The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGLGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Determination of Pathways for Oxygen Binding to Human HbA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
59
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MOC A; 1MOH A; 3QQQ A; 5KER A; 3D17 B; 2ZSX A; 1THB B; 3QM8 A; 4FWY A; 1YG5 B; 1MTJ A; 1HBS A; 3G4W A; 1CPW A; 4L7Y B; 1FHJ A; 1IDR A; 3UHC A; 3OVU C; 1G09 A; 1YGF B; 3S1I A; 4X0L B; 2O5M X; 4YU4 B; 1HGB B; 3GKV A; 3PT8 B; 2VLZ A; 1HRM A; 1J40 B; 1S0H B; 2W72 A; 1YGF A; 1GDL A; 4N7O B; 105M A; 4MBA A; 3WCU B; 4X0L A; 1R1Y B; 6HBW A; 3SZK B; 1AJG A; 3G4U A; 3R5I B; 1QPW B; 1YFF B; 1DM1 A; 2ZLX B; 1S0H A; 5E29 A; 3WCW D; 1JEB B; 2H8D B; 1R1Y A; 1MYI A; 1RVW B; 3BJ2 A; 4MQI B; 1JY7 A; 3SZK A; 3O7N A; 1AZI A; 4UIQ A; 3R5I A; 3LHB A; 5KDQ B; 1QPW A; 1DO1 A; 1HGA B; 3PI9 B; 1CG5 B; 1UFP A; 1J7S B; 4TWU A; 2YRS A; 1JEB A; 1MZ0 A; 1MLO A; 3UHK A; 2ZT2 A; 1RSE A; 3GQG B; 4MQI A; 3E55 A; 1HBG A; 1XY0 B; 2D60 B; 1CQ2 A; 1VHB A; 4NZI A; 2E2Y A; 3HYU A; 1MDN A; 3LB2 A; 4F4O A; 1HGA A; 3UHV A; 1JZL A; 3DUT B; 3IXF A; 3BJ3 A; 3UGZ A; 1BJE A; 2ZS0 C; 2VYZ A; 5EE4 C; 1XQ5 B; 3GQG A; 5ILM A; 1OJ6 A; 1Y5J B; 3PI8 B; 1XY0 A; 1VWT A; 4MU5 A; 1URY A; 1C7C B; 2HHD B; 3CIU B; 1MYZ A; 2GTL B; 4KN3 A; 2G12 A; 4MQK B; 4O2G A; 1NQP B; 1NEJ B; 2AA1 A; 1J3Y B; 1FSX A; 3HEO A; 2MHB A; 2AUO A; 2QMB B; 2R80 A; 3QM9 A; 3MYN A; 1FCS A; 2DN1 A; 2GTL A; 2FRI X; 2VHB A; 3OGB A; 2EVK A; 2QSS A; 1NQP A; 4PQC A; 1J3Y A; 3VAU A; 3ZJI A; 3NL7 B; 3PEL B; 3QJB B; 104M A; 1N9H A; 1MGN A; 1Y8W B; 2QSP A; 1J3Z B; 5CN9 A; 1HHO B; 1HBI A; 2LH2 A; 2DN2 B; 1Y7C B; 1A0Z B; 1J7Y A; 3H57 A; 1Y8K B; 3QJB A; 1XZV A; 2G14 A; 1K0Y A; 1CO8 A; 3AG0 A; 2OIF A; 1SDL B; 3GDJ A; 2QLS B; 3KUN A; 1DTI A; 1HHO A; 1OFJ A; 3B75 B; 1XXT A; 1Y35 B; 4HSW A; 2PGH A; 2GL3 A; 3OO4 B; 2VRY A; 1G0A B; 3DHT B; 2HZ3 A; 1SDK A; 1OR4 A; 3UHD A; 1RQ3 B; 4O35 A; 4ESA B; 3B75 A; 1MBN A; 3MOU A; 1Y35 A; 1DUO A; 1MBI A; 1HDB B; 3LR9 A; 3UHE A; 1BZR A; 3W4U B; 5C6Y A; 2FAL A; 1IT2 A; 3WCU C; 1MLN A; 3HF4 B; 1RQ3 A; 4WCH D; 1C7D A; 2MGM A; 1EW6 A; 1S56 A; 2R4Z A; 5MBA A; 3PI2 A; 3ZH0 A; 1OBM A; 1NZ5 A; 3W4U A; 1EBC A; 3ZOM A; 1DXC A; 2ZFO A; 1Y31 B; 1GDJ A; 3GYS B; 3ONZ B; 1NS6 A; 2GRF A; 1X3K A; 3NML A; 1YE0 B; 5HBI A; 2ZSO A; 1ECO A; 103M A; 4WJG A; 1A9W E; 3G4V A; 1TU9 A; 4MQH B; 3RJ6 A; 2XYK A; 3ONZ A; 1RPS B; 1VXE A; 1DXU A; 1JP8 A; 5HU6 A; 2MYA A; 2ZSN A; 4MQH A; 3UBV A; 1HDS B; 3LQD B; 1V5H A; 1R1X B; 2ZS1 A; 2H35 A; 1JDO A; 1HBH B; 1VXG A; 5KKK A; 5JDO C; 1HAC B; 2NRL A; 1HV4 B; 1YVT A; 3VRF B; 2GTL C; 5CNB A; 4N7N A; 1F63 A; 1LHT A; 1T1N B; 3LQD A; 3V2Z A; 3KMF A; 1V9Q A; 5EQM A; 1MLG A; 1R1X A; 1HBH A; 2HBE B; 1LH1 A; 3QJC A; 1PBX A; 2MGG A; 1DXV A; 3QJD A; 3ZJM A; 1YE2 A; 3D1A A; 4PNJ A; 3VRE B; 2MGI A; 1LH2 A; 2MYD A; 1IRD B; 4KMW A; 2HBE A; 1YHE B; 3GLN A; 1LFL B; 1LFQ B; 1Y4P B; 1LA6 B; 3AQ6 A; 3AQ8 A; 3LB3 A; 5ILE A; 1Y7Z A; 2D5Z A; 2VEB A; 1YHU D; 3QZX A; 1YZI B; 1LFL A; 1GBU A; 5EV5 A; 1LFQ A; 3ECZ A; 1CH7 A; 1BVD A; 3WI8 A; 4KJT A; 4G51 B; 1S5X B; 1D8U A; 2EVP A; 2HHB B; 3PI4 A; 2CMM A; 3A0G B; 1CH2 A; 1YEV A; 2HBC B; 3G4R A; 1UC3 A; 2ZLT B; 1WLA A; 1A6K A; 3QMA A; 2G0X A; 3RJN B; 1KR7 A; 4G51 A; 1LUE A; 4B4Y A; 5HAV A; 3WCT D; 1MLL A; 1COH A; 1WVP A; 2ZLW B; 4FWX A; 1Y7G B; 1Y0D B; 4M4A B; 3ECL A; 4AVE A; 2HBC A; 1HGC B; 2ZLT A; 1BZ1 A; 3A9M A; 1YOH A; 1MLF A; 2ZLW A; 2O5O X; 1HGC A; 3LB1 A; 1CMY B; 2D2M D; 1O1M B; 2BMM A; 2MYB A; 4DWT A; 1Y0A B; 1LHS A; 4SDH A; 1HCO A; 2M6Z B; 2B7H B; 1V4X B; 4F6J A; 2D2N D; 3G46 A; 4ROM A; 1MYM A; 1GVH A; 1CMY A; 3BJ1 A; 1O1M A; 1BZ0 A; 1A3O B; 2ZT3 A; 1GCV B; 3G52 A; 2HZ2 A; 3AT6 A; 1O1J A; 1JP9 A; 1V4U A; 1MOD A; 2M6Z A; 1A00 B; 2MGH A; 3CY5 A; 4MQG B; 1IBE B; 1YIE B; 2V1E A; 2G11 A; 4ZVB A; 4H2L B; 1A4F A; 4IRO A; 3KMF C; 5F2A A; 2MGD A; 3G4Y A; 1HBA B; 1UX9 A; 2MGB A; 4U8U D; 1YOG A; 1I3E A; 1A9W A; 1N9X A; 1IBE A; 3DHR B; 1RQA B; 1OUT B; 3WTG B; 1X46 A; 3UHB A; 2HBF B; 1Y09 B; 2ZFB B; 4C44 A; 3E5I A; 1XZ4 B; 3WCW B; 1Y5F B; 1Y22 B; 2Z8A A; 1Y83 B; 1LJW A; 1DKE A; 5SW7 B; 4OOD A; 1HBR B; 1M9P B; 1HLB A; 2ZFB A; 2PEG B; 4FC3 B; 3QQR A; 2RI4 B; 1DUK A; 1Y5F A; 1Y22 A; 1SPG B; 2DHB B; 1BBB B; 1HBR A; 3MYM A; 1JPB A; 1NXF A; 2G0S A; 3D17 A; 3E4N A; 1THB A; 3S66 B; 1MLQ A; 1YG5 A; 1IWH B; 3ED9 A; 1V07 A; 1OR6 A; 1UVY A; 4F6G A; 4L7Y A; 1YH9 B; 4GZG A; 4M4B B; 1MLK A; 3PI3 A; 4HRT B; 1XYE B; 1Y4G B; 3S66 A; 1Y8I B; 4YU4 A; 3ARL A; 1JZM A; 1HGB A; 4ODC B; 3M38 A; 3OZW A; 1LFV B; 3PT8 A; 1J40 A; 1NIH B; 1Y46 B; 1XYE A; 4PQB A; 4N7O A; 1TES A; 3WCU A; 1H1X A; 1LFZ B; 2W6V B; 5ILP A; 1Y4G A; 4VHB A; 1Y8I A; 4O4T A; 3P5Q B; 1MCY A; 1YFF A; 1FAW B; 1LFV A; 1DWT A; 4L2M A; 2ZLX A; 1Y46 A; 1NIH A; 4XDI A; 3LB4 A; 2GDM A; 3M3B A; 3A5B A; 1ITH A; 2H8D A; 1RVW A; 1MNJ A; 3P5Q A; 2DN3 B; 1YVQ B; 5KDQ A; 3PI9 A; 1CG5 A; 1J7S A; 2QU0 B; 1O1P B; 1ECD A; 102M A; 3HHB B; 4MBN A; 2HBD B; 1MNI A; 1RTX A; 1S6A A; 4F6I A; 5CND A; 1YVQ A; 2VLX A; 2D60 A; 1LH6 A; 3ZJO A; 1NPF A; 3OO5 B; 3DUT A; 5D1V A; 1O1P A; 2ZSQ A; 3FS4 B; 1NGK A; 1XQ5 A; 1G08 B; 3PT7 B; 5CN5 A; 2HBG A; 1Y5J A; 3PI8 A; 5HLU A; 1C7C A; 1YCA A; 3OZU A; 2HHD A; 3LR7 A; 5EUI B; 3CIU A; 2BWH A; 1G08 A; 5D5R A; 4NK1 A; 5EOH A; 3UH5 A; 3OJ1 A; 4MQK A; 1NEJ A; 4ILZ A; 1O1L B; 4HHB B; 2LH6 A; 2ZT0 A; 2V1F A; 1FDH G; 1CH9 A; 3D7O B; 1YIH B; 3QZZ A; 3ZOL A; 2QMB A; 1AJ9 B; 5AB8 A; 3ZJQ A; 1O1I B; 1O1L A; 4HHB A; 3WCW C; 5EET A; 4KMV A; 1XZ7 B; 3NL7 A; 1J7W B; 3PEL A; 1CIK A; 1YIH A; 1DWR A; 3QJE B; 4MXK A; 2GKN A; 4UUR A; 1AJ9 A; 1QXE B; 1Y8W A; 3S1J A; 1O1I A; 1GJN A; 2GKM A; 1J3Z A; 2QFN A; 3BOM B; 3UGY A; 1GBV B; 3GQR B; 3ODQ B; 5CNG A; 1Y0C B; 1H97 A; 2DN2 A; 1Y7C A; 5CNE A; 1A0Z A; 2SPM A; 1QXD B; 1Y8K A; 1B0B A; 3QJE A; 1YGD B; 4N7P B; 1SDL A; 3EU1 B; 2QLS A; 1CIO A; 4FWZ A; 1GBV A; 3AT5 B; 2LH7 A; 1JWN A; 1YEO B; 3K8B B; 2D5X B; 111M A; 1IT3 A; 1QXD A; 3A5A A; 2XKI A; 3GQP B; 3OO4 A; 1G0A A; 2MGF A; 1IOP A; 1Y7D B; 3DHT A; 1O1O B; 4N7P A; 4PQ6 A; 1CH4 A; 3EU1 A; 5B85 A; 1YEU B; 3UHW A; 4ESA A; 1YEO A; 3K8B A; 1BUW B; 1MKO B; 1MNH A; 1OFK A; 2OH8 A; 3A59 B; 3OZV A; 4DC8 A; 3GKT A; 1HDB A; 1VXD A; 4NI0 B; 1F5P A; 1S5Y B; 1O1O A; 2WTH A; 1GLI B; 1YEU A; 3HF4 A; 1QSH B; 1HBB B; 4N8T B; 3A59 A; 1Y45 B; 2Z85 A; 3ZJN A; 2LH5 A; 1MBC A; 3ORD A; 1C40 B; 1VRE A; 1Y31 A; 4H07 A; 2ZSR A; 1Y4Q B; 3GYS A; 1QSH A; 2AUR A; 1VXB A; 3NMM B; 4DC7 A; 5CN6 A; 1DO3 A; 1YE0 A; 4O1T A; 3HXN B; 2G0Z A; 1YEN B; 1C40 A; 1YHU B; 1HDA B; 2G10 A; 4MQJ B; 1RPS A; 4WJG 1; 1JW8 A; 2SPO A; 3ZJH A; 3HXN A; 1YHU A; 2JHO A; 3EOK B; 1HDS A; 1CLS B; 2BLH A; 2MYE A; 1LFY B; 2ZFO D; 4NXA A; 1MBD A; 1F65 A; 3EOK A; 1HAC A; 2FAM A; 1HV4 A; 2MGA A; 3VRF A; 1CLS A; 3D1K B; 1VXF A; 1T1N A; 1SHR B; 2G3H A; 3A5G A; 1NWN A; 1NWI A; 108M A; 3UH3 A; 1U7R A; 1DO7 A; 1JL6 A; 4HRR B; 1Y4V B; 3QM6 A; 2NSS A; 5IKS A; 3HRW B; 1X9F D; 1SHR A; 2BLI A; 3VRE A; 1YEQ B; 3WFW A; 1IRD A; 1ABS A; 2HHE B; 2D2M B; 3WCV D; 1YHE A; 3M39 A; 1NZ2 A; 2VM0 A; 2WY4 A; 3H58 A; 1Y4P A; 2ZS1 D; 1LA6 A; 5HLQ A; 2D2N B; 2GNW A; 2V1I A; 2W31 A; 2V1J A; 5E83 B; 1YZI A; 1CP5 A; 5CMV A; 1J41 B; 1KD2 B; 4F69 A; 5EU2 A; 1W92 A; 2OHA A; 3DR9 A; 1MWB A; 1WMU B; 4MAX A; 1N9I A; 1S5X A; 3UH6 A; 5C6E B; 2NSR A; 2HHB A; 1J41 A; 2ZST A; 2ZSY A; 3A0G A; 1IRC A; 5EYS A; 1UIW B; 4U8U B; 3K9Z A; 1MLU A; 4B3W A; 1A3N B; 1MLS A; 1I3D A; 1C7B B; 5C6E A; 1FDH A; 1LH7 A; 1O1K B; 3S65 B; 1Y7G A; 1XZU B; 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3GKV B; 1BBB A; 3BCQ A; 1DO4 A; 3ZJJ A; 1DLY A; 2D2N C; 3VRG A; 2W72 B; 3UHS A; 2WTG A; 1N9F A; 6HBW B; 1IWH A; 2AUP A; 4ROL A; 2RAO A; 4MXL A; 106M A; 1VXC A; 1UT0 A; 1YH9 A; 2ZSZ A; 4M4B A; 1JP6 A; 4O4Z A; 4HRT A; 5E29 B; 2MBW A; 2QRW A; 109M A; 1MNO A; 1URV A; 3BJ2 B; 1JY7 B; 4ODC A; 1G0B B; 1PMB A; 1MYT A; 1YOI A; 3NG6 B; 4U8U C; 2KSC A; 1MTK A; 2YRS B; 2R50 A; 1LFZ A; 2W6V A; 1M6C A; 3A2G A; 1XZ2 B; 3IC0 B; 1G0B A; 3HYU B; 1FAW A; 4F4O B; 3NG6 A; 1LTW A; 1U7S A; 4C0N A; 3BJ3 B; 1S61 A; 2O5B X; 1Z8U B; 2MGJ A; 110M A; 1XZ2 A; 2DN3 A; 3IC0 A; 1UMO A; 4DWU A; 3UHG A; 2XKG A; 1VWT B; 1JF3 A; 2ZWJ A; 3WFU A; 2C0K A; 2QU0 A; 3HC9 A; 3HHB A; 2G0V A; 2HBD A; 1GDI A; 1Y2Z B; 2Z6S A; 3BA2 A; 4HSX A; 1Y4B B; 2AA1 B; 3ARJ A; 3NFE B; 1AJH A; 1FSX B; 3WCU D; 3OO5 A; 2MHB B; 2R80 B; 3FS4 A; 2DN1 B; 3PT7 A; 1MWC A; 1Y2Z A; 2QSS B; 1Y4B A; 3NFE A; 5ILR A; 2W6X A; 3EDA A; 1YMA A; 1V4W B; 5EUI A; 2GRH A; 1Q1F A; 2V1G A; 1MWD A; 1DXT B; 3UHN A; 1KFR A; 4JYQ A; 7HBI A; 1A6N A; 2QSP B; 4H0B A; 1L2K A; 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