The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
145
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structure length |
145
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Chain Sequence |
ADFDAVLKCWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPETQKLFPKFAGIAQADIAGNAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGSHAAILKPLANSHATKHKIPINNFKLISEVLVKVMQEKAGLDAGGQTALRNVMGIIIADLEANYKELGFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
High Resolution Structures of Blackfin Tuna Myoglobin
rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
145
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| sequence length |
145
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4F68 A; 2ZT3 A; 1G08 B; 2W6Y A; 3UHD A; 2GNW A; 4YU4 B; 1YEV A; 1OR4 A; 1YIE B; 4ROL B; 1Y8I B; 1S6A A; 4MXK A; 3B75 A; 1AJG A; 1MYH A; 1WVP A; 3MYM A; 5HBI A; 2ZSN A; 3AT6 A; 4ROM A; 1B0B A; 1IRD A; 1QSH B; 3QJB A; 3DHR B; 2LH2 A; 1MBD A; 3HHB A; 3UHW A; 1A01 B; 2BNL A; 1FAW B; 1RPS B; 3NFE B; 4NI1 A; 1HV4 B; 1F65 A; 1JPB A; 5MBA A; 1VXC A; 1K0Y B; 5HLX A; 2YRS A; 1BAB A; 1KD2 A; 2Z6N A; 3D17 B; 1V4U A; 1LH3 A; 5JDO D; 1KFR A; 2G0V A; 1HBS A; 2VLY A; 1MZ0 A; 3K3U A; 1GBU B; 1YVT A; 3BJ3 B; 1BUW A; 1WMU A; 3BJ2 A; 3IC2 B; 1CMY B; 2MGB A; 1V4X B; 2XKG A; 1M9P B; 3IC0 B; 1BVD A; 4MPM A; 2QFN A; 4L2M A; 3M39 A; 3S1I A; 2G3H A; 1QXE A; 1SPE A; 2EKU A; 4IRO A; 3ZJI A; 1YVQ A; 1CQX A; 1QPW B; 3OZW A; 1JY7 A; 1FDH A; 1NXF A; 4KJT A; 1NPG A; 3WCU B; 1O1J B; 3LHB A; 3ARL A; 3G4R A; 2G11 A; 2JHO A; 2PGH A; 5JDO E; 4PQC A; 4X0L B; 109M A; 3DHT A; 4HRT B; 4GZG A; 1YGD B; 1XYE B; 3NMM A; 3PT8 B; 3BOM A; 1LHT A; 1Y7Z B; 1CH5 A; 1NWN A; 2NX0 A; 3WCW C; 4HBI A; 1A3N B; 1UFJ A; 2ZS1 A; 1V07 A; 1NQP A; 2MGC A; 3AT5 A; 2EB8 A; 2Z6T A; 2MYB A; 3G53 A; 2EF2 A; 3NML A; 2Z85 A; 2MHB B; 1JF3 A; 1RVW B; 3A9M A; 1YDZ B; 2QLS A; 1OBM A; 3V2V A; 2R4X A; 5CN9 A; 1CP0 A; 4AVE A; 2R50 A; 5CNE A; 2HHB B; 1Y09 A; 5CNF A; 5JDO C; 2B7H B; 3EOK A; 5E29 B; 2BMM A; 1S5X B; 2GTL B; 1LTW A; 1JL7 A; 1YFF A; 3K8B B; 4MU5 A; 2D2N A; 3A2G A; 5HLU A; 4H2L A; 3ZJQ A; 2QSS A; 1MLH A; 3TM9 A; 3PEL A; 2IG3 A; 1Y2Z A; 1IT2 A; 2ZFO D; 4NXA A; 2ZLW A; 1CH7 A; 2FRF A; 1O1M B; 2HBG A; 1S5Y A; 1NPF A; 1Y4F A; 1XQ5 B; 3NL7 A; 3NG6 B; 1IWH A; 2D2M B; 3EU1 B; 2R1H B; 1JP8 A; 1LH5 A; 2MGI A; 4WJG 1; 2M6Z A; 4N7O B; 1IBE B; 3D4X A; 1OR6 A; 2ZLV B; 3QZX A; 101M A; 2ZT0 A; 3MN0 A; 5HLQ A; 1DXU B; 1ECD A; 2VYW A; 1N9H A; 1VRE A; 1NEJ A; 2H8D B; 3HXN A; 2GNV A; 1MTI A; 1J7W B; 1Y5K A; 3D1A B; 1RTX A; 3PIA B; 1N9I A; 2D2M D; 4KN3 A; 4N8T B; 1V9Q A; 1BZR A; 1A4F B; 2ZSY A; 105M A; 1YEO A; 2OHA A; 4N7N B; 2H8F A; 3ASE A; 1YHE A; 5JGG B; 1GBV A; 1MWC A; 5EU2 A; 1Y7G A; 4H0B A; 108M A; 1DUO A; 2HBE B; 1UC3 A; 4MQJ A; 1MLN A; 2HBC A; 1Y4G B; 1SI4 A; 3ZOM A; 2ZSX A; 3P5Q A; 3ZJL A; 1NZ5 A; 3QMA A; 5HY8 A; 1Y0C B; 2QFK A; 1Y5J A; 1DO7 A; 1UX8 A; 1LH1 A; 1DXT A; 4KMV A; 1SDL A; 4MQC B; 3WCT B; 2AUQ A; 3H58 A; 1DKE B; 1VXB A; 3FS4 B; 4MQK A; 1HBA A; 1Y45 B; 1YH9 B; 3UBV A; 1NS6 A; 1HLM A; 3TM3 A; 2QRW A; 1Y22 B; 4M4B A; 2SPN A; 1MNH A; 1AJH A; 1SHR B; 2LH7 A; 5ILP A; 5B84 A; 1OUT B; 1LHS A; 1JF4 A; 1XZ4 A; 3UHN A; 1HBB A; 4TWU A; 1ECO A; 2SPO A; 2ZFB B; 1QSI A; 3IA3 B; 2AV0 A; 2ZST A; 3PT7 B; 2SPM A; 2HZ2 A; 2GTL C; 2LH3 A; 1MOD A; 3GKV A; 5E6E A; 3VHB A; 1LH7 A; 4FWY A; 1LFV A; 1C7C A; 1SDK A; 1YEU A; 2V1G A; 3GDJ B; 2HHE A; 2GRH A; 2GKN A; 3RJ6 A; 1UMO A; 3GOU A; 2V1F A; 2OIF A; 1ABY A; 2RI4 B; 3UHS A; 1NIH A; 5MBN A; 3TLD A; 1VWT B; 1NWI A; 2V1H A; 1HGA B; 1MBC A; 3WCV B; 1XCH A; 3ONZ B; 2D2M C; 3MOU A; 1NZ3 A; 1JEB A; 1T1N A; 2RAO B; 3GKT A; 1C7B A; 3HRW A; 1Y85 A; 2W6V B; 3M3A A; 1EBC A; 1GCW A; 3OO4 B; 5F2A A; 1S69 A; 3QJC B; 1Y8H A; 4F69 A; 1HBH A; 1YGF A; 2GRZ A; 2R4Z A; 3W4U B; 1J7Y A; 1LJW B; 3HEO A; 1MBN A; 1BBB A; 1YEQ A; 2D60 B; 1GVH A; 1CG5 A; 1DO3 A; 1HGC A; 1V5H A; 3WTG B; 1LFQ B; 1MYG A; 1ITH A; 6HBW B; 3FH9 B; 1BIJ A; 4KMW A; 2DC3 A; 1YE0 B; 1J40 B; 1LA6 A; 4TWV A; 5EUI A; 2ZT2 A; 1AZI A; 1BZP A; 1YOG A; 1NGK A; 3OGB A; 1YG5 B; 2ZLX A; 1Y0A B; 3UHY A; 1F5P A; 1Y0D B; 1JWN A; 2QU0 A; 3QJE B; 5D5R A; 1DTM A; 1Y83 A; 1Y31 A; 1YHU A; 1MLS A; 2QSP A; 4NZI A; 4HHB A; 4U8U D; 3WCT C; 3UHV A; 1S61 A; 1YIH A; 1J3F A; 1CG8 B; 3PI2 A; 2ZLT B; 3WCW A; 3A0G B; 2MGL A; 1ABW B; 3ZJN A; 2SPL A; 1A6K A; 3UI0 A; 3UBC A; 1XZU A; 3MJP A; 1MNJ A; 4C0N A; 4HSW A; 5CNB A; 1LFT A; 2D5X A; 1BZ6 A; 2XKI A; 3QQQ A; 5EE4 D; 1K1K B; 4L7Y B; 4NK2 A; 1G08 A; 4YU4 A; 3UHU A; 1HHO B; 4MQG B; 1YIE A; 4ROL A; 1Y8I A; 2ZWJ A; 1R1Y B; 3UGY A; 1FLP A; 1LFZ B; 106M A; 1EW6 A; 1FSX B; 1Y5F B; 3IXF A; 3GK9 A; 1R1X B; 2VEB A; 4G51 B; 1URY A; 3MKB B; 2EVK A; 1QSH A; 1MLU A; 3DHR A; 1LFY B; 2ZT4 A; 2DHB B; 1A01 A; 1FAW A; 1RPS A; 3UHK A; 1O1N B; 1YZI B; 3NFE A; 1I3D A; 4SDH A; 2R4Y A; 1HV4 A; 4N7P B; 1G9V B; 3VRE B; 1K0Y A; 3WR1 B; 1THB B; 4HSX A; 3UHB A; 3D17 A; 3QJD B; 4WJG A; 3AG0 A; 1MYI A; 3HF4 B; 1TES A; 1GBU A; 2H35 B; 3BJ3 A; 3WHM B; 3IC2 A; 1CMY A; 1MLM A; 1V4X A; 3OZU A; 1M9P A; 1NS9 B; 1RSE A; 3RGK A; 3IC0 A; 3ECZ A; 1GDL A; 1HBG A; 5ILM A; 1G0A B; 4U8U C; 5AB8 A; 1DM1 A; 3UH5 A; 3R0G A; 1QPW A; 2O5S X; 1Y4P B; 3UH3 A; 2HZ1 A; 3VRF B; 1GLI B; 3WCU A; 1O1J A; 1YE2 B; 4M4A B; 3WFT A; 1O1P B; 2MGE A; 1BZ1 B; 1ASH A; 2PEG B; 1HDA B; 3A59 B; 4X0L A; 4HRT A; 5EE4 C; 1YGD A; 1XYE A; 2LH1 A; 1HDS B; 3PT8 A; 1VXE A; 1Y35 B; 1Y7Z A; 3GLN A; 3WI8 A; 1A3N A; 3S1J A; 4ILZ A; 1X9F D; 4H07 A; 1A9W E; 4DC7 A; 1QXD B; 2ZSO A; 3UHR A; 2V1J A; 2MHB A; 4IT8 A; 2ZS0 D; 1RVW A; 1YDZ A; 1YOI A; 3PI1 A; 2G10 A; 1XZ5 B; 3ODQ B; 3QZZ A; 1MLK A; 4F6D A; 1O1I B; 2VEE A; 1KR7 A; 1JW8 A; 2HHB A; 1Y8W B; 2B7H A; 5E29 A; 1S5X A; 2GTL A; 1A0Z B; 2WTG A; 3K8B A; 1Y0T B; 2Z6S A; 2HHD B; 2MGD A; 4MQH B; 1UT0 A; 1BZ0 B; 3GQP B; 3M3B A; 3E5O A; 3MJU B; 1O1M A; 1MWD A; 1XQ5 A; 1HCO B; 3NG6 A; 4O1T A; 2O5B X; 2D2M A; 1GDJ A; 3EU1 A; 2R1H A; 1MBI A; 4N7O A; 1A00 B; 1IBE A; 4NS2 A; 3WCP B; 1MLQ A; 1GZX B; 2ZLV A; 5HU6 A; 2XKH A; 3D1K B; 1DXU A; 2R80 B; 4G1V A; 1PMB A; 4F4O B; 2H8D A; 5KDQ B; 2VLX A; 2HBS B; 1MBO A; 1RQ4 B; 1UFP A; 2HBD B; 1J7W A; 2IN4 A; 3D1A A; 3LB2 A; 2AUR A; 3PIA A; 3RJN B; 1HLB A; 1MNO A; 5KER B; 4N8T A; 1NZ4 A; 1AJ9 B; 1A4F A; 1X9F C; 4N7N A; 2OH9 A; 1MOA A; 5JGG A; 1LH6 A; 2HBE A; 3LB4 A; 1Y4G A; 1HSY A; 3G4Y A; 2ZFO B; 2GKM A; 3ARJ A; 3LQD B; 1IT3 A; 2ZS0 C; 2FAL A; 1MGN A; 2LH5 A; 2OH8 A; 1V4W B; 1Y0C A; 5E83 B; 4MBN A; 3UHE A; 4PNJ A; 1J3Y B; 1JP9 A; 4MQC A; 3WCT A; 3HEN A; 2HCO B; 3BA2 A; 7HBI A; 1DKE A; 107M A; 3FS4 A; 1HAC B; 1Y4V B; 1Y45 A; 1YH9 A; 3OZV A; 1A6G A; 3GQG B; 3S66 B; 2FRJ X; 1MLF A; 1RTE A; 1Y22 A; 3HYU B; 1SHR A; 3ZJM A; 1OUT A; 1V75 B; 1FHJ B; 3OO5 B; 2ZFB A; 5AZR A; 3PT7 A; 3ZJP A; 4LPI A; 2GRF A; 3KMF C; 5KKK A; 4OOD A; 1G0B B; 1C40 B; 4TYX A; 1GCV B; 2O58 X; 5EET A; 2MGG A; 1OJ6 A; 4AVD A; 3GDJ A; 4FH7 A; 1MWB A; 2RI4 A; 4NI0 B; 2MYC A; 1VWT A; 3PI8 B; 1HGA A; 5ILE A; 3WCV A; 1LH2 A; 3BJ1 B; 3ONZ A; 2BLJ M; 1HRM A; 1MYF A; 2RAO A; 2DXM B; 4PQB A; 3OO4 A; 3ED9 A; 3QJC A; 1XY0 B; 3SDH A; 2MGK A; 3LB1 A; 1D8U A; 1Y46 B; 3W4U A; 1FCS A; 1HJT A; 1YOH A; 2D6C A; 1LJW A; 5C6E B; 1XZV B; 2ZS1 D; 1MTJ A; 1HAB B; 1A0U B; 2D60 A; 1UVY A; 2G12 A; 4G1B A; 1Y7D B; 3WTG A; 1LFQ A; 6HBW A; 2AA1 B; 1MOC A; 3FH9 A; 1YE0 A; 1J40 A; 2NRL A; 2BK9 A; 1YG5 A; 6HBI A; 2ZFO C; 3QM6 A; 3UHX A; 1Y0A A; 1Y0D A; 1A3O B; 3QJE A; 1NZ2 A; 1OFJ A; 1Y01 B; 110M A; 1Y7C B; 5B85 A; 3KUN A; 1MKO B; 3PI9 B; 1CG8 A; 4FC3 B; 1X3K A; 2ZLT A; 2D2N D; 3A0G A; 1O1L B; 3KUO A; 2C0K A; 2NSS A; 1ABW A; 1YHR B; 1H1X A; 1J7S B; 4MAX A; 3UHG A; 5CN8 A; 1K1K A; 3DUT B; 4L7Y A; 1A6M A; 2QMB B; 4F6I A; 3OK5 A; 1DXC A; 1HHO A; 1U7S A; 4MQG A; 1R1Y A; 5CN4 A; 1VXF A; 1Y8K B; 1FSX A; 1Y5F A; 1YMA A; 1R1X A; 1MNI A; 4G51 A; 1DO1 A; 3MKB A; 3D7O B; 3UGZ A; 3SZK B; 1DXV B; 4MQI B; 1LFY A; 1HDB B; 2DHB A; 1EBT A; 1HBR B; 1O1N A; 1YZI A; 1JZK A; 4U8U B; 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3O89 A; 2G0R A; 1SPG B; 1A00 A; 3WCP A; 2ZS0 B; 1GZX A; 1YHU D; 1MBA A; 3D1K A; 1G09 B; 3CY5 B; 2R80 A; 1A6N A; 4F4O A; 5KDQ A; 1VXA A; 2HBS A; 1TU9 A; 2VHB A; 1RQ4 A; 3ARK A; 3GQR B; 2ZLU B; 2HBD A; 1DTI A; 2W6X A; 3WCW D; 1MLJ A; 2W72 C; 3WFW A; 3BCQ B; 5KER A; 1AJ9 A; 1CH4 A; 1UX9 A; 1EMY A; 4NXC A; 3AQ7 A; 1YMC A; 1J52 A; 5C6Y A; 5CNG A; 3S48 C; 1GDI A; 1LFL B; 3UHQ A; 4DWU A; 2ZFO A; 3LQD A; 2HBF B; 4HRR B; 1CP5 A; 2V1I A; 3ZJR A; 4DC8 A; 1XXT B; 1V4W A; 1CIO A; 2D5Z B; 1S0H B; 2DN3 B; 1XZ2 B; 5E83 A; 4YU3 B; 1J3Y A; 1CH9 A; 1XZ7 B; 3EDA A; 1F5O A; 2ZSP A; 1CH2 A; 2HCO A; 3A5G A; 1X46 A; 4XDI A; 1YEN B; 2MGF A; 1VHB A; 1HAC A; 1Y4V A; 3GQG A; 4PQ6 A; 3S66 A; 3HYU A; 1RQA B; 5EV5 A; 3VRG B; 5EOH A; 2W6W A; 1UVX A; 1JP6 A; 1FN3 B; 4ESA B; 1V75 A; 1FHJ A; 3OO5 A; 1CIK A; 2MBW A; 5EYJ A; 2ZT1 A; 2LHB A; 2AUP A; 1B86 B; 3MYN A; 1G0B A; 1MNK A; 1YEV B; 1C40 A; 3A5B A; 3UHZ A; 1GCV A; 5JDO F; 1YHU C; 3B75 B; 4O4Z A; 1BJE A; 4O2G A; 1DO4 A; 4F6J A; 1I3E A; 4NI0 A; 3AT6 B; 2VLZ A; 4F6G A; 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