The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGLGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Determination of Pathways for Oxygen Binding to Human HbA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
62
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5B84 A; 1DXV B; 1XXT A; 3WCU B; 3AT6 A; 2G11 A; 1G0A A; 3M3A A; 3G53 A; 1YEN A; 4UUR A; 3GDJ A; 3PIA A; 2QFN A; 1MYG A; 1Y22 B; 1HDA A; 1AJ9 A; 1S6A A; 1YOH A; 1DUO A; 1XXT B; 4X0L A; 3AT6 B; 5E29 A; 1ECA A; 1G0A B; 5HBI A; 5AZQ A; 1Y0W A; 1YEN B; 3FH9 A; 1MKO A; 2HBG A; 1HDB A; 3GDJ B; 3PIA B; 1MTK A; 1HDA B; 1AJ9 B; 2BNL A; 1DWT A; 2MGH A; 2EVK A; 4X0L B; 4KJT A; 4NS2 A; 1LUE A; 5E29 B; 2OH9 A; 3G4Y A; 1Y0W B; 3FH9 B; 1GVH A; 3LB4 A; 1MKO B; 2ZT2 A; 3LB1 A; 1HDB B; 1Y83 A; 3OO4 A; 1MBA A; 1VWT B; 3WI8 A; 3ZJM A; 1XZ4 B; 3ECX A; 1VHB A; 3HF4 A; 4PNJ A; 1Q1F A; 5E83 B; 1ECD A; 1V4X A; 1HBR A; 5CND A; 1HBI A; 1Y83 B; 5E6E A; 3OO4 B; 2W6V A; 3MN0 A; 3GQP A; 3HF4 B; 4MQG A; 5SW7 A; 1V4X B; 105M A; 1HBR B; 5E6E B; 1YEU A; 3MVC A; 2W6V B; 3QJD A; 5HLX A; 2D5X A; 3GQP B; 4HSX A; 3EOK B; 2HHB B; 3LHB A; 2G0Z A; 1H97 A; 4MQG B; 1HBG A; 3UH5 A; 5SW7 B; 1BVD A; 4M4A A; 3UH3 A; 1SI4 A; 1YEU B; 3V2V A; 3ZH0 A; 3QJD B; 2D5X B; 1HAC A; 2MGC A; 1LFQ A; 4UIQ A; 1J41 A; 1FCS A; 1NPF A; 1ABY A; 4M4A B; 1SI4 B; 4NZI A; 1NZ3 A; 2B7H A; 1Y8W A; 1VXG A; 3EDB A; 1HAC B; 2MGG A; 1LFQ B; 1Y5J A; 3D17 A; 1Y8H A; 3K3U A; 1Y4V A; 1ABS A; 1ABY B; 108M A; 1MLH A; 3ONZ A; 1V4W A; 3VRE A; 2ZSR A; 3GLN A; 1DXT A; 4IRO A; 2B7H B; 1YZI B; 1UVY A; 3D17 B; 1Y5J B; 1Y8H B; 3ZJL A; 2W72 C; 1DO1 A; 4ESA A; 3OZU A; 1V4W B; 2V1J A; 3VRE B; 3BOM A; 3ORD A; 4IRO B; 3LQD A; 2ZLV A; 3QQR A; 106M A; 3M3B A; 1JEB A; 2O5T X; 104M A; 2NSR A; 3S65 A; 2EB8 A; 3PI4 A; 1O1L A; 4ESA B; 4WJG 1; 2GDM A; 3BOM B; 1X46 A; 2ZLV B; 2ZS1 A; 1Y85 A; 1Y4B A; 3VAU A; 1JEB B; 1MLS A; 2ZT1 A; 4XDI A; 4MAX A; 1I3E A; 1NZ2 A; 3P5Q A; 5EET A; 2DN2 A; 3S65 B; 1VXE A; 1O1L B; 3UHQ A; 1CBM A; 1MLJ A; 2MYC A; 2O5M X; 102M A; 1Z8U B; 3GYS A; 2MYD A; 2ZS1 B; 2CMM A; 1RQ3 A; 1Y85 B; 1Y4B B; 1MOD A; 4G1B A; 5EYJ A; 2DC3 A; 3P5Q B; 4N7N A; 3LR9 A; 3ECL A; 4F6I A; 4PQ6 A; 3GYS B; 3H57 A; 2YRS A; 1W92 A; 3WCT A; 1RQ3 B; 1FLP A; 7HBI A; 2BMM A; 3ZJI A; 4H2L A; 3HXN A; 1YH9 A; 1O1I B; 1YHU C; 3UHC A; 3OO5 B; 4YU4 A; 1QSI A; 3ZJQ A; 1IWH B; 1IT3 A; 2YRS B; 3WCT B; 1S61 A; 2BLH A; 1Y4R A; 3CY5 A; 3LB3 A; 4H2L B; 3H58 A; 1YH9 B; 3HXN B; 3WCT C; 4VHB A; 4MQI A; 2HHE A; 3ZOM A; 3G4R A; 4YU4 B; 1QSI B; 1VRF A; 1LH1 A; 1XZU A; 1Y4R B; 3HRW A; 1NZ4 A; 4L2M A; 1JL7 A; 5CNF A; 4MQI B; 2ZS0 A; 2R1H A; 3UHX A; 5F0B A; 1YHE B; 1LH7 A; 1C40 A; 1QXE B; 1XZU B; 3MYN A; 5EE4 D; 3HRW B; 5EU2 A; 1O1J A; 1YEQ A; 1JP6 A; 3G4W A; 3RJ6 A; 2MGD A; 2ZS0 B; 1MTJ A; 3AQ5 A; 2R1H B; 4C44 A; 1MLF A; 1MYT A; 1XZV A; 1Y45 A; 1C40 B; 2ZS0 C; 3VRF A; 2VYW A; 2G10 A; 1O1J B; 1YEQ B; 2ZFB A; 1A3N A; 4DWU A; 5HLU A; 1GLI A; 1XZV B; 1MBC A; 1X9F C; 1CQX A; 1NXF A; 2HBC B; 2QU0 A; 3D1K B; 2V1F A; 2G12 A; 1QPW A; 1CH5 A; 4HSW A; 1CIK A; 2ZFB B; 1IRD A; 3KUN A; 3A5G A; 1A3N B; 1LH6 A; 1XZ5 A; 4UZV A; 2SPM A; 1Y2Z A; 1GLI B; 3UH6 A; 2D2M B; 2BLJ M; 1NS9 A; 2QU0 B; 2DXM B; 4N7P A; 1D8U A; 109M A; 1QPW B; 112M A; 1IRD B; 1JWN A; 1CPW A; 1BJE A; 4FC3 B; 1WLA A; 4M4B A; 1XZ5 B; 1Y2Z B; 2ZSP A; 3GKV B; 4B3W A; 3BCQ A; 1NS9 B; 2GTL A; 2GRZ A; 1NS6 A; 5C6E A; 1BZR A; 4F68 A; 1YOI A; 2QSP A; 1OUT B; 4M4B B; 1Y4G A; 1MOH A; 1Y35 A; 2BK9 A; 1IOP A; 3E55 A; 3MOU A; 5ILM A; 3BCQ B; 2GTL B; 3UHS A; 1NS6 B; 5C6E B; 1IT2 A; 1HCO A; 5EUI A; 1FHJ A; 1Y35 B; 2D2M D; 3KUO A; 2NRL A; 1Y8I A; 2BKM A; 2HZ3 A; 4MQK A; 1SPG A; 2ZSS A; 3ARK A; 1Y0A A; 5CN6 A; 2ZSQ A; 2EF2 A; 3MJP A; 3OGB A; 1HCO B; 1FHJ B; 1GZX A; 3G4U A; 3WFW A; 1JP9 A; 1YVT B; 1Y8I B; 1YEO B; 4MQK B; 2SPN A; 3ZHW A; 1FN3 A; 1BVC A; 1SPG B; 1KR7 A; 1Y0A B; 3PT8 A; 1DLW A; 3OZV A; 3WCP A; 3MJP B; 2DN3 A; 1BUW B; 1MYI A; 1GZX B; 1HAB A; 1XCH A; 2GTL D; 4KMW A; 3MJU A; 1HV4 A; 1R1X B; 1FN3 B; 4C0N A; 2NRM A; 107M A; 2PEG B; 2DHB A; 1MYJ A; 3PT8 B; 3W4U A; 3WCP B; 3WR1 B; 1GDK A; 2XKI A; 1OFK A; 1G08 A; 1GDJ A; 1HAB B; 3MJU B; 1HV4 B; 4F6J A; 1MYM A; 1VXF A; 2DHB B; 1JW8 A; 1J7Y B; 3W4U B; 1C7C A; 2HBS A; 2AUQ A; 1BAB A; 1AZI A; 1OBM A; 1FDH A; 1G08 B; 1DO3 A; 1MYZ A; 3GOU A; 1A6N A; 2ZSY A; 2NX0 A; 3LR7 A; 2D5Z A; 2FAL A; 2ZLW A; 3IA3 B; 1C7C B; 2HBS B; 3R0G A; 2LHB A; 1BAB B; 1V4U A; 2ZSO A; 3UBC A; 1O1K A; 2ZFO B; 1CH2 A; 3A0G A; 1DM1 A; 3GOU B; 2HHD A; 3HEN A; 1MBI A; 2D5Z B; 2QMB A; 2ZLW B; 3WCU C; 5HLQ A; 1V4U B; 1Y0D B; 2KSC A; 1A00 A; 1O1K B; 2H8F B; 5JDO C; 3A0G B; 1Y7G A; 2R4X A; 2HHD B; 2XYK A; 4DWT A; 2QMB B; 4FWY A; 2ZWJ A; 111M A; 1R1Y A; 4HHB B; 1FAW A; 1VWT A; 3UHI A; 1V9Q A; 2HBD A; 2ZLU B; 3UI0 A; 1A00 B; 1XZ4 A; 1YCA A; 4H07 A; 4B4Y A; 1Y7G B; 2MB5 A; 2G0R A; 5CHQ A; 5E83 A; 1CP5 A; 3UHU A; 1DWR A; 1V5H A; 1R1Y B; 4AVE A; 1FAW B; 2HBD B; 2ZFO D; 4MQH A; 1B86 A; 1CH9 A; 1JZL A; 1NPG A; 3WFU A; 1MLG A; 1MOC A; 1LFT A; 1LJW A; 1YIH B; 2EVP A; 5CNC A; 3RJN B; 3D1A B; 5KER B; 2H35 A; 1NWI A; 3ZJP A; 3UHG A; 1QI8 A; 4FH6 A; 4MQH B; 1YG5 B; 3U3E A; 1B86 B; 1J40 B; 1YCB A; 3EOK A; 5CNE A; 1CH1 A; 2HHB A; 4OF9 A; 1LFT B; 1LJW B; 3WHM A; 3SZK A; 2D6C A; 3UBV A; 1A6G A; 2H35 B; 2WY4 A; 2MGI A; 2HBE A; 2W6X A; 1QI8 B; 2AUO A; 4F6F A; 4ODC A; 1ASH A; 3M38 A; 6HBI A; 3WFT A; 3WHM B; 3ZJN A; 1A0U B; 3SZK B; 2VYY A; 1UIW B; 3K8B A; 4LPI A; 2HBE B; 2MGK A; 1MOA A; 4ODC B; 1M6M A; 4MU5 A; 1CG8 A; 1JY7 A; 1JPB A; 3AQ8 A; 1F5P A; 1UFJ A; 2ZT0 A; 1MBD A; 1O1N A; 1WVP A; 3K8B B; 1YZI A; 2LH1 A; 4F6G A; 2GKM A; 4FWX A; 1TU9 A; 1CG8 B; 1XY0 A; 1JY7 B; 2G3H A; 1MWC A; 1K1K A; 1VRE A; 2GLN A; 3ZJJ A; 1HDS A; 5EOH A; 1LFL A; 1C7D A; 1O1N B; 5B85 A; 3KMF A; 1XY0 B; 1DKE A; 4SDH A; 3HEO A; 2LH7 A; 1K1K B; 3UHE A; 2W6W A; 2JHO A; 1HDS B; 1YOG A; 1LFL B; 1C7D B; 5MBN A; 3BA2 A; 1YFF A; 3OVU C; 4GZG A; 2GRH A; 1GBV A; 1MLL A; 1DKE B; 1AJG A; 1VXB A; 1ABW A; 1HGC A; 3KMF C; 1I3D A; 5EV5 A; 4NI0 A; 1CMY A; 1YFF B; 3D4X B; 1GBV B; 2G0S A; 1ABW B; 2AV3 A; 3R5I A; 1HGC B; 4H0B A; 2MGF A; 4KN3 A; 1MYF A; 2R80 A; 1Y46 A; 1LH5 A; 1U7R A; 3ZJS A; 3QJC A; 4NI0 B; 1CMY B; 4NK1 A; 4O35 A; 1CH4 A; 1O1I A; 2ZS1 C; 3O7N A; 4F4O B; 3R5I B; 3MKB A; 1RVW A; 2OH8 A; 3OO5 A; 2R80 B; 1IWH A; 1PMB A; 1Y46 B; 1URY A; 1A6K A; 3QJC B; 5AB8 A; 4XS0 A; 2RAO A; 1SWM A; 5JDO F; 4N7O A; 3MKB B; 2VLX A; 1OUU A; 1RVW B; 3QZX A; 4JAC A; 4XS0 B; 3PI1 A; 5CN9 A; 1S5X A; 2RAO B; 1Y4Q B; 5F2A A; 1HBB A; 2Z6S A; 3DHR A; 2O5Q X; 4N7O B; 1BIN A; 1OUU B; 3S1J A; 2BWH A; 1VXD A; 1YHE A; 2MGE A; 1QXE A; 1S5X B; 1EWA A; 1HBB B; 3DHR B; 2GNV A; 1EBT A; 2GNW A; 2BW9 M; 5CNG A; 2ZLX B; 3E5O A; 3FS4 A; 1YEV A; 2V1K A; 2DN1 B; 3GQR B; 1BBB A; 1RTE A; 1GBU A; 3QJE A; 1T1N A; 1G0B A; 3FS4 B; 1YHU D; 1YEV B; 3IXF A; 2QSS A; 3D1K A; 2HBC A; 4NXC A; 1BBB B; 1LH3 A; 1GBU B; 1VXC A; 3GKT A; 1UT0 A; 3QJE B; 1T1N B; 1G0B B; 1LA6 A; 3WCW A; 4JYQ A; 2BLI A; 1O1P A; 3DHT A; 2D2M A; 2QSS B; 2VEE A; 2DXM A; 3PI3 A; 3HHB A; 1HJT A; 4FC3 A; 1MNJ A; 1LA6 B; 3WCW B; 1DXD A; 2R50 A; 5JDO E; 2Z8A A; 1A9W A; 3NML A; 1JF4 A; 1O1P B; 3GKV A; 3DHT B; 1KFR A; 2FAM A; 2V1E A; 1X3K A; 2D2N B; 2D60 A; 3HHB B; 1BZ1 A; 2ZSZ A; 2D2M C; 1OUT A; 1LFZ B; 1HBH A; 1J3F A; 2ZT4 A; 3UHV A; 1XYE A; 1G9V A; 1GDI A; 1OFJ A; 2D60 B; 1BZ1 B; 2EKU A; 1MNO A; 2SPO A; 1HBH B; 1LFV A; 1XYE B; 1BZ0 B; 3ZJH A; 5IKS A; 3PI2 A; 1G9V B; 3QM5 A; 1X9F D; 1QXD A; 3WCW D; 3QQQ A; 3RGK A; 3UGY A; 2SPL A; 1GCW A; 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2ZFO C; 1SDL A; 1QSH B; 4HHB A; 1V75 B; 2ZLU A; 1DXU B; 1Y5F A; 4G51 B; 1UX9 A; 3UHK A; 1YVQ B; 1MBO A; 1F63 A; 3GQG B; 1ECN A; 1O16 A; 1O1O B; 2FRJ X; 1SDL B; 1J7W A; 2PGH A; 1K0Y A; 1MBN A; 3E4N A; 1Y5F B; 3NFE A; 3EDA A; 1ECO A; 1YIE A; 3B75 A; 1LFY A; 2MGB A; 4O2G A; 1YIH A; 5CHR A; 3SDN A; 2O58 X; 2V1H A; 3D1A A; 2IN4 A; 5KER A; 3AQ7 A; 1Y4F A; 1J7W B; 2GL3 A; 2FRF A; 1NZ5 A; 2PGH B; 2VRY A; 1K0Y B; 2IG3 A; 2VEB A; 1CP0 A; 1YG5 A; 4NI1 A; 3NFE B; 1J40 A; 4MQJ A; 3ZJR A; 3PI8 A; 1YIE B; 2O5B X; 3B75 B; 1LFY B; 1MYH A; 3QMA A; 1OJ6 A; 3A2G A; 1A01 A; 5EQM A; 1Y4F B; 2HBF A; 1S56 A; 1MTI A; 6HBW A; 1SDK A; 3QJB A; 4NI1 B; 3WCU D; 4MQJ B; 3PI8 B; 1ITH A; 1YMC A; 3OZW A; 1A0U A; 1MNH A; 5JDO D; 2ZST A; 1MLR A; 1A01 B; 1UIW A; 1MLM A; 4HRT A; 2HBF B; 6HBW B; 1SDK B; 3QJB B; 1Y7Z A; 3DUT A; 1DWS A; 1DLY A; 103M A; 3A5B A; 1MLN A; 1F5O A; 2LH6 A; 2LH5 A; 2VHB A; 5M3S A; 5HY8 A; 3S48 C; 2AA1 A; 4HRT B; 1LHS A; 3BJ1 A; 3HEP A; 2W6Y A; 1Y7Z B; 3DUT B; 3EU1 A; 2LH3 A; 2NSS A; 1SHR A; 2HZ2 A; 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