3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Chaperone
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
4BRAA 5BRHA 3ZETA 3VEZA 1NGJA 5AQOA 3WQTA 3AARA 4H5WA 1U2VB 2Q0RA 2KHOA 5AQVA 4AM6A 4BRIA 2P9UB 1NM1A 4BVOA 4H5VA 1X9JA 3VESA 3U9ZA 2CGLA 3QBWA 3SMPA 1QZ5A 2P9IA 2E88A 4FWNA 4O8KA 3O6WA 4B1UB 4CZJA 2GWKA 4QS9A 5AFUA 3A5OC 4F9OA 5BN8A 3CJCA 3R6MA 5AQLA 3VF6A 3HZ6A 5BRDA 3LDNA 1HJOA 3CHWA 4FOEA 4FWLA 2UYTA 4BRGA 2A3ZA 3QICA 5BPLA 5AQRA 5FPEA 3WXJA 1G99A 3O08A 2AA4A 2Q97A 2VYPA 1U6ZA 1QHAA 1BWFO 4JN4A 2Q1NA 4BR7A 4FOIA 3L6QA 2IVNA 3DXKB 3O80A 3WT0A 3CQXA 2V52B 3LM9A 3KVGA 4JHDB 4L3QA 4Z94A 3EO3A 4BRPA 4ISEA 3QFUA 3D2EA 4QS7A 4A62A 3VF4A 4JAXA 3FE1A 4ISGA 2Q31A 1YAGA 2P9NA 4CZKA 1TUYA 1WOQA 1GLDG 1V4SA 3KHYA 1YXQA 4PKIA 3J8AA 3IMXA 5LJVA 2ZF5O 2E8AA 2I7NA 2YCHA 4M7YA 3FZLA 3WXKA 3VENA 3HBTA 1SAZA 1XQSC 2D4WA 4BC4A 4BC3A 3FZHA 4XH1A 5AZJA 1BA1A 2P9LB 1Z05A 5AQPA 4MLHA 3IDHA 2V7YA 3CJAA 2F9TA 1H1VA 4KBOA 4B1WB 4FWPA 1QQOA 4IXCA 4WQ5A 4BRQA 4BRDA 3HTVA 5FPNA 1ZC6A 3MMVA 4BRMA 4BG9A 4JD2A 4FO0A 3LDQA 4RCHA 5E26A 4DHYA 1NGAA 4IO8A 4CBXA 4H5RA 2FLOA 5KQDA 1HKGA 2QWOA 3BUZB 5KPZA 2YHWA 3FR0A 3ZEUB 4A2AA 2GUPA 4BR2A 4EFHA 1QQMA 3GL1A 3CERA 4I6MA 4PKGA 3CETA 4BRNA 1YVNA 3SMSA 3F9MA 4FWKA 5KQ8A 3VEVA 4YDUC 4CZGA 4GY2B 2GELA 4CZLA 5E84A 1IJJA 1NGBA 2D1KA 2HMPA 4BR4A 3TPQA 1ATNA 1KXPA 5AQTA 4FL9A 3H1QA 1NGIA 1MWKA 3WEEB 2YHYA 5JLHA 5AQYA 2D0OA 1EQYA 3GDQA 3L4IA 2QM1A 3H3OB 4WQ5C 2J4RA 1NGHA 1QZ6A 3A0IX 5BRFA 4CD3A 2V7ZA 3I33A 2P9SA 5AQXA 3GE1A 3LL3A 2A41A 2FXUA 4LC9B 4K41A 4XH5A 4B1YB 1QQNA 1X3MA 3MN9A 3RSEB 1NGGA 4BC2A 4QS8A 3ULEB 3LDPA 1MDUB 1E4GT 2BUPA 2P9LA 5FPMA 1JCFA 2DPNA 4H0YB 4CZMA 4B1VA 3H46O 5LJWA 2P9PA 3VGKA 1BU6O 3QDKA 3A8YA 3FZKA 2NLXA 4MO5A 3JS6A 3C7NB 3UKRB 4BREA 1SZ2A 2YJEA 3M3ZA 4EAHD 1OKJA 3KZBA 4HWIA 1Z6RA 3U8XA 3GOIA 5AQZA 2E1YA 4FPBA 4FWRA 1BOTO 1MWMA 3VEYA 4FWOA 4H5TA 1TYQA 3R8EA 4BQZA 2V51B 4CD1A 4ISFA 5JLFA 2QWNA 2E2PA 4A61A 4BVPA 3S41A 2E2OA 5AR0A 4H0TB 3SJHA 5AQQA 1KAYA 3UKUA 3DXMA 4NB4A 1BG3A 4BR9A 4BC5A 3AY9A 1NGCA 5JICA 4MLEA 5F0XA 4H03B 1GLAG 2GEMA 1U2VA 3H3NO 5EVZA 4FSVA 2OANA 1HUXA 1RDWX 2FSNA 3DWLA 3O4WA 5AQNA 3OHRA 4H0XB 3EKUA 2P9UA 4YDUA 5LY3A 1NGEA 4K42A 4B1XB 4M7XA 1T44A 2E2NA 4BRHA 4DB3A 2NZTA 4EHUA 1MA9B 4BGBA 3VERA 4CZFA 3SK3A 5B8HA 1NLVA 2W40A 3GBTA 3ZX3A 5EXWA 1GLFO 1ATSA 2IIRA 3WQUA 2ZWHA 3WXLA 3ZETB 1P8ZA 4A2BA 1S3XA 3C7NA 1HX1A 3UKRA 3VOVA 4BRKA 4CZEA 1XC3A 4BRFA 2A40A 3JXUA 5EX5A 3CIPA 3BF3A 3CJBA 4J8FA 3A5MC 3MCPA 3VF2A 3MN5A 1NMDA 3CI5A 4CBWA 3QBXA 2QWRA 3A5NC 3HSCA 1LOTB 4GNIA 5ELZA 2W41A 3DXKA 1JCGA 3WUHA 1KAXA 3D7EO 3QB0A 3VETA 2QWQA 3ENHA 4JHDA 3W0LA 4BR5A 1KAZA 2FF3B 3QMLA 2PBDA 2CH5A 3H6EA 3B8AX 5EY4A 1BUPA 2QWMA 4B9QA 3ID8A 5AQWA 3BF1A 3ATVA 4WYBA 1Y64A 2FF6A 4DQ8A 1DKGD 2FSJA 5AQHA 3D2FB 1NBWA 3U9DA 4B1ZA 4FWQA 3FZMA 2Q2RA 3FGUA 4HTLA 4K43A 3AAQA 3O8MA 2P9KB 3UE5A 2ASOA 3CQYA 2E1ZA 1WUAA 3ENOA 4CJ7A 2P9NB 3LM2A 2ASMA 4EIAA 2CGJA 1T6DA 5AQJA 4H0PA 5F2RA 5BPMA 5AQFA 1HKBA 3ZX0A 2GTDA 3O1BA 2E20A 3O5BA 2CH6A 3EKSA 5AQMA 3AAPA 2YI1A 3FLCO 3VEOA 4C23A 5BR9A 2D0PA 3HM8A 4FWMA 1HKCA 5TKYA 4BRLA 4BR0A 5AQUA 3SLCA 3ZEUA 5AZIB 3M1FA 3FZFA 5AZJB 5ADXH 2CGKA 5BREA 5EOYA 4BROA 5AQSA 2QW9A 4K25A 3QFPA 3I8BA 2PAVA 2A6AA 4JNEA 3IFRA 4WQ4A 5AQKA 4XEIA 4CZIA 2EWSA 2A42A 2A5XA 5JMVA 3EZWA 3M6GA 4JD2B 4BG8A 4BRCA 4PKHA 2VCPA 3U4LA 4EHTA 3VGLA 1X3NA 3WEEA 3TU5A 1C0GA 4H0OA 1DEJA 1DGKN 4I6MB 1YUWA 3D2FA 1Q18A 3VEWA 4IWVA 2ZGZA 1RFQA 2E2QA 4AM7A 5AQIA 4FPAA 5BN9A 2QXLA 3H1VX 1BA0A 1K8KB 2P9KA 4MO4A 1C0FA 2AP1A 1T6CA 4H5NA 3H45C 3RSEA 4IZ9A 3G25A 2F9WA 1GLJO 5AFUH 2Q0UA 3ULEA 4BGAA 2HF4A 3LDLA 5CE3A 3C0BA 3WXIA 1GLLO 1E4FT 1NWKA 3UB5A 4WQ4C 3VPZA 3P4IA 2ASPA 3O1WA 1BO5O 1CZAN 5F1XA 5FPDA 3BEXA 4DCHA 4M63C 2YHXA 2P9SB 3L0QA 1ESVA 3EN9A 5I9EB 3VEXA 3GG4A 2ZGYA 2QWLA 4PL7A 4CI6A 5AZIA 1S22A 2P9IB 3BP8A 1ATRA 1NGFA 1V4TA 4FWSA 3CJ9A 3R9PA 4Y0WA 3W3DA 2HF3A 2P9PB 4PL8A 1LCUA 2NRHA 4H0VB 1SQKA 1J6ZA 2ITMA 2IVOA 5KPRA 2IVPA 1GLEG 1BDGA 1TUUA 1GLCG 1HLUA 4NO7A 3CJ7A 5BPNA 3HI0A 2I7PA 2QWPA 3ATUA 1ZBSA 3MN6A 1D4XA 3VGMA 1HPMA 1ZXOA 1IG8A 5KPTA 2Q36A 3IUCA 3A5LC 4RTFD 3LDOA 2FSKA 1TYQB 4IJAA 1NGDA 2HOEA 1XUPO 4IJNA 1JCEA 3MDQA 4CBUA 3MK6A 3FFKB 3CJ1A 4O5FA 4BQLA 1K8KA 2WUSA 3ZX2A 5ADXA 2H3GX 2VWBA 1R59O 4E1JA 3D2EB 2GWJA 4RWTA 2YJFA 1RGIA 4XH4A 3MN7A 4CZHA 5AQGA 3EL2A 3UKUB 3DXMB 2BTFA 1GLBG 3DJCA 3DAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CXCM 3Q7BA 1NGJA 3ZT3A 3WQTA 4RW7A 2KFNA 4M3TA 5K14A 3C95A 3CCUN 1WSJA 4X66K 5CHIA 4DSIA 4JI0K 3LWLA 3V9ZA 4PQUA 4FWNA 3L3VA 4KHWA 3TTDA 4B1UB 2XY8A 4CK3A 4QS9A 2IOCA 2K35A 5AFUA 3AVBA 4F9OA 4ELVA 5BN8A 1X9MA 1ZYQA 4FJLA 2W42A 3VF6A 4KPYA 3U3GA 4AHCA 2PZSA 3QINA 1VSDA 3LDNA 1B92A 2ZE2A 1TK8A 1EXQA 3QICA 1G99A 3LP2A 2UXBK 2BH1A 2Q97A 2VYPA 4QAGA 3SJJA 5BR8K 1VQON 3PLAA 4IKFA 1OH7A 4BR7A 3L6QA 3M8QA 3BGRA 4KV8A 3R1XA 3CQ8A 3LM9A 3VF4A 4JAXA 2N66A 2VY6A 1ZUTA 3VQCA 2Q31A 1YAGA 3IKMA 2WC9A 1UAXA 1KD1O 3C6TA 1SV5A 2FBVA 1RDCA 5KGWA 3HT3A 3PV8A 1NJYA 5M1QA 4CHNA 3KHYA 5HROA 4PKIA 4JYAK 4OGCA 1WAJA 3IMXA 5LJVA 4M41A 4U67L 4KO0A 4BE7B 4UY8O 1T7EA 1SN1A 4M7YA 3FZLA 4PY5A 1XQSC 2D4WA 2O8FA 1TK0A 3T1AA 5AQPA 3PY8A 5HRRA 2P1JA 2V7YA 1H1VA 1QQOA 3S3OA 1SKSA 5FPNA 4BRMA 4BG9A 1REVA 1U48A 4JD2A 3THYA 1NGAA 3AVKA 4CBXA 4H5RA 4G9ZA 3HVTA 2QWOA 1KRPA 4UAFE 3FR0A 2GUPA 1RDDA 1QQMA 3GL1A 2QEXN 3KKRA 1YVNA 3SMSA 3KP1A 3KOYA 4X64K 1KVCA 1GPTA 4F2RA 4CZGA 1CZBA 3VA3A 4CZLA 4EP5A 2UUBK 1NGBA 3O9TA 4BR4A 3TPQA 1KXPA 4FL9A 3H1QA 3WEEB 4BWMA 3AGRA 3MXMA 3SQ0A 5JLHA 2D0OA 1CHZA 3AGKA 4JI6K 4CEAA 3H3OB 5C15A 4DQPA 2J4RA 3BDPA 1PTXA 2HBLA 2YIOA 3AA4A 3OYKA 2GX9A 3OYJA 5C24A 2ASCA 1TKXA 5AQXA 3DLKA 2A41A 1TKTA 3P1GA 2FXUA 4K41A 4DMNA 1F21A 3AO1A 3E01A 4M3YA 4BC2A 5GAHP 1WNSA 4OVLA 1A5VA 1E4GT 3TANA 1KCFA 2P9LA 3M8SA 4H0YB 1VSMA 3L2UA 3H46O 3AVFA 1ASUA 2QXFA 3VGKA 3AA3A 3THWB 1BU6O 3QDKA 3LAMA 1HNZK 3C7NB 4M42A 4CK1A 3S3NA 4EAHD 1NK4A 2RF2A 3I56N 1HNVA 4DG1A 1VQ9N 2D0CA 4OO1J 1Z6RA 4ICLA 1ZBIA 3NH1A 4FPBA 1TYQA 4BQZA 3T19A 1OVYA 4I2PA 1K73O 4FJNA 3TAPA 2O4IA 5C25A 4KTQA 1T03A 2F7TA 3S41A 4CJRA 1I6FA 1SS6A 4CEEA 4W5TA 5JICA 4MLEA 5F0XA 4LF6K 4Z4GA 1P0AA 4FZYA 3H3NO 4NYNA 3OYDA 4FSVA 2OANA 2ZJRL 2FSNA 4ZTFA 5J2PA 5LL6Z 3OY9A 3KOZA 4RW8A 3HJFA 2NY8X 2D0AA 1NGEA 1T3VA 4M7XA 4A5BA 4V19S 4C8MA 4BGBA 3MX5A 4K8ZA 3SK3A 3LANA 5FRNA 1POIA 3NE6A 2KW4A 4FM0A 3N4PA 2ZWHA 2KJAA 1W2BM 1P8ZA 1NPIA 2N69A 4BRFA 4W5OA 4E19A 3CCRN 3NH0A 4RW4A 3AO3A 3G10A 5HL7L 1B9DA 5EX5A 3OYGA 4JKGB 2B68A 1NK5A 4FJ5A 3A5MC 3VF2A 4C8OA 1NMDA 3CI5A 4QCLA 1NK0A 4ILHA 4KFBA 5CYMA 3NGYA 2O4GA 4BWJA 3KJVA 1I94K 1KAXA 1NKEA 2HNYA 4JHDA 4BE2A 3W0LA 1VQNN 3QMLA 4JEPA 3H6EA 2OPSA 1BUPA 2QWMA 4F2SA 5AQWA 3WNGA 3ATVA 4CJ3A 3VN5A 1EX4A 4FK4A 3I0RA 4CE9A 1VQ6N 1TK5A 5AQHA 5KK4A 3NH2A 1NBWA 3CCJN 4B1ZA 2HHUA 4ZTJA 3FGUA 3SF4D 4KH4A 3OYHA 4FLTA 3TAGA 2P9KB 4NCBA 1WUAA 1WN7A 4YOUA 3NF7A 1YITN 2O8DB 1SN4A 3ENOA 3S9HA 4CJ7A 2B6AA 2DFFA 2WFBA 2P9NB 4IFEA 2ASMA 2BGGA 1T6DA 3D45A 4RG8A 4H0PA 3K0SA 4YOTA 4YOXA 2GTDA 4B9NA 3EY1A 2LT8A 2NRWA 3O5BA 2RE2A 1IG9A 4OKKA 4BR0A 4DR5K 5BREA 5EOYA 4BROA 4I7FA 2QW9A 1JL1A 4B9UA 2PAVA 4JNEA 4DTMA 2UXDK 2ZJPL 1SNBA 3P31A 2OTLN 2A42A 3O4QA 2WONA 3EZWA 3OYLA 4BRCA 3PIPL 2UUCK 1OMYA 3O9SA 2W6KA 4BDPA 3PX6A 3TU5A 4DTJA 2E3GA 1NRBA 2MZ0A 1ICAA 4HUFA 3DI6A 3O9QA 4EZ6A 3VQ6A 1YUWA 4X62K 1GOAA 5CZ2A 2ZGZA 4ID5A 1ZVEA 5DK5A 1M1KO 3H1VX 2N2QA 4HE7A 1XWLA 2FC0A 2QTDA 3NBPA 4DR1K 4IZ9A 2F9WA 1BI4A 3CW4A 4FK0A 2O8CA 1VQ7N 1AHOA 2MN5A 3LDLA 4ZHRA 3C0BA 3VTIA 3TTFA 3WXIA 4CEQA 2KFZA 3TWHA 3SV4A 3PO5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CXC M;  3Q7B A;  1NGJ A;  3ZT3 A;  3WQT A;  4RW7 A;  2KFN A;  4M3T A;  5K14 A;  3C95 A;  3CCU N;  1WSJ A;  4X66 K;  5CHI A;  4DSI A;  4JI0 K;  3LWL A;  3V9Z A;  4PQU A;  4FWN A;  3L3V A;  4KHW A;  3TTD A;  4B1U B;  2XY8 A;  4CK3 A;  4QS9 A;  2IOC A;  2K35 A;  5AFU A;  3AVB A;  4F9O A;  4ELV A;  5BN8 A;  1X9M A;  1ZYQ A;  4FJL A;  2W42 A;  3VF6 A;  4KPY A;  3U3G A;  4AHC A;  2PZS A;  3QIN A;  1VSD A;  3LDN A;  1B92 A;  2ZE2 A;  1TK8 A;  1EXQ A;  3QIC A;  1G99 A;  3LP2 A;  2UXB K;  2BH1 A;  2Q97 A;  2VYP A;  4QAG A;  3SJJ A;  5BR8 K;  1VQO N;  3PLA A;  4IKF A;  1OH7 A;  4BR7 A;  3L6Q A;  3M8Q A;  3BGR A;  4KV8 A;  3R1X A;  3CQ8 A;  3LM9 A;  3VF4 A;  4JAX A;  2N66 A;  2VY6 A;  1ZUT A;  3VQC A;  2Q31 A;  1YAG A;  3IKM A;  2WC9 A;  1UAX A;  1KD1 O;  3C6T A;  1SV5 A;  2FBV A;  1RDC A;  5KGW A;  3HT3 A;  3PV8 A;  1NJY A;  5M1Q A;  4CHN A;  3KHY A;  5HRO A;  4PKI A;  4JYA K;  4OGC A;  1WAJ A;  3IMX A;  5LJV A;  4M41 A;  4U67 L;  4KO0 A;  4BE7 B;  4UY8 O;  1T7E A;  1SN1 A;  4M7Y A;  3FZL A;  4PY5 A; 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