAZA 4DCHA 3VPZA 4M63C 4BG8A 4AM7A 4B1YB 2V7ZA 1E4GT 4FWNA 1J6ZA 4B1WB 2QW9A 2Q0UA 2PBDA 5E26A 3VESA 3O4WA 5KQ8A 2QWPA 1NMDA 2FF3B 5BRDA 4H5TA 2YHXA 1MDUB 3CJCA 1QQMA 2KHOA 4AM6A 5I9EB 4J8FA 4O5FA 3BF1A 1KXPA 1BDGA 3LM2A 4CZLA 5AQNA 1U2VB 5F0XA 4BC2A 3QB0A 4PKGA 3A5NC 4BRQA 3C7NA 2P9NB 3H46O 3O1WA 2CH6A 2GELA 3VEYA 3I8BA 4GY2B 5BPNA 3O1BA 3GL1A 3QFPA 2ASMA 4MO5A 4WYBA 4BR0A 3A8YA 1XQSC 5BPLA 2D0OA 3L6QA 1GLCG 3VEOA 2ITMA 1X9JA 1NGBA 5BREA 2J4RA 1CZAN 5AQXA 5AQFA 1DEJA 4BQLA 5AQUA 2F9TA 3C7NB 4HWIA 3EN9A 4NO7A 3KHYA 3MMVA 4BR4A 4BR7A 4CD1A 4FSVA 2NRHA 2CGJA 1DKGD 1V4TA 1T6DA 3W0LA 1XUPO 4NB4A 1RDWX 1Z05A 4CZGA 3M3ZA 4M7XA 3ATUA 4WQ5C 3AAQA 2V51B 1YVNA 3GDQA 3SLCA 4CZIA 1TYQA 2Q2RA 3VEXA 4BROA 3MN6A 4BRLA 5EY4A 1JCGA 1NLVA 2E2OA 5BRHA 5AQZA 5AQMA 4JHDA 4YDUA 3FZMA 4H0YB 5FPDA 4XEIA 2IVOA 4BVOA 1GLAG 1SZ2A 4ISFA 4CZJA 3D2FA 3BP8A 3D7EO 4FWOA 5ADXH 1HPMA 3ZETA 3FZKA 1HX1A 1X3MA 1TYQB 1BO5O 5ELZA 3CJAA 3SMPA 2Q1NA 4QS7A 3DXKA 1GLEG 4LC9B 2WUSA 5BPMA 4DQ8A 2I7NA 1BOTO 4B1ZA 4B1VA 4JHDB 3M6GA 1KAZA 3MN7A 3H45C 2D1KA 4MLEA 4CD3A 1SQKA 1NBWA 5AZIA 2P9SA 3VEWA 3U8XA 4FL9A 3CJ7A 2A42A 3P4IA 5KPZA 2FLOA 3D2FB 1MWMA 4H0PA 3HBTA 1TUUA 1NWKA 3MCPA 3ZETB 1HKCA 3M1FA 4B1XB 4E1JA 1U6ZA 2GWJA 4BRHA 3DXKB 3DXMA 1ZXOA 3EKUA 4CJ7A 2E2NA 3LDPA 3O80A 5CE3A 2Q36A 3LDLA 3LDQA 1T6CA 3O8MA 4K41A 5JMVA 1OKJA 5AZIB 2P9SB 5KPTA 3CJ1A 5LJVA 3DJCA 3FE1A 3FFKB 4IWVA 1QQOA 4XH4A 4CBWA 1Q18A 3IMXA 3O08A 4JD2A 3L4IA 3KVGA 3CJ9A 1NGDA 1G99A 1RFQA 3FZHA 2Q97A 3DXMB 1GLDG 3FLCO 4IJAA 4PL8A 2E1ZA 3OHRA 1EQYA 4XH5A 4BRGA 2P9LA 1YAGA 2E20A 3ULEA 3BF3A 3ZEUA 3R6MA 1QHAA 1X3NA 4BRPA 3WXLA 2P9PA 4MLHA 4WQ5A 3WQUA 3HZ6A 3ZX2A 2DPNA 1ATRA 3R8EA 3VERA 3WUHA 4BC5A 3RSEA 2V52B 4JD2B 3G25A 1ZC6A 3SMSA 4BRDA 4ISGA 4EHUA 1GLFO 2NLXA 4RTFD 4O8KA 3HI0A 2A40A 1V4SA 4WQ4C 2HF3A 5BR9A 1GLJO 2P9LB 3UKRA 3ULEB 3ZEUB 4CBXA 3EZWA 3CJBA 5KQDA 4BQZA 2H3GX 2P9PB 1QZ6A 3H1QA 5E84A 2NZTA 4H5WA 5AFUH 3ZX0A 3VF6A 3W3DA 3DAWA 3RSEB 4BR9A 4K25A 3AARA 1RGIA 5AQIA 5BN8A 4BRIA 2BUPA 1P8ZA 5EOYA 4A62A 3LM9A 5JICA 2ZGZA 4QS9A 3UKRB 2CH5A 1IJJA 3S41A 4B9QA 4EFHA 4BC4A 4M7YA 2Q0RA 4H0TB 2UYTA 4CZEA 5EXWA 5EX5A 3HTVA 1BA0A 5AQWA 2GWKA 2QWNA 2CGLA 4FOIA 3WXJA 5AQQA 2GTDA 1ATSA 5FPMA 2YHYA 3KZBA 4BVPA 2AP1A 1C0GA 2FSKA 3FR0A 4JNEA 3H1VX 2GEMA 3CERA 2QWOA 3JXUA 3U9ZA 3QICA 3UB5A 1LOTB 4CZHA 3VEVA 1D4XA 5BRFA 5ADXA 3BUZB 5F1XA 2E88A 5AQYA 1HKBA 2E2PA 2Q31A 1E4FT 3CHWA 4RCHA 3FGUA 1HKGA 4PKIA 1T44A 3ATVA 4BG9A 1BU6O 4FPAA 2ASPA 5BN9A 3QDKA 2GUPA 2FF6A 3IDHA 1K8KA 3GG4A 3R9PA 3VOVA 2YJEA 1R59O 1C0FA 1NGHA 2A41A 3CETA 2A3ZA 3CIPA 2QWQA 2ASOA 4K42A 4QS8A 2ZF5O 2VWBA 4I6MA 5AQSA 3FZLA 4GNIA 1Z6RA 1GLLO 3B8AX 4H0VB 1QZ5A 1BUPA 2ZGYA 4BC3A 3O6WA 1H1VA 3ENHA 1IG8A 1KAYA 3QBXA 4RWTA 3MK6A 3VF2A 4A61A 1K8KB 2QWRA 3WQTA 2A5XA 4BR5A 5AZJA 2ZWHA 4DHYA 1BWFO 1GLBG 2P9NA 3QBWA 4HTLA 1S22A 3BEXA 4PKHA 4I6MB 5AQVA 4B1UB 3I33A 2I7PA 4PL7A 2FSJA 1ATNA 2P9IA 5AQOA 3AAPA 3EKSA 1NGEA 1NGIA 4IO8A 1BA1A 5F2RA 5EVZA 4FPBA 4L3QA 4BR2A 4BGBA 2EWSA 1MWKA 4CI6A 3UKUA 3D2EA 4BRCA 2YJFA 4A2BA 4K43A 3H3OB 3ID8A 5AZJB 3VGLA 2PAVA 5B8HA 3TPQA 1JCEA 3LDNA 4BRFA 2W40A 5FPEA 4CBUA 4H5NA 1YXQA 5LY3A 2QWLA 3JS6A 4Z94A 2YI1A 3WT0A 2BTFA 3A5OC 3IFRA 5AQPA 2P9IB 1JCFA 4FWPA 3VENA 4BREA 5JLHA 2HF4A 4CZKA 1WUAA 4FWLA 1HJOA 1S3XA 1HUXA 2A6AA 4IJNA 3VETA 2E8AA 3D2EB 3UKUB 4FWRA 2QXLA 4KBOA 2E1YA 2OANA 2VYPA 4IZ9A 4MO4A 4FWKA 3WEEA 3MN5A 3CQXA 3EO3A 1QQNA 3SJHA 4FOEA 3CI5A 1XC3A 2YCHA 5AFUA 3MDQA 2F9WA 2FXUA 1TUYA 2FSNA 1YUWA 4C23A 5AQTA 4BRNA 5JLFA 5AQRA 2CGKA 2V7YA 3AY9A 1DGKN 3O5BA 2IVNA 3QMLA 2D4WA 4BGAA 4EAHD 1NGCA 4EHTA 1NGAA 5TKYA 3UE5A 3L0QA 5LJWA 5KPRA 4FWSA 5AR0A 3WEEB 4FWMA 3HM8A 1ESVA 4JN4A 3WXIA 3A5MC 3HSCA 1NGFA 2AA4A 3H6EA 3U4LA 4H5RA 4XH1A 2IIRA 2P9KA 2D0PA 3LL3A 5AQHA 3EL2A 4F9OA 2E2QA 1WOQA 3ENOA 4FWQA 4H5VA 3VEZA 2P9UA 4H0XB 4ISEA 2HOEA 4FO0A 1NGGA 4IXCA 5FPNA 3F9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQYA 3E9LA 5KGXA 1VQMN 3QO9A 2N2QA 3MN9A 3VGMA 3LDOA 2O8BA 4FJ9A 3A0IX 1KAXA 5AQGA 2P9KB 3DWLA 2O4IA 3O4NA 1Y64A 3VGKA 4JAXA 5M1KA 3CCVN 5M1FA 4RW4A 1TKDA 4C8KA 4BRAA 4F4KA 4H03B 3KP0A 3VF4A 4BE7B 4M3RA 3S9HA 2QM1A 1D8YA 4M42A 4IEIA 4KH6A 2O8BB 1JJ2M 4CHNA 4M3XA 3AVCA 3TU5A 1REVA 1VQLN 4DU4A 3AVJA 2ITGA 3HJFA 1SAZA 2JGUA 3ALYA 4DCHA 5KTQA 4CJKA 3QEVA 4KI4A 1A5WA 2HBLA 1ZBIA 3CCLN 5FRMA 1HRHA 2PBDA 4F2RA 3DOLA 1RCHA 3V4IA 2WFBA 1TK0A 4CFAA 3KD1E 4MDAA 3LM2A 5AQNA 4GVEA 3AVNA 2ZJRL 3C7NA 3O1WA 3QERA 1WBDA 4CJPA 2CH6A 1HNIA 3CMAN 2HHQA 1LAWA 3IS9A 1BQMA 4F3OA 1EO1A 3RRGA 3L6QA 3WNHA 1NGBA 5I3UA 5BREA 2J4RA 4JK7A 2DFEA 4FM2A 1NNEA 5C10A 1XHZA 3C7NB 4HWIA 5JVGL 4WE1A 4OLBA 2MN5A 1RTDA 4BR7A 1JXEA 1BCOA 4CERA 4KKOA 3KOWA 4ZTJA 4KHPK 4LF8K 2KBJA 3AVMA 3S5TA 3ASMA 4DR1K 1XUPO 3HO1A 4NB4A 3TAQA 4CZGA 5J2MA 3CPWM 3AAQA 4CEOA 1TYQA 3CXCM 3QNNA 1JLQA 1ZYWA 1JL2A 1YHQN 4BRLA 1IBLK 1U48A 1JCGA 1W9HA 4PHTX 2QI2A 4OKKA 4W5TA 3AVBA 5AQZA 5BRHA 2G8KA 5AQMA 4YDUA 4E7JA 5CZ2A 1C1BA 4HE7A 2LT8A 1YJ9N 3HP6A 4CZJA 1JLAA 3D7EO 4JKAA 3V9WA 2RPIA 1ZYQA 4DSEA 1QVGM 1TYQB 5ELZA 4LC9B 2Z1HA 4B1ZA 2YNFA 4ZHRA 5J1EA 3KP1A 4OLAA 3K0SA 3MN7A 2KBHA 1IH7A 4IFEA 4CEEA 1NBWA 1EP4A 3SAGA 3VEWA 3U8XA 3QEIA 2VWKA 2A42A 1T3VA 3O3HA 2FLOA 3CC7N 1MWMA 3AGKA 1S1VA 3L2QA 1D5AA 4AHSA 4E1JA 4DV4K 4CJ7A 4LF9K 1ITGA 2ETJA 2YNGA 4RG8A 4CJ5A 3LDLA 1WAJA 3KWIA 4K41A 1CLQA 2OPPA 4JI7K 2OPSA 1OKJA 1RBVA 4BY9C 1Y97A 3DJCA 3SZ2A 5HRSA 4K8ZA 1J53A 4IO9L 4XH4A 4CBWA 4C1NK 4JYAK 4JD2A 1RNHA 2GL1A 1FW6A 4N41A 4WFBL 3KVGA 2G8HA 3FLCO 2E1ZA 1EQYA 3PY8A 4BRGA 4EZ9A 1PE4A 1C55A 4CJUA 2E20A 3J7YP 3ULDA 1F21A 1HJRA 1ASVA 2P9PA 4MLHA 3HZ6A 5C25A 1UOCA 3VERA 4BC5A 5KRSA 1GOAA 3G25A 4JD2B 4IDHA 4EHUA 2NLXA 3MAQA 4GVMA 1L3VA 2BANA 4B3MK 1SN4A 5HRNA 3PO5A 4NXNK 2P9PB 4WFNL 1VAZA 2NZTA 1OVYA 1XRSB 3ZX0A 3F9KA 2R7YA 1L4VA 1TKZA 3ZT2A 1EWQA 1RGIA 2LY5A 1RBRA 3LM9A 3VQDA 4QS9A 3SCXA 3RMBA 4YHHK 5J2PA 1DJTA 1T7AA 4JV5K 2CH5A 5C42A 4KH5A 4H0TB 2UYTA 4Z4FA 2EHGA 5AQWA 1ZVEA 1VSLA 2ZJPL 1DLOA 4AEIA 3P83D 4CGFA 2QA4N 3HPHA 4CJ3A 4PWDA 3PUFA 1YI2N 3T1AA 4KHSA 5JS1A 2LY6A 4BVPA 1C0UA 1NOYA 3FR0A 2QTDA 1ICAA 3CERA 3SBGA 1KTQA 2D56A 1ILYA 3QICA 3VEVA 3HSTB 4JKHA 3BUZB 2VWJA 5HROA 3QI7A 1T0ZA 3DLEA 2YKMA 2E2PA 4FJ7A 1WAFA 3CHWA 5M1OA 4RCHA 1TK5A 3OYJA 5SZTA 1NK6A 3D6RA 4KV8A 4FJXA 2LR3A 1VHXA 2GUPA 2FF6A 1T7PA 4X62K 3G71N 2YJEA 3F2KA 3DLGA 4CIEA 2A41A 3D45A 3NVMA 4IKFA 5JS2A 1NE5A 2QWQA 2ASOA 3CIPA 3K9JA 4DU1A 2ZF5O 3VQ9A 5KRTA 3TR8A 4I6MA 1JLGA 3CCMN 1T05A 4DTUA 3Q7CA 2ZGYA 4CJEA 4C8LA 1OVQA 3AA5X 1LWEA 1IG8A 1KAYA 3ZSRA 3QBXA 3R3LA 3MK6A 4X64K 2XRIA 1LQQA 2XHBA 4Z4IA 1WSFA 4ICLA 4V1DC 2ATQA 1VQ7N 1ASUA 4W5OA 3QBWA 2P9NA 4HTLA 1XNRK 1BHLA 1WSHA 4OPJA 1ZBFA 2HHHK 1I39A 4I6MB 1RDCA 4B1UB 1W97L 1OH8A 1IV0A 3SNNA 4IO8A 5F2RA 4L3QA 3C65A 3I0RA 4BRCA 1Q86O 5JENA 3BK3C 3VGLA 3HPOA 3OYMA 1N36K 5E41A 3AVLA 2KLAA 1JCEA 1NKBA 4FVMA 4BRFA 4DR4K 2W40A 4NXMK 3OW2M 3VQEA 1YXQA 2O8EA 1TK8A 4DG1A 3IFRA 4ZTFA 5AQPA 3I0SA 1M1KO 2E4LA 3ZSQA 3HP9A 4E3SA 1S3XA 3PIPL 3VETA 4LFBK 4Z4HA 4DV7K 2E1YA 2VYPA 3BY5A 3V9XA 4FJ5A 4PY5A 1Q82O 4IDKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CQY A;  3E9L A;  5KGX A;  1VQM N;  3QO9 A;  2N2Q A;  3MN9 A;  3VGM A;  3LDO A;  2O8B A;  4FJ9 A;  3A0I X;  1KAX A;  5AQG A;  2P9K B;  3DWL A;  2O4I A;  3O4N A;  1Y64 A;  3VGK A;  4JAX A;  5M1K A;  3CCV N;  5M1F A;  4RW4 A;  1TKD A;  4C8K A;  4BRA A;  4F4K A;  4H03 B;  3KP0 A;  3VF4 A;  4BE7 B;  4M3R A;  3S9H A;  2QM1 A;  1D8Y A;  4M42 A;  4IEI A;  4KH6 A;  2O8B B;  1JJ2 M;  4CHN A;  4M3X A;  3AVC A;  3TU5 A;  1REV A;  1VQL N;  4DU4 A;  3AVJ A;  2ITG A;  3HJF A;  1SAZ A;  2JGU A;  3ALY A;  4DCH A;  5KTQ A;  4CJK A;  3QEV A;  4KI4 A;  1A5W A;  2HBL A;  1ZBI A;  3CCL N;  5FRM A;  1HRH A;  2PBD A;  4F2R A;  3DOL A;  1RCH A;  3V4I A;  2WFB A;  1TK0 A;  4CFA A;  3KD1 E;  4MDA A;  3LM2 A;  5AQN A;  4GVE A;  3AVN A;  2ZJR L;  3C7N A;  3O1W A;  3QER A;  1WBD A;  4CJP A;  2CH6 A;  1HNI A;  3CMA N;  2HHQ A;  1LAW A;  3IS9 A;  1BQM A;  4F3O A;  1EO1 A;  3RRG A;  3L6Q A;  3WNH A;  1NGB A;  5I3U A;  5BRE A;  2J4R A;  4JK7 A;  2DFE A;  4FM2 A;  1NNE A;  5C10 A;  1XHZ A;  3C7N B;  4HWI A;  5JVG L;  4WE1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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