3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
3D2FB 4FPAA 1WOQA 4FOEA 3I33A 3H45C 1BA1A 2CGLA 4FL9A 4IXCA 3ZEUA 4A62A 2A41A 4H0VB 3A0IX 3VEYA 3WXIA 3GL1A 1NGCA 2P9NA 1V4SA 3HI0A 4FOIA 4H5WA 5AZJA 1Y64A 1X3MA 5AQGA 5AQVA 2E20A 2GUPA 3DJCA 4M7XA 1X3NA 2V7YA 3CJCA 3AY9A 1C0GA 3L4IA 1NGEA 3O4WA 4JD2A 5KPTA 4NO7A 2AP1A 2Q1NA 4B1ZA 3SK3A 4Y0WA 4ISEA 2FF6A 4WQ5A 1DEJA 3ZEUB 2P9PA 2Q0RA 2IIRA 3IDHA 2P9NB 5FPNA 3M1FA 3IMXA 5AZJB 3GE1A 5AQTA 4WYBA 1EQYA 2IVOA 4FWPA 4H0PA 2A3ZA 2YHXA 5AQXA 3VF6A 4CD3A 2QW9A 4IJAA 4CZKA 4AM7A 2WUSA 4WQ4A 1TUYA 4JD2B 4BQLA 1BWFO 4BVOA 3CJBA 3ULEA 3JS6A 4ISFA 3VESA 1GLFO 3O8MA 3DAWA 5JLFA 4MLHA 2P9PB 3UE5A 4BRNA 3EO3A 5BPMA 2GELA 2D0OA 1BO5O 1SZ2A 4YDUA 2F9WA 4CBUA 4BQZA 1YUWA 1J6ZA 3KZBA 3ENOA 4B9QA 2YCHA 5AQLA 3AARA 4MLEA 2E2PA 4BC3A 4CZIA 5AFUA 3HTVA 5EOYA 2PBDA 3LDNA 3ULEB 2I7NA 3WXKA 5BPNA 4IO8A 1NGIA 4H5TA 4EHTA 4BR5A 5ADXA 1NGBA 3QICA 4ISGA 3CJ7A 3H3OB 3U8XA 1QHAA 5EVZA 3QB0A 1YAGA 2NZTA 1MA9B 3VERA 5AQHA 3IUCA 2E88A 4H0TB 2A5XA 4KBOA 2P9UB 2V7ZA 4DB3A 3H3NO 2CH5A 3D2EA 3G25A 5BN8A 1P8ZA 4FSVA 2D0PA 3DWLA 3FZKA 4BR4A 2KHOA 2P9IA 4MO5A 4XH5A 4K43A 1HPMA 3A5MC 3J8AA 3ZX2A 2E2OA 2YJFA 1T6CA 3EN9A 4EHUA 4PL7A 1U6ZA 2ASOA 4JNEA 1SQKA 3VEXA 3U4LA 2W41A 2OANA 2E2QA 1G99A 3H6EA 4FWQA 3FZMA 4WQ5C 3VENA 2YHWA 5TKYA 3HBTA 3DXKA 3IFRA 2P9IB 2CH6A 3EKSA 5LY3A 4PL8A 4BC5A 2J4RA 5EX5A 3VOVA 4XH1A 1SAZA 1ATNA 3MDQA 1NGGA 3BP8A 3CI5A 2AA4A 3H1QA 4WQ4C 5E26A 5AFUH 2VCPA 3TU5A 4BR7A 4RWTA 5E84A 3U9ZA 5ADXH 4YDUC 2ASMA 4RCHA 3S41A 1IG8A 3DXKB 2VWBA 3JXUA 5AQQA 2ASPA 3I8BA 3LM9A 1NGAA 1U2VA 3QBWA 1NGDA 3BF3A 3L0QA 5AQPA 4B1UB 5AQSA 3TPQA 2FSJA 1GLCG 3MMVA 4PKIA 4FWMA 3CERA 3O1WA 5ELZA 2V52B 1Z6RA 2UYTA 4BGAA 2CGKA 5AQRA 2ZGYA 1D4XA 2ZF5O 3VEZA 4CZEA 3DXMA 2QWNA 5AQYA 3VETA 5AZIA 3MN7A 3WT0A 1U2VB 3QFPA 3FFKB 4BRMA 2YI1A 1NWKA 3A5OC 4CJ7A 3FR0A 4NB4A 4K41A 4CZLA 5KQ8A 2YHYA 4CI6A 2GWJA 3O5BA 1Q18A 1TYQA 1KAZA 4BRQA 4CZFA 4CD1A 1OKJA 4BG9A 2Q97A 2NLXA 2H3GX 1R59O 1ZXOA 5AZIB 1JCFA 2A42A 3CJ9A 3H1VX 3P4IA 3VF4A 3KVGA 1WUAA 4BRKA 4BC4A 3FZHA 3ID8A 1HUXA 2A6AA 4IJNA 4CBXA 3WQTA 2ZGZA 4BRCA 3QBXA 3CJAA 3A8YA 3FGUA 4HWIA 4M63C 1TYQB 3QDKA 3F9MA 2P9KA 2Q31A 3ATVA 2I7PA 1YVNA 4JN4A 1HX1A 3ZX3A 4FWSA 1BOTO 3EL2A 5LJVA 2QWOA 2D1KA 3WXJA 5AQMA 3SMPA 5JMVA 1IJJA 1Z05A 5BREA 4GNIA 3SMSA 3A5NC 2QXLA 3WUHA 3HZ6A 1KAYA 3UKUA 3VPZA 4CBWA 3B8AX 3VGMA 1QQNA 1RFQA 4BRAA 3MCPA 2QWPA 1JCGA 5AQIA 2BTFA 5FPDA 2Q2RA 1NMDA 1E4FT 3ZX0A 1NGFA 4K42A 1H1VA 2P9LA 4JHDA 2Q36A 4L3QA 2E8AA 2FXUA 4H5NA 2QWMA 2W40A 1GLEG 4AM6A 3MN6A 4E1JA 3EZWA 4BRDA 2P9SA 4H5RA 4BROA 3O1BA 3OHRA 4BG8A 4J8FA 3D2EB 3M3ZA 3UKUB 2FF3B 4IWVA 1LCUA 1XQSC 1NM1A 3O80A 5LJWA 1GLLO 4I6MA 3R6MA 3R8EA 5BR9A 5FPEA 1MWMA 3LDLA 5BPLA 1HKGA 5AQJA 5FPMA 4FWLA 4BRHA 4O8KA 5BRDA 2P9LB 4JHDB 3D2FA 4PKHA 1QZ6A 4BRPA 2HF4A 4FWNA 4EAHD 4H0XB 2P9SB 5AQUA 3SLCA 3C0BA 4K25A 4QS9A 1DGKN 3CIPA 5I9EB 1KXPA 4I6MB 4HTLA 1XUPO 2E1YA 4B1YB 5BRFA 4M7YA 3VEWA 3LL3A 2DPNA 4O5FA 3ENHA 3VEOA 3VGLA 4BRGA 4B1VA 4DQ8A 4EFHA 3C7NA 3FE1A 2CGJA 4BRLA 4QS7A 5EY4A 3CHWA 4H0OA 5CE3A 2F9TA 4F9OA 3VEVA 3FLCO 2E1ZA 1V4TA 4LC9B 3U9DA 4DHYA 1BDGA 5KPRA 3WEEA 4GY2B 4XH4A 5JLHA 2GTDA 5KQDA 3UKRA 3GBTA 3LDPA 2ITMA 4BRFA 5AQFA 1KAXA 1HLUA 5AQNA 2EWSA 3W3DA 3SJHA 5AQOA 2YJEA 3C7NB 3HM8A 3WQUA 1RDWX 2PAVA 3BUZB 3EKUA 1S22A 4BC2A 3LM2A 2GWKA 4IZ9A 1GLDG 3WEEB 3DXMB 3GDQA 5JICA 1K8KA 3UKRB 1GLBG 3QFUA 1T44A 4B1WB 3H46O 3A5LC 3R9PA 4BRIA 4B1XB 4Z94A 3UB5A 2IVNA 5F2RA 1NLVA 1JCEA 1LOTB 3LDOA 4RTFD 3ZETA 5F0XA 1ATSA 2FSNA 3BF1A 4MO4A 2FLOA 2QWRA 1NGJA 1QZ5A 2QM1A 3KHYA 3VGKA 3O6WA 2HMPA 4DCHA 3FZFA 3W0LA 1ZBSA 4H0YB 1BG3A 1ESVA 1QQOA 1QQMA 4BR2A 1K8KB 3GG4A 1C0FA 1HKCA 3MN5A 2ZWHA 3AAQA 3QMLA 1MDUB 2P9UA 4FWRA 3ZETB 2A40A 5EXWA 3CETA 1BU6O 4C23A 4H5VA 3CQYA 1T6DA 3BEXA 4CZHA 3HSCA 1TUUA 5AQWA 1NBWA 3VF2A 4BVPA 4BR9A 2VYPA 4A2BA 1E4GT 2BUPA 4H03B 1GLJO 2P9KB 4FO0A 2HOEA 1X9JA 3AAPA 5F1XA 4JAXA 3LDQA 5AQKA 4QS8A 4BGBA 1XC3A 5AR0A 1ZC6A 5AQZA 2NRHA 3ATUA 2QWQA 2FSKA 2Q0UA 1S3XA 1GLAG 4BR0A 1ATRA 1HKBA 4EIAA 3RSEA 2D4WA 1DKGD 3CQXA 3GOIA 1YXQA 4FWOA 5BN9A 2GEMA 3WXLA 1MWKA 2QWLA 4A61A 2HF3A 3MK6A 3CJ1A 4CZMA 1HJOA 3L6QA 4FWKA 1RGIA 3MN9A 4BREA 3O08A 4FPBA 4CZJA 3FZLA 3D7EO 5KPZA 3RSEB 1NGHA 3M6GA 1CZAN 1BA0A 4A2AA 2V51B 4CZGA 2E2NA 1BUPA 4XEIA 4PKGA 5B8HA 2IVPA 5BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DOLA 4FPAA 4FOEA 3SAFA 4DV0K 1EWQA 1X9SA 5LMNK 1FJGK 4A62A 2CGLA 1VSDA 4R5PA 5HLFA 3SYZA 1S1WA 4JK7A 1SS6A 1IBLK 4AQYK 2ZQBA 4YOXA 3CCMN 5AQGA 1X3MA 3VTIA 5AQVA 2E20A 2GUPA 3DJCA 1VQ8N 1X3NA 3CJCA 4MFBA 3THVA 4L8RB 1S5JA 5CZ2A 1TK5A 4I7FA 4NO7A 1KLMA 1VK0A 3V81A 3TAQA 3VQCA 3TAEA 5DK5A 4E89A 4ISEA 2VWJA 1DEJA 3ZEUB 2Q0RA 4KRFA 2F96A 4X64K 4IOCL 3ZT0A 2ZM6K 5AQTA 3M8PA 1T3VA 1N8RO 4N5SA 4NCAA 1LAVA 1RNHA 1I94K 4DR7K 3V1QA 1ILYA 4IJAA 1N36K 3DLHA 4AM7A 1N33K 3R3LA 3T3FA 4PQUA 3VA3A 3ULEA 3JS6A 1UOCA 4LY7A 5BPMA 4KHPK 3TSPA 1SZ2A 1Q81O 2F9WA 4CBUA 3VMFB 3THXA 3TAGA 1NKEA 1TK8A 4CIGA 1X1PA 2PYJA 2Z1HA 3AA4A 2E2PA 3DLGA 4BC3A 4GVEA 4CFDA 5AFUA 3QEIA 4DTRA 3LDNA 3MXIA 1NGIA 4HHTA 4H5TA 3HK2A 3L2VA 3AO4A 1NGBA 4I9LA 4ELTA 3CJ7A 5EVZA 3VERA 5AQHA 4KB1A 4C8OA 3CM5A 1XWLA 1J5OA 4CK2A 4YOYA 1KVAA 1W9HA 3LP0A 4DR2K 4DTMA 1YT3A 3DI6A 3O4QA 5SZTA 4BR4A 2ZJQL 4XH5A 4K43A 1ZBLA 4JKDA 2QTDA 3ID6A 2OPRA 3ZSVA 3CCVN 1QSYA 4CEEA 2XY5A 4KHYA 1Q86O 2W41A 4M3WA 1QVFM 4FWQA 2Z1JA 1NK8A 4A5AA 1SL2A 3VENA 4K8ZA 1HNVA 3DXKA 2RN2A 2CH6A 4IOXA 4A59A 2J4RA 2RKIA 1WAJA 4OKKA 3TAPA 4EZ6A 3H1QA 3KK2A 5AFUH 3C6TA 1N5YA 3OY9A 4HTUA 3KD5E 4HVJA 4YNQA 2PYLA 4LF4K 4RCHA 3S41A 3ZT4A 1IG8A 1TAUA 3JXUA 5J2MA 2XY8A 4ILHA 1NGAA 2YNFA 1U2VA 3QBWA 1NGDA 4B1UB 3CFPA 1GLCG 4FWMA 3CERA 3O1WA 2V52B 3E9OA 2CGKA 3TABA 2OA8A 2D0BA 4GV9A 3DRSA 4PUOA 1UWBA 3AVJA 3ZYYX 5AQYA 3I56N 3ZSYA 2YNIA 4JI5K 2YKMA 1NWKA 1TKZA 4B9UA 4DSLA 4F3TA 4YOUA 4CZLA 3HXMA 4PHTX 1D8YA 2YKNA 4DSFA 3CXCM 1SUQA 2DFEA 4CF9A 1OKJA 2Q97A 4KH4A 4J2BA 5AZIB 1R59O 1JCFA 2A42A 3CJ9A 3M8QA 3QESA 1EX4A 3WQTA 1QS4A 4IKFA 2Z1GA 1SKSA 4JKGB 2VG6A 3OTOK 4KREA 2FBVA 1VQON 5I3UA 4N47A 2Q31A 4B3RK 1JLFA 3NHGA 4CJSA 2HNYA 3KJVA 3NF7A 5LJVA 2DY4A 5M1KA 1DLOA 5AQMA 2NUBA 3BZCA 3HL8A 1IJJA 2X74A 4GNIA 1G15A 3WUHA 1I3AA 4DR5K 3HZ6A 3RMBA 1KAYA 2O8BA 1SKWA 3SBTA 3RMDA 3CMEN 1RDBA 4H4OA 2QWPA 2O8FB 2YHBA 5AQIA 1B9FA 1NGFA 4K42A 4JKCA 2Q36A 2FXUA 4FLZA 1OH7A 1GLEG 4AM6A 3MN6A 5C10A 3KWIA 4BROA 4ELUA 1XC9A 4DTJA 4BDPA 4J8FA 2EHGA 1JL2A 4DV5K 1Q9XA 5IT9O 4DV6K 4IWVA 4M3RA 3UIQA 4BDYA 1NM1A 5LJWA 2VGMA 4IDKA 3R8EA 3RR7A 5BR9A 1BQMA 4Z4FA 3QIPA 1EKEA 3NGYA 3O9QA 1IBKK 1NJYA 3L3VA 2P9LB 5LMUK 4AHRA 3U3YA 2BGGA 4O4GA 4BRPA 2NRRA 4FWNA 3QEVA 1O1WA 2P9SB 3AO3A 5TKWA 4KH6A 3CIPA 4O0JA 2KFZA 1X9MA 2E1YA 3ZCMA 3QEWA 1KVCA 5BRFA 4JRQA 4M7YA 2DPNA 3VEOA 4FLXA 3KK7A 2OYQA 3O9RA 3PO5A 1OVQA 3VGLA 4A5BA 2OPPA 4B1VA 5KGWA 2OPQA 2CGJA 2WC9A 5CE3A 1LW0A 2F9TA 4K8XA 3CCLN 1NKBA 3FLCO 4LC9B 4OKEA 3JSMA 5CR4A 3NMUA 4XH4A 1BCMA 1J53A 4BY9C 5M1PA 4CK3A 1KAXA 4B9TA 3EZ5A 5AQNA 5CY4A 5AQOA 2YJEA 3C7NB 1P90A 3HM8A 3OVNA 1W7AA 1WB9A 4Q5VA 4IEEA 4BC2A 4NCGA 1Y97A 3EEQA 4IZ9A 4XIUA 3DXMB 3VQDA 3SUNA 3KLHA 1K8KA 1GLBG 1T44A 2NRXA 3H46O 3CFOA 3R9PA 4BRIA 4CJ5A 5KGXA 4DUZK 1YI2N 1RTHA 4E7JA 5F0XA 3HT3A 3BF1A 5KTQA 3E66A 3MEDA 1S6PA 4I2PA 2HMPA 1C6VA 4CJVA 1QQOA 1U47A 1QQMA 5M1OA 4YFUA 3S3NA 3GG4A 1C0FA 3MN5A 4J2DA 3QMLA 1QSLA 3ZETB 4FWRA 3CETA 4Y1DA 4FK4A 1BU6O 3CQYA 1T6DA 1ASWA 2ZJPL 3BEXA 1JLCA 3HSCA 4K0KK 2X6SA 1XNQK 3ZT2A 3VF2A 4DFPA 2D0CA 3SUPA 2VYPA 1N6QA 4FW2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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