3QSLA

Structure of cae31940 from bordetella bronchiseptica rb50
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
318
structure length
318
Chain Sequence
QKLEKAKVQIAVGGKPLIYYLPLTIAEVKGFFKDEGLDVSIADFAGGSKALQAVVGGSADVVSGAFEHTLSLQAKGQFYRAFALQGRAPMIGVGVSKKNLPGYKGPADLKGRKIGVTAPGSSTNMVVNFFLAKHGLKASDVSFIGVGAGAGAVTALRSGQIDAISNTDPVVSMLETSGDIQIIVDTRTLKDTKEIFGGNMPAGCLYAPQAFVDANPNTAQALTNAIVRADKWIQKAGADEIAKAVPEGYLLGDPAVYKAAIGKSMEGLSPDGVIPEDGAATALKALAAFVPDFDAAKVDPAKAWTNEYTRRANEKYPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative exported protein
publication title Structure of CAE31940 from Bordetella bronchiseptica RB50
rcsb
source organism Bordetella bronchiseptica
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 113
structure length 318
sequence length 318
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qslA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qslA01
1NNTA 3FVKA 2Q88A 4HW8A 3K01A 3PPNA 2XXXA 2A5TB 3MZ1A 3TODA 3IOWA 2DWHA 2AL5A 4TLMB 3TPAA 5DEXB 1DOTA 2ANJA 1UQWA 5CMCA 3RTFB 4H67A 4QHQA 1SBPA 4M1VA 1JEVA 3N5LA 3OO7A 1B7UA 3T96B 1RYXA 3G7WA 2UVIA 4ELPA 5I57B 5L9MA 5JTYB 3S2VA 1Y4TA 1JVYA 4ZEIA 4RY1A 1F9BA 1KWHA 3LSFB 2YPNA 2ESNA 3QXMA 4OXVA 4C0RA 1IIWA 2GFEA 2DQVA 1MDP1 3CVGA 1ZKBA 5H8QA 4I9DA 4OTEA 1MM7A 4IO5A 4NF5A 4XKNA 2GHAA 3QUJA 1P1QA 5I2NA 3PGFA 3I3VA 4NTLA 4KQPA 5B7DA 2IA4A 4O3AA 4U22A 4GVOA 1SDXA 3G3GA 2LAOA 2I4CA 5JEIA 4F2QA 2D21A 3HSTA 3KN7A 3QAXA 3MZ9A 3MBPA 1PC3A 1USYE 1II5A 4QSEA 2PT2A 2O7UA 2ONRA 1GV8A 3U72A 4GD5A 1Q35A 4LP2B 1OLCA 5H8HA 3SETA 5TP9B 1SD3A 1B6HA 2PX1A 3TAJA 2Y7WA 4G8NA 4QSCA 3RGYA 3OO9A 2ZNUA 3PUWE 3E13X 3KBRA 4KYEA 1S50A 1EH3A 4OWDA 2QJEA 4GLIA 2DWJA 4EUOA 4ESWA 5F7VA 3K6WA 1B3EA 5EHSA 4UA8A 2VD3A 1XHYA 4NF4A 1QUIA 4YAHX 1PDAA 3MP1A 3PMVA 4DLDA 2XXTA 2QSXA 2ZNSA 4YKJA 1SW4A 4NF8B 1B1XA 3ZKKA 2DOJA 1SYIA 2HAUA 3TTMA 3OEMA 5KCJB 2QS4A 1M5DA 3W15C 4IO7A 4XKQA 3EHTA 3PUZE 1XT8A 4HCYA 3GBAA 4NEDA 3PMWA 3T66A 2PVUA 2Z23A 4WEDA 3LSLA 3HHGA 1EZOA 1NNKA 4BDLA 2DVCA 4Q30B 4ND9A 2O6AA 3PPOA 3V89B 4AB5A 2QRYA 4OERA 4PFYA 1FCKA 4FORA 2ZMBA 1N7XA 3IL1B 3U94A 3V83A 3FIRA 4GXAA 1A99A 3JV9A 4JWOA 2YJPA 3W9VA 2GH9A 2F6GA 2X26A 2XX9A 4IO6A 4O3CA 1P1WA 5ELVA 4WKMA 5DVJA 3IX1A 3H6UA 5L8DA 4WEPA 1URSA 1MY4A 4G77A 2GRVA 4R72A 1SVXB 3UA8A 1MY2A 3U93A 2F8DA 3TTNA 2O1MA 1USYH 2I3VA 2UYFA 4Q8RA 3FD3A 1DPEA 4ZEKA 1I6QA 2P2AA 3SEYA 5ICQA 2ZYNA 4ZZEA 1LFGA 1Y3PA 4GFRA 4DXCA 1LAHE 4ZZAA 1MY0A 3U8QA 2YLNA 3C9HA 2V93A 1US4A 4QFNA 3EHSA 4BDMA 1NNFA 4F1UA 1B3HA 3ODBA 4GF8A 5H8NA 3SEXA 5AA4A 1FTJA 2VD2A 4G4PA 3IJOB 3JYRA 4Z7EA 4OEUA 3PPQA 5J1DA 4F18A 2OK2A 2Q9TA 4ELQA 3CG3A 1NNPA 4G8MA 3CFZA 3T9HB 2DVZA 2ZYMA 3VE1B 5CRYA 2UVHA 1NKXA 3O66A 4THIA 3MP6A 4NE4A 3EPEA 4EXLA 1M5FA 1N0TA 1PB8A 1D9YA 3IB2A 1LCTA 1AMFA 4R9GA 2HZKA 4KI0E 2UXAA 3FZVA 3ZS6A 2Q89A 1JW5A 1B2HA 2WKYA 1Y4CA 3Q28A 3IORA 1NFTA 2ONSA 4GL0A 1UTBB 3A09A 1BKAA 3CFXA 3CRBA 4Q5TA 4RXLA 2RC9A 2KLFA 2X7QA 1IQ7A 4YB6A 3TKDA 2XHDA 3KFMA 1LBBA 4YZZA 4QFOA 1OQGA 4NWCA 3GZGA 5CI5A 1LSTA 4ZEDA 3H7MA 3CR9A 3KEIA 5AA2D 3TMGA 1S9TA 5JK4A 4ZEFA 4F39A 3KOSA 3QSLA 3K4UA 4F31B 2OLBA 3OD7A 5BWJA 1N7WA 2XXWA 4EQBA 3Q26A 3WAFA 3FASA 4RNSA 1ATGA 2AYSA 3MPLA 5TPAA 2DXRA 4JSOA 1CE2A 3DELB 2QS3A 4LA9A 3SEWA 5HBCA 2VGQA 3MC2A 4DCYA 3EQ1A 3SDFA 4EXKA 4R9FA 3TZAA 1B5HA 4ZE8A 4R6KA 3MJNA 3G3KA 1IXIA 5CC2A 5H8FB 3IJXB 4F3SA 4QRZA 5EYFA 1MRPA 5I2KA 3B7DA 4AB6A 4R2FA 3TCGA 3ZSFA 1D3KA 2NWJA 2UVJA 4QFPA 4X1DA 4JWYA 1FQEA 3EF7A 3RTWB 1GR2A 2DSFA 2XXHA 1FQDA 4KYSA 3K6XA 1GGGA 4G8HA 3HPIA 5LOMA 4XTCQ 1D9VA 3TYHA 3K6UA 4FJPA 2IEEA 4KYDA 2AL4A 2XX8A 1I6BA 4H65A 1XVXA 2E1SA 3USDA 3UIFA 4QF9A 2HAVA 2BJJX 3KN3A 2NVUB 2RKMA 3U92A 3TCHA 4IB2A 5KDTA 3C36A 4G68C 1VFEA 4F29A 4NF5B 3K1PA 1MQIA 5HPQA 3IOTA 3FV2A 3FVGA 3R7XA 1Q1KA 2FNCA 2ONKE 2D5WA 2QPQA 1UIUA 3VDFA 4N6PA 1J1NA 4X48A 3TFLA 5I58A 2VP1A 4IO2A 1FTKA 4YKKA 2V3TA 1B52A 5K2YA 3THIA 1ELJA 4P0IA 4DXUA 1GVCA 3V8XB 5I56B 2Y7KA 2ZYKA 3OELA 4IY6A 3GBBA 4DIGA 1DTZA 3V5AA 2A5TA 1B5IA 2DE4A 1BLFA 2H4IA 1S7YA 4LZ5A 3O9PA 2XXYA 3PPRA 5DEXA 3OOAA 4N07A 1B4HA 1IZ1A 4G68B 5KZTA 3G3IA 2I0CA 1SW5A 3C4MA 1Y3NA 2E0SA 3K1NA 4MLVA 4GQOA 2Q2CA 1QUKA 4RA1A 1QKBA 5JTYA 3LSWA 1ZIUA 2OWTA 3CSBA 4NF4B 1IEJA 3S9MC 2PYYA 3Q29A 3K00A 4DZ1A 2H5YA 2OZZA 2ZNTA 4O3BA 1FTLA 3W9WA 1MY3A 4TQUQ 1LFIA 4KR5A 4YKIA 4YMAA 1LAFE 3HO7A 1SW1A 1DPPA 4FIMA 1ANFA 1LAXA 1OIBA 3C35A 3PPPA 3UP9A 1I69A 2XXPA 1QUJA 3TUSA 1B7HA 4ZECA 1MY1A 2GHBA 2D3IA 1MXYA 4ISUA 3UGWA 1H3DA 1MPDA 3KOTA 1FTMA 1YTVA 3QIMA 4NF6B 1JEUA 4PE5B 5DVIA 3ILUB 1HSEA 3H3GA 1LBCA 4BLAA 1Y1ZA 3SEUA 3TDJA 2R6GE 1N84A 1O7TA 4EF1A 2H9BA 3O28A 3TTKA 2DWAA 5F1QA 3DP4A 3OMBA 3T9VA 1R1NA 3H06B 4PP0A 4MFIA 1O63A 3D4GA 1WODA 4QSDA 1MXZA 1LAGE 2QL3A 3N26A 4PETA 3GLBA 4H8JA 1QW0A 1JW1A 2B65A 2XXRA 3B6TA 5M2VA 5AA1A 4RJZA 1B3GA 3MWBA 4EF2A 1JNFA 1MM6A 3CSGA 4JXIA 3ECRA 3RQTA 2Z8DA 2HZLA 3H6TA 3MVWA 4R2BA 3N6UA 5KCJA 2Q2AA 1EU8A 3I5OA 1PBPA 4P11A 4XIGQ 1B5JA 1NH7A 1R6ZA 3DLNA 3PD8A 4FE8A 4LATA 4NWDA 1POY1 4BDRA 3UK4A 1N3XA 3SERA 4TLLB 4XKRA 4YICA 3EHUA 5I59B 1A8EA 4XKPA 1Y9UA 2QS2A 1N3WA 3H03A 4GIZA 1B46A 1PB9A 1R9LA 3T9UA 4IO4A 4E0WA 4I8CA 1A55A 4OQOA 3OO8A 5AA2B 4K3FA 3MQ9A 3E4RA 3ILTB 4KCDA 3H6VA 3S4UA 4QFKA 3KN8A 3L6GA 4ELRA 1M5CA 2V84A 3VXBA 3QUFA 2VOZA 1DTGA 2XD2A 4H5GA 3PMXA 4F2OA 5FHMA 1URGA 1QJMA 3CG1A 1IXCA 3B6QA 1MQDA 5A5XA 1MQHA 3WAEA 1VFDA 3H4ZA 2R9JA 3SEVA 1N76A 3PUYE 3IR1A 1M5BA 4F19A 3BKIB 3VV5A 3K6VA 4RK2A 1NH8A 1JVXA 1MPCA 2I4BA 3OXNA 3R26A 4AQ4A 1H76A 3LBSA 3FXQA 1O64A 1FQCA 3FXUA 3FJMA 2DXYA 3IO6A 4PFWA 3G3FA 1B0HA 4C1UA 3Q27A 3G3JA 1D4NA 1OVBA 4RK9A 3RT8A 2HFBA 4POWA 4H5FA 5ISUA 3K02A 2B3FA 1XC1A 1OLAA 3G3HA 3IOUA 1QKAA 1Y3QA 3PD9A 4LONB 3IOVA 4GXSB 3C31A 1MXXA 2DYXA 3MZBA 2Z8FA 5EHMA 2G29A 3R6UA 4U1OA 1MH3A 4R73A 2CZLA 2HQ0A 1T0KA 1HSLA 2F97A 3L6HA 4G2ZA 2Y84A 3BFTA 2PMSA 4MF3A 1LCFA 1MQJA 2I3WA 3RLFE 3QK6A 1ZU0A 1UTHB 3UN6A 2O68A 3IB0A 3KJTA 1DMBA 1FW0A 3U1OA 4MBPA 1MS7A 3FV1A 1N04A 3O2AA 1LLSA 1AIVA 1YPNA 1RYOA 3KZGA 5CBRA 4ECFA 3RT6B 1B40A 2FA7A 2P0SA 3N6TA 4EQ9A 2Z8EA 2PBWA 4KHZE 4JB7A 4F3GA 2ZXTA 1DSNA 4L17A 1L5TA 3VLVA 2CMOA 4OEVA 3HCQA 2A5SA 5H8SA 1AH5A 3OO6A 3VVDA 4ZEBA 4KFQA 3O6GA 3KSXA 1NMUA 1PBQA 1A54A 5HM4B 5CBSA 4YB5A 1H43A 3P7IA 1TFDA 3VLUA 5KDTB 2DE3A 5DYHA 4H0WA 4EQ7A 4U2RA 1UIVA 4HCWA 3A3CA 3IAZA 4MH5A 4OESA 1AOVA 2XX7A 2Y7PA 1XS5A 4OFOA 3OENA 1I6AA 3MUQA 1AL3A 3ZKLA 4LQ2A 1SYHA 3PUXE 1ZMGA 2O1LA 4OENA 3FJGA 4IGTA 2UVGA 4X9TA 3RNNA 2XXQA 5H8QB 1B51A 3M3FA 3VLWA 2AIXA 3MPKA 4R75A 3MAMA 3QYTA 3KJ7A 5I2NB 3JZJA 1Z7NE 2HCAA 3N94A 2RC7A 1IXHA 1POTA 1JQFA 4QFLA 4ZE9A 2NUVA 1MQGA 2H98A 5IKBA 3FUZA 1EZ9A 3T93B 3GXAA 5B70A 3IB1A 3E3KA 4YMBA 5H8HB 3RY3A 1MXWA 4Z0IA 1B9JA 2V3QA 5K2XA 1JETA 2ABHA 1FTOA 5AA3A 2QS1A 4PFTA 2M8CA 1H44A 3FATA 2ALUA 4LQ5A 5I57A 1PEBA 3ONMA 3CFLA 4DE8A 4R74A 1VSOA 2F35A 3M3KA 3HV1A 3O29A 4YB7A 3H6WA 3TQWA 3TQLA 4PQJA 5I56A 1QULA 3MP8A 2DWIA 4NMYA 5DVFA 2NXOA 5BUUA 4H8IA 2P1SA 4Q0CA 1FQBA 2XXVA 3F11A 5L9OA 3BFUA 4G68A 2OJTA 1XOCA 4JDFA 4FECA 2HXWA 2F7BA 1B32A 3KSJA 2F78A 4X1BA 4H6DA 1Y1MA 5TP9A 3HHFA 1VR5A 2PT1A 3C34A 3OSQA 2VHAA 3O6HA 3T9XB 4TOZA 2F34A 2RCBA 2RF1A 1OQHA 2XD3A 3IK6B 3PU5A 2RC8A 3FGSA 2RCAA 4GL8A 4KPTA 5FHNA 4M4GA 1ZTYA 1WDNA 3EN3A 1P1UA 3E9XA 3MVZA 4DCXA 1OVTA 2F7AA 4C1TA 4U21A 2O7IA 2DS9A 2QMXA 2I0BA 3CI8A 1LGBC 5CMKA 2I6EA 3IO4A 1SI1A 1ZLQA 4H1XA 1TFAA 3T22A 1LB9A 1TWYA 4ELOA 1B05A 2OCUA 3C33A 3KGCA 1BP5A 4NF8A 3KG2A 1A7LA 1WVJA 4NF6A 1OMPA 2H99A 3BBRA 1PB7A 4ESXA 4OHNA 2OWSA 3LC8A 4GRKA 3RN8A 1TXFA 4XXUA 4IO3A 5IAIA 2Y7RA 1HSJA 1MPBA 5H8NB 3B6WA 5AA4B 1XVYA 4OVJA 4OFLA 3PUVE 4HS7A 4RPNA 3S9LC 5A5XB 3S9NC 3SESA 4F1YA 3RPWA 1SI0A 3LR1A 4U1ZA 4IY5A 4GOTA 2QMWA 4LVQA 2R71A 3D4CA 3O97A 1BIYA 3TEPA 2O51A 3MVYA 3C32A 3DM0A 5I59A 3K0VA 1GTKA 1H45A 3A3UA 4YU0A 1B3FA 4OYVA 3O6IA 1YAEA 1IUDA 1VE4A 1ZJLA 4R6YA 4DXBA 5AA2A 4F1VA 3LSXA 1MH4A 5L9SA 2Z22A 3S9EA 4DDDA 1LFHA 2FYIA 1M5EA 1US5A 4POXA 2I49A 5CM6A 4U4XA 1MXVA 5TU0A 4I1DA 1IXGA 5CMBA 5FTHA 2F5XA 2F36A 1A8FA 1BTJA 4MLQA 1MG1A 1MXUA 4F22A 2REJA 3Q25A 4LZ7A 1NL5A 4U4SA 4FEDA 1YCJA 1B1HA 4ONYA 2O84X 4KD5A 1B7ZA 2UYEA 4RPOA 5TPAB 4JBZA 1ZBMA 5FHOA 2F6PA 2B3BA 4F3BA 1B3LA 2NOOA 4WXJA 2I48A 4FAJA 2XXUA 1IITA 1P1OA 2V3UA 2OBGA 4IGRA 2F7CA 4YKPA 1TT1A 4U23A 1CB6A 4UACA 3AXFA 1UTBA 3I6VA 3TTRA 4EDPA 4BDNA 3MVXA 4BDQA 3SKPA 3FXRA 5FTIA 5I2KB 1EZPA 3UORA 1FQFA 1R9QA 4FATA 1B58A 2ZYOA 3K2DA 2G93A 4JWXA 2O69A 3PV0E 3RUMA 1P99A 1P1NA 3HN0A 3VXCA 4PFUA 1B4ZA 1SW2A 5ITOA 3TELA 4GWOA 4JSDA 5AE4A 3OEKA 1RKMA 4ZDMA 1QVSA 3VVFA 2I58A 4FEBA 4OMBA 4OFJA 4ZS9A 3LUYA 3DP6A 4N13A 4RYAA 2THIA 1LB8A 2V25A 3VFJA 2W7YA 3DP8A 2X7PA 1URDA 3FJ7A 2RINA 4BDOA 3CIJA 5ITPA 1Z7ME 1UTHA 3VVEA 3OSRA 4P0GA 2HEUA 2DE2A 3K1MA 4I62A 4KCCA 2DP8A 3FVNA 4LZ8A 5DTBA 4F3PA 4LUBA 3MW0A 1SQYA 5ICTA 2H25A 2Q8JA 5I84A 1B0LA 5H8FA 5CMMA 1Y20A 1FQAA 3FVOA 4R6HA 3TTLA 5DT6A 5I58B 2XXIA 4OETA 4OZ9A 4E0XA 2REGA 3M3LA 1JW4A 3TCFA 1MDQA 2Y7IA 4HTGA 3M8UA 1A40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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