3QVIA

Crystal structure of kni-10395 bound histo-aspartic protease (hap) from plasmodium falciparum
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
327
structure length
323
Chain Sequence
EFDNVELKDLANVLSFGEAKLGDNGQKFNFLFHTASSNVWVPSIKCTSESCESKNHYDSSKSKTYEKDDTPVKLTSKAGTISGIFSKDLVTIGKLSVPYKFIEMTEIVGFEPFYSESDVDGVFGLGWKDLSIGSIDPYIVELKTQNKIEQAVYSIYLPPENKNKGYLTIGGIEERFFDGPLNYEKLNHDLMWQVDLDVHFGNVSSKKANVILDSATSVITVPTEFFNQFVESASVFLSLYVTTCGNTKLPTLEYRSPNKVYTLEPKQYLEPLENIFSALCMLNIVPIDLEKNTFVLGDPFMRKYFTVYDYDNHTVGFALAKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Histo-aspartic protease
publication title Structural insights into the activation and inhibition of histo-aspartic protease from Plasmodium falciparum.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 81
structure length 323
sequence length 327
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3qviA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3qviA01
1FMXA 4QGIA 5P2UA 3JVYA 4GJDA 2IEOA 2QI3A 1UH9A 3CIBA 1SDUA 3RSXA 1C6ZA 5COPA 4R95A 3MWSA 1BAIA 1A8KA 3UQUA 1TCWA 2QHYA 5DGUA 2R5QA 3R0YA 4J0TA 5P2RA 2P8HA 2R3WA 3EKXA 5HDUA 2FDPA 4EJLA 2OHMA 3D3TA 5OZHA 3IAWA 4JP9A 3INFA 3KT5A 2IL2A 5P56A 5P5KA 3PSGA 4YD5A 5P5EA 2QZXA 5P3CA 4DJYA 4R91A 4GMIA 4NJVA 2JYSA 3FNUA 5P3WA 4NJSA 3UQWA 3LIYA 4Z22A 5P0RA 5P07A 2R9BA 2MIPA 5JG1A 4L1AA 3PSUA 5P68A 4LAPA 5P8PA 5P8EA 5P1MA 3D20A 2P4JA 5P0JA 5P0GA 5P6ZA 2HS2A 3OY4A 5P3HA 5P4ZA 2PMAA 1T6EX 2I4DA 5P2SA 5P5LA 3S43B 4OBFA 5P2CA 1SBGA 3FNTA 4EYRA 3LZYA 3HAWA 5OZ7A 4BELA 5P14A 4Y3DA 4MC6A 3VSWA 4Y53A 3RTNA 3VSXA 2QZLA 4YE3A 2ZJKA 3SABA 2PYNA 4F74A 3SM1A 4TVHA 1WBKA 5P5JA 1HVCA 4Y58A 5P17A 1LYWA 3GI5A 2B8VA 2Q3KA 3KDDA 4ZSPA 3T3CA 5P7LA 1BXQA 5P81A 3JVWA 5P18A 4GZFA 3O9BA 5OYVA 5P12A 2F3EA 1RQ9A 5P6DA 5P6AA 1HTGA 4LXKA 4I0EA 5P8JA 1HVRA 1WKRA 2I4QA 1GNMA 4RCDA 4HDFA 4DQCA 1W5YA 1ZPKA 3PCWA 3RSVA 5P8OA 2FNTA 5F01A 3BRAA 3NDUA 1B6LA 1AJXA 2VIJA 4RVJA 4QJ9A 2FDDA 1HTEA 4J1HA 5P6KA 2PWCA 4EP2A 1LS5A 5P7EA 4YCTA 2FXDA 1PSOE 5P7GA 5P79A 3OXVA 1YG9A 5P06A 5P3ZA 1YX9A 1MUIA 3GW5A 4Z50A 1EBZA 2AVVA 4Y5MA 4RRNA 3NUOA 5P69A 3QN8A 4F73A 5COKA 5AH9A 1TW7A 5P7XA 4OC6A 2V16C 5P23A 2QMDA 3NDXA 1OEWA 2ANLA 1MSNA 5OZ9A 5OZBA 2PWRA 5P3JA 4RLDA 3UDMA 3TPRA 5OZLA 5P4VA 1T7JA 5P35A 3EKVA 3TH9A 3IXJA 5P4QA 2I4UA 3EMYA 5P8RA 2ZYEA 4Y4GA 5P2NA 3ZKXA 4Y3TA 5OYUA 4OBZA 4PHVA 2VA6A 5P4BA 1VIKA 4Y41A 4Y37A 5P6NA 2HPEA 5P8NA 3SKFA 3IVIA 4GJ6A 2QD7A 1APUE 1TCXA 5OZTA 4DFGA 1F7AA 2HS1A 1ZTZA 3S45A 5P1HA 5P3MA 2BQVA 5P4OA 5P19A 3UHLA 5HVPA 5P7JA 4JPEA 5P0KA 1XL2A 4RROA 1BVGA 4DI2A 5BRYA 1WBMA 1FGCC 2WEAA 3QS1A 4Y4EA 1NPVA 3OHHA 4Y4TA 4Y57A 4Y4DA 3LZVA 1MPPA 3UDJA 2ZGAA 2NMYA 4H3GA 4RRSA 3UF3A 4RVXA 2ER7E 5P6MA 3I25A 5P1FA 1YTHA 1B6JA 2ZJHA 4Y45A 3QBHA 5OYQA 5AH8A 2AZ9A 1FMBA 5P0HA 4F76A 4DJPA 4I0FA 2VS2A 5P0SA 5P46A 3UDRA 1K6PA 2HB3A 2AOJA 4Y3SA 4Y5CA 3OOTA 3UPJA 5P6EA 4I11A 1DP5A 2UPJA 3OU4B 5DQ2A 4YOBA 5P65A 3TPPA 1MRWA 2FS4A 5P09A 2CEMA 3OQAA 3LPIA 3CKPA 5P6BA 3TLHA 1EC0A 2NMZA 2OF0A 5P4GA 3A2OA 3ZKMA 4X2LA 5P74A 4WTUA 3VUCA 1JLDA 3LZSA 2UXZA 5P6FA 3EM3A 4ZPGA 4Y50A 3U6AA 4ACXA 5P2EA 3VFBA 2J9KA 5CONA 3BGBA 5I3WA 3VG1A 1FMUA 3GGVA 1NPAA 5P30A 1FF0C 5P04A 2I4WA 4D89A 5P77A 2ZHSA 2P3DA 3Q70A 3DK1A 5P2MA 3LIXA 4DVFA 4Y38A 3LIQA 3EM6A 5P82A 4DJRA 1HHPA 1FIVA 1VIJA 5P49A 1AZ5A 3VV7A 3L3AA 2QZWA 3D1YA 3ZKSA 1W5WA 5P50A 1FQ6A 4Y3EA 4QJ7A 5P5BA 1IDAA 3TOHA 3VYDA 5P1RA 5OZWA 4BFDA 5P4NA 2G1OA 4YCKA 1HEGE 3T7XA 1MIQA 1KJHA 4HE9A 4I8ZA 4RGHA 5P8AA 3OADB 5P2KA 5P4MA 1KJGA 5BS4A 5P1AA 3BUHA 5P8FA 1KZKA 4Y3LA 2FLEA 3C9XA 4ZSRA 2B7ZA 3APPA 4QJ8A 1NPWA 4U7VA 1ME6A 2JXRA 2AOFA 5C9DA 1SDTA 2RKFA 1LF2A 3OUDA 4NJUA 4OBHA 2G27A 3NU6A 4QJ6A 3OHFA 5OZ3A 5OYRA 5P2HA 2G21A 1LYBA 3TOGA 5SXNA 3CKRA 1FLHA 3L5BA 5P42A 4D88A 3CMSA 4DQHA 3PWRA 5APRE 1BWAA 1BBSA 2R3TA 1YTIA 3PI5A 5P1GA 5P3GA 4R8YA 1YT9A 3K4VA 3GI0A 3CYWA 4Y5NA 3TNEA 3SA4A 3DM6A 3M9FA 3IN3A 4GJ7A 4B05A 3DOXA 1CMSA 2HIZA 3N3IA 1BVEA 4L1AB 1W6HA 2XYFA 5P5UA 4ZIPA 4YDGA 3BXSA 5AHAA 3S8IA 1HPSA 5OZSA 2ASIA 3SA3A 4FSEA 4OBDA 3L5EA 2V13A 5P03A 4HLAA 5BWYA 5P7ZA 1FKNA 4XXSA 2WJOA 3OU1A 5DQ4A 3S53A 5P5FA 4EHCA 1XL5A 3OGPA 2NTRA 1MRXA 4DQBA 3SAAA 3SKGA 2WL0A 3LITA 4PEPA 5IS4A 2NNKA 4KE0A 2ZHVA 1BDRA 5P3LA 5P3PA 3Q3TA 3SA5A 5P87A 2WEBA 1HXBA 4DJXA 3HBOA 5P4EA 5OYYA 1LYWB 3K5FA 6APRE 3EL1A 2Q11A 5P2LA 5P0LA 4IVSA 3R2FA 3IVHA 2P3CA 5E5KA 5P73A 4KB9A 1EPME 2QD8A 1LV1A 1W6IA 4ZE6A 2ZHUA 4GJCA 2AVOA 2APRA 5E5JA 3NLSA 5P1LA 5P60A 1C70A 4CPXA 3U71A 5KR1A 5P3VA 1IVPA 2NNPA 2NXLA 2ZHRA 1HPVA 2O40A 5P8QA 5P47A 5P1JA 3HVPA 3D91A 4RVIA 1ZP8A 3TTPA 3EKYA 5P80A 4Y4AA 3OQDA 5KR2A 2WECA 4Y3ZA 3O9DA 3VYFA 3PEPA 5P0PA 2FGUA 5P1DA 1D4IA 2P83A 5OZNA 5OZPA 5P5ZA 5P7IA 2Q15A 1EPOE 5TOLA 1ODWA 5P7RA 5OZ2A 5P3OA 4Y3MA 5P62A 1K6VA 1FEJC 4EPJA 3QBFA 4J1EA 4EJDA 3OK9A 2WF3A 4Y54A 2O4NA 5SY3A 5P0YA 3PMYA 3ECGA 2ZJMA 1BDQA 7UPJA 2XFIA 1ER8E 2AOHA 4ZPFA 5P3DA 3EXOA 2VIZA 4PZWA 3QI1A 1SMRA 3PGIA 3VF7A 4OC6B 2QMGA 5ENMA 5P1VA 5AH6A 1E5OE 5P0UA 4B0QA 1XE6A 5P7DA 2FGVA 1FQ4A 2UY0A 3TKWA 3SA7A 1HBVA 1HPXA 4ZLSA 2Q64A 3NUJA 4TRWA 4MC2A 3EBZA 5OZJA 2QI1A 4HDPA 5P08A 3PCZA 1G35A 5P0AA 4OBZB 1RPIA 3TPLA 3BVAA 2AVMA 4BEKA 4YD7A 2BPYA 2HC0A 5P7BA 5SY2A 5P24A 2PH8A 4Y36A 4DH6A 5P29A 1FG6C 1QBSA 3SA9A 4DJUA 5P55A 5P0TA 8HVPA 5P4IA 1T3RA 3QAAA 4DJOA 1A94A 4D8CA 3ZPUA 4GYEA 2AOGA 4N00A 1ZAPA 5P1UA 5P43A 3DUYA 3DJKA 1D4SA 2QMFA 3ST5A 1ZSFA 4LHHA 4QJ2A 3BGCA 3OTYA 3OXWA 1LZQA 4DPFA 2FMBA 1N49A 5P4LA 4IVTA 1AVFA 3KMYA 1GVWA 5P6OA 3CKTA 4CPQA 5P01A 3PLLA 1PSAA 4EQ0A 2IGYA 3PRSA 5P6XA 2AZBA 3NWXA 2WF1A 3SO9A 5DR3A 2PC0A 2CEJA 5JFPA 5OYWA 2ER0E 3SLZA 1B6PA 5P32A 2NR6A 5P3IA 2I0DA 2O4KA 2PSVA 1FFFC 3AIDA 3RU1A 3OTSA 4CPTA 5KQZA 1D4LA 1LYAA 2VA7A 2QI0A 3G6ZA 3I6OA 5P8MA 3QIHA 1XN3A 4Y35A 7HVPA 3L38A 4Y5AA 5P0OA 5P5RA 1UH8A 5P0ZA 4Y4UA 2FIVA 3O9LA 3ZKIA 3S7MA 5KR0A 4L7HA 5OZMA 1APWE 1LF3A 3BHEA 1W5XA 1HVJA 5OZ4A 1PFZA 1MERA 5OZ0A 2CENA 5P1BA 3N4LA 3OAGA 1MT7A 3FIVA 5P67A 2WKZA 4CPRA 2OAHA 3PJ6A 5P3YA 1HXWA 4B72A 1YTGA 1AM5A 1Z1HA 2AIDA 4J0ZA 2BB9A 2P3BA 4Y3NA 5DGWA 4K4RA 4Y3XA 2VJ9A 5P8SA 4DJQA 4Y3RA 3TOFA 3K1WA 2HAHA 3PLDA 1FQ7A 2G24A 1LEEA 4Y43A 5FIVA 3JW2A 5P63A 1HWRA 5P7OA 3S7LA 4J1FA 3OUDB 5P20A 4H1EA 1IZDA 4I12A 4A4QA 2BKTA 3INHA 1PPLE 2BPVA 2O4SA 5P3QA 2QAKA 5P2XA 4OD9A 5P2YA 4COEA 5C9BA 3L59A 1G6LA 1HIIA 3FV3A 4U8WA 4MC9A 4LC7A 2ZJNA 4UPJA 1MT9A 1ODXA 3AUPA 4Y5GA 4CMSA 2BBBA 5KAOA 1IDBA 3KDCA 3LIZA 1NH0A 1BV7A 1D4KA 4Z4XA 5P5HA 3H5BA 3KMXA 4FRSA 2J9JB 5P1TA 4FS4A 3NU3A 5COOA 1YTJA 3PB5A 2WHHA 4BFBA 2AZCA 5P1WA 4R93A 2HB4A 4Y4ZA 5P88A 5P26A 4PYVA 5P25A 1SIPA 5P22A 3Q5HA 5P5IA 3OU1B 4M8XA 5P6QA 4Z2ZA 2OHUA 1HOSA 5C9FA 1BIMA 1K6TA 5HDVA 2BPZA 4Y4BA 5P7NA 5P41A 5IVQA 4B1CA 4I0JA 2JJIA 4Y3JA 3DV1A 3S43A 5P1KA 3IXKA 2JJJA 4EWOA 3MXDA 5P5TA 3L58A 5P5DA 4J17A 5P6IA 4L7GA 4EJ8A 4XKXA 2ER6E 5OZQA 3BC4A 3R0WA 5P4WA 5P44A 1MTBA 1ZBGA 5DR0A 2OHKA 1SGZA 5P59A 3GI6A 4QJAA 5P8KA 1HTRB 1EPQE 3OXCA 5P3TA 5P2QA 5P7UA 2P3AA 2G1RA 4APEA 4FE6A 1BXOA 5P8CA 4GJ8A 5ER2E 1F34A 4YOAA 4I0IA 1A30A 1Q9PA 3ZKNA 4CP7A 5KQXA 2H6TA 1GVXA 1EPRE 3NWQA 3HDKA 2V11C 3OUCA 2WF4A 3MXEA 4TRZA 3CYXA 4Y4XA 1TQFA 1KJFA 4OBJA 1D4HA 4E43A 4Y48A 4CPUA 5P0DA 4J1IA 5HE5A 5OZ8A 5P8DA 2QHZA 3KFSA 1YM4A 4NPUA 2I0AA 2H6SA 3WSJA 4APRE 1GKTA 5P7KA 5P4SA 3QRVA 3O9FA 5ER1E 1IBQA 5P66A 1XDHA 5P7WA 1M0BA 5KOSA 4U7QA 1K2BA 2G1NA 3URIA 3VYEA 5P5CA 5IVRA 5P7QA 4YDFA 4Y4JA 1QS8A 5P8HA 5OYXA 2PSGA 2AQUA 1NSOA 4I1CA 3I2LA 3ZL7A 2XFJA 5P0QA 5P4AA 3KM4A 3BUFA 1HEFE 1FG8C 5P7AA 4FIVA 5P54A 1DIFA 4K9HA 4AUCA 4Q5MA 1B11A 4J1KA 5EZXA 1SDVA 3WB5A 1AXAA 1FQ5A 5P1EA 3ZMGA 3UCBA 5P86A 3FX5A 3NSHA 1A8GA 3HAUA 4DQGA 3NDWA 3ER5E 3EKWA 5DR4A 5P4DA 5DR1A 5P3EA 2BKSA 5P85A 6UPJA 4J1CA 2XFKA 3EKTA 2G1SA 1B5FA 5P52A 1GNNA 5T4SA 3EL0A 2OHRA 1HTFA 5DQ1A 2R43A 1CZIE 1DMPA 5CLMA 4Y56A 2QNPA 4ZSMA 4DUSA 1CPIA 3L5CA 3IGBA 5P4KA 5P76A 5P7YA 5P5QA 3G70A 2IKOA 2OHSA 5OYZA 1HRNA 4YBIA 3S56A 6FIVA 4FLGA 3L5FA 3S54A 4GJ5A 2QI4A 3UQPA 4B70A 5P83A 1PROA 4JECA 5I3XA 5P5GA 2QK5A 5OZRA 1APTE 5P31A 3EM4A 5I3YA 5P2FA 3ZKGA 3HW1A 2A1EA 5P64A 1EC2A 2V00A 5KQFA 2QNQA 5OZCA 5OZUA 1XE5A 2AOEA 3L5DA 5IVSA 4Y3GA 4HDBA 5P7VA 5OZOA 4ER4E 4RCEA 4B1EA 4GIDA 4YD6A 1GVVA 3OU4A 3HLOA 5B18A 4FGXA 5P4CA 3R4BA 2ZHTA 3OU3A 1HSIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FMX A;  4QGI A;  5P2U A;  3JVY A;  4GJD A;  2IEO A;  2QI3 A;  1UH9 A;  3CIB A;  1SDU A;  3RSX A;  1C6Z A;  5COP A;  4R95 A;  3MWS A;  1BAI A;  1A8K A;  3UQU A;  1TCW A;  2QHY A;  5DGU A;  2R5Q A;  3R0Y A;  4J0T A;  5P2R A;  2P8H A;  2R3W A;  3EKX A;  5HDU A;  2FDP A;  4EJL A;  2OHM A;  3D3T A;  5OZH A;  3IAW A;  4JP9 A;  3INF A;  3KT5 A;  2IL2 A;  5P56 A;  5P5K A;  3PSG A;  4YD5 A;  5P5E A;  2QZX A;  5P3C A;  4DJY A;  4R91 A;  4GMI A;  4NJV A;  2JYS A;  3FNU A;  5P3W A;  4NJS A;  3UQW A;  3LIY A;  4Z22 A;  5P0R A;  5P07 A;  2R9B A;  2MIP A;  5JG1 A;  4L1A A;  3PSU A;  5P68 A;  4LAP A;  5P8P A;  5P8E A;  5P1M A;  3D20 A;  2P4J A;  5P0J A;  5P0G A;  5P6Z A;  2HS2 A;  3OY4 A;  5P3H A;  5P4Z A;  2PMA A;  1T6E X;  2I4D A;  5P2S A;  5P5L A;  3S43 B;  4OBF A;  5P2C A;  1SBG A;  3FNT A;  4EYR A;  3LZY A;  3HAW A;  5OZ7 A;  4BEL A;  5P14 A;  4Y3D A;  4MC6 A;  3VSW A;  4Y53 A;  3RTN A;  3VSX A;  2QZL A;  4YE3 A;  2ZJK A;  3SAB A;  2PYN A;  4F74 A;  3SM1 A;  4TVH A;  1WBK A;  5P5J A;  1HVC A;  4Y58 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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