3QHNA

Crystal analysis of the complex structure, e201a-cellotetraose, of endocellulase from pyrococcus horikoshii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNAPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
total genus 136
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qhnA00
1RD6A 1OD0A 2GVYA 5D9PA 1W9DM 4EAMA 2WMGA 3CH9A 4Y7EA 3M6DA 4UNIA 3WQ5A 3PN8A 4HA1A 1W1TA 1GJWA 3ZJ6A 4NF7A 1E71M 1US3A 1V3HA 3GBDA 4AISA 5I78A 1ITXA 4X0VA 1HL8A 2DT1A 2EPNA 5DT5A 5BROA 2W92A 3SUWA 3W24A 3AQUA 1E4LA 3OA5A 1HVQA 1VFOA 3QHNA 1W9PA 1Z32X 6TAAA 1G94A 1NWUA 3APGA 4D6EA 1JZ8A 3CUGA 3F5LA 1Q6CA 4CD4A 1CDGA 1B31A 4B9YA 4TVCA 4HP5A 1JIBA 2WM0A 1JL8A 1UH4A 1XH2A 2VCCA 7CGTA 2WHJA 1QVBA 1QBBA 1E3ZA 1G0CA 1CXHA 4GXPA 1OD8A 3N15A 2UWFA 1LF1A 1XCXA 1U2YA 5AY7A 5CPQA 4GO9A 4JIEA 5EFDA 1W9VA 5DT7A 2Z1SA 4W8AA 3T0AA 5DMYA 2A3EA 1E4NA 1IZKA 2CHNA 3I3DA 2CKRA 2XM2A 1DTUA 1E6QM 2ZX9A 1K9DA 1B3VA 1LG1A 2YDRA 2X1IA 4UOQA 4ZENA 5HDRA 4A3YA 1HJWA 3VX0A 1JYWA 2EXOA 3LPGA 1JD9A 1DWFM 2WKLA 4EANA 3WEMA 1RPKA 4IM4A 2E3ZA 4D1JA 2V5DA 5AC4A 4AYSA 3L4XA 2GFTA 3S6TA 1VBRA 5I3DA 3WDIA 4EKJA 3BAIA 3WNLA 1U30A 2CNCA 1E40A 3TP4A 1FHLA 3RJXA 1V3KA 2JEQA 4AC1X 1JFXA 4HPGA 4LYQA 3GZAA 1V3LA 3T08A 1DWAM 7TAAA 2DSZA 4CU8A 2XSBA 3ZJ8A 4F66A 1QW8A 1UWQA 3N11A 1JDCA 1QHPA 3LPOA 5A94A 1KQYA 1W3HA 2J7DA 3PTQA 3RO8A 2BY0A 4J7RA 2BVDA 1UHVA 1AMYA 4AZIA 4MB4A 1F4HA 1I1XA 1DWHM 2FDMA 2WHLA 5CGTA 2DGAA 4M80A 3AMGA 2J25A 5A6MA 2BFGA 2OWXA 3AMKA 3GXIA 3ZQ9A 3QHMA 1CGUA 3THCA 1HKKA 3WQVA 4E4PA 1EH9A 2WLZA 2O9TA 2PBGA 4UQAA 1HF6A 3WBEA 3SCRA 3RMEA 3LMYA 3M7SA 1B3YA 3IANA 4WIWA 1WDPA 3W38A 3K8MA 2ZUSA 1V0KA 1GOWA 1QNOA 3QR3A 2XPKA 3WQ4A 4A3HA 3KEHA 1ZBWA 1TE1A 4UR9A 2J7EA 2VQUA 5IDIA 3RCNA 3TTSA 1GNXA 3DYPA 3RJYA 4ATLA 4Z2GA 2CESA 4P7RA 1KWGA 4YPJA 4AY1A 2VI0A 2QV4A 4AZCB 1H41A 1NH6A 1OB0A 3THDA 4AWEA 1UR4A 5BYWA 1ISYA 2PBOA 4GQRA 2J74A 4TTUA 3CMGA 2PB1A 1HJXA 3VIKA 2XTKA 2WLYA 1MW3A 3BXWA 3CZLA 1BAGA 1B3ZA 2QMJA 1MVYA 3AIWA 2CBIA 3WNOA 3N17A 4D6IA 1WNOA 3VM5A 3WN6A 1BTCA 2O9RA 3L4YA 3AHXA 1OM0A 3A6OA 2A3CA 3AFBA 5CLWA 1EGZA 3VIIA 3WIJA 2WMIB 1CEOA 4J28A 1W1PA 2WVVB 4GO8A 1GOMA 4LX4A 2HVMA 3PZTA 1BVNP 3VNZA 2Y4SA 4UQEA 5GNXA 1LL6A 2VZSA 3K46A 4PTMA 1JYVA 2BY2A 2VRJA 4X9YA 3W27A 5HPOA 1C92A 1D3CA 1MFUA 4F79A 2BV9A 4QLLA 5GPRA 1XRVA 1E6ZA 2YBTA 1QW9A 1E73M 1SYTA 5C71A 2W66A 2X0HA 3K8LA 4URIA 1KB3A 2YDSA 4H41A 2X09A 3VPLA 1D7FA 4PTXA 1OIMA 3WUBA 4C7FA 4JKMA 4PEEA 2E0PA 1Y7VA 4N0RA 4GZIA 3GM8A 3UG4A 3T0DA 3ZSSA 1HJVA 2VL4A 3WNNA 2Y5EA 5AYBA 6CGTA 3VGFA 4W5ZA 1FH8A 4B3LA 1HNYA 1QI4A 4CGTA 1UA3A 3A4XA 1E70M 3CHDA 5JIPA 1LL4A 1XSKA 3AHZA 1BG9A 3QHOA 3VGBA 1MQPA 1J0KA 3SCSA 3AS0A 4OZOA 1TMQA 4PMOA 3VD9A 2QPUA 3VDCA 1CXIA 4XUYA 2XHYA 3SUTA 2OLHA 5I0DA 2DSWA 4TUFA 1H4PA 2Y8VA 1EHAA 1TG7A 5ABHA 3VIOA 2GK1B 4AZHA 1AVAA 4P7LA 3AZTA 1B1YA 1QNRA 4OKDA 5CXPA 3SCUA 4IPNB 1UR9A 5A8NA 4MTVA 1MYRA 1GOQA 1JXJA 4PUDA 1PEZA 1WZAA 2ZXBA 3CPUA 4CKQA 1J0JA 2J7CA 3ZOAA 4MDPA 4TTGA 2XJ7A 3VUPA 2EO7A 1ZS2A 1VAHA 1CXFA 1LJYA 3CUJA 3OGRA 2IXUA 3WDRA 3GNRA 3OB8A 1NWTA 1C90A 4QAWA 4UFMA 3VIMA 3VGEA 1IT0A 2WMHA 1XYFA 1ISVA 5CPTA 4UFJA 1HP4A 2PWGA 3VIGA 4GI9A 1R85A 1JZ5A 2J47A 1E6XM 1UWSA 4KRUA 1QNPA 4ML4A 4HMDA 1V3IA 2VRKA 1V6UA 1WAWA 1KR0A 1BLIA 4JFTA 1ISWA 1UWIA 5I23A 4CU7A 4AZ5A 4UTFA 1ZB5A 1A3HA 3NJ3A 5LA1A 4JHZA 2CBVA 3GH4A 4ATDA 2ZXQA 4PMYA 4OJYA 2JIWA 4B3KA 4LXFA 2WW5A 3K4DA 1E0XA 2V3GA 4W86A 3KL0A 1YHTA 2OSXA 1KXHA 1VFMA 1OGSA 3AIVA 3WQWA 3CHCA 3UEQA 2O9PA 2DH3A 1UD4A 4W7VA 3N1AA 2UY3A 4AD1A 1BG4A 3WMBA 4HZ7A 3AZSA 4WSJA 3L4UA 2RGMA 3ARUA 4DWSA 3AYRA 1EA9C 1UR1A 3L4WA 4MADA 2ZUUA 1VFFA 2QHAA 2YL9A 2WVTA 1BPLB 3N9KA 3OIHA 2J8FA 3AIQA 4M24A 2XG9A 4NRRA 3S2CA 1VRXA 1QHOA 2MANA 3PHAA 1R7AA 3N12A 5E0FA 1ECEA 5FL1A 4V28A 3BLKA 1PZ2A 4BS0A 1WB0A 5A8MA 3MUZ1 1E6RA 1XSIA 1J0HA 5EB8A 2VX5A 4PYSA 2ZXAA 1GZJA 4W87A 1J11A 2WAGA 2XYLA 2WHMA 2Y2WA 2GJRA 5FD0A 4JL2A 1VF8A 4AZGA 3MSDA 4ZEPA 2VTFA 2O92A 5CJ5A 3BAXA 2J7HA 5D8WA 1TCMA 3DECA 1HKJA 2XFYA 4J3WA 1GCYA 4PRWA 3AI0A 4QP0A 5A2AA 4BCEA 4W84A 5KEZA 4MAVA 1ISZA 3PZVA 3WFZA 3RILA 2JF6A 4H04A 1DWIM 3ARVA 3O9NA 4Z2IA 2DEPA 2E8YA 4OUEA 1V6XA 5E70A 2WYSA 2CERA 1HN1A 2BVYA 1MQRA 1HL9A 4MDOA 3PZQA 3A47A 3BCFA 2WKGA 3VDBA 4MNMA 3OBAA 4ACYA 1C8QA 1PIFA 1R7OA 1XH1A 4UQCA 4DM2A 1VEPA 5FKYA 4HPHA 2WMKA 4U2YA 5A6KA 1H1NA 1SMDA 3SCWA 1V6YA 1GQKA 1QOXA 3MU7A 4CD7A 3WELA 1NOWA 4AZCA 1VFUA 3AYSA 1NP2A 3WH8A 3QOKA 2W63A 2WK2A 1L8NA 3L4VA 3WUEA 2G3JA 4XV0A 1BYBA 4DUWA 1XHGA 3F4VA 1WDQA 3PZOA 4MB3A 2OSWA 5GQBA 2BHUA 2YKKA 3IJ9A 4HMEA 2PC8A 2ZX5A 4TX8A 3CLWA 1EDGA 3ARYA 1TZ7A 1EHNA 1PJ9A 1EQCA 2WMIA 4BQ2A 2ZXDA 4GINA 4GZJA 5JIWA 4JFVA 2XVPA 2WVVA 3I3BA 3TTYA 5BRPA 4CN6A 3W25A 1C7TA 1W3KA 5AC5A 2CIPA 4U3CA 4P8WA 4QCEA 1X1NA 2J75A 4D6DA 2ZUVA 2GUYA 3NIYA 4EK7A 1GOOA 2YA0A 2EPKX 1XV8A 1UD2A 3VD5A 4JAWA 2BXZA 1E6SM 2CPUA 2D0HA 1HKIA 1OINA 3GBEA 1EOKA 4F8XA 3IK2A 1UOKA 3B9DA 3SEPA 1JXKA 3WUGA 3MMDA 2VT0A 3AISA 2D3LA 1E43A 1FA2A 3SUVA 1W1VA 3WSUA 4JCLA 4C7GA 4YHGA 1E3XA 5HOSA 2AAAA 8A3HA 3IAPA 1UZ1A 4KWUA 4OBSA 1AQMA 2WVSA 4AW7A 1DWGM 1AQHA 4JKKA 1XGZA 4HOZA 1OIFA 2W4XA 4U2ZA 2VZVA 1KXTA 4EE9A 5A6BD 4JL1A 3VM7A 4J3SA 5DO8A 1CXLA 2C0HA 3QOMA 2NSXA 4FF5A 4IISA 1W3LA 2VNCA 3CZJA 1KCLA 1C8XA 4UFHA 1HVXA 1CWYA 5ECUA 1XH0A 2CBUA 1UKTA 1CZ1A 1E1EA 2CKSA 5A6AA 2GK1A 3T2QA 4F9DA 4UQ9A 5FIPA 5C70A 1US2A 1GHSA 2WWDA 1OWQA 3BSHA 1VB9A 1AQ0A 3HJEA 3F5KA 4D72A 2D1ZA 3ZSTA 2Q8XA 3CHEA 4E8CA 1BYDA 5BXPA 5A2BA 5BXSA 3WMCA 2C7FA 1EOMA 2UY2A 1JF6A 1EO7A 4JKLA 3W29A 3W6LA 3HMCA 4PUEA 1GHRA 3VOCA 1UH2A 4W88A 3SCNA 4U5KA 4W8BA 1DEDA 5A8QA 7A3HA 1XSJA 5HPCA 5CSYA 5D4YA 4FLRA 2JFEX 4RE3A 3O2LA 3W81A 3SCTA 2VQTA 1MW1A 3PZMA 3SCOA 2EPMX 4V27A 1E0VA 3AIEA 5FOOA 3GNOA 4PMDA 1BQCA 1J12A 4ZE5A 1W9XA 5CQ1A 3SURA 1JDDA 3K8KA 2BNJA 3RIKA 4H8VA 4ATWA 2DPEA 4W85A 3OLIA 3VVGA 3WDPP 1C93A 2YBUA 4H8HA 2VJXA 5ABEA 5C8BB 4B9ZA 5KZ6A 1UD8A 2YA1A 5ABFB 2O9OA 3RM8A 4BZYA 2E9LA 3CUIA 3SIMA 2B31A 1QNSA 4MNLA 2JF7A 3DC0A 5A95A 4TX6A 1GVYA 4FLQA 1JDAA 1V6WA 4JHOA 4E8DA 1ZU8A 2J7FA 3AHTA 1B3XA 1PAMA 4XB3A 3L2MA 2FHFA 2BY1A 3KZSA 3T09A 3OGSA 4H2CA 1TR1A 1M7XA 2CYGA 4HU0A 1KGWA 2BY3A 3K4AA 4PMNA 2ZWZA 1KGUA 3PTKA 3BAYA 4M1RA 1EQPA 3EDDA 3WBAA 2DT3A 2BVTA 3MKKA 2CBJA 2F8QA 2VX7A 1HIZA 3SUUA 2Y8KA 3MO4A 1K9EA 4N42A 2F2HA 1CECA 5M17A 1OGGA 2YLLA 3W26A 5JBEA 1EDQA 1JYNA 3EMQA 2OSYA 2EPLX 2G41A 2WB5A 3B9EA 3VINA 2JEPA 3W28A 4AEFA 5I2UA 2WSPA 1E6PA 4IPLA 4PMUA 1ITCA 4UFIA 3OG2A 2XVNA 4UFKA 1ZBCA 1MXGA 2E4TA 4UQDA 4GI6A 1VIWA 3CZ8A 2WC4A 1CYGA 5LA2A 1E1FA 5A6SA 2W91A 1KBKA 3OLEA 1KFWA 2D23A 1GQJA 1TA3B 1DP0A 1SFSA 4NRSA 1M53A 2W62A 4MPKA 2GJXB 2EPOA 1TUXA 3WDHA 2ZIDA 4WSKA 4M29A 2ZUNA 3GYCA 1HJSA 3VO0A 3RPMA 3CUHA 4P8UA 3VD7A 1U33A 1BFNA 3CBWA 3EDFA 3KWXA 4TVUA 4PMQA 4AD4A 3CZGA 1J10A 2VVNA 1E9LA 1FOBA 4ZXLA 3U7VA 5DEZA 3ARWA 5BXRA 2GDVA 4U31A 2GSJA 1FP9A 4X0NA 2D0FA 5GNYA 3FHAA 4S3JA 5DF0A 1OSEA 2XVKA 1G9HA 1J01A 2D2OA 4M8UA 5DFAA 1ZL1A 3LPFA 2G4FA 2EBNA 3EDJA 4AD5A 4GQQA 3BGAA 1CENA 2WSKA 1G1YA 2BXYA 5E0CA 5BXTA 4CVUA 1HKMA 5IFTA 1HP5A 1LLOA 1GVIA 2W61A 3HN3A 2FH8A 3PZ9A 3DYOA 1Q6EA 2FH6A 4FLSA 3T0BA 3BC9A 4U5IA 4CD6A 1YQ2A 3MMUA 3WMSA 4LYPA 3SCQA 1UKOA 4QCFA 5I6SA 4W93A 4ACZB 3ARPA 2DQXA 1MW0A 4GKLA 3VIPA 5CLTA 2QMKA 4Z2KA 2VCAA 1S46A 3OLDA 4HOWA 2YL8A 3BH4A 1NP0A 2CETA 3AOFA 2WCSA 3U57A 3ZMRA 1LWHA 1HJUA 3UG5A 5M5DA 1XYZA 5BRQA 5HNNA 2XUCA 3GXFA 2VZOA 4BF7A 2XVLA 2DIJA 3WUFA 5TD4A 4D6GA 1JNDA 4PN2A 3MSGA 2X2YA 3B8SA 3FNDA 1BYCA 2EJ1A 1FH7A 2VURA 3VGGA 4C7DA 4PTVA 3WKZA 2VUYA 2CXGA 2ZICA 1NOUA 1UWUA 5AYIA 4GIAA 2XIBA 1GPFA 3IJ8A 2XVGA 3SUSA 4PMZA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RD6 A;  1OD0 A;  2GVY A;  5D9P A;  1W9D M;  4EAM A;  2WMG A;  3CH9 A;  4Y7E A;  3M6D A;  4UNI A;  3WQ5 A;  3PN8 A;  4HA1 A;  1W1T A;  1GJW A;  3ZJ6 A;  4NF7 A;  1E71 M;  1US3 A;  1V3H A;  3GBD A;  4AIS A;  5I78 A;  1ITX A;  4X0V A;  1HL8 A;  2DT1 A;  2EPN A;  5DT5 A;  5BRO A;  2W92 A;  3SUW A;  3W24 A;  3AQU A;  1E4L A;  3OA5 A;  1HVQ A;  1VFO A;  3QHN A;  1W9P A;  1Z32 X;  6TAA A;  1G94 A;  1NWU A;  3APG A;  4D6E A;  1JZ8 A;  3CUG A;  3F5L A;  1Q6C A;  4CD4 A;  1CDG A;  1B31 A;  4B9Y A;  4TVC A;  4HP5 A;  1JIB A;  2WM0 A;  1JL8 A;  1UH4 A;  1XH2 A;  2VCC A;  7CGT A;  2WHJ A;  1QVB A;  1QBB A;  1E3Z A;  1G0C A;  1CXH A;  4GXP A;  1OD8 A;  3N15 A;  2UWF A;  1LF1 A;  1XCX A;  1U2Y A;  5AY7 A;  5CPQ A;  4GO9 A;  4JIE A;  5EFD A;  1W9V A;  5DT7 A;  2Z1S A;  4W8A A;  3T0A A;  5DMY A;  2A3E A;  1E4N A;  1IZK A;  2CHN A;  3I3D A;  2CKR A;  2XM2 A;  1DTU A;  1E6Q M;  2ZX9 A;  1K9D A;  1B3V A;  1LG1 A;  2YDR A;  2X1I A;  4UOQ A;  4ZEN A;  5HDR A;  4A3Y A;  1HJW A;  3VX0 A;  1JYW A;  2EXO A;  3LPG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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