3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
2GUPA 2P9PB 3FLCO 4J8FA 4XH1A 2FLOA 3A8YA 2ZGZA 2Q1NA 3SMPA 1ATSA 3H45C 2W40A 1K8KB 3JXUA 4CI6A 3GBTA 3DXKB 3LDLA 3ZEUA 1HX1A 4XH5A 5ADXH 5EVZA 3EKUA 1R59O 3H46O 5AZJA 4BR5A 4CD3A 2V7YA 5BPMA 2YHXA 3OHRA 5AQLA 4BG8A 4QS7A 4CJ7A 4K41A 4CZJA 1OKJA 3WEEA 1QHAA 2QM1A 3D7EO 2YJEA 1Z6RA 4WQ5C 4Y0WA 1QQNA 3W3DA 4BRGA 1E4GT 1DKGD 1NGJA 5BREA 3ZETA 3MN9A 3MK6A 2FXUA 2D4WA 4O8KA 4BRPA 3VGLA 2F9WA 2Q97A 2P9KA 3D2FB 3CQXA 4WQ5A 5BN8A 2QWNA 1S22A 3SMSA 2QW9A 3QICA 5BRFA 4FOIA 2P9LA 5FPDA 1JCGA 3VEOA 1MDUB 4H0TB 5CE3A 4BRHA 4K42A 1BG3A 2YJFA 3O1BA 4MLEA 4K43A 3U9DA 1ATRA 3BP8A 1HKBA 4FSVA 2ZWHA 4H0YB 2CH5A 2UYTA 3CJ1A 2W41A 4PKHA 4FWMA 4I6MA 3MN7A 1KXPA 4H0OA 1ZBSA 2E20A 4IJAA 5AQKA 4NB4A 3J8AA 4RCHA 3GE1A 1NBWA 5EX5A 2A5XA 3AAPA 4FWLA 3BEXA 1GLJO 5EXWA 1X9JA 3EL2A 5AQFA 3FZKA 2IVPA 4BRKA 3BF1A 5AR0A 3WXKA 3GL1A 4DHYA 3A5MC 3LM9A 4BGAA 3VF2A 3M1FA 1C0GA 3DJCA 5EOYA 5TKYA 1TYQB 3RSEA 1ESVA 3A0IX 2J4RA 3IMXA 3CJ9A 1IG8A 4FWNA 1MWKA 2PAVA 1BO5O 4CBXA 2F9TA 2P9SB 2GEMA 3FR0A 2OANA 4MO4A 4FL9A 4BRCA 1NWKA 3ULEB 4AM7A 2DPNA 3LM2A 4C23A 1GLFO 2P9LB 1YVNA 2ASMA 3ATVA 1DGKN 1E4FT 1XQSC 5F1XA 1HPMA 1NGCA 1Y64A 4LC9B 3C0BA 4XEIA 2VWBA 3GG4A 5AFUA 2CGKA 4H5TA 4K25A 4BREA 3AY9A 3M6GA 4B1WB 3ENHA 3R8EA 4EHUA 1GLEG 2QWLA 3ZEUB 2HF3A 4M7YA 3CHWA 1ATNA 4QS8A 3VGKA 3RSEB 3U4LA 4MO5A 3P4IA 3AAQA 1JCFA 1HUXA 4E1JA 3VEWA 3VEYA 2VCPA 4H0XB 5AQYA 4GY2B 1NGBA 5JICA 2KHOA 2P9SA 3F9MA 1LOTB 3ZX2A 3QDKA 2P9NA 4M7XA 4M63C 1TUYA 2E8AA 1GLLO 2P9UB 2HOEA 3TPQA 2P9IB 3ZX0A 3ULEA 3CERA 3HI0A 3KVGA 2PBDA 4YDUC 2A41A 1D4XA 3SJHA 2EWSA 5JLFA 3WXIA 3FE1A 4PL7A 4MLHA 3CIPA 3BUZB 2P9KB 3UB5A 2V7ZA 4CZEA 2D0PA 2P9IA 3MCPA 3O6WA 5AQSA 3VOVA 4BC3A 4PKGA 1RDWX 4BVPA 1SQKA 3TU5A 3HM8A 5AQJA 5AQTA 3ATUA 2CGJA 4H5WA 4A61A 4CBWA 5LJVA 3FGUA 1YAGA 3HSCA 5AQIA 3AARA 2FF6A 2V52B 1G99A 2YCHA 5ELZA 3U9ZA 2NRHA 5BR9A 3HTVA 4CZFA 1Z05A 3VEZA 2CH6A 3I8BA 4NO7A 3FZFA 2D0OA 3O08A 4CZGA 4WQ4A 3D2EA 1P8ZA 4H03B 4IWVA 4CZHA 4WQ4C 5BPLA 3G25A 4BRDA 2E2QA 3VETA 1JCEA 3FZLA 2A3ZA 5KPRA 5JMVA 4B1YB 4PKIA 3C7NA 3L6QA 4B1UB 3SK3A 4IZ9A 1BWFO 1J6ZA 5BN9A 4H5VA 1BU6O 4B9QA 2WUSA 3U8XA 3H1VX 3WT0A 5I9EB 2Q36A 4BC5A 4H5NA 2Q0RA 3A5OC 3EKSA 1H1VA 4KBOA 3R6MA 4B1ZA 4BR9A 1V4TA 3VPZA 4BC2A 4BRAA 5LY3A 3VEVA 3BF3A 4F9OA 2ZF5O 4BRMA 2P9PA 3ID8A 1QZ6A 3WUHA 5F0XA 2ITMA 1BDGA 2IIRA 3IUCA 4H0VB 4FWQA 4QS9A 5AQGA 2FSJA 5FPEA 2IVOA 1WOQA 4YDUA 2QWMA 2YHWA 1GLDG 2P9NB 4CZMA 4FWSA 3QMLA 3EO3A 3H3NO 4XH4A 3M3ZA 4EFHA 5KPTA 3O8MA 3FZMA 4FWKA 2E2NA 1NGAA 5EY4A 3WQUA 3MMVA 4A2BA 4BR0A 4DB3A 1T6CA 4AM6A 4CZIA 2GWJA 4EAHD 4EHTA 3EZWA 4BR4A 1TUUA 4ISGA 2Q0UA 4H0PA 3VERA 2AP1A 3UKRA 5BPNA 5KPZA 4CD1A 1NMDA 5AQRA 1NGFA 1ZC6A 5E26A 3FZHA 3IDHA 2E1ZA 3CJBA 3H6EA 4A2AA 3A5LC 2E88A 1KAXA 4GNIA 1T44A 5AZJB 2P9UA 4CBUA 1XC3A 4I6MB 2YI1A 2GTDA 3QB0A 3UKUB 4IO8A 1GLBG 4B1VA 2ASPA 4JN4A 1NGHA 3A5NC 5AFUH 2HMPA 3DAWA 1NLVA 2QXLA 1HKGA 3MDQA 1HKCA 4ISFA 4FPAA 4JHDB 4BRQA 3VESA 4JNEA 3MN6A 1DEJA 2YHYA 2ASOA 5F2RA 3S41A 1QZ5A 3H3OB 4BRFA 4PL8A 3VF4A 3I33A 4DQ8A 2NLXA 2A6AA 4JAXA 3R9PA 3ENOA 3IFRA 1SZ2A 1SAZA 2I7NA 2I7PA 3WXJA 3FFKB 2QWQA 3CI5A 3O80A 5AQWA 3WXLA 3HBTA 4Z94A 2VYPA 2V51B 2QWOA 1ZXOA 5KQDA 4IJNA 3L0QA 3QBXA 5AQZA 1NGDA 3VENA 3QBWA 4BRIA 2IVNA 2AA4A 3WQTA 2GELA 1V4SA 4BQLA 5B8HA 3UKUA 1X3NA 5ADXA 1NGEA 4BR2A 5JLHA 3SLCA 2BUPA 2HF4A 5AZIA 2CGLA 4B1XB 1WUAA 5KQ8A 4A62A 1T6DA 4ISEA 1YUWA 5BRHA 1NGIA 2BTFA 5AQHA 3EN9A 4BQZA 5FPMA 4EIAA 3CETA 3LL3A 4HTLA 3CQYA 3L4IA 4RTFD 4FWRA 3ZX3A 3H1QA 3GOIA 3KHYA 1U6ZA 3GDQA 4FO0A 1GLAG 2Q31A 3VEXA 3O1WA 4FWOA 3CJ7A 1LCUA 3D2EB 1BA1A 5AQVA 5AQUA 4JD2B 3C7NB 3CJCA 4BVOA 5LJWA 1QQMA 3JS6A 2FF3B 1X3MA 3WEEB 1NM1A 3UKRB 2E2OA 1EQYA 4O5FA 4CZLA 2FSNA 1NGGA 1MA9B 4FPBA 2E2PA 4H5RA 4L3QA 1RGIA 1S3XA 3ZETB 4BG9A 2A40A 5AQMA 3KZBA 2QWRA 1Q18A 2GWKA 1K8KA 3B8AX 1C0FA 2A42A 3D2FA 3CJAA 5AQXA 4DCHA 3MN5A 2Q2RA 1YXQA 3LDQA 3LDPA 4FWPA 5AQQA 3HZ6A 1U2VA 1XUPO 1BOTO 1GLCG 3DWLA 3QFUA 4BC4A 1KAZA 3DXKA 2ZGYA 1RFQA 4RWTA 3O4WA 3UE5A 1CZAN 4BRNA 2D1KA 4BRLA 5E84A 4FOEA 2QWPA 1KAYA 3O5BA 5AQPA 1QQOA 5AQOA 4JHDA 1BA0A 2NZTA 5AQNA 2H3GX 5BRDA 2FSKA 3DXMA 3W0LA 5FPNA 3VGMA 3VF6A 4WYBA 4BGBA 4BR7A 1MWMA 1HLUA 4JD2A 4IXCA 1IJJA 3QFPA 2E1YA 4BROA 3LDNA 1BUPA 1U2VB 1HJOA 3DXMB 4HWIA 5AZIB 4CZKA 3LDOA 1TYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B9SA 4DQRA 2X6SA 3HYFA 3VQCA 5GINA 4FW1A 3A8YA 4CEFA 2Q1NA 4CEOA 1ATSA 4CI6A 1SKWA 3CC4N 3ZEUA 1HX1A 1T05A 4JI3K 4DQQA 3C95A 3DLRA 3OHRA 4CJ7A 4K41A 2YKNA 1OKJA 3D7EO 4WQ5C 1TKZA 1QQNA 2E5LK 1C0TA 4DQIA 1JL1A 4FJJA 3VQEA 2RPIA 3ZETA 4H8KA 1S9EA 3VQDA 4O8KA 4DQSA 2P9KA 4CJ5A 3ZT2A 1S22A 1TL3A 2P51A 3VEOA 3THYB 3MXJA 2HB5A 3AVCA 1K9MO 4K42A 3K9JA 1N5YA 3O1BA 4MLEA 4K43A 3EYZA 1ATRA 3P38A 4AHRA 4FSVA 4YOVA 3C6UA 4CJLA 4RW9A 1YJNN 2UYTA 2G8UA 4FWMA 4YHHK 5J2QA 4IEIA 5CZ2A 3GE1A 3AAPA 3QERA 5J1EA 4E7KA 4FK4A 1CXQA 4FVUA 1FK9A 4AH9A 1X9JA 5HROA 4JV5K 3KLGA 2IVPA 4BRKA 2FBXA 3BF1A 2VWJA 5DK5A 4NXMK 3A5MC 4OKKA 1DTTA 4FZZA 4Z4CA 2KZMA 3J7AP 5EOYA 3C6HA 1TYQB 3RSEA 3A0IX 1VSJA 2DFHA 4FXDA 1YVUA 2GEMA 3FR0A 2OANA 4A5AA 4MO4A 2HNYA 1JLGA 4X62K 4JS4A 1C1AA 1HYVA 4BRCA 4NCBA 2F96A 1X9MA 4AM7A 2DPNA 4C23A 1CZ9A 4KI4A 4Z4HA 4DQPA 1GLFO 4HCBA 4E0DA 3ATVA 1E4FT 1QTMA 1TK0A 4XEIA 2VWBA 3GG4A 3TAFA 1OH7A 1JLBA 2JWKA 4CHZA 4C8OA 3M6GA 3ENHA 4F2RA 4Z4IA 3VGKA 1BI4A 4MO5A 4B9MA 1ZBFA 5HLFA 1JCFA 4E1JA 3K0SA 2KFNA 3VEWA 4NXNK 3RRHA 2ZD1A 3F9MA 4DV5K 4MFBA 3ZX2A 1RTJA 1Z26A 4M63C 1JXEA 1HRHA 1JLCA 2P5GA 2A41A 4DV6K 5FLXO 3NH2A 2FC0A 3SJHA 3E9LA 4PL7A 3TI0A 3CIPA 3IG1A 4Z4GA 3KLFA 3M8RA 3SUQA 1KVCA 2D0PA 5AQSA 3S3MA 3VOVA 2VG7A 3V81A 3C94A 1VQLN 5AQTA 4CBWA 3OYCA 1NK7A 1YAGA 3AO1A 2NRVA 4DTUA 3HSCA 5AQIA 1U47A 1OH6A 3L2RA 4B3OA 2V52B 1G99A 2YCHA 3U3GA 1K8AO 1QSSA 3HTVA 1Z05A 3NH0A 1WSIA 2QKBA 1HNWK 3OBYA 3D2EA 4IWVA 1VQNN 3PLAA 4CEZA 4WQ4C 2IOCA 3VETA 1JCEA 3G71N 5JMVA 3L6QA 2QI2A 4DS5A 1NOZA 3SK3A 5BN9A 4N41A 3AVFA 4AQYK 2W42A 2RE2A 3H1VX 1SL1A 4K0KK 4BC5A 2FBYA 4H5NA 4E7IA 3EKSA 2O8DA 4B1ZA 4Y1CA 1FW6A 4CIEA 4BR9A 4JKBA 4I9LA 4BC2A 2B5JA 4FJ9A 2EX3A 5KTQA 1VK0A 4BRMA 4CHPA 1WBDA 4I9QA 4KHPK 5F0XA 3ZSOA 3LWMA 5IT9O 5AQGA 4B3MK 1RBSA 1WOQA 3K59A 4FM2A 4ELTA 2P9NB 3T69A 2RHKA 3EO3A 1REVA 4C8NA 4YORA 4HTUA 5HRPA 2XY8A 3TAEA 3I55N 3T1HK 4BR0A 2YNHA 1TVRA 2GWJA 3TSUA 3VQ9A 3ZSVA 4ISGA 3OVNA 3PIOL 2Q0UA 3S9HA 3HO1A 3HM9A 3MXMA 4IFVA 1YT3A 2KZZA 2ATQA 3DOLA 3J81O 1XMOK 4BE1A 2PYJA 3QB0A 4E1MA 4DLEA 1WSJA 4C8LA 5C10A 1NK5A 3AA4A 1N34K 3A5NC 3LP1A 2HMPA 4CJEA 4IFYA 4AHCA 2HHVA 4BRQA 4AILC 1I3AA 4X65K 4FJLA 2YHYA 1SS6A 3K58A 4DV0K 1X9SA 4HCCA 2AJQA 3P5JA 2A6AA 4JAXA 5KGXA 3CCJN 3PUFA 3WXJA 5CYMA 3OS0A 4LSLA 3O80A 2QWQA 3CC7N 3ENBA 3HBTA 4OPJA 2QWOA 1ZXOA 3LWLA 2HBKA 4ZHRA 3PY8A 1NGDA 3QETA 4BRIA 2AA4A 1LWCA 4HUFA 1ZBLA 1KLNA 4JKAA 3J80O 3Q7CA 3THXB 1VAZA 2NRXA 5JLHA 2BUPA 4JKFA 5AZIA 5C12A 1R0AA 4A62A 3CCUN 1T6DA 1YUWA 3EEQA 4CFDA 3LZJA 3BDPA 3OW2M 3CQYA 1RT2A 3M8QA 3O1WA 4B9UA 3CD6N 1QS4A 1GOAA 1GOBA 4DTOA 1VRUA 4KO0A 2NUBA 3CJCA 3CMAN 2HHHK 3F73A 1ZBHA 1EQYA 4FM0A 1MA9B 3V4IA 4C8MA 2E2PA 2GV9A 4L3QA 5GAHP 1WNSA 1IO2A 1S3XA 4KH5A 5AQMA 1U04A 1BQNA 1RTIA 4CGGA 3T3FA 3PX6A 1C0UA 4BY9C 3B8AX 1C0FA 1JLEA 3D2FA 4CEAA 1BHLA 3V9ZA 4KTQA 3MWPA 1DTQA 3LP0A 4CIGA 3OYJA 1YXQA 1WAJA 3LDQA 1U2VA 1BOTO 3DWLA 2HHXA 1FXXA 3WNEA 2O8FA 4JLHA 4BC4A 1NJIO 4M3WA 4KHWA 3K9KA 2JGUA 3CYMA 3L3VA 4B8CA 4IEEA 4LFBK 1UA1A 2YNIA 4BRLA 4V19S 1KAYA 3KK1A 3LP2A 4O55A 4KFBA 1BA0A 5FPNA 1J5OA 4HHTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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