3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
1JCEA 2V52B 3SK3A 4IXCA 5BR9A 2F9TA 4EAHD 3ZETB 4BR9A 3TPQA 5AQIA 4AM6A 4QS7A 3GE1A 4IWVA 3AY9A 4M7XA 1K8KB 3MMVA 2H3GX 2P9LA 3DWLA 4BR2A 4K41A 2E2QA 4CBUA 4IO8A 2V7YA 3LM2A 3HBTA 4JD2A 1HKGA 3A5MC 5AQGA 3BF1A 3U9DA 4GY2B 1HLUA 2W40A 1QHAA 1QQNA 5FPMA 4BRMA 3D2EB 1NLVA 3CJAA 2QWRA 3EZWA 3P4IA 1TYQA 3O5BA 3O08A 4CZJA 4BRAA 5BPLA 2FSKA 5BN9A 4BC5A 2Q36A 5AZJB 1HKBA 2BUPA 4B1XB 1GLBG 4FWMA 2J4RA 2P9KB 5AQNA 4B1YB 2IVNA 4BR5A 5ELZA 3RSEA 4HWIA 4JAXA 4DHYA 3W3DA 3IMXA 1QZ5A 1S3XA 4BRPA 1X3MA 5AQZA 5ADXA 5AZIB 4FWQA 4KBOA 1SAZA 4QS9A 3LDNA 4DCHA 2IVOA 1BOTO 2E1ZA 3SMSA 2AP1A 2P9UA 1C0GA 2YHWA 3S41A 3HM8A 4F9OA 3FZLA 3UKUA 2WUSA 3H3NO 2P9SA 1Y64A 5LJWA 3G25A 2P9LB 3QICA 1NBWA 5AQSA 3C7NA 3VERA 1Z6RA 3ULEB 3FZFA 1E4GT 4PL7A 4JD2B 2QWOA 4IJAA 3MDQA 2ZF5O 4EFHA 5AQQA 3QBWA 2ASMA 4JHDA 2DPNA 3JS6A 4H5VA 1GLCG 4CBXA 3LL3A 2Q2RA 1HPMA 2GTDA 4H0YB 4BRHA 3CJBA 1JCGA 3VETA 5EY4A 3I8BA 3FLCO 1JCFA 1HKCA 1TYQB 2VCPA 3GBTA 1NWKA 2A41A 1NGBA 1DGKN 5AQMA 1YUWA 4FSVA 3DXKA 1TUYA 4CZMA 2A40A 2EWSA 4FL9A 5TKYA 3FZKA 4CD1A 4FOIA 1LCUA 3VEVA 3RSEB 2D1KA 1GLAG 3WT0A 1T6DA 2F9WA 3VF2A 3U9ZA 3VESA 1BU6O 3SLCA 3VGKA 1RGIA 1HJOA 3BF3A 4J8FA 3JXUA 1X3NA 2FLOA 4NB4A 3EO3A 4BRLA 3FGUA 3WUHA 1QQMA 1YAGA 5I9EB 3UKUB 2D0PA 4LC9B 2A5XA 2P9SB 5BRFA 5KPRA 4BRIA 5F0XA 4B1UB 3C7NB 3QB0A 2QM1A 1RFQA 5AQPA 2NZTA 4CZHA 4RWTA 4MO5A 1IJJA 3H1QA 3A5OC 3ZEUA 2CH5A 2GEMA 4BREA 1GLJO 4H0TB 4JHDB 4EIAA 3ZX3A 4M63C 3CIPA 1QZ6A 1ZBSA 2V51B 5KQ8A 4WQ4C 2HF4A 1CZAN 1BA1A 5B8HA 4B9QA 1BA0A 4FO0A 3VGLA 5AQYA 3HI0A 3KZBA 5AFUH 3D2FA 1GLEG 4B1VA 3FE1A 4BR4A 2ZGZA 3HTVA 4WQ4A 3VF6A 1NGEA 3CJCA 4MLEA 3GG4A 4B1ZA 4H5WA 3CJ9A 4EHUA 2A42A 3EL2A 4FWSA 5AQXA 1V4SA 2UYTA 1TUUA 1X9JA 3ZX2A 3FZHA 3CQXA 5JMVA 3TU5A 4BGAA 4BRNA 2QWQA 1NM1A 4ISGA 1IG8A 4CBWA 2ASPA 3LDPA 2Q97A 5BN8A 3IUCA 1SQKA 1Q18A 2ASOA 2E20A 3WEEA 1XQSC 4BR7A 4BC3A 4BRQA 4PKGA 4BVOA 2Q31A 5AQUA 2W41A 1MDUB 3ATVA 4FPBA 2QXLA 4FWKA 5FPEA 1BO5O 3WXKA 2BTFA 3MN9A 5JLHA 1MWMA 4PKIA 5EOYA 1T6CA 3ZEUB 3EKSA 1SZ2A 3DXMA 3A5NC 3MCPA 1HUXA 3MN5A 5AQJA 3LDQA 2GWKA 3W0LA 4ISFA 4CD3A 3I33A 1C0FA 3VPZA 5KPZA 3ENOA 2FF3B 3H1VX 5LJVA 2QWMA 3D2FB 3VEYA 4BG8A 1ATNA 2Q0RA 3ATUA 5KQDA 4CZLA 5AR0A 1NGAA 3WQTA 4O5FA 1NGHA 2GUPA 3UKRA 3VEZA 2GELA 3GDQA 4H0OA 2FSJA 4BROA 3FZMA 4FWRA 4H03B 1DKGD 1U6ZA 3AAQA 1BG3A 2PBDA 5E84A 2E2OA 3UB5A 2AA4A 2P9PA 4FWOA 5BREA 1H1VA 4H0XB 3WQUA 3U4LA 4M7YA 2D4WA 1GLLO 4QS8A 1Z05A 4A61A 3AARA 2HMPA 5F2RA 2HF3A 3BP8A 1RDWX 4BR0A 2YHXA 1MWKA 1V4TA 5BRHA 2I7NA 4Y0WA 5AQTA 1OKJA 3GOIA 4MLHA 1ZC6A 4GNIA 4H5TA 4CZKA 3LDLA 2P9UB 3WXLA 1KXPA 2YHYA 1NGJA 5AFUA 3EKUA 3DXMB 4JNEA 3O6WA 4CZFA 4DB3A 2VYPA 1XUPO 3QBXA 3FFKB 3R6MA 3L0QA 1LOTB 3VEXA 1ESVA 2QW9A 4XH5A 2VWBA 3C0BA 4H0VB 5FPNA 3VEWA 3O1WA 4BG9A 4L3QA 3L4IA 5EXWA 3QDKA 3CERA 5F1XA 3H46O 2GWJA 3QMLA 4BRFA 2A6AA 3UKRB 1E4FT 3H45C 3VGMA 4O8KA 4I6MA 3ID8A 3VOVA 2KHOA 4JN4A 5EVZA 3O80A 4PKHA 4BRDA 1HX1A 3ZX0A 3DXKB 1BWFO 2P9PB 2Q0UA 3HSCA 5AQRA 4BRKA 3CI5A 4A2AA 2D0OA 1QQOA 3ULEA 5FPDA 2YJFA 3VENA 2P9IA 3A8YA 4BGBA 3O8MA 3UE5A 5BRDA 3CJ1A 5AQLA 5BPNA 2V7ZA 3A0IX 3L6QA 4FWPA 1NMDA 1XC3A 3H6EA 2NRHA 2CGJA 4CZEA 4H5NA 3LDOA 5JLFA 4NO7A 1G99A 4ISEA 2CGKA 2E88A 4HTLA 2E2PA 2E1YA 2P9NA 1BDGA 1GLFO 4CI6A 3DAWA 1WUAA 2IIRA 1NGGA 4BRGA 3MK6A 4RCHA 4XH4A 3U8XA 4FOEA 2I7PA 4WQ5C 4BC4A 4XEIA 4BVPA 5AQFA 2YCHA 1KAYA 4PL8A 3CHWA 3QFPA 1YVNA 3O4WA 4WQ5A 1NGFA 1T44A 5KPTA 5AQWA 4I6MB 5BPMA 1P8ZA 1WOQA 2PAVA 3IDHA 2NLXA 1NGCA 2IVPA 3WXJA 5JICA 3GL1A 2CGLA 2E2NA 1U2VA 3CQYA 2CH6A 4CZIA 3WXIA 3AAPA 3M3ZA 5AQVA 5CE3A 3ENHA 4K42A 4BC2A 4BQZA 3KHYA 4MO4A 1GLDG 4EHTA 1ZXOA 4H5RA 3ZETA 1BUPA 3F9MA 3CETA 3CJ7A 4BQLA 2P9IB 3HZ6A 5ADXH 3BEXA 4WYBA 1K8KA 3R8EA 1NGIA 4A2BA 3KVGA 1NGDA 3J8AA 3VEOA 2FXUA 4H0PA 3O1BA 2E8AA 4Z94A 2QWNA 2QWPA 4E1JA 3WEEB 3SMPA 2ITMA 5AQOA 4A62A 2FF6A 2Q1NA 4IJNA 2A3ZA 3H3OB 3MN7A 5E26A 4CJ7A 4XH1A 2YI1A 5LY3A 2P9NB 3BUZB 4YDUC 1ATRA 3QFUA 3M1FA 1DEJA 1D4XA 3D2EA 1R59O 3SJHA 4BRCA 3M6GA 4RTFD 3A5LC 3D7EO 2ZWHA 3VF4A 4YDUA 2QWLA 1S22A 5EX5A 5AZJA 3OHRA 2P9KA 4FWNA 4IZ9A 3B8AX 2HOEA 1YXQA 4K25A 3EN9A 4FPAA 4C23A 2OANA 1EQYA 1ATSA 5AQHA 4AM7A 3R9PA 1U2VB 5AZIA 3MN6A 1MA9B 3LM9A 3FR0A 5AQKA 1J6ZA 3DJCA 2YJEA 2ZGYA 4DQ8A 2FSNA 3IFRA 4FWLA 4K43A 4CZGA 4B1WB 1KAXA 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SPZA 4DTUA 1XHZA 3V81A 1U47A 3OYJA 3ZETB 4QS7A 3GE1A 4E7HA 1G15A 1Z26A 1VQ8N 2UUCK 4A57A 2HBKA 4KHWA 4FVMA 3VQ4A 4OGEA 4JK8A 2UUAK 4ZTFA 3ID6A 2VG5A 1HPZA 5KRSA 2KZMA 3BF1A 2D5RA 3U9DA 2HW3A 4DQQA 3CPEA 1IG9A 2YHAA 3PV8A 1X9WA 1CXUA 3VTHA 4KREA 1RBVA 1W0HA 1TYQA 3O5BA 3O08A 4CZJA 4FLVA 3HOTA 4E7KA 1NKEA 2OZSA 4B1XB 1C1AA 2J4RA 5CZ1A 1BCMA 5JS1A 1IH7A 5ELZA 3RSEA 2OA8A 1CZBA 2HHXA 4B9NA 1QZ5A 4BRPA 2DFEA 5AQZA 1U04A 3SV3A 2Y1JA 5CY4A 1SAZA 4QS9A 1LWEA 3SMSA 1CLQA 3NMUA 4CGJA 3UKUA 2HBJA 3H3NO 3TAQA 4EP5A 2P9LB 3KD1E 2F96A 4FLXA 4LSLA 3RRHA 3FZFA 1E4GT 4PL7A 4W5NA 2ZF5O 4NLBA 3QBWA 1S1WA 3BZKA 2E6LA 4DV0K 1WNSA 4DV5K 3KK3A 3VQ9A 4B9LA 1HKCA 5HRRA 4KH4A 5HL7L 2OPSA 1NWKA 2A41A 1NGBA 3AVFA 4BE0A 4CZMA 3WNEA 1XMOK 2YX6A 2A40A 2EWSA 3MX2A 3OJSA 4DR7K 1LWCA 1GLAG 2WOMA 3I55N 1HNIA 2F8TA 4IOAL 3U9ZA 4CJSA 3VESA 5E41A 4F3TA 1BU6O 1RGIA 4J8FA 3JXUA 1X3NA 2FLOA 1U49A 3FGUA 3WUHA 1Q9XA 2GUIA 1RBTA 4CJUA 1YAGA 1O13A 2A5XA 4DU3A 3V1OA 2YNFA 4E7JA 5F0XA 3V9WA 1L3SA 3QB0A 4E7IA 3LZIA 4CZHA 3OYHA 5C24A 4I7FA 3I56N 1N5YA 2GEMA 3ALYA 4H0TB 3NF6A 4JHDB 4JI5K 3BZCA 3KK7A 3ZCMA 3EEQA 2DFHA 5J2PA 3HI0A 3KZBA 2YKNA 5C25A 3BDPA 1C1BA 3VQPA 2RE2A 4KKOA 4I9QA 3V4IA 3JYTA 4Y1CA 3VF6A 3CD6N 3CJCA 5HOOA 3DLRA 4DTOA 4EHUA 3HJFA 1YTAA 2VWKA 2UYTA 4CHQA 4OJRA 4CJRA 3IUCA 2O8DA 2ASOA 2E20A 2D0AA 4CJ4A 4XIUA 3CPWM 4BRQA 1HNWK 4PKGA 3TTCA 5AQUA 4FJMA 4FPBA 5FPEA 1BO5O 3V6DA 1VAZA 3JSMA 2BTFA 5JLHA 2Z1JA 4PKIA 3NFAA 4FLWA 1SZ2A 3A5NC 3MCPA 1D9FA 3CC2N 2OZMA 5FROA 3THYB 4CD3A 3I33A 4DSJA 1KLNA 4FW1A 2QWMA 4FJXA 3M5RA 3VEYA 3VQ5A 4DG1A 1EXQA 2HHVA 4FJ8A 3ATUA 4DR6K 4HCCA 3OW2M 2ETJA 1QHTA 3WNFA 4BDZA 1TAQA 4BROA 1OH6A 1EWQA 4H03B 4BWMA 1U6ZA 2PBDA 5E84A 2E2OA 4YOWA 3UB5A 1VQ4N 2AA4A 3T1AA 1H1VA 4DSIA 4FJNA 4H4MA 1VHXA 1Z05A 4HUGA 3AARA 5F2RA 1HNZK 2O8CA 4M3WA 1REVA 1MWKA 4DSFA 5DM6L 5CYQA 3QERA 3O9TA 4Y0WA 4C1NI 3KLFA 1OKJA 4MLHA 4L8RB 1ZC6A 5J2MA 4JI0K 4GNIA 1SL1A 4DUZK 4H5TA 1SKWA 3LDLA 3TR8A 4N5SA 3WXLA 3ZT1A 3NF9A 2YHYA 4YOYA 4DR2K 3DXMB 4DV7K 3KJVA 4KAZA 4DU1A 2O8FA 3U6FA 3SQ2A 4DB3A 3L0QA 1LOTB 3THVA 5C2FA 3RRGA 2VWBA 1R0AA 4L3QA 4RW4A 1E4FT 4WFBL 4CJQA 2KHOA 5EVZA 4BRDA 3NGZA 1BWFO 2P9PB 2Q0UA 3DI6A 3PSFA 1L3UA 3CI5A 1S1XA 4LD0A 4GW6A 5FPDA 2YJFA 1VSLA 3OBWA 2UXCK 3DLEA 4ELUA 4BGBA 3THWB 3O8MA 1TV6A 4ILJA 3VTIA 2WTUA 2O4GA 1SL0A 1NJIO 4LY7A 4M42A 4A59A 4DV6K 4KHPK 5SWMA 4Q0BA 1ZBUA 4NO7A 3VQ6A 3MWPA 3SQ1A 1RT3A 1BCOA 1NOZA 4PWDA 1HNVA 3HK2A 3F5TA 3L2QA 4CI6A 4BDPA 5M1QA 4N56A 4RW9A 4FOEA 4FLTA 4IDHA 5AQFA 1BQNA 1KAYA 1S9GA 1JJ2M 3ZLJA 1L3VA 4UQGA 1S5JA 4F3OA 4WQ5A 2UUBK 4CJVA 5KPTA 5AQWA 1WOQA 2NLXA 4CF0A 2VWJA 1NGCA 1GOCA 4ILHA 5JICA 3GL1A 2CGLA 4CFAA 1K8AO 1Q9YA 2UU9K 4X62K 1N6QA 4LH5A 5HRNA 2W6KA 3H08A 4MO4A 4EHTA 3NBPA 1Q81O 3N4PA 1SV5A 1BUPA 1Q8IA 3TAFA 2P9IB 3HZ6A 4M3TA 5ADXH 3BEXA 4X65K 2HHTA 1K8KA 4A2BA 1QSSA 4PHTX 3M8RA 3VEOA 2A1SA 4LFAK 3HOSA 3O1BA 4B9MA 4Z94A 3WEEB 4MDAA 4G9ZA 4R5PA 2FF6A 2Q1NA 2RF2A 2A3ZA 3MN7A 4CJ7A 3NDKA 2YI1A 1NK5A 5LY3A 2P9NB 3TTDA 4YDUC 4YOXA 3S3OA 4AHUA 3D2EA 1R59O 1WN7A 3SJHA 4A5AA 1VQNN 3M6GA 3F73A 3A5LC 1ASWA 3VF4A 1T03A 3AVGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JCE A;  2V52 B;  3SK3 A;  4IXC A;  5BR9 A;  2F9T A;  4EAH D;  3ZET B;  4BR9 A;  3TPQ A;  5AQI A;  4AM6 A;  4QS7 A;  3GE1 A;  4IWV A;  3AY9 A;  4M7X A;  1K8K B;  3MMV A;  2H3G X;  2P9L A;  3DWL A;  4BR2 A;  4K41 A;  2E2Q A;  4CBU A;  4IO8 A;  2V7Y A;  3LM2 A;  3HBT A;  4JD2 A;  1HKG A;  3A5M C;  5AQG A;  3BF1 A;  3U9D A;  4GY2 B;  1HLU A;  2W40 A;  1QHA A;  1QQN A;  5FPM A;  4BRM A;  3D2E B;  1NLV A;  3CJA A;  2QWR A;  3EZW A;  3P4I A;  1TYQ A;  3O5B A;  3O08 A;  4CZJ A;  4BRA A;  5BPL A;  2FSK A;  5BN9 A;  4BC5 A;  2Q36 A;  5AZJ B;  1HKB A;  2BUP A;  4B1X B;  1GLB G;  4FWM A;  2J4R A;  2P9K B;  5AQN A;  4B1Y B;  2IVN A;  4BR5 A;  5ELZ A;  3RSE A;  4HWI A;  4JAX A;  4DHY A;  3W3D A;  3IMX A;  1QZ5 A;  1S3X A;  4BRP A;  1X3M A;  5AQZ A;  5ADX A;  5AZI B;  4FWQ A;  4KBO A;  1SAZ A;  4QS9 A;  3LDN A;  4DCH A;  2IVO A;  1BOT O;  2E1Z A;  3SMS A;  2AP1 A;  2P9U A;  1C0G A;  2YHW A;  3S41 A;  3HM8 A;  4F9O A;  3FZL A;  3UKU A;  2WUS A;  3H3N O;  2P9S A;  1Y64 A;  5LJW A;  3G25 A;  2P9L B;  3QIC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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