The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
171
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structure length |
151
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Chain Sequence |
QFLRTDDEVVLQCTATIHKEQQKLCLAAERLCFLESVEKWKFMMKTHRTLLYGHAILLRHSYSGMYLCCLSTSRSSTDKLAFDVGLQEDTTGEACWWTIHPASKQRSEGEKVRVGDDLILVSVSSERYLHLSYSWHVDAAFQQTLWSVAPI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
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| molecule keywords |
Cardiac Ca2+ release channel
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| publication title |
The deletion of exon 3 in the cardiac Ryanodine Receptor is rescued by beta strand switching
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
30
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| structure length |
151
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| sequence length |
171
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-02-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Trefoil | Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) | Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WO2 A; 3BAH A; 4Z9W B; 2DRE A; 1F31 A; 1G9C A; 4J2X A; 3CA3 A; 4WBC A; 4LO0 A; 1BFG A; 2ZQN A; 3VEQ A; 4D0T A; 2HZ9 A; 3ILA A; 3BAV A; 4KEI A; 1BAR A; 1IT0 A; 1FMZ A; 1YF8 B; 2ESU A; 2NZ9 A; 1XZZ A; 2BEA A; 3FJA A; 1ABR B; 1JT5 A; 3E8L C; 3HN1 A; 3LTQ A; 3N7L A; 6I1B A; 3PG0 A; 4LO2 A; 2FO1 A; 3AZV A; 3V0B A; 2MIB A; 3CA5 A; 4II0 A; 2D23 A; 4QKS A; 2KI4 A; 3IM5 A; 3S8J A; 2Y9X E; 3AH2 A; 4I8M A; 2P39 A; 3BAO A; 3OBR A; 4KEJ A; 1HWP B; 3AJ5 A; 3FJF A; 4DEN A; 1PUU B; 2M49 A; 3CRI A; 3N7J A; 2K4A B; 1E0O A; 2RG9 B; 1J0S A; 1PUM B; 4J2S A; 3BTA A; 1JQZ A; 2FDB M; 2VSE A; 1QQK A; 4P0K A; 4IHZ A; 4XKI A; 5DUY A; 2FGF A; 3OGG A; 4AN7 B; 3TC2 A; 5BXR A; 1AFC A; 3FJH A; 5BQU C; 2RQ9 A; 1FWU A; 3FGM A; 3NBC A; 3UD7 A; 3MPP G; 3AKG A; 3S8K A; 3UJ4 A; 4IZE A; 3BRD A; 4D8H A; 4I6I A; 4ZA3 B; 1AVX B; 4IY9 A; 1S0B A; 4XFS A; 1EYL A; 4ZFW B; 4IY8 A; 3OBT A; 41BI A; 2D24 A; 2R9K B; 3CA6 A; 1XG6 A; 2D43 A; 1BA7 A; 3MAL A; 3F1R A; 3UD9 A; 4J2Y A; 3ZXD A; 3POK A; 3CA4 A; 1D0H A; 4LO8 B; 1DZC A; 4EFQ A; 4GOY A; 2XOA A; 2P23 A; 3Q7W A; 3V0A A; 2J3P A; 4OUJ A; 2HWM A; 4XFU A; 2D7R A; 5FNW A; 3BX1 C; 4QBC A; 2Q9X A; 3WIN A; 1N4K A; 3RTI B; 4X3A A; 3BA4 A; 1FV3 A; 1V6U A; 4P0J A; 5B2H A; 3H6R A; 4IQP A; 1OQL B; 2D20 A; 3NBD A; 1G82 A; 1JTC A; 1TP0 A; 3AZW A; 4Q9G A; 1CE7 B; 2E4M A; 3UDA A; 4J23 B; 2F2F A; 1MC9 A; 1ISZ A; 1RZO B; 4P6A A; 4DEP A; 1WD3 A; 1S0G A; 2KKI A; 4X38 A; 4I4V A; 1JT7 A; 2RST A; 3IM7 A; 1R8O A; 3R4U A; 1I1E A; 3FUO A; 1ILR 1; 3PHZ A; 1WD4 A; 4JQ0 A; 4KC3 A; 5F90 A; 4ZFU B; 2LIQ A; 1AF9 A; 3I29 B; 3Q7X A; 3FJD A; 3OJV A; 1II4 A; 4EKX B; 2KI6 B; 1G9B A; 3BB2 A; 4JRA A; 1FMM S; 4JKX B; 1HWN B; 4LO0 C; 1ITB A; 3ZX7 A; 3FJJ A; 4GP0 A; 5BVP I; 2MC2 A; 3NJ5 A; 2HWA A; 5JLV A; 2IWT B; 3FUQ A; 1SR4 A; 1G9A A; 3V0B B; 3IM6 A; 1QXM A; 1JY0 A; 4G9M A; 4JKQ A; 5BP5 C; 2NM1 A; 3A22 A; 3VWC A; 1XYF A; 2F8X C; 1RY7 A; 1S0L A; 4I96 A; 3WO3 A; 1JT3 A; 5FZY A; 1P63 A; 2UUS A; 1M16 A; 1KNM A; 7I1B A; 1AVW B; 1GGP B; 1JT4 A; 3BAG A; 3C9Z A; 1V6W A; 4I1B A; 4I4R A; 4H9W A; 3I2X A; 1TIE A; 3R4S A; 3JUT A; 2IHO A; 1K5V A; 4TLP A; 2Y9W C; 4P0L A; 1V6V A; 5FNX A; 1YYN A; 1VCL A; 2VSA A; 1BFC A; 3HMY A; 1PZZ A; 1W3F A; 2K43 A; 4I4S A; 4HJJ A; 4I37 A; 4USP A; 4A7K A; 1DLL A; 1HWO B; 3N0K A; 3CU1 B; 4PC4 A; 3O4O A; 1YXW A; 3O44 A; 5DZU A; 1HCE A; 4IZX A; 5D61 A; 2VU9 A; 4I2S A; 2VUA A; 2GO2 A; 3FJC A; 4I4Y A; 4DCK C; 4JP0 A; 1M2T B; 1RG8 A; 2YUG A; 3A21 A; 3K1X A; 5FZZ A; 4ISR A; 1TWE A; 1TWM A; 4ZKT B; 2KH2 A; 4F83 A; 3H6S E; 3WMU A; 3V0A B; 3I2A A; 4OW4 A; 4OWL A; 3VUO A; 4YOL A; 1RML A; 8I1B A; 1FGA A; 2AXM A; 3FJ8 A; 3H6R B; 4ION A; 3WIN C; 1A8D A; 3NBN A; 4FVV A; 3AKF A; 1AXM A; 1BLD A; 1HCD A; 4Q91 A; 1DFQ A; 4AN6 A; 2QYI B; 3OJM A; 4OEF A; 2AFG A; 2F2F C; 1JLY A; 1HIB A; 3O4B A; 4JPZ A; 4G9N A; 4ZOT A; 3ZXG A; 4QKR A; 4LO3 A; 2VXR A; 3WMV A; 2ERM A; 4A7Y A; 3HAL A; 3HBW A; 2WRY A; 3A23 A; 4Q9P A; 1AVU A; 4ISQ A; 2FFV A; 3VT0 A; 4LO1 C; 1HKN A; 1Z4S A; 1HWM B; 3FJK A; 1JLX A; 3LLP A; 3SNV A; 3AH1 A; 1YTO A; 1YBI A; 3WO4 A; 4JAW A; 5BOW A; 1IIL A; 5F8S A; 1S0E A; 2Q3N B; 1ISV A; 2WBC A; 4I0Y A; 1TOO A; 4GP3 A; 3UJ0 A; 3CQA A; 31BI A; 1S0D A; 3N7M A; 3JRR A; 3CA1 A; 3O5W B; 1V6X A; 3O4D A; 3QYD A; 3FJI A; 1DZD A; 1PWA A; 2NYY A; 2X2T A; 2AAI B; 4I4P A; 1IOB A; 2Z49 A; 1IHK A; 1IJT A; 1K5U A; 1SR4 C; 3CRG A; 5F8Y A; 3RSJ A; 1G9D A; 3BRF A; 3V79 C; 3D7W B; 3VT2 A; 3FJB A; 1ISY A; 2BEB A; 2ET2 A; 4LO2 C; 1R8N A; 2ZQO A; 4OWK A; 1FWV A; 9ILB A; 5EG6 C; 4ZBV B; 3RMX A; 3P53 A; 2QN4 A; 1QQL A; 4XFT A; 3AKI A; 1S0F A; 3FFZ A; 4GOV A; 1TTU A; 1NZK A; 1BFF A; 2D44 A; 1T9F A; 1Q03 A; 1TFM B; 3OJ2 A; 1PC8 B; 2MLL B; 2K8R A; 2Y9G A; 4ZGR B; 5I1B A; 1CVS A; 3T8S A; 5G00 A; 3WA1 A; 4KBB A; 4GAF A; 3ZC8 A; 5D62 A; 5BP5 A; 2AQZ A; 3RMY A; 3W9T A; 3BA5 A; 4ZLB B; 1DFC A; 3CRH A; 4ZFY B; 4KEK A; 1AVA C; 1S0C A; 4G1R A; 4L4I A; 2X2S A; 2KLL A; 4EEE B; 4X37 A; 4EB2 B; 4L4H A; 3BAQ A; 5E24 E; 3UD8 A; 1Q04 A; 3BAU A; 2D1Z A; 4I4Q A; 3P6J A; 1FN0 A; 1BAS A; 3O4A A; 2DS0 A; 1ONK B; 3B9U A; 3OGF A; 3HSM A; 21BI A; 3BA7 A; 2NP0 A; 4J2K A; 5BQU A; 3CA0 A; 3FJ9 A; 4OEG A; 1BFB A; 4HR6 C; 1SZ6 B; 4H04 A; 4HA2 A; 3AJ6 A; 4I1E A; 1EVT A; 3F62 B; 5GAQ A; 3PUB A; 4USO A; 4OEE A; 2HW9 A; 2VLC A; 1MD6 A; 1UPS A; 4I4X A; 2GZB A; 2BFH A; 2FFU A; 2DRZ A; 4I4U A; 1ISX A; 1DQO A; 3BRG C; 1W3A A; 1DIW A; 4QAL A; 2LIE A; 4A7Z A; 3KMV A; 2E4M C; 4EFP A; 5DSS B; 4LO3 C; 1FQ9 A; 4QBV A; 1XHB A; 3QR5 A; 1W3G A; 1IRA X; 3EF2 A; 2DRY A; 2D7I A; 3N7K A; 4F34 A; 1BLA A; 3CAH A; 3AKH A; 2Y9F A; 3VSF A; 3PME A; 2NVH A; 4D0Z A; 2D22 A; 1IRP A; 4FGF A; 4QD2 B; 2NTD A; 3H6Q A; 3Q7Y A; 1WBC A; 4G6J A; 3O49 A; 4QC4 A; 1EV2 A; 4EFR A; 3RTJ B; 1FV2 A; 3A07 A; 4QD2 C; 5EHA A; 3O3Q A; 1EPW A; 4IYB A; 3FJE A; 1Z2V A; 2Z48 A; 3HOM A; 5D63 A; 5DVH A; 5BXP A; 4I7I A; 4I3N A; 2I1B A; 3VT1 A; 3ZC9 A; 1ISW A; 4Z8S B; 2L5X A; 4R6U B; 4LO1 A; 5JMC A; 1NUN A; 3IIR A; 2VXT I; 3O4C A; 4GAI A; 5F8W A; 3AH4 A; 1WBA A; 3P6I A; 4X39 A; 1Z0H A; 4LO7 B; 1L2H A; 5FZU A; 4QO3 A; 3NBE A; 1DQG A; 5HPZ A; 1T4Q A; 1DJS B; 1I1B A; 4LO7 C; 5EC5 A; 3IAG C; 5BXT A; 4END A; 1Q1U A; 5BXS A; 2ZR1 B; 4OWJ A; 4G6M A; 4CJM A; 4I4O A; 3BAD A; 3VSZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WO2 A; 3BAH A; 4Z9W B; 2DRE A; 1F31 A; 1G9C A; 4J2X A; 3CA3 A; 4WBC A; 4LO0 A; 1BFG A; 2ZQN A; 3VEQ A; 4D0T A; 2HZ9 A; 2NS2 A; 3ILA A; 3BAV A; 4KEI A; 1BAR A; 1IT0 A; 1FMZ A; 1YF8 B; 2ESU A; 2NZ9 A; 1XZZ A; 2BEA A; 3FJA A; 1ABR B; 1JT5 A; 3E8L C; 3HN1 A; 3LTQ A; 3N7L A; 6I1B A; 3PG0 A; 4LO2 A; 2FO1 A; 3AZV A; 3V0B A; 2MIB A; 3CA5 A; 4II0 A; 2D23 A; 4QKS A; 2KI4 A; 4MZF B; 3IM5 A; 3S8J A; 2Y9X E; 3AH2 A; 4I8M A; 2P39 A; 3BAO A; 3OBR A; 4KEJ A; 1HWP B; 3AJ5 A; 3FJF A; 4DEN A; 1PUU B; 2M49 A; 3CRI A; 3N7J A; 2K4A B; 1E0O A; 2RG9 B; 1J0S A; 1PUM B; 4J2S A; 3BTA A; 1JQZ A; 2FDB M; 2VSE A; 1QQK A; 4P0K A; 4IHZ A; 4XKI A; 5DUY A; 2FGF A; 3OGG A; 4AN7 B; 3TC2 A; 5BXR A; 1AFC A; 3FJH A; 5BQU C; 2RQ9 A; 1FWU A; 3FGM A; 3NBC A; 3UD7 A; 3MPP G; 3AKG A; 3S8K A; 3UJ4 A; 4IZE A; 3BRD A; 4D8H A; 4I6I A; 4ZA3 B; 1AVX B; 4IY9 A; 1S0B A; 4XFS A; 1EYL A; 4ZFW B; 4IY8 A; 3OBT A; 41BI A; 2D24 A; 2R9K B; 3CA6 A; 1XG6 A; 2D43 A; 1BA7 A; 3MAL A; 3F1R A; 3UD9 A; 4J2Y A; 4H75 A; 3ZXD A; 3POK A; 3CA4 A; 1D0H A; 4LO8 B; 1DZC A; 4EFQ A; 4GOY A; 2XOA A; 2P23 A; 3Q7W A; 3V0A A; 2J3P A; 4OUJ A; 2HWM A; 4XFU A; 2D7R A; 5FNW A; 3BX1 C; 4QBC A; 2Q9X A; 3WIN A; 1N4K A; 3RTI B; 4X3A A; 3BA4 A; 1FV3 A; 1V6U A; 4P0J A; 5B2H A; 3H6R A; 4IQP A; 1OQL B; 2D20 A; 3NBD A; 1G82 A; 1JTC A; 1TP0 A; 3AZW A; 4Q9G A; 1CE7 B; 2E4M A; 3UDA A; 4J23 B; 2F2F A; 1MC9 A; 1ISZ A; 1RZO B; 4P6A A; 4DEP A; 1WD3 A; 1S0G A; 2KKI A; 4X38 A; 4I4V A; 1JT7 A; 2RST A; 3IM7 A; 1R8O A; 3R4U A; 1I1E A; 3FUO A; 1ILR 1; 3PHZ A; 1WD4 A; 4JQ0 A; 4KC3 A; 5F90 A; 4ZFU B; 2LIQ A; 1AF9 A; 3I29 B; 3Q7X A; 3FJD A; 3OJV A; 1II4 A; 4EKX B; 2KI6 B; 1G9B A; 3BB2 A; 4JRA A; 1FMM S; 4JKX B; 1HWN B; 4LO0 C; 1ITB A; 3ZX7 A; 3FJJ A; 4GP0 A; 5BVP I; 2MC2 A; 3NJ5 A; 2HWA A; 5JLV A; 2IWT B; 3FUQ A; 1SR4 A; 1G9A A; 3V0B B; 3IM6 A; 1QXM A; 1JY0 A; 4G9M A; 4JKQ A; 5BP5 C; 2NM1 A; 3A22 A; 3VWC A; 1XYF A; 2F8X C; 1RY7 A; 1S0L A; 4I96 A; 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2FFV A; 3VT0 A; 4LO1 C; 1HKN A; 1Z4S A; 1HWM B; 3FJK A; 1JLX A; 3LLP A; 3SNV A; 3AH1 A; 1YTO A; 1YBI A; 3WO4 A; 4JAW A; 5BOW A; 1IIL A; 5F8S A; 1S0E A; 2Q3N B; 1ISV A; 2WBC A; 4I0Y A; 1TOO A; 4GP3 A; 3UJ0 A; 3CQA A; 31BI A; 1S0D A; 3N7M A; 3JRR A; 3CA1 A; 3O5W B; 1V6X A; 3O4D A; 3QYD A; 3FJI A; 1DZD A; 1PWA A; 2NYY A; 2X2T A; 2AAI B; 4I4P A; 1IOB A; 2Z49 A; 1IHK A; 1IJT A; 1K5U A; 1SR4 C; 3CRG A; 5F8Y A; 3RSJ A; 1G9D A; 3BRF A; 3V79 C; 3D7W B; 3VT2 A; 3FJB A; 1ISY A; 2BEB A; 2ET2 A; 4LO2 C; 4MZH A; 1R8N A; 2ZQO A; 4OWK A; 1FWV A; 9ILB A; 5EG6 C; 4ZBV B; 3RMX A; 3P53 A; 2QN4 A; 1QQL A; 4XFT A; 3AKI A; 1S0F A; 3FFZ A; 4GOV A; 1TTU A; 1NZK A; 1BFF A; 2D44 A; 1T9F A; 1Q03 A; 1TFM B; 3OJ2 A; 1PC8 B; 2MLL B; 2K8R A; 2Y9G A; 4ZGR B; 5I1B A; 1CVS A; 3T8S A; 5G00 A; 3WA1 A; 4KBB A; 4GAF A; 3ZC8 A; 5D62 A; 5BP5 A; 2AQZ A; 3RMY A; 3W9T A; 3BA5 A; 4ZLB B; 1DFC A; 3CRH A; 4ZFY B; 4KEK A; 1AVA C; 1S0C A; 4G1R A; 4L4I A; 2X2S A; 2KLL A; 4EEE B; 4X37 A; 4EB2 B; 4L4H A; 3BAQ A; 5E24 E; 3UD8 A; 1Q04 A; 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