3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
1NM1A 4BREA 1WUAA 2HOEA 3AAQA 3MMVA 5AQYA 3KHYA 3D2FA 3CJAA 5B8HA 3VEYA 4EHUA 1E4FT 4CI6A 4H0OA 2YCHA 4JAXA 1HKBA 1NGHA 1T6CA 1MWKA 5BN9A 2FSKA 3VF4A 5AZIB 3MCPA 4PL8A 4XH1A 5AQRA 3BF1A 2A6AA 2UYTA 4M7YA 4QS8A 4CD3A 1LCUA 2FF3B 3BF3A 4A2BA 4XEIA 4BRFA 1MWMA 1BOTO 4GNIA 1NBWA 4CZLA 1XQSC 3F9MA 4YDUC 1QZ5A 1BUPA 5TKYA 2P9NA 2QWOA 3M1FA 1NGEA 3UKUB 4IJAA 3ID8A 1BWFO 5EX5A 1ZXOA 3VEOA 1BO5O 3GL1A 3DJCA 5BR9A 2Q2RA 3BUZB 2P9KB 4IXCA 4BQLA 2DPNA 3DXMA 1P8ZA 1IG8A 2QWPA 1HLUA 1NGCA 4DHYA 2GTDA 3CQXA 3LDNA 1NWKA 4A62A 2Q0RA 2E20A 4L3QA 3VGMA 2YJEA 4BR5A 3HBTA 3ZX2A 3DAWA 2Q31A 4B9QA 3FZKA 4Y0WA 2PBDA 3EKSA 4RWTA 4CBXA 2PAVA 2QW9A 5AQQA 4FPAA 1LOTB 4B1WB 2E1ZA 3G25A 1KXPA 3LM2A 3LDPA 4H03B 4WQ5C 1GLLO 1YVNA 3FZMA 4Z94A 3QBWA 3SMPA 1SQKA 4JD2B 4EHTA 1BA1A 1CZAN 3EO3A 5EXWA 2D1KA 4ISEA 1YXQA 3VEWA 1DGKN 3FE1A 2CH6A 5ADXH 3A0IX 3VETA 3LM9A 3HM8A 4FWPA 4H0PA 4PKHA 5E84A 4CZHA 4IZ9A 4RTFD 4EFHA 5BREA 3MK6A 3WQTA 4FOIA 1HJOA 3TPQA 4BRLA 2QWLA 3O80A 5LJWA 2YHYA 4M7XA 3SMSA 3GOIA 3CQYA 2EWSA 4FOEA 1QQOA 3ZETB 1Z6RA 3O1WA 4BRNA 2FSJA 3HTVA 3EN9A 2NLXA 4H0TB 4K42A 1XUPO 2FSNA 1XC3A 4B1XB 5BRHA 2A5XA 2NZTA 3L0QA 2ASPA 3C7NA 3R8EA 2W40A 3GDQA 5JLFA 2P9LA 4BRQA 1T6DA 4PL7A 3JS6A 5FPEA 2Q36A 4A2AA 3VPZA 2A3ZA 5JMVA 1TYQB 4HWIA 1K8KB 4AM6A 5EY4A 2Q1NA 3SK3A 4H5NA 2P9KA 5AQZA 5AZJB 2H3GX 1KAYA 4MO5A 4BG8A 4FSVA 3QDKA 4J8FA 3MN9A 3ZEUA 3FLCO 1HPMA 4BR0A 4I6MB 3ULEA 3L6QA 3A8YA 2AP1A 2P9UB 3ZX3A 4BRKA 3MN5A 3CI5A 4K41A 4DB3A 3UB5A 4CBWA 3A5MC 4XH5A 4O5FA 3MDQA 2HF4A 2ZGYA 3SLCA 1J6ZA 3A5LC 4K25A 3FR0A 5KPRA 5CE3A 3O6WA 4JD2A 2CGKA 2YHWA 5AQFA 5AQUA 2GUPA 4JNEA 4NO7A 1DKGD 1GLCG 3IFRA 3H1VX 3MN6A 4MLHA 2YI1A 3I8BA 1E4GT 4ISFA 1HKCA 3FGUA 1EQYA 5AQXA 3H3NO 3DXKB 3AAPA 1NGAA 3DWLA 4QS7A 4IJNA 4BR9A 4CZIA 3WEEB 3P4IA 3H6EA 3ZETA 3U9DA 1U2VB 1MDUB 2ASOA 2D0PA 3HZ6A 3QB0A 3QFUA 5AQJA 3UKRA 3VEVA 2CH5A 3LDOA 3FZHA 2E2QA 4BVOA 2P9IB 1ESVA 1JCGA 4IWVA 1X3MA 4EIAA 4JN4A 2VWBA 3CETA 2A42A 4F9OA 4BVPA 4H5TA 4BC2A 3R9PA 4NB4A 5AQLA 4WQ4A 2P9PA 5AQNA 3I33A 4BRIA 4FWSA 4JHDB 1IJJA 2IVNA 3WQUA 4QS9A 1X3NA 5AQMA 5AZJA 2KHOA 1HKGA 3KVGA 3QMLA 1KAXA 5AFUA 3HI0A 4O8KA 1ATSA 3GE1A 3VERA 1C0FA 5AQKA 1NMDA 3L4IA 3HSCA 4I6MA 3VF2A 2P9UA 2Q0UA 5BPLA 1ATNA 1H1VA 5AZIA 1TUUA 2QM1A 3FZLA 5AQVA 2AA4A 2VYPA 3VEXA 2QWQA 3D2EB 1V4SA 3A5NC 2Q97A 2QXLA 5BN8A 1Q18A 1V4TA 2QWNA 5FPNA 1SAZA 4BRCA 1HX1A 3CHWA 3M3ZA 4FL9A 3O5BA 4FWOA 5BPNA 2CGJA 3CJ9A 5F2RA 2P9SB 4BRMA 2IVOA 4LC9B 1QHAA 2YJFA 5AQPA 4BGBA 4CZKA 5BRFA 3UKUA 3RSEB 4BR7A 2ITMA 4BR4A 4MO4A 1NGDA 1RDWX 4FWNA 2OANA 4CJ7A 1QQNA 3CJBA 4AM7A 4ISGA 2YHXA 3DXKA 3FFKB 1TUYA 2D0OA 3ENHA 4GY2B 1NGJA 4FPBA 5F0XA 3WEEA 3J8AA 2E1YA 2ZWHA 4BRPA 3EKUA 3IMXA 4B1ZA 3IDHA 5EOYA 5AQWA 2E2PA 1ZC6A 3CJ1A 3H46O 4YDUA 3VEZA 3VGLA 2GEMA 2P9IA 3BEXA 2FLOA 4CZMA 1NGBA 2HF3A 1RFQA 2QWRA 1BDGA 2A40A 1ATRA 5AQIA 3O4WA 4CZGA 3U4LA 1ZBSA 1NGGA 3GG4A 3QBXA 3SJHA 3TU5A 3W3DA 4FWMA 2E8AA 4CZJA 4JHDA 3QICA 4CBUA 2E88A 3CJ7A 4BQZA 3JXUA 4BC4A 4BR2A 3UE5A 2ZGZA 2ASMA 1GLEG 4A61A 4BRGA 3B8AX 4C23A 4KBOA 2A41A 4IO8A 5AQOA 4BC3A 4CZFA 3C7NB 3U8XA 1D4XA 2GWJA 2FF6A 2E2OA 3EL2A 3W0LA 4B1VA 1JCEA 2P9LB 5AQHA 4DQ8A 2ZF5O 2V52B 1HUXA 2NRHA 4MLEA 1GLDG 4H5VA 3VOVA 5BPMA 5AQTA 4BC5A 3VGKA 3ATVA 3H1QA 4PKGA 1BU6O 2IVPA 5LY3A 3D2EA 4CD1A 3FZFA 1JCFA 4WQ5A 1BG3A 3D2FB 2FXUA 3WXKA 3CJCA 4DCHA 3LDQA 5AQSA 2P9SA 5I9EB 3WT0A 3VF6A 5ADXA 3WXIA 1R59O 3ZEUB 1TYQA 3RSEA 4PKIA 1OKJA 4RCHA 3S41A 3AY9A 2BUPA 3ULEB 3VESA 1K8KA 5KPTA 3R6MA 5AR0A 2F9TA 2QWMA 1YUWA 3A5OC 5EVZA 4FWQA 2IIRA 2V51B 1NGIA 1U6ZA 5LJVA 4EAHD 2GWKA 3O8MA 1KAZA 3LDLA 4B1UB 5KQDA 4HTLA 3ENOA 4H0VB 3M6GA 3WUHA 4H0XB 4BRAA 3AARA 1DEJA 1WOQA 4H5WA 3GBTA 3O08A 1S22A 3U9ZA 1NLVA 1RGIA 1NGFA 2VCPA 3MN7A 1C0GA 1QQMA 1SZ2A 2CGLA 3O1BA 4WYBA 2I7NA 5AQGA 2P9NB 4B1YB 1Z05A 3CIPA 2I7PA 4FWLA 4FWRA 4BROA 1GLBG 2V7YA 3CERA 4WQ4C 3EZWA 1S3XA 3H3OB 2D4WA 3LL3A 5E26A 5ELZA 5KPZA 4FWKA 4BRHA 1BA0A 2E2NA 5FPMA 5FPDA 4M63C 3DXMB 3WXLA 4E1JA 1YAGA 3C0BA 5KQ8A 1G99A 4BGAA 1GLAG 2BTFA 1GLFO 4H0YB 4K43A 3WXJA 1Y64A 5AFUH 5F1XA 5JLHA 4BRDA 3UKRB 2GELA 2J4RA 3BP8A 2WUSA 3OHRA 2W41A 2HMPA 3D7EO 1T44A 4BG9A 1QZ6A 4XH4A 1MA9B 2F9WA 3ATUA 4FO0A 4CZEA 1X9JA 5JICA 3IUCA 1GLJO 3QFPA 3ZX0A 3H45C 2V7ZA 3KZBA 5BRDA 2P9PB 4H5RA 1U2VA 3VENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TANA 4PHTX 2HOEA 4PY5A 2NRXA 4K8XA 3QINA 1NU0A 1S72N 3KHYA 3TSQA 3IAYA 1WSEA 4CFBA 5HOOA 5J2PA 5B8HA 3FFIA 3U6FA 4Z4IA 4FVUA 4CI6A 2JWLA 5AJ3K 3QEIA 3OYMA 3BZKA 1WSIA 4JAXA 4NLBA 4M3XA 5AZIB 5LMUK 4ZHRA 5AQRA 3BF1A 2A6AA 4M7YA 4DUZK 5HRSA 3SPZA 3BF3A 4A2BA 4NYFA 2QTDA 4BRFA 1L3UA 3VQPA 2A1SA 4Z4CA 4KFBA 4KHSA 4CZLA 3ZSZA 3F9MA 2B4JA 1QZ5A 3KWGA 4DTRA 4IFVA 1BUPA 2OYQA 1VQ5N 4CJRA 3EYZA 5FROA 3HL8A 3ID8A 1BWFO 3EY1A 3NE6A 5EX5A 3HO1A 3TAFA 4JKEA 3KKSA 1IG9A 1L3TA 4IXCA 4BQLA 3RMDA 2OTJN 2XY6A 4OKKA 2QWPA 3F73A 1JLEA 1WAFA 2GTDA 3F9KA 4CF8A 3A2FA 3HYFA 4DFMA 3BDPA 3P38A 1RBUA 2VG7A 3LPUA 3ZT0A 1YT3A 3DAWA 2FBVA 1WSHA 4B9QA 4Y0WA 4CBXA 4DTPA 2UUCK 1BCOA 4FPAA 4FZZA 1FKOA 1VRTA 4KB0A 1KXPA 5KRSA 1K6YA 4WQ5C 3KK2A 4OLBA 1GLLO 3ISNC 4Z94A 4FJ7A 5JS2A 1RTIA 3QBWA 1ZBLA 3QNOA 4DSIA 4KH5A 4EHTA 4F3OA 1BA1A 3EO3A 5FRNA 2D1KA 4ISEA 1WBBA 1YF5L 3KK3A 4B9UA 4H0PA 1QSYA 3DLHA 4CZHA 4CEZA 4EFHA 3RMAA 3WQTA 4FOIA 1HJOA 4BRLA 2QWLA 4BDZA 5LJWA 1Q9XA 4M7XA 4BRNA 4FJJA 1CZ9A 4FJMA 4FLWA 5LMNK 3ZSXA 1BQNA 1XUPO 2KZZA 4IG0A 5BRHA 2A5XA 3JYTA 3CXCM 3R8EA 4DTXA 4J2DA 4KHWA 1VQ4N 1ZBUA 3GDQA 4DV0K 4ELTA 2NRZA 3ZCMA 1RBVA 1RT5A 4A2AA 3VPZA 2A3ZA 1TYQB 1K8KB 1B92A 3HPOA 3CFOA 3PX4A 3DRRA 3VQDA 5TKWA 4IO9L 3OVNA 4LSLA 3OYAA 4ILJA 4FK4A 4Y1DA 4B9MA 1CLQA 1RDCA 4M3RA 1N8RO 2HHXA 4UQGA 1HNZK 2JGUA 2A1RA 2YV0X 1TK5A 2P1JA 4E7HA 3MN5A 3CI5A 3BY5A 2ITGA 1NK7A 3KKRA 5C25A 4DB3A 3UB5A 4JKDA 4CEQA 1BL3A 3SYZA 4O5FA 2ZGYA 4OPJA 3SLCA 1ITGA 4QCLA 3CG7A 2E5LK 3K5MA 3DRSA 4H4OA 4JD2A 3ASMA 4CGGA 2YHWA 3PIPL 3C6AA 1T3VA 3HVRA 4NCAA 5KTQA 2Y1IA 1L3SA 2YI1A 3I8BA 3KLIA 1E4GT 2GX9A 3LAMA 5C2DA 1HKCA 3K5LA 4DR3K 2HHSA 4OLAA 1DTTA 4DTSA 4KPYA 4QS7A 3CC7N 3LALA 3L2WA 3H6EA 4FLXA 1S6QA 3VQQA 4GW6A 1U2VB 4FJIA 3UKRA 3MCAB 3OBWA 3LDOA 4BVOA 1VK0A 1JXEA 3CPEA 3AA3A 4IWVA 1X3MA 2YHAA 2A42A 4F9OA 4BVPA 4H5TA 4CGFA 2NNWA 1RNHA 2I5JA 2FBYA 4WQ4A 2P9PA 2E6LA 4BRIA 1J54A 3CD6N 4JHDB 2IVNA 1XMOK 4WE1A 1S1WA 4QS9A 3QIOA 1NNEA 1KFDA 3KVGA 3T1YK 4G1QA 1U04A 1KAXA 5AFUA 3DLEA 3ZSRA 1ATSA 2O8EA 1VSEA 1C0UA 4HCCA 3DOLA 2Q0UA 5BPLA 4U7BA 1H1VA 1IKWA 5AZIA 3FZLA 4QAGA 3L2QA 2AA4A 3KK7A 2GBZA 2Q97A 4CJPA 4DR7K 1Q18A 4G9ZA 5FPNA 2WC9A 3OYLA 4DLGA 4FL9A 4M3ZA 4CF9A 2E6MA 2HNYA 2VG6A 1X9WA 1Q9YA 5F2RA 3MX2A 1RDBA 4LC9B 2HNDA 2YJFA 4F2RA 3TWHA 3RSEB 3SAHA 4KHQA 4BR7A 4CECA 3CCQN 4MO4A 4DS4A 1YVUA 1RDWX 4FWNA 4FJKA 4W5RA 2OANA 1QQNA 4X66K 4ISGA 1RBSA 2OA8A 1IKYA 3LDSA 4CF1A 4M3WA 1WAJA 1SV5A 3V9ZA 3QESA 4Z0UA 4B9LA 1S6PA 3KLHA 5AQWA 4C1NI 2E2PA 5CZ1A 2ZD1A 3CJ1A 1KLMA 4YDUA 1J5OA 3HJFA 2GEMA 3K9JA 3RMBA 3RR8A 3KJVA 4OPHA 3O4NA 3DM2A 4PWDA 1NG9A 2HF3A 1RFQA 2A40A 1TL1A 4DUYK 3NF8A 4DU4A 4N47A 3PUFA 4CZGA 1TKTA 4FW1A 3U4LA 2O4IA 1K9MO 1U48A 2WONA 2HBJA 3W3DA 4DTUA 2GV9A 4CIGA 3CCEN 3CJ7A 4CK3A 4FJ9A 3SQ2A 3JXUA 3DLLL 4LF6K 1KCFA 3OYGA 1BHLA 1GLEG 4M3YA 4BRGA 1HJRA 2WOMA 4KBOA 4GV9A 1HR0K 4CHQA 5AQOA 3U8XA 3W0LA 3EL2A 4LF7K 1JCEA 3CC4N 2O8DB 1HUXA 3O9QA 5J1EA 3KWIA 5AQTA 4BC5A 1Z26A 3VQ8A 4DWIA 1Y97A 3ATVA 3VN5A 3O3FA 4CW7B 1BU6O 4DU3A 3D2EA 3QEWA 1T03A 3NH0A 3FZFA 1JCFA 3DMJA 2OTLN 2FXUA 4CFAA 1W97L 5AQSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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