3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
5AQJA 5EOYA 1V4TA 5AQIA 1ZBSA 1T44A 4CBWA 3DXMA 4M7YA 1Q18A 3UE5A 3VEZA 3QMLA 4HTLA 2ASPA 4JHDA 1TUYA 1Y64A 4FL9A 1JCFA 3BEXA 4QS9A 3CETA 4YDUC 4BRGA 3VGLA 3ID8A 3KVGA 4I6MB 3W0LA 3CHWA 2D4WA 3ZETA 1GLCG 3R9PA 4XH1A 5KPRA 3VEVA 4CZJA 1NGGA 3LDPA 2OANA 4MLHA 2E2OA 4K42A 2FF6A 3D2EA 2YCHA 3R6MA 2FSKA 2EWSA 4M7XA 1YUWA 1NWKA 4CBXA 4O5FA 3A5LC 3I33A 3WXLA 5AQXA 1ZXOA 4AM6A 4O8KA 1KAXA 1X9JA 4WYBA 3MN9A 4IWVA 3HZ6A 4H0XB 4FPAA 2H3GX 4WQ4A 1YAGA 4FSVA 4FWSA 4ISFA 4CD3A 5BN9A 1DGKN 5LY3A 3RSEB 3U8XA 2Q1NA 3A5NC 4K25A 3ZEUA 2CGLA 3FE1A 1XC3A 1ATSA 5LJWA 3GOIA 1WOQA 4BC2A 3ZX0A 1NM1A 1CZAN 2VCPA 1C0FA 3UKUB 5FPDA 3ULEA 2P9SB 2A42A 5AQVA 4CZIA 3CIPA 2YHXA 2NZTA 1T6DA 4H0PA 5AQHA 3SJHA 5B8HA 1XUPO 3FZKA 3CJ7A 4EAHD 3VEXA 4BG9A 4FWNA 1K8KA 5FPNA 3TPQA 2KHOA 1SAZA 3VESA 5AZJB 3O80A 4JN4A 4CZLA 3U4LA 2ASMA 1NGEA 1GLAG 3S41A 4FWKA 3VF4A 3R8EA 5BN8A 2FSJA 1YXQA 2VYPA 4QS7A 1DEJA 2YHWA 1V4SA 1X3NA 1E4FT 3GDQA 3CJAA 1JCGA 3UB5A 1Z6RA 3A8YA 1HUXA 3VPZA 1BUPA 1R59O 2D0OA 3A0IX 2A40A 1SQKA 4A2AA 2E1YA 2QWNA 3FZMA 3BP8A 2YI1A 3QBWA 3UKRA 1IJJA 4JD2B 2P9NB 5E84A 4Y0WA 3SLCA 2W40A 1MWMA 4NO7A 3KHYA 2ASOA 2E88A 1HLUA 2P9KB 4FWRA 1QZ5A 3HI0A 3D7EO 4BC4A 5TKYA 2E8AA 2VWBA 4XEIA 5E26A 5AQQA 2GWKA 2P9PB 4BG8A 3DJCA 1NGCA 2WUSA 3JS6A 4FWPA 1DKGD 3VF6A 3LDLA 3AARA 3QFUA 2NRHA 4XH5A 2GWJA 3OHRA 3DXKB 5AZIA 5FPMA 2A41A 3O4WA 2P9LA 2QW9A 2V7YA 4EIAA 4BR0A 5KPZA 4ISGA 1GLBG 3AAPA 2I7PA 5AFUH 4BRAA 1NMDA 2E2QA 3M1FA 4BRQA 3C7NB 2FLOA 3WEEA 3WQUA 1YVNA 4CZMA 2F9TA 3O1WA 4B1ZA 2QM1A 4CZKA 1BA1A 3CQYA 5AQPA 3D2FA 4C23A 3L6QA 4BQZA 5AQRA 3RSEA 3O6WA 2GELA 5AFUA 3JXUA 4JAXA 3MN5A 4H0VB 3L0QA 1HKCA 4LC9B 1WUAA 4EFHA 4A62A 2A6AA 4CBUA 4JNEA 3U9DA 4KBOA 2ZF5O 2YHYA 5AQSA 2YJFA 4EHUA 1GLLO 2Q97A 4YDUA 4RWTA 3QFPA 4DCHA 5JICA 2IVOA 3ATVA 4K41A 5AQOA 1OKJA 3F9MA 4K43A 3M3ZA 1U2VA 3HM8A 3VF2A 3C0BA 3GG4A 4PL8A 5AQWA 3DXMB 3A5OC 4PKGA 1TYQA 3VENA 4H5VA 3EKUA 4JHDB 4FPBA 4BRNA 2ZGZA 3CJCA 5JLFA 3EO3A 4BR7A 3B8AX 1NGFA 2UYTA 3EL2A 4BREA 1MWKA 4H0OA 3TU5A 5JLHA 4PKIA 3ZETB 2A3ZA 2P9IB 4AM7A 1X3MA 3IDHA 2HF4A 4CJ7A 2FSNA 1U6ZA 4H5NA 4BROA 4FWMA 3MK6A 3D2EB 3L4IA 4DQ8A 4CD1A 3SMPA 4J8FA 1HJOA 2P9UA 4B9QA 3BF1A 3O08A 4BRIA 3DAWA 3ZX2A 4BC3A 1LOTB 3BUZB 4XH4A 4FOIA 1GLDG 2Q2RA 3A5MC 3FR0A 3CJ1A 3VGMA 2E2PA 1BWFO 4IZ9A 2V51B 5BPMA 2Q0UA 2V52B 5AQLA 4H5TA 5F0XA 1MDUB 2CGKA 4BC5A 4EHTA 3KZBA 3ZEUB 5KQ8A 5CE3A 1QQOA 4HWIA 1HKBA 1QQNA 5AR0A 2QWMA 1GLJO 2J4RA 4BR9A 4BRKA 4GNIA 3MN6A 3CI5A 3ULEB 5FPEA 5AQKA 3GE1A 2CH5A 3H1VX 5AQGA 1NGHA 5BREA 1ESVA 1T6CA 4BR5A 3CERA 3IMXA 2PAVA 1K8KB 4I6MA 1HX1A 3CJBA 1C0GA 4B1XB 1QQMA 1S3XA 1BA0A 2Q36A 5I9EB 4FWOA 3SK3A 1BOTO 3ENOA 5BRDA 4ISEA 3WXJA 3CQXA 3HTVA 3ENHA 5EVZA 3H1QA 1KAYA 2IVNA 2IIRA 3SMSA 2QWOA 3FGUA 3J8AA 4CZHA 1NGAA 3H3OB 2Q0RA 4FO0A 1Z05A 4CI6A 2QWQA 5F1XA 1D4XA 4FOEA 3AAQA 4PL7A 3LDOA 3VEWA 2QWRA 4WQ5C 3LM9A 3HBTA 2QWLA 1RGIA 1MA9B 2AA4A 3AY9A 3UKRB 4RCHA 3MDQA 3VGKA 3FFKB 3O1BA 4BRLA 1G99A 5ADXA 5BRHA 2CH6A 3O8MA 3VERA 3M6GA 1ATRA 4BR4A 4A2BA 4CZFA 1RDWX 4RTFD 2E1ZA 3BF3A 4BRHA 5AQFA 2ZGYA 3UKUA 4WQ5A 3MN7A 2P9SA 5LJVA 2GEMA 1GLEG 1NBWA 2GUPA 1BU6O 2P9IA 4MO5A 4H03B 3MMVA 4H5RA 5EXWA 3O5BA 5AZIB 4WQ4C 5BPNA 1NGBA 2P9LB 3P4IA 2FXUA 4F9OA 5AZJA 4B1UB 3FLCO 3EKSA 2HOEA 1BG3A 4Z94A 1E4GT 2IVPA 1QHAA 5AQZA 3G25A 3QICA 3WEEB 2W41A 3IUCA 4CZGA 4A61A 4BR2A 4MLEA 1GLFO 2HMPA 3D2FB 1H1VA 4BGAA 3EN9A 4BVPA 5F2RA 4M63C 3ZX3A 3LDNA 5AQMA 4B1VA 4DHYA 3WQTA 1JCEA 2YJEA 3H6EA 4H0YB 1KAZA 3VETA 3QBXA 4BQLA 4JD2A 2P9NA 5BPLA 5EY4A 2Q31A 3WUHA 4BVOA 4BRFA 2P9KA 3VEYA 5KPTA 4BRMA 1SZ2A 3FZFA 3WXKA 4IJNA 4CZEA 2BUPA 2GTDA 3WXIA 3FZLA 3LDQA 2E2NA 1BDGA 2D0PA 2HF3A 2P9PA 3IFRA 5AQYA 1QZ6A 1U2VB 1P8ZA 3LM2A 3GL1A 4FWQA 4IO8A 2QXLA 1BO5O 1ATNA 2AP1A 2F9WA 4BRPA 1KXPA 3QB0A 1EQYA 3DXKA 1TYQB 2A5XA 2E20A 4BRDA 5ELZA 3U9ZA 4BGBA 3I8BA 4B1WB 4H5WA 4IXCA 2QWPA 4MO4A 4DB3A 3C7NA 5AQUA 3VEOA 5KQDA 1RFQA 1ZC6A 3H3NO 3HSCA 3EZWA 4BRCA 1IG8A 4H0TB 5JMVA 3H46O 1NGDA 1XQSC 4NB4A 3W3DA 1HKGA 1J6ZA 5BRFA 5BR9A 3LL3A 3WT0A 1TUUA 1LCUA 3FZHA 1S22A 3H45C 2P9UB 1NGIA 2ZWHA 1HPMA 3QDKA 2FF3B 2NLXA 3DWLA 4L3QA 1NGJA 4FWLA 2DPNA 2V7ZA 2BTFA 3VOVA 2PBDA 5ADXH 4GY2B 4QS8A 5AQTA 3CJ9A 3ATUA 4B1YB 5EX5A 4IJAA 4E1JA 1NLVA 5AQNA 2I7NA 2ITMA 3GBTA 3MCPA 2D1KA 2CGJA 4PKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OY9A 1V4TA 3DXMA 5J2NA 3NMUA 3HPOA 3QMLA 4DFPA 4FM1A 4HTLA 2KBKA 4FJNA 5HRSA 3D6RA 5GIPA 1JJ2M 4QS9A 3B6PA 4ID5A 3CETA 4YDUC 4JI1K 3K5NA 1FKOA 1L5UA 3CHWA 3WXMB 1LQIA 5KPRA 4FJIA 1NGGA 3LDPA 1BQMA 4YHHK 5CY4A 3OTOK 4V1DC 4LF8K 3D2EA 2YCHA 5KTQA 4MDAA 3R6MA 4CBXA 2IS3A 1BI4B 3WXLA 5HLFA 1SL0A 4JI5K 1ZXOA 4O8KA 4HHFA 3HJFA 4IWVA 2N2QA 1RCHA 5HRRA 1HRHA 4DSIA 1WB9A 3U8XA 3NCIA 3V1QA 4KV8A 2Q1NA 2VGNA 4FJGA 1OZZA 1ATSA 1BQNA 3TANA 5LJWA 4DTNA 1T05A 1WOQA 1A5VA 1SL2A 1NJIO 1I94K 4KTQA 4Q0BA 4DU4A 5HOOA 5FPDA 4LD0A 3QEPA 4KHWA 2F96A 2B3CA 2A42A 3AV9A 3CFPA 4CZIA 2HHQA 2YHXA 4JK7A 1WSGA 2ZJPL 4H0PA 5B8HA 1P90A 4EAHD 4JYAK 3VEXA 5C2DA 4FWNA 1K8KA 1ZBLA 5FPNA 3TPQA 4DQPA 1SAZA 4DG1A 1WT7A 2YBRC 3U4LA 2B6AA 2KYQA 1NGEA 2HBLA 3V6DA 3LZIA 3AA2A 3R8EA 2VY6A 2YV0X 2VYPA 4GVEA 4W5RA 4FZYA 3CQ8A 1XC9A 4M3RA 4CJEA 3VPZA 4IEIA 3CPWM 1N6QA 1BUPA 3CM5A 1SQKA 2E1YA 3FZMA 3U3YA 1VNAA 4FLXA 4OX9K 4QOZB 3F5TA 3UKRA 2LR3A 4Y0WA 4CJRA 4BE0A 2BH1A 1HLUA 3M5RA 4FWRA 1EWRA 4CK1A 3SPZA 3OYNA 4YOWA 1S9EA 3NVKA 2VWBA 2GWKA 5SZTA 4ICLA 3KK2A 3IS9A 4C8LA 1DQ7A 3AVJA 1T7AA 2G8WA 3AARA 2BE2A 3VQDA 2GWJA 3OHRA 2KFNA 3DXKB 4B8CA 1WAFA 3O4WA 3AGRA 2P9LA 2QW9A 1VAZA 3M8SA 3CF5L 2I7PA 1NMDA 2E2QA 4BRQA 4CZMA 3KHWA 4B1ZA 3O1WA 3EZ5A 1SKRA 4DSJA 4J2DA 2K35A 2QM1A 1BA1A 3KOXA 4N47A 3RSEA 5AFUA 4CVNE 4JAXA 3HO1A 4JI8K 1YTAA 3L0QA 2UUCK 1YTUA 4KB0A 2YKMA 2XY7A 3U9DA 2ZF5O 3NVMA 4CIFA 4JRPA 3I0RA 4YDUA 3QFPA 3OYFA 4DCHA 3ATVA 3NGYA 5AQOA 4K43A 1CHZA 5J2MA 3OA9A 4V19S 1U4BA 4B9VA 4DV0K 4IEEA 3ZT4A 4KHPK 4CFCA 3DXMB 2KGQA 2IDOA 3AVIA 2W6KA 3THYA 2F7TA 3VENA 1RBVA 4H5VA 2O8EA 4BRNA 4DTSA 4ZTJA 1S6QA 5JENA 2RE2A 4M45A 1T03A 3U6FA 3PIOL 5JLHA 1VQMN 4PKIA 2OCEA 1NJXA 4OO1J 1HNWK 2P9IB 3THXB 3T1YK 3I8DA 3TAFA 4H5NA 1NOZA 4B9SA 4U7BA 4N5SA 3D2EB 1NE5A 3L4IA 4DQ8A 1TKXA 1N4NA 1WSHA 3VA3A 4B9QA 3TWHA 2LY6A 3A2FA 1BHLA 1TVRA 4BRIA 1XI1A 2G2KA 3ZX2A 4BC3A 4DMNA 4CJWA 3BUZB 4XH4A 4DFMA 4FOIA 4HUEA 4C8KA 2KQ2A 3R2VA 4CK3A 1BWFO 3VQAA 5FDLA 2V52B 3K5OA 5GAHP 5F0XA 4BC5A 5C15A 4LF4K 1Q86O 5CE3A 1NRBA 1QSSA 4NCBA 1ZVGA 2A7TA 3KLFA 1K8AO 1GLJO 3RVCA 3CI5A 1RT2A 5FPEA 5AQKA 5E41A 3AVBA 3RMAA 2CH5A 1LQHA 4YOUA 4E0DA 3F2KA 3NGIA 1J9AA 1K8KB 4I6MA 2G8FA 3CJBA 3PSMA 4FW1A 2Q36A 1S3XA 3AA5X 3M8PA 5CR4A 4FWOA 1I39A 3U3GA 4Q5VA 3S5TA 4LY7A 4C8OA 3CQXA 4FLVA 3P83D 5EVZA 3H1QA 3R3LA 1L3UA 2IVNA 4CZHA 4OPJA 1BCGA 1Q9YA 3H3OB 4CJ3A 1ZFUA 4O8UA 2OPPA 3KOYA 2GL1A 2KW4A 4WF9L 4DTXA 5F1XA 1D4XA 4CHYA 2EX3A 3AAQA 3ZSWA 2E5LK 3HBTA 2P1JA 4CJFA 3UKRB 1RBRA 3IG1A 3O9QA 4IG3A 3HL8A 1JZAA 4FCYA 2B5JA 1LV5A 1OH5A 4KH6A 1FJGK 1G99A 5BRHA 3O8MA 3M6GA 1QTMA 3E7RL 4BR4A 1RDWX 3F9KA 2E2FA 4BRHA 4DV4K 2ZGYA 4IFVA 4WQ5A 1ZVEA 3NF9A 1DLOA 2D0BA 1NBWA 3CCSN 3PO4A 2G8VA 4H5RA 5EXWA 2P9LB 2W42A 1YJNN 4ELTA 4CGJA 4CGFA 2HOEA 2DFEA 1E4GT 3LP2A 2N66A 1I6GA 3IUCA 4M3WA 4A61A 4MLEA 3DLHA 4GMJB 3CMEN 1MYNA 3HSTB 3M8QA 3KLEA 4Z4IA 3C6TA 1GOAA 5C42A 3LDNA 3CFOA 5AQMA 2Z1HA 4F3OA 1TK0A 3PY8A 4EP4A 1MU2A 4H0YB 3OYLA 3VA0A 1T0ZA 1KQSM 3QBXA 4BQLA 4JD2A 2P9NA 2C1GA 4CJSA 1WAJA 2EHGA 5EY4A 2Q31A 2KKZA 4X65K 4BVOA 5IT9O 5KPTA 1VQ4N 3I56N 3TTCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3OY9 A;  1V4T A;  3DXM A;  5J2N A;  3NMU A;  3HPO A;  3QML A;  4DFP A;  4FM1 A;  4HTL A;  2KBK A;  4FJN A;  5HRS A;  3D6R A;  5GIP A;  1JJ2 M;  4QS9 A;  3B6P A;  4ID5 A;  3CET A;  4YDU C;  4JI1 K;  3K5N A;  1FKO A;  1L5U A;  3CHW A;  3WXM B;  1LQI A;  5KPR A;  4FJI A;  1NGG A;  3LDP A;  1BQM A;  4YHH K;  5CY4 A;  3OTO K;  4V1D C;  4LF8 K;  3D2E A;  2YCH A;  5KTQ A;  4MDA A;  3R6M A;  4CBX A;  2IS3 A;  1BI4 B;  3WXL A;  5HLF A;  1SL0 A;  4JI5 K;  1ZXO A;  4O8K A;  4HHF A;  3HJF A;  4IWV A;  2N2Q A;  1RCH A;  5HRR A;  1HRH A;  4DSI A;  1WB9 A;  3U8X A;  3NCI A;  3V1Q A;  4KV8 A;  2Q1N A;  2VGN A;  4FJG A;  1OZZ A;  1ATS A;  1BQN A;  3TAN A;  5LJW A;  4DTN A;  1T05 A;  1WOQ A;  1A5V A;  1SL2 A;  1NJI O;  1I94 K;  4KTQ A;  4Q0B A;  4DU4 A;  5HOO A;  5FPD A;  4LD0 A;  3QEP A;  4KHW A;  2F96 A;  2B3C A;  2A42 A;  3AV9 A;  3CFP A;  4CZI A;  2HHQ A;  2YHX A;  4JK7 A;  1WSG A;  2ZJP L;  4H0P A;  5B8H A;  1P90 A;  4EAH D;  4JYA K;  3VEX A;  5C2D A;  4FWN A;  1K8K A;  1ZBL A;  5FPN A;  3TPQ A;  4DQP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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