3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
b'YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
2FF3B 5KPRA 4H0XB 4JAXA 3CQXA 3LM9A 3CETA 2OANA 2P9NA 1HKCA 4GY2B 3R8EA 3VEVA 4EIAA 2E2OA 1V4TA 2W41A 1BOTO 4I6MB 5B8HA 3CJAA 3L0QA 4EHTA 2YHWA 5BRDA 3RSEA 2ASPA 3FLCO 4H5WA 3C7NB 1XQSC 2P9SA 4FPBA 1BG3A 5AQXA 1NGHA 2FXUA 2ASOA 1U2VB 5KPTA 1MA9B 3DXKB 3H45C 4ISGA 4FL9A 1T44A 4EHUA 3AY9A 3U8XA 3UKUB 3B8AX 4FWMA 3H3OB 1QHAA 4K43A 4BRQA 2CGKA 3VGLA 5ADXH 4IWVA 2YJFA 4XH4A 4BRDA 2A42A 4FWKA 5I9EB 4DHYA 1IG8A 3CJ7A 2GTDA 2P9IB 3WXLA 1NBWA 4A61A 5JLFA 3HTVA 3JS6A 4K41A 4BC5A 3R6MA 4XEIA 2E20A 4BC2A 5JLHA 3VF6A 1HKBA 3EN9A 2V7ZA 3KHYA 1E4GT 1C0FA 2QWMA 4WQ5A 3VF4A 4PL8A 4ISFA 5BRFA 2A5XA 3EKUA 3W0LA 1NMDA 3CJCA 3A0IX 3EKSA 2FLOA 2P9PB 2NZTA 1GLLO 3QFPA 1NLVA 3G25A 3FZKA 4MLEA 5AQHA 4L3QA 4GNIA 2QXLA 3BP8A 4CZJA 3UKRB 2QM1A 5EOYA 4CZLA 3ENHA 4QS9A 4RTFD 2Q0UA 2UYTA 2BUPA 3LDOA 1BDGA 3VGKA 1GLFO 4NO7A 3SLCA 1MDUB 5BREA 4IJAA 2QWNA 3I8BA 5AFUH 5FPEA 3VF2A 1TUUA 4AM7A 3DWLA 4H5RA 1ZBSA 4HWIA 4XH5A 2D0OA 2CH6A 5KQDA 2IVOA 4BREA 3D2EB 3CHWA 2EWSA 3MK6A 4DCHA 3O1BA 3QICA 3S41A 3HBTA 3CJ9A 1V4SA 5AZIB 1X3NA 4JN4A 4Z94A 3HSCA 2GWJA 2HOEA 5AQKA 4H5NA 5AQZA 3J8AA 3QBXA 4I6MA 1NGIA 4FPAA 2HF3A 3O5BA 3C7NA 5AQNA 5AQGA 3I33A 1BO5O 3SK3A 1P8ZA 1U2VA 2VCPA 5ADXA 1QQMA 2VYPA 3DXKA 3U9DA 2HMPA 3TU5A 5LJWA 1LCUA 4BVPA 3UKUA 3ZEUB 2E2NA 2I7PA 3VEXA 1MWKA 2E1YA 2F9WA 4FWNA 3WUHA 1MWMA 1U6ZA 1HKGA 3D7EO 1K8KB 3U4LA 3FGUA 4B9QA 2P9IA 2Q0RA 4IXCA 1KAZA 1NGJA 3LDNA 3VEOA 4BROA 5BPMA 2FSNA 2QW9A 1NWKA 4B1VA 4M7XA 1S3XA 4JD2A 4WQ4C 5E84A 4MLHA 2IVPA 4CZEA 2P9LB 3MCPA 5FPMA 3CERA 4K25A 2QWOA 2FF6A 3EO3A 3W3DA 3CI5A 1ESVA 4CZIA 1HX1A 3DAWA 4M63C 2GUPA 1JCGA 4BRCA 2P9PA 5AQTA 2AA4A 3BUZB 5BN8A 2YHYA 2KHOA 3M1FA 3UKRA 1Q18A 1WOQA 3BF3A 5AFUA 4CZKA 1YXQA 3QBWA 5AQOA 3FZFA 5BN9A 1RGIA 4KBOA 1GLAG 3SJHA 4BG9A 1DKGD 1RFQA 2J4RA 4FOIA 5LY3A 2E2PA 4BRKA 1IJJA 3WEEA 4H5TA 4B1XB 4EFHA 3IFRA 4JD2B 4CZFA 3H46O 4BRPA 5BR9A 4CD3A 4C23A 2I7NA 5EY4A 5KQ8A 3D2EA 3GOIA 3H1QA 4JHDB 1G99A 1XUPO 2QWPA 3U9ZA 3FR0A 2ZGZA 4FWPA 3ULEB 3QMLA 5AZIA 4BRNA 2IVNA 1NGAA 4MO4A 4A2BA 5F0XA 1X3MA 4MO5A 1NGFA 2ASMA 3P4IA 3HM8A 4H0VB 3ZX2A 1ATRA 2D4WA 3BEXA 4WQ4A 3A5MC 2E1ZA 1GLDG 4BGAA 4BRHA 3BF1A 3ZETB 1NM1A 3L4IA 2Q31A 3VOVA 3WEEB 4IZ9A 2Q97A 2A40A 3WXKA 4BR5A 5FPDA 1ZC6A 1Y64A 3MN9A 3ZEUA 4CZHA 2GELA 3TPQA 5AQQA 3AAQA 4BRIA 2YHXA 1T6DA 3SMPA 2FSKA 3D2FB 1K8KA 4H0PA 3O08A 5AQWA 3WXIA 4NB4A 3QB0A 2NLXA 3AAPA 3WT0A 3WXJA 2P9UB 2P9LA 3FE1A 3FZMA 3O80A 3H3NO 2CGLA 5AQLA 5E26A 3HI0A 3IUCA 3MN6A 4BR9A 5AQRA 3ID8A 4FWLA 2GWKA 3KZBA 2H3GX 3ATVA 5AQJA 4BRAA 1SAZA 3ATUA 4BRMA 3QFUA 2CGJA 1R59O 2QWLA 3GE1A 4CBWA 1Z6RA 4B1ZA 1ATNA 4FO0A 2V51B 3VEYA 1BA0A 1NGBA 3H1VX 4H03B 1T6CA 2ITMA 3WQTA 4A2AA 5BPLA 2Q1NA 4BC3A 3O4WA 2V7YA 3GG4A 1GLCG 4BG8A 2YCHA 3DXMB 1E4FT 2A41A 5CE3A 1KAXA 1TYQB 4JHDA 4BC4A 3LDLA 4QS7A 1S22A 4FWRA 3C0BA 4PKIA 3LM2A 3ULEA 3UB5A 3FZLA 2IIRA 4A62A 1HUXA 2AP1A 5TKYA 1EQYA 4B1UB 5AZJB 2W40A 1JCFA 1X9JA 2E88A 3VERA 4BR7A 2BTFA 3LDQA 1QQNA 4BQLA 5FPNA 1RDWX 1QZ5A 4K42A 3ZETA 3ZX0A 2ZF5O 4FWSA 2E2QA 1CZAN 3MMVA 4CZGA 1NGDA 2P9KB 1BA1A 4YDUC 5EX5A 5BPNA 4RCHA 1TUYA 3VEWA 3VPZA 3UE5A 3GL1A 1GLEG 1SQKA 4HTLA 4B1YB 4E1JA 1LOTB 1GLBG 3IMXA 4BQZA 3SMSA 4EAHD 5JICA 2PBDA 4FSVA 4FWOA 3H6EA 1QQOA 4BR2A 3EL2A 5AQUA 1BU6O 3A8YA 1YUWA 1ZXOA 1GLJO 4IO8A 3D2FA 2YJEA 4BRGA 5F1XA 4IJNA 2P9NB 2Q36A 1ATSA 4JNEA 2FSJA 2E8AA 3MN7A 3OHRA 4CBXA 1WUAA 2WUSA 3A5OC 2HF4A 4WYBA 5AQIA 2P9UA 3WQUA 5AQVA 4O5FA 5AQPA 3RSEB 2VWBA 3KVGA 3M6GA 4CZMA 1H1VA 2P9SB 2GEMA 5EXWA 1HJOA 3FFKB 4BVOA 1XC3A 3VENA 4DB3A 1NGGA 2YI1A 3GDQA 4H5VA 3L6QA 2A3ZA 4B1WB 5EVZA 4CI6A 3MDQA 1JCEA 1QZ6A 3MN5A 3O8MA 3VETA 5JMVA 4LC9B 3AARA 4BRLA 2ZWHA 2Q2RA 2D1KA 2V52B 4O8KA 4ISEA 4BGBA 5AQFA 4Y0WA 1HPMA 2DPNA 4H0TB 5BRHA 3HZ6A 5ELZA 1BUPA 3VESA 4YDUA 3R9PA 2F9TA 1DGKN 5AR0A 5F2RA 3VGMA 3ZX3A 3DXMA 2PAVA 1Z05A 3O1WA 4PL7A 1TYQA 1NGCA 4DQ8A 3M3ZA 1YAGA 4BRFA 2D0PA 2CH5A 4PKGA 2ZGYA 1DEJA 4CJ7A 4XH1A 5AZJA 1HLUA 1OKJA 4AM6A 3VEZA 4QS8A 3GBTA 3CIPA 4CBUA 3F9MA 2QWRA 3FZHA 1C0GA 4BR0A 4CD1A 3LL3A 2NRHA 3IDHA 5AQYA 1J6ZA 5LJVA 1YVNA 4FWQA 4M7YA 3LDPA 3CJ1A 3DJCA 1SZ2A 1KXPA 3EZWA 2P9KA 4RWTA 1D4XA 3CQYA 4FOEA 5AQMA 3CJBA 5AQSA 4H0YB 2A6AA 1KAYA 2QWQA 1BWFO 3A5LC 3A5NC 3JXUA 4PKHA 4WQ5C 4BR4A 4F9OA 4H0OA 3QDKA 3ENOA 3O6WA 4J8FA 5KPZA 1NGEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CK2A 4LF9K 3CQXA 3I8DA 4XIUA 1S1WA 2W6LA 1EKEA 3PY8A 1HKCA 4CIEA 5C10A 4GY2B 2O8CA 2XY6A 1QVGM 1LW0A 2UXCK 3PIOL 4I6MB 4Y1CA 4K8XA 4EHTA 2O8DA 4H5WA 1QS4A 4CJLA 1M1KO 1ZBFA 1BCMA 2X74A 4FPBA 3KWGA 5AQXA 2ASOA 2IS3A 4FJ9A 1MA9B 3H45C 1T44A 1HYZA 1JKHA 1KFDA 3B8AX 1I3AA 1QHAA 5MLCQ 2VWKA 4ID5A 1NK5A 4KHSA 4JKGB 3RRGA 2YJFA 4ELVA 5BR8K 4FWKA 5KI6A 3OYHA 1RT5A 4CJ4A 1C0TA 2VQFK 4CVNE 1IG8A 1RT2A 1IO2A 4C8MA 1QE1A 2P5GA 3O3GA 3JSMA 4BC5A 1JLGA 4DSEA 1IBLK 1HKBA 3EN9A 3AO4A 1VSFA 4JK9A 5LL6Z 4LSLA 4WQ5A 1O1WA 4PL8A 3LANA 2NRRA 4ISFA 5BRFA 3AVBA 1UOCA 3MAQA 3DLKA 4B3OA 4ZTJA 1NMDA 2BH1A 1HYSA 3NH2A 1Q9XA 2UXDK 5HLFA 4MLEA 3KLEA 3HVRA 1EXQA 3AVNA 1FJGK 3AVKA 3RMDA 2JWKA 4QS9A 3DLGA 2UYTA 2BUPA 1C0MA 1FKOA 1BDGA 2YNIA 3VGKA 3BZCA 3SLCA 4HCBA 4M41A 3VQ8A 4BE0A 2ZM6K 3I8BA 5AFUH 3VF2A 4DF8A 1TUUA 4M3YA 4AM7A 3V9ZA 4LFAK 3DWLA 4U67L 2VG6A 1RT4A 3OYEA 2D0OA 4A57A 3RMBA 1NK7A 5C24A 3TR8A 4F3OA 3CHWA 3O1BA 3Q7BA 1NKBA 3T3FA 1VSDA 4J2DA 4AHSA 4FZXC 3D6RA 3PX0A 3WNFA 4FPAA 3O5BA 4YORA 4E89A 1Q81O 4B9NA 2YV0X 3SQ0A 3OA9A 3SK3A 3NAEA 1P8ZA 4O4GA 1IKWA 1LV5A 4WFNL 4W5QA 2HMPA 3V81A 1LCUA 2WONA 1NJIO 3PV8A 2WTUA 4NLBA 1YJWN 4FWNA 1OH6A 5DMRA 4PQUA 1RTIA 1U04A 4LH5A 2YX6A 5BPMA 4B3RK 2HNDA 4M7XA 4B8AB 3HPOA 4AQYK 3RMAA 4MLHA 4IDKA 2Y1IA 4CGGA 1S9GA 2QWOA 3EO3A 4HHTA 4KHUA 3OYKA 1HX1A 4IDHA 4CEEA 1BHLA 3V6DA 3CYMA 4KV8A 1JCGA 1NJYA 2P9PA 5E41A 4M3ZA 1LWEA 4DUYK 1Q18A 5LMNK 4OLBA 4W5OA 3OYLA 3FZFA 1UA1A 1U45A 2OTJN 1L5UA 4GV6A 2J4RA 4FOIA 5LY3A 5IWAK 3L2VA 1UAXA 4GV9A 1IJJA 4HCCA 4CK3A 4CJRA 4KHQA 3CCVN 4DQIA 4DTJA 1X9MA 3TAGA 3QIPA 2RPIA 1XMOK 4BRPA 5EY4A 5DM6L 1G99A 2QWPA 2UU9K 3NGZA 3FR0A 3ZSOA 3AVFA 5AZIA 1XHZA 2IVNA 1U49A 2OPRA 4OVLA 4JI6K 3OVNA 1X3MA 2ASMA 2DFEA 3NF6A 3P5JA 4H0VB 5C15A 2D4WA 1VSLA 4IEEA 4FLXA 1KTQA 5J2NA 2GX9A 4GV3A 3VOVA 4CJQA 1X9SA 3HYFA 2A40A 4LF8K 3IKMA 4E19A 5FPDA 3CC2N 3AVHA 4U7BA 2KFZA 2D5RA 4CZHA 2PYJA 2IAJA 3TPQA 4BRIA 3NH0A 4CW7B 4LFBK 1K8KA 1NOYA 3KTQA 4M42A 4N5SA 2UUBK 2ITGA 1VQ7N 3CCJN 2OZMA 4H4OA 4Z4HA 1KCFA 1KLMA 5CHIA 3OY9A 4E7HA 3WT0A 4O0JA 2P9UB 2P9LA 3RTVA 1C6VA 4CFBA 3H3NO 2UXBK 4AHRA 4CJUA 4CGIA 3IUCA 4BDYA 3CCSN 2IOCA 2H3GX 3VMFB 4CJPA 3CC4N 1NOZA 1SAZA 3AGRA 4BRMA 4GW6A 2IGIA 3VQ4A 1Q8IA 1C1BA 2QWLA 4JI0K 4B1ZA 1N32K 1ATNA 4JRQA 2V51B 1NGBA 3H1VX 3WQTA 3F73A 1LW2A 4C8NA 3TSPA 1BGXT 3O4WA 1GLCG 4QCLA 3QLHA 3ZSYA 3NFAA 4JHDA 3RR7A 5KRSA 1S22A 3CCUN 3C0BA 3DRSA 3FZLA 2IIRA 1HUXA 1I94K 4DR4K 2E88A 4AF1A 2HHHK 3VQ5A 3G6EN 4I7FA 1RDWX 4K42A 4FLYA 3ZX0A 2ZF5O 2QA4N 2GBZA 1BA1A 3SAFA 4RCHA 3VPZA 3DLBA 3CCQN 1NG9A 1SQKA 4HTLA 4E1JA 3QEVA 1GLBG 4BQZA 3SMSA 2PBDA 3VA3A 3SJJA 3OS0A 3CCRN 4JYAK 3OYAA 3PLAA 1BU6O 2HNYA 5GAEP 4OPHA 4IJNA 2OTLN 2PY5A 2JWLA 3OHRA 3T19A 2XHBA 1KC8O 5I42A 1TL3A 1NK9A 1DLOA 5AQVA 2WFBA 1YJNN 5AQPA 2O8DB 5KGWA 1QSSA 4CZMA 1GOBA 3BY5A 1SKWA 5EXWA 1Q86O 1HJOA 3FFKB 3NGYA 4CEQA 4F8RA 1XC3A 3HO1A 5M1FA 2KZMA 5K14A 4CJWA 4GKJK 3GDQA 3L6QA 4MQ3A 1W9HA 5HBMA 3V9WA 4JI2K 1KFSA 2Z1IA 4AH9A 3V9UA 2Z1HA 1RBUA 3AV9A 3AARA 4BRLA 4KHPK 3HL8A 3MX2A 2O8EA 5AQFA 3G71N 1HPMA 1XNRK 1CXQA 3TTFA 4B9VA 3LPUA 4AILC 3MX5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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