3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
1YAGA 1NGHA 1K8KA 4BRGA 5AQPA 3WXLA 1BOTO 3AAPA 5EVZA 4CZLA 4FOEA 3I8BA 2GUPA 3F9MA 4K25A 4CZMA 1T44A 4BROA 1S3XA 2FSKA 2A5XA 2YHYA 4FWMA 4BC5A 4PL7A 2A40A 3A8YA 5AQNA 5F2RA 3UB5A 5AQSA 3WXJA 4PL8A 5AQHA 2E2QA 3LM9A 2P9UB 4RWTA 2ASPA 4CD1A 5F1XA 3OHRA 3VEYA 4QS7A 4FWOA 2EWSA 2FSNA 3QFUA 4JD2B 5FPNA 1QZ5A 3VF6A 5ADXA 1U2VB 3VEVA 4I6MA 1HX1A 3ATVA 5I9EB 2QWOA 3HI0A 3M3ZA 3WT0A 4FWQA 4BREA 4ISEA 3AAQA 4XH1A 5BPNA 2P9SA 4DHYA 1QHAA 3BP8A 3MN7A 1QQNA 3M6GA 3CJAA 3SMPA 1V4TA 2QWPA 1HLUA 2P9PA 4K42A 2PAVA 4IJAA 2NRHA 1MWMA 4PKGA 5CE3A 3VGLA 4FWNA 4M7YA 3CETA 3KVGA 3MN9A 2OANA 3VEWA 1GLBG 5FPDA 5JLHA 3LM2A 2YHXA 4BR4A 4GNIA 1KAYA 3SMSA 3CJBA 3U8XA 2V7YA 5AQFA 4L3QA 4IXCA 3CERA 5BREA 2YJEA 4YDUA 3H6EA 5AQOA 1DEJA 1DGKN 2A42A 4H0YB 4BRPA 2CGLA 3L0QA 2P9SB 2CGKA 2GWKA 3G25A 2A3ZA 3BEXA 4MLEA 1ATSA 5KQDA 2P9LA 2Q97A 3A0IX 2Q31A 3WXIA 2YI1A 3FLCO 4M63C 3D2FB 4CZHA 3A5NC 1Z6RA 3HTVA 4PKHA 4F9OA 3VENA 4H0PA 4H5WA 3RSEB 2E8AA 3QB0A 3MMVA 4MO5A 3C7NA 3DXMA 4DB3A 2V51B 1RGIA 2GWJA 3DJCA 2IVOA 4BRQA 2VYPA 3GE1A 3WQUA 3EL2A 3HBTA 5AQXA 3HM8A 2QWMA 2FLOA 1HKGA 2Q36A 3CJ9A 2E1ZA 4PKIA 1Z05A 2E2PA 4BG9A 4EHTA 2VWBA 3D2EA 3SK3A 1NGAA 5B8HA 3MCPA 3KHYA 4A2BA 3CIPA 2HMPA 3FFKB 3H3OB 3M1FA 1XQSC 3WQTA 1K8KB 1QQMA 4M7XA 3WUHA 3CQXA 2P9IA 1CZAN 2P9LB 3O8MA 4IJNA 4MO4A 4B1ZA 1QZ6A 4JNEA 2V7ZA 5AQGA 1X3NA 4B1WB 1ATRA 3J8AA 2AA4A 3VEXA 3AY9A 4EFHA 2W41A 5AQVA 3CI5A 4XEIA 4NB4A 3ENHA 1R59O 3IMXA 3O1WA 3FE1A 1NGIA 1HJOA 1MDUB 5AQJA 4BRLA 2Q2RA 2D0PA 3UKRA 1WOQA 4B1XB 4ISFA 3CHWA 3S41A 4AM6A 4WQ4A 3FZMA 3L4IA 1ATNA 3VESA 4CBWA 5AZIA 5LJVA 1NBWA 3EZWA 4XH5A 2CH6A 3CJCA 1XC3A 3H1VX 5EXWA 1X9JA 5AFUA 2E2OA 2FF6A 2IIRA 5BRHA 2F9TA 4WQ4C 3VOVA 3P4IA 3ZEUB 1LOTB 2D1KA 2QWNA 1MA9B 1G99A 4MLHA 3TPQA 4BR2A 1GLEG 2NZTA 3BF3A 2I7PA 1DKGD 3H45C 3FR0A 2YHWA 4H5TA 1H1VA 5KQ8A 4B1UB 4CJ7A 3CJ7A 3O1BA 5ADXH 2V52B 5BPMA 1KAZA 4H0OA 2E20A 1SZ2A 1BDGA 1X3MA 3WXKA 1SQKA 4ISGA 3FZKA 3RSEA 2HF3A 3LDLA 4BR0A 5BPLA 1YUWA 1ZXOA 2QW9A 5F0XA 2H3GX 3VERA 3D2FA 3TU5A 1MWKA 5KPZA 4GY2B 1BA0A 4C23A 1RFQA 1NGJA 4JN4A 5AZJA 3DXKB 4H5VA 3O5BA 4IO8A 4LC9B 1GLAG 2ASMA 3UE5A 1NWKA 3CJ1A 4EAHD 3SJHA 4BC3A 1T6CA 1OKJA 2KHOA 3D2EB 3LDPA 4RTFD 3DWLA 2P9KB 2F9WA 2VCPA 3D7EO 2DPNA 1NGDA 3MK6A 4BR9A 4BRHA 4DQ8A 3O6WA 5AQZA 1JCGA 3QFPA 2BTFA 5AQIA 5AQRA 1HPMA 3LDOA 4FPBA 1EQYA 1C0FA 1WUAA 3AARA 2IVPA 5JMVA 1U2VA 2QWLA 4BC2A 4BVOA 2W40A 4WYBA 3ULEB 4Z94A 4FWPA 4BG8A 2ZGYA 1YXQA 3DAWA 4JAXA 4JHDA 3H3NO 3WEEB 3JXUA 1LCUA 3O08A 4B1YB 3UKUA 5LY3A 3CQYA 4CZJA 3H1QA 4WQ5C 1E4FT 4FWKA 4BRCA 4CD3A 2HF4A 3C7NB 2D0OA 3DXMB 1C0GA 3GL1A 3VF4A 4DCHA 4RCHA 4BRMA 5KPRA 3A5LC 1P8ZA 2D4WA 2PBDA 2QWQA 2Q0RA 5EY4A 4CZIA 4H0TB 1HKBA 3IUCA 3VF2A 1J6ZA 1GLCG 3U9ZA 1ESVA 2CH5A 4FL9A 3LDQA 1TUUA 5AZIB 4BRNA 3HSCA 1TYQA 1ZC6A 3UKUB 5EX5A 3QMLA 3ZETB 3FGUA 5BR9A 4CBUA 3GOIA 3MN5A 4XH4A 2E2NA 3B8AX 5AQMA 3VPZA 2YCHA 1NGEA 4H5RA 2AP1A 5LJWA 2P9UA 2CGJA 1Y64A 5ELZA 1YVNA 4FWSA 2FSJA 3W3DA 3H46O 4BGBA 3VEOA 1XUPO 1HKCA 4FSVA 4H5NA 2Q1NA 2FF3B 4H0VB 4QS8A 3HZ6A 5AQKA 4BQZA 3FZLA 3EKUA 4FWRA 5BN9A 1SAZA 5JLFA 5AQUA 5E84A 4BC4A 3UKRB 1IJJA 1BA1A 1KXPA 3BF1A 2Q0UA 2HOEA 3MDQA 5AQLA 3FZFA 2WUSA 3IFRA 1T6DA 3I33A 3U9DA 1NM1A 4YDUC 1TYQB 3O80A 4JHDB 4FPAA 1IG8A 1BG3A 2A6AA 5AZJB 2QXLA 3EN9A 4WQ5A 5BRDA 4K43A 4FOIA 4A62A 3O4WA 1RDWX 1S22A 4H0XB 4NO7A 3ZX3A 3W0LA 2FXUA 3SLCA 4AM7A 3C0BA 3QICA 5EOYA 3DXKA 2P9KA 1GLDG 5KPTA 3FZHA 1ZBSA 3VGMA 3ZX0A 4BGAA 2YJFA 4HWIA 4KBOA 4B9QA 2UYTA 4HTLA 4BR5A 2A41A 4E1JA 2P9PB 2GELA 2IVNA 2QWRA 1JCFA 3MN6A 3KZBA 2ZWHA 5AQTA 1V4SA 3ID8A 2E88A 4FWLA 3ZETA 4FO0A 4B1VA 3L6QA 3LDNA 4BR7A 2GEMA 4CI6A 3A5OC 1GLJO 3U4LA 4CZKA 4CBXA 1JCEA 3EKSA 2ASOA 3A5MC 1NGCA 4BRFA 4CZGA 1D4XA 1HUXA 5AQQA 3R8EA 2GTDA 3ENOA 4EIAA 3QBXA 4IWVA 1U6ZA 3QBWA 5E26A 4BRAA 3GDQA 4BRIA 1BUPA 1BWFO 1QQOA 3VETA 5JICA 5TKYA 1NLVA 3BUZB 1Q18A 2P9NB 3VEZA 4BQLA 3ZX2A 2QM1A 3WEEA 3JS6A 2J4RA 3ZEUA 5FPMA 1BU6O 4BRDA 5AQWA 2E1YA 3GG4A 4A61A 4QS9A 5BRFA 1KAXA 4JD2A 4O5FA 4Y0WA 5AFUH 2P9IB 3ULEA 1TUYA 2ZGZA 3R6MA 4A2AA 4IZ9A 2BUPA 2P9NA 2ZF5O 1NMDA 4BRKA 4CZEA 5FPEA 3IDHA 1NGBA 1NGFA 2ITMA 4I6MB 1GLFO 4EHUA 5AQYA 3ATUA 1E4GT 4H03B 2I7NA 4O8KA 3LL3A 1GLLO 3VGKA 4J8FA 4BVPA 2NLXA 1BO5O 5BN8A 3QDKA 1NGGA 3GBTA 3EO3A 3R9PA 4K41A 4CZFA 5AR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YAGA 1NGHA 1K8KA 1KVAA 5AQPA 1VHXA 4DV2K 4FK2A 4CZLA 4JKHA 5EVZA 4LF8K 3KLGA 1FKOA 4CHPA 4K25A 4CZMA 3KLHA 2FSKA 2GUIA 2YHYA 1KLNA 1VQ9N 2A40A 3LANA 5AQSA 1JLQA 5AQHA 2E2QA 4BDZA 4DV1K 4DTPA 2P9UB 4Z4HA 4BE1A 4M3ZA 4WFBL 4JI2K 5F1XA 3PX0A 1QVGM 4JD2B 3VQ8A 1S1TA 1SV5A 3KWIA 3VF6A 4E3SA 5HOOA 3ENBA 1REVA 3PSIA 3ATVA 5I9EB 4DSLA 1Q81O 3HXMA 3PUFA 1I39A 4CJQA 4FJHA 3WT0A 3AO2A 4B9NA 3AAQA 5JS1A 1WN7A 3TAPA 3OYMA 4V19S 3VQBA 3SMPA 5TKWA 1Q7YO 4IJAA 4W5NA 4FZZA 2JWLA 1JLBA 1DTTA 3ZT3A 2HNDA 2ZJPL 3D0PA 3ISNC 4DU1A 3CETA 3KVGA 3MN9A 3LP0A 1XWLA 3K58A 2X6SA 4FXDA 1N34K 4L3QA 3TSQA 3CERA 5BREA 2O8DA 5AQOA 4CIEA 2A42A 2P9SB 3RMAA 1S1UA 2GWKA 3PX6A 2A3ZA 4DTNA 2G8FA 4PWDA 2AJQA 1Q82O 2KLAA 2RF2A 3OYNA 3A0IX 4KH6A 4DUYK 2VWKA 1NJZA 4M63C 1BCOA 2UUCK 1Z6RA 4EZ9A 4H0PA 4H5WA 4Z4CA 4CK3A 1RT6A 3QEXA 3SBGA 3RMDA 2E8AA 3QB0A 4GVEA 3ZSZA 5D3GA 4N5SA 5J2NA 1RGIA 4JI7K 3OS2A 4IOAL 2YNFA 3LAKA 3C95A 1HKGA 4EHTA 1Z05A 4BG9A 2QEXN 3L2WA 3C6UA 3KHYA 3IG1A 1EXQA 1VQON 3CIPA 3WXMB 1VSKA 3QEIA 4LH5A 2OPPA 3WNHA 4LY7A 3ULDA 3K5MA 2KQ2A 1NK8A 4M7XA 3OYEA 1ASUA 1W0HA 2P9LB 4IJNA 4M3RA 4DS4A 4C8KA 3NGIA 5AQGA 2O8CA 1E3MA 4CJRA 4DTUA 4KHSA 5C15A 3TAFA 5AQVA 3CI5A 4CJ3A 3HPOA 3SJJA 1R59O 1IO2A 4FJ7A 2KFNA 4E7KA 4X62K 3DOLA 3ZSRA 3KTQA 3KWGA 1HJOA 4FLXA 4CJ4A 4DTXA 4E1MA 1WOQA 4B1XB 4ISFA 3CHWA 1JXEA 2VWJA 3T69A 4DTOA 4DFPA 1QSYA 4WQ4A 4FZYA 3RRHA 3K5NA 1ATNA 2HHUA 1RILA 4QOZB 3OBWA 2KW4A 3VESA 4F2SA 1CZ9A 4FVUA 4KHYA 5LJVA 1NBWA 5FDLA 4XH5A 3ZSOA 3CJCA 2O8EB 1VQ7N 3K9JA 4YHHK 5EXWA 1X9JA 2ZQBA 4RW7A 2XY7A 5AFUA 2O4IA 5CZ1A 2VGMA 5BRHA 1ZBLA 4W5OA 4DTJA 4CEQA 3P4IA 1LAVA 2QWNA 1YF5L 1MA9B 1G99A 2BH1A 3TPQA 3SQ0A 2G8HA 2O8FB 1GLEG 2YHAA 1ITGA 3CJ7A 4B3RK 3DLGA 3M8PA 5BPMA 3M5RA 1G15A 3N4PA 2DY4A 1SZ2A 1BDGA 4ISGA 2X6NA 3ALYA 3T7ZA 4BR0A 3MAQA 5KPZA 1EWRA 1BA0A 4HCCA 1RFQA 1L5UA 5AZJA 4DS5A 3TAQA 2HHHK 2HHVA 4CFCA 4CERA 1EX4A 4FK4A 4GW6A 1W97L 4LFAK 4OLAA 3CJ1A 3CCQN 4IFEA 4JKGA 3IAYA 3SJHA 4CJWA 3I0RA 4DSFA 1OKJA 3LWLA 1RBRA 2VCPA 3VQ6A 3AVBA 3OBYA 2RPIA 1NGDA 2B4JA 3O6WA 4G1QA 3QFPA 4FVMA 4JEPA 3SCXA 2A1RA 3AVIA 1EQYA 1WUAA 3AARA 4KH5A 3VQAA 4WFAL 4BC2A 4CEBA 3PSFA 4Y1DA 1HR0K 4WYBA 4Z94A 2O8FA 4I7FA 1D9FA 1WAFA 3L3UA 3EEQA 4FJIA 4DFKA 4HCBA 1XHZA 1Q9YA 2W42A 4JKFA 4BRCA 4EP5A 4CD3A 3V9SA 1OH5A 3G6EN 1W2BM 1TL1A 4H4MA 3QERA 3ZYYX 1RTDA 3THWB 1I3AA 2PBDA 2QWQA 2Q0RA 5EY4A 1IKXA 4NLCA 4DKWA 3MXMA 1RBUA 4ZTFA 3KK2A 1J6ZA 4DTMA 1ESVA 4Z0UA 5AZIB 4E7IA 4ILHA 1QQCA 3KKSA 1M1KO 5KRSA 1A5XA 3QMLA 3ZT4A 5BR9A 1S5JA 1TKZA 3ZT2A 3NH0A 4XH4A 2HHXA 4CEAA 3QEPA 4H5RA 5GIPA 3LPTA 5LJWA 2P9UA 2XHBA 4JI3K 1YVNA 4FWSA 1IH7A 3QIPA 1Q86O 2RN2A 1HKCA 1XNQK 4PY5A 2Q1NA 3ZT0A 1EKEA 2OPQA 4DV5K 4BQZA 4IDHA 4FWRA 4JKDA 5BN9A 5C2DA 4I2PA 4W5RA 3UKRB 1IJJA 4Z4GA 4OKJA 4O4GA 2HBLA 2P51A 5AQLA 4KRFA 3MWPA 3O3GA 4JS4A 1T6DA 3PO4A 1UOCA 4F2RA 4PQUA 4JHDB 3O80A 2B5JA 1BG3A 2A6AA 4WQ5A 4K43A 4O5BA 4CEOA 3V9UA 4CE9A 3O4WA 1RDWX 1FK9A 3TWHA 2HBKA 4B8CA 4DUZK 2HNZA 2E6LA 4FLUA 4AM7A 3J80O 3C0BA 3MWTA 4KTWA 3VQ7A 3QICA 4Z4IA 1NK9A 2ZJQL 1ZBSA 4LD0A 3TR8A 3SAFA 3S9HA 4HWIA 3DI6A 2P9PB 5BR8K 3CG7A 1NK6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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